Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5stm_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 3.A N PRO 126.A O MET 3.A H 2.959 2.198 ASN 4.A N ASN 7.A OD1 ASN 4.A H 3.074 2.242 ASN 4.A ND2 GLU 128.A OE1.A ASN 4.A HD22 3.108 2.383 SER 6.A N ASN 4.A OD1 SER 6.A H 3.004 2.253 ASN 7.A ND2 ALA 2.A O ASN 7.A HD21 3.484 2.651 GLU 10.A N ASN 7.A O GLU 10.A H 3.337 2.523 PHE 12.A N ALA 9.A O PHE 12.A H 2.897 2.048 ASN 13.A N GLU 10.A O ASN 13.A H 3.422 2.563 ASP 15.A N ASN 13.A OD1 ASP 15.A H 2.984 2.152 LYS 17.A NZ ASN 13.A OD1 LYS 17.A HZ1 2.772 2.214 LYS 17.A NZ ASP 15.A O LYS 17.A HZ2 2.650 1.825 LEU 18.A N GLN 100.A O LEU 18.A H 3.209 2.409 PHE 19.A N LEU 50.A O PHE 19.A H 2.895 2.052 VAL 20.A N ILE 102.A O VAL 20.A H 2.860 2.068 ASP 21.A N PHE 48.A O ASP 21.A H 2.945 2.165 THR 23.A N.A ASP 21.A OD1 THR 23.A H.A 3.135 2.320 THR 23.A N.B ASP 21.A OD1 THR 23.A H.B 3.119 2.290 THR 23.A OG1.B ASP 21.A OD1 THR 23.A HG1.B 2.521 1.754 ASN 24.A ND2 SER 134.A O ASN 24.A HD21 2.840 2.000 VAL 25.A N ASP 22.A O VAL 25.A H 3.138 2.283 ARG 27.A NE ASN 44.A O ARG 27.A HE 3.086 2.401 ARG 27.A NH1 ASN 44.A O ARG 27.A HH11 2.828 2.082 THR 29.A N LYS 41.A O THR 29.A H 2.787 1.956 HIS 31.A N ALA 39.A O HIS 31.A H 2.853 2.009 HIS 31.A ND1 LYS 32.A O HIS 31.A HD1 3.088 2.228 THR 33.A N ASN 37.A O THR 33.A H 2.608 1.792 GLY 36.A N THR 33.A O GLY 36.A H 2.695 1.848 ASN 37.A N THR 33.A OG1 ASN 37.A H 3.014 2.240 ALA 39.A N HIS 31.A O ALA 39.A H 2.853 2.039 LYS 41.A N THR 29.A O LYS 41.A H 2.859 2.031 LYS 41.A NZ ALA 42.A O LYS 41.A HZ3 3.158 2.325 ILE 43.A N ARG 27.A O ILE 43.A H 2.888 2.061 ASN 44.A ND2 VAL 146.A O ASN 44.A HD22 2.811 1.991 ASN 44.A ND2 ALA 149.A O ASN 44.A HD21 2.967 2.226 GLY 45.A N ILE 62.A O GLY 45.A H 2.748 1.949 CYS 46.A N ASN 24.A O CYS 46.A H 3.045 2.280 ILE 47.A N LYS 60.A O ILE 47.A H 2.924 2.125 PHE 48.A N ASP 21.A O PHE 48.A H 3.207 2.348 LEU 50.A N PHE 19.A O LEU 50.A H 2.920 2.117 ASN 51.A N HIS 56.A O ASN 51.A H 2.790 1.944 LYS 53.A N ASN 51.A OD1 LYS 53.A H 2.961 2.220 LYS 53.A NZ PHE 12.A O LYS 53.A HZ2 2.465 1.830 THR 54.A N ASN 51.A OD1 THR 54.A H 3.351 2.594 GLY 55.A N ASN 51.A O GLY 55.A H 2.955 2.194 HIS 56.A N THR 54.A OG1 HIS 56.A H 3.228 2.373 LEU 57.A N PHE 157.A O LEU 57.A H 2.967 2.124 PHE 58.A N THR 49.A O PHE 58.A H 2.717 1.894 LEU 59.A N VAL 155.A O LEU 59.A H 2.945 2.113 LYS 60.A N ILE 47.A O LYS 60.A H 3.278 2.591 LYS 60.A NZ GLU 84.A OE1 LYS 60.A HZ3 3.341 2.606 ILE 61.A N GLN 153.A O ILE 61.A H 2.708 1.859 ILE 62.A N GLY 45.A O ILE 62.A H 2.767 1.914 THR 64.A N ASN 44.A OD1 THR 64.A H 3.211 2.435 SER 65.A N HIS 63.A ND1 SER 65.A H 3.213 2.369 SER 65.A OG HIS 63.A ND1 SER 65.A HG 2.881 2.210 VAL 66.A N.A HIS 63.A O VAL 66.A H.A 2.966 2.111 VAL 66.A N.B HIS 63.A O VAL 66.A H.B 2.954 2.113 TRP 67.A N THR 64.A O TRP 67.A H.A 2.996 2.168 ALA 68.A N SER 65.A O ALA 68.A H 3.169 2.323 GLN 70.A N TRP 67.A O GLN 70.A H 3.001 2.153 ARG 72.A NH2 GLN 75.A OE1 ARG 72.A HH21 3.303 2.469 LEU 76.A N ARG 72.A O LEU 76.A H 2.940 2.098 ALA 77.A N LEU 73.A O ALA 77.A H 2.757 1.927 LYS 78.A N GLN 75.A O LYS 78.A H 3.151 2.490 LYS 80.A N LEU 76.A O LYS 80.A H 2.757 1.912 THR 81.A N ALA 77.A O THR 81.A H 2.945 2.111 THR 81.A OG1 ALA 77.A O THR 81.A HG1 2.734 2.030 ALA 82.A N LYS 78.A O ALA 82.A H 2.951 2.125 GLU 83.A N TRP 79.A O GLU 83.A H 2.680 1.854 GLU 84.A N LYS 80.A O GLU 84.A H 2.864 2.043 VAL 85.A N THR 81.A O VAL 85.A H 2.824 1.984 SER 86.A N.A ALA 82.A O SER 86.A H.A 2.979 2.140 SER 86.A N.B ALA 82.A O SER 86.A H.B 2.977 2.131 SER 86.A OG.A ALA 82.A O SER 86.A HG.A 3.161 2.449 SER 86.A OG.A GLU 83.A O SER 86.A HG.A 2.808 2.240 ALA 87.A N GLU 83.A O ALA 87.A H.B 2.934 2.091 LEU 88.A N GLU 84.A O LEU 88.A H 2.900 2.129 VAL 89.A N VAL 85.A O VAL 89.A H 2.938 2.098 ARG 90.A N SER 86.A O.A ARG 90.A H 2.970 2.124 ARG 90.A N SER 86.A O.B ARG 90.A H 2.970 2.124 ARG 90.A NE SER 86.A OG.B ARG 90.A HE 2.976 2.344 ARG 90.A NH1 ASP 118.A OD2 ARG 90.A HH12 2.983 2.288 ARG 90.A NH2 SER 86.A OG.B ARG 90.A HH21 2.763 2.084 ARG 90.A NH2 ASP 118.A OD2 ARG 90.A HH22 3.220 2.589 SER 91.A N ALA 87.A O SER 91.A H 3.064 2.303 SER 91.A OG LEU 88.A O SER 91.A HG 2.673 2.025 LEU 92.A N LEU 88.A O LEU 92.A H 3.146 2.514 LEU 92.A N VAL 89.A O LEU 92.A H 2.929 2.166 GLU 95.A N GLU 95.A OE2 GLU 95.A H 2.914 2.126 GLU 96.A N PRO 93.A O GLU 96.A H 2.753 1.946 GLN 97.A N LYS 94.A O GLN 97.A H 3.168 2.370 GLN 97.A NE2 VAL 89.A O GLN 97.A HE21 2.990 2.270 GLN 97.A NE2 LEU 92.A O GLN 97.A HE21 3.177 2.593 LYS 99.A N.A ILE 16.A O LYS 99.A H.A 2.763 1.956 LYS 99.A N.B ILE 16.A O LYS 99.A H.B 2.754 1.950 GLN 100.A NE2 GLU 10.A OE2 GLN 100.A HE22 3.074 2.219 ILE 101.A N ALA 123.A O ILE 101.A H 2.902 2.092 ILE 102.A N LEU 18.A O ILE 102.A H 2.853 2.061 VAL 103.A N ARG 125.A O VAL 103.A H 2.887 2.113 THR 104.A N VAL 20.A O THR 104.A H 2.898 2.097 THR 104.A OG1 ASP 21.A OD2 THR 104.A HG1 2.620 1.796 ARG 105.A NE ASP 22.A OD1 ARG 105.A HE 2.729 1.918 ARG 105.A NH2 ASP 22.A OD2 ARG 105.A HH21 2.713 1.859 MET 108.A N ARG 105.A O MET 108.A H 3.047 2.199 LEU 109.A N LYS 106.A O LEU 109.A H 2.917 2.065 LEU 112.A N MET 108.A O LEU 112.A H 2.922 2.067 GLU 113.A N LEU 109.A O GLU 113.A H 2.788 1.942 VAL 114.A N ASP 110.A O VAL 114.A H 2.878 2.026 HIS 115.A N PRO 111.A O HIS 115.A H 3.103 2.246 MET 116.A N LEU 112.A O MET 116.A H 2.874 2.216 MET 116.A N GLU 113.A O MET 116.A H 3.177 2.470 LEU 117.A N VAL 114.A O LEU 117.A H 3.325 2.492 PHE 119.A N MET 116.A O PHE 119.A H 2.651 1.808 ILE 122.A N PHE 119.A O ILE 122.A H 3.063 2.214 ALA 123.A N LYS 99.A O.A ALA 123.A H 3.090 2.253 ALA 123.A N LYS 99.A O.B ALA 123.A H 3.049 2.221 ARG 125.A N ILE 101.A O ARG 125.A H 2.896 2.092 ARG 125.A NE GLY 1.A O ARG 125.A HE 2.880 2.026 ARG 125.A NH1 GLU 10.A OE1 ARG 125.A HH12 3.365 2.751 ARG 125.A NH1 GLN 100.A OE1 ARG 125.A HH11 2.715 1.911 THR 127.A OG1 MET 3.A O THR 127.A HG1 2.694 1.926 GLU 128.A N.A MET 3.A O GLU 128.A H.A 2.551 1.759 GLU 128.A N.B MET 3.A O GLU 128.A H.B 2.567 1.783 LEU 129.A N THR 127.A OG1 LEU 129.A H.B 3.128 2.336 ALA 135.A N PRO 132.A O ALA 135.A H 3.187 2.348 ALA 136.A N PHE 133.A O ALA 136.A H 3.091 2.236 SER 138.A N ALA 135.A O SER 138.A H 2.589 1.749 ILE 139.A N ALA 136.A O ILE 139.A H 3.174 2.328 LYS 141.A NZ SER 204.A O LYS 141.A HZ3 3.079 2.311 LYS 141.A NZ HIS 206.A O LYS 141.A HZ2 2.693 1.829 SER 143.A N ILE 139.A O SER 143.A H 2.964 2.128 ASP 144.A N ASP 140.A O ASP 144.A H 2.832 2.049 VAL 145.A N LYS 141.A O VAL 145.A H 3.218 2.463 VAL 146.A N LEU 142.A O VAL 146.A H 3.149 2.304 MET 147.A N.A SER 143.A O MET 147.A H.A 2.970 2.128 MET 147.A N.B SER 143.A O MET 147.A H.B 2.984 2.140 MET 147.A N.C SER 143.A O MET 147.A H.C 2.985 2.136 LYS 148.A N ASP 144.A O LYS 148.A H.C 3.093 2.283 ALA 149.A N VAL 146.A O ALA 149.A H 3.243 2.443 VAL 155.A N LEU 59.A O VAL 155.A H 2.942 2.093 PHE 157.A N LEU 57.A O PHE 157.A H 3.127 2.290 ASN 158.A ND2 THR 54.A O ASN 158.A HD21 3.190 2.546 ILE 159.A N GLY 55.A O ILE 159.A H 2.919 2.141 TYR 160.A N ASN 158.A OD1 TYR 160.A H 2.756 1.928 TYR 160.A OH PRO 52.A O TYR 160.A HH 2.645 1.820 ASP 161.A N ASN 158.A O ASP 161.A H 3.131 2.313 TRP 163.A N TYR 160.A O TRP 163.A H 2.772 1.923 ASP 165.A N ASP 162.A O ASP 165.A H 3.090 2.266 ARG 166.A N TRP 163.A O ARG 166.A H 2.916 2.062 ARG 166.A NE ASP 213.A OD1 ARG 166.A HE 2.749 2.062 ARG 166.A NE ASP 213.A OD2 ARG 166.A HE 3.182 2.457 ARG 166.A NH1 ASP 213.A OD2 ARG 166.A HH11 2.844 2.026 ILE 167.A N TRP 163.A O ILE 167.A H 3.084 2.350 SER 169.A OG.A LYS 53.A O SER 169.A HG.A 2.724 2.243 THR 171.A N SER 168.A OG THR 171.A H 3.205 2.371 THR 171.A OG1 SER 168.A OG THR 171.A HG1 3.240 2.468 ALA 172.A N SER 168.A O ALA 172.A H 2.891 2.056 PHE 173.A N SER 169.A O.A PHE 173.A H 2.714 1.869 PHE 173.A N SER 169.A O.B PHE 173.A H 2.850 2.003 SER 174.A N TYR 170.A O SER 174.A H 3.071 2.266 SER 174.A OG TYR 170.A O SER 174.A HG 2.924 2.137 ARG 175.A N THR 171.A O ARG 175.A H 2.830 1.988 ARG 175.A NE GLU 220.A OE1 ARG 175.A HE 2.757 1.900 LEU 176.A N ALA 172.A O LEU 176.A H 2.844 1.995 THR 177.A N PHE 173.A O THR 177.A H 2.963 2.109 THR 177.A OG1 PHE 173.A O THR 177.A HG1 3.174 2.392 THR 177.A OG1 SER 174.A O THR 177.A HG1 3.284 2.819 LEU 178.A N SER 174.A O LEU 178.A H 3.051 2.200 LEU 179.A N ARG 175.A O LEU 179.A H 2.860 2.013 LEU 180.A N LEU 176.A O LEU 180.A H 2.905 2.074 ARG 181.A N THR 177.A O ARG 181.A H 2.794 1.937 ALA 182.A N LEU 178.A O ALA 182.A H 3.068 2.212 LEU 183.A N LEU 179.A O LEU 183.A H 2.839 1.992 LYS 184.A N LEU 180.A O LYS 184.A H 2.827 2.039 LYS 184.A NZ SER 134.A OG LYS 184.A HZ2 3.049 2.213 THR 185.A N.A ARG 181.A O THR 185.A H.A 2.964 2.263 THR 185.A N.A ALA 182.A O THR 185.A H.A 3.097 2.469 THR 185.A N.B ARG 181.A O THR 185.A H.B 2.973 2.267 THR 185.A N.B ALA 182.A O THR 185.A H.B 3.112 2.488 THR 185.A OG1.B ARG 181.A O THR 185.A HG1.B 2.725 1.892 ASN 186.A N ALA 182.A O ASN 186.A H.B 2.996 2.137 ASN 186.A ND2 GLU 230.A OE1 ASN 186.A HD22 2.913 2.073 SER 189.A N ASN 186.A OD1 SER 189.A H 3.085 2.231 ALA 190.A N ASN 186.A O ALA 190.A H 2.987 2.138 LYS 191.A N GLU 187.A O LYS 191.A H 2.849 2.008 LYS 191.A NZ ASP 140.A OD1 LYS 191.A HZ3 2.826 2.033 MET 192.A N GLU 188.A O MET 192.A H.B 2.790 1.945 ILE 193.A N SER 189.A O ILE 193.A H 2.806 1.988 LEU 194.A N ALA 190.A O LEU 194.A H 3.146 2.413 LEU 195.A N MET 192.A O LEU 195.A H 3.335 2.552 THR 199.A N ASP 197.A OD1 THR 199.A H 3.127 2.289 ILE 200.A N ASP 197.A O ILE 200.A H 3.106 2.262 LYS 203.A NZ THR 201.A OG1 LYS 203.A HZ2 3.173 2.502 LYS 203.A NZ SER 210.A OG LYS 203.A HZ3 3.088 2.247 HIS 206.A N LYS 203.A O HIS 206.A H 2.902 2.055 LEU 207.A N ASP 161.A OD1 LEU 207.A H 2.853 2.013 TRP 208.A N ASP 161.A OD2 TRP 208.A H 3.012 2.185 TRP 208.A NE1 ILE 159.A O TRP 208.A HE1 2.914 2.114 SER 210.A N THR 201.A O SER 210.A H 2.853 2.123 PHE 211.A N PRO 209.A O PHE 211.A H 3.012 2.346 THR 212.A N GLN 215.A OE1 THR 212.A H 3.088 2.261 GLN 215.A N THR 212.A OG1 GLN 215.A H 3.142 2.290 TRP 216.A N THR 212.A O TRP 216.A H 2.769 1.992 ILE 217.A N ASP 213.A O ILE 217.A H 3.233 2.430 THR 218.A N GLU 214.A O THR 218.A H 3.149 2.319 ILE 219.A N GLN 215.A O ILE 219.A H 2.885 2.046 GLU 220.A N TRP 216.A O GLU 220.A H 2.708 1.853 SER 221.A N.A ILE 217.A O SER 221.A H.A 2.838 2.000 SER 221.A N.B ILE 217.A O SER 221.A H.B 2.834 1.987 SER 221.A OG.A ILE 217.A O SER 221.A HG.A 2.564 1.726 GLN 222.A N THR 218.A O GLN 222.A H.A 2.981 2.183 MET 223.A N ILE 219.A O MET 223.A H 2.934 2.149 ARG 224.A N.A GLU 220.A O ARG 224.A H.A 3.059 2.247 ARG 224.A N.B GLU 220.A O ARG 224.A H.B 3.072 2.278 ASP 225.A N SER 221.A O.A ASP 225.A H.A 3.099 2.245 ASP 225.A N SER 221.A O.B ASP 225.A H.A 3.045 2.196 LEU 226.A N GLN 222.A O LEU 226.A H 3.043 2.206 ILE 227.A N MET 223.A O ILE 227.A H 3.016 2.195 LEU 228.A N ARG 224.A O.A LEU 228.A H 2.809 1.959 LEU 228.A N ARG 224.A O.B LEU 228.A H 2.844 1.989 THR 229.A N ASP 225.A O THR 229.A H 2.597 1.738 THR 229.A OG1 ASP 225.A O THR 229.A HG1 2.858 2.142 THR 229.A OG1 ASP 225.A OD1.B THR 229.A HG1 3.098 2.503 GLU 230.A N LEU 226.A O GLU 230.A H 2.821 1.970 TYR 231.A N ILE 227.A O TYR 231.A H 2.912 2.099 GLY 232.A N LEU 228.A O GLY 232.A H 2.959 2.229 GLY 232.A N THR 229.A O GLY 232.A H 2.644 2.010 ARG 233.A N THR 229.A O ARG 233.A H 2.795 2.030 ARG 233.A NH1 GLU 230.A OE2 ARG 233.A HH11 3.214 2.547 LYS 234.A N GLU 230.A O LYS 234.A H 2.731 1.977 LYS 234.A NZ TYR 235.A OH LYS 234.A HZ2 3.560 2.855 TYR 235.A N TYR 231.A O TYR 235.A H 3.104 2.247 ASN 236.A N GLY 232.A O ASN 236.A H 2.338 1.568