Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5u8m_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 2.A NZ ASP 121.A OD1 LYS 2.A HZ1 2.793 2.098 LYS 2.A NZ ASP 121.A OD2 LYS 2.A HZ1 3.014 2.182 ARG 3.A N ASP 47.A OD2 ARG 3.A H 2.788 1.936 ARG 3.A NE ASP 29.A OD2 ARG 3.A HE 3.181 2.467 ARG 3.A NH1 ASP 29.A OD2 ARG 3.A HH11 3.085 2.361 ILE 4.A N ARG 27.A O ILE 4.A H 2.753 1.941 LEU 5.A N LEU 48.A O LEU 5.A H 2.946 2.153 LEU 6.A N ASP 29.A O LEU 6.A H 2.968 2.126 LEU 7.A N LEU 50.A O LEU 7.A H 2.982 2.123 LYS 9.A N ASN 52.A OD1 LYS 9.A H 2.856 2.077 GLU 10.A N GLU 8.A OE2 GLU 10.A H 2.881 2.029 ALA 14.A N GLU 10.A O ALA 14.A H 2.821 1.975 HIS 15.A N ARG 11.A O HIS 15.A H 2.961 2.189 HIS 15.A N ASN 12.A O HIS 15.A H 3.200 2.606 PHE 16.A N ASN 12.A O PHE 16.A H 3.246 2.420 LEU 17.A N LEU 13.A O LEU 17.A H 2.733 1.879 SER 18.A N ALA 14.A O SER 18.A H 2.955 2.116 LEU 19.A N HIS 15.A O LEU 19.A H 3.218 2.425 GLU 20.A N PHE 16.A O GLU 20.A H 3.007 2.182 LEU 21.A N LEU 17.A O LEU 21.A H 3.014 2.169 GLN 22.A N SER 18.A O GLN 22.A H 3.000 2.219 LYS 23.A N LEU 19.A O LYS 23.A H 3.104 2.387 LYS 23.A N GLU 20.A O LYS 23.A H 3.228 2.609 LYS 23.A NZ GLU 20.A OE1 LYS 23.A HZ2 3.421 2.616 LYS 23.A NZ GLU 20.A OE2 LYS 23.A HZ2 2.491 1.686 GLU 24.A N LEU 21.A O GLU 24.A H 3.187 2.461 GLN 25.A N GLN 22.A O GLN 25.A H 2.873 2.083 GLN 25.A NE2 LYS 23.A O GLN 25.A HE22 3.010 2.415 TYR 26.A N LEU 21.A O TYR 26.A H 3.251 2.484 ARG 27.A N LYS 2.A O ARG 27.A H 2.786 1.992 ARG 27.A NH1 GLY 1.A O ARG 27.A HH11 3.518 2.848 ASP 29.A N ILE 4.A O ASP 29.A H 2.873 2.037 VAL 31.A N LEU 6.A O VAL 31.A H 2.961 2.121 GLN 35.A N ASP 57.A OD2 GLN 35.A H 2.860 2.077 ALA 37.A N GLU 33.A O ALA 37.A H 2.783 1.951 LEU 38.A N GLY 34.A O LEU 38.A H 2.891 2.101 SER 39.A N GLN 35.A O SER 39.A H 3.028 2.201 MET 40.A N LYS 36.A O MET 40.A H 2.985 2.156 ALA 41.A N ALA 37.A O ALA 41.A H 2.988 2.237 LEU 42.A N LEU 38.A O LEU 42.A H 2.973 2.186 GLN 43.A N SER 39.A O GLN 43.A H 3.289 2.535 THR 44.A N MET 40.A O THR 44.A H 3.062 2.373 TYR 46.A OH ASP 29.A OD2 TYR 46.A HH 2.802 1.983 ASP 47.A N ARG 3.A O ASP 47.A H 2.859 2.146 ILE 49.A N VAL 75.A O ILE 49.A H 2.799 2.001 LEU 50.A N LEU 5.A O LEU 50.A H 2.792 1.953 LEU 51.A N MET 77.A O LEU 51.A H 3.009 2.213 ASN 52.A ND2 GLU 8.A OE1 ASN 52.A HD21 2.887 2.076 ASN 52.A ND2 LEU 79.A O ASN 52.A HD22 2.935 2.081 VAL 53.A N ASP 80.A OD2 VAL 53.A H 2.981 2.140 LEU 55.A N MET 58.A O LEU 55.A H 2.764 1.954 GLY 56.A N ASN 54.A OD1 GLY 56.A H 2.761 1.907 MET 59.A N ASP 62.A OD2 MET 59.A H 3.228 2.402 ALA 60.A N VAL 53.A O ALA 60.A H 2.824 1.972 ASP 62.A N MET 59.A O ASP 62.A H 2.853 2.252 PHE 63.A N MET 59.A O PHE 63.A H 3.016 2.185 ALA 64.A N ALA 60.A O ALA 64.A H 2.795 1.977 GLU 65.A N GLN 61.A O GLU 65.A H 3.049 2.223 LYS 66.A N ASP 62.A O LYS 66.A H 2.969 2.124 LEU 67.A N PHE 63.A O LEU 67.A H 2.945 2.086 SER 68.A N ALA 64.A O SER 68.A H 2.792 2.012 SER 68.A OG GLU 65.A O SER 68.A HG 2.755 1.945 ARG 69.A N LYS 66.A O ARG 69.A H 3.198 2.379 ARG 69.A NE GLU 65.A OE2 ARG 69.A HE 3.140 2.381 THR 70.A N LEU 67.A O THR 70.A H 3.093 2.407 LYS 71.A N LEU 67.A O LYS 71.A H 2.854 2.029 LYS 71.A NZ ALA 41.A O LYS 71.A HZ2 2.711 1.964 LYS 71.A NZ THR 44.A O LYS 71.A HZ3 3.140 2.554 SER 74.A N LYS 71.A O SER 74.A H 3.131 2.393 SER 74.A OG LYS 71.A O SER 74.A HG 2.766 1.974 MET 77.A N ILE 49.A O MET 77.A H 2.854 2.027 ILE 78.A N SER 98.A O ILE 78.A H 3.063 2.254 LEU 79.A N LEU 51.A O LEU 79.A H 2.841 2.013 ASP 80.A N ILE 100.A O ASP 80.A H 3.133 2.346 HIS 81.A N ASP 80.A OD1 HIS 81.A H 2.627 1.914 HIS 81.A NE2 GLU 10.A OE1 HIS 81.A HE2 2.979 2.154 LEU 85.A N HIS 81.A O LEU 85.A H 3.062 2.233 GLN 86.A N TRP 82.A O GLN 86.A H 2.727 1.875 GLN 86.A NE2 TYR 101.A OH GLN 86.A HE21 3.009 2.227 GLU 87.A N GLU 83.A O GLU 87.A H 3.144 2.311 GLU 88.A N LEU 85.A O GLU 88.A H 2.996 2.253 LEU 89.A N GLN 86.A O LEU 89.A H 3.136 2.336 VAL 92.A N GLU 88.A O VAL 92.A H 2.921 2.066 GLN 93.A N LEU 89.A O GLN 93.A H 2.754 1.936 GLN 93.A NE2 TYR 99.A OH GLN 93.A HE21 3.343 2.660 ARG 94.A N VAL 91.A O ARG 94.A H 2.977 2.210 PHE 95.A N VAL 91.A O PHE 95.A H 3.271 2.490 ALA 96.A N VAL 92.A O ALA 96.A H 2.895 2.106 VAL 97.A N ILE 76.A O VAL 97.A H 2.683 1.917 ILE 100.A N ILE 78.A O ILE 100.A H 2.924 2.158 LYS 102.A N ASP 80.A O LYS 102.A H 2.756 1.966 LYS 102.A NZ GLU 10.A OE1 LYS 102.A HZ2 2.683 2.061 GLU 107.A N GLU 107.A OE2 GLU 107.A H 2.868 2.037 LEU 109.A N LEU 105.A O LEU 109.A H 3.217 2.426 VAL 110.A N ILE 106.A O VAL 110.A H 2.959 2.128 ALA 111.A N GLU 107.A O ALA 111.A H 3.080 2.271 ARG 112.A N ASN 108.A O ARG 112.A H 3.019 2.252 ARG 112.A NH1 SER 98.A OG ARG 112.A HH11 3.364 2.772 ILE 113.A N LEU 109.A O ILE 113.A H 2.963 2.139 SER 114.A N VAL 110.A O SER 114.A H 2.952 2.124 ALA 115.A N ALA 111.A O ALA 115.A H 3.040 2.209 ILE 116.A N ARG 112.A O ILE 116.A H 3.004 2.159 PHE 117.A N ILE 113.A O PHE 117.A H 2.969 2.138 ARG 118.A N SER 114.A O ARG 118.A H 2.984 2.148 GLY 119.A N ALA 115.A O GLY 119.A H 2.876 2.048 ARG 120.A N ILE 116.A O ARG 120.A H 2.908 2.102 ARG 120.A NH2 ILE 116.A O ARG 120.A HH21 2.968 2.258 ASP 121.A N PHE 117.A O ASP 121.A H 2.991 2.208 PHE 122.A N ARG 118.A O PHE 122.A H 2.963 2.218 ILE 123.A N GLY 119.A O ILE 123.A H 3.363 2.518 ASP 124.A N ARG 120.A O ASP 124.A H 2.801 1.999 GLN 125.A N ASP 121.A O GLN 125.A H 2.911 2.159 HIS 126.A N ILE 123.A O HIS 126.A H 2.933 2.113 CYS 127.A N PHE 122.A O CYS 127.A H 3.299 2.461 CYS 127.A SG PHE 122.A O no hydrogen 3.425 N/A MET 130.A N SER 128.A OG MET 130.A H 3.037 2.187 TYR 136.A N LEU 139.A O TYR 136.A H 3.025 2.231 ARG 137.A NH1 LYS 213.A O ARG 137.A HH12 3.024 2.165 ARG 137.A NH2 SER 214.A O ARG 137.A HH22 3.067 2.308 ARG 137.A NH2 GLN 227.A O ARG 137.A HH21 2.673 1.861 LEU 139.A N TYR 136.A O LEU 139.A H 2.682 1.843 ARG 140.A N TYR 149.A O ARG 140.A H 2.720 1.885 ILE 141.A N ARG 134.A O ILE 141.A H 2.820 1.962 ASP 142.A N THR 147.A O ASP 142.A H 2.807 1.980 HIS 145.A N ASP 142.A OD1 HIS 145.A H 3.055 2.233 HIS 145.A ND1 ASP 142.A OD1 no hydrogen 2.869 N/A HIS 145.A ND1 ASP 142.A OD2 no hydrogen 2.762 N/A HIS 146.A N VAL 143.A O HIS 146.A H 3.285 2.450 THR 147.A N ASP 142.A O THR 147.A H 3.138 2.335 TYR 149.A N ARG 140.A O TYR 149.A H 2.755 1.924 ARG 150.A N GLU 153.A O ARG 150.A H 2.852 2.035 ARG 150.A NH1 LEU 207.A O ARG 150.A HH11 2.511 1.764 ARG 150.A NH2 GLU 153.A OE1 ARG 150.A HH21 2.981 2.187 GLY 151.A N ASN 138.A O GLY 151.A H 3.075 2.235 GLU 153.A N ARG 150.A O GLU 153.A H 3.101 2.281 ILE 155.A N VAL 148.A O ILE 155.A H 2.924 2.095 LEU 157.A N ILE 155.A O LEU 157.A H 2.915 2.208 THR 158.A N GLU 161.A OE1 THR 158.A H 2.900 2.067 ARG 159.A NE ASP 163.A OD1 ARG 159.A HE 2.628 1.789 ARG 159.A NE ASP 163.A OD2 ARG 159.A HE 3.422 2.709 ARG 159.A NH1 ASP 163.A OD1 ARG 159.A HH11 3.316 2.701 ARG 160.A NH1 VAL 184.A O ARG 160.A HH11 2.925 2.306 ARG 160.A NH1 GLU 188.A OE1 ARG 160.A HH12 3.186 2.536 ARG 160.A NH1 GLU 188.A OE2 ARG 160.A HH12 3.158 2.302 ARG 160.A NH2 GLU 188.A OE1 ARG 160.A HH22 2.786 2.010 GLU 161.A N THR 158.A OG1 GLU 161.A H 3.180 2.325 TYR 162.A N THR 158.A O TYR 162.A H 2.797 1.940 ASP 163.A N ARG 159.A O ASP 163.A H 2.805 1.981 LEU 164.A N ARG 160.A O LEU 164.A H 2.938 2.118 LEU 165.A N GLU 161.A O LEU 165.A H 2.852 2.021 ALA 166.A N TYR 162.A O ALA 166.A H 2.948 2.148 THR 167.A N ASP 163.A O THR 167.A H 3.026 2.277 THR 167.A OG1 ASP 163.A O THR 167.A HG1 2.894 2.117 LEU 168.A N LEU 164.A O LEU 168.A H 3.013 2.160 MET 169.A N LEU 165.A O MET 169.A H 2.901 2.044 GLY 170.A N THR 167.A O GLY 170.A H 3.063 2.376 SER 171.A N LEU 168.A O SER 171.A H 3.311 2.456 SER 171.A OG LYS 173.A O SER 171.A HG 2.825 2.193 LEU 175.A N TYR 224.A O LEU 175.A H 2.893 2.043 THR 176.A N GLN 179.A OE1 THR 176.A H 2.394 1.562 ARG 177.A NE ASP 197.A OD1 ARG 177.A HE 2.967 2.123 GLN 179.A N THR 176.A OG1 GLN 179.A H 3.099 2.308 LEU 180.A N THR 176.A O LEU 180.A H 2.776 1.985 LEU 181.A N ARG 177.A O LEU 181.A H 2.743 1.884 GLU 182.A N GLU 178.A O GLU 182.A H 3.013 2.235 SER 183.A N LEU 180.A O SER 183.A H 3.116 2.337 SER 183.A OG GLN 179.A O SER 183.A HG 3.110 2.318 SER 183.A OG LEU 180.A O SER 183.A HG 3.231 2.738 VAL 184.A N LEU 180.A O VAL 184.A H 2.800 1.961 TRP 185.A N LEU 181.A O TRP 185.A H 2.950 2.173 LYS 186.A N SER 183.A O LYS 186.A H 3.464 2.611 LYS 186.A NZ GLU 182.A OE2 LYS 186.A HZ3 3.433 2.570 GLU 188.A N TRP 185.A O GLU 188.A H 2.999 2.154 THR 193.A OG1 GLU 178.A OE2 THR 193.A HG1 3.364 2.580 ILE 195.A N GLU 192.A O ILE 195.A H 3.369 2.526 VAL 196.A N THR 193.A O VAL 196.A H 3.183 2.515 VAL 198.A N ASN 194.A O VAL 198.A H 3.276 2.550 VAL 198.A N ILE 195.A O VAL 198.A H 2.896 2.299 TYR 199.A N ILE 195.A O TYR 199.A H 3.067 2.265 ILE 200.A N VAL 196.A O ILE 200.A H 2.894 2.057 ARG 201.A N ASP 197.A O ARG 201.A H 3.199 2.350 TYR 202.A N VAL 198.A O TYR 202.A H 3.067 2.275 LEU 203.A N TYR 199.A O LEU 203.A H 2.783 1.949 ARG 204.A N ILE 200.A O ARG 204.A H 2.866 2.020 ARG 204.A NE SER 214.A OG ARG 204.A HE 3.009 2.254 ARG 204.A NE ILE 216.A O ARG 204.A HE 3.417 2.750 ARG 204.A NH1 THR 218.A OG1 ARG 204.A HH12 3.304 2.626 ARG 204.A NH2 ILE 216.A O ARG 204.A HH21 2.787 1.959 ARG 204.A NH2 THR 218.A OG1 ARG 204.A HH22 2.837 2.009 SER 205.A N ARG 201.A O SER 205.A H 3.031 2.219 SER 205.A OG ARG 201.A O SER 205.A HG 3.326 2.607 SER 205.A OG TYR 202.A O SER 205.A HG 2.792 2.192 LYS 206.A N TYR 202.A O LYS 206.A H 3.243 2.517 LYS 206.A N LEU 203.A O LYS 206.A H 3.083 2.423 LYS 206.A NZ ALA 156.A O LYS 206.A HZ3 2.672 1.961 LYS 206.A NZ GLU 161.A OE1 LYS 206.A HZ2 2.875 2.046 LEU 207.A N LEU 203.A O LEU 207.A H 2.994 2.203 ASP 208.A N ARG 204.A O ASP 208.A H 2.837 1.990 GLN 212.A N VAL 209.A O GLN 212.A H 3.123 2.341 SER 214.A OG ASP 208.A OD1 SER 214.A HG 3.243 2.507 SER 214.A OG ASP 208.A OD2 SER 214.A HG 2.503 1.757 TYR 215.A N ASP 208.A OD1 TYR 215.A H 2.906 2.079 TYR 215.A OH ASN 138.A OD1 TYR 215.A HH 2.665 1.845 ILE 216.A N SER 214.A OG ILE 216.A H 3.176 2.347 LYS 217.A N THR 225.A O LYS 217.A H 2.735 1.881 VAL 219.A N GLY 223.A O VAL 219.A H 3.064 2.218 VAL 222.A N VAL 219.A O VAL 222.A H 3.020 2.241 GLY 223.A N VAL 219.A O GLY 223.A H 3.244 2.421 TYR 224.A N LEU 175.A O TYR 224.A H 2.839 2.029 TYR 224.A OH ASP 197.A OD1 TYR 224.A HH 2.497 1.762 THR 225.A N LYS 217.A O THR 225.A H 3.042 2.231 GLN 227.A N TYR 215.A O GLN 227.A H 2.805 2.032