Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vd8_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 2.A N GLU 76.A OE2 ARG 2.A H 3.034 2.225 ARG 2.A NE GLU 6.A OE1 ARG 2.A HE 3.443 2.664 TYR 3.A N GLU 76.A OE1 TYR 3.A H 3.108 2.284 TYR 3.A OH GLU 9.A OE2 TYR 3.A HH 2.779 1.982 THR 4.A N SER 1.A OG THR 4.A H 3.324 2.465 THR 5.A N SER 1.A O THR 5.A H 2.865 2.107 GLU 6.A N ARG 2.A O GLU 6.A H 2.784 1.937 PHE 7.A N TYR 3.A O PHE 7.A H 3.123 2.378 HIS 8.A N VAL 25.A O HIS 8.A H 2.777 1.950 LEU 10.A N LYS 23.A O LEU 10.A H 2.866 2.027 ILE 13.A N VAL 21.A O ILE 13.A H 2.864 2.037 GLY 14.A N VAL 21.A O GLY 14.A H 3.306 2.597 GLY 16.A N GLY 19.A O GLY 16.A H 2.952 2.185 GLY 19.A N GLY 16.A O GLY 19.A H 3.011 2.168 SER 20.A N ARG 37.A O SER 20.A H 3.026 2.186 VAL 21.A N GLY 14.A O VAL 21.A H 2.885 2.051 PHE 22.A N ILE 35.A O PHE 22.A H 2.807 1.979 LYS 23.A N GLU 11.A O LYS 23.A H 2.822 2.062 CYS 24.A N TYR 33.A O CYS 24.A H 2.914 2.084 VAL 25.A N HIS 8.A O VAL 25.A H 2.906 2.113 LYS 26.A N CYS 31.A O LYS 26.A H 2.942 2.118 ARG 27.A N GLU 6.A O ARG 27.A H 2.908 2.070 ARG 27.A NE THR 5.A O ARG 27.A HE 2.858 2.218 ARG 27.A NH1 THR 4.A O ARG 27.A HH11 2.949 2.102 GLY 30.A N LYS 26.A O GLY 30.A H 2.795 2.033 CYS 31.A N ASP 29.A OD1 CYS 31.A H 2.789 1.930 CYS 31.A SG ASP 29.A O CYS 31.A HG 3.793 2.648 TYR 33.A N CYS 24.A O TYR 33.A H 2.822 1.994 ALA 34.A N ASN 84.A O ALA 34.A H 2.880 2.116 ILE 35.A N PHE 22.A O ILE 35.A H 2.875 2.027 LYS 36.A N ILE 82.A O LYS 36.A H 2.906 2.108 ARG 37.A N SER 20.A O ARG 37.A H 2.701 1.850 SER 38.A N MET 80.A O SER 38.A H 2.898 2.058 LYS 40.A N ASP 78.A O LYS 40.A H 2.777 1.922 GLY 44.A N GLU 48.A OE1 GLY 44.A H 2.600 1.749 SER 45.A N LEU 42.A O SER 45.A H 3.198 2.503 GLU 48.A N SER 45.A O GLU 48.A H 3.059 2.394 GLU 48.A N SER 45.A OG GLU 48.A H 3.278 2.561 GLN 49.A N SER 45.A O GLN 49.A H 3.148 2.318 ASN 50.A N VAL 46.A O ASN 50.A H 3.109 2.270 ALA 51.A N ASP 47.A O ALA 51.A H 3.068 2.269 LEU 52.A N GLU 48.A O LEU 52.A H 2.711 1.970 ARG 53.A N GLN 49.A O ARG 53.A H 2.775 2.000 ARG 53.A NE ASN 50.A OD1 ARG 53.A HE 3.328 2.706 ARG 53.A NE GLY 154.A O ARG 53.A HE 3.002 2.235 ARG 53.A NH1 GLN 163.A OE1 ARG 53.A HH11 2.801 2.208 ARG 53.A NH2 ASN 50.A OD1 ARG 53.A HH21 2.580 1.743 GLU 54.A N ASN 50.A O GLU 54.A H 3.372 2.626 VAL 55.A N ALA 51.A O VAL 55.A H 3.366 2.541 TYR 56.A N LEU 52.A O TYR 56.A H 3.061 2.207 ALA 57.A N ARG 53.A O ALA 57.A H 2.884 2.163 HIS 58.A N GLU 54.A O HIS 58.A H 3.129 2.320 ALA 59.A N VAL 55.A O ALA 59.A H 3.009 2.255 VAL 60.A N ALA 57.A O VAL 60.A H 3.195 2.475 LEU 61.A N ALA 57.A O LEU 61.A H 3.009 2.253 HIS 66.A N HIS 64.A ND1 HIS 66.A H 3.115 2.271 HIS 66.A ND1 PHE 148.A O HIS 66.A HD1 2.878 2.045 VAL 67.A N HIS 64.A O VAL 67.A H 3.246 2.397 VAL 68.A N ILE 150.A O VAL 68.A H 2.762 1.927 ARG 69.A N GLU 85.A OE1 ARG 69.A H 3.055 2.210 PHE 71.A N GLN 83.A O PHE 71.A H 2.940 2.116 SER 72.A N GLN 83.A O SER 72.A H 3.409 2.614 TRP 74.A N LEU 81.A O TRP 74.A H 2.973 2.188 TRP 74.A NE1 GLU 76.A OE1 TRP 74.A HE1 3.036 2.184 GLU 76.A N HIS 79.A O GLU 76.A H 2.875 2.096 HIS 79.A N GLU 76.A O HIS 79.A H 2.817 2.000 HIS 79.A ND1 ASP 77.A O HIS 79.A HD1 3.037 2.188 MET 80.A N SER 38.A O MET 80.A H 2.619 1.818 LEU 81.A N TRP 74.A O LEU 81.A H 2.714 1.921 ILE 82.A N LYS 36.A O ILE 82.A H 2.984 2.182 GLN 83.A N SER 72.A O GLN 83.A H 2.769 1.916 ASN 84.A N ALA 34.A O ASN 84.A H 2.811 1.955 GLU 85.A N ARG 69.A O GLU 85.A H 2.904 2.060 CYS 87.A SG SER 143.A OG CYS 87.A HG 3.604 2.754 GLY 89.A N ILE 142.A O GLY 89.A H 2.654 1.897 GLY 90.A N CYS 87.A O GLY 90.A H 3.355 2.529 SER 91.A N ASP 94.A OD2 SER 91.A H 2.955 2.102 LEU 92.A N ILE 140.A O LEU 92.A H 2.671 1.897 ALA 93.A N PRO 137.A O ALA 93.A H 3.206 2.493 ASP 94.A N SER 91.A OG ASP 94.A H 3.156 2.331 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 3.109 2.300 ILE 96.A N LEU 92.A O ILE 96.A H 2.845 2.025 SER 97.A N ALA 93.A O SER 97.A H 2.981 2.162 GLU 98.A N ASP 94.A O GLU 98.A H 2.949 2.130 ASN 99.A N ALA 95.A O ASN 99.A H 2.807 1.969 TYR 100.A N ILE 96.A O TYR 100.A H 3.027 2.192 ARG 101.A N SER 97.A O ARG 101.A H 3.002 2.256 ARG 101.A NE GLU 98.A OE1 ARG 101.A HE 2.929 2.092 ARG 101.A NH2 GLU 98.A OE1 ARG 101.A HH21 3.434 2.760 ARG 101.A NH2 GLU 98.A OE2 ARG 101.A HH21 2.845 2.066 ILE 102.A N GLU 98.A O ILE 102.A H 3.083 2.243 SER 104.A N ASN 99.A O SER 104.A H 2.900 2.192 LEU 111.A N LYS 107.A O LEU 111.A H 3.061 2.311 LEU 111.A N GLU 108.A O LEU 111.A H 3.206 2.620 LYS 112.A N GLU 108.A O LYS 112.A H 3.178 2.387 ASP 113.A N ALA 109.A O ASP 113.A H 2.974 2.177 LEU 114.A N GLU 110.A O LEU 114.A H 3.002 2.188 LEU 115.A N LEU 111.A O LEU 115.A H 2.969 2.163 LEU 116.A N LYS 112.A O LEU 116.A H 2.982 2.170 GLN 117.A N ASP 113.A O GLN 117.A H 3.061 2.233 GLN 117.A NE2 ASP 113.A OD1 GLN 117.A HE21 2.862 2.031 GLN 117.A NE2 VAL 146.A O GLN 117.A HE22 3.210 2.366 VAL 118.A N LEU 114.A O VAL 118.A H 3.154 2.295 GLY 119.A N LEU 115.A O GLY 119.A H 2.963 2.190 ARG 120.A N LEU 116.A O ARG 120.A H 2.916 2.177 GLY 121.A N GLN 117.A O GLY 121.A H 3.181 2.386 LEU 122.A N VAL 118.A O LEU 122.A H 2.882 2.059 ARG 123.A N GLY 119.A O ARG 123.A H 2.906 2.095 TYR 124.A N ARG 120.A O TYR 124.A H 3.202 2.397 ILE 125.A N GLY 121.A O ILE 125.A H 3.045 2.200 HIS 126.A N LEU 122.A O HIS 126.A H 2.746 1.892 HIS 126.A NE2 ASP 188.A OD2 HIS 126.A HE2 2.975 2.123 SER 127.A N ARG 123.A O SER 127.A H 2.892 2.163 SER 127.A OG TYR 124.A O SER 127.A HG 2.519 1.690 MET 128.A N TYR 124.A O MET 128.A H 3.189 2.566 MET 128.A N ILE 125.A O MET 128.A H 3.084 2.343 SER 129.A N HIS 126.A O SER 129.A H 3.017 2.219 LEU 130.A N ILE 125.A O LEU 130.A H 3.207 2.384 VAL 131.A N THR 157.A O VAL 131.A H 2.971 2.187 HIS 132.A N ASP 188.A OD2 HIS 132.A H 2.806 1.977 HIS 132.A NE2 GLY 151.A O HIS 132.A HE2 2.806 1.976 MET 133.A N ASP 188.A OD1 MET 133.A H 2.814 1.973 ASP 134.A N HIS 132.A ND1 ASP 134.A H 3.071 2.297 ASN 139.A N LYS 136.A O ASN 139.A H 2.970 2.143 ASN 139.A ND2 ASP 134.A O ASN 139.A HD21 2.760 1.914 ASN 139.A ND2 ASP 134.A OD2 ASN 139.A HD22 2.994 2.352 ILE 140.A N PRO 137.A O ILE 140.A H 3.193 2.350 PHE 141.A N LYS 149.A O PHE 141.A H 2.802 1.948 ILE 142.A N GLY 90.A O ILE 142.A H 2.828 2.080 SER 143.A N MET 147.A O SER 143.A H 2.936 2.096 ARG 144.A N ASN 88.A OD1 ARG 144.A H 2.627 1.834 MET 147.A N SER 143.A O MET 147.A H 3.018 2.200 PHE 148.A N GLN 117.A OE1 PHE 148.A H 2.667 1.820 LYS 149.A N PHE 141.A O LYS 149.A H 2.831 2.031 LYS 149.A NZ SER 65.A O LYS 149.A HZ3 3.169 2.409 LYS 149.A NZ GLU 85.A OE2 LYS 149.A HZ2 3.050 2.386 ILE 150.A N HIS 66.A O ILE 150.A H 2.821 1.973 GLY 151.A N ASN 139.A O GLY 151.A H 2.836 1.997 HIS 155.A ND1 GLU 165.A O HIS 155.A HD1 3.080 2.266 VAL 156.A N LEU 153.A O VAL 156.A H 3.125 2.278 THR 157.A N VAL 131.A O THR 157.A H 3.130 2.346 ILE 159.A N SER 129.A O ILE 159.A H 3.065 2.226 GLN 163.A N THR 157.A OG1 GLN 163.A H 2.787 2.128 ARG 170.A N ASP 168.A OD1 ARG 170.A H 2.981 2.134 ARG 170.A NE ASP 168.A OD1 ARG 170.A HE 2.972 2.151 ARG 170.A NE ASP 168.A OD2 ARG 170.A HE 3.194 2.515 ARG 170.A NH2 ASP 168.A OD2 ARG 170.A HH21 2.737 1.928 PHE 171.A N ASP 168.A O PHE 171.A H 3.077 2.246 LEU 172.A N SER 169.A O LEU 172.A H 3.365 2.510 GLU 175.A N GLU 175.A OE2 GLU 175.A H 2.851 2.044 VAL 176.A N ALA 173.A O VAL 176.A H 3.160 2.462 LEU 177.A N ALA 173.A O LEU 177.A H 3.375 2.552 GLN 178.A N ASN 174.A O GLN 178.A H 2.797 2.056 GLU 179.A N VAL 176.A O GLU 179.A H 2.903 2.089 ASN 180.A N GLU 175.A O ASN 180.A H 2.753 1.922 THR 182.A N ASN 180.A OD1 THR 182.A H 3.238 2.401 LYS 186.A N HIS 183.A O LYS 186.A H 3.084 2.344 LYS 186.A NZ ARG 246.A O LYS 186.A HZ1 2.900 2.091 ALA 187.A N LEU 184.A O ALA 187.A H 2.850 2.118 ILE 189.A N PRO 185.A O ILE 189.A H 3.222 2.464 PHE 190.A N LYS 186.A O PHE 190.A H 3.002 2.175 ALA 191.A N ALA 187.A O ALA 191.A H 3.089 2.274 LEU 192.A N ASP 188.A O LEU 192.A H 2.930 2.166 ALA 193.A N ILE 189.A O ALA 193.A H 3.150 2.332 LEU 194.A N PHE 190.A O LEU 194.A H 3.344 2.514 THR 195.A N ALA 191.A O THR 195.A H 2.929 2.173 THR 195.A OG1 ALA 191.A O THR 195.A HG1 2.753 1.947 VAL 196.A N LEU 192.A O VAL 196.A H 2.962 2.185 VAL 197.A N ALA 193.A O VAL 197.A H 2.975 2.172 CYS 198.A N LEU 194.A O CYS 198.A H 2.948 2.164 ALA 199.A N THR 195.A O ALA 199.A H 3.119 2.307 ALA 200.A N VAL 196.A O ALA 200.A H 2.845 2.168 ALA 200.A N VAL 197.A O ALA 200.A H 3.181 2.557 GLY 201.A N CYS 198.A O GLY 201.A H 2.940 2.100 ALA 202.A N VAL 197.A O ALA 202.A H 3.263 2.417 TRP 212.A NE1 SER 169.A O TRP 212.A HE1 2.927 2.086 HIS 213.A N GLY 209.A O HIS 213.A H 3.228 2.420 HIS 213.A ND1 GLY 209.A O HIS 213.A HD1 2.875 2.093 GLU 214.A N ASP 210.A O GLU 214.A H 2.899 2.074 ILE 215.A N GLN 211.A O ILE 215.A H 3.197 2.424 ARG 216.A NE LEU 172.A O ARG 216.A HE 2.909 2.171 ARG 216.A NH1 TRP 212.A O ARG 216.A HH11 3.340 2.509 ARG 216.A NH2 ARG 170.A O ARG 216.A HH22 3.049 2.201 ARG 216.A NH2 LEU 172.A O ARG 216.A HH21 2.839 2.121 GLN 217.A N GLU 214.A O GLN 217.A H 3.204 2.447 GLY 218.A N ILE 215.A O GLY 218.A H 2.814 2.003 GLN 225.A NE2 PHE 106.A O GLN 225.A HE21 3.052 2.511 SER 228.A N GLU 108.A OE1 SER 228.A H 2.997 2.155 GLU 230.A N GLU 230.A OE1 GLU 230.A H 2.491 1.832 PHE 231.A N SER 228.A OG PHE 231.A H 3.098 2.253 THR 232.A N SER 228.A O THR 232.A H 2.993 2.150 THR 232.A OG1 SER 228.A O THR 232.A HG1 2.924 2.207 GLU 233.A N GLN 229.A O GLU 233.A H 2.942 2.214 LEU 234.A N GLU 230.A O LEU 234.A H 3.069 2.322 LEU 235.A N PHE 231.A O LEU 235.A H 3.133 2.352 LYS 236.A N THR 232.A O LYS 236.A H 3.084 2.355 VAL 237.A N GLU 233.A O VAL 237.A H 3.166 2.346 MET 238.A N LEU 234.A O MET 238.A H 3.311 2.609 ILE 239.A N LYS 236.A O ILE 239.A H 3.054 2.256 HIS 240.A N VAL 237.A O HIS 240.A H 3.231 2.388 ASP 242.A N HIS 240.A ND1 ASP 242.A H 3.040 2.234 GLU 244.A N ASP 242.A OD1 GLU 244.A H 2.907 2.099 ARG 245.A N ASP 242.A O ARG 245.A H 2.910 2.104 ARG 246.A N PRO 243.A O ARG 246.A H 3.294 2.602 ARG 246.A NE HIS 240.A O ARG 246.A HE 2.799 2.024 ARG 246.A NH1 GLU 175.A OE1 ARG 246.A HH12 2.648 1.848 ARG 246.A NH1 LYS 186.A O ARG 246.A HH11 3.018 2.252 ARG 246.A NH2 GLU 175.A OE1 ARG 246.A HH22 3.427 2.852 ARG 246.A NH2 GLU 175.A OE2 ARG 246.A HH22 2.942 2.130 ARG 246.A NH2 HIS 240.A O ARG 246.A HH21 3.017 2.310 ALA 251.A N SER 248.A OG ALA 251.A H 3.123 2.308 LEU 252.A N SER 248.A O LEU 252.A H 2.900 2.156 VAL 253.A N ALA 249.A O VAL 253.A H 3.103 2.304 LYS 254.A NZ MET 250.A O LYS 254.A HZ3 2.955 2.337 HIS 255.A N LEU 252.A O HIS 255.A H 3.104 2.323 VAL 257.A N HIS 255.A ND1 VAL 257.A H 3.233 2.408 LEU 258.A N HIS 255.A O LEU 258.A H 3.197 2.491 LEU 259.A N HIS 255.A O no hydrogen 2.939 N/A