Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vda_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 2.A N GLU 76.A OE2 ARG 2.A H 3.020 2.394 ARG 2.A NE GLU 6.A OE2 ARG 2.A HE 3.208 2.485 TYR 3.A N GLU 76.A OE1 TYR 3.A H 2.943 2.127 THR 4.A N SER 1.A OG THR 4.A H 3.169 2.347 THR 5.A N SER 1.A O THR 5.A H 2.777 1.984 GLU 6.A N ARG 2.A O GLU 6.A H 2.739 1.885 PHE 7.A N TYR 3.A O PHE 7.A H 3.028 2.298 HIS 8.A N VAL 25.A O HIS 8.A H 2.983 2.153 LEU 10.A N LYS 23.A O LEU 10.A H 2.808 1.982 ILE 13.A N VAL 21.A O ILE 13.A H 2.910 2.120 GLY 14.A N VAL 21.A O GLY 14.A H 3.248 2.485 GLY 16.A N GLY 19.A O GLY 16.A H 3.047 2.286 GLY 19.A N GLY 16.A O GLY 19.A H 2.825 1.980 SER 20.A N ARG 37.A O SER 20.A H 2.979 2.147 VAL 21.A N GLY 14.A O VAL 21.A H 2.925 2.102 PHE 22.A N ILE 35.A O PHE 22.A H 2.818 2.027 LYS 23.A N GLU 11.A O LYS 23.A H 2.805 2.107 CYS 24.A N TYR 33.A O CYS 24.A H 2.933 2.097 VAL 25.A N HIS 8.A O VAL 25.A H 3.086 2.302 LYS 26.A N CYS 31.A O LYS 26.A H 2.880 2.064 ARG 27.A N GLU 6.A O ARG 27.A H 2.907 2.104 ARG 27.A NH1 THR 4.A O ARG 27.A HH12 2.028 1.208 ARG 27.A NH1 THR 5.A O ARG 27.A HH11 2.596 1.841 GLY 30.A N LYS 26.A O GLY 30.A H 2.872 2.168 CYS 31.A N ASP 29.A OD1 CYS 31.A H 2.567 1.713 TYR 33.A N CYS 24.A O TYR 33.A H 2.853 2.032 TYR 33.A OH ASP 29.A OD2 TYR 33.A HH 2.732 1.920 ALA 34.A N ASN 84.A O ALA 34.A H 2.910 2.131 ILE 35.A N PHE 22.A O ILE 35.A H 2.871 2.028 LYS 36.A N ILE 82.A O LYS 36.A H 2.917 2.115 ARG 37.A N SER 20.A O ARG 37.A H 2.747 1.904 SER 38.A N MET 80.A O SER 38.A H 2.902 2.092 LYS 39.A NZ LYS 40.A O LYS 39.A HZ2 3.403 2.677 LYS 40.A N ASP 78.A O LYS 40.A H 2.971 2.115 GLY 44.A N GLU 48.A OE1 GLY 44.A H 2.727 1.874 SER 45.A N LEU 42.A O SER 45.A H 3.155 2.442 SER 45.A OG LEU 42.A O SER 45.A HG 2.593 1.932 GLU 48.A N SER 45.A OG GLU 48.A H 3.194 2.401 GLN 49.A N SER 45.A O GLN 49.A H 3.040 2.223 ASN 50.A N VAL 46.A O ASN 50.A H 2.763 1.916 ALA 51.A N ASP 47.A O ALA 51.A H 2.932 2.111 LEU 52.A N GLU 48.A O LEU 52.A H 2.814 1.979 ARG 53.A N GLN 49.A O ARG 53.A H 2.791 1.949 ARG 53.A NE GLY 153.A O ARG 53.A HE 2.947 2.193 ARG 53.A NH2 ASN 50.A OD1 ARG 53.A HH21 2.597 1.755 GLU 54.A N ASN 50.A O GLU 54.A H 3.158 2.331 VAL 55.A N ALA 51.A O VAL 55.A H 2.985 2.204 TYR 56.A N LEU 52.A O TYR 56.A H 2.921 2.089 ALA 57.A N ARG 53.A O ALA 57.A H 2.887 2.062 HIS 58.A N GLU 54.A O HIS 58.A H 3.230 2.381 ALA 59.A N VAL 55.A O ALA 59.A H 3.127 2.286 VAL 60.A N ALA 57.A O VAL 60.A H 3.155 2.426 LEU 61.A N ALA 57.A O LEU 61.A H 2.933 2.144 GLY 62.A N HIS 58.A O GLY 62.A H 3.449 2.592 HIS 66.A N HIS 64.A ND1 HIS 66.A H 3.047 2.191 HIS 66.A ND1 PHE 147.A O HIS 66.A HD1 2.933 2.100 VAL 67.A N HIS 64.A O VAL 67.A H 3.254 2.410 VAL 68.A N ILE 149.A O VAL 68.A H 2.766 1.924 ARG 69.A N GLU 85.A OE1 ARG 69.A H 2.852 1.995 PHE 71.A N GLN 83.A O PHE 71.A H 2.800 1.959 SER 72.A N GLN 83.A O SER 72.A H 3.313 2.551 TRP 74.A N LEU 81.A O TRP 74.A H 2.986 2.229 TRP 74.A NE1 GLU 76.A OE1 TRP 74.A HE1 2.706 1.861 GLU 76.A N HIS 79.A O GLU 76.A H 2.927 2.143 HIS 79.A N GLU 76.A O HIS 79.A H 2.781 1.963 HIS 79.A ND1 ASP 77.A O HIS 79.A HD1 2.707 1.856 MET 80.A N SER 38.A O MET 80.A H 2.729 1.963 LEU 81.A N TRP 74.A O LEU 81.A H 2.920 2.062 ILE 82.A N LYS 36.A O ILE 82.A H 2.935 2.129 GLN 83.A N SER 72.A O GLN 83.A H 2.821 1.972 ASN 84.A N ALA 34.A O ASN 84.A H 2.903 2.048 GLU 85.A N ARG 69.A O GLU 85.A H 2.906 2.071 CYS 87.A SG SER 143.A OG CYS 87.A HG 3.522 2.629 ASN 88.A ND2 ARG 144.A O ASN 88.A HD21 3.244 2.395 GLY 89.A N ILE 142.A O GLY 89.A H 2.641 1.881 GLY 90.A N CYS 87.A O GLY 90.A H 3.208 2.353 SER 91.A N ASP 94.A OD2 SER 91.A H 3.144 2.291 LEU 92.A N ILE 140.A O LEU 92.A H 2.659 1.846 ALA 93.A N PRO 137.A O ALA 93.A H 3.276 2.570 ASP 94.A N SER 91.A OG ASP 94.A H 3.108 2.291 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 3.092 2.267 ILE 96.A N LEU 92.A O ILE 96.A H 2.808 2.035 SER 97.A N ALA 93.A O SER 97.A H 3.048 2.228 GLU 98.A N ASP 94.A O GLU 98.A H 2.915 2.098 ASN 99.A N ALA 95.A O ASN 99.A H 2.963 2.171 TYR 100.A N ILE 96.A O TYR 100.A H 2.912 2.142 ARG 101.A N GLU 98.A O ARG 101.A H 3.106 2.334 ILE 102.A N GLU 98.A O ILE 102.A H 2.984 2.207 SER 104.A N ASN 99.A O SER 104.A H 3.105 2.429 LYS 107.A N GLU 110.A OE1 LYS 107.A H 2.975 2.157 LEU 111.A N LYS 107.A O LEU 111.A H 2.911 2.113 LYS 112.A N GLU 108.A O LYS 112.A H 2.933 2.118 ASP 113.A N ALA 109.A O ASP 113.A H 3.162 2.347 LEU 114.A N GLU 110.A O LEU 114.A H 3.020 2.174 LEU 115.A N LEU 111.A O LEU 115.A H 2.902 2.156 LEU 116.A N LYS 112.A O LEU 116.A H 2.994 2.166 GLN 117.A N ASP 113.A O GLN 117.A H 2.997 2.156 GLN 117.A NE2 ASP 113.A OD1 GLN 117.A HE22 2.923 2.064 GLN 117.A NE2 ASP 113.A OD2 GLN 117.A HE22 3.282 2.681 GLN 117.A NE2 VAL 145.A O GLN 117.A HE21 3.143 2.294 VAL 118.A N LEU 114.A O VAL 118.A H 3.043 2.214 GLY 119.A N LEU 115.A O GLY 119.A H 2.846 2.084 ARG 120.A N LEU 116.A O ARG 120.A H 2.797 2.002 GLY 121.A N GLN 117.A O GLY 121.A H 3.291 2.526 GLY 121.A N VAL 118.A O GLY 121.A H 3.160 2.575 LEU 122.A N VAL 118.A O LEU 122.A H 3.004 2.180 ARG 123.A N GLY 119.A O ARG 123.A H 2.819 2.054 TYR 124.A N ARG 120.A O TYR 124.A H 3.135 2.301 TYR 124.A OH LEU 61.A O TYR 124.A HH 2.511 1.757 ILE 125.A N GLY 121.A O ILE 125.A H 2.990 2.149 HIS 126.A N LEU 122.A O HIS 126.A H 2.861 2.007 HIS 126.A NE2 ASP 187.A OD2 no hydrogen 2.859 N/A SER 127.A N ARG 123.A O SER 127.A H 3.111 2.370 SER 127.A N TYR 124.A O SER 127.A H 3.079 2.472 MET 128.A N ILE 125.A O MET 128.A H 3.050 2.318 SER 129.A N HIS 126.A O SER 129.A H 2.915 2.146 LEU 130.A N ILE 125.A O LEU 130.A H 3.231 2.402 VAL 131.A N THR 156.A O VAL 131.A H 2.868 2.052 HIS 132.A N ASP 187.A OD2 HIS 132.A H 2.829 1.983 HIS 132.A NE2 GLY 150.A O HIS 132.A HE2 2.890 2.060 MET 133.A N ASP 187.A OD1 MET 133.A H 2.696 1.856 ASP 134.A N HIS 132.A ND1 ASP 134.A H 3.032 2.222 LYS 136.A NZ ASP 167.A OD2 LYS 136.A HZ2 3.021 2.278 ASN 139.A N LYS 136.A O ASN 139.A H 2.953 2.115 ASN 139.A ND2 ASP 134.A O ASN 139.A HD21 2.705 1.866 ASN 139.A ND2 ASP 134.A OD2 ASN 139.A HD22 3.246 2.589 ILE 140.A N PRO 137.A O ILE 140.A H 3.089 2.239 PHE 141.A N LYS 148.A O PHE 141.A H 2.831 1.980 ILE 142.A N GLY 90.A O ILE 142.A H 2.828 2.089 SER 143.A N MET 146.A O SER 143.A H 2.867 2.048 ARG 144.A N ASN 88.A OD1 ARG 144.A H 2.869 2.069 MET 146.A N SER 143.A O MET 146.A H 2.730 1.887 PHE 147.A N GLN 117.A OE1 PHE 147.A H 2.912 2.077 LYS 148.A N PHE 141.A O LYS 148.A H 2.862 2.038 LYS 148.A NZ GLU 85.A OE2 LYS 148.A HZ3 2.633 1.809 ILE 149.A N HIS 66.A O ILE 149.A H 2.769 1.925 GLY 150.A N ASN 139.A O GLY 150.A H 2.951 2.090 VAL 155.A N LEU 152.A O VAL 155.A H 3.087 2.238 THR 156.A N VAL 131.A O THR 156.A H 3.071 2.303 ILE 158.A N SER 129.A O ILE 158.A H 2.977 2.133 GLN 162.A N THR 156.A OG1 GLN 162.A H 2.674 1.924 ASP 167.A N ASP 134.A OD1 ASP 167.A H 3.365 2.528 ARG 169.A N ASP 167.A OD1 ARG 169.A H 3.035 2.185 ARG 169.A NE ASP 167.A OD1 ARG 169.A HE 2.836 2.076 ARG 169.A NH2 ASP 167.A OD2 ARG 169.A HH21 2.863 2.134 PHE 170.A N ASP 167.A O PHE 170.A H 2.996 2.145 GLU 174.A N GLU 174.A OE2 GLU 174.A H 3.032 2.240 VAL 175.A N ALA 172.A O VAL 175.A H 3.170 2.506 LEU 176.A N ALA 172.A O LEU 176.A H 3.355 2.524 GLN 177.A N ASN 173.A O GLN 177.A H 2.845 2.176 GLN 177.A N GLU 174.A O GLN 177.A H 3.208 2.600 GLU 178.A N VAL 175.A O GLU 178.A H 2.940 2.109 ASN 179.A N GLU 174.A O ASN 179.A H 2.856 2.032 THR 181.A N ASN 179.A OD1 THR 181.A H 3.065 2.238 LYS 185.A N HIS 182.A O LYS 185.A H 2.920 2.203 LYS 185.A NZ ARG 245.A O LYS 185.A HZ3 2.805 1.999 ALA 186.A N LEU 183.A O ALA 186.A H 2.620 1.870 ILE 188.A N PRO 184.A O ILE 188.A H 3.193 2.466 PHE 189.A N LYS 185.A O PHE 189.A H 3.148 2.306 ALA 190.A N ALA 186.A O ALA 190.A H 3.148 2.349 LEU 191.A N ASP 187.A O LEU 191.A H 3.073 2.340 LEU 191.A N ILE 188.A O LEU 191.A H 3.179 2.580 ALA 192.A N ILE 188.A O ALA 192.A H 3.172 2.356 LEU 193.A N PHE 189.A O LEU 193.A H 3.214 2.402 THR 194.A N ALA 190.A O THR 194.A H 2.847 2.064 VAL 195.A N LEU 191.A O VAL 195.A H 2.833 2.074 VAL 196.A N ALA 192.A O VAL 196.A H 2.934 2.148 CYS 197.A N LEU 193.A O CYS 197.A H 2.926 2.169 ALA 198.A N THR 194.A O ALA 198.A H 3.109 2.278 ALA 199.A N VAL 195.A O ALA 199.A H 3.005 2.348 ALA 199.A N VAL 196.A O ALA 199.A H 3.190 2.527 GLY 200.A N CYS 197.A O GLY 200.A H 2.874 2.032 ALA 201.A N VAL 196.A O ALA 201.A H 3.338 2.506 GLU 202.A N GLU 202.A OE1 GLU 202.A H 2.616 1.986 TRP 211.A NE1 SER 168.A O TRP 211.A HE1 2.936 2.099 HIS 212.A N GLY 208.A O HIS 212.A H 3.196 2.377 GLU 213.A N ASP 209.A O GLU 213.A H 2.787 2.019 ILE 214.A N GLN 210.A O ILE 214.A H 3.084 2.333 ILE 214.A N TRP 211.A O ILE 214.A H 3.150 2.524 ARG 215.A N TRP 211.A O ARG 215.A H 3.330 2.507 ARG 215.A NE LEU 171.A O ARG 215.A HE 2.733 1.973 ARG 215.A NH1 TRP 211.A O ARG 215.A HH11 3.317 2.479 ARG 215.A NH2 ARG 169.A O ARG 215.A HH22 3.119 2.291 ARG 215.A NH2 LEU 171.A O ARG 215.A HH21 2.779 2.084 GLN 216.A N HIS 212.A O GLN 216.A H 2.989 2.287 GLN 216.A N GLU 213.A O GLN 216.A H 3.209 2.558 GLY 217.A N ILE 214.A O GLY 217.A H 2.700 1.877 GLN 224.A NE2 PHE 106.A O GLN 224.A HE22 3.052 2.198 GLN 224.A NE2 ALA 199.A O GLN 224.A HE21 2.999 2.214 SER 227.A N GLU 108.A OE1 SER 227.A H 2.990 2.239 PHE 230.A N SER 227.A O PHE 230.A H 3.203 2.591 PHE 230.A N SER 227.A OG PHE 230.A H 3.058 2.293 THR 231.A N SER 227.A O THR 231.A H 2.939 2.084 THR 231.A OG1 SER 227.A O THR 231.A HG1 2.954 2.255 GLU 232.A N GLN 228.A O GLU 232.A H 2.969 2.129 LEU 233.A N GLU 229.A O LEU 233.A H 3.330 2.537 LEU 234.A N PHE 230.A O LEU 234.A H 2.975 2.172 LYS 235.A N THR 231.A O LYS 235.A H 2.741 1.899 VAL 236.A N GLU 232.A O VAL 236.A H 2.910 2.096 MET 237.A N LEU 233.A O MET 237.A H 3.123 2.447 MET 237.A N LEU 234.A O MET 237.A H 3.005 2.348 ILE 238.A N LYS 235.A O ILE 238.A H 3.137 2.331 HIS 239.A N VAL 236.A O HIS 239.A H 3.299 2.453 ASP 241.A N HIS 239.A ND1 ASP 241.A H 2.871 2.031 GLU 243.A N ASP 241.A OD1 GLU 243.A H 2.985 2.211 ARG 244.A N ASP 241.A O ARG 244.A H 2.745 1.925 ARG 245.A NE HIS 239.A O ARG 245.A HE 2.895 2.086 ARG 245.A NH1 GLU 174.A OE1 ARG 245.A HH12 2.890 2.093 ARG 245.A NH1 LYS 185.A O ARG 245.A HH11 2.958 2.211 ARG 245.A NH2 GLU 174.A OE2 ARG 245.A HH22 2.835 2.025 ARG 245.A NH2 HIS 239.A O ARG 245.A HH21 3.084 2.361 LEU 251.A N SER 247.A O LEU 251.A H 2.872 2.089 VAL 252.A N ALA 248.A O VAL 252.A H 2.931 2.125 HIS 254.A N LEU 251.A O HIS 254.A H 3.214 2.426 VAL 256.A N HIS 254.A ND1 VAL 256.A H 3.075 2.226 LEU 257.A N HIS 254.A O LEU 257.A H 3.059 2.362 LEU 258.A N HIS 254.A O LEU 258.A H 3.034 2.238