Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5ud4_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N PRO 73.A O MET 1.A H1 3.023 2.350 MET 1.A N ILE 75.A O MET 1.A H3 2.631 1.980 VAL 3.A N VAL 77.A O VAL 3.A H 2.715 1.914 GLY 5.A N THR 99.A O GLY 5.A H 3.216 2.406 ASN 6.A N SER 130.A OG ASN 6.A H 3.000 2.205 GLU 7.A N LYS 4.A O GLU 7.A H 2.941 2.216 ILE 8.A N GLY 5.A O ILE 8.A H 3.145 2.524 LEU 9.A N GLY 5.A O LEU 9.A H 3.082 2.271 LEU 10.A N ASN 6.A O LEU 10.A H 2.824 1.975 LYS 11.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 11.A HZ2 3.001 2.303 ALA 12.A N ILE 8.A O ALA 12.A H 3.240 2.404 HIS 13.A N LEU 9.A O HIS 13.A H 2.806 1.973 LYS 14.A N LEU 10.A O LYS 14.A H 2.953 2.116 GLU 15.A N LYS 11.A O GLU 15.A H 2.894 2.092 GLY 16.A N ALA 12.A O GLY 16.A H 2.722 2.108 TYR 17.A N ALA 12.A O TYR 17.A H 3.079 2.297 GLY 18.A N LEU 287.A O GLY 18.A H 2.975 2.119 VAL 19.A N ASN 236.A O VAL 19.A H 2.747 1.911 ALA 21.A N VAL 238.A O ALA 21.A H 2.889 2.037 PHE 22.A N PHE 45.A O PHE 22.A H 2.904 2.081 ASN 23.A N THR 240.A O ASN 23.A H 3.290 2.475 ASN 23.A ND2 ASP 82.A OD2 ASN 23.A HD22 3.103 2.253 PHE 24.A N GLN 47.A O PHE 24.A H 3.137 2.429 GLU 28.A N GLU 28.A OE1 GLU 28.A H 2.850 2.140 MET 29.A N ASN 26.A OD1 MET 29.A H 3.097 2.247 LEU 30.A N ASN 26.A O LEU 30.A H 3.225 2.385 ASN 31.A N PHE 27.A O ASN 31.A H 2.751 1.910 ASN 31.A ND2 GLN 273.A OE1 ASN 31.A HD21 2.842 2.013 ALA 32.A N GLU 28.A O ALA 32.A H 3.159 2.317 ILE 33.A N MET 29.A O ILE 33.A H 3.026 2.192 PHE 34.A N LEU 30.A O PHE 34.A H 3.026 2.183 GLU 35.A N ASN 31.A O GLU 35.A H 2.898 2.052 ALA 36.A N ALA 32.A O ALA 36.A H 3.007 2.192 GLY 37.A N ILE 33.A O GLY 37.A H 3.044 2.214 ASN 38.A N PHE 34.A O ASN 38.A H 2.859 2.035 GLU 39.A N GLU 35.A O GLU 39.A H 2.930 2.146 GLU 40.A N ALA 36.A O GLU 40.A H 2.931 2.168 SER 42.A N GLY 37.A O SER 42.A H 3.040 2.207 SER 42.A OG PRO 43.A O SER 42.A HG 2.928 2.111 LEU 44.A N PRO 76.A O LEU 44.A H 2.819 1.975 ILE 46.A N ALA 78.A O ILE 46.A H 2.855 2.004 GLN 47.A N PHE 22.A O GLN 47.A H 3.005 2.170 GLN 47.A NE2 ASN 23.A OD1 GLN 47.A HE21 2.890 2.033 ALA 48.A N HIS 80.A O ALA 48.A H 2.968 2.163 ALA 52.A N SER 49.A OG ALA 52.A H 2.938 2.103 ILE 53.A N SER 49.A O ILE 53.A H 2.934 2.130 LYS 54.A N GLU 50.A O LYS 54.A H 2.942 2.124 TYR 55.A N GLY 51.A O TYR 55.A H 3.001 2.242 MET 56.A N ALA 52.A O MET 56.A H 2.894 2.061 GLY 57.A N ILE 53.A O GLY 57.A H 2.705 2.000 MET 60.A N GLY 57.A O MET 60.A H 2.982 2.364 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 2.984 2.159 VAL 62.A N ILE 58.A O VAL 62.A H 3.066 2.208 GLY 63.A N ASP 59.A O GLY 63.A H 2.939 2.145 MET 64.A N MET 60.A O MET 64.A H 2.857 2.005 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.328 2.495 LYS 66.A N VAL 62.A O LYS 66.A H 2.899 2.069 ILE 67.A N GLY 63.A O ILE 67.A H 3.099 2.266 MET 68.A N MET 64.A O MET 68.A H 2.963 2.147 CYS 69.A N.A VAL 65.A O CYS 69.A H.A 2.809 1.979 CYS 69.A N.B VAL 65.A O CYS 69.A H.B 2.825 2.012 GLU 70.A N.A LYS 66.A O GLU 70.A H.A 3.043 2.232 GLU 70.A N.B LYS 66.A O GLU 70.A H.B 3.050 2.277 ARG 71.A N ILE 67.A O ARG 71.A H 2.995 2.280 ARG 71.A N MET 68.A O ARG 71.A H 3.075 2.484 TYR 72.A N MET 68.A O TYR 72.A H 3.073 2.393 TYR 72.A N CYS 69.A O.A TYR 72.A H 3.192 2.530 ILE 75.A N TYR 72.A O ILE 75.A H 3.122 2.264 VAL 77.A N MET 1.A O VAL 77.A H 2.702 1.903 ALA 78.A N LEU 44.A O ALA 78.A H 2.982 2.180 LEU 79.A N THR 99.A OG1 LEU 79.A H 3.071 2.258 HIS 80.A N ILE 46.A O HIS 80.A H 2.794 2.022 HIS 80.A ND1 SER 100.A OG HIS 80.A HD1 2.596 1.768 LEU 81.A N SER 100.A O LEU 81.A H 2.950 2.155 ASP 82.A N ALA 48.A O ASP 82.A H 2.888 2.040 HIS 83.A ND1.A ASP 82.A OD1 HIS 83.A HD1.A 2.803 1.963 GLY 84.A N MET 102.A O GLY 84.A H 2.861 2.223 THR 85.A N GLU 50.A OE1 THR 85.A H 2.842 2.049 GLU 88.A N GLU 88.A OE1 GLU 88.A H 2.718 1.952 SER 89.A N THR 86.A OG1 SER 89.A H 2.942 2.109 SER 89.A OG GLU 50.A OE1 SER 89.A HG 2.585 1.781 CYS 90.A N THR 86.A O CYS 90.A H 3.165 2.330 GLU 91.A N PHE 87.A O GLU 91.A H 2.835 2.013 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.873 2.045 ALA 93.A N SER 89.A O ALA 93.A H 3.047 2.240 VAL 94.A N CYS 90.A O VAL 94.A H 2.951 2.109 LYS 95.A N GLU 91.A O LYS 95.A H 2.955 2.124 ALA 96.A N LYS 92.A O ALA 96.A H 2.988 2.218 GLY 97.A N ALA 93.A O GLY 97.A H 3.106 2.436 GLY 97.A N VAL 94.A O GLY 97.A H 3.196 2.473 PHE 98.A N ALA 93.A O PHE 98.A H 2.998 2.189 THR 99.A N LEU 79.A O THR 99.A H 2.888 2.134 THR 99.A OG1 VAL 3.A O THR 99.A HG1 2.726 2.084 SER 100.A N LEU 79.A O SER 100.A H 3.118 2.523 VAL 101.A N SER 130.A O VAL 101.A H 2.897 2.107 MET 102.A N LEU 81.A O MET 102.A H 2.921 2.164 ILE 103.A N GLU 132.A O ILE 103.A H 3.009 2.234 ASP 104.A N GLY 84.A O ASP 104.A H 2.914 2.063 SER 106.A N ASP 104.A OD1 SER 106.A H 3.016 2.161 HIS 108.A N ALA 105.A O HIS 108.A H 3.015 2.174 GLU 111.A N GLU 111.A OE1 GLU 111.A H 2.763 2.001 ASN 113.A N ALA 109.A O ASN 113.A H 2.925 2.070 ASN 113.A ND2 GLU 134.A O ASN 113.A HD22 2.945 2.095 LEU 114.A N PHE 110.A O LEU 114.A H 2.826 1.981 GLU 115.A N GLU 111.A O GLU 115.A H 2.923 2.125 LEU 116.A N GLU 112.A O LEU 116.A H 3.005 2.150 THR 117.A N ASN 113.A O THR 117.A H 2.918 2.066 THR 117.A OG1 ASN 113.A O THR 117.A HG1 2.908 2.232 THR 117.A OG1 ASN 113.A OD1 THR 117.A HG1 3.176 2.753 SER 118.A N LEU 114.A O SER 118.A H 2.887 2.058 SER 118.A OG LEU 114.A O SER 118.A HG 2.852 2.121 LYS 119.A N GLU 115.A O LYS 119.A H 3.088 2.288 VAL 120.A N LEU 116.A O VAL 120.A H 3.041 2.209 VAL 121.A N THR 117.A O VAL 121.A H 2.812 1.971 LYS 122.A N SER 118.A O LYS 122.A H 2.923 2.095 MET 123.A N LYS 119.A O MET 123.A H 3.233 2.383 ALA 124.A N VAL 120.A O ALA 124.A H 2.775 1.929 HIS 125.A N VAL 121.A O HIS 125.A H 2.776 1.918 HIS 125.A NE2 ASP 156.A OD2 HIS 125.A HE2 2.792 1.937 ASN 126.A N LYS 122.A O ASN 126.A H 3.135 2.316 ALA 127.A N ALA 124.A O ALA 127.A H 2.937 2.191 GLY 128.A N HIS 125.A O GLY 128.A H 3.077 2.229 VAL 129.A N ALA 124.A O VAL 129.A H 2.902 2.059 SER 130.A N THR 99.A O SER 130.A H 3.339 2.501 VAL 131.A N ASP 156.A OD2 VAL 131.A H 2.825 2.051 GLU 132.A N VAL 101.A O GLU 132.A H 2.859 2.043 ALA 133.A N TYR 157.A O ALA 133.A H 3.188 2.420 LEU 135.A N ALA 159.A O LEU 135.A H 3.140 2.321 ARG 137.A N VAL 139.A O ARG 137.A H 2.911 2.059 ARG 137.A NH1 HIS 108.A O ARG 137.A HH12 2.825 2.250 VAL 141.A N ALA 161.A O VAL 141.A H 3.031 2.175 LYS 144.A N ASN 142.A OD1 LYS 144.A H 2.986 2.319 LYS 144.A NZ GLU 147.A OE1 LYS 144.A HZ3 2.846 2.127 GLU 145.A N ASN 142.A OD1 GLU 145.A H 3.420 2.627 ALA 146.A N ASN 142.A O ALA 146.A H 2.968 2.176 GLU 147.A N PRO 143.A O GLU 147.A H 2.978 2.188 GLN 148.A N LYS 144.A O GLN 148.A H 3.220 2.381 PHE 149.A N GLU 145.A O PHE 149.A H 2.717 1.873 VAL 150.A N ALA 146.A O VAL 150.A H 2.919 2.074 LYS 151.A N GLU 147.A O LYS 151.A H 3.087 2.256 GLU 152.A N.A GLN 148.A O GLU 152.A H.A 2.880 2.053 GLU 152.A N.B GLN 148.A O GLU 152.A H.B 2.867 2.032 SER 153.A N PHE 149.A O SER 153.A H 2.931 2.097 SER 153.A OG PHE 149.A O SER 153.A HG 2.788 2.093 GLN 154.A N VAL 150.A O GLN 154.A H 2.997 2.220 VAL 155.A N SER 153.A OG VAL 155.A H 3.016 2.168 ASP 156.A N VAL 131.A O ASP 156.A H 3.029 2.318 TYR 157.A N VAL 131.A O TYR 157.A H 3.166 2.384 TYR 157.A OH SER 100.A OG TYR 157.A HH 2.594 1.803 LEU 158.A N PRO 192.A O LEU 158.A H 3.256 2.479 ALA 159.A N ALA 133.A O ALA 159.A H 2.803 1.956 ALA 161.A N LEU 135.A O ALA 161.A H 2.913 2.097 LYS 170.A N LYS 220.A O LYS 170.A H 3.270 2.444 LYS 170.A NZ SER 165.A O LYS 170.A HZ2 2.839 2.239 LYS 170.A NZ GLY 167.A O LYS 170.A HZ3 2.783 2.055 LYS 170.A NZ GLY 197.A O LYS 170.A HZ2 3.049 2.458 ASP 178.A N ILE 162.A O ASP 178.A H 2.907 2.088 ARG 181.A N ASP 178.A OD1 ARG 181.A H 3.035 2.189 ARG 181.A NE ASP 178.A OD2 ARG 181.A HE 2.851 2.004 ARG 181.A NH1 VAL 141.A O ARG 181.A HH11 2.779 1.932 ARG 181.A NH2 ASP 178.A OD2 ARG 181.A HH21 3.295 2.603 LEU 182.A N ASP 178.A O LEU 182.A H 3.072 2.244 GLN 183.A N PHE 179.A O GLN 183.A H 2.933 2.102 GLU 184.A N GLU 180.A O GLU 184.A H 3.077 2.284 VAL 185.A N ARG 181.A O VAL 185.A H 2.946 2.094 LYS 186.A N LEU 182.A O LYS 186.A H 2.912 2.085 LYS 186.A NZ ILE 191.A O LYS 186.A HZ1 2.929 2.043 LYS 186.A NZ GLY 234.A O LYS 186.A HZ2 2.975 2.106 ARG 187.A N GLN 183.A O ARG 187.A H 2.894 2.060 ARG 187.A NE GLU 184.A OE2 ARG 187.A HE 3.171 2.343 ARG 187.A NH2 GLU 184.A OE1 ARG 187.A HH21 2.414 1.646 ARG 187.A NH2 GLU 184.A OE2 ARG 187.A HH21 3.390 2.639 LEU 188.A N GLU 184.A O LEU 188.A H 2.996 2.176 THR 189.A N VAL 185.A O THR 189.A H 2.910 2.126 ASN 190.A N LYS 186.A O ASN 190.A H 2.908 2.073 LEU 193.A N ASN 236.A OD1 LEU 193.A H 3.361 2.611 VAL 194.A N LEU 158.A O VAL 194.A H 2.811 2.074 LEU 195.A N LYS 237.A O LEU 195.A H 2.852 2.018 HIS 196.A NE2 GLU 132.A OE2 HIS 196.A HE2 2.734 1.880 ALA 198.A N ASN 239.A O ALA 198.A H 3.224 2.438 ALA 200.A N ASP 243.A OD2 ALA 200.A H 2.875 2.041 ILE 201.A N ASP 243.A OD1 ILE 201.A H 2.709 1.935 ARG 206.A N PRO 202.A O ARG 206.A H 2.875 2.024 ARG 206.A NH1 SER 219.A O ARG 206.A HH12 2.925 2.240 ARG 206.A NH1 SER 219.A OG ARG 206.A HH12 3.282 2.620 ARG 206.A NH2 SER 219.A O ARG 206.A HH22 2.668 1.893 LYS 207.A N ASP 203.A O LYS 207.A H 2.839 2.022 LYS 207.A NZ ASP 211.A OD1 LYS 207.A HZ2 2.588 1.734 SER 208.A N ASN 204.A O SER 208.A H 2.935 2.133 SER 208.A OG GLU 251.A OE1 SER 208.A HG 3.314 2.655 TYR 209.A N VAL 205.A O TYR 209.A H 3.025 2.205 LEU 210.A N ARG 206.A O LEU 210.A H 2.923 2.093 ASP 211.A N LYS 207.A O ASP 211.A H 2.810 1.962 ALA 212.A N SER 208.A O ALA 212.A H 3.050 2.259 GLY 213.A N LEU 210.A O GLY 213.A H 2.829 2.004 GLY 214.A N TYR 209.A O GLY 214.A H 2.898 2.087 LYS 217.A N ASP 215.A OD2 LYS 217.A H 3.055 2.292 LYS 217.A NZ ASP 215.A OD1 LYS 217.A HZ2 3.253 2.553 SER 219.A N LEU 216.A O SER 219.A H 3.045 2.313 VAL 222.A N SER 199.A O VAL 222.A H 2.844 2.000 GLU 225.A N GLU 225.A OE1 GLU 225.A H 2.736 1.923 PHE 226.A N PRO 223.A O PHE 226.A H 2.907 2.307 LEU 227.A N PRO 223.A O LEU 227.A H 3.084 2.287 GLN 228.A N PHE 224.A O GLN 228.A H 3.006 2.182 GLU 229.A N GLU 225.A O GLU 229.A H 2.880 2.066 SER 230.A N.A PHE 226.A O SER 230.A H.A 2.796 1.995 SER 230.A N.B PHE 226.A O SER 230.A H.B 2.824 2.058 SER 230.A OG.A PHE 226.A O SER 230.A HG.A 2.828 2.028 SER 230.A OG.B LEU 227.A O SER 230.A HG.B 2.857 2.036 VAL 231.A N LEU 227.A O VAL 231.A H 3.042 2.233 LYS 232.A N GLN 228.A O LYS 232.A H 2.927 2.092 GLY 233.A N GLU 229.A O GLY 233.A H 2.897 2.166 GLY 234.A N VAL 231.A O GLY 234.A H 3.039 2.225 ILE 235.A N SER 230.A O.A ILE 235.A H 3.030 2.174 ILE 235.A N SER 230.A O.B ILE 235.A H 2.911 2.060 ASN 236.A N LEU 193.A O ASN 236.A H 2.783 1.929 ASN 236.A ND2 TYR 17.A O ASN 236.A HD22 3.072 2.217 LYS 237.A N LEU 193.A O LYS 237.A H 3.092 2.360 LYS 237.A NZ GLN 47.A OE1 LYS 237.A HZ2 3.039 2.297 LYS 237.A NZ GLU 132.A OE1 LYS 237.A HZ3 2.746 1.942 LYS 237.A NZ ASN 239.A OD1 LYS 237.A HZ1 2.746 1.885 VAL 238.A N VAL 19.A O VAL 238.A H 3.001 2.245 ASN 239.A N LEU 195.A O ASN 239.A H 2.928 2.079 THR 240.A N ALA 21.A O THR 240.A H 2.905 2.103 ARG 245.A N ASP 241.A O ARG 245.A H 3.057 2.259 ARG 245.A NE ASP 241.A OD1 ARG 245.A HE 2.877 2.033 ARG 245.A NH2 ASP 241.A OD2 ARG 245.A HH21 2.876 2.043 ILE 246.A N THR 242.A O ILE 246.A H 2.935 2.094 ALA 247.A N ASP 243.A O ALA 247.A H 3.160 2.309 PHE 248.A N LEU 244.A O PHE 248.A H 3.016 2.189 ILE 249.A N ARG 245.A O ILE 249.A H 2.885 2.028 ALA 250.A N ILE 246.A O ALA 250.A H 2.875 2.028 GLU 251.A N PHE 248.A O GLU 251.A H 3.062 2.416 VAL 252.A N PHE 248.A O VAL 252.A H 3.250 2.454 ARG 253.A N ILE 249.A O ARG 253.A H 2.857 2.003 LYS 254.A N ALA 250.A O LYS 254.A H 2.977 2.201 VAL 255.A N GLU 251.A O VAL 255.A H 3.053 2.216 ALA 256.A N VAL 252.A O ALA 256.A H 3.052 2.207 ASN 257.A N ARG 253.A O ASN 257.A H 2.927 2.147 ASN 257.A ND2 ALA 212.A O ASN 257.A HD21 2.783 2.059 GLU 258.A N LYS 254.A O GLU 258.A H 3.001 2.251 ASP 259.A N VAL 255.A O ASP 259.A H 3.145 2.359 LYS 260.A NZ ALA 256.A O LYS 260.A HZ3 3.354 2.540 SER 261.A N ASP 259.A OD1 SER 261.A H 2.893 2.118 GLN 262.A N ASP 259.A O GLN 262.A H 3.178 2.324 ASP 264.A N GLN 262.A OE1 ASP 264.A H 3.020 2.179 ARG 266.A N ASP 264.A OD1 ARG 266.A H 2.961 2.200 ARG 266.A NE ASP 264.A OD1 ARG 266.A HE 2.906 2.061 ARG 266.A NH2 ASP 264.A OD1 ARG 266.A HH21 3.438 2.762 ARG 266.A NH2 ASP 264.A OD2 ARG 266.A HH21 3.143 2.414 LYS 267.A N ASP 264.A O LYS 267.A H 2.906 2.180 PHE 268.A N LEU 265.A O PHE 268.A H 3.086 2.431 PHE 269.A N LEU 265.A O PHE 269.A H 2.993 2.233 SER 270.A N ARG 266.A O SER 270.A H 2.886 2.053 GLN 273.A N PHE 269.A O GLN 273.A H 2.856 2.014 LEU 274.A N SER 270.A O LEU 274.A H 3.083 2.260 ALA 275.A N PRO 271.A O ALA 275.A H 3.053 2.243 LEU 276.A N ALA 272.A O LEU 276.A H 3.027 2.180 LYS 277.A N GLN 273.A O LYS 277.A H 2.743 1.888 LYS 277.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 277.A HZ1 3.085 2.334 LYS 277.A NZ GLU 39.A OE2 LYS 277.A HZ1 2.962 2.116 ASN 278.A N LEU 274.A O ASN 278.A H 2.992 2.194 VAL 279.A N ALA 275.A O VAL 279.A H 3.158 2.326 VAL 280.A N LEU 276.A O VAL 280.A H 3.050 2.233 LYS 281.A N LYS 277.A O LYS 281.A H 2.865 2.019 LYS 281.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 281.A HZ3 2.532 1.653 GLU 282.A N ASN 278.A O GLU 282.A H 2.993 2.136 ARG 283.A N VAL 279.A O ARG 283.A H 2.974 2.167 ARG 283.A NH1 ASP 243.A OD2 ARG 283.A HH12 2.869 2.107 ARG 283.A NH2 ASP 243.A OD2 ARG 283.A HH22 2.853 2.088 MET 284.A N VAL 280.A O MET 284.A H 2.809 1.978 LYS 285.A N LYS 281.A O LYS 285.A H 3.100 2.275 LYS 285.A NZ GLU 282.A OE1 LYS 285.A HZ1 3.520 2.917 LYS 285.A NZ GLU 282.A OE2 LYS 285.A HZ1 2.617 1.815 LEU 286.A N GLU 282.A O LEU 286.A H 2.903 2.080 LEU 287.A N ARG 283.A O LEU 287.A H 2.932 2.125 GLY 288.A N MET 284.A O GLY 288.A H 3.105 2.420 SER 289.A N MET 284.A O SER 289.A H 3.092 2.398 ASN 291.A N GLU 40.A O ASN 291.A H 2.863 2.056 LYS 292.A N ASN 41.A O LYS 292.A H 3.083 2.467 LYS 292.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 292.A HZ1 2.589 1.895 ILE 293.A N ASN 41.A O ILE 293.A H 3.284 2.562