Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vd2_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A OG GLU 76.A OE2 SER 1.A HG 2.618 1.825 ARG 2.A NE GLU 6.A OE2 ARG 2.A HE 3.478 2.663 TYR 3.A N GLU 76.A OE1 TYR 3.A H 2.899 2.180 TYR 3.A OH GLU 9.A OE2 TYR 3.A HH 2.719 1.883 THR 5.A N SER 1.A O THR 5.A H 2.764 1.943 THR 5.A OG1 SER 1.A O THR 5.A HG1 2.731 2.070 GLU 6.A N ARG 2.A O GLU 6.A H 2.984 2.145 PHE 7.A N TYR 3.A O PHE 7.A H 3.083 2.414 HIS 8.A N VAL 25.A O HIS 8.A H 2.799 1.979 LEU 10.A N LYS 23.A O LEU 10.A H 2.905 2.075 GLU 11.A N LYS 23.A O GLU 11.A H 3.352 2.604 ILE 13.A N VAL 21.A O ILE 13.A H 2.883 2.050 GLY 16.A N GLY 19.A O GLY 16.A H 2.774 2.115 GLY 19.A N GLY 16.A O GLY 19.A H 2.734 1.907 SER 20.A N ARG 37.A O SER 20.A H 3.011 2.204 VAL 21.A N GLY 14.A O VAL 21.A H 2.941 2.122 PHE 22.A N ILE 35.A O PHE 22.A H 2.827 2.006 LYS 23.A N GLU 11.A O LYS 23.A H 2.808 2.022 CYS 24.A N TYR 33.A O CYS 24.A H 2.857 2.047 VAL 25.A N HIS 8.A O VAL 25.A H 2.917 2.147 LYS 26.A N CYS 31.A O LYS 26.A H 3.010 2.192 ARG 27.A N GLU 6.A O ARG 27.A H 3.024 2.200 GLY 30.A N LYS 26.A O GLY 30.A H 2.805 2.046 CYS 31.A N ASP 29.A OD1 CYS 31.A H 2.846 1.986 TYR 33.A N CYS 24.A O TYR 33.A H 2.852 2.027 TYR 33.A OH ASP 29.A OD2 TYR 33.A HH 2.751 1.942 ALA 34.A N ASN 84.A O ALA 34.A H 2.844 2.079 ILE 35.A N PHE 22.A O ILE 35.A H 2.856 2.014 LYS 36.A N ILE 82.A O LYS 36.A H 2.736 1.931 ARG 37.A N SER 20.A O ARG 37.A H 2.676 1.823 SER 38.A N MET 80.A O SER 38.A H 2.946 2.116 SER 38.A OG PHE 18.A O SER 38.A HG 2.982 2.279 LYS 40.A N ASP 78.A O LYS 40.A H 2.900 2.045 LYS 40.A NZ ASP 77.A O LYS 40.A HZ3 3.022 2.292 GLY 44.A N GLU 48.A OE1 GLY 44.A H 2.714 1.876 SER 45.A N LEU 42.A O SER 45.A H 3.099 2.384 SER 45.A OG LEU 42.A O SER 45.A HG 2.445 1.697 GLN 49.A N SER 45.A O GLN 49.A H 3.348 2.529 ASN 50.A N VAL 46.A O ASN 50.A H 2.919 2.074 ALA 51.A N ASP 47.A O ALA 51.A H 3.050 2.276 LEU 52.A N GLU 48.A O LEU 52.A H 2.860 2.059 ARG 53.A N GLN 49.A O ARG 53.A H 2.644 1.790 ARG 53.A NE GLY 154.A O ARG 53.A HE 2.807 2.011 ARG 53.A NH1 GLN 163.A OE1 ARG 53.A HH11 3.560 2.768 ARG 53.A NH2 ASN 50.A OD1 ARG 53.A HH21 2.306 1.615 GLU 54.A N ASN 50.A O GLU 54.A H 2.969 2.177 VAL 55.A N ALA 51.A O VAL 55.A H 3.064 2.272 TYR 56.A N LEU 52.A O TYR 56.A H 2.842 1.984 ALA 57.A N ARG 53.A O ALA 57.A H 2.923 2.088 HIS 58.A N GLU 54.A O HIS 58.A H 3.206 2.356 ALA 59.A N VAL 55.A O ALA 59.A H 2.978 2.147 VAL 60.A N TYR 56.A O VAL 60.A H 2.840 2.015 LEU 61.A N ALA 57.A O LEU 61.A H 2.810 2.010 GLY 62.A N HIS 58.A O GLY 62.A H 2.679 1.852 HIS 66.A N HIS 64.A ND1 HIS 66.A H 3.123 2.281 HIS 66.A ND1 PHE 148.A O HIS 66.A HD1 2.855 2.009 VAL 67.A N HIS 64.A O VAL 67.A H 3.109 2.257 VAL 68.A N ILE 150.A O VAL 68.A H 2.936 2.113 ARG 69.A N GLU 85.A OE1 ARG 69.A H 2.988 2.147 PHE 71.A N GLN 83.A O PHE 71.A H 2.879 2.027 SER 72.A OG GLN 83.A OE1 SER 72.A HG 2.728 2.138 TRP 74.A N LEU 81.A O TRP 74.A H 2.943 2.156 TRP 74.A NE1 GLU 76.A OE1 TRP 74.A HE1 2.494 1.655 GLU 76.A N HIS 79.A O GLU 76.A H 3.082 2.261 HIS 79.A N GLU 76.A O HIS 79.A H 3.113 2.322 MET 80.A N SER 38.A O MET 80.A H 2.611 1.786 LEU 81.A N TRP 74.A O LEU 81.A H 2.772 1.914 ILE 82.A N LYS 36.A O ILE 82.A H 2.929 2.148 GLN 83.A N SER 72.A O GLN 83.A H 2.858 2.003 ASN 84.A N ALA 34.A O ASN 84.A H 2.772 1.957 ASN 84.A ND2 ALA 34.A O ASN 84.A HD22 3.406 2.646 GLU 85.A N ARG 69.A O GLU 85.A H 3.000 2.170 ASN 88.A ND2 ARG 144.A O ASN 88.A HD21 2.931 2.078 GLY 89.A N ILE 142.A O GLY 89.A H 2.757 1.973 GLY 90.A N CYS 87.A O GLY 90.A H 3.172 2.332 SER 91.A N ASP 94.A OD2 SER 91.A H 3.239 2.384 LEU 92.A N ILE 140.A O LEU 92.A H 2.746 1.944 ALA 93.A N PRO 137.A O ALA 93.A H 3.287 2.562 ASP 94.A N SER 91.A OG ASP 94.A H 3.168 2.373 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 2.946 2.143 ILE 96.A N LEU 92.A O ILE 96.A H 2.770 1.940 SER 97.A N ALA 93.A O SER 97.A H 2.952 2.091 GLU 98.A N ASP 94.A O GLU 98.A H 2.834 2.056 ASN 99.A N ALA 95.A O ASN 99.A H 2.953 2.219 TYR 100.A N ILE 96.A O TYR 100.A H 3.129 2.351 ARG 101.A N SER 97.A O ARG 101.A H 3.290 2.525 ARG 101.A NE GLU 98.A OE1 ARG 101.A HE 2.655 1.801 ARG 101.A NH2 GLU 98.A OE1 ARG 101.A HH21 3.397 2.781 ILE 102.A N GLU 98.A O ILE 102.A H 3.109 2.276 SER 104.A N ASN 99.A O SER 104.A H 2.984 2.232 LYS 107.A N GLU 110.A OE1 LYS 107.A H 3.189 2.436 LEU 111.A N LYS 107.A O LEU 111.A H 2.809 1.974 LYS 112.A N GLU 108.A O LYS 112.A H 2.807 1.970 ASP 113.A N ALA 109.A O ASP 113.A H 3.099 2.298 LEU 114.A N GLU 110.A O LEU 114.A H 2.840 2.024 LEU 115.A N LEU 111.A O LEU 115.A H 2.938 2.116 LEU 116.A N LYS 112.A O LEU 116.A H 2.924 2.102 GLN 117.A N ASP 113.A O GLN 117.A H 2.990 2.151 GLN 117.A NE2 ASP 113.A OD1 GLN 117.A HE21 3.364 2.531 GLN 117.A NE2 ASP 113.A OD2 GLN 117.A HE21 3.036 2.324 GLN 117.A NE2 VAL 146.A O GLN 117.A HE22 3.069 2.237 VAL 118.A N LEU 114.A O VAL 118.A H 3.103 2.251 GLY 119.A N LEU 115.A O GLY 119.A H 2.839 2.044 ARG 120.A N LEU 116.A O ARG 120.A H 2.949 2.232 ARG 120.A N GLN 117.A O ARG 120.A H 3.107 2.485 GLY 121.A N GLN 117.A O GLY 121.A H 3.171 2.345 LEU 122.A N VAL 118.A O LEU 122.A H 2.845 1.997 ARG 123.A N GLY 119.A O ARG 123.A H 2.699 1.897 TYR 124.A N ARG 120.A O TYR 124.A H 2.910 2.103 TYR 124.A OH LEU 61.A O TYR 124.A HH 2.569 1.757 ILE 125.A N GLY 121.A O ILE 125.A H 2.928 2.077 HIS 126.A N LEU 122.A O HIS 126.A H 2.771 1.911 HIS 126.A NE2 ASP 188.A OD2 HIS 126.A HE2 2.812 1.957 SER 127.A N ARG 123.A O SER 127.A H 2.933 2.134 SER 127.A OG TYR 124.A O SER 127.A HG 2.623 1.813 MET 128.A N TYR 124.A O MET 128.A H 3.106 2.390 MET 128.A N ILE 125.A O MET 128.A H 3.038 2.374 SER 129.A N HIS 126.A O SER 129.A H 2.905 2.097 LEU 130.A N ILE 125.A O LEU 130.A H 3.209 2.382 VAL 131.A N THR 157.A O VAL 131.A H 2.955 2.141 HIS 132.A N ASP 188.A OD2 HIS 132.A H 2.878 2.027 HIS 132.A NE2 GLY 151.A O HIS 132.A HE2 2.942 2.092 MET 133.A N ASP 188.A OD1 MET 133.A H 2.919 2.066 ASP 134.A N HIS 132.A ND1 ASP 134.A H 3.042 2.250 ASN 139.A N LYS 136.A O ASN 139.A H 2.889 2.060 ASN 139.A ND2 ASP 134.A O ASN 139.A HD22 2.751 1.903 ASN 139.A ND2 ASP 134.A OD2 ASN 139.A HD21 3.161 2.504 ILE 140.A N PRO 137.A O ILE 140.A H 3.161 2.324 PHE 141.A N LYS 149.A O PHE 141.A H 2.820 2.004 ILE 142.A N GLY 90.A O ILE 142.A H 2.887 2.205 SER 143.A N MET 147.A O SER 143.A H 2.848 2.001 ARG 144.A N ASN 88.A OD1 ARG 144.A H 2.756 1.906 MET 147.A N SER 143.A O MET 147.A H 2.829 2.017 PHE 148.A N GLN 117.A OE1 PHE 148.A H 2.897 2.064 LYS 149.A N PHE 141.A O LYS 149.A H 2.847 2.067 LYS 149.A NZ SER 65.A O LYS 149.A HZ3 2.683 1.828 ILE 150.A N HIS 66.A O ILE 150.A H 2.726 1.877 GLY 151.A N ASN 139.A O GLY 151.A H 2.797 1.949 HIS 155.A ND1 GLU 165.A O HIS 155.A HD1 3.037 2.182 VAL 156.A N LEU 153.A O VAL 156.A H 3.162 2.316 THR 157.A N VAL 131.A O THR 157.A H 3.156 2.420 ILE 159.A N SER 129.A O ILE 159.A H 3.010 2.173 GLN 163.A N THR 157.A OG1 GLN 163.A H 2.803 1.957 ASP 168.A N ASP 134.A OD1 ASP 168.A H 3.404 2.594 SER 169.A OG ARG 207.A O SER 169.A HG 3.135 2.704 ARG 170.A N ASP 168.A OD1 ARG 170.A H 2.928 2.074 ARG 170.A NE ASP 168.A OD1 ARG 170.A HE 3.168 2.319 ARG 170.A NE ASP 168.A OD2 ARG 170.A HE 3.363 2.683 ARG 170.A NH2 ASP 168.A OD2 ARG 170.A HH21 2.781 1.934 PHE 171.A N ASP 168.A O PHE 171.A H 3.028 2.204 GLU 175.A N GLU 175.A OE2 GLU 175.A H 2.802 1.999 VAL 176.A N ALA 173.A O VAL 176.A H 3.179 2.546 LEU 177.A N ALA 173.A O LEU 177.A H 3.333 2.494 GLN 178.A N ASN 174.A O GLN 178.A H 2.909 2.183 GLU 179.A N VAL 176.A O GLU 179.A H 2.792 2.013 ASN 180.A N GLU 175.A O ASN 180.A H 2.921 2.119 THR 182.A N ASN 180.A OD1 THR 182.A H 3.132 2.410 HIS 183.A ND1 THR 182.A O no hydrogen 2.569 N/A HIS 183.A NE2 GLU 244.A OE2 HIS 183.A HE2 3.066 2.273 LYS 186.A N HIS 183.A O LYS 186.A H 3.002 2.285 LYS 186.A NZ ARG 246.A O LYS 186.A HZ3 2.598 1.760 ALA 187.A N LEU 184.A O ALA 187.A H 2.803 2.083 ILE 189.A N PRO 185.A O ILE 189.A H 3.270 2.468 PHE 190.A N LYS 186.A O PHE 190.A H 3.043 2.211 ALA 191.A N ALA 187.A O ALA 191.A H 3.028 2.196 LEU 192.A N ASP 188.A O LEU 192.A H 2.860 2.069 ALA 193.A N ILE 189.A O ALA 193.A H 3.004 2.187 LEU 194.A N PHE 190.A O LEU 194.A H 3.276 2.456 THR 195.A N ALA 191.A O THR 195.A H 2.878 2.070 THR 195.A OG1 ALA 191.A O THR 195.A HG1 2.806 2.016 VAL 196.A N LEU 192.A O VAL 196.A H 2.943 2.140 VAL 197.A N ALA 193.A O VAL 197.A H 2.916 2.152 CYS 198.A N LEU 194.A O CYS 198.A H 2.895 2.066 CYS 198.A SG LEU 194.A O CYS 198.A HG 3.365 2.316 ALA 199.A N THR 195.A O ALA 199.A H 3.054 2.214 ALA 200.A N VAL 196.A O ALA 200.A H 2.944 2.278 ALA 200.A N VAL 197.A O ALA 200.A H 3.060 2.407 GLY 201.A N CYS 198.A O GLY 201.A H 2.915 2.064 ALA 202.A N VAL 197.A O ALA 202.A H 3.394 2.547 TRP 212.A NE1 SER 169.A O TRP 212.A HE1 2.848 1.996 HIS 213.A N GLY 209.A O HIS 213.A H 3.268 2.429 HIS 213.A ND1 GLY 209.A O HIS 213.A HD1 3.173 2.442 GLU 214.A N ASP 210.A O GLU 214.A H 2.929 2.112 ILE 215.A N GLN 211.A O ILE 215.A H 3.030 2.223 ARG 216.A N TRP 212.A O ARG 216.A H 3.169 2.357 ARG 216.A NE LEU 172.A O ARG 216.A HE 2.954 2.212 ARG 216.A NH1 TRP 212.A O ARG 216.A HH11 3.450 2.604 ARG 216.A NH2 ARG 170.A O ARG 216.A HH22 3.048 2.235 ARG 216.A NH2 LEU 172.A O ARG 216.A HH21 2.829 2.076 GLN 217.A N HIS 213.A O GLN 217.A H 2.838 2.195 GLN 217.A N GLU 214.A O GLN 217.A H 3.290 2.604 GLY 218.A N ILE 215.A O GLY 218.A H 2.764 1.950 ARG 219.A N GLU 214.A O ARG 219.A H 3.095 2.289 ARG 219.A NH1 LEU 220.A O ARG 219.A HH11 3.465 2.677 GLN 225.A NE2 PHE 106.A O GLN 225.A HE22 2.742 1.916 GLN 225.A NE2 ALA 200.A O GLN 225.A HE21 3.049 2.228 SER 228.A N GLU 108.A OE2 SER 228.A H 2.800 1.974 SER 228.A OG GLU 108.A OE1 SER 228.A HG 2.460 1.782 PHE 231.A N SER 228.A OG PHE 231.A H 3.238 2.422 THR 232.A N SER 228.A O THR 232.A H 3.062 2.218 GLU 233.A N GLN 229.A O GLU 233.A H 2.951 2.185 LEU 234.A N GLU 230.A O LEU 234.A H 2.936 2.190 LEU 235.A N PHE 231.A O LEU 235.A H 3.122 2.288 LYS 236.A N THR 232.A O LYS 236.A H 2.999 2.240 VAL 237.A N GLU 233.A O VAL 237.A H 3.142 2.333 MET 238.A N LEU 234.A O MET 238.A H 3.191 2.434 ILE 239.A N LYS 236.A O ILE 239.A H 3.028 2.258 HIS 240.A N VAL 237.A O HIS 240.A H 3.198 2.366 ASP 242.A N HIS 240.A ND1 ASP 242.A H 3.015 2.163 GLU 244.A N ASP 242.A OD1 GLU 244.A H 3.346 2.596 ARG 245.A N ASP 242.A O ARG 245.A H 2.881 2.105 ARG 245.A NH2 ARG 245.A O ARG 245.A HH21 3.284 2.626 ARG 246.A N PRO 243.A O ARG 246.A H 2.956 2.195 ARG 246.A NE HIS 240.A O ARG 246.A HE 2.707 1.898 ARG 246.A NH1 GLU 175.A OE1 ARG 246.A HH12 2.693 1.930 ARG 246.A NH1 LYS 186.A O ARG 246.A HH11 3.122 2.358 ARG 246.A NH2 GLU 175.A OE2 ARG 246.A HH22 3.016 2.225 ARG 246.A NH2 HIS 240.A O ARG 246.A HH21 2.997 2.303 ALA 251.A N SER 248.A OG ALA 251.A H 2.945 2.088 LEU 252.A N SER 248.A O LEU 252.A H 2.485 1.739 VAL 253.A N ALA 249.A O VAL 253.A H 2.785 1.991 LYS 254.A N MET 250.A O LYS 254.A H 3.184 2.374 HIS 255.A N LEU 252.A O HIS 255.A H 3.209 2.392 HIS 255.A ND1 SER 256.A O no hydrogen 3.142 N/A