Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vfa_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 1.A N GLN 25.A O no hydrogen 2.953 N/A LYS 2.A NZ ASP 121.A OD1 LYS 2.A HZ3 3.145 2.544 LYS 2.A NZ ASP 121.A OD2 LYS 2.A HZ3 2.872 1.984 ARG 3.A N ASP 47.A OD2 ARG 3.A H 2.825 1.985 ARG 3.A NE ASP 29.A OD2 ARG 3.A HE 3.397 2.709 ARG 3.A NH2 ASP 29.A OD2 ARG 3.A HH21 2.876 2.066 ILE 4.A N ARG 27.A O ILE 4.A H 2.784 1.960 LEU 5.A N LEU 48.A O LEU 5.A H 2.961 2.151 LEU 6.A N ASP 29.A O LEU 6.A H 2.907 2.074 LEU 7.A N LEU 50.A O LEU 7.A H 2.980 2.135 LYS 9.A N ASN 52.A OD1 LYS 9.A H 2.954 2.176 GLU 10.A N GLU 8.A OE2 GLU 10.A H 2.950 2.094 ARG 11.A NH1 GLU 32.A OE2 ARG 11.A HH12 3.147 2.294 ALA 14.A N GLU 10.A O ALA 14.A H 2.825 1.986 HIS 15.A N ARG 11.A O HIS 15.A H 2.996 2.167 PHE 16.A N ASN 12.A O PHE 16.A H 2.951 2.108 LEU 17.A N LEU 13.A O LEU 17.A H 2.792 1.945 SER 18.A N ALA 14.A O SER 18.A H 2.936 2.097 LEU 19.A N HIS 15.A O LEU 19.A H 3.061 2.219 GLU 20.A N PHE 16.A O GLU 20.A H 2.913 2.078 LEU 21.A N LEU 17.A O LEU 21.A H 2.889 2.044 GLN 22.A N SER 18.A O GLN 22.A H 3.079 2.264 GLN 22.A NE2 SER 18.A O GLN 22.A HE21 3.221 2.486 GLN 22.A NE2 SER 18.A OG GLN 22.A HE21 2.966 2.345 LYS 23.A N LEU 19.A O LYS 23.A H 3.168 2.466 LYS 23.A N GLU 20.A O LYS 23.A H 3.170 2.539 LYS 23.A NZ GLU 20.A OE2 LYS 23.A HZ2 2.821 1.982 GLU 24.A N LEU 21.A O GLU 24.A H 3.014 2.277 GLN 25.A N GLN 22.A O GLN 25.A H 2.898 2.078 ARG 27.A N LYS 2.A O ARG 27.A H 2.907 2.099 ASP 29.A N ILE 4.A O ASP 29.A H 2.861 2.025 VAL 31.A N LEU 6.A O VAL 31.A H 2.928 2.103 GLY 34.A N ASP 57.A OD1 GLY 34.A H 2.973 2.337 GLN 35.A N ASP 57.A OD2 GLN 35.A H 2.755 1.984 ALA 37.A N GLU 33.A O ALA 37.A H 2.933 2.098 LEU 38.A N GLY 34.A O LEU 38.A H 2.882 2.072 SER 39.A N GLN 35.A O SER 39.A H 3.115 2.282 SER 39.A OG LYS 36.A O SER 39.A HG 2.787 2.105 MET 40.A N LYS 36.A O MET 40.A H 3.024 2.197 ALA 41.A N ALA 37.A O ALA 41.A H 2.877 2.036 LEU 42.A N LEU 38.A O LEU 42.A H 2.881 2.137 GLN 43.A N SER 39.A O GLN 43.A H 3.318 2.620 GLN 43.A N MET 40.A O GLN 43.A H 3.196 2.528 THR 44.A N MET 40.A O THR 44.A H 2.863 2.149 TYR 46.A OH ASP 29.A OD2 TYR 46.A HH 2.679 1.861 ASP 47.A N ARG 3.A O ASP 47.A H 2.816 2.110 LEU 48.A N ARG 3.A O LEU 48.A H 3.320 2.570 ILE 49.A N VAL 75.A O ILE 49.A H 2.900 2.109 LEU 50.A N LEU 5.A O LEU 50.A H 2.803 1.962 LEU 51.A N MET 77.A O LEU 51.A H 3.033 2.221 ASN 52.A ND2 GLU 8.A OE1 ASN 52.A HD21 2.825 1.985 ASN 52.A ND2 LEU 79.A O ASN 52.A HD22 2.847 2.006 VAL 53.A N ASP 80.A OD2 VAL 53.A H 2.870 2.025 LEU 55.A N MET 58.A O LEU 55.A H 2.811 2.024 GLY 56.A N ASN 54.A OD1 GLY 56.A H 2.903 2.051 ALA 60.A N VAL 53.A O ALA 60.A H 2.864 2.008 ASP 62.A N MET 59.A O ASP 62.A H 3.042 2.452 PHE 63.A N MET 59.A O PHE 63.A H 3.052 2.210 ALA 64.A N ALA 60.A O ALA 64.A H 2.818 2.000 GLU 65.A N GLN 61.A O GLU 65.A H 2.992 2.174 LYS 66.A N ASP 62.A O LYS 66.A H 3.060 2.223 LYS 66.A NZ ASP 62.A OD1 LYS 66.A HZ2 2.775 2.009 LEU 67.A N PHE 63.A O LEU 67.A H 2.973 2.126 SER 68.A N ALA 64.A O SER 68.A H 2.882 2.134 SER 68.A OG GLU 65.A O SER 68.A HG 2.711 1.875 ARG 69.A N LYS 66.A O ARG 69.A H 3.383 2.569 ARG 69.A NE GLU 65.A OE2 ARG 69.A HE 3.063 2.229 ARG 69.A NH2 GLU 65.A OE1 ARG 69.A HH21 2.831 2.059 ARG 69.A NH2 GLU 65.A OE2 ARG 69.A HH21 3.457 2.752 THR 70.A N.A LEU 67.A O THR 70.A H.A 3.254 2.473 THR 70.A N.B LEU 67.A O THR 70.A H.B 3.258 2.483 LYS 71.A N LEU 67.A O LYS 71.A H.B 2.890 2.068 LYS 71.A NZ ALA 41.A O LYS 71.A HZ1 2.874 2.001 LYS 71.A NZ ASP 45.A OD1 LYS 71.A HZ2 2.778 1.937 SER 74.A N LYS 71.A O SER 74.A H 3.168 2.443 SER 74.A OG LYS 71.A O SER 74.A HG 2.732 1.920 MET 77.A N ILE 49.A O MET 77.A H 2.841 2.012 ILE 78.A N SER 98.A O ILE 78.A H 3.133 2.326 LEU 79.A N LEU 51.A O LEU 79.A H 2.862 2.062 ASP 80.A N ILE 100.A O ASP 80.A H 3.123 2.344 HIS 81.A N ASP 80.A OD1 HIS 81.A H 2.795 2.075 GLU 83.A N GLU 83.A OE1 GLU 83.A H 2.786 1.978 LEU 85.A N HIS 81.A O LEU 85.A H 3.032 2.187 GLN 86.A N TRP 82.A O GLN 86.A H 2.886 2.045 GLN 86.A NE2 TYR 101.A OH GLN 86.A HE21 2.895 2.201 GLU 87.A N GLU 83.A O GLU 87.A H 3.037 2.230 GLU 88.A N LEU 85.A O GLU 88.A H 3.055 2.283 LEU 89.A N GLN 86.A O LEU 89.A H 3.352 2.566 VAL 92.A N GLU 88.A O VAL 92.A H 2.855 2.018 GLN 93.A N LEU 89.A O GLN 93.A H 2.889 2.040 GLN 93.A NE2 TYR 193.A OH GLN 93.A HE21 2.939 2.130 ARG 94.A N GLU 90.A O ARG 94.A H 3.135 2.375 ARG 94.A N VAL 91.A O ARG 94.A H 3.153 2.558 PHE 95.A N VAL 92.A O PHE 95.A H 3.090 2.324 ALA 96.A N VAL 92.A O ALA 96.A H 2.809 1.998 VAL 97.A N ILE 76.A O VAL 97.A H 2.723 1.976 ILE 100.A N ILE 78.A O ILE 100.A H 2.852 2.095 LYS 102.A N ASP 80.A O LYS 102.A H 2.840 2.017 LYS 102.A NZ GLU 8.A OE1 LYS 102.A HZ1 3.469 2.740 LYS 102.A NZ GLU 8.A OE2 LYS 102.A HZ1 2.650 1.893 LYS 102.A NZ GLU 10.A OE2 LYS 102.A HZ3 2.771 1.925 GLU 107.A N GLU 107.A OE1 GLU 107.A H 2.767 1.953 ASN 108.A N LEU 105.A O ASN 108.A H 2.922 2.285 LEU 109.A N LEU 105.A O LEU 109.A H 3.087 2.264 VAL 110.A N ILE 106.A O VAL 110.A H 2.923 2.066 ALA 111.A N GLU 107.A O ALA 111.A H 3.076 2.258 ARG 112.A N ASN 108.A O ARG 112.A H 2.949 2.127 ARG 112.A NH1 TYR 99.A O ARG 112.A HH12 2.864 2.115 ARG 112.A NH2 TYR 99.A O ARG 112.A HH22 3.297 2.677 ILE 113.A N LEU 109.A O ILE 113.A H 2.937 2.086 SER 114.A N VAL 110.A O SER 114.A H 3.081 2.239 ALA 115.A N ALA 111.A O ALA 115.A H 3.131 2.306 ILE 116.A N ARG 112.A O ILE 116.A H 2.997 2.161 PHE 117.A N ILE 113.A O PHE 117.A H 2.977 2.131 ARG 118.A N SER 114.A O ARG 118.A H 3.012 2.190 GLY 119.A N ALA 115.A O GLY 119.A H 2.876 2.067 ARG 120.A N ILE 116.A O ARG 120.A H 3.048 2.219 ARG 120.A NE ASP 155.A OD2 ARG 120.A HE 3.015 2.221 ARG 120.A NH1 ASP 155.A OD2 ARG 120.A HH11 3.069 2.306 ARG 120.A NH1 VAL 176.A O ARG 120.A HH12 2.723 2.071 ARG 120.A NH2 ILE 116.A O ARG 120.A HH21 3.023 2.263 ASP 121.A N PHE 117.A O ASP 121.A H 2.929 2.091 PHE 122.A N ARG 118.A O PHE 122.A H 3.110 2.282 ASP 124.A N ARG 120.A O ASP 124.A H 2.796 1.970 TYR 128.A N LEU 131.A O TYR 128.A H 3.100 2.306 ARG 129.A NH1 GLN 203.A OE1 ARG 129.A HH11 3.248 2.676 ARG 129.A NH1 LYS 204.A O ARG 129.A HH12 2.853 2.039 ARG 129.A NH2 LYS 204.A O ARG 129.A HH22 3.182 2.476 ARG 129.A NH2 SER 205.A O ARG 129.A HH22 3.005 2.309 ARG 129.A NH2 GLN 218.A O ARG 129.A HH21 2.893 2.082 ASN 130.A N TYR 206.A OH ASN 130.A H 3.339 2.524 LEU 131.A N TYR 128.A O LEU 131.A H 2.746 1.893 ARG 132.A N TYR 141.A O ARG 132.A H 2.780 1.977 ILE 133.A N ARG 126.A O ILE 133.A H 2.773 1.935 ASP 134.A N THR 139.A O ASP 134.A H 2.840 1.984 HIS 137.A N ASP 134.A O HIS 137.A H 3.251 2.598 HIS 137.A N ASP 134.A OD1 HIS 137.A H 3.222 2.436 HIS 137.A ND1 ASP 134.A OD1 HIS 137.A HD1 2.976 2.130 HIS 137.A ND1 ASP 134.A OD2 HIS 137.A HD1 3.041 2.432 HIS 138.A NE2 ASP 124.A OD1 HIS 138.A HE2 2.578 1.837 THR 139.A N ASP 134.A O THR 139.A H 3.250 2.431 TYR 141.A N ARG 132.A O TYR 141.A H 2.883 2.074 ARG 142.A N GLU 145.A O ARG 142.A H 2.982 2.327 ARG 142.A NH1 LYS 197.A O ARG 142.A HH12 3.270 2.746 ARG 142.A NH1 LEU 198.A O ARG 142.A HH11 2.831 2.158 GLY 143.A N ASN 130.A O GLY 143.A H 3.088 2.344 ILE 147.A N VAL 140.A O ILE 147.A H 2.806 1.967 LEU 149.A N ILE 147.A O LEU 149.A H 2.838 2.142 THR 150.A N GLU 153.A OE1 THR 150.A H 2.984 2.162 ARG 151.A NE ASP 155.A OD1 ARG 151.A HE 3.030 2.272 ARG 151.A NE ASP 155.A OD2 ARG 151.A HE 3.312 2.538 ARG 151.A NH1 ASP 124.A OD2 ARG 151.A HH12 2.917 2.143 ARG 151.A NH2 ASP 124.A OD1 ARG 151.A HH22 2.779 1.938 ARG 151.A NH2 ASP 124.A OD2 ARG 151.A HH22 3.347 2.700 ARG 151.A NH2 ASP 155.A OD1 ARG 151.A HH21 2.937 2.170 ARG 152.A NE VAL 97.A O ARG 152.A HE 2.953 2.157 ARG 152.A NH1 VAL 176.A O ARG 152.A HH11 2.884 2.323 ARG 152.A NH1 GLU 180.A OE2 ARG 152.A HH12 3.221 2.533 ARG 152.A NH2 VAL 97.A O ARG 152.A HH21 3.007 2.249 ARG 152.A NH2 SER 98.A OG ARG 152.A HH21 3.109 2.441 ARG 152.A NH2 GLU 180.A OE2 ARG 152.A HH22 2.840 2.027 GLU 153.A N THR 150.A OG1 GLU 153.A H 3.143 2.289 TYR 154.A N THR 150.A O TYR 154.A H 2.759 1.911 ASP 155.A N ARG 151.A O ASP 155.A H 2.925 2.081 LEU 156.A N ARG 152.A O LEU 156.A H 2.898 2.089 LEU 157.A N GLU 153.A O LEU 157.A H 2.891 2.044 ALA 158.A N TYR 154.A O ALA 158.A H 2.844 2.016 THR 159.A N ASP 155.A O THR 159.A H 3.005 2.198 THR 159.A OG1 ASP 155.A O THR 159.A HG1 2.799 2.015 LEU 160.A N LEU 156.A O LEU 160.A H 2.979 2.150 MET 161.A N LEU 157.A O MET 161.A H 2.853 2.003 GLY 162.A N ALA 158.A O GLY 162.A H 2.881 2.128 SER 163.A N LEU 160.A O SER 163.A H 3.385 2.540 SER 163.A OG LYS 165.A O SER 163.A HG 2.953 2.351 LEU 167.A N TYR 215.A O LEU 167.A H 3.076 2.226 THR 168.A N GLN 171.A OE1 THR 168.A H 2.876 2.042 THR 168.A OG1 GLN 171.A OE1 THR 168.A HG1 3.322 2.510 ARG 169.A NE ASP 188.A OD1 ARG 169.A HE 2.871 2.073 GLU 170.A N GLU 170.A OE1 GLU 170.A H 2.777 2.056 GLN 171.A N THR 168.A OG1 GLN 171.A H 2.989 2.148 LEU 172.A N THR 168.A O LEU 172.A H 2.929 2.101 LEU 173.A N ARG 169.A O LEU 173.A H 2.824 1.988 GLU 174.A N GLU 170.A O GLU 174.A H 3.037 2.247 SER 175.A N GLN 171.A O SER 175.A H 3.057 2.322 VAL 176.A N LEU 172.A O VAL 176.A H 2.932 2.086 TRP 177.A N LEU 173.A O TRP 177.A H 2.909 2.113 GLU 180.A N TRP 177.A O GLU 180.A H 3.157 2.312 ASN 185.A N GLU 183.A OE2 ASN 185.A H 2.892 2.122 VAL 187.A N THR 184.A O VAL 187.A H 2.851 2.164 VAL 189.A N ASN 185.A O VAL 189.A H 3.245 2.451 TYR 190.A N ILE 186.A O TYR 190.A H 3.125 2.305 TYR 190.A OH GLN 93.A O TYR 190.A HH 2.724 2.128 ILE 191.A N VAL 187.A O ILE 191.A H 2.905 2.067 ARG 192.A N ASP 188.A O ARG 192.A H 3.059 2.233 ARG 192.A NH2 GLU 90.A OE1 ARG 192.A HH22 3.110 2.251 TYR 193.A N VAL 189.A O TYR 193.A H 3.017 2.208 TYR 193.A OH GLU 90.A OE1 TYR 193.A HH 2.785 1.963 LEU 194.A N TYR 190.A O LEU 194.A H 2.825 1.998 ARG 195.A N ILE 191.A O ARG 195.A H 2.864 2.008 ARG 195.A NE SER 205.A OG ARG 195.A HE 3.126 2.508 ARG 195.A NE ILE 207.A O ARG 195.A HE 3.111 2.345 ARG 195.A NH2 ILE 207.A O ARG 195.A HH21 2.922 2.114 ARG 195.A NH2 THR 209.A OG1 ARG 195.A HH22 2.894 2.093 SER 196.A N ARG 192.A O SER 196.A H 3.005 2.184 SER 196.A OG TYR 193.A O SER 196.A HG 2.660 1.839 LYS 197.A N TYR 193.A O LYS 197.A H 3.154 2.454 LYS 197.A N LEU 194.A O LYS 197.A H 3.025 2.381 LYS 197.A NZ ALA 148.A O LYS 197.A HZ3 2.804 1.916 LYS 197.A NZ GLU 153.A OE1 LYS 197.A HZ2 2.782 1.924 LEU 198.A N LEU 194.A O LEU 198.A H 3.015 2.227 ASP 199.A N ARG 195.A O ASP 199.A H 2.912 2.095 GLN 203.A N VAL 200.A O GLN 203.A H 2.949 2.102 SER 205.A OG ASP 199.A OD1 SER 205.A HG 3.338 2.648 SER 205.A OG ASP 199.A OD2 SER 205.A HG 2.632 1.834 TYR 206.A N ASP 199.A OD1 TYR 206.A H 2.808 1.955 ILE 207.A N SER 205.A OG ILE 207.A H 3.086 2.227 LYS 208.A N THR 216.A O LYS 208.A H 2.869 2.045 VAL 210.A N GLY 214.A O VAL 210.A H 2.819 1.970 VAL 213.A N VAL 210.A O VAL 213.A H 2.978 2.163 GLY 214.A N VAL 210.A O GLY 214.A H 3.189 2.397 TYR 215.A N LEU 167.A O TYR 215.A H 2.999 2.192 TYR 215.A OH ASP 188.A OD1 TYR 215.A HH 2.651 1.821 THR 216.A N LYS 208.A O THR 216.A H 3.125 2.331 GLN 218.A N TYR 206.A O GLN 218.A H 2.842 2.042 GLN 218.A NE2 SER 205.A O GLN 218.A HE21 2.894 2.035