Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vc6_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 2.A N GLU 76.A OE2 ARG 2.A H 3.213 2.500 ARG 2.A NE GLU 6.A OE1 ARG 2.A HE 3.009 2.206 TYR 3.A N GLU 76.A OE1 TYR 3.A H 3.271 2.464 TYR 3.A OH GLU 9.A OE2 TYR 3.A HH 2.931 2.110 THR 4.A N SER 1.A OG THR 4.A H 3.230 2.372 THR 4.A OG1 SER 1.A OG THR 4.A HG1 3.149 2.400 THR 5.A N SER 1.A O THR 5.A H 2.742 1.978 THR 5.A OG1 SER 1.A O THR 5.A HG1 2.914 2.296 GLU 6.A N ARG 2.A O GLU 6.A H 2.732 1.891 PHE 7.A N TYR 3.A O PHE 7.A H 3.001 2.235 HIS 8.A N VAL 25.A O HIS 8.A H 2.927 2.102 LEU 10.A N LYS 23.A O LEU 10.A H 2.721 1.882 GLU 11.A N LYS 23.A O GLU 11.A H 3.334 2.555 ILE 13.A N VAL 21.A O ILE 13.A H 2.790 1.976 GLY 14.A N VAL 21.A O GLY 14.A H 3.127 2.404 GLY 16.A N GLY 19.A O GLY 16.A H 3.044 2.315 GLY 19.A N GLY 16.A O GLY 19.A H 3.064 2.209 SER 20.A N ARG 37.A O SER 20.A H 2.981 2.137 VAL 21.A N GLY 14.A O VAL 21.A H 2.908 2.078 PHE 22.A N ILE 35.A O PHE 22.A H 2.922 2.099 LYS 23.A N GLU 11.A O LYS 23.A H 2.713 1.926 CYS 24.A N TYR 33.A O CYS 24.A H 2.939 2.095 VAL 25.A N HIS 8.A O VAL 25.A H 2.993 2.193 LYS 26.A N CYS 31.A O LYS 26.A H 2.828 2.006 ARG 27.A N GLU 6.A O ARG 27.A H 2.918 2.068 ARG 27.A NE THR 5.A O ARG 27.A HE 2.920 2.291 ARG 27.A NH2 THR 4.A O ARG 27.A HH21 2.759 1.909 GLY 30.A N LYS 26.A O GLY 30.A H 2.907 2.203 CYS 31.A N ASP 29.A OD1 CYS 31.A H 2.883 2.026 TYR 33.A N CYS 24.A O TYR 33.A H 2.807 1.974 TYR 33.A OH ASP 29.A OD2 TYR 33.A HH 2.571 1.765 ALA 34.A N ASN 84.A O ALA 34.A H 2.847 2.042 ILE 35.A N PHE 22.A O ILE 35.A H 2.937 2.093 LYS 36.A N ILE 82.A O LYS 36.A H 2.842 2.068 LYS 36.A NZ GLU 54.A OE2 LYS 36.A HZ1 2.921 2.059 ARG 37.A N SER 20.A O ARG 37.A H 2.754 1.903 SER 38.A N MET 80.A O SER 38.A H 2.830 2.036 LYS 39.A NZ LYS 40.A O LYS 39.A HZ1 2.769 2.074 LYS 39.A NZ ASP 78.A OD2 LYS 39.A HZ2 2.892 2.168 LYS 40.A N ASP 78.A O LYS 40.A H 2.808 1.950 GLY 44.A N GLU 48.A OE1 GLY 44.A H 2.827 1.976 SER 45.A N LEU 42.A O SER 45.A H 3.267 2.625 GLU 48.A N SER 45.A OG GLU 48.A H 2.959 2.140 GLN 49.A N SER 45.A O GLN 49.A H 2.946 2.138 ASN 50.A N VAL 46.A O ASN 50.A H 2.764 1.913 ALA 51.A N ASP 47.A O ALA 51.A H 2.918 2.059 LEU 52.A N GLU 48.A O LEU 52.A H 2.891 2.084 ARG 53.A N GLN 49.A O ARG 53.A H 3.224 2.456 ARG 53.A N ASN 50.A O ARG 53.A H 3.065 2.446 ARG 53.A NE GLY 153.A O ARG 53.A HE 2.902 2.110 VAL 55.A N ALA 51.A O VAL 55.A H 3.345 2.527 TYR 56.A N LEU 52.A O TYR 56.A H 3.356 2.549 ALA 57.A N ARG 53.A O ALA 57.A H 3.046 2.238 HIS 58.A N GLU 54.A O HIS 58.A H 3.188 2.369 ALA 59.A N VAL 55.A O ALA 59.A H 3.133 2.310 VAL 60.A N TYR 56.A O VAL 60.A H 3.161 2.485 VAL 60.A N ALA 57.A O VAL 60.A H 3.239 2.543 LEU 61.A N ALA 57.A O LEU 61.A H 2.716 1.868 GLY 62.A N TYR 124.A OH GLY 62.A H 2.970 2.149 HIS 66.A N HIS 64.A ND1 HIS 66.A H 3.067 2.217 HIS 66.A ND1 PHE 147.A O HIS 66.A HD1 2.720 1.890 VAL 67.A N HIS 64.A O VAL 67.A H 3.019 2.163 VAL 68.A N ILE 149.A O VAL 68.A H 2.743 1.891 ARG 69.A N GLU 85.A OE1 ARG 69.A H 2.919 2.063 PHE 71.A N GLN 83.A O PHE 71.A H 2.901 2.065 SER 72.A OG GLN 83.A OE1 SER 72.A HG 2.547 1.935 TRP 74.A N LEU 81.A O TRP 74.A H 2.843 2.029 TRP 74.A NE1 GLU 76.A OE1 TRP 74.A HE1 2.905 2.054 GLU 76.A N HIS 79.A O GLU 76.A H 2.979 2.190 HIS 79.A N GLU 76.A O HIS 79.A H 2.853 2.035 HIS 79.A ND1 ASP 77.A O HIS 79.A HD1 2.908 2.069 MET 80.A N SER 38.A O MET 80.A H 2.580 1.769 LEU 81.A N TRP 74.A O LEU 81.A H 2.832 1.972 ILE 82.A N LYS 36.A O ILE 82.A H 2.879 2.057 GLN 83.A N SER 72.A O GLN 83.A H 2.780 1.928 ASN 84.A N ALA 34.A O ASN 84.A H 2.742 1.921 ASN 84.A ND2 ALA 34.A O ASN 84.A HD21 3.086 2.327 GLU 85.A N ARG 69.A O GLU 85.A H 2.829 1.993 CYS 87.A SG SER 143.A OG CYS 87.A HG 3.511 2.592 GLY 89.A N ILE 142.A O GLY 89.A H 2.594 1.826 GLY 90.A N CYS 87.A O GLY 90.A H 3.196 2.340 SER 91.A N ASP 94.A OD2 SER 91.A H 2.897 2.069 LEU 92.A N ILE 140.A O LEU 92.A H 2.710 1.903 ASP 94.A N SER 91.A OG ASP 94.A H 2.996 2.160 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 3.105 2.279 ILE 96.A N LEU 92.A O ILE 96.A H 2.954 2.114 SER 97.A N ALA 93.A O SER 97.A H 3.015 2.175 SER 97.A OG ALA 93.A O SER 97.A HG 3.094 2.340 GLU 98.A N ASP 94.A O GLU 98.A H 2.913 2.105 ASN 99.A N ALA 95.A O ASN 99.A H 2.963 2.118 TYR 100.A N ILE 96.A O TYR 100.A H 2.876 2.065 ARG 101.A N GLU 98.A O ARG 101.A H 2.982 2.230 ILE 102.A N GLU 98.A O ILE 102.A H 2.670 1.841 MET 103.A N ASN 99.A O MET 103.A H 2.920 2.255 LYS 107.A N GLU 110.A OE1 LYS 107.A H 2.653 1.891 LYS 107.A NZ GLU 110.A OE1 LYS 107.A HZ2 2.995 2.387 LYS 107.A NZ GLU 110.A OE2 LYS 107.A HZ3 2.644 1.901 LEU 111.A N LYS 107.A O LEU 111.A H 3.067 2.307 LYS 112.A N GLU 108.A O LYS 112.A H 3.184 2.417 LYS 112.A NZ VAL 256.A O LYS 112.A HZ2 3.293 2.529 ASP 113.A N ALA 109.A O ASP 113.A H 2.949 2.152 LEU 114.A N GLU 110.A O LEU 114.A H 3.054 2.242 LEU 115.A N LEU 111.A O LEU 115.A H 3.110 2.317 LEU 116.A N LYS 112.A O LEU 116.A H 3.073 2.244 GLN 117.A N ASP 113.A O GLN 117.A H 2.965 2.138 GLN 117.A NE2 ASP 113.A OD1 GLN 117.A HE21 2.935 2.089 GLN 117.A NE2 VAL 145.A O GLN 117.A HE22 3.159 2.310 VAL 118.A N LEU 114.A O VAL 118.A H 3.058 2.209 GLY 119.A N LEU 115.A O GLY 119.A H 2.768 1.964 ARG 120.A N LEU 116.A O ARG 120.A H 2.857 2.114 GLY 121.A N GLN 117.A O GLY 121.A H 3.200 2.423 LEU 122.A N VAL 118.A O LEU 122.A H 2.993 2.155 ARG 123.A N GLY 119.A O ARG 123.A H 2.911 2.084 TYR 124.A N ARG 120.A O TYR 124.A H 3.209 2.407 ILE 125.A N GLY 121.A O ILE 125.A H 3.034 2.191 HIS 126.A N LEU 122.A O HIS 126.A H 2.789 1.933 HIS 126.A NE2 ASP 187.A OD2 no hydrogen 2.966 N/A SER 127.A N ARG 123.A O SER 127.A H 3.062 2.415 SER 127.A N TYR 124.A O SER 127.A H 2.909 2.236 MET 128.A N TYR 124.A O MET 128.A H 3.276 2.617 MET 128.A N ILE 125.A O MET 128.A H 3.042 2.303 SER 129.A N HIS 126.A O SER 129.A H 3.087 2.319 LEU 130.A N ILE 125.A O LEU 130.A H 3.288 2.456 VAL 131.A N THR 156.A O VAL 131.A H 2.947 2.173 HIS 132.A N ASP 187.A OD2 HIS 132.A H 2.794 1.980 HIS 132.A NE2 GLY 150.A O HIS 132.A HE2 2.910 2.118 MET 133.A N ASP 187.A OD1 MET 133.A H 2.792 1.961 ASP 134.A N HIS 132.A ND1 ASP 134.A H 3.207 2.427 ASN 139.A N LYS 136.A O ASN 139.A H 2.925 2.083 ASN 139.A ND2 ASP 134.A O ASN 139.A HD22 2.880 2.027 ASN 139.A ND2 ASP 134.A OD2 ASN 139.A HD21 3.398 2.793 ILE 140.A N PRO 137.A O ILE 140.A H 3.160 2.315 PHE 141.A N LYS 148.A O PHE 141.A H 2.838 1.996 ILE 142.A N GLY 90.A O ILE 142.A H 2.774 2.106 SER 143.A N MET 146.A O SER 143.A H 3.030 2.196 ARG 144.A N ASN 88.A OD1 ARG 144.A H 2.741 1.919 MET 146.A N SER 143.A O MET 146.A H 2.910 2.061 PHE 147.A N GLN 117.A OE1 PHE 147.A H 2.758 1.924 LYS 148.A N PHE 141.A O LYS 148.A H 3.015 2.241 LYS 148.A NZ SER 65.A O LYS 148.A HZ3 3.035 2.304 LYS 148.A NZ GLU 85.A OE2 LYS 148.A HZ2 3.032 2.288 ILE 149.A N HIS 66.A O ILE 149.A H 2.848 2.007 GLY 150.A N ASN 139.A O GLY 150.A H 2.856 1.997 GLY 153.A N ASP 151.A OD1 GLY 153.A H 3.472 2.622 VAL 155.A N LEU 152.A O VAL 155.A H 3.187 2.355 THR 156.A N VAL 131.A O THR 156.A H 3.185 2.418 ARG 157.A NE SER 129.A O ARG 157.A HE 3.520 2.694 ILE 158.A N SER 129.A O ILE 158.A H 2.869 2.031 GLN 162.A N THR 156.A OG1 GLN 162.A H 2.577 1.778 GLU 165.A N GLU 165.A OE2 GLU 165.A H 2.902 2.125 ASP 167.A N ASP 134.A OD1 ASP 167.A H 3.213 2.394 SER 168.A OG ARG 206.A O SER 168.A HG 2.948 2.479 ARG 169.A N ASP 167.A OD1 ARG 169.A H 2.990 2.138 ARG 169.A NE ASP 167.A OD1 ARG 169.A HE 3.048 2.222 ARG 169.A NE ASP 167.A OD2 ARG 169.A HE 3.375 2.710 ARG 169.A NH2 ASP 167.A OD2 ARG 169.A HH21 2.819 1.982 PHE 170.A N ASP 167.A O PHE 170.A H 2.936 2.094 GLU 174.A N GLU 174.A OE2 GLU 174.A H 2.980 2.188 VAL 175.A N ALA 172.A O VAL 175.A H 3.109 2.506 LEU 176.A N ALA 172.A O LEU 176.A H 3.373 2.587 GLN 177.A N ASN 173.A O GLN 177.A H 2.873 2.221 GLN 177.A N GLU 174.A O GLN 177.A H 3.031 2.397 GLU 178.A N VAL 175.A O GLU 178.A H 3.101 2.286 ASN 179.A N GLU 174.A O ASN 179.A H 2.963 2.129 THR 181.A N ASN 179.A OD1 THR 181.A H 3.126 2.279 LYS 185.A N HIS 182.A O LYS 185.A H 3.082 2.325 LYS 185.A NZ PRO 242.A O LYS 185.A HZ3 3.180 2.639 LYS 185.A NZ ARG 245.A O LYS 185.A HZ1 2.924 2.069 ALA 186.A N LEU 183.A O ALA 186.A H 2.690 1.940 ASP 187.A N PRO 184.A O ASP 187.A H 3.078 2.467 ILE 188.A N PRO 184.A O ILE 188.A H 3.290 2.519 PHE 189.A N LYS 185.A O PHE 189.A H 2.976 2.121 ALA 190.A N ALA 186.A O ALA 190.A H 2.990 2.233 LEU 191.A N ASP 187.A O LEU 191.A H 2.871 2.098 ALA 192.A N ILE 188.A O ALA 192.A H 3.076 2.275 LEU 193.A N PHE 189.A O LEU 193.A H 3.382 2.563 THR 194.A N ALA 190.A O THR 194.A H 3.151 2.419 VAL 195.A N LEU 191.A O VAL 195.A H 2.982 2.176 VAL 196.A N ALA 192.A O VAL 196.A H 2.979 2.168 CYS 197.A N LEU 193.A O CYS 197.A H 2.912 2.153 ALA 198.A N THR 194.A O ALA 198.A H 3.003 2.204 ALA 199.A N VAL 195.A O ALA 199.A H 2.897 2.199 GLY 200.A N CYS 197.A O GLY 200.A H 3.014 2.173 ALA 201.A N VAL 196.A O ALA 201.A H 3.263 2.444 TRP 211.A NE1 SER 168.A O TRP 211.A HE1 2.870 2.030 HIS 212.A N GLY 208.A O HIS 212.A H 3.383 2.539 GLU 213.A N ASP 209.A O GLU 213.A H 2.955 2.157 ILE 214.A N GLN 210.A O ILE 214.A H 3.145 2.376 ILE 214.A N TRP 211.A O ILE 214.A H 3.187 2.568 ARG 215.A N TRP 211.A O ARG 215.A H 3.411 2.620 ARG 215.A NE LEU 171.A O ARG 215.A HE 2.911 2.186 ARG 215.A NH1 TRP 211.A O ARG 215.A HH11 3.208 2.371 ARG 215.A NH2 ARG 169.A O ARG 215.A HH22 2.850 2.070 ARG 215.A NH2 LEU 171.A O ARG 215.A HH21 3.014 2.299 GLN 216.A N GLU 213.A O GLN 216.A H 3.180 2.393 GLY 217.A N ILE 214.A O GLY 217.A H 2.857 2.063 ARG 218.A N ILE 214.A O ARG 218.A H 3.191 2.556 THR 231.A N SER 227.A O THR 231.A H 3.086 2.254 THR 231.A OG1 SER 227.A O THR 231.A HG1 3.027 2.298 GLU 232.A N GLN 228.A O GLU 232.A H 3.010 2.244 LEU 233.A N GLU 229.A O LEU 233.A H 3.380 2.571 LEU 234.A N PHE 230.A O LEU 234.A H 3.045 2.212 LYS 235.A N THR 231.A O LYS 235.A H 2.803 2.059 VAL 236.A N GLU 232.A O VAL 236.A H 2.866 2.036 MET 237.A N LEU 233.A O MET 237.A H 3.167 2.438 ILE 238.A N LYS 235.A O ILE 238.A H 3.000 2.214 HIS 239.A N VAL 236.A O HIS 239.A H 3.235 2.397 ASP 241.A N HIS 239.A ND1 ASP 241.A H 3.069 2.217 GLU 243.A N ASP 241.A OD1 GLU 243.A H 3.217 2.418 ARG 244.A N ASP 241.A O ARG 244.A H 2.966 2.143 ARG 245.A N PRO 242.A O ARG 245.A H 3.110 2.343 ARG 245.A NE HIS 239.A O ARG 245.A HE 2.827 2.079 ARG 245.A NH1 GLU 174.A OE1 ARG 245.A HH12 2.565 1.771 ARG 245.A NH1 LYS 185.A O ARG 245.A HH11 3.153 2.424 ARG 245.A NH2 GLU 174.A OE2 ARG 245.A HH22 2.902 2.117 ARG 245.A NH2 HIS 239.A O ARG 245.A HH21 2.994 2.293 ALA 250.A N SER 247.A OG ALA 250.A H 3.005 2.156 LEU 251.A N SER 247.A O LEU 251.A H 2.890 2.134 VAL 252.A N ALA 248.A O VAL 252.A H 2.926 2.096 HIS 254.A N LEU 251.A O HIS 254.A H 2.881 2.031 VAL 256.A N HIS 254.A ND1 VAL 256.A H 3.050 2.208 LEU 257.A N HIS 254.A O LEU 257.A H 3.164 2.447 LEU 258.A N HIS 254.A O LEU 258.A H 3.425 2.595