Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5ud3_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N PRO 73.A O MET 1.A H3 2.972 2.170 MET 1.A N ILE 75.A O MET 1.A H2 2.689 1.947 VAL 3.A N VAL 77.A O VAL 3.A H 2.753 1.969 GLY 5.A N THR 99.A O GLY 5.A H 3.235 2.428 ASN 6.A N SER 130.A OG ASN 6.A H 2.952 2.148 GLU 7.A N LYS 4.A O GLU 7.A H 3.006 2.288 ILE 8.A N GLY 5.A O ILE 8.A H 3.129 2.531 LEU 9.A N GLY 5.A O LEU 9.A H 3.059 2.247 LEU 10.A N ASN 6.A O LEU 10.A H 2.775 1.926 LYS 11.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 11.A HZ3 3.034 2.379 ALA 12.A N ILE 8.A O ALA 12.A H 3.220 2.391 HIS 13.A N LEU 9.A O HIS 13.A H 2.807 1.980 LYS 14.A N LEU 10.A O LYS 14.A H 2.970 2.140 GLU 15.A N LYS 11.A O GLU 15.A H 2.908 2.104 GLY 16.A N ALA 12.A O GLY 16.A H 2.763 2.143 TYR 17.A N ALA 12.A O TYR 17.A H 3.049 2.263 GLY 18.A N LEU 287.A O GLY 18.A H 2.965 2.110 VAL 19.A N ASN 236.A O VAL 19.A H 2.773 1.935 ALA 21.A N VAL 238.A O ALA 21.A H 2.882 2.030 PHE 22.A N PHE 45.A O PHE 22.A H 2.917 2.091 ASN 23.A N THR 240.A O ASN 23.A H 3.299 2.490 ASN 23.A ND2 ASP 82.A OD2 ASN 23.A HD22 3.091 2.237 PHE 24.A N GLN 47.A O PHE 24.A H 3.098 2.376 GLU 28.A N GLU 28.A OE1 GLU 28.A H 2.841 2.130 MET 29.A N ASN 26.A OD1 MET 29.A H 3.136 2.284 LEU 30.A N ASN 26.A O LEU 30.A H 3.261 2.424 ASN 31.A N PHE 27.A O ASN 31.A H 2.783 1.940 ASN 31.A ND2 GLN 273.A OE1 ASN 31.A HD22 2.829 2.007 ALA 32.A N GLU 28.A O ALA 32.A H 3.175 2.332 ILE 33.A N MET 29.A O ILE 33.A H 3.021 2.193 PHE 34.A N LEU 30.A O PHE 34.A H 3.034 2.202 GLU 35.A N ASN 31.A O GLU 35.A H 2.912 2.067 ALA 36.A N ALA 32.A O ALA 36.A H 3.055 2.246 GLY 37.A N ILE 33.A O GLY 37.A H 3.071 2.243 ASN 38.A N PHE 34.A O ASN 38.A H 2.857 2.035 GLU 39.A N GLU 35.A O GLU 39.A H 2.914 2.123 GLU 40.A N ALA 36.A O GLU 40.A H 2.908 2.134 ASN 41.A N ASN 38.A O ASN 41.A H 3.454 2.625 SER 42.A N GLY 37.A O SER 42.A H 3.038 2.207 SER 42.A OG SER 289.A O SER 42.A HG 3.460 2.802 LEU 44.A N PRO 76.A O LEU 44.A H 2.855 2.027 ILE 46.A N ALA 78.A O ILE 46.A H 2.831 1.985 GLN 47.A N PHE 22.A O GLN 47.A H 2.999 2.163 GLN 47.A NE2 ASN 23.A OD1 GLN 47.A HE21 2.894 2.038 ALA 48.A N HIS 80.A O ALA 48.A H 2.980 2.177 ALA 52.A N SER 49.A OG ALA 52.A H 2.961 2.123 ILE 53.A N SER 49.A O ILE 53.A H 2.918 2.106 LYS 54.A N GLU 50.A O LYS 54.A H 2.927 2.119 TYR 55.A N GLY 51.A O TYR 55.A H 3.002 2.223 MET 56.A N ALA 52.A O MET 56.A H 2.919 2.088 GLY 57.A N ILE 53.A O GLY 57.A H 2.716 2.005 MET 60.A N GLY 57.A O MET 60.A H 2.992 2.363 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 2.983 2.150 VAL 62.A N ILE 58.A O VAL 62.A H 3.061 2.203 GLY 63.A N ASP 59.A O GLY 63.A H 2.955 2.163 MET 64.A N MET 60.A O MET 64.A H 2.849 1.994 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.341 2.509 LYS 66.A N VAL 62.A O LYS 66.A H 2.900 2.081 ILE 67.A N GLY 63.A O ILE 67.A H 3.097 2.275 MET 68.A N MET 64.A O MET 68.A H 3.000 2.186 CYS 69.A N.A VAL 65.A O CYS 69.A H.A 2.830 2.001 CYS 69.A N.B VAL 65.A O CYS 69.A H.B 2.841 2.027 CYS 69.A SG.A VAL 65.A O CYS 69.A HG.A 3.384 2.470 GLU 70.A N.A LYS 66.A O GLU 70.A H.A 3.064 2.245 GLU 70.A N.B LYS 66.A O GLU 70.A H.B 3.065 2.284 ARG 71.A N ILE 67.A O ARG 71.A H 2.967 2.237 TYR 72.A N MET 68.A O TYR 72.A H 3.037 2.351 TYR 72.A N CYS 69.A O.A TYR 72.A H 3.163 2.507 ILE 75.A N TYR 72.A O ILE 75.A H 3.161 2.302 VAL 77.A N MET 1.A O VAL 77.A H 2.805 2.000 ALA 78.A N LEU 44.A O ALA 78.A H 3.033 2.234 LEU 79.A N THR 99.A OG1 LEU 79.A H 3.088 2.281 HIS 80.A N ILE 46.A O HIS 80.A H 2.825 2.056 HIS 80.A ND1 SER 100.A OG HIS 80.A HD1 2.637 1.796 LEU 81.A N SER 100.A O LEU 81.A H 2.986 2.184 ASP 82.A N ALA 48.A O ASP 82.A H 2.918 2.071 HIS 83.A ND1.A ASP 82.A OD1 HIS 83.A HD1.A 2.752 1.919 HIS 83.A ND1.C ASP 82.A OD1 HIS 83.A HD1.C 2.924 2.072 GLY 84.A N MET 102.A O GLY 84.A H 2.878 2.235 THR 85.A N GLU 50.A OE1 THR 85.A H 2.829 2.032 GLU 88.A N GLU 88.A OE1 GLU 88.A H 2.746 1.965 SER 89.A N THR 86.A OG1 SER 89.A H 2.960 2.128 CYS 90.A N THR 86.A O CYS 90.A H 3.166 2.330 GLU 91.A N PHE 87.A O GLU 91.A H 2.835 2.020 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.871 2.036 ALA 93.A N SER 89.A O ALA 93.A H 3.043 2.238 VAL 94.A N CYS 90.A O VAL 94.A H 2.946 2.108 LYS 95.A N GLU 91.A O LYS 95.A H 2.932 2.101 ALA 96.A N LYS 92.A O ALA 96.A H 2.932 2.181 GLY 97.A N ALA 93.A O GLY 97.A H 3.135 2.466 GLY 97.A N VAL 94.A O GLY 97.A H 3.184 2.460 PHE 98.A N ALA 93.A O PHE 98.A H 2.984 2.164 THR 99.A N LEU 79.A O THR 99.A H 2.875 2.121 SER 100.A N LEU 79.A O SER 100.A H 3.126 2.491 VAL 101.A N SER 130.A O VAL 101.A H 2.865 2.073 MET 102.A N LEU 81.A O MET 102.A H 2.907 2.178 ILE 103.A N GLU 132.A O ILE 103.A H 3.033 2.240 ASP 104.A N GLY 84.A O ASP 104.A H 2.936 2.088 SER 106.A N ASP 104.A OD1 SER 106.A H 3.028 2.171 HIS 108.A N ALA 105.A O HIS 108.A H 3.024 2.180 GLU 111.A N GLU 111.A OE1 GLU 111.A H 2.779 2.030 ASN 113.A N ALA 109.A O ASN 113.A H 2.930 2.075 ASN 113.A ND2 GLU 134.A O.A ASN 113.A HD22 2.962 2.107 ASN 113.A ND2 GLU 134.A O.C ASN 113.A HD22 2.948 2.095 LEU 114.A N PHE 110.A O LEU 114.A H 2.805 1.956 GLU 115.A N GLU 111.A O GLU 115.A H 2.902 2.091 LEU 116.A N GLU 112.A O LEU 116.A H 2.989 2.136 THR 117.A N ASN 113.A O THR 117.A H 2.901 2.049 SER 118.A N LEU 114.A O SER 118.A H 2.887 2.057 SER 118.A OG LEU 114.A O SER 118.A HG 2.862 2.132 LYS 119.A N GLU 115.A O LYS 119.A H 3.067 2.244 VAL 120.A N LEU 116.A O VAL 120.A H 3.031 2.194 VAL 121.A N THR 117.A O VAL 121.A H 2.827 2.001 LYS 122.A N SER 118.A O LYS 122.A H 2.939 2.106 MET 123.A N LYS 119.A O MET 123.A H 3.222 2.374 ALA 124.A N VAL 120.A O ALA 124.A H 2.816 1.977 HIS 125.A N VAL 121.A O HIS 125.A H 2.748 1.890 HIS 125.A NE2 ASP 156.A OD2 HIS 125.A HE2 2.762 1.909 ASN 126.A N LYS 122.A O ASN 126.A H 3.123 2.313 ALA 127.A N ALA 124.A O ALA 127.A H 2.932 2.199 GLY 128.A N HIS 125.A O GLY 128.A H 3.029 2.179 VAL 129.A N ALA 124.A O VAL 129.A H 2.911 2.072 SER 130.A N THR 99.A O SER 130.A H 3.324 2.486 VAL 131.A N ASP 156.A OD2 VAL 131.A H 2.836 2.068 GLU 132.A N VAL 101.A O GLU 132.A H 2.856 2.037 ALA 133.A N TYR 157.A O ALA 133.A H 3.210 2.448 LEU 135.A N ALA 159.A O LEU 135.A H 3.143 2.331 ARG 137.A N VAL 139.A O no hydrogen 2.859 N/A VAL 141.A N ALA 161.A O VAL 141.A H 3.043 2.187 LYS 144.A N ASN 142.A OD1 LYS 144.A H 2.977 2.326 LYS 144.A NZ GLU 147.A OE1 LYS 144.A HZ2 2.726 1.891 GLU 145.A N ASN 142.A OD1 GLU 145.A H 3.379 2.579 ALA 146.A N ASN 142.A O ALA 146.A H 2.936 2.137 GLU 147.A N PRO 143.A O GLU 147.A H 2.972 2.181 GLN 148.A N LYS 144.A O GLN 148.A H 3.233 2.396 PHE 149.A N GLU 145.A O PHE 149.A H 2.745 1.895 VAL 150.A N ALA 146.A O VAL 150.A H 2.977 2.140 LYS 151.A N GLU 147.A O LYS 151.A H 3.088 2.254 GLU 152.A N GLN 148.A O GLU 152.A H 2.896 2.066 SER 153.A N PHE 149.A O SER 153.A H 2.962 2.148 GLN 154.A N VAL 150.A O GLN 154.A H 3.032 2.257 VAL 155.A N SER 153.A OG VAL 155.A H 3.060 2.218 ASP 156.A N VAL 131.A O ASP 156.A H 3.050 2.346 TYR 157.A N VAL 131.A O TYR 157.A H 3.167 2.390 TYR 157.A OH SER 100.A OG TYR 157.A HH 2.613 1.824 LEU 158.A N PRO 192.A O LEU 158.A H 3.286 2.514 ALA 159.A N ALA 133.A O ALA 159.A H 2.822 1.980 ALA 161.A N LEU 135.A O ALA 161.A H 2.916 2.101 THR 164.A OG1 HIS 196.A O THR 164.A HG1 2.612 1.854 LYS 170.A N LYS 220.A O no hydrogen 3.185 N/A LYS 170.A NZ SER 165.A O no hydrogen 2.834 N/A LYS 170.A NZ GLY 167.A O no hydrogen 2.809 N/A LYS 170.A NZ GLY 197.A O no hydrogen 3.153 N/A ASP 178.A N ILE 162.A O ASP 178.A H 2.888 2.072 ARG 181.A N ASP 178.A OD1 ARG 181.A H 2.996 2.145 ARG 181.A NE VAL 141.A O ARG 181.A HE 2.841 2.068 ARG 181.A NH1 ASP 178.A OD2 ARG 181.A HH11 3.026 2.201 LEU 182.A N ASP 178.A O LEU 182.A H 3.136 2.294 GLN 183.A N PHE 179.A O GLN 183.A H 3.000 2.173 GLU 184.A N GLU 180.A O GLU 184.A H 3.044 2.235 VAL 185.A N ARG 181.A O VAL 185.A H 2.897 2.047 LYS 186.A N LEU 182.A O LYS 186.A H 2.891 2.064 LYS 186.A NZ ILE 191.A O LYS 186.A HZ2 2.854 1.964 LYS 186.A NZ GLY 234.A O LYS 186.A HZ3 2.946 2.072 ARG 187.A N GLN 183.A O ARG 187.A H 2.907 2.092 ARG 187.A NE GLU 184.A OE1 ARG 187.A HE 3.193 2.360 ARG 187.A NH2 GLU 184.A OE1 ARG 187.A HH21 3.443 2.697 ARG 187.A NH2 GLU 184.A OE2 ARG 187.A HH21 2.469 1.695 LEU 188.A N GLU 184.A O LEU 188.A H 3.035 2.229 THR 189.A N VAL 185.A O THR 189.A H 2.944 2.149 ASN 190.A N LYS 186.A O ASN 190.A H 2.962 2.134 LEU 193.A N ASN 236.A OD1 LEU 193.A H 3.336 2.593 VAL 194.A N LEU 158.A O VAL 194.A H 2.808 2.068 LEU 195.A N LYS 237.A O LEU 195.A H 2.841 2.004 HIS 196.A NE2 GLU 132.A OE2 HIS 196.A HE2 2.768 1.910 ALA 198.A N ASN 239.A O ALA 198.A H 3.219 2.418 ALA 200.A N ASP 243.A OD2 ALA 200.A H 2.825 1.983 ILE 201.A N ASP 243.A OD1 ILE 201.A H 2.705 1.905 ARG 206.A N.A PRO 202.A O ARG 206.A H.A 2.923 2.074 ARG 206.A N.B PRO 202.A O ARG 206.A H.B 2.928 2.084 ARG 206.A NE.B SER 219.A OG ARG 206.A HE.B 3.156 2.485 ARG 206.A NH1.A ASP 203.A OD1 ARG 206.A HH11.A 3.049 2.210 ARG 206.A NH1.B SER 219.A O ARG 206.A HH11.B 2.845 2.160 ARG 206.A NH1.B SER 219.A OG ARG 206.A HH11.B 2.963 2.257 ARG 206.A NH2.B ILE 201.A O ARG 206.A HH22.B 3.245 2.684 LYS 207.A N ASP 203.A O LYS 207.A H 2.917 2.071 LYS 207.A NZ ASP 211.A OD1 LYS 207.A HZ2 3.386 2.592 LYS 207.A NZ ASP 211.A OD2 LYS 207.A HZ2 3.125 2.383 SER 208.A N.A ASN 204.A O SER 208.A H.A 3.019 2.172 SER 208.A N.B ASN 204.A O SER 208.A H.B 3.012 2.168 TYR 209.A N VAL 205.A O no hydrogen 3.115 N/A LEU 210.A N ARG 206.A O.A LEU 210.A H 2.943 2.107 LEU 210.A N ARG 206.A O.B LEU 210.A H 2.944 2.104 ASP 211.A N LYS 207.A O ASP 211.A H 2.852 1.994 ALA 212.A N SER 208.A O.A ALA 212.A H 3.258 2.505 ALA 212.A N SER 208.A O.B ALA 212.A H 3.314 2.566 GLY 213.A N LEU 210.A O GLY 213.A H 2.882 2.077 GLY 214.A N TYR 209.A O GLY 214.A H 2.993 2.205 SER 219.A N LEU 216.A O SER 219.A H 2.869 2.043 SER 219.A OG LEU 216.A O SER 219.A HG 3.216 2.608 LYS 220.A N ALA 168.A O LYS 220.A H 2.810 2.082 LYS 220.A NZ GLY 173.A O LYS 220.A HZ3 3.434 2.781 VAL 222.A N SER 199.A O VAL 222.A H 2.860 2.024 GLU 225.A N GLU 225.A OE1 GLU 225.A H 2.811 2.016 PHE 226.A N PRO 223.A O PHE 226.A H 2.899 2.307 LEU 227.A N PRO 223.A O LEU 227.A H 3.047 2.254 GLN 228.A N PHE 224.A O GLN 228.A H 2.988 2.161 GLU 229.A N GLU 225.A O GLU 229.A H 2.945 2.131 SER 230.A N.A PHE 226.A O SER 230.A H.A 2.831 2.061 SER 230.A N.B PHE 226.A O SER 230.A H.B 2.809 2.014 VAL 231.A N LEU 227.A O VAL 231.A H 3.062 2.247 LYS 232.A N GLN 228.A O LYS 232.A H 2.955 2.112 GLY 233.A N GLU 229.A O GLY 233.A H 2.915 2.174 GLY 234.A N VAL 231.A O GLY 234.A H 3.027 2.237 ILE 235.A N SER 230.A O.A ILE 235.A H 2.906 2.055 ILE 235.A N SER 230.A O.B ILE 235.A H 3.019 2.165 ASN 236.A N LEU 193.A O ASN 236.A H 2.769 1.914 ASN 236.A ND2 TYR 17.A O ASN 236.A HD22 3.050 2.196 LYS 237.A N LEU 193.A O LYS 237.A H 3.103 2.348 LYS 237.A NZ GLN 47.A OE1 LYS 237.A HZ1 3.059 2.307 LYS 237.A NZ GLU 132.A OE1 LYS 237.A HZ2 2.757 1.941 LYS 237.A NZ ASN 239.A OD1 LYS 237.A HZ3 2.756 1.908 VAL 238.A N VAL 19.A O VAL 238.A H 3.022 2.266 ASN 239.A N LEU 195.A O ASN 239.A H 2.933 2.078 THR 240.A N ALA 21.A O THR 240.A H 2.906 2.091 THR 240.A OG1 VAL 238.A O THR 240.A HG1 3.017 2.212 ASP 243.A N SER 199.A OG ASP 243.A H 2.964 2.137 ARG 245.A N ASP 241.A O ARG 245.A H 3.043 2.245 ARG 245.A NE ASP 241.A OD1 ARG 245.A HE 2.881 2.034 ARG 245.A NH2 ASP 241.A OD2 ARG 245.A HH21 2.926 2.085 ILE 246.A N THR 242.A O ILE 246.A H 2.960 2.118 ALA 247.A N ASP 243.A O ALA 247.A H 3.145 2.292 PHE 248.A N LEU 244.A O PHE 248.A H 3.032 2.199 ILE 249.A N ARG 245.A O ILE 249.A H 2.890 2.035 ALA 250.A N ILE 246.A O ALA 250.A H 2.884 2.048 GLU 251.A N PHE 248.A O GLU 251.A H 3.119 2.489 VAL 252.A N PHE 248.A O VAL 252.A H 3.232 2.427 ARG 253.A N ILE 249.A O ARG 253.A H 2.818 1.965 LYS 254.A N ALA 250.A O LYS 254.A H 2.980 2.182 LYS 254.A NZ GLU 258.A OE1 LYS 254.A HZ1 3.356 2.596 VAL 255.A N GLU 251.A O VAL 255.A H 3.068 2.237 ALA 256.A N VAL 252.A O ALA 256.A H 3.065 2.219 ASN 257.A N ARG 253.A O ASN 257.A H 2.929 2.156 ASN 257.A ND2 ALA 212.A O ASN 257.A HD21 2.824 2.040 GLU 258.A N LYS 254.A O GLU 258.A H 3.016 2.278 ASP 259.A N VAL 255.A O ASP 259.A H 3.158 2.383 LYS 260.A NZ ALA 256.A O LYS 260.A HZ3 3.260 2.443 SER 261.A N ASP 259.A OD1 SER 261.A H 2.905 2.124 GLN 262.A N ASP 259.A O GLN 262.A H 3.168 2.321 ASP 264.A N GLN 262.A OE1 ASP 264.A H 3.074 2.231 ARG 266.A N ASP 264.A OD1 ARG 266.A H 2.968 2.192 ARG 266.A NE ASP 264.A OD1 ARG 266.A HE 2.880 2.036 ARG 266.A NH2 ASP 264.A OD1 ARG 266.A HH21 3.414 2.742 ARG 266.A NH2 ASP 264.A OD2 ARG 266.A HH21 3.118 2.396 LYS 267.A N ASP 264.A O LYS 267.A H 2.910 2.197 PHE 268.A N LEU 265.A O PHE 268.A H 3.104 2.468 PHE 269.A N LEU 265.A O PHE 269.A H 2.947 2.194 SER 270.A N ARG 266.A O SER 270.A H 2.886 2.053 GLN 273.A N PHE 269.A O GLN 273.A H 2.882 2.037 LEU 274.A N SER 270.A O LEU 274.A H 3.094 2.263 ALA 275.A N PRO 271.A O ALA 275.A H 3.047 2.220 LEU 276.A N ALA 272.A O LEU 276.A H 3.002 2.156 LYS 277.A N GLN 273.A O LYS 277.A H 2.722 1.874 LYS 277.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 277.A HZ3 3.094 2.368 LYS 277.A NZ GLU 39.A OE2 LYS 277.A HZ3 3.052 2.197 ASN 278.A N LEU 274.A O ASN 278.A H 2.956 2.142 VAL 279.A N ALA 275.A O VAL 279.A H 3.156 2.329 VAL 280.A N LEU 276.A O VAL 280.A H 3.091 2.276 LYS 281.A N LYS 277.A O LYS 281.A H 2.872 2.030 LYS 281.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 281.A HZ2 2.574 1.692 GLU 282.A N ASN 278.A O GLU 282.A H 3.044 2.188 ARG 283.A N VAL 279.A O ARG 283.A H 2.980 2.182 ARG 283.A NH1 ASP 243.A OD2 ARG 283.A HH12 2.928 2.177 ARG 283.A NH2 ASP 243.A OD2 ARG 283.A HH22 2.873 2.103 MET 284.A N VAL 280.A O MET 284.A H 2.844 2.020 LYS 285.A N LYS 281.A O LYS 285.A H 3.108 2.276 LYS 285.A NZ GLU 282.A OE1 LYS 285.A HZ3 3.484 2.885 LYS 285.A NZ GLU 282.A OE2 LYS 285.A HZ3 2.617 1.779 LEU 286.A N GLU 282.A O LEU 286.A H 2.927 2.113 LEU 287.A N ARG 283.A O LEU 287.A H 2.911 2.109 GLY 288.A N MET 284.A O GLY 288.A H 3.105 2.431 GLY 288.A N LYS 285.A O GLY 288.A H 3.317 2.623 SER 289.A N MET 284.A O SER 289.A H 3.100 2.376 ASN 291.A N GLU 40.A O ASN 291.A H 2.891 2.092 LYS 292.A N ASN 41.A O LYS 292.A H 3.081 2.462 LYS 292.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 292.A HZ1 2.539 1.838 ILE 293.A N ASN 41.A O ILE 293.A H 3.278 2.516