Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5ud0_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N PRO 73.A O MET 1.A H1 3.017 2.332 VAL 3.A N VAL 77.A O VAL 3.A H 2.764 1.968 GLY 5.A N THR 99.A O GLY 5.A H 3.146 2.309 ASN 6.A N SER 130.A OG ASN 6.A H 2.931 2.118 GLU 7.A N LYS 4.A O GLU 7.A H 3.076 2.378 ILE 8.A N GLY 5.A O ILE 8.A H 3.174 2.564 LEU 9.A N GLY 5.A O LEU 9.A H 3.139 2.319 LEU 10.A N ASN 6.A O LEU 10.A H 2.611 1.779 LYS 11.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 11.A HZ3 2.991 2.309 ALA 12.A N ILE 8.A O ALA 12.A H 3.308 2.488 HIS 13.A N LEU 9.A O HIS 13.A H 2.733 1.902 LYS 14.A N LEU 10.A O LYS 14.A H 2.902 2.063 GLU 15.A N LYS 11.A O GLU 15.A H 2.935 2.113 TYR 17.A N ALA 12.A O TYR 17.A H 3.028 2.256 GLY 18.A N LEU 276.A O GLY 18.A H 2.994 2.138 VAL 19.A N ASN 225.A O VAL 19.A H 2.718 1.894 ALA 21.A N VAL 227.A O ALA 21.A H 2.844 1.994 PHE 22.A N PHE 45.A O PHE 22.A H 2.956 2.122 ASN 23.A N THR 229.A O ASN 23.A H 3.113 2.298 ASN 23.A ND2 ASP 82.A OD2 ASN 23.A HD21 3.062 2.215 PHE 24.A N GLN 47.A O PHE 24.A H 3.066 2.320 GLU 28.A N GLU 28.A OE1 GLU 28.A H 2.943 2.226 MET 29.A N ASN 26.A OD1 MET 29.A H 3.060 2.211 LEU 30.A N ASN 26.A O LEU 30.A H 3.240 2.413 ASN 31.A N PHE 27.A O ASN 31.A H 2.801 1.972 ASN 31.A ND2 GLN 262.A OE1 ASN 31.A HD22 2.826 2.016 ALA 32.A N GLU 28.A O ALA 32.A H 3.198 2.349 ILE 33.A N MET 29.A O ILE 33.A H 3.091 2.240 PHE 34.A N LEU 30.A O PHE 34.A H 3.010 2.173 GLU 35.A N ASN 31.A O GLU 35.A H 2.858 2.030 ALA 36.A N ALA 32.A O ALA 36.A H 2.968 2.122 GLY 37.A N ILE 33.A O GLY 37.A H 2.983 2.150 ASN 38.A N PHE 34.A O ASN 38.A H 2.821 1.984 GLU 39.A N GLU 35.A O GLU 39.A H 2.862 2.100 GLU 40.A N ALA 36.A O GLU 40.A H 2.875 2.084 SER 42.A N GLY 37.A O SER 42.A H 3.083 2.254 LEU 44.A N PRO 76.A O LEU 44.A H 2.739 1.901 ILE 46.A N ALA 78.A O ILE 46.A H 2.795 1.944 GLN 47.A N PHE 22.A O GLN 47.A H 2.901 2.050 GLN 47.A NE2 ASN 23.A OD1 GLN 47.A HE21 2.954 2.159 ALA 48.A N HIS 80.A O ALA 48.A H 2.948 2.142 ALA 52.A N SER 49.A OG ALA 52.A H 3.023 2.215 ILE 53.A N SER 49.A O ILE 53.A H 2.938 2.095 LYS 54.A N GLU 50.A O LYS 54.A H 2.949 2.139 TYR 55.A N GLY 51.A O TYR 55.A H 3.014 2.265 MET 56.A N ALA 52.A O MET 56.A H 2.834 1.987 GLY 57.A N ILE 53.A O GLY 57.A H 2.722 2.053 MET 60.A N GLY 57.A O MET 60.A H 2.993 2.357 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 2.956 2.125 VAL 62.A N ILE 58.A O VAL 62.A H 2.983 2.124 GLY 63.A N ASP 59.A O GLY 63.A H 2.951 2.151 MET 64.A N MET 60.A O MET 64.A H 2.808 1.953 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.292 2.450 LYS 66.A N VAL 62.A O LYS 66.A H 2.863 2.035 ILE 67.A N GLY 63.A O ILE 67.A H 3.036 2.210 MET 68.A N MET 64.A O MET 68.A H 2.962 2.150 CYS 69.A N VAL 65.A O CYS 69.A H 2.856 2.018 CYS 69.A SG VAL 65.A O CYS 69.A HG 3.441 2.564 GLU 70.A N LYS 66.A O GLU 70.A H 3.105 2.277 ARG 71.A N ILE 67.A O ARG 71.A H 2.971 2.247 TYR 72.A N MET 68.A O TYR 72.A H 3.007 2.334 TYR 72.A N CYS 69.A O TYR 72.A H 3.143 2.477 ILE 75.A N TYR 72.A O ILE 75.A H 3.177 2.317 VAL 77.A N MET 1.A O VAL 77.A H 3.271 2.492 ALA 78.A N LEU 44.A O ALA 78.A H 2.972 2.168 LEU 79.A N THR 99.A OG1 LEU 79.A H 3.037 2.238 HIS 80.A N ILE 46.A O HIS 80.A H 2.767 1.966 LEU 81.A N SER 100.A O LEU 81.A H 2.880 2.084 ASP 82.A N ALA 48.A O ASP 82.A H 2.995 2.145 HIS 83.A ND1 ASP 82.A OD1 HIS 83.A HD1 2.759 2.053 HIS 83.A NE2 HIS 163.A NE2 no hydrogen 3.225 N/A GLY 84.A N MET 102.A O GLY 84.A H 2.890 2.252 THR 85.A N GLU 50.A OE1 THR 85.A H 2.817 2.005 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE1 THR 85.A HG1 3.065 2.240 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE2 THR 85.A HG1 2.685 2.060 GLU 88.A N GLU 88.A OE1 GLU 88.A H 2.768 2.038 SER 89.A N THR 86.A OG1 SER 89.A H 3.037 2.211 SER 89.A OG GLU 50.A OE1 SER 89.A HG 2.514 1.702 CYS 90.A N THR 86.A O CYS 90.A H 3.194 2.352 CYS 90.A SG THR 86.A O CYS 90.A HG 3.544 2.536 GLU 91.A N PHE 87.A O GLU 91.A H 2.840 2.036 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.921 2.079 ALA 93.A N SER 89.A O ALA 93.A H 3.041 2.220 VAL 94.A N CYS 90.A O VAL 94.A H 2.897 2.060 LYS 95.A N GLU 91.A O LYS 95.A H 2.859 2.040 ALA 96.A N LYS 92.A O ALA 96.A H 2.950 2.172 GLY 97.A N ALA 93.A O GLY 97.A H 3.146 2.468 GLY 97.A N VAL 94.A O GLY 97.A H 3.204 2.484 PHE 98.A N ALA 93.A O PHE 98.A H 3.025 2.202 THR 99.A N LEU 79.A O THR 99.A H 2.946 2.222 THR 99.A OG1 VAL 3.A O THR 99.A HG1 2.756 2.096 VAL 101.A N SER 130.A O VAL 101.A H 2.946 2.156 MET 102.A N LEU 81.A O MET 102.A H 2.838 2.067 ILE 103.A N GLU 132.A O ILE 103.A H 3.016 2.203 ASP 104.A N GLY 84.A O ASP 104.A H 2.834 1.986 SER 106.A N ASP 104.A OD1 SER 106.A H 3.105 2.269 SER 106.A OG ASP 104.A OD1 SER 106.A HG 2.871 2.150 HIS 108.A N ALA 105.A O HIS 108.A H 2.922 2.104 GLU 112.A N ALA 109.A O GLU 112.A H 2.879 2.247 ASN 113.A N ALA 109.A O ASN 113.A H 2.888 2.041 ASN 113.A ND2 GLU 134.A O ASN 113.A HD21 2.884 2.038 LEU 114.A N PHE 110.A O LEU 114.A H 2.863 2.084 GLU 115.A N GLU 111.A O GLU 115.A H 3.277 2.460 LEU 116.A N GLU 112.A O LEU 116.A H 3.334 2.477 THR 117.A N ASN 113.A O THR 117.A H 3.151 2.308 THR 117.A OG1 ASN 113.A O THR 117.A HG1 2.684 1.986 SER 118.A N LEU 114.A O SER 118.A H 2.876 2.071 SER 118.A OG LEU 114.A O SER 118.A HG 2.694 1.958 LYS 119.A N GLU 115.A O LYS 119.A H 3.006 2.226 VAL 120.A N LEU 116.A O VAL 120.A H 2.980 2.148 VAL 121.A N THR 117.A O VAL 121.A H 2.869 2.082 LYS 122.A N SER 118.A O LYS 122.A H 3.094 2.257 MET 123.A N LYS 119.A O MET 123.A H 3.216 2.359 ALA 124.A N VAL 120.A O ALA 124.A H 2.733 1.879 HIS 125.A N VAL 121.A O HIS 125.A H 2.705 1.850 HIS 125.A NE2 ASP 153.A OD2 HIS 125.A HE2 2.776 1.925 ASN 126.A N LYS 122.A O ASN 126.A H 2.987 2.150 ALA 127.A N ALA 124.A O ALA 127.A H 2.955 2.261 GLY 128.A N HIS 125.A O GLY 128.A H 3.027 2.198 VAL 129.A N ALA 124.A O VAL 129.A H 2.954 2.132 SER 130.A N THR 99.A O SER 130.A H 3.393 2.557 VAL 131.A N ASP 153.A OD2 VAL 131.A H 2.839 2.060 GLU 132.A N VAL 101.A O GLU 132.A H 2.918 2.094 ALA 133.A N TYR 154.A O ALA 133.A H 3.186 2.412 LEU 135.A N ALA 156.A O LEU 135.A H 3.152 2.372 VAL 138.A N ALA 158.A O VAL 138.A H 3.019 2.175 GLU 142.A N ASN 139.A OD1 GLU 142.A H 2.864 2.046 ALA 143.A N ASN 139.A O ALA 143.A H 2.861 2.039 GLU 144.A N PRO 140.A O GLU 144.A H 2.741 1.926 GLN 145.A N LYS 141.A O GLN 145.A H 3.019 2.191 PHE 146.A N GLU 142.A O PHE 146.A H 2.663 1.816 VAL 147.A N ALA 143.A O VAL 147.A H 2.905 2.063 LYS 148.A N GLU 144.A O LYS 148.A H 3.115 2.304 GLU 149.A N GLN 145.A O GLU 149.A H 2.979 2.133 SER 150.A N PHE 146.A O SER 150.A H 3.002 2.192 SER 150.A OG PHE 146.A O SER 150.A HG 2.766 2.031 GLN 151.A N VAL 147.A O GLN 151.A H 2.964 2.183 VAL 152.A N SER 150.A OG VAL 152.A H 3.293 2.473 ASP 153.A N VAL 131.A O ASP 153.A H 2.986 2.247 TYR 154.A N VAL 131.A O TYR 154.A H 3.219 2.442 TYR 154.A OH SER 100.A OG TYR 154.A HH 2.587 1.794 LEU 155.A N PRO 181.A O LEU 155.A H 3.326 2.561 ALA 156.A N ALA 133.A O ALA 156.A H 2.753 1.911 ALA 158.A N LEU 135.A O ALA 158.A H 3.091 2.267 THR 161.A OG1 HIS 185.A O THR 161.A HG1 2.965 2.143 ASP 167.A N ILE 159.A O ASP 167.A H 2.821 1.961 ARG 170.A N ASP 167.A OD1 ARG 170.A H 3.297 2.458 ARG 170.A NE ASP 167.A OD2 ARG 170.A HE 2.599 1.770 ARG 170.A NH1 VAL 138.A O ARG 170.A HH11 2.736 1.959 ARG 170.A NH2 ASP 167.A OD2 ARG 170.A HH21 3.315 2.715 LEU 171.A N ASP 167.A O LEU 171.A H 2.846 2.024 GLN 172.A N PHE 168.A O GLN 172.A H 2.867 2.047 GLU 173.A N GLU 169.A O GLU 173.A H 3.010 2.213 VAL 174.A N ARG 170.A O VAL 174.A H 3.006 2.162 LYS 175.A N LEU 171.A O LYS 175.A H 2.976 2.140 LYS 175.A NZ ILE 180.A O LYS 175.A HZ2 3.132 2.250 LYS 175.A NZ GLY 223.A O LYS 175.A HZ3 2.765 1.900 ARG 176.A N GLN 172.A O ARG 176.A H 2.874 2.025 LEU 177.A N GLU 173.A O LEU 177.A H 2.920 2.082 THR 178.A N VAL 174.A O THR 178.A H 2.864 2.050 THR 178.A OG1 VAL 174.A O THR 178.A HG1 2.638 1.810 ASN 179.A N LYS 175.A O ASN 179.A H 2.739 1.931 LEU 182.A N ASN 225.A OD1 LEU 182.A H 3.321 2.574 VAL 183.A N LEU 155.A O VAL 183.A H 2.784 2.053 LEU 184.A N LYS 226.A O LEU 184.A H 2.919 2.083 HIS 185.A ND1 HIS 83.A NE2 no hydrogen 3.067 N/A HIS 185.A NE2 GLU 132.A OE2 HIS 185.A HE2 2.616 1.888 ALA 189.A N ASP 232.A OD2 ALA 189.A H 2.579 1.787 ARG 195.A N PRO 191.A O ARG 195.A H 2.860 2.025 ARG 195.A NH1 SER 208.A O ARG 195.A HH12 3.426 2.632 LYS 196.A N ASP 192.A O LYS 196.A H 2.978 2.160 LYS 196.A NZ ASP 200.A OD2 LYS 196.A HZ2 2.877 2.149 SER 197.A N ASN 193.A O SER 197.A H 3.042 2.207 SER 197.A OG ASN 193.A O SER 197.A HG 3.312 2.705 TYR 198.A N VAL 194.A O TYR 198.A H 3.047 2.225 LEU 199.A N ARG 195.A O LEU 199.A H 3.048 2.194 ASP 200.A N LYS 196.A O ASP 200.A H 2.712 1.862 ALA 201.A N SER 197.A O ALA 201.A H 3.166 2.456 ALA 201.A N TYR 198.A O ALA 201.A H 3.238 2.572 GLY 202.A N LEU 199.A O GLY 202.A H 2.938 2.115 GLY 203.A N TYR 198.A O GLY 203.A H 2.887 2.102 VAL 211.A N SER 188.A O VAL 211.A H 3.114 2.363 GLU 214.A N GLU 214.A OE1 GLU 214.A H 2.605 1.819 PHE 215.A N PRO 212.A O PHE 215.A H 2.838 2.196 GLN 217.A N PHE 213.A O GLN 217.A H 2.911 2.079 GLU 218.A N GLU 214.A O GLU 218.A H 2.773 1.918 SER 219.A N PHE 215.A O SER 219.A H 2.988 2.214 SER 219.A OG PHE 215.A O SER 219.A HG 3.370 2.806 SER 219.A OG LEU 216.A O SER 219.A HG 2.590 1.887 VAL 220.A N LEU 216.A O VAL 220.A H 2.977 2.150 LYS 221.A N GLN 217.A O LYS 221.A H 2.973 2.134 GLY 222.A N GLU 218.A O GLY 222.A H 2.863 2.164 GLY 222.A N SER 219.A O GLY 222.A H 3.075 2.484 GLY 223.A N VAL 220.A O GLY 223.A H 3.060 2.284 ILE 224.A N SER 219.A O ILE 224.A H 2.947 2.099 ASN 225.A N LEU 182.A O ASN 225.A H 2.890 2.037 ASN 225.A ND2 TYR 17.A O ASN 225.A HD22 3.080 2.220 LYS 226.A N LEU 182.A O LYS 226.A H 3.199 2.488 LYS 226.A NZ GLN 47.A OE1 LYS 226.A HZ1 2.692 1.916 LYS 226.A NZ GLU 132.A OE1 LYS 226.A HZ2 2.821 2.020 LYS 226.A NZ ASN 228.A OD1 LYS 226.A HZ3 2.750 1.938 VAL 227.A N VAL 19.A O VAL 227.A H 3.000 2.204 ASN 228.A N LEU 184.A O ASN 228.A H 3.141 2.320 THR 229.A N ALA 21.A O THR 229.A H 2.780 2.007 THR 229.A OG1 VAL 227.A O THR 229.A HG1 2.967 2.176 ASP 232.A N SER 188.A OG ASP 232.A H 3.124 2.308 ARG 234.A N ASP 230.A O ARG 234.A H 3.030 2.204 ARG 234.A NE ASP 230.A OD1 ARG 234.A HE 2.892 2.064 ARG 234.A NH2 ASP 230.A OD2 ARG 234.A HH21 2.906 2.117 ILE 235.A N THR 231.A O ILE 235.A H 3.036 2.213 ALA 236.A N ASP 232.A O ALA 236.A H 3.242 2.393 PHE 237.A N LEU 233.A O PHE 237.A H 2.943 2.112 ILE 238.A N ARG 234.A O ILE 238.A H 2.856 1.998 ALA 239.A N ILE 235.A O ALA 239.A H 2.921 2.102 GLU 240.A N PHE 237.A O GLU 240.A H 3.130 2.465 VAL 241.A N PHE 237.A O VAL 241.A H 3.297 2.490 ARG 242.A N ILE 238.A O ARG 242.A H 2.852 1.994 LYS 243.A N ALA 239.A O LYS 243.A H 2.999 2.226 LYS 243.A NZ GLU 247.A OE1 LYS 243.A HZ2 3.448 2.835 LYS 243.A NZ GLU 247.A OE2 LYS 243.A HZ2 2.667 1.894 VAL 244.A N GLU 240.A O VAL 244.A H 2.996 2.158 ALA 245.A N VAL 241.A O ALA 245.A H 3.064 2.213 ASN 246.A N ARG 242.A O ASN 246.A H 2.918 2.126 ASN 246.A ND2 ALA 201.A O ASN 246.A HD21 2.832 2.050 GLU 247.A N LYS 243.A O GLU 247.A H 2.990 2.233 ASP 248.A N VAL 244.A O ASP 248.A H 3.256 2.533 LYS 249.A NZ ALA 245.A O LYS 249.A HZ3 3.415 2.600 SER 250.A N ASP 248.A OD1 SER 250.A H 2.846 2.039 SER 250.A OG ASP 248.A OD1 SER 250.A HG 2.674 1.839 SER 250.A OG ASP 248.A OD2 SER 250.A HG 3.517 2.873 GLN 251.A N ASP 248.A O GLN 251.A H 3.214 2.377 ASP 253.A N GLN 251.A OE1 ASP 253.A H 3.028 2.192 ARG 255.A N ASP 253.A OD1 ARG 255.A H 2.978 2.254 ARG 255.A NE ASP 253.A OD1 ARG 255.A HE 3.024 2.175 ARG 255.A NH2 ASP 253.A OD1 ARG 255.A HH21 3.442 2.730 ARG 255.A NH2 ASP 253.A OD2 ARG 255.A HH21 3.280 2.615 LYS 256.A N ASP 253.A O LYS 256.A H 2.922 2.277 PHE 257.A N LEU 254.A O PHE 257.A H 3.019 2.392 PHE 258.A N LEU 254.A O PHE 258.A H 2.952 2.219 SER 259.A N ARG 255.A O SER 259.A H 2.933 2.111 SER 259.A OG ARG 255.A O SER 259.A HG 3.220 2.640 GLN 262.A N PHE 258.A O GLN 262.A H 2.883 2.058 LEU 263.A N SER 259.A O LEU 263.A H 3.080 2.245 ALA 264.A N PRO 260.A O ALA 264.A H 2.959 2.121 LEU 265.A N ALA 261.A O LEU 265.A H 2.997 2.142 LYS 266.A N GLN 262.A O LYS 266.A H 2.734 1.875 LYS 266.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 266.A HZ2 3.154 2.368 LYS 266.A NZ GLU 39.A OE2 LYS 266.A HZ2 3.238 2.415 ASN 267.A N LEU 263.A O ASN 267.A H 2.959 2.158 VAL 268.A N ALA 264.A O VAL 268.A H 3.155 2.365 VAL 269.A N LEU 265.A O VAL 269.A H 3.078 2.275 LYS 270.A N LYS 266.A O LYS 270.A H 2.901 2.067 LYS 270.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 270.A HZ2 2.611 1.740 GLU 271.A N ASN 267.A O GLU 271.A H 3.053 2.201 ARG 272.A N VAL 268.A O ARG 272.A H 3.051 2.250 ARG 272.A NH1 ASP 232.A OD2 ARG 272.A HH12 3.220 2.461 ARG 272.A NH2 ASP 232.A OD2 ARG 272.A HH22 3.086 2.285 MET 273.A N VAL 269.A O MET 273.A H 2.883 2.054 LYS 274.A N LYS 270.A O LYS 274.A H 3.128 2.301 LYS 274.A NZ GLU 271.A OE2 LYS 274.A HZ1 2.801 1.957 LEU 275.A N GLU 271.A O LEU 275.A H 2.884 2.056 LEU 276.A N ARG 272.A O LEU 276.A H 2.827 1.982 GLY 277.A N MET 273.A O GLY 277.A H 3.092 2.424 GLY 277.A N LYS 274.A O GLY 277.A H 3.272 2.606 SER 278.A N MET 273.A O SER 278.A H 3.004 2.304 SER 278.A OG MET 273.A O SER 278.A HG 3.518 2.776 ASN 280.A N GLU 40.A O ASN 280.A H 2.809 2.017 LYS 281.A N ASN 41.A O LYS 281.A H 2.982 2.358 LYS 281.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 281.A HZ1 2.522 1.803 ILE 282.A N ASN 41.A O ILE 282.A H 3.283 2.523