Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vd9_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 3.A NE GLU 7.A OE2 ARG 3.A HE 3.564 2.603 TYR 4.A N GLU 77.A OE2 TYR 4.A H 3.141 2.355 TYR 4.A OH GLU 10.A OE2 TYR 4.A HH 2.758 1.983 THR 5.A N SER 2.A OG THR 5.A H 2.973 2.117 THR 6.A N SER 2.A O THR 6.A H 2.767 2.020 GLU 7.A N ARG 3.A O GLU 7.A H 2.837 1.979 PHE 8.A N TYR 4.A O PHE 8.A H 3.001 2.254 HIS 9.A N VAL 26.A O HIS 9.A H 2.879 2.056 LEU 11.A N LYS 24.A O LEU 11.A H 2.757 1.927 ILE 14.A N VAL 22.A O ILE 14.A H 2.827 2.042 GLY 15.A N VAL 22.A O GLY 15.A H 3.203 2.443 GLY 17.A N GLY 20.A O GLY 17.A H 3.015 2.285 GLY 20.A N GLY 17.A O GLY 20.A H 2.966 2.114 SER 21.A N ARG 38.A O SER 21.A H 2.911 2.057 VAL 22.A N GLY 15.A O VAL 22.A H 2.876 2.043 PHE 23.A N ILE 36.A O PHE 23.A H 2.948 2.134 LYS 24.A N GLU 12.A O LYS 24.A H 2.908 2.190 CYS 25.A N TYR 34.A O CYS 25.A H 2.951 2.144 CYS 25.A SG PHE 23.A O CYS 25.A HG 3.769 2.592 VAL 26.A N HIS 9.A O VAL 26.A H 2.924 2.129 LYS 27.A N CYS 32.A O LYS 27.A H 2.784 1.962 ARG 28.A N GLU 7.A O ARG 28.A H 2.955 2.116 ARG 28.A NH1 THR 5.A O ARG 28.A HH12 2.325 1.597 ARG 28.A NH1 THR 6.A O ARG 28.A HH11 2.949 2.244 GLY 31.A N LYS 27.A O GLY 31.A H 2.684 1.883 CYS 32.A N ASP 30.A OD1 CYS 32.A H 2.743 1.890 CYS 32.A SG ASP 30.A O CYS 32.A HG 3.919 2.754 TYR 34.A N CYS 25.A O TYR 34.A H 2.880 2.074 TYR 34.A OH ASP 30.A OD2 TYR 34.A HH 2.719 1.931 ALA 35.A N ASN 85.A O ALA 35.A H 2.808 2.016 ILE 36.A N PHE 23.A O ILE 36.A H 2.868 2.022 LYS 37.A N ILE 83.A O LYS 37.A H 2.880 2.081 ARG 38.A N SER 21.A O ARG 38.A H 2.740 1.894 SER 39.A N MET 81.A O SER 39.A H 3.087 2.277 LYS 41.A N ASP 79.A O LYS 41.A H 2.604 1.747 GLY 45.A N GLU 49.A OE1 GLY 45.A H 2.333 1.535 SER 46.A N LEU 43.A O SER 46.A H 3.223 2.513 GLU 49.A N SER 46.A OG GLU 49.A H 2.975 2.165 GLN 50.A N SER 46.A O GLN 50.A H 2.890 2.112 ASN 51.A N VAL 47.A O ASN 51.A H 2.687 1.834 ASN 51.A ND2 GLU 166.A OE1 ASN 51.A HD21 2.971 2.129 ALA 52.A N ASP 48.A O ALA 52.A H 2.906 2.082 LEU 53.A N GLU 49.A O LEU 53.A H 2.852 2.069 ARG 54.A N GLN 50.A O ARG 54.A H 2.892 2.052 ARG 54.A NE GLY 155.A O ARG 54.A HE 3.162 2.439 ARG 54.A NH2 GLU 166.A OE1 ARG 54.A HH21 3.227 2.582 GLU 55.A N ASN 51.A O GLU 55.A H 3.282 2.473 VAL 56.A N ALA 52.A O VAL 56.A H 3.209 2.405 TYR 57.A N LEU 53.A O TYR 57.A H 3.135 2.284 ALA 58.A N ARG 54.A O ALA 58.A H 2.978 2.166 HIS 59.A N GLU 55.A O HIS 59.A H 3.252 2.400 ALA 60.A N VAL 56.A O ALA 60.A H 3.012 2.176 VAL 61.A N TYR 57.A O VAL 61.A H 3.164 2.450 VAL 61.A N ALA 58.A O VAL 61.A H 3.155 2.503 LEU 62.A N ALA 58.A O LEU 62.A H 2.847 2.108 LEU 62.A N HIS 59.A O LEU 62.A H 3.152 2.556 HIS 67.A N HIS 65.A ND1 HIS 67.A H 3.099 2.248 HIS 67.A ND1 PHE 149.A O HIS 67.A HD1 2.788 1.952 VAL 68.A N HIS 65.A O VAL 68.A H 3.143 2.291 VAL 69.A N ILE 151.A O VAL 69.A H 2.921 2.076 ARG 70.A N GLU 86.A OE1 ARG 70.A H 2.896 2.038 PHE 72.A N GLN 84.A O PHE 72.A H 2.820 1.981 SER 73.A N GLN 84.A O SER 73.A H 3.379 2.596 TRP 75.A N LEU 82.A O TRP 75.A H 2.796 2.009 TRP 75.A NE1 GLU 77.A OE2 TRP 75.A HE1 2.731 1.890 GLU 77.A N HIS 80.A O GLU 77.A H 2.870 2.074 HIS 80.A N GLU 77.A O HIS 80.A H 2.862 2.035 MET 81.A N SER 39.A O MET 81.A H 2.873 2.083 LEU 82.A N TRP 75.A O LEU 82.A H 2.696 1.843 ILE 83.A N LYS 37.A O ILE 83.A H 3.013 2.212 GLN 84.A N SER 73.A O GLN 84.A H 2.755 1.896 ASN 85.A N ALA 35.A O ASN 85.A H 2.831 1.978 GLU 86.A N ARG 70.A O GLU 86.A H 2.944 2.099 CYS 88.A SG SER 144.A OG CYS 88.A HG 3.584 2.752 GLY 90.A N ILE 143.A O GLY 90.A H 2.712 1.949 GLY 91.A N CYS 88.A O GLY 91.A H 3.218 2.360 SER 92.A N ASP 95.A OD2 SER 92.A H 2.972 2.133 LEU 93.A N ILE 141.A O LEU 93.A H 2.724 1.924 ALA 94.A N PRO 138.A O ALA 94.A H 3.239 2.530 ASP 95.A N SER 92.A OG ASP 95.A H 3.218 2.396 ALA 96.A N SER 92.A O ALA 96.A H 3.211 2.387 ILE 97.A N LEU 93.A O ILE 97.A H 2.948 2.118 SER 98.A N ALA 94.A O SER 98.A H 2.887 2.056 GLU 99.A N ASP 95.A O GLU 99.A H 2.886 2.142 ASN 100.A N ALA 96.A O ASN 100.A H 2.825 2.012 TYR 101.A N ILE 97.A O TYR 101.A H 3.006 2.178 ARG 102.A N SER 98.A O ARG 102.A H 2.957 2.302 ARG 102.A N GLU 99.A O ARG 102.A H 3.025 2.405 ILE 103.A N GLU 99.A O ILE 103.A H 3.041 2.206 SER 105.A N ASN 100.A O SER 105.A H 2.998 2.296 LYS 108.A NZ GLU 111.A OE2 LYS 108.A HZ1 3.116 2.374 LEU 112.A N LYS 108.A O LEU 112.A H 2.937 2.167 LYS 113.A N GLU 109.A O LYS 113.A H 3.066 2.297 ASP 114.A N ALA 110.A O ASP 114.A H 3.046 2.231 LEU 115.A N GLU 111.A O LEU 115.A H 3.039 2.198 LEU 116.A N LEU 112.A O LEU 116.A H 3.053 2.248 LEU 117.A N LYS 113.A O LEU 117.A H 2.962 2.121 GLN 118.A N ASP 114.A O GLN 118.A H 2.983 2.124 GLN 118.A NE2 ASP 114.A OD1 GLN 118.A HE21 3.001 2.176 GLN 118.A NE2 VAL 147.A O GLN 118.A HE22 3.028 2.172 VAL 119.A N LEU 115.A O VAL 119.A H 2.999 2.154 GLY 120.A N LEU 116.A O GLY 120.A H 2.876 2.099 ARG 121.A N LEU 117.A O ARG 121.A H 2.852 2.084 GLY 122.A N GLN 118.A O GLY 122.A H 3.247 2.439 LEU 123.A N VAL 119.A O LEU 123.A H 2.986 2.143 ARG 124.A N GLY 120.A O ARG 124.A H 2.809 2.007 TYR 125.A N ARG 121.A O TYR 125.A H 3.073 2.272 ILE 126.A N GLY 122.A O ILE 126.A H 2.994 2.159 HIS 127.A N LEU 123.A O HIS 127.A H 2.785 1.943 HIS 127.A NE2 ASP 189.A OD2 HIS 127.A HE2 2.921 2.070 SER 128.A N ARG 124.A O SER 128.A H 3.098 2.336 MET 129.A N TYR 125.A O MET 129.A H 3.278 2.590 MET 129.A N ILE 126.A O MET 129.A H 3.103 2.393 SER 130.A N HIS 127.A O SER 130.A H 2.928 2.144 LEU 131.A N ILE 126.A O LEU 131.A H 3.223 2.391 VAL 132.A N THR 158.A O VAL 132.A H 2.962 2.201 HIS 133.A N ASP 189.A OD2 HIS 133.A H 2.753 1.911 HIS 133.A NE2 GLY 152.A O HIS 133.A HE2 2.868 2.036 MET 134.A N ASP 189.A OD1 MET 134.A H 2.728 1.890 ASP 135.A N HIS 133.A ND1 ASP 135.A H 3.045 2.241 LYS 137.A NZ ASP 169.A OD2 LYS 137.A HZ3 2.990 2.330 ASN 140.A N LYS 137.A O ASN 140.A H 3.042 2.211 ASN 140.A ND2 ASP 135.A O ASN 140.A HD21 2.824 1.974 ASN 140.A ND2 ASP 135.A OD2 ASN 140.A HD22 3.124 2.498 ILE 141.A N PRO 138.A O ILE 141.A H 3.143 2.298 PHE 142.A N LYS 150.A O PHE 142.A H 2.768 1.922 ILE 143.A N GLY 91.A O ILE 143.A H 2.852 2.118 SER 144.A N MET 148.A O SER 144.A H 2.922 2.081 ARG 145.A N ASN 89.A OD1 ARG 145.A H 2.800 1.988 MET 148.A N SER 144.A O MET 148.A H 2.920 2.075 PHE 149.A N GLN 118.A OE1 PHE 149.A H 2.783 1.952 LYS 150.A N PHE 142.A O LYS 150.A H 2.921 2.142 LYS 150.A NZ SER 66.A O LYS 150.A HZ1 3.481 2.906 LYS 150.A NZ GLU 86.A OE1 LYS 150.A HZ3 3.517 2.728 LYS 150.A NZ GLU 86.A OE2 LYS 150.A HZ3 2.906 2.074 ILE 151.A N HIS 67.A O ILE 151.A H 2.857 2.017 GLY 152.A N ASN 140.A O GLY 152.A H 2.828 1.969 LEU 154.A N GLU 55.A OE2 LEU 154.A H 3.440 2.625 VAL 157.A N LEU 154.A O VAL 157.A H 3.089 2.244 THR 158.A N VAL 132.A O THR 158.A H 3.095 2.319 ILE 160.A N SER 130.A O ILE 160.A H 2.978 2.149 GLN 164.A N THR 158.A OG1 GLN 164.A H 2.541 1.845 ASP 169.A N ASP 135.A OD1 ASP 169.A H 3.389 2.548 ARG 171.A N ASP 169.A OD1 ARG 171.A H 3.037 2.189 ARG 171.A NE ASP 169.A OD1 ARG 171.A HE 2.981 2.144 ARG 171.A NH2 ASP 169.A OD2 ARG 171.A HH21 2.857 2.004 PHE 172.A N ASP 169.A O PHE 172.A H 3.031 2.174 GLU 176.A N GLU 176.A OE2 GLU 176.A H 2.904 2.123 VAL 177.A N ALA 174.A O VAL 177.A H 3.037 2.381 LEU 178.A N ALA 174.A O LEU 178.A H 3.318 2.514 GLN 179.A N ASN 175.A O GLN 179.A H 2.777 2.077 GLU 180.A N VAL 177.A O GLU 180.A H 3.011 2.186 ASN 181.A N GLU 176.A O ASN 181.A H 2.859 2.040 THR 183.A N ASN 181.A OD1 THR 183.A H 3.207 2.359 THR 183.A OG1 ASN 181.A OD1 THR 183.A HG1 2.715 1.909 LYS 187.A N HIS 184.A O LYS 187.A H 2.991 2.315 LYS 187.A NZ ARG 247.A O LYS 187.A HZ1 2.646 1.828 ALA 188.A N LEU 185.A O ALA 188.A H 2.741 2.030 ASP 189.A N LEU 185.A O ASP 189.A H 3.363 2.604 ILE 190.A N PRO 186.A O ILE 190.A H 3.178 2.415 PHE 191.A N LYS 187.A O PHE 191.A H 3.115 2.281 ALA 192.A N ALA 188.A O ALA 192.A H 3.032 2.197 LEU 193.A N ASP 189.A O LEU 193.A H 2.971 2.203 ALA 194.A N ILE 190.A O ALA 194.A H 3.126 2.317 LEU 195.A N PHE 191.A O LEU 195.A H 3.170 2.346 THR 196.A N ALA 192.A O THR 196.A H 2.877 2.125 VAL 197.A N LEU 193.A O VAL 197.A H 2.940 2.206 VAL 197.A N ALA 194.A O VAL 197.A H 3.059 2.445 VAL 198.A N ALA 194.A O VAL 198.A H 2.925 2.109 CYS 199.A N LEU 195.A O CYS 199.A H 2.939 2.154 ALA 200.A N THR 196.A O ALA 200.A H 3.096 2.278 ALA 201.A N VAL 197.A O ALA 201.A H 2.871 2.187 ALA 201.A N VAL 198.A O ALA 201.A H 3.138 2.488 GLY 202.A N CYS 199.A O GLY 202.A H 2.929 2.085 ALA 203.A N VAL 198.A O ALA 203.A H 3.298 2.445 GLN 212.A NE2 GLN 212.A O GLN 212.A HE21 3.059 2.508 TRP 213.A NE1 SER 170.A O TRP 213.A HE1 2.804 1.969 HIS 214.A N GLY 210.A O HIS 214.A H 3.268 2.467 GLU 215.A N ASP 211.A O GLU 215.A H 2.993 2.216 ILE 216.A N GLN 212.A O ILE 216.A H 3.327 2.553 ARG 217.A N TRP 213.A O ARG 217.A H 3.408 2.601 ARG 217.A NE LEU 173.A O ARG 217.A HE 2.915 2.329 ARG 217.A NH1 TRP 213.A O ARG 217.A HH11 3.224 2.388 ARG 217.A NH2 ARG 171.A O ARG 217.A HH22 2.968 2.144 ARG 217.A NH2 LEU 173.A O ARG 217.A HH21 2.921 2.223 GLN 218.A N HIS 214.A O GLN 218.A H 3.062 2.462 GLN 218.A N GLU 215.A O GLN 218.A H 3.228 2.504 GLY 219.A N ILE 216.A O GLY 219.A H 2.780 1.950 ARG 220.A NH1 GLN 218.A OE1 ARG 220.A HH11 2.505 1.950 GLN 226.A NE2 PHE 107.A O GLN 226.A HE21 3.059 2.310 GLN 226.A NE2 ALA 201.A O GLN 226.A HE22 3.440 2.734 SER 229.A N GLU 109.A OE1 SER 229.A H 3.076 2.279 SER 229.A N GLU 109.A OE2 SER 229.A H 3.112 2.364 PHE 232.A N SER 229.A OG PHE 232.A H 3.185 2.403 THR 233.A N SER 229.A O THR 233.A H 2.978 2.122 THR 233.A OG1 SER 229.A O THR 233.A HG1 2.987 2.299 GLU 234.A N GLN 230.A O GLU 234.A H 2.951 2.208 LEU 235.A N GLU 231.A O LEU 235.A H 3.264 2.503 LEU 236.A N PHE 232.A O LEU 236.A H 2.977 2.170 LYS 237.A N THR 233.A O LYS 237.A H 2.883 2.113 VAL 238.A N GLU 234.A O VAL 238.A H 2.971 2.189 MET 239.A N LEU 235.A O MET 239.A H 3.159 2.412 ILE 240.A N LYS 237.A O ILE 240.A H 2.995 2.216 HIS 241.A N VAL 238.A O HIS 241.A H 3.181 2.348 ASP 243.A N HIS 241.A ND1 ASP 243.A H 2.920 2.092 GLU 245.A N ASP 243.A OD1 GLU 245.A H 2.966 2.155 ARG 246.A N ASP 243.A O ARG 246.A H 2.853 2.039 ARG 247.A N PRO 244.A O ARG 247.A H 3.209 2.443 ARG 247.A NE HIS 241.A O ARG 247.A HE 2.836 2.053 ARG 247.A NH1 GLU 176.A OE1 ARG 247.A HH12 2.792 1.996 ARG 247.A NH1 LYS 187.A O ARG 247.A HH11 3.035 2.234 ARG 247.A NH2 GLU 176.A OE1 ARG 247.A HH22 3.541 2.954 ARG 247.A NH2 GLU 176.A OE2 ARG 247.A HH22 2.962 2.143 ARG 247.A NH2 HIS 241.A O ARG 247.A HH21 2.873 2.119 ALA 252.A N SER 249.A OG ALA 252.A H 3.147 2.299 LEU 253.A N SER 249.A O LEU 253.A H 2.883 2.091 VAL 254.A N ALA 250.A O VAL 254.A H 3.113 2.282 HIS 256.A N LEU 253.A O HIS 256.A H 3.067 2.220 VAL 258.A N HIS 256.A ND1 VAL 258.A H 3.444 2.591 LEU 259.A N HIS 256.A O LEU 259.A H 3.073 2.390 LEU 260.A N HIS 256.A O LEU 260.A H 3.049 2.285