Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5u8k_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 3.A N ASP 46.A OD2 ARG 3.A H 2.825 1.981 ARG 3.A NH2 ASP 29.A OD2 ARG 3.A HH21 2.777 2.027 ILE 4.A N ARG 27.A O ILE 4.A H 2.724 1.884 LEU 5.A N LEU 47.A O LEU 5.A H 2.908 2.095 LEU 6.A N ASP 29.A O LEU 6.A H 2.892 2.060 LEU 7.A N LEU 49.A O LEU 7.A H 2.956 2.112 LYS 9.A N ASN 51.A OD1 LYS 9.A H 2.890 2.071 GLU 10.A N GLU 8.A OE2 GLU 10.A H 2.933 2.082 ALA 14.A N GLU 10.A O ALA 14.A H 2.856 2.025 HIS 15.A N ARG 11.A O HIS 15.A H 3.036 2.206 PHE 16.A N ASN 12.A O PHE 16.A H 2.921 2.080 LEU 17.A N LEU 13.A O LEU 17.A H 2.764 1.916 SER 18.A N ALA 14.A O SER 18.A H 2.891 2.038 LEU 19.A N HIS 15.A O LEU 19.A H 3.010 2.164 GLU 20.A N PHE 16.A O GLU 20.A H 2.892 2.070 LEU 21.A N LEU 17.A O LEU 21.A H 2.887 2.039 GLN 22.A N SER 18.A O GLN 22.A H 3.129 2.346 LYS 23.A N LEU 19.A O LYS 23.A H 3.194 2.462 LYS 23.A N GLU 20.A O LYS 23.A H 3.145 2.539 LYS 23.A NZ GLU 20.A OE2 LYS 23.A HZ2 2.803 1.985 GLU 24.A N LEU 21.A O GLU 24.A H 3.077 2.330 GLN 25.A N GLN 22.A O GLN 25.A H 2.835 2.033 GLN 25.A NE2 LYS 23.A O GLN 25.A HE21 3.674 3.210 ARG 27.A N LYS 2.A O ARG 27.A H 2.998 2.180 ARG 27.A NE GLY 1.A O ARG 27.A HE 3.082 2.257 ARG 27.A NH2 GLY 1.A O ARG 27.A HH21 3.369 2.642 ASP 29.A N ILE 4.A O ASP 29.A H 2.859 2.028 VAL 31.A N LEU 6.A O VAL 31.A H 2.908 2.076 GLY 34.A N ASP 56.A OD1 GLY 34.A H 2.905 2.193 GLN 35.A N ASP 56.A OD2 GLN 35.A H 2.774 1.958 ALA 37.A N GLU 33.A O ALA 37.A H 2.961 2.113 LEU 38.A N GLY 34.A O LEU 38.A H 2.693 1.885 SER 39.A N GLN 35.A O SER 39.A H 3.014 2.202 SER 39.A OG GLN 35.A O SER 39.A HG 3.512 2.788 SER 39.A OG LYS 36.A O SER 39.A HG 2.938 2.341 ALA 40.A N ALA 37.A O ALA 40.A H.A 2.865 2.061 LEU 41.A N LEU 38.A O LEU 41.A H 2.909 2.145 TYR 45.A OH ASP 29.A OD2 TYR 45.A HH 2.592 1.759 ASP 46.A N ARG 3.A O ASP 46.A H 2.884 2.210 LEU 47.A N ARG 3.A O LEU 47.A H 3.302 2.537 ILE 48.A N VAL 72.A O ILE 48.A H 2.905 2.127 LEU 49.A N LEU 5.A O LEU 49.A H 2.752 1.914 ASN 51.A ND2 GLU 8.A OE1 ASN 51.A HD21 2.837 2.000 ASN 51.A ND2 LEU 75.A O ASN 51.A HD22 2.856 2.016 VAL 52.A N ASP 76.A OD2 VAL 52.A H 2.826 1.980 GLY 55.A N ASN 53.A OD1 GLY 55.A H 2.918 2.064 ALA 57.A N VAL 52.A O ALA 57.A H 2.864 2.007 ALA 61.A N ALA 57.A O ALA 61.A H 2.817 2.001 GLU 62.A N GLN 58.A O GLU 62.A H 2.966 2.155 LYS 63.A N ASP 59.A O LYS 63.A H 2.989 2.162 LYS 63.A NZ ASP 59.A OD1 LYS 63.A HZ2 2.802 1.954 LEU 64.A N PHE 60.A O LEU 64.A H 2.881 2.030 SER 65.A N ALA 61.A O SER 65.A H 2.867 2.095 SER 65.A OG GLU 62.A O SER 65.A HG 2.704 1.868 ARG 66.A N LYS 63.A O ARG 66.A H 3.337 2.516 ARG 66.A NE GLU 62.A OE2 ARG 66.A HE 2.882 2.092 ARG 66.A NH2 GLU 62.A OE1 ARG 66.A HH21 2.958 2.213 ARG 66.A NH2 GLU 62.A OE2 ARG 66.A HH21 3.437 2.772 THR 67.A N LEU 64.A O THR 67.A H 3.210 2.431 LYS 68.A N LEU 64.A O LYS 68.A H 2.910 2.112 LYS 68.A NZ ALA 40.A O LYS 68.A HZ2 2.866 1.990 LYS 68.A NZ ASP 44.A OD1 LYS 68.A HZ3 2.752 1.941 SER 71.A N LYS 68.A O SER 71.A H 3.178 2.404 SER 71.A OG LYS 68.A O SER 71.A HG 2.789 1.991 ILE 74.A N SER 94.A O ILE 74.A H.B 3.139 2.327 LEU 75.A N LEU 50.A O LEU 75.A H 2.863 2.054 ASP 76.A N ILE 96.A O ASP 76.A H 3.140 2.369 HIS 77.A N ASP 76.A OD1 HIS 77.A H 2.776 2.071 LEU 81.A N HIS 77.A O LEU 81.A H 3.013 2.162 GLN 82.A N TRP 78.A O GLN 82.A H 2.917 2.093 GLN 82.A NE2 TYR 97.A OH GLN 82.A HE21 2.787 2.145 GLU 83.A N GLU 79.A O GLU 83.A H 3.091 2.295 GLU 84.A N LEU 81.A O GLU 84.A H 3.068 2.286 LEU 85.A N GLN 82.A O LEU 85.A H 3.360 2.581 VAL 88.A N GLU 84.A O VAL 88.A H 2.909 2.080 GLN 89.A N LEU 85.A O GLN 89.A H 2.879 2.039 GLN 89.A NE2 TYR 195.A OH GLN 89.A HE21 3.046 2.230 ARG 90.A N GLU 86.A O ARG 90.A H 3.198 2.454 ARG 90.A N VAL 87.A O ARG 90.A H 3.144 2.561 ARG 90.A NH1 SER 198.A OG ARG 90.A HH12 3.387 2.538 PHE 91.A N VAL 87.A O PHE 91.A H 3.215 2.514 PHE 91.A N VAL 88.A O PHE 91.A H 3.136 2.510 ALA 92.A N VAL 88.A O ALA 92.A H 2.845 2.033 VAL 93.A N.A ILE 73.A O VAL 93.A H.A 2.715 1.930 VAL 93.A N.B ILE 73.A O VAL 93.A H.B 2.776 2.057 ILE 96.A N ILE 74.A O ILE 96.A H 2.840 2.066 LYS 98.A N ASP 76.A O LYS 98.A H 2.852 2.023 LYS 98.A NZ GLU 8.A OE1 LYS 98.A HZ1 3.515 2.810 LYS 98.A NZ GLU 8.A OE2 LYS 98.A HZ1 2.678 1.912 LYS 98.A NZ GLU 10.A OE1 LYS 98.A HZ3 2.679 1.818 GLU 103.A N GLU 103.A OE1 GLU 103.A H 2.858 2.042 ASN 104.A N LEU 101.A O ASN 104.A H 2.976 2.356 LEU 105.A N LEU 101.A O LEU 105.A H 3.020 2.189 VAL 106.A N ILE 102.A O VAL 106.A H 2.875 2.028 ALA 107.A N GLU 103.A O ALA 107.A H 3.074 2.248 ARG 108.A N ASN 104.A O ARG 108.A H 2.929 2.108 ARG 108.A NH1 TYR 95.A O ARG 108.A HH12 3.324 2.677 ARG 108.A NH2 TYR 95.A O ARG 108.A HH22 3.017 2.282 ILE 109.A N LEU 105.A O ILE 109.A H 2.968 2.133 SER 110.A N VAL 106.A O SER 110.A H 3.035 2.188 ALA 111.A N ALA 107.A O ALA 111.A H 3.032 2.211 ILE 112.A N ARG 108.A O ILE 112.A H 2.912 2.086 PHE 113.A N ILE 109.A O PHE 113.A H 2.945 2.095 ARG 114.A N.A SER 110.A O ARG 114.A H.A 2.941 2.113 ARG 114.A N.B SER 110.A O ARG 114.A H.B 2.943 2.113 ARG 114.A NE.B SER 110.A O ARG 114.A HE.B 3.356 2.653 ARG 114.A NE.B SER 110.A OG ARG 114.A HE.B 3.166 2.437 GLY 115.A N ALA 111.A O GLY 115.A H.A 2.896 2.085 ARG 116.A N ILE 112.A O ARG 116.A H 3.021 2.191 ARG 116.A NE ASP 157.A OD2 ARG 116.A HE 2.884 2.164 ARG 116.A NH1 ILE 112.A O ARG 116.A HH11 3.045 2.307 ARG 116.A NH2 ASP 157.A OD2 ARG 116.A HH21 2.855 2.106 ARG 116.A NH2 VAL 177.A O ARG 116.A HH22 2.833 2.151 ASP 117.A N PHE 113.A O ASP 117.A H 3.022 2.185 PHE 118.A N ARG 114.A O.A PHE 118.A H 2.944 2.159 PHE 118.A N ARG 114.A O.B PHE 118.A H 2.962 2.178 ILE 119.A N GLY 115.A O ILE 119.A H 3.032 2.203 ASP 120.A N ARG 116.A O ASP 120.A H 2.952 2.117 GLN 121.A N ASP 117.A O GLN 121.A H 2.968 2.123 HIS 122.A N PHE 118.A O HIS 122.A H 2.829 1.982 SER 123.A N ILE 119.A O SER 123.A H 2.825 1.990 SER 123.A OG ILE 119.A O SER 123.A HG 2.924 2.219 SER 123.A OG ASP 120.A O SER 123.A HG 3.147 2.540 SER 124.A N ASP 120.A O SER 124.A H 3.124 2.441 SER 124.A N GLN 121.A O SER 124.A H 3.217 2.525 SER 124.A OG GLN 121.A O SER 124.A HG 2.738 1.901 LEU 125.A N HIS 122.A O LEU 125.A H 3.174 2.360 TYR 131.A N LEU 134.A O TYR 131.A H 3.035 2.238 ARG 132.A NH1 GLN 205.A OE1 ARG 132.A HH11 3.368 2.791 ARG 132.A NH1 LYS 206.A O ARG 132.A HH12 2.849 2.025 ARG 132.A NH2 LYS 206.A O ARG 132.A HH22 3.241 2.544 ARG 132.A NH2 SER 207.A O ARG 132.A HH22 2.973 2.253 ARG 132.A NH2 GLN 219.A O ARG 132.A HH21 2.853 2.044 ASN 133.A N TYR 208.A OH ASN 133.A H 3.194 2.381 LEU 134.A N TYR 131.A O LEU 134.A H 2.813 1.971 ARG 135.A N TYR 144.A O ARG 135.A H 2.878 2.085 ILE 136.A N ARG 129.A O ILE 136.A H 3.041 2.228 ASP 137.A N THR 142.A O ASP 137.A H 2.784 1.926 HIS 140.A N ASP 137.A O HIS 140.A H 3.273 2.592 HIS 140.A N ASP 137.A OD1 HIS 140.A H 3.263 2.512 HIS 140.A ND1 ASP 137.A OD1 no hydrogen 3.056 N/A HIS 140.A ND1 ASP 137.A OD2 no hydrogen 2.825 N/A HIS 141.A NE2 ASP 120.A OD1 HIS 141.A HE2 2.790 1.946 THR 142.A N ASP 137.A O THR 142.A H 3.218 2.402 TYR 144.A N ARG 135.A O TYR 144.A H 2.914 2.093 ARG 145.A N GLU 148.A O ARG 145.A H 2.905 2.140 ARG 145.A NH1 LEU 200.A O ARG 145.A HH11 2.703 1.964 GLY 146.A N ASN 133.A O GLY 146.A H 2.860 2.039 GLU 148.A N ARG 145.A O GLU 148.A H 3.120 2.265 ILE 149.A N VAL 143.A O ILE 149.A H 2.841 1.995 LEU 151.A N ILE 149.A O LEU 151.A H 2.766 2.067 THR 152.A N GLU 155.A OE1 THR 152.A H 2.974 2.151 ARG 153.A NE ASP 157.A OD1 ARG 153.A HE 2.764 1.930 ARG 153.A NH2 ASP 120.A OD1 ARG 153.A HH22 2.903 2.118 ARG 153.A NH2 ASP 157.A OD1 ARG 153.A HH21 3.220 2.543 ARG 154.A NE VAL 93.A O.A ARG 154.A HE 2.961 2.202 ARG 154.A NE VAL 93.A O.B ARG 154.A HE 3.106 2.289 ARG 154.A NH1 VAL 177.A O ARG 154.A HH11 2.880 2.339 ARG 154.A NH1 GLU 181.A OE2 ARG 154.A HH12 2.983 2.263 ARG 154.A NH2 VAL 93.A O.A ARG 154.A HH21 2.799 2.010 ARG 154.A NH2 VAL 93.A O.B ARG 154.A HH21 3.178 2.403 ARG 154.A NH2 SER 94.A OG ARG 154.A HH21 3.161 2.494 ARG 154.A NH2 GLU 181.A OE1 ARG 154.A HH22 3.305 2.577 ARG 154.A NH2 GLU 181.A OE2 ARG 154.A HH22 2.840 2.066 GLU 155.A N THR 152.A OG1 GLU 155.A H 3.175 2.323 TYR 156.A N THR 152.A O TYR 156.A H 2.758 1.905 ASP 157.A N ARG 153.A O ASP 157.A H 2.859 2.019 LEU 158.A N ARG 154.A O LEU 158.A H 2.898 2.066 LEU 159.A N GLU 155.A O LEU 159.A H 2.905 2.083 ALA 160.A N TYR 156.A O ALA 160.A H 2.824 1.974 THR 161.A N ASP 157.A O THR 161.A H 3.030 2.236 THR 161.A OG1 ASP 157.A O THR 161.A HG1 2.788 2.032 LEU 162.A N LEU 158.A O LEU 162.A H 2.964 2.136 GLY 163.A N ALA 160.A O GLY 163.A H 2.917 2.212 SER 164.A N LEU 162.A O SER 164.A H 3.364 2.558 SER 164.A OG LYS 166.A O SER 164.A HG 2.901 2.441 LEU 168.A N TYR 217.A O LEU 168.A H 3.039 2.202 THR 169.A N GLN 172.A OE1 THR 169.A H 2.871 2.038 ARG 170.A NE.A ASP 190.A OD1 ARG 170.A HE.A 2.836 2.079 ARG 170.A NH2.A ASP 190.A OD1 ARG 170.A HH21.A 3.558 2.994 ARG 170.A NH2.B ASP 190.A OD2 ARG 170.A HH21.B 3.070 2.470 GLN 172.A N THR 169.A OG1 GLN 172.A H 3.009 2.180 LEU 173.A N THR 169.A O LEU 173.A H 2.896 2.074 LEU 174.A N ARG 170.A O.A LEU 174.A H 2.919 2.089 LEU 174.A N ARG 170.A O.B LEU 174.A H 2.760 1.921 GLU 175.A N GLU 171.A O GLU 175.A H 2.942 2.130 SER 176.A N GLN 172.A O SER 176.A H 3.053 2.378 SER 176.A N LEU 173.A O SER 176.A H 3.232 2.572 VAL 177.A N LEU 173.A O VAL 177.A H 2.852 1.995 TRP 178.A N LEU 174.A O TRP 178.A H 2.927 2.138 LYS 179.A NZ GLU 175.A O LYS 179.A HZ3 3.128 2.548 LYS 179.A NZ GLU 175.A OE2 LYS 179.A HZ3 2.998 2.284 GLU 181.A N TRP 178.A O GLU 181.A H 3.019 2.207 THR 184.A N GLU 181.A O THR 184.A H 3.007 2.151 THR 184.A OG1 GLU 181.A O THR 184.A HG1 2.781 2.005 ILE 188.A N GLU 185.A O ILE 188.A H 3.201 2.367 VAL 189.A N THR 186.A O VAL 189.A H 2.923 2.116 TYR 192.A N ILE 188.A O TYR 192.A H 3.200 2.387 TYR 192.A OH GLN 89.A O TYR 192.A HH 2.715 2.077 ILE 193.A N VAL 189.A O ILE 193.A H 2.896 2.060 ARG 194.A N ASP 190.A O ARG 194.A H 3.048 2.217 ARG 194.A NH1 GLU 86.A OE2 ARG 194.A HH12 3.178 2.401 ARG 194.A NH2 GLU 86.A OE2 ARG 194.A HH22 3.158 2.373 TYR 195.A N VAL 191.A O TYR 195.A H 3.025 2.213 TYR 195.A OH GLU 86.A OE2 TYR 195.A HH 2.846 2.007 LEU 196.A N TYR 192.A O LEU 196.A H 2.842 2.008 ARG 197.A N ILE 193.A O ARG 197.A H 2.884 2.028 ARG 197.A NE SER 207.A OG ARG 197.A HE 3.263 2.668 ARG 197.A NE ILE 209.A O ARG 197.A HE 3.081 2.305 ARG 197.A NH2 ILE 209.A O ARG 197.A HH21 2.977 2.182 ARG 197.A NH2 THR 211.A OG1 ARG 197.A HH22 2.879 2.068 SER 198.A N ARG 194.A O SER 198.A H 3.028 2.203 SER 198.A OG TYR 195.A O SER 198.A HG 2.740 1.913 LYS 199.A N TYR 195.A O LYS 199.A H 3.197 2.505 LYS 199.A N LEU 196.A O LYS 199.A H 3.092 2.428 LYS 199.A NZ ALA 150.A O LYS 199.A HZ3 2.854 1.975 LYS 199.A NZ GLU 155.A OE1 LYS 199.A HZ2 2.760 1.889 LEU 200.A N LEU 196.A O LEU 200.A H 3.017 2.262 ASP 201.A N ARG 197.A O ASP 201.A H 2.890 2.101 GLN 205.A N VAL 202.A O GLN 205.A H 2.974 2.130 SER 207.A OG ASP 201.A OD1 SER 207.A HG 3.352 2.669 SER 207.A OG ASP 201.A OD2 SER 207.A HG 2.572 1.762 TYR 208.A N ASP 201.A OD1 TYR 208.A H 2.818 1.966 ILE 209.A N SER 207.A OG ILE 209.A H 3.110 2.251 LYS 210.A N THR 218.A O LYS 210.A H 2.836 1.996 VAL 212.A N GLY 216.A O VAL 212.A H 2.763 1.904 VAL 215.A N VAL 212.A O VAL 215.A H 2.976 2.155 GLY 216.A N VAL 212.A O GLY 216.A H 3.139 2.337 TYR 217.A N LEU 168.A O TYR 217.A H 2.894 2.079 TYR 217.A OH ASP 190.A OD1 TYR 217.A HH 2.584 1.760 THR 218.A N LYS 210.A O THR 218.A H 3.087 2.306 GLN 219.A N TYR 208.A O GLN 219.A H 2.836 2.048 GLN 219.A NE2 SER 207.A O GLN 219.A HE21 2.903 2.044