Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vd7_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 2.A N GLU 76.A OE2 ARG 2.A H 3.069 2.269 ARG 2.A NE GLU 6.A OE1 ARG 2.A HE 3.301 2.556 TYR 3.A N GLU 76.A OE1 TYR 3.A H 3.166 2.357 TYR 3.A OH GLU 9.A OE2 TYR 3.A HH 2.861 2.030 THR 4.A N SER 1.A OG THR 4.A H 3.277 2.423 THR 5.A N SER 1.A O THR 5.A H 2.819 2.040 GLU 6.A N ARG 2.A O GLU 6.A H 2.691 1.834 PHE 7.A N TYR 3.A O PHE 7.A H 2.985 2.263 HIS 8.A N VAL 25.A O HIS 8.A H 2.952 2.112 LEU 10.A N LYS 23.A O LEU 10.A H 2.879 2.051 GLU 11.A N LYS 23.A O GLU 11.A H 3.354 2.611 ILE 13.A N VAL 21.A O ILE 13.A H 2.865 2.067 GLY 14.A N VAL 21.A O GLY 14.A H 3.314 2.607 GLY 16.A N GLY 19.A O GLY 16.A H 2.984 2.291 GLY 19.A N GLY 16.A O GLY 19.A H 3.069 2.247 SER 20.A N ARG 37.A O SER 20.A H 2.812 1.962 VAL 21.A N GLY 14.A O VAL 21.A H 2.868 2.035 PHE 22.A N ILE 35.A O PHE 22.A H 2.729 1.903 LYS 23.A N GLU 11.A O LYS 23.A H 2.708 1.939 CYS 24.A N TYR 33.A O CYS 24.A H 2.831 1.996 VAL 25.A N HIS 8.A O VAL 25.A H 3.125 2.332 LYS 26.A N CYS 31.A O LYS 26.A H 2.988 2.172 ARG 27.A N GLU 6.A O ARG 27.A H 3.067 2.269 ARG 27.A NE THR 4.A O ARG 27.A HE 3.417 2.693 ARG 27.A NE THR 5.A O ARG 27.A HE 2.941 2.298 ARG 27.A NH1 THR 4.A O ARG 27.A HH11 3.039 2.206 GLY 30.A N LYS 26.A O GLY 30.A H 2.757 1.977 CYS 31.A N ASP 29.A OD1 CYS 31.A H 2.764 1.906 CYS 31.A SG ASP 29.A O CYS 31.A HG 3.743 2.595 TYR 33.A N CYS 24.A O TYR 33.A H 2.761 1.932 ALA 34.A N ASN 84.A O ALA 34.A H 2.909 2.178 ILE 35.A N PHE 22.A O ILE 35.A H 2.870 2.022 LYS 36.A N ILE 82.A O LYS 36.A H 3.043 2.225 ARG 37.A N SER 20.A O ARG 37.A H 2.635 1.801 SER 38.A N MET 80.A O SER 38.A H 3.119 2.332 LYS 39.A NZ ASP 78.A OD1 LYS 39.A HZ1 3.432 2.593 LYS 40.A N ASP 78.A O LYS 40.A H 3.120 2.262 GLY 44.A N GLU 48.A OE1 GLY 44.A H 2.487 1.673 SER 45.A N LEU 42.A O SER 45.A H 2.872 2.084 SER 45.A OG LEU 42.A O SER 45.A HG 2.305 1.584 GLN 49.A N SER 45.A O GLN 49.A H 3.023 2.199 ASN 50.A N VAL 46.A O ASN 50.A H 2.739 1.884 ASN 50.A ND2 GLY 155.A O ASN 50.A HD21 2.791 2.198 ALA 51.A N ASP 47.A O ALA 51.A H 2.793 2.073 LEU 52.A N GLU 48.A O LEU 52.A H 2.835 2.071 ARG 53.A N GLN 49.A O ARG 53.A H 3.115 2.304 ARG 53.A NE GLY 155.A O ARG 53.A HE 3.069 2.296 VAL 55.A N ALA 51.A O VAL 55.A H 3.346 2.532 TYR 56.A N LEU 52.A O TYR 56.A H 2.892 2.035 ALA 57.A N ARG 53.A O ALA 57.A H 2.919 2.286 ALA 57.A N GLU 54.A O ALA 57.A H 3.291 2.607 HIS 58.A N GLU 54.A O HIS 58.A H 3.356 2.584 HIS 58.A N VAL 55.A O HIS 58.A H 3.045 2.433 ALA 59.A N VAL 55.A O ALA 59.A H 3.208 2.385 LEU 61.A N ALA 57.A O LEU 61.A H 2.918 2.153 GLY 62.A N HIS 58.A O GLY 62.A H 3.222 2.391 HIS 66.A N HIS 64.A ND1 HIS 66.A H 3.140 2.311 HIS 66.A ND1 PHE 149.A O HIS 66.A HD1 2.927 2.105 VAL 67.A N HIS 64.A O VAL 67.A H 3.257 2.412 VAL 68.A N ILE 151.A O VAL 68.A H 2.783 1.945 ARG 69.A N GLU 85.A OE1 ARG 69.A H 2.963 2.103 PHE 71.A N GLN 83.A O PHE 71.A H 2.917 2.073 SER 72.A N GLN 83.A O SER 72.A H 3.418 2.607 TRP 74.A N LEU 81.A O TRP 74.A H 2.822 2.020 TRP 74.A NE1 GLU 76.A OE1 TRP 74.A HE1 3.108 2.263 GLU 76.A N HIS 79.A O GLU 76.A H 2.831 2.041 HIS 79.A N GLU 76.A O HIS 79.A H 2.921 2.107 HIS 79.A ND1 ASP 77.A O HIS 79.A HD1 3.088 2.251 MET 80.A N SER 38.A O MET 80.A H 2.841 2.036 LEU 81.A N TRP 74.A O LEU 81.A H 2.648 1.796 ILE 82.A N LYS 36.A O ILE 82.A H 3.152 2.370 GLN 83.A N SER 72.A O GLN 83.A H 2.716 1.861 ASN 84.A N ALA 34.A O ASN 84.A H 2.895 2.045 GLU 85.A N ARG 69.A O GLU 85.A H 2.827 1.984 ASN 88.A ND2 ARG 144.A O ASN 88.A HD22 3.462 2.604 GLY 89.A N ILE 142.A O GLY 89.A H 2.661 1.912 GLY 90.A N CYS 87.A O GLY 90.A H 3.299 2.482 SER 91.A N ASP 94.A OD2 SER 91.A H 3.158 2.302 SER 91.A OG ASP 94.A OD2 SER 91.A HG 3.149 2.314 LEU 92.A N ILE 140.A O LEU 92.A H 2.702 1.904 ASP 94.A N SER 91.A OG ASP 94.A H 3.346 2.524 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 3.108 2.296 ILE 96.A N LEU 92.A O ILE 96.A H 2.826 2.018 SER 97.A N ALA 93.A O SER 97.A H 2.967 2.140 SER 97.A OG ALA 93.A O SER 97.A HG 3.072 2.300 GLU 98.A N ASP 94.A O GLU 98.A H 2.868 2.067 ASN 99.A N ALA 95.A O ASN 99.A H 2.868 2.118 TYR 100.A N ILE 96.A O TYR 100.A H 3.297 2.523 ARG 101.A N SER 97.A O ARG 101.A H 3.128 2.325 ARG 101.A NE GLU 98.A OE2 ARG 101.A HE 3.078 2.463 ILE 102.A N GLU 98.A O ILE 102.A H 3.211 2.356 SER 104.A N ASN 99.A O SER 104.A H 2.777 2.086 LEU 111.A N LYS 107.A O LEU 111.A H 2.915 2.141 LYS 112.A N GLU 108.A O LYS 112.A H 3.078 2.292 ASP 113.A N ALA 109.A O ASP 113.A H 2.934 2.161 LEU 114.A N GLU 110.A O LEU 114.A H 3.006 2.185 LEU 115.A N LEU 111.A O LEU 115.A H 3.038 2.265 LEU 116.A N LYS 112.A O LEU 116.A H 3.021 2.197 GLN 117.A N ASP 113.A O GLN 117.A H 3.037 2.186 GLN 117.A NE2 ASP 113.A OD1 GLN 117.A HE21 2.967 2.170 GLN 117.A NE2 VAL 147.A O GLN 117.A HE22 3.049 2.200 VAL 118.A N LEU 114.A O VAL 118.A H 3.109 2.251 GLY 119.A N LEU 115.A O GLY 119.A H 2.914 2.173 ARG 120.A N LEU 116.A O ARG 120.A H 2.808 2.079 GLY 121.A N GLN 117.A O GLY 121.A H 3.199 2.388 LEU 122.A N VAL 118.A O LEU 122.A H 2.912 2.086 ARG 123.A N GLY 119.A O ARG 123.A H 2.931 2.126 TYR 124.A N ARG 120.A O TYR 124.A H 3.136 2.315 ILE 125.A N GLY 121.A O ILE 125.A H 3.016 2.178 HIS 126.A N LEU 122.A O HIS 126.A H 2.825 1.988 HIS 126.A NE2 ASP 189.A OD2 HIS 126.A HE2 3.021 2.168 SER 127.A N ARG 123.A O SER 127.A H 2.944 2.184 MET 128.A N TYR 124.A O MET 128.A H 3.259 2.581 MET 128.A N ILE 125.A O MET 128.A H 3.154 2.455 SER 129.A N HIS 126.A O SER 129.A H 2.955 2.178 LEU 130.A N ILE 125.A O LEU 130.A H 3.190 2.376 VAL 131.A N THR 158.A O VAL 131.A H 2.948 2.146 HIS 132.A N ASP 189.A OD2 HIS 132.A H 2.782 1.947 HIS 132.A NE2 GLY 152.A O HIS 132.A HE2 2.860 2.024 MET 133.A N ASP 189.A OD1 MET 133.A H 2.764 1.933 ASP 134.A N HIS 132.A ND1 ASP 134.A H 3.066 2.309 LYS 136.A NZ ASP 169.A OD2 LYS 136.A HZ2 3.548 2.869 ASN 139.A N LYS 136.A O ASN 139.A H 2.907 2.071 ASN 139.A ND2 ASP 134.A O ASN 139.A HD22 2.784 1.942 ASN 139.A ND2 ASP 134.A OD2 ASN 139.A HD21 3.098 2.457 ILE 140.A N PRO 137.A O ILE 140.A H 3.153 2.322 PHE 141.A N LYS 150.A O PHE 141.A H 2.743 1.892 ILE 142.A N GLY 90.A O ILE 142.A H 2.808 2.015 SER 143.A N MET 148.A O SER 143.A H 2.913 2.078 ARG 144.A N ASN 88.A OD1 ARG 144.A H 2.887 2.047 THR 145.A N LYS 146.A O THR 145.A H 2.847 1.993 MET 148.A N SER 143.A O MET 148.A H 2.818 1.975 PHE 149.A N GLN 117.A OE1 PHE 149.A H 2.593 1.747 LYS 150.A N PHE 141.A O LYS 150.A H 2.764 1.977 LYS 150.A NZ SER 65.A O LYS 150.A HZ3 3.096 2.207 ILE 151.A N HIS 66.A O ILE 151.A H 2.831 1.983 GLY 152.A N ASN 139.A O GLY 152.A H 2.765 1.928 VAL 157.A N LEU 154.A O VAL 157.A H 3.249 2.405 THR 158.A N VAL 131.A O THR 158.A H 3.124 2.357 ARG 159.A NE SER 161.A OG ARG 159.A HE 3.378 2.525 ILE 160.A N SER 129.A O ILE 160.A H 2.942 2.090 GLN 164.A N THR 158.A OG1 GLN 164.A H 2.676 1.844 ASP 169.A N ASP 134.A OD1 ASP 169.A H 3.407 2.576 ARG 171.A N ASP 169.A OD1 ARG 171.A H 2.942 2.089 ARG 171.A NE ASP 169.A OD1 ARG 171.A HE 3.063 2.297 ARG 171.A NE ASP 169.A OD2 ARG 171.A HE 3.183 2.536 ARG 171.A NH2 ASP 169.A OD2 ARG 171.A HH21 2.790 2.045 PHE 172.A N ASP 169.A O PHE 172.A H 3.164 2.337 LEU 173.A N SER 170.A O LEU 173.A H 3.436 2.582 GLU 176.A N GLU 176.A OE2 GLU 176.A H 2.861 2.057 VAL 177.A N ALA 174.A O VAL 177.A H 3.263 2.547 GLN 179.A N ASN 175.A O GLN 179.A H 2.861 2.209 GLU 180.A N VAL 177.A O GLU 180.A H 2.881 2.074 ASN 181.A N GLU 176.A O ASN 181.A H 2.822 2.024 THR 183.A N ASN 181.A OD1 THR 183.A H 3.138 2.297 THR 183.A OG1 ASN 181.A OD1 THR 183.A HG1 2.673 1.867 LYS 187.A N HIS 184.A O LYS 187.A H 2.955 2.199 LYS 187.A NZ ARG 247.A O LYS 187.A HZ2 2.837 2.043 ALA 188.A N LEU 185.A O ALA 188.A H 2.965 2.210 ILE 190.A N PRO 186.A O ILE 190.A H 3.381 2.609 PHE 191.A N LYS 187.A O PHE 191.A H 3.123 2.300 ALA 192.A N ALA 188.A O ALA 192.A H 3.043 2.234 LEU 193.A N ASP 189.A O LEU 193.A H 2.917 2.159 ALA 194.A N ILE 190.A O ALA 194.A H 3.108 2.324 LEU 195.A N PHE 191.A O LEU 195.A H 3.362 2.540 THR 196.A N ALA 192.A O THR 196.A H 2.992 2.252 VAL 197.A N LEU 193.A O VAL 197.A H 2.958 2.170 VAL 198.A N ALA 194.A O VAL 198.A H 2.961 2.189 CYS 199.A N LEU 195.A O CYS 199.A H 2.959 2.200 ALA 200.A N THR 196.A O ALA 200.A H 3.097 2.275 ALA 201.A N VAL 197.A O ALA 201.A H 2.882 2.262 ALA 201.A N VAL 198.A O ALA 201.A H 3.199 2.553 GLY 202.A N CYS 199.A O GLY 202.A H 3.106 2.261 ALA 203.A N VAL 198.A O ALA 203.A H 3.240 2.411 TRP 213.A NE1 SER 170.A O TRP 213.A HE1 2.875 2.029 HIS 214.A N GLY 210.A O HIS 214.A H 3.316 2.529 HIS 214.A ND1 GLY 210.A O HIS 214.A HD1 2.957 2.243 GLU 215.A N ASP 211.A O GLU 215.A H 2.921 2.127 ILE 216.A N GLN 212.A O ILE 216.A H 3.292 2.559 ARG 217.A NE LEU 173.A O ARG 217.A HE 2.770 2.106 ARG 217.A NH1 TRP 213.A O ARG 217.A HH11 3.362 2.545 ARG 217.A NH2 ARG 171.A O ARG 217.A HH22 3.263 2.419 ARG 217.A NH2 LEU 173.A O ARG 217.A HH21 2.607 1.864 GLN 218.A N HIS 214.A O GLN 218.A H 2.916 2.247 GLY 219.A N ILE 216.A O GLY 219.A H 2.741 1.915 GLN 226.A NE2 PHE 106.A O GLN 226.A HE21 2.801 1.965 SER 229.A N GLU 108.A OE1 SER 229.A H 3.326 2.580 SER 229.A N GLU 108.A OE2 SER 229.A H 3.143 2.330 SER 229.A OG GLU 108.A OE2 SER 229.A HG 3.120 2.441 PHE 232.A N SER 229.A OG PHE 232.A H 2.985 2.161 THR 233.A N SER 229.A O THR 233.A H 3.108 2.252 THR 233.A OG1 SER 229.A O THR 233.A HG1 3.407 2.746 GLU 234.A N GLN 230.A O GLU 234.A H 3.121 2.404 LEU 235.A N GLU 231.A O LEU 235.A H 3.024 2.314 LEU 235.A N PHE 232.A O LEU 235.A H 3.126 2.521 LEU 236.A N PHE 232.A O LEU 236.A H 3.076 2.278 LYS 237.A N THR 233.A O LYS 237.A H 2.830 2.047 VAL 238.A N GLU 234.A O VAL 238.A H 3.235 2.400 MET 239.A N LEU 236.A O MET 239.A H 3.237 2.564 ILE 240.A N LYS 237.A O ILE 240.A H 3.064 2.283 HIS 241.A N VAL 238.A O HIS 241.A H 3.320 2.484 ASP 243.A N HIS 241.A ND1 ASP 243.A H 3.034 2.273 GLU 245.A N ASP 243.A OD1 GLU 245.A H 2.922 2.127 ARG 246.A N ASP 243.A O ARG 246.A H 2.862 2.052 ARG 247.A N PRO 244.A O ARG 247.A H 3.285 2.574 ARG 247.A NE HIS 241.A O ARG 247.A HE 2.858 2.096 ARG 247.A NH1 GLU 176.A OE1 ARG 247.A HH12 2.696 1.916 ARG 247.A NH1 LYS 187.A O ARG 247.A HH11 2.991 2.218 ARG 247.A NH2 GLU 176.A OE2 ARG 247.A HH22 2.975 2.184 ARG 247.A NH2 HIS 241.A O ARG 247.A HH21 3.065 2.365 ALA 252.A N SER 249.A OG ALA 252.A H 3.106 2.293 LEU 253.A N SER 249.A O LEU 253.A H 2.836 2.115 VAL 254.A N ALA 250.A O VAL 254.A H 2.967 2.169 HIS 256.A N LEU 253.A O HIS 256.A H 3.133 2.290 VAL 258.A N HIS 256.A ND1 VAL 258.A H 3.426 2.600 LEU 259.A N HIS 256.A O LEU 259.A H 3.043 2.249 LEU 260.A N SER 257.A O LEU 260.A H 3.297 2.442