Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vim_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 3.A N GLU 6.A OE1 THR 3.A H 2.803 1.961 THR 3.A OG1 TYR 183.A O THR 3.A HG1 2.774 1.953 GLU 6.A N THR 3.A OG1 GLU 6.A H 3.244 2.439 LYS 7.A N THR 3.A O LYS 7.A H 2.942 2.133 TRP 8.A N LEU 4.A O TRP 8.A H 2.840 2.018 TRP 8.A NE1 TYR 23.A OH TRP 8.A HE1 2.980 2.237 LYS 9.A N GLY 5.A O LYS 9.A H 2.840 2.049 LYS 9.A NZ SER 147.A O LYS 9.A HZ1 2.681 1.821 ALA 10.A N GLU 6.A O ALA 10.A H 3.095 2.266 ARG 11.A N LYS 7.A O ARG 11.A H 2.998 2.157 ARG 11.A NH1 ASP 241.A OD1 ARG 11.A HH12 2.849 2.031 ARG 11.A NH2 ASP 241.A OD1 ARG 11.A HH22 3.330 2.665 LEU 12.A N TRP 8.A O LEU 12.A H 2.842 2.028 ASN 13.A N LYS 9.A O ASN 13.A H 3.014 2.205 ASN 13.A ND2 SER 148.A O ASN 13.A HD21 2.818 2.042 GLN 14.A N ALA 10.A O GLN 14.A H 3.132 2.487 GLN 14.A N ARG 11.A O GLN 14.A H 3.213 2.523 MET 15.A N LEU 12.A O MET 15.A H 3.261 2.437 GLU 19.A N SER 16.A OG GLU 19.A H 3.281 2.429 PHE 20.A N SER 16.A O PHE 20.A H 3.104 2.303 TYR 21.A N ALA 17.A O TYR 21.A H 2.959 2.118 SER 22.A N LEU 18.A O SER 22.A H 3.102 2.332 TYR 23.A N PHE 20.A O TYR 23.A H 3.027 2.308 TYR 23.A OH LEU 236.A O TYR 23.A HH 2.709 1.930 LYS 24.A N PHE 20.A O LYS 24.A H 2.859 2.081 LYS 25.A NZ GLU 30.A OE1 LYS 25.A HZ1 3.533 2.848 SER 26.A N TYR 23.A O SER 26.A H 3.084 2.234 GLY 27.A N ARG 245.A O GLY 27.A H 3.256 2.588 ILE 28.A N LYS 25.A O ILE 28.A H 3.433 2.582 THR 29.A N PRO 206.A O THR 29.A H 3.068 2.213 GLU 30.A N LYS 248.A O GLU 30.A H 3.119 2.337 CYS 32.A N GLU 250.A O CYS 32.A H 3.278 2.484 ARG 33.A NH1 ALA 50.A O ARG 33.A HH12 2.802 2.070 ARG 33.A NH1 ASP 252.A OD2 ARG 33.A HH11 2.904 2.125 ARG 33.A NH2 ALA 50.A O ARG 33.A HH22 3.074 2.424 GLU 34.A N GLU 34.A OE1 GLU 34.A H 2.790 2.129 ARG 37.A N ARG 33.A O ARG 37.A H 2.767 1.916 ARG 38.A N GLU 34.A O ARG 38.A H 3.315 2.501 ALA 39.A N GLU 35.A O ALA 39.A H 3.146 2.290 LEU 40.A N ALA 36.A O LEU 40.A H 2.929 2.082 LYS 41.A N ARG 37.A O LYS 41.A H 2.869 2.037 LYS 41.A NZ ASP 42.A OD1 LYS 41.A HZ2 3.214 2.600 ASP 42.A N ARG 38.A O ASP 42.A H 2.953 2.247 ASP 42.A N ALA 39.A O ASP 42.A H 3.124 2.523 GLY 43.A N LEU 40.A O GLY 43.A H 2.957 2.149 VAL 44.A N ALA 39.A O VAL 44.A H 2.888 2.056 ARG 53.A NH1 VAL 31.A O ARG 53.A HH12 2.791 2.038 GLY 54.A N SER 52.A OG GLY 54.A H 3.253 2.429 SER 55.A OG GLY 82.A O SER 55.A HG 2.626 1.865 LYS 57.A NZ GLU 214.A OE2 LYS 57.A HZ3 2.518 1.803 LYS 57.A NZ TYR 216.A OH LYS 57.A HZ2 3.130 2.270 LEU 58.A N GLY 54.A O LEU 58.A H 3.011 2.170 ARG 59.A N SER 55.A O ARG 59.A H 2.943 2.131 TRP 60.A N ALA 56.A O TRP 60.A H 3.075 2.297 VAL 62.A N LEU 58.A O VAL 62.A H 2.969 2.128 GLU 63.A N ARG 59.A O GLU 63.A H 2.856 1.999 ARG 64.A N LEU 61.A O ARG 64.A H 3.255 2.531 ARG 64.A NH1 TRP 60.A O ARG 64.A HH11 3.087 2.314 GLY 65.A N VAL 62.A O GLY 65.A H 2.971 2.130 TYR 66.A N LEU 61.A O TYR 66.A H 3.022 2.292 TYR 70.A N THR 138.A OG1 TYR 70.A H 2.885 2.044 GLY 71.A N LYS 92.A O GLY 71.A H 2.733 1.897 LYS 72.A N ASP 137.A OD2 LYS 72.A H 2.641 1.784 VAL 73.A N GLU 95.A O VAL 73.A H 2.671 1.814 VAL 74.A N THR 138.A O VAL 74.A H 2.906 2.076 ASP 75.A N ARG 97.A O ASP 75.A H 2.881 2.054 LEU 76.A N LEU 140.A O LEU 76.A H 2.780 1.934 GLY 77.A N TYR 99.A O GLY 77.A H 2.680 2.024 CYS 78.A N TYR 99.A O CYS 78.A H 2.990 2.200 GLY 79.A N THR 100.A OG1 GLY 79.A H 3.081 2.304 ARG 80.A NE VAL 51.A O ARG 80.A HE 2.780 1.939 ARG 80.A NH2 VAL 51.A O ARG 80.A HH21 3.512 2.890 SER 84.A OG ASP 75.A OD2 SER 84.A HG 2.680 1.872 TYR 85.A N GLY 81.A O TYR 85.A H 2.931 2.082 TYR 85.A OH MET 110.A O TYR 85.A HH 2.536 1.735 TYR 86.A N GLY 82.A O TYR 86.A H 3.312 2.508 ALA 87.A N TRP 83.A O ALA 87.A H 3.020 2.190 ALA 88.A N SER 84.A O ALA 88.A H 3.083 2.397 THR 89.A N TYR 86.A O THR 89.A H 3.087 2.256 THR 89.A OG1 TYR 86.A O THR 89.A HG1 2.698 1.866 ILE 90.A N ALA 87.A O ILE 90.A H 3.077 2.231 VAL 93.A N ILE 90.A O VAL 93.A H 3.234 2.433 GLN 94.A N GLY 71.A O GLN 94.A H 3.027 2.171 GLU 95.A N GLY 71.A O GLU 95.A H 3.260 2.482 VAL 96.A N ILE 119.A O VAL 96.A H 2.943 2.118 ARG 97.A N VAL 73.A O ARG 97.A H 2.789 1.948 ARG 97.A NH1 VAL 96.A O ARG 97.A HH11 2.879 2.067 ARG 97.A NH1 ILE 119.A O ARG 97.A HH12 3.202 2.586 GLY 98.A N ARG 121.A O GLY 98.A H 3.011 2.197 TYR 99.A N ASP 75.A O TYR 99.A H 2.968 2.138 THR 100.A N LYS 123.A O THR 100.A H 2.970 2.199 LYS 101.A NZ HIS 106.A NE2 LYS 101.A HZ1 3.150 2.309 GLY 103.A N GLU 108.A OE2 GLY 103.A H 2.676 1.849 HIS 106.A N GLY 103.A O HIS 106.A H 3.154 2.457 HIS 106.A ND1 PRO 104.A O HIS 106.A HD1 3.000 2.161 GLU 107.A N GLU 107.A OE1 GLU 107.A H 2.534 1.717 MET 110.A N ARG 80.A O MET 110.A H 2.909 2.052 GLN 113.A N ALA 45.A O GLN 113.A H 2.795 2.003 TYR 115.A N LEU 255.A O TYR 115.A H 2.920 2.104 GLY 116.A N GLY 258.A O GLY 116.A H 3.148 2.385 TRP 117.A N SER 114.A O TRP 117.A H 2.986 2.307 ASN 118.A ND2 ARG 260.A O ASN 118.A HD21 3.210 2.414 ILE 119.A N GLY 116.A O ILE 119.A H 3.209 2.382 VAL 120.A N TRP 117.A O VAL 120.A H 3.122 2.287 ARG 121.A N VAL 96.A O ARG 121.A H 2.988 2.192 LYS 123.A N GLY 98.A O LYS 123.A H 2.876 2.121 SER 124.A OG GLU 108.A OE1 SER 124.A HG 2.725 1.959 GLY 125.A N LYS 101.A O GLY 125.A H 2.936 2.234 VAL 126.A N THR 100.A O VAL 126.A H 3.052 2.201 PHE 129.A N ASP 127.A OD1 PHE 129.A H 3.065 2.274 HIS 130.A N ASP 127.A O HIS 130.A H 2.806 1.989 MET 131.A N VAL 128.A O MET 131.A H 3.158 2.321 ASP 137.A N LYS 72.A O ASP 137.A H 2.975 2.145 THR 138.A N LYS 72.A O THR 138.A H 3.023 2.176 THR 138.A OG1 TYR 70.A O THR 138.A HG1 2.825 2.120 LEU 139.A N ALA 174.A O LEU 139.A H 2.981 2.163 LEU 140.A N VAL 74.A O LEU 140.A H 2.756 1.901 CYS 141.A N CYS 176.A O CYS 141.A H 2.875 2.057 ASP 142.A N LEU 76.A O ASP 142.A H 3.319 2.511 SER 147.A N GLU 153.A OE2 SER 147.A H 2.974 2.127 SER 149.A N SER 147.A OG SER 149.A H 3.390 2.551 GLU 151.A N GLU 151.A OE1 GLU 151.A H 2.671 1.929 VAL 152.A N SER 149.A OG VAL 152.A H 3.292 2.455 GLU 153.A N SER 149.A O GLU 153.A H 3.037 2.186 GLU 154.A N PRO 150.A O GLU 154.A H 2.972 2.155 THR 155.A N GLU 151.A O THR 155.A H 2.964 2.113 THR 155.A OG1 GLU 151.A O THR 155.A HG1 3.057 2.300 ARG 156.A N VAL 152.A O ARG 156.A H 2.794 1.944 ARG 156.A NH1 GLU 145.A O ARG 156.A HH11 2.909 2.149 THR 157.A N GLU 153.A O THR 157.A H 3.040 2.263 THR 157.A OG1 GLU 153.A O THR 157.A HG1 2.682 1.878 LEU 158.A N GLU 154.A O LEU 158.A H 3.063 2.241 ARG 159.A N THR 155.A O ARG 159.A H 3.076 2.331 ARG 159.A NH1 ARG 159.A O ARG 159.A HH11 3.141 2.375 VAL 160.A N ARG 156.A O VAL 160.A H 3.213 2.421 LEU 161.A N THR 157.A O LEU 161.A H 3.013 2.196 SER 162.A N LEU 158.A O SER 162.A H 3.066 2.308 MET 163.A N ARG 159.A O MET 163.A H 3.053 2.265 VAL 164.A N VAL 160.A O VAL 164.A H 2.763 1.932 GLY 165.A N LEU 161.A O GLY 165.A H 3.001 2.315 LEU 168.A N VAL 164.A O LEU 168.A H 2.938 2.164 GLU 169.A N GLY 165.A O GLU 169.A H 3.112 2.486 LYS 170.A N TRP 167.A O LYS 170.A H 3.074 2.244 ARG 171.A N LEU 168.A O ARG 171.A H 3.027 2.187 ALA 174.A N ASP 137.A O ALA 174.A H 3.306 2.465 PHE 175.A N SER 219.A OG PHE 175.A H 3.031 2.223 CYS 176.A N LEU 139.A O CYS 176.A H 2.935 2.138 ILE 177.A N TRP 217.A O ILE 177.A H 2.828 2.004 LYS 178.A N CYS 141.A O LYS 178.A H 2.799 1.976 VAL 179.A N MET 215.A O VAL 179.A H 2.691 1.849 CYS 181.A N THR 157.A OG1 CYS 181.A H 3.025 2.282 TYR 183.A OH GLU 153.A OE1 TYR 183.A HH 3.314 2.564 THR 184.A OG1 GLU 154.A OE2 THR 184.A HG1 2.675 1.884 MET 187.A N THR 184.A OG1 MET 187.A H 3.149 2.346 MET 188.A N THR 184.A O MET 188.A H 3.042 2.226 GLU 189.A N SER 185.A O GLU 189.A H 2.956 2.112 THR 190.A N THR 186.A O THR 190.A H 2.803 1.985 THR 190.A OG1 THR 186.A O THR 190.A HG1 2.649 1.828 MET 191.A N MET 187.A O MET 191.A H 2.946 2.122 GLU 192.A N MET 188.A O GLU 192.A H 3.011 2.204 ARG 193.A N GLU 189.A O ARG 193.A H 3.162 2.344 LEU 194.A N THR 190.A O LEU 194.A H 2.981 2.171 GLN 195.A N MET 191.A O GLN 195.A H 2.790 2.075 GLN 195.A NE2 GLY 200.A O GLN 195.A HE21 2.815 1.960 GLN 195.A NE2 SER 223.A O GLN 195.A HE22 3.016 2.190 ARG 196.A N GLU 192.A O ARG 196.A H 3.070 2.264 HIS 198.A N LEU 194.A O HIS 198.A H 2.866 2.011 GLY 199.A N GLN 195.A O GLY 199.A H 2.589 1.836 GLY 201.A N VAL 218.A O GLY 201.A H 2.994 2.235 VAL 203.A N TYR 216.A O VAL 203.A H 2.919 2.153 ARG 204.A NH1 THR 212.A O ARG 204.A HH12 2.839 2.080 ARG 204.A NH1 GLU 214.A O ARG 204.A HH11 2.769 2.031 ARG 204.A NH2 ARG 209.A O ARG 204.A HH22 2.961 2.311 ARG 204.A NH2 THR 212.A O ARG 204.A HH22 3.037 2.341 SER 208.A N VAL 205.A O SER 208.A H 2.910 2.055 SER 208.A OG GLU 214.A OE2 SER 208.A HG 2.678 1.957 ASN 210.A N LYS 24.A O ASN 210.A H 2.877 2.076 ASN 210.A ND2 TYR 23.A O ASN 210.A HD22 2.902 2.059 ASN 210.A ND2 SER 26.A O ASN 210.A HD21 2.725 1.927 THR 212.A N ARG 209.A O THR 212.A H 3.308 2.465 HIS 213.A ND1 HIS 213.A O HIS 213.A HD1 2.624 1.937 HIS 213.A NE2 SER 233.A OG no hydrogen 2.560 N/A GLU 214.A N THR 212.A OG1 GLU 214.A H 3.187 2.388 MET 215.A N VAL 179.A O MET 215.A H 3.057 2.214 TYR 216.A N VAL 203.A O TYR 216.A H 2.857 2.011 TYR 216.A OH ASP 142.A OD1 TYR 216.A HH 2.883 2.078 TRP 217.A N ILE 177.A O TRP 217.A H 2.734 1.917 TRP 217.A NE1 GLY 199.A O TRP 217.A HE1 2.995 2.183 VAL 218.A N GLY 201.A O VAL 218.A H 2.936 2.104 SER 219.A N PHE 175.A O SER 219.A H 3.089 2.331 GLY 220.A N TYR 66.A O GLY 220.A H 2.820 2.102 ALA 221.A N VAL 218.A O ALA 221.A H 3.346 2.543 LYS 227.A N ASN 224.A OD1 LYS 227.A H 2.824 1.998 SER 228.A N ASN 224.A O SER 228.A H.B 2.911 2.117 SER 228.A OG.A LEU 202.A O SER 228.A HG.A 2.726 1.942 SER 228.A OG.B ASN 224.A O SER 228.A HG.B 2.923 2.238 SER 228.A OG.B ILE 225.A O SER 228.A HG.B 2.673 2.099 VAL 229.A N ILE 225.A O VAL 229.A H 2.927 2.079 SER 230.A N ILE 226.A O SER 230.A H 2.874 2.038 THR 231.A N LYS 227.A O THR 231.A H 3.035 2.237 THR 231.A OG1 LYS 227.A O THR 231.A HG1 2.677 1.903 THR 232.A N SER 228.A O THR 232.A H 3.268 2.447 SER 233.A N VAL 229.A O SER 233.A H 2.937 2.103 SER 233.A OG VAL 229.A O SER 233.A HG 3.081 2.293 GLN 234.A N SER 230.A O GLN 234.A H 2.973 2.156 LEU 235.A N THR 231.A O LEU 235.A H 3.040 2.240 LEU 236.A N THR 232.A O LEU 236.A H 2.967 2.131 LEU 237.A N SER 233.A O LEU 237.A H 2.913 2.074 GLY 238.A N GLN 234.A O GLY 238.A H 2.762 1.958 ARG 239.A N LEU 235.A O ARG 239.A H 2.978 2.235 ARG 239.A NH1 ASN 210.A OD1 ARG 239.A HH11 2.943 2.143 MET 240.A N LEU 237.A O MET 240.A H 3.100 2.417 ARG 245.A N SER 26.A OG ARG 245.A H 2.908 2.077 LYS 248.A N ILE 28.A O LYS 248.A H 2.847 2.023 GLU 250.A N GLU 30.A O GLU 250.A H 2.808 1.964 ASN 254.A ND2 GLY 47.A O ASN 254.A HD21 3.235 2.453 LEU 255.A N GLY 48.A O LEU 255.A H 2.779 1.949 GLY 256.A N ASN 254.A OD1 GLY 256.A H 3.034 2.206 ARG 260.A N ASN 118.A OD1 ARG 260.A H 2.790 1.977 ARG 260.A NH1 ALA 88.A O ARG 260.A HH11 2.694 1.856 ARG 260.A NH1 ILE 90.A O ARG 260.A HH12 2.476 1.681 ARG 260.A NH2 ILE 90.A O ARG 260.A HH22 3.343 2.803 ARG 260.A NH2 ARG 91.A O ARG 260.A HH22 2.482 1.736