Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5ud2_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N PRO 73.A O MET 1.A H1 3.252 2.535 MET 1.A N ILE 75.A O MET 1.A H2 2.283 1.661 VAL 3.A N VAL 77.A O VAL 3.A H 2.624 1.811 GLY 5.A N THR 99.A O GLY 5.A H 3.228 2.394 ASN 6.A N SER 130.A OG ASN 6.A H 2.884 2.080 GLU 7.A N LYS 4.A O GLU 7.A H 3.027 2.357 ILE 8.A N GLY 5.A O ILE 8.A H 3.184 2.533 LEU 9.A N GLY 5.A O LEU 9.A H 3.193 2.381 LEU 10.A N ASN 6.A O LEU 10.A H 2.782 1.929 LYS 11.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 11.A HZ3 3.271 2.576 ALA 12.A N ILE 8.A O ALA 12.A H 3.197 2.372 HIS 13.A N LEU 9.A O HIS 13.A H 2.686 1.873 LYS 14.A N LEU 10.A O LYS 14.A H 2.883 2.066 GLU 15.A N LYS 11.A O GLU 15.A H 2.993 2.251 GLY 16.A N ALA 12.A O GLY 16.A H 2.776 2.098 TYR 17.A N ALA 12.A O TYR 17.A H 3.230 2.482 GLY 18.A N LEU 286.A O GLY 18.A H 2.898 2.053 VAL 19.A N ASN 235.A O VAL 19.A H 2.663 1.822 ALA 21.A N VAL 237.A O ALA 21.A H 2.888 2.034 PHE 22.A N PHE 45.A O PHE 22.A H 2.928 2.123 ASN 23.A N THR 239.A O ASN 23.A H 3.262 2.467 ASN 23.A ND2 ASP 82.A OD2 ASN 23.A HD21 3.197 2.356 PHE 24.A N GLN 47.A O PHE 24.A H 3.104 2.390 GLU 28.A N GLU 28.A OE1 GLU 28.A H 3.007 2.318 MET 29.A N ASN 26.A OD1 MET 29.A H 3.192 2.344 LEU 30.A N ASN 26.A O LEU 30.A H 3.243 2.390 ASN 31.A N PHE 27.A O ASN 31.A H 2.826 1.978 ASN 31.A ND2 GLN 272.A OE1 ASN 31.A HD22 2.895 2.082 ALA 32.A N GLU 28.A O ALA 32.A H 3.154 2.301 ILE 33.A N MET 29.A O ILE 33.A H 2.964 2.147 PHE 34.A N LEU 30.A O PHE 34.A H 2.910 2.085 GLU 35.A N ASN 31.A O GLU 35.A H 2.860 2.007 ALA 36.A N ALA 32.A O ALA 36.A H 3.072 2.279 GLY 37.A N ILE 33.A O GLY 37.A H 3.104 2.306 ASN 38.A N PHE 34.A O ASN 38.A H 2.919 2.099 GLU 39.A N GLU 35.A O GLU 39.A H 3.063 2.302 GLU 40.A N ALA 36.A O GLU 40.A H 3.076 2.339 SER 42.A N GLY 37.A O SER 42.A H 3.050 2.221 LEU 44.A N PRO 76.A O LEU 44.A H 2.850 2.008 ILE 46.A N ALA 78.A O ILE 46.A H 2.854 2.013 GLN 47.A N PHE 22.A O GLN 47.A H 2.875 2.024 GLN 47.A NE2 ASN 23.A OD1 GLN 47.A HE21 2.802 2.058 ALA 48.A N HIS 80.A O ALA 48.A H 2.913 2.087 ALA 52.A N SER 49.A OG ALA 52.A H 3.070 2.223 ILE 53.A N SER 49.A O ILE 53.A H 2.844 2.037 LYS 54.A N GLU 50.A O LYS 54.A H 2.961 2.152 TYR 55.A N GLY 51.A O TYR 55.A H 2.995 2.194 MET 56.A N ALA 52.A O MET 56.A H 2.904 2.054 GLY 57.A N ILE 53.A O GLY 57.A H 2.596 1.909 MET 60.A N GLY 57.A O MET 60.A H 3.055 2.450 MET 60.A N ASP 59.A OD2 MET 60.A H 2.875 2.277 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 2.980 2.150 VAL 62.A N ILE 58.A O VAL 62.A H 3.063 2.204 GLY 63.A N ASP 59.A O GLY 63.A H 2.890 2.090 MET 64.A N MET 60.A O MET 64.A H 2.883 2.031 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.344 2.518 LYS 66.A N VAL 62.A O LYS 66.A H 2.954 2.119 ILE 67.A N GLY 63.A O ILE 67.A H 3.087 2.251 MET 68.A N MET 64.A O MET 68.A H 2.984 2.169 CYS 69.A N.A VAL 65.A O CYS 69.A H.A 2.818 2.017 CYS 69.A N.B VAL 65.A O CYS 69.A H.B 2.825 2.044 CYS 69.A SG.A VAL 65.A O CYS 69.A HG.A 3.359 2.429 CYS 69.A SG.B LYS 66.A O CYS 69.A HG.B 3.425 2.362 GLU 70.A N LYS 66.A O GLU 70.A H 3.047 2.221 ARG 71.A N ILE 67.A O ARG 71.A H 3.094 2.411 ARG 71.A N MET 68.A O ARG 71.A H 3.061 2.440 TYR 72.A N MET 68.A O TYR 72.A H 2.995 2.262 ILE 75.A N TYR 72.A O ILE 75.A H 3.189 2.334 VAL 77.A N MET 1.A O VAL 77.A H 2.639 1.806 ALA 78.A N LEU 44.A O ALA 78.A H 3.048 2.237 LEU 79.A N THR 99.A OG1 LEU 79.A H 2.965 2.182 HIS 80.A N ILE 46.A O HIS 80.A H 2.782 2.029 LEU 81.A N SER 100.A O LEU 81.A H 2.888 2.080 ASP 82.A N ALA 48.A O ASP 82.A H 2.911 2.066 HIS 83.A ND1.A ASP 82.A OD1 HIS 83.A HD1.A 2.765 1.911 HIS 83.A ND1.B ASP 104.A OD2 HIS 83.A HD1.B 3.107 2.397 GLY 84.A N MET 102.A O GLY 84.A H 2.892 2.231 THR 85.A N GLU 50.A OE1 THR 85.A H 2.905 2.107 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE1 THR 85.A HG1 3.202 2.366 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE2 THR 85.A HG1 2.973 2.357 SER 89.A N THR 86.A OG1 SER 89.A H 3.000 2.186 SER 89.A OG GLU 50.A OE1 SER 89.A HG 2.756 1.943 CYS 90.A N THR 86.A O CYS 90.A H 3.146 2.305 CYS 90.A SG THR 86.A O CYS 90.A HG 3.547 2.553 GLU 91.A N PHE 87.A O GLU 91.A H 2.774 1.973 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.898 2.088 ALA 93.A N SER 89.A O ALA 93.A H 3.090 2.272 VAL 94.A N CYS 90.A O VAL 94.A H 2.984 2.141 LYS 95.A N GLU 91.A O LYS 95.A H 2.961 2.129 ALA 96.A N LYS 92.A O ALA 96.A H 2.912 2.140 GLY 97.A N ALA 93.A O GLY 97.A H 3.056 2.351 GLY 97.A N VAL 94.A O GLY 97.A H 3.307 2.610 PHE 98.A N ALA 93.A O PHE 98.A H 2.990 2.150 THR 99.A N LEU 79.A O THR 99.A H 2.949 2.246 THR 99.A OG1 VAL 3.A O THR 99.A HG1 2.752 2.131 SER 100.A N LEU 79.A O SER 100.A H 3.062 2.423 SER 100.A OG HIS 80.A ND1 SER 100.A HG 2.673 2.103 VAL 101.A N SER 130.A O VAL 101.A H 2.932 2.151 MET 102.A N LEU 81.A O MET 102.A H 2.888 2.105 ILE 103.A N GLU 132.A O ILE 103.A H 3.042 2.233 ASP 104.A N GLY 84.A O ASP 104.A H 2.754 1.910 SER 106.A N ASP 104.A OD1 SER 106.A H 3.263 2.409 SER 106.A OG ASP 104.A OD1 SER 106.A HG 3.029 2.247 HIS 108.A N ALA 105.A O HIS 108.A H 3.079 2.247 GLU 111.A N GLU 111.A OE1 GLU 111.A H 2.693 1.963 ASN 113.A N ALA 109.A O ASN 113.A H 2.865 2.006 ASN 113.A ND2 GLU 134.A O ASN 113.A HD21 2.911 2.068 LEU 114.A N PHE 110.A O LEU 114.A H 2.785 1.938 GLU 115.A N GLU 111.A O GLU 115.A H 2.912 2.130 LEU 116.A N GLU 112.A O LEU 116.A H 3.070 2.211 THR 117.A N ASN 113.A O THR 117.A H 2.946 2.092 THR 117.A OG1 ASN 113.A O THR 117.A HG1 2.920 2.219 THR 117.A OG1 ASN 113.A OD1 THR 117.A HG1 3.176 2.757 SER 118.A N LEU 114.A O SER 118.A H 2.886 2.042 SER 118.A OG LEU 114.A O SER 118.A HG 2.926 2.212 LYS 119.A N GLU 115.A O LYS 119.A H 3.056 2.250 VAL 120.A N LEU 116.A O VAL 120.A H 3.058 2.218 VAL 121.A N THR 117.A O VAL 121.A H 2.797 1.956 LYS 122.A N SER 118.A O LYS 122.A H 2.958 2.119 MET 123.A N LYS 119.A O MET 123.A H 3.140 2.313 ALA 124.A N VAL 120.A O ALA 124.A H 2.737 1.881 HIS 125.A N VAL 121.A O HIS 125.A H 2.721 1.868 HIS 125.A NE2 ASP 155.A OD2 HIS 125.A HE2 2.737 1.898 ASN 126.A N LYS 122.A O ASN 126.A H 3.212 2.424 ALA 127.A N ALA 124.A O ALA 127.A H 2.923 2.221 GLY 128.A N HIS 125.A O GLY 128.A H 3.088 2.236 VAL 129.A N ALA 124.A O VAL 129.A H 2.901 2.071 SER 130.A N THR 99.A O SER 130.A H 3.280 2.444 VAL 131.A N ASP 155.A OD2 VAL 131.A H 2.844 2.084 GLU 132.A N VAL 101.A O GLU 132.A H 2.849 2.027 ALA 133.A N TYR 156.A O ALA 133.A H 3.281 2.511 LEU 135.A N ALA 158.A O LEU 135.A H 3.090 2.266 ARG 137.A N VAL 138.A O ARG 137.A H 2.819 1.964 ARG 137.A NE SER 106.A O ARG 137.A HE 3.016 2.188 ARG 137.A NH2 HIS 108.A O ARG 137.A HH21 3.091 2.325 VAL 140.A N ALA 160.A O VAL 140.A H 3.017 2.179 LYS 143.A NZ GLU 146.A OE1 no hydrogen 2.794 N/A GLU 144.A N ASN 141.A OD1 GLU 144.A H 3.373 2.569 ALA 145.A N ASN 141.A O ALA 145.A H 2.791 1.990 GLU 146.A N PRO 142.A O GLU 146.A H 2.921 2.144 GLN 147.A N.A LYS 143.A O GLN 147.A H.A 3.302 2.462 GLN 147.A N.B LYS 143.A O GLN 147.A H.B 3.313 2.482 PHE 148.A N GLU 144.A O PHE 148.A H 2.828 1.982 VAL 149.A N ALA 145.A O VAL 149.A H 2.948 2.107 LYS 150.A N GLU 146.A O LYS 150.A H 3.075 2.233 GLU 151.A N GLN 147.A O.A GLU 151.A H 2.826 2.001 GLU 151.A N GLN 147.A O.B GLU 151.A H 2.877 2.056 SER 152.A N PHE 148.A O SER 152.A H 2.968 2.129 SER 152.A OG PHE 148.A O SER 152.A HG 2.796 2.067 GLN 153.A N VAL 149.A O GLN 153.A H 3.039 2.239 VAL 154.A N SER 152.A OG VAL 154.A H 3.188 2.400 ASP 155.A N VAL 131.A O ASP 155.A H 3.116 2.398 TYR 156.A N VAL 131.A O TYR 156.A H 3.286 2.499 TYR 156.A OH SER 100.A OG TYR 156.A HH 2.615 1.854 LEU 157.A N PRO 191.A O LEU 157.A H 3.285 2.519 ALA 158.A N ALA 133.A O ALA 158.A H 2.791 1.958 ALA 160.A N LEU 135.A O ALA 160.A H 2.871 2.055 THR 163.A OG1 HIS 195.A O.A THR 163.A HG1 2.389 1.776 THR 163.A OG1 HIS 195.A O.B THR 163.A HG1 2.348 1.750 LYS 169.A NZ SER 164.A O LYS 169.A HZ2 3.004 2.306 LYS 169.A NZ GLY 166.A O LYS 169.A HZ3 2.600 1.791 ASP 177.A N ILE 161.A O ASP 177.A H 2.957 2.110 ARG 180.A N ASP 177.A OD1 ARG 180.A H 3.207 2.361 ARG 180.A NE ASP 177.A OD2 ARG 180.A HE 2.749 1.981 ARG 180.A NH1 VAL 140.A O ARG 180.A HH11 2.747 1.948 ARG 180.A NH2 ASP 177.A OD2 ARG 180.A HH21 3.462 2.889 LEU 181.A N ASP 177.A O LEU 181.A H 3.106 2.291 GLN 182.A N PHE 178.A O GLN 182.A H 2.922 2.096 GLU 183.A N GLU 179.A O GLU 183.A H 3.146 2.359 VAL 184.A N ARG 180.A O VAL 184.A H 3.061 2.208 LYS 185.A N LEU 181.A O LYS 185.A H 2.970 2.130 LYS 185.A NZ ILE 190.A O LYS 185.A HZ2 3.003 2.129 LYS 185.A NZ GLY 233.A O LYS 185.A HZ3 2.800 1.916 ARG 186.A N GLN 182.A O ARG 186.A H 2.862 2.048 ARG 186.A NE GLU 183.A OE1 ARG 186.A HE 3.396 2.546 ARG 186.A NH2 GLU 183.A OE2 ARG 186.A HH21 2.669 1.835 LEU 187.A N GLU 183.A O LEU 187.A H 2.953 2.164 THR 188.A N VAL 184.A O THR 188.A H 2.826 2.023 THR 188.A OG1 VAL 184.A O THR 188.A HG1 2.788 1.981 ASN 189.A N LYS 185.A O ASN 189.A H 2.961 2.144 LEU 192.A N ASN 235.A OD1 LEU 192.A H 3.374 2.629 VAL 193.A N LEU 157.A O VAL 193.A H 2.725 1.985 LEU 194.A N LYS 236.A O LEU 194.A H 2.771 1.935 HIS 195.A ND1.B HIS 83.A NE2.B no hydrogen 2.956 N/A HIS 195.A NE2.A GLU 132.A OE2 HIS 195.A HE2.A 2.652 1.816 HIS 195.A NE2.B GLU 132.A OE2 HIS 195.A HE2.B 2.658 1.816 ALA 197.A N ASN 238.A O ALA 197.A H 3.274 2.478 ALA 199.A N ASP 242.A OD2 ALA 199.A H 2.647 1.861 ILE 200.A N ASP 242.A OD1 ILE 200.A H 2.630 1.841 VAL 204.A N PRO 201.A O VAL 204.A H 3.109 2.521 ARG 205.A N PRO 201.A O ARG 205.A H 2.972 2.120 ARG 205.A NH1 SER 218.A O ARG 205.A HH12 2.808 2.078 ARG 205.A NH2 SER 218.A O ARG 205.A HH22 2.960 2.280 LYS 206.A N ASP 202.A O LYS 206.A H 2.798 1.972 LYS 206.A NZ ASP 210.A OD1 LYS 206.A HZ3 3.424 2.566 LYS 206.A NZ ASP 210.A OD2 LYS 206.A HZ3 2.599 1.979 SER 207.A N ASN 203.A O SER 207.A H 2.974 2.169 TYR 208.A N VAL 204.A O TYR 208.A H 2.958 2.112 LEU 209.A N ARG 205.A O LEU 209.A H 2.938 2.082 ASP 210.A N LYS 206.A O ASP 210.A H 2.904 2.069 ALA 211.A N SER 207.A O ALA 211.A H 3.104 2.396 ALA 211.A N TYR 208.A O ALA 211.A H 3.114 2.462 GLY 212.A N LEU 209.A O GLY 212.A H 2.959 2.183 GLY 213.A N TYR 208.A O GLY 213.A H 2.990 2.185 LYS 216.A N ASP 214.A OD1 LYS 216.A H 3.134 2.355 SER 218.A N LEU 215.A O SER 218.A H 3.227 2.625 LYS 219.A N ALA 167.A O LYS 219.A H 3.145 2.447 VAL 221.A N SER 198.A O VAL 221.A H 2.960 2.125 GLU 224.A N GLU 224.A OE1 GLU 224.A H 2.746 1.994 PHE 225.A N PRO 222.A O PHE 225.A H 2.938 2.343 LEU 226.A N PRO 222.A O LEU 226.A H 3.092 2.288 GLN 227.A N PHE 223.A O GLN 227.A H 2.989 2.152 GLU 228.A N GLU 224.A O GLU 228.A H 2.942 2.121 SER 229.A N.A PHE 225.A O SER 229.A H.A 2.792 2.005 SER 229.A N.B PHE 225.A O SER 229.A H.B 2.804 2.029 SER 229.A OG.A PHE 225.A O SER 229.A HG.A 2.862 2.059 VAL 230.A N LEU 226.A O VAL 230.A H 3.055 2.238 LYS 231.A N GLN 227.A O LYS 231.A H 2.952 2.107 GLY 232.A N GLU 228.A O GLY 232.A H 2.882 2.153 GLY 233.A N VAL 230.A O GLY 233.A H 3.044 2.292 ILE 234.A N SER 229.A O.A ILE 234.A H 3.020 2.161 ILE 234.A N SER 229.A O.B ILE 234.A H 2.964 2.106 ASN 235.A N LEU 192.A O ASN 235.A H 2.862 2.007 ASN 235.A ND2 TYR 17.A O ASN 235.A HD22 3.092 2.236 LYS 236.A N LEU 192.A O LYS 236.A H 3.099 2.331 LYS 236.A NZ GLN 47.A OE1 LYS 236.A HZ1 2.742 1.966 LYS 236.A NZ GLU 132.A OE1 LYS 236.A HZ2 2.921 2.142 LYS 236.A NZ ASN 238.A OD1 LYS 236.A HZ3 2.514 1.689 VAL 237.A N VAL 19.A O VAL 237.A H 3.057 2.274 ASN 238.A N LEU 194.A O ASN 238.A H 2.941 2.099 THR 239.A N ALA 21.A O THR 239.A H 2.788 1.982 THR 239.A OG1 VAL 237.A O THR 239.A HG1 2.954 2.152 ASP 242.A N SER 198.A OG ASP 242.A H 2.972 2.140 ARG 244.A N ASP 240.A O ARG 244.A H 3.177 2.400 ILE 245.A N THR 241.A O ILE 245.A H 2.971 2.120 ALA 246.A N ASP 242.A O ALA 246.A H 3.167 2.310 PHE 247.A N LEU 243.A O PHE 247.A H 3.016 2.205 ILE 248.A N ARG 244.A O ILE 248.A H 2.844 1.984 ALA 249.A N ILE 245.A O ALA 249.A H 2.808 1.996 GLU 250.A N PHE 247.A O GLU 250.A H 3.172 2.567 VAL 251.A N PHE 247.A O VAL 251.A H 3.300 2.483 ARG 252.A N ILE 248.A O ARG 252.A H 2.857 2.002 LYS 253.A N ALA 249.A O LYS 253.A H 3.030 2.272 VAL 254.A N GLU 250.A O VAL 254.A H 2.943 2.127 ALA 255.A N VAL 251.A O ALA 255.A H 3.109 2.279 ASN 256.A N ARG 252.A O ASN 256.A H 2.965 2.134 ASN 256.A ND2 ALA 211.A O ASN 256.A HD21 2.803 2.088 GLU 257.A N LYS 253.A O GLU 257.A H 3.109 2.372 ASP 258.A N VAL 254.A O ASP 258.A H 3.208 2.515 LYS 259.A NZ ALA 255.A O LYS 259.A HZ3 3.377 2.548 SER 260.A N ASP 258.A OD1 SER 260.A H 3.101 2.328 SER 260.A OG ASP 258.A OD1 SER 260.A HG 2.934 2.165 GLN 261.A N ASP 258.A O GLN 261.A H 3.343 2.506 ASP 263.A N GLN 261.A OE1 ASP 263.A H 3.043 2.214 ARG 265.A N ASP 263.A OD1 ARG 265.A H 3.055 2.288 LYS 266.A N ASP 263.A O LYS 266.A H 3.014 2.382 PHE 267.A N LEU 264.A O PHE 267.A H 3.032 2.364 PHE 268.A N LEU 264.A O PHE 268.A H 2.979 2.253 SER 269.A N ARG 265.A O SER 269.A H 2.842 1.996 SER 269.A OG ARG 265.A O SER 269.A HG 3.075 2.537 GLN 272.A N PHE 268.A O GLN 272.A H 2.768 1.934 LEU 273.A N SER 269.A O LEU 273.A H 3.132 2.321 ALA 274.A N PRO 270.A O ALA 274.A H 3.008 2.187 LEU 275.A N ALA 271.A O LEU 275.A H 3.051 2.195 LYS 276.A N GLN 272.A O LYS 276.A H 2.799 1.949 LYS 276.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 276.A HZ2 3.166 2.421 LYS 276.A NZ GLU 39.A OE2 LYS 276.A HZ2 3.044 2.188 ASN 277.A N LEU 273.A O ASN 277.A H 3.014 2.239 VAL 278.A N ALA 274.A O VAL 278.A H 3.173 2.347 VAL 279.A N LEU 275.A O VAL 279.A H 3.105 2.265 LYS 280.A N LYS 276.A O LYS 280.A H 2.907 2.055 LYS 280.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 280.A HZ2 2.675 1.798 GLU 281.A N ASN 277.A O GLU 281.A H 3.058 2.212 ARG 282.A N VAL 278.A O ARG 282.A H 2.930 2.099 ARG 282.A NH1 ASP 242.A OD2 ARG 282.A HH12 2.984 2.178 ARG 282.A NH2 ASP 242.A OD2 ARG 282.A HH22 3.159 2.413 MET 283.A N VAL 279.A O MET 283.A H 2.800 1.987 LYS 284.A N LYS 280.A O LYS 284.A H 3.157 2.334 LYS 284.A NZ LYS 280.A O LYS 284.A HZ3 3.556 2.749 LYS 284.A NZ GLU 281.A OE2 LYS 284.A HZ1 3.436 2.636 LEU 285.A N GLU 281.A O LEU 285.A H 2.845 2.021 LEU 286.A N ARG 282.A O LEU 286.A H 2.902 2.096 GLY 287.A N MET 283.A O GLY 287.A H 3.175 2.486 SER 288.A N MET 283.A O SER 288.A H 3.069 2.367 ALA 289.A N MET 283.A O ALA 289.A H 3.355 2.612 ASN 290.A N GLU 40.A O ASN 290.A H 2.828 2.034 LYS 291.A N ASN 41.A O LYS 291.A H 3.066 2.451 LYS 291.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 291.A HZ1 2.616 1.982 ILE 292.A N ASN 41.A O ILE 292.A H 3.279 2.516