Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vd4_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 2.A N GLU 76.A OE1 ARG 2.A H 3.038 2.234 ARG 2.A NE GLU 6.A OE2 ARG 2.A HE 3.283 2.575 TYR 3.A N GLU 76.A OE2 TYR 3.A H 3.074 2.268 THR 4.A N SER 1.A OG THR 4.A H 2.879 2.031 THR 5.A N SER 1.A O THR 5.A H 2.844 2.032 GLU 6.A N ARG 2.A O GLU 6.A H 2.771 1.946 PHE 7.A N TYR 3.A O PHE 7.A H 2.984 2.285 HIS 8.A N VAL 25.A O HIS 8.A H 2.975 2.139 LEU 10.A N LYS 23.A O LEU 10.A H 2.844 2.038 GLU 11.A N LYS 23.A O GLU 11.A H 3.361 2.621 ILE 13.A N VAL 21.A O ILE 13.A H 2.894 2.069 GLY 14.A N VAL 21.A O GLY 14.A H 3.249 2.490 GLY 16.A N GLY 19.A O GLY 16.A H 3.010 2.196 GLY 19.A N GLY 16.A O GLY 19.A H 3.318 2.607 SER 20.A N ARG 37.A O SER 20.A H 2.920 2.082 VAL 21.A N GLY 14.A O VAL 21.A H 2.857 2.014 PHE 22.A N ILE 35.A O PHE 22.A H 2.675 1.840 LYS 23.A N GLU 11.A O LYS 23.A H 2.772 1.979 CYS 24.A N TYR 33.A O CYS 24.A H 2.921 2.089 VAL 25.A N HIS 8.A O VAL 25.A H 3.133 2.335 LYS 26.A N CYS 31.A O LYS 26.A H 2.982 2.180 ARG 27.A N GLU 6.A O ARG 27.A H 2.920 2.125 ARG 27.A NE THR 4.A O ARG 27.A HE 3.161 2.384 ARG 27.A NE THR 5.A O ARG 27.A HE 3.250 2.711 ARG 27.A NH1 THR 4.A O ARG 27.A HH12 3.069 2.276 GLY 30.A N LYS 26.A O GLY 30.A H 2.814 2.025 CYS 31.A N ASP 29.A OD1 CYS 31.A H 2.714 1.858 TYR 33.A N CYS 24.A O TYR 33.A H 2.838 2.015 TYR 33.A OH ASP 29.A OD2 TYR 33.A HH 2.773 1.954 ALA 34.A N ASN 84.A O ALA 34.A H 2.833 2.091 ILE 35.A N PHE 22.A O ILE 35.A H 2.785 1.935 LYS 36.A N ILE 82.A O LYS 36.A H 3.048 2.276 LYS 36.A NZ GLU 54.A OE2 LYS 36.A HZ1 3.335 2.525 ARG 37.A N SER 20.A O ARG 37.A H 2.696 1.850 SER 38.A N MET 80.A O SER 38.A H 2.998 2.156 LYS 39.A N PHE 18.A O LYS 39.A H 3.018 2.243 LYS 40.A N ASP 78.A O LYS 40.A H 2.796 1.950 GLY 44.A N GLU 48.A OE1 GLY 44.A H 2.906 2.231 SER 45.A N LEU 42.A O SER 45.A H 2.960 2.170 GLN 49.A N SER 45.A O GLN 49.A H 3.073 2.329 ASN 50.A N VAL 46.A O ASN 50.A H 2.898 2.074 ALA 51.A N ASP 47.A O ALA 51.A H 2.831 1.979 LEU 52.A N GLU 48.A O LEU 52.A H 3.039 2.265 ARG 53.A N GLN 49.A O ARG 53.A H 2.712 1.883 ARG 53.A NE GLY 155.A O ARG 53.A HE 2.893 2.169 ARG 53.A NH1 GLU 166.A OE1 ARG 53.A HH12 3.451 2.642 ARG 53.A NH2 ASN 50.A OD1 ARG 53.A HH21 2.488 1.772 GLU 54.A N ASN 50.A O GLU 54.A H 3.177 2.411 TYR 56.A N LEU 52.A O TYR 56.A H 2.943 2.085 ALA 57.A N ARG 53.A O ALA 57.A H 2.871 2.246 ALA 59.A N VAL 55.A O ALA 59.A H 3.061 2.270 VAL 60.A N ALA 57.A O VAL 60.A H 3.215 2.460 LEU 61.A N ALA 57.A O LEU 61.A H 2.834 2.110 GLY 62.A N HIS 58.A O GLY 62.A H 2.972 2.340 HIS 66.A N HIS 64.A ND1 HIS 66.A H 3.129 2.291 HIS 66.A ND1 PHE 149.A O HIS 66.A HD1 2.805 1.988 VAL 67.A N HIS 64.A O VAL 67.A H 3.149 2.295 VAL 68.A N ILE 151.A O VAL 68.A H 2.738 1.909 ARG 69.A N GLU 85.A OE2 ARG 69.A H 3.004 2.172 PHE 71.A N GLN 83.A O PHE 71.A H 2.856 2.033 SER 72.A OG GLN 83.A OE1 SER 72.A HG 2.899 2.188 TRP 74.A N LEU 81.A O TRP 74.A H 2.920 2.132 TRP 74.A NE1 GLU 76.A OE2 TRP 74.A HE1 3.020 2.183 GLU 76.A N HIS 79.A O GLU 76.A H 2.953 2.203 HIS 79.A N GLU 76.A O HIS 79.A H 3.068 2.287 HIS 79.A ND1 ASP 77.A O HIS 79.A HD1 2.993 2.176 MET 80.A N SER 38.A O MET 80.A H 2.762 1.970 LEU 81.A N TRP 74.A O LEU 81.A H 2.640 1.806 ILE 82.A N LYS 36.A O ILE 82.A H 3.017 2.215 GLN 83.A N SER 72.A O GLN 83.A H 2.746 1.888 ASN 84.A N ALA 34.A O ASN 84.A H 2.861 2.011 GLU 85.A N ARG 69.A O GLU 85.A H 2.818 1.983 CYS 87.A SG SER 143.A OG CYS 87.A HG 3.564 2.734 ASN 88.A ND2 ARG 144.A O ASN 88.A HD21 3.256 2.407 GLY 89.A N ILE 142.A O GLY 89.A H 2.778 2.010 GLY 90.A N CYS 87.A O GLY 90.A H 3.136 2.302 SER 91.A N ASP 94.A OD2 SER 91.A H 2.981 2.122 LEU 92.A N ILE 140.A O LEU 92.A H 2.710 1.930 ALA 93.A N PRO 137.A O ALA 93.A H 3.164 2.545 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 3.025 2.196 ILE 96.A N LEU 92.A O ILE 96.A H 2.866 2.102 SER 97.A N ALA 93.A O SER 97.A H 2.813 1.983 GLU 98.A N ASP 94.A O GLU 98.A H 2.747 2.016 ASN 99.A N ALA 95.A O ASN 99.A H 2.992 2.306 TYR 100.A N ILE 96.A O TYR 100.A H 3.006 2.252 ARG 101.A N SER 97.A O ARG 101.A H 3.108 2.259 ARG 101.A NE GLU 98.A OE2 ARG 101.A HE 3.152 2.478 ARG 101.A NH2 GLU 98.A OE1 ARG 101.A HH21 3.241 2.492 ARG 101.A NH2 GLU 98.A OE2 ARG 101.A HH21 2.815 2.061 MET 103.A N TYR 100.A O MET 103.A H 3.393 2.591 LYS 107.A N GLU 110.A OE1 LYS 107.A H 2.906 2.080 GLU 110.A N LYS 107.A O GLU 110.A H 3.047 2.453 LEU 111.A N LYS 107.A O LEU 111.A H 2.901 2.108 LYS 112.A N GLU 108.A O LYS 112.A H 2.961 2.124 ASP 113.A N ALA 109.A O ASP 113.A H 3.182 2.414 LEU 114.A N GLU 110.A O LEU 114.A H 2.934 2.097 LEU 115.A N LEU 111.A O LEU 115.A H 2.932 2.135 LEU 116.A N LYS 112.A O LEU 116.A H 2.845 2.008 GLN 117.A N ASP 113.A O GLN 117.A H 2.952 2.116 GLN 117.A NE2 ASP 113.A OD1 GLN 117.A HE22 2.762 1.946 GLN 117.A NE2 VAL 147.A O GLN 117.A HE21 3.205 2.363 VAL 118.A N LEU 114.A O VAL 118.A H 3.112 2.255 GLY 119.A N LEU 115.A O GLY 119.A H 2.923 2.163 ARG 120.A N LEU 116.A O ARG 120.A H 2.816 2.095 GLY 121.A N GLN 117.A O GLY 121.A H 3.132 2.358 LEU 122.A N VAL 118.A O LEU 122.A H 2.850 2.023 ARG 123.A N GLY 119.A O ARG 123.A H 2.828 2.009 TYR 124.A N ARG 120.A O TYR 124.A H 3.143 2.319 TYR 124.A OH LEU 61.A O TYR 124.A HH 2.516 1.745 ILE 125.A N GLY 121.A O ILE 125.A H 2.994 2.154 HIS 126.A N LEU 122.A O HIS 126.A H 2.807 1.953 HIS 126.A NE2 ASP 189.A OD2 no hydrogen 2.970 N/A SER 127.A N ARG 123.A O SER 127.A H 3.006 2.214 MET 128.A N TYR 124.A O MET 128.A H 3.138 2.459 MET 128.A N ILE 125.A O MET 128.A H 3.181 2.493 SER 129.A N HIS 126.A O SER 129.A H 2.774 1.994 LEU 130.A N ILE 125.A O LEU 130.A H 3.108 2.300 VAL 131.A N THR 158.A O VAL 131.A H 2.855 2.084 HIS 132.A N ASP 189.A OD2 HIS 132.A H 2.834 2.010 HIS 132.A NE2 GLY 152.A O HIS 132.A HE2 2.843 2.002 MET 133.A N ASP 189.A OD1 MET 133.A H 2.841 2.004 ASP 134.A N HIS 132.A ND1 ASP 134.A H 3.083 2.280 LYS 136.A NZ ASP 169.A OD2 LYS 136.A HZ3 3.361 2.654 ASN 139.A N LYS 136.A O ASN 139.A H 2.837 2.004 ASN 139.A ND2 ASP 134.A O ASN 139.A HD21 2.694 1.864 ASN 139.A ND2 ASP 134.A OD2 ASN 139.A HD22 2.831 2.173 ILE 140.A N PRO 137.A O ILE 140.A H 3.303 2.466 PHE 141.A N LYS 150.A O PHE 141.A H 2.770 1.913 ILE 142.A N GLY 90.A O ILE 142.A H 2.744 1.999 SER 143.A N MET 148.A O SER 143.A H 2.875 2.037 ARG 144.A N ASN 88.A OD1 ARG 144.A H 2.828 1.991 THR 145.A N LYS 146.A O THR 145.A H 2.722 1.878 MET 148.A N SER 143.A O MET 148.A H 2.832 2.001 PHE 149.A N GLN 117.A OE1 PHE 149.A H 2.641 1.797 LYS 150.A N PHE 141.A O LYS 150.A H 2.764 1.971 LYS 150.A NZ SER 65.A O LYS 150.A HZ2 2.950 2.154 LYS 150.A NZ GLU 85.A OE1 LYS 150.A HZ1 3.210 2.613 ILE 151.A N HIS 66.A O ILE 151.A H 2.851 2.001 GLY 152.A N ASN 139.A O GLY 152.A H 2.966 2.108 HIS 156.A ND1 GLU 166.A O no hydrogen 3.135 N/A VAL 157.A N LEU 154.A O VAL 157.A H 3.127 2.276 THR 158.A N VAL 131.A O THR 158.A H 2.997 2.217 THR 158.A OG1 GLN 164.A O THR 158.A HG1 3.530 2.894 ILE 160.A N SER 129.A O ILE 160.A H 3.141 2.300 SER 170.A OG ARG 208.A O SER 170.A HG 3.177 2.764 ARG 171.A N ASP 169.A OD1 ARG 171.A H 2.964 2.134 ARG 171.A NE ASP 169.A OD1 ARG 171.A HE 2.956 2.103 ARG 171.A NE ASP 169.A OD2 ARG 171.A HE 3.365 2.732 ARG 171.A NH2 ASP 169.A OD2 ARG 171.A HH21 2.620 1.774 PHE 172.A N ASP 169.A O PHE 172.A H 3.026 2.211 LEU 173.A N SER 170.A O LEU 173.A H 3.469 2.612 GLU 176.A N GLU 176.A OE2 GLU 176.A H 2.859 2.061 LEU 178.A N ALA 174.A O LEU 178.A H 3.441 2.614 GLN 179.A N ASN 175.A O GLN 179.A H 2.902 2.200 GLU 180.A N VAL 177.A O GLU 180.A H 2.845 2.036 ASN 181.A N GLU 176.A O ASN 181.A H 2.851 2.039 THR 183.A N ASN 181.A OD1 THR 183.A H 3.394 2.600 LYS 187.A N HIS 184.A O LYS 187.A H 2.979 2.209 LYS 187.A NZ ARG 247.A O LYS 187.A HZ1 2.976 2.126 ALA 188.A N LEU 185.A O ALA 188.A H 2.849 2.098 ASP 189.A N LEU 185.A O ASP 189.A H 3.366 2.593 ILE 190.A N PRO 186.A O ILE 190.A H 3.292 2.533 PHE 191.A N LYS 187.A O PHE 191.A H 3.064 2.258 ALA 192.A N ALA 188.A O ALA 192.A H 2.967 2.143 LEU 193.A N ASP 189.A O LEU 193.A H 2.894 2.130 ALA 194.A N ILE 190.A O ALA 194.A H 3.091 2.291 LEU 195.A N PHE 191.A O LEU 195.A H 3.333 2.536 THR 196.A N ALA 192.A O THR 196.A H 2.932 2.202 VAL 197.A N LEU 193.A O VAL 197.A H 2.930 2.122 VAL 198.A N ALA 194.A O VAL 198.A H 2.973 2.208 CYS 199.A N LEU 195.A O CYS 199.A H 2.948 2.135 ALA 200.A N THR 196.A O ALA 200.A H 3.105 2.293 ALA 201.A N VAL 197.A O ALA 201.A H 2.866 2.195 ALA 201.A N VAL 198.A O ALA 201.A H 3.075 2.437 GLY 202.A N CYS 199.A O GLY 202.A H 3.091 2.293 ALA 203.A N VAL 198.A O ALA 203.A H 3.313 2.458 TRP 213.A NE1 SER 170.A O TRP 213.A HE1 2.922 2.067 HIS 214.A N GLY 210.A O HIS 214.A H 3.215 2.416 GLU 215.A N ASP 211.A O GLU 215.A H 2.887 2.082 ILE 216.A N GLN 212.A O ILE 216.A H 3.202 2.427 ARG 217.A N TRP 213.A O ARG 217.A H 3.307 2.528 ARG 217.A NE LEU 173.A O ARG 217.A HE 2.975 2.198 ARG 217.A NH1 TRP 213.A O ARG 217.A HH11 3.283 2.440 ARG 217.A NH2 ARG 171.A O ARG 217.A HH22 2.950 2.118 ARG 217.A NH2 LEU 173.A O ARG 217.A HH21 2.990 2.251 GLN 218.A N HIS 214.A O GLN 218.A H 2.930 2.243 GLY 219.A N ILE 216.A O GLY 219.A H 2.860 2.050 ARG 220.A N GLU 215.A O ARG 220.A H 3.175 2.367 GLN 226.A NE2 PHE 106.A O GLN 226.A HE21 2.637 1.777 GLN 226.A NE2 ALA 201.A O GLN 226.A HE22 3.572 2.746 SER 229.A N GLU 108.A OE2 SER 229.A H 2.891 2.097 PHE 232.A N SER 229.A OG PHE 232.A H 3.083 2.260 THR 233.A N SER 229.A O THR 233.A H 2.872 2.033 THR 233.A OG1 SER 229.A O THR 233.A HG1 3.241 2.524 GLU 234.A N GLN 230.A O GLU 234.A H 2.869 2.079 LEU 235.A N GLU 231.A O LEU 235.A H 3.192 2.470 LEU 235.A N PHE 232.A O LEU 235.A H 3.127 2.521 LEU 236.A N PHE 232.A O LEU 236.A H 3.141 2.306 LYS 237.A N THR 233.A O LYS 237.A H 2.882 2.128 LYS 237.A NZ GLU 234.A OE2 LYS 237.A HZ2 2.741 1.916 VAL 238.A N GLU 234.A O VAL 238.A H 2.913 2.104 MET 239.A N LEU 235.A O MET 239.A H 3.082 2.349 ILE 240.A N LYS 237.A O ILE 240.A H 3.213 2.425 HIS 241.A N VAL 238.A O HIS 241.A H 3.089 2.264 ASP 243.A N HIS 241.A ND1 ASP 243.A H 3.054 2.262 GLU 245.A N ASP 243.A OD1 GLU 245.A H 3.025 2.268 ARG 246.A N ASP 243.A O ARG 246.A H 2.856 2.039 ARG 247.A N PRO 244.A O ARG 247.A H 3.097 2.360 ARG 247.A NE HIS 241.A O ARG 247.A HE 2.771 1.980 ARG 247.A NH1 GLU 176.A OE1 ARG 247.A HH12 2.693 1.899 ARG 247.A NH1 LYS 187.A O ARG 247.A HH11 2.925 2.171 ARG 247.A NH2 GLU 176.A OE2 ARG 247.A HH22 2.978 2.177 ARG 247.A NH2 HIS 241.A O ARG 247.A HH21 3.017 2.321 LEU 253.A N SER 249.A O LEU 253.A H 2.858 2.050 VAL 254.A N ALA 250.A O VAL 254.A H 2.892 2.076 LYS 255.A N MET 251.A O LYS 255.A H 2.958 2.269 HIS 256.A N LEU 253.A O HIS 256.A H 3.151 2.322 LEU 259.A N HIS 256.A O LEU 259.A H 2.820 2.030 LEU 260.A N SER 257.A O LEU 260.A H 3.144 2.299 SER 261.A OG LEU 260.A O SER 261.A HG 2.556 1.887