Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5uck_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N PRO 73.A O MET 1.A H2 3.161 2.443 MET 1.A N ILE 75.A O MET 1.A H1 2.696 2.015 VAL 3.A N VAL 77.A O VAL 3.A H 2.702 1.886 GLY 5.A N THR 99.A O GLY 5.A H 3.268 2.439 ASN 6.A N SER 130.A OG ASN 6.A H 3.092 2.288 GLU 7.A N LYS 4.A O GLU 7.A H 2.935 2.219 ILE 8.A N GLY 5.A O ILE 8.A H 3.153 2.532 LEU 9.A N GLY 5.A O LEU 9.A H 3.111 2.300 LEU 10.A N ASN 6.A O LEU 10.A H 2.868 2.035 LYS 11.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 11.A HZ3 3.145 2.458 ALA 12.A N ILE 8.A O ALA 12.A H 3.200 2.380 HIS 13.A N LEU 9.A O HIS 13.A H 2.756 1.951 LYS 14.A N LEU 10.A O LYS 14.A H 2.840 2.037 GLU 15.A N LYS 11.A O GLU 15.A H 2.980 2.198 GLY 16.A N ALA 12.A O GLY 16.A H 2.786 2.027 TYR 17.A N ALA 12.A O TYR 17.A H 3.177 2.404 GLY 18.A N LEU 285.A O GLY 18.A H 2.942 2.087 VAL 19.A N ASN 234.A O VAL 19.A H 2.792 1.937 ALA 21.A N VAL 236.A O ALA 21.A H 2.858 2.005 PHE 22.A N PHE 45.A O PHE 22.A H 2.905 2.092 ASN 23.A N THR 238.A O ASN 23.A H 3.194 2.403 ASN 23.A ND2 ASP 82.A OD2 ASN 23.A HD21 2.911 2.060 PHE 24.A N GLN 47.A O PHE 24.A H 3.065 2.348 GLU 28.A N GLU 28.A OE1 GLU 28.A H 2.965 2.306 MET 29.A N ASN 26.A OD1 MET 29.A H 3.047 2.201 LEU 30.A N ASN 26.A O LEU 30.A H 3.285 2.453 ASN 31.A N PHE 27.A O ASN 31.A H 2.794 1.955 ASN 31.A ND2 GLN 271.A OE1 ASN 31.A HD22 2.688 1.887 ALA 32.A N GLU 28.A O ALA 32.A H 3.199 2.355 ILE 33.A N MET 29.A O ILE 33.A H 2.987 2.146 PHE 34.A N LEU 30.A O PHE 34.A H 3.006 2.219 GLU 35.A N ASN 31.A O GLU 35.A H 2.902 2.054 ALA 36.A N ALA 32.A O ALA 36.A H 2.994 2.165 GLY 37.A N ILE 33.A O GLY 37.A H 3.097 2.291 ASN 38.A N PHE 34.A O ASN 38.A H 2.908 2.076 GLU 39.A N GLU 35.A O GLU 39.A H 2.933 2.159 GLU 40.A N ALA 36.A O GLU 40.A H 2.919 2.133 SER 42.A N GLY 37.A O SER 42.A H 3.038 2.203 SER 42.A OG PRO 43.A O SER 42.A HG 2.915 2.083 LEU 44.A N PRO 76.A O LEU 44.A H 2.955 2.146 ILE 46.A N ALA 78.A O ILE 46.A H 2.836 1.984 GLN 47.A N PHE 22.A O GLN 47.A H 2.834 2.014 GLN 47.A NE2 ASN 23.A OD1 GLN 47.A HE21 3.144 2.404 ALA 48.A N HIS 80.A O ALA 48.A H 3.034 2.219 ALA 52.A N SER 49.A OG ALA 52.A H 3.015 2.161 ILE 53.A N SER 49.A O ILE 53.A H 2.913 2.101 LYS 54.A N GLU 50.A O LYS 54.A H 2.910 2.152 TYR 55.A N GLY 51.A O TYR 55.A H 2.920 2.131 MET 56.A N ALA 52.A O MET 56.A H 2.892 2.055 GLY 57.A N ILE 53.A O GLY 57.A H 2.680 1.985 MET 60.A N GLY 57.A O MET 60.A H 3.032 2.384 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 3.027 2.199 VAL 62.A N ILE 58.A O VAL 62.A H 3.157 2.299 GLY 63.A N ASP 59.A O GLY 63.A H 2.982 2.176 MET 64.A N MET 60.A O MET 64.A H 2.860 2.004 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.318 2.490 LYS 66.A N VAL 62.A O LYS 66.A H 2.918 2.087 ILE 67.A N GLY 63.A O ILE 67.A H 3.058 2.226 MET 68.A N MET 64.A O MET 68.A H 2.989 2.180 CYS 69.A N VAL 65.A O CYS 69.A H 2.833 2.044 CYS 69.A SG VAL 65.A O CYS 69.A HG 3.373 2.440 GLU 70.A N LYS 66.A O GLU 70.A H 3.102 2.278 ARG 71.A N ILE 67.A O ARG 71.A H 3.004 2.243 TYR 72.A N MET 68.A O TYR 72.A H 3.056 2.366 TYR 72.A N CYS 69.A O TYR 72.A H 3.185 2.554 ILE 75.A N TYR 72.A O ILE 75.A H 3.185 2.336 VAL 77.A N MET 1.A O VAL 77.A H 2.895 2.098 ALA 78.A N LEU 44.A O ALA 78.A H 3.030 2.211 LEU 79.A N THR 99.A OG1 LEU 79.A H 2.982 2.174 HIS 80.A N ILE 46.A O HIS 80.A H 2.846 2.073 HIS 80.A ND1 SER 100.A OG HIS 80.A HD1 2.566 1.719 LEU 81.A N SER 100.A O LEU 81.A H 2.965 2.156 ASP 82.A N ALA 48.A O ASP 82.A H 2.978 2.127 HIS 83.A ND1.A ASP 82.A OD1 HIS 83.A HD1.A 2.806 1.977 HIS 83.A ND1.B ASP 104.A OD2 HIS 83.A HD1.B 2.955 2.238 HIS 83.A NE2.B HIS 194.A ND1.B no hydrogen 2.795 N/A GLY 84.A N MET 102.A O GLY 84.A H 2.890 2.223 THR 85.A N GLU 50.A OE1 THR 85.A H 2.829 2.044 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE1 THR 85.A HG1 2.984 2.154 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE2 THR 85.A HG1 2.878 2.278 SER 89.A N THR 86.A OG1 SER 89.A H 2.888 2.036 SER 89.A OG GLU 50.A OE1 SER 89.A HG 2.608 1.784 CYS 90.A N THR 86.A O CYS 90.A H 3.242 2.397 CYS 90.A SG THR 86.A O CYS 90.A HG 3.562 2.650 GLU 91.A N PHE 87.A O GLU 91.A H 2.758 1.942 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.827 2.035 ALA 93.A N SER 89.A O ALA 93.A H 3.012 2.197 VAL 94.A N CYS 90.A O VAL 94.A H 2.917 2.085 LYS 95.A N GLU 91.A O LYS 95.A H 2.952 2.118 ALA 96.A N LYS 92.A O ALA 96.A H 2.928 2.210 GLY 97.A N ALA 93.A O GLY 97.A H 3.150 2.441 GLY 97.A N VAL 94.A O GLY 97.A H 3.302 2.602 PHE 98.A N ALA 93.A O PHE 98.A H 2.996 2.191 THR 99.A N LEU 79.A O THR 99.A H 2.925 2.228 THR 99.A OG1 VAL 3.A O THR 99.A HG1 2.796 2.161 VAL 101.A N SER 130.A O VAL 101.A H 2.889 2.109 MET 102.A N LEU 81.A O MET 102.A H 2.963 2.216 ILE 103.A N GLU 132.A O ILE 103.A H 2.998 2.194 ASP 104.A N GLY 84.A O ASP 104.A H 2.862 2.009 SER 106.A N ASP 104.A OD1 SER 106.A H 3.223 2.370 SER 106.A OG ASP 104.A OD1 SER 106.A HG 3.018 2.211 HIS 108.A N ALA 105.A O HIS 108.A H 3.013 2.168 GLU 111.A N GLU 111.A OE1 GLU 111.A H 2.672 1.983 ASN 113.A N ALA 109.A O ASN 113.A H 2.953 2.095 ASN 113.A ND2 GLU 134.A O ASN 113.A HD21 2.848 2.010 LEU 114.A N PHE 110.A O LEU 114.A H 2.927 2.074 GLU 115.A N GLU 111.A O GLU 115.A H 3.034 2.248 LEU 116.A N GLU 112.A O LEU 116.A H 3.052 2.199 THR 117.A N ASN 113.A O THR 117.A H 2.907 2.062 THR 117.A OG1 ASN 113.A O THR 117.A HG1 2.773 2.092 SER 118.A N LEU 114.A O SER 118.A H 2.885 2.052 SER 118.A OG LEU 114.A O SER 118.A HG 2.799 2.109 LYS 119.A N GLU 115.A O LYS 119.A H 3.064 2.260 VAL 120.A N LEU 116.A O VAL 120.A H 2.909 2.075 VAL 121.A N THR 117.A O VAL 121.A H 2.789 2.009 LYS 122.A N SER 118.A O LYS 122.A H 3.043 2.224 MET 123.A N LYS 119.A O MET 123.A H 3.275 2.441 ALA 124.A N VAL 120.A O ALA 124.A H 2.829 1.972 HIS 125.A N VAL 121.A O HIS 125.A H 2.724 1.870 HIS 125.A NE2 ASP 154.A OD2 HIS 125.A HE2 2.498 1.664 ASN 126.A N LYS 122.A O ASN 126.A H 3.205 2.406 ALA 127.A N ALA 124.A O ALA 127.A H 2.896 2.165 GLY 128.A N HIS 125.A O GLY 128.A H 3.169 2.315 VAL 129.A N ALA 124.A O VAL 129.A H 2.875 2.028 SER 130.A N THR 99.A O SER 130.A H 3.366 2.520 VAL 131.A N ASP 154.A OD2 VAL 131.A H 2.889 2.143 GLU 132.A N VAL 101.A O GLU 132.A H 2.828 2.005 ALA 133.A N TYR 155.A O ALA 133.A H 3.279 2.514 LEU 135.A N ALA 157.A O LEU 135.A H 3.158 2.336 ARG 137.A NE SER 106.A O no hydrogen 3.193 N/A ARG 137.A NH2 HIS 108.A O no hydrogen 3.106 N/A VAL 139.A N ALA 159.A O VAL 139.A H 3.018 2.238 LYS 142.A NZ GLU 145.A OE1 LYS 142.A HZ2 2.847 2.221 ALA 144.A N ASN 140.A O ALA 144.A H 2.825 1.995 GLU 145.A N PRO 141.A O GLU 145.A H 2.825 2.025 GLN 146.A N LYS 142.A O GLN 146.A H 3.115 2.273 GLN 146.A NE2 GLU 150.A OE2 GLN 146.A HE21 3.349 2.594 PHE 147.A N GLU 143.A O PHE 147.A H 2.632 1.781 VAL 148.A N ALA 144.A O VAL 148.A H 2.918 2.092 LYS 149.A N GLU 145.A O LYS 149.A H 3.169 2.352 GLU 150.A N GLN 146.A O GLU 150.A H 3.010 2.197 SER 151.A N PHE 147.A O SER 151.A H 3.010 2.176 SER 151.A OG PHE 147.A O SER 151.A HG 2.781 2.137 GLN 152.A N VAL 148.A O GLN 152.A H 2.964 2.174 VAL 153.A N SER 151.A OG VAL 153.A H 3.045 2.227 ASP 154.A N VAL 131.A O ASP 154.A H 2.949 2.239 TYR 155.A N VAL 131.A O TYR 155.A H 3.152 2.365 TYR 155.A OH SER 100.A OG TYR 155.A HH 2.759 1.996 LEU 156.A N PRO 190.A O LEU 156.A H 3.192 2.412 ALA 157.A N ALA 133.A O ALA 157.A H 2.839 2.007 ALA 159.A N LEU 135.A O ALA 159.A H 3.027 2.214 THR 162.A OG1 HIS 194.A O.A THR 162.A HG1 2.656 2.020 THR 162.A OG1 HIS 194.A O.B THR 162.A HG1 2.561 1.946 HIS 164.A NE2 HIS 83.A NE2.B no hydrogen 2.853 N/A LYS 168.A N ALA 166.A O no hydrogen 2.731 N/A LYS 168.A N LYS 218.A O no hydrogen 3.442 N/A LYS 168.A NZ SER 163.A O no hydrogen 2.992 N/A LYS 168.A NZ GLY 165.A O no hydrogen 2.283 N/A LYS 168.A NZ GLY 195.A O no hydrogen 3.132 N/A ASP 176.A N ILE 160.A O ASP 176.A H 3.019 2.193 ARG 179.A N ASP 176.A OD1 ARG 179.A H 3.141 2.285 ARG 179.A NE ASP 176.A OD2 ARG 179.A HE 2.821 2.031 ARG 179.A NH1 VAL 139.A O ARG 179.A HH11 2.770 2.001 ARG 179.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 179.A HH21 3.515 2.921 LEU 180.A N ASP 176.A O LEU 180.A H 3.160 2.362 GLN 181.A N PHE 177.A O GLN 181.A H 2.999 2.172 GLU 182.A N GLU 178.A O GLU 182.A H 3.085 2.259 VAL 183.A N ARG 179.A O VAL 183.A H 3.026 2.167 LYS 184.A N LEU 180.A O LYS 184.A H 2.840 1.991 LYS 184.A NZ ILE 189.A O LYS 184.A HZ2 3.164 2.323 LYS 184.A NZ GLY 232.A O LYS 184.A HZ3 2.682 1.868 ARG 185.A N GLN 181.A O ARG 185.A H 2.824 1.990 LEU 186.A N GLU 182.A O LEU 186.A H 2.878 2.052 THR 187.A N VAL 183.A O THR 187.A H 2.839 2.052 THR 187.A OG1 VAL 183.A O THR 187.A HG1 2.853 2.053 ASN 188.A N LYS 184.A O ASN 188.A H 2.864 2.027 LEU 191.A N ASN 234.A OD1 LEU 191.A H 3.347 2.601 VAL 192.A N LEU 156.A O VAL 192.A H 2.872 2.185 LEU 193.A N LYS 235.A O LEU 193.A H 2.829 2.007 HIS 194.A ND1.B HIS 83.A NE2.B no hydrogen 2.795 N/A HIS 194.A NE2.A GLU 132.A OE2 HIS 194.A HE2.A 2.708 1.867 HIS 194.A NE2.B GLU 132.A OE2 HIS 194.A HE2.B 2.587 1.829 ALA 196.A N ASN 237.A O ALA 196.A H 3.231 2.457 ALA 198.A N ASP 241.A OD2 ALA 198.A H 2.773 1.975 ILE 199.A N ASP 241.A OD1 ILE 199.A H 2.645 1.857 ILE 199.A N ASP 241.A OD2 ILE 199.A H 3.338 2.577 ARG 204.A N PRO 200.A O ARG 204.A H 3.144 2.307 ARG 204.A NH2 SER 217.A O.A ARG 204.A HH22 2.462 1.810 ARG 204.A NH2 SER 217.A O.B ARG 204.A HH22 2.456 1.809 LYS 205.A N ASP 201.A O LYS 205.A H 2.962 2.130 LYS 205.A NZ ASP 209.A OD1 LYS 205.A HZ3 2.746 1.907 SER 206.A N ASN 202.A O SER 206.A H 2.852 2.008 TYR 207.A N VAL 203.A O TYR 207.A H 2.945 2.131 LEU 208.A N ARG 204.A O LEU 208.A H 2.922 2.078 ASP 209.A N LYS 205.A O ASP 209.A H 2.757 1.901 ALA 210.A N SER 206.A O ALA 210.A H 3.159 2.445 ALA 210.A N TYR 207.A O ALA 210.A H 3.132 2.501 GLY 211.A N LEU 208.A O GLY 211.A H 2.825 2.025 GLY 212.A N TYR 207.A O GLY 212.A H 2.963 2.152 SER 217.A OG.A LEU 214.A O SER 217.A HG.A 3.149 2.622 VAL 220.A N SER 197.A O VAL 220.A H 2.883 2.067 GLU 223.A N GLU 223.A OE1 GLU 223.A H 2.679 1.922 PHE 224.A N PRO 221.A O PHE 224.A H 3.015 2.397 LEU 225.A N PRO 221.A O LEU 225.A H 3.103 2.295 GLN 226.A N PHE 222.A O GLN 226.A H 2.975 2.143 GLN 226.A NE2 LEU 284.A O GLN 226.A HE21 3.521 2.703 GLU 227.A N GLU 223.A O GLU 227.A H 3.023 2.198 SER 228.A N PHE 224.A O SER 228.A H 2.757 1.955 SER 228.A OG PHE 224.A O SER 228.A HG 3.025 2.280 VAL 229.A N LEU 225.A O VAL 229.A H 3.032 2.226 LYS 230.A N GLN 226.A O LYS 230.A H 2.927 2.078 GLY 231.A N GLU 227.A O GLY 231.A H 2.784 2.088 GLY 232.A N SER 228.A O GLY 232.A H 3.051 2.462 GLY 232.A N VAL 229.A O GLY 232.A H 3.031 2.303 ILE 233.A N SER 228.A O ILE 233.A H 3.019 2.166 ASN 234.A N LEU 191.A O ASN 234.A H 2.840 1.987 ASN 234.A ND2 TYR 17.A O ASN 234.A HD22 3.275 2.417 LYS 235.A N LEU 191.A O LYS 235.A H 3.129 2.408 LYS 235.A NZ GLN 47.A OE1 LYS 235.A HZ1 2.471 1.721 LYS 235.A NZ GLU 132.A OE1 LYS 235.A HZ2 2.960 2.246 LYS 235.A NZ ASN 237.A OD1 LYS 235.A HZ3 2.483 1.673 VAL 236.A N VAL 19.A O VAL 236.A H 3.017 2.225 ASN 237.A N LEU 193.A O ASN 237.A H 2.857 2.008 THR 238.A N ALA 21.A O THR 238.A H 2.828 2.016 ASP 241.A N SER 197.A OG ASP 241.A H 2.956 2.118 ARG 243.A N ASP 239.A O ARG 243.A H 3.104 2.300 ARG 243.A NE ASP 239.A OD1 ARG 243.A HE 2.787 1.989 ARG 243.A NH2 ASP 239.A OD2 ARG 243.A HH21 2.836 2.151 ILE 244.A N THR 240.A O ILE 244.A H 2.982 2.132 ALA 245.A N ASP 241.A O ALA 245.A H 3.170 2.315 PHE 246.A N LEU 242.A O PHE 246.A H 2.954 2.136 ILE 247.A N ARG 243.A O ILE 247.A H 2.845 1.986 ALA 248.A N ILE 244.A O ALA 248.A H 2.844 2.038 GLU 249.A N PHE 246.A O GLU 249.A H 3.097 2.437 VAL 250.A N PHE 246.A O VAL 250.A H 3.335 2.540 ARG 251.A N ILE 247.A O ARG 251.A H 2.896 2.037 LYS 252.A N ALA 248.A O LYS 252.A H 3.026 2.270 VAL 253.A N GLU 249.A O VAL 253.A H 2.972 2.168 ALA 254.A N VAL 250.A O ALA 254.A H 3.120 2.268 ASN 255.A N ARG 251.A O ASN 255.A H 3.008 2.224 ASN 255.A ND2 ALA 210.A O ASN 255.A HD21 2.941 2.219 GLU 256.A N LYS 252.A O GLU 256.A H 3.147 2.419 ASP 257.A N VAL 253.A O ASP 257.A H 3.226 2.571 LYS 258.A NZ ALA 254.A O LYS 258.A HZ3 3.345 2.564 SER 259.A N ASP 257.A OD1 SER 259.A H 2.983 2.202 SER 259.A OG ASP 257.A OD1 SER 259.A HG 2.835 2.067 GLN 260.A N ASP 257.A O GLN 260.A H 3.275 2.425 ASP 262.A N GLN 260.A OE1 ASP 262.A H 3.036 2.207 ARG 264.A N ASP 262.A OD1 ARG 264.A H 2.913 2.125 LYS 265.A N ASP 262.A O LYS 265.A H 2.957 2.322 PHE 266.A N LEU 263.A O PHE 266.A H 3.115 2.429 PHE 267.A N LEU 263.A O PHE 267.A H 3.035 2.286 SER 268.A N ARG 264.A O SER 268.A H 2.863 2.017 GLN 271.A N PHE 267.A O GLN 271.A H 2.813 1.971 LEU 272.A N SER 268.A O LEU 272.A H 3.109 2.305 ALA 273.A N PRO 269.A O ALA 273.A H 3.063 2.225 LEU 274.A N ALA 270.A O LEU 274.A H 3.074 2.236 LYS 275.A N GLN 271.A O LYS 275.A H 2.829 1.983 LYS 275.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 275.A HZ2 3.337 2.716 LYS 275.A NZ GLU 39.A OE2 LYS 275.A HZ2 3.193 2.319 ASN 276.A N LEU 272.A O ASN 276.A H 3.038 2.212 VAL 277.A N ALA 273.A O VAL 277.A H 3.157 2.327 VAL 278.A N LEU 274.A O VAL 278.A H 3.083 2.272 LYS 279.A N LYS 275.A O LYS 279.A H 2.842 1.997 LYS 279.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 279.A HZ2 2.614 1.729 GLU 280.A N ASN 276.A O GLU 280.A H 3.050 2.190 ARG 281.A N VAL 277.A O ARG 281.A H 2.983 2.183 ARG 281.A NH1 ASP 241.A OD2 ARG 281.A HH12 2.950 2.177 ARG 281.A NH2 ASP 241.A OD2 ARG 281.A HH22 2.986 2.225 MET 282.A N VAL 278.A O MET 282.A H 2.812 1.988 LYS 283.A N LYS 279.A O LYS 283.A H 3.075 2.259 LYS 283.A NZ GLU 280.A OE2 LYS 283.A HZ1 3.062 2.245 LEU 284.A N GLU 280.A O LEU 284.A H 2.978 2.169 LEU 285.A N ARG 281.A O LEU 285.A H 2.954 2.134 GLY 286.A N MET 282.A O GLY 286.A H 3.103 2.433 SER 287.A N MET 282.A O SER 287.A H 3.134 2.357 ASN 289.A N GLU 40.A O ASN 289.A H 2.810 2.005 LYS 290.A N ASN 41.A O LYS 290.A H 2.985 2.360 LYS 290.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 290.A HZ1 2.625 1.863 ILE 291.A N ASN 41.A O ILE 291.A H 3.341 2.608