Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vjf_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N PRO 73.A O MET 1.A H1 2.874 1.916 MET 1.A N ILE 75.A O MET 1.A H2 2.821 1.883 VAL 3.A N VAL 77.A O VAL 3.A H 2.749 1.920 GLY 5.A N THR 99.A O GLY 5.A H 3.201 2.380 ASN 6.A N SER 130.A OG ASN 6.A H 2.847 2.032 GLU 7.A N LYS 4.A O GLU 7.A H 3.004 2.253 ILE 8.A N GLY 5.A O ILE 8.A H 3.148 2.499 LEU 9.A N GLY 5.A O LEU 9.A H 3.066 2.235 LEU 10.A N ASN 6.A O LEU 10.A H 2.804 1.969 LYS 11.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 11.A HZ2 3.094 2.397 ALA 12.A N ILE 8.A O ALA 12.A H 3.199 2.373 HIS 13.A N LEU 9.A O HIS 13.A H 2.779 1.966 LYS 14.A N LEU 10.A O LYS 14.A H 2.978 2.165 GLU 15.A N LYS 11.A O GLU 15.A H 2.948 2.177 GLY 16.A N ALA 12.A O GLY 16.A H 2.762 2.108 TYR 17.A N ALA 12.A O TYR 17.A H 2.961 2.186 GLY 18.A N LEU 288.A O GLY 18.A H 2.995 2.148 VAL 19.A N ASN 237.A O VAL 19.A H 2.754 1.941 ALA 21.A N VAL 239.A O ALA 21.A H 2.824 1.972 PHE 22.A N PHE 45.A O PHE 22.A H 2.968 2.132 ASN 23.A N THR 241.A O ASN 23.A H 3.283 2.477 ASN 23.A ND2 ASP 82.A OD2 ASN 23.A HD21 3.174 2.321 PHE 24.A N GLN 47.A O PHE 24.A H 3.067 2.320 GLU 28.A N GLU 28.A OE1 GLU 28.A H 2.874 2.166 MET 29.A N ASN 26.A OD1 MET 29.A H 3.147 2.300 LEU 30.A N ASN 26.A O LEU 30.A H 3.224 2.378 ASN 31.A N PHE 27.A O ASN 31.A H 2.835 2.003 ASN 31.A ND2 GLU 35.A OE1 ASN 31.A HD21 3.344 2.727 ASN 31.A ND2 GLN 274.A OE1 ASN 31.A HD22 2.866 2.054 ALA 32.A N GLU 28.A O ALA 32.A H 3.214 2.376 ILE 33.A N MET 29.A O ILE 33.A H 3.075 2.241 PHE 34.A N LEU 30.A O PHE 34.A H 3.088 2.255 GLU 35.A N ASN 31.A O GLU 35.A H 2.948 2.102 ALA 36.A N ALA 32.A O ALA 36.A H 2.975 2.155 GLY 37.A N ILE 33.A O GLY 37.A H 3.055 2.235 ASN 38.A N PHE 34.A O ASN 38.A H 2.809 1.988 GLU 39.A N GLU 35.A O GLU 39.A H 2.841 2.045 GLU 40.A N ALA 36.A O GLU 40.A H 2.877 2.112 ASN 41.A N ASN 38.A O ASN 41.A H 3.447 2.615 ASN 41.A ND2 ASN 292.A OD1 ASN 41.A HD22 3.619 2.919 SER 42.A N GLY 37.A O SER 42.A H 2.996 2.181 SER 42.A OG PRO 43.A O SER 42.A HG 2.783 2.290 LEU 44.A N PRO 76.A O LEU 44.A H 3.175 2.379 PHE 45.A N GLY 20.A O PHE 45.A H 3.180 2.323 ILE 46.A N ALA 78.A O ILE 46.A H 2.853 2.022 GLN 47.A N PHE 22.A O GLN 47.A H 2.910 2.059 GLN 47.A NE2 ASN 23.A OD1 GLN 47.A HE21 2.840 1.981 ALA 48.A N HIS 80.A O ALA 48.A H 2.997 2.201 ALA 52.A N SER 49.A OG ALA 52.A H 3.116 2.299 ILE 53.A N SER 49.A O ILE 53.A H 2.949 2.124 LYS 54.A N GLU 50.A O LYS 54.A H 2.982 2.179 TYR 55.A N GLY 51.A O TYR 55.A H 2.939 2.117 MET 56.A N ALA 52.A O MET 56.A H 2.895 2.067 GLY 57.A N ILE 53.A O GLY 57.A H 2.667 1.951 MET 60.A N GLY 57.A O MET 60.A H 3.093 2.472 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 3.032 2.204 VAL 62.A N ILE 58.A O VAL 62.A H 2.999 2.141 GLY 63.A N ASP 59.A O GLY 63.A H 2.952 2.170 MET 64.A N MET 60.A O MET 64.A H 2.827 1.971 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.321 2.494 LYS 66.A N VAL 62.A O LYS 66.A H 2.912 2.079 ILE 67.A N GLY 63.A O ILE 67.A H 3.072 2.255 MET 68.A N MET 64.A O MET 68.A H 3.015 2.193 CYS 69.A N VAL 65.A O CYS 69.A H 2.868 2.044 CYS 69.A SG VAL 65.A O CYS 69.A HG 3.450 2.511 GLU 70.A N LYS 66.A O GLU 70.A H 3.003 2.218 ARG 71.A N ILE 67.A O ARG 71.A H 2.974 2.269 TYR 72.A N MET 68.A O TYR 72.A H 2.895 2.146 ILE 75.A N TYR 72.A O ILE 75.A H 3.127 2.272 VAL 77.A N MET 1.A O VAL 77.A H 2.937 2.121 ALA 78.A N LEU 44.A O ALA 78.A H 3.228 2.423 LEU 79.A N THR 99.A OG1 LEU 79.A H 3.056 2.286 HIS 80.A N ILE 46.A O HIS 80.A H 2.915 2.113 HIS 80.A ND1 SER 100.A OG HIS 80.A HD1 2.596 1.775 LEU 81.A N SER 100.A O LEU 81.A H 2.962 2.161 ASP 82.A N ALA 48.A O ASP 82.A H 2.917 2.090 HIS 83.A ND1 ASP 104.A OD2 HIS 83.A HD1 2.745 2.049 HIS 83.A NE2 HIS 197.A ND1 no hydrogen 3.065 N/A GLY 84.A N MET 102.A O GLY 84.A H 2.837 2.183 THR 85.A N GLU 50.A OE1 THR 85.A H 2.834 2.046 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE1 THR 85.A HG1 3.224 2.415 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE2 THR 85.A HG1 2.773 2.141 GLU 88.A N GLU 88.A OE1 GLU 88.A H 2.738 1.985 SER 89.A N THR 86.A OG1 SER 89.A H 2.996 2.180 SER 89.A OG GLU 50.A OE1 SER 89.A HG 2.680 1.904 CYS 90.A N THR 86.A O CYS 90.A H 3.155 2.311 CYS 90.A SG THR 86.A O CYS 90.A HG 3.540 2.614 GLU 91.A N PHE 87.A O GLU 91.A H 2.819 2.016 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.907 2.098 ALA 93.A N SER 89.A O ALA 93.A H 3.043 2.230 VAL 94.A N CYS 90.A O VAL 94.A H 2.960 2.136 LYS 95.A N GLU 91.A O LYS 95.A H 2.952 2.115 ALA 96.A N LYS 92.A O ALA 96.A H 2.923 2.208 ALA 96.A N ALA 93.A O ALA 96.A H 3.213 2.627 GLY 97.A N ALA 93.A O GLY 97.A H 3.108 2.436 GLY 97.A N VAL 94.A O GLY 97.A H 3.245 2.522 PHE 98.A N ALA 93.A O PHE 98.A H 2.989 2.170 THR 99.A N LEU 79.A O THR 99.A H 2.876 2.089 THR 99.A OG1 VAL 3.A O THR 99.A HG1 2.762 2.129 SER 100.A N LEU 79.A O SER 100.A H 3.117 2.483 VAL 101.A N SER 130.A O VAL 101.A H 2.945 2.159 MET 102.A N LEU 81.A O MET 102.A H 2.810 2.009 ILE 103.A N GLU 132.A O ILE 103.A H 2.903 2.135 ASP 104.A N GLY 84.A O ASP 104.A H 2.822 1.965 SER 106.A N ASP 104.A OD1 SER 106.A H 3.138 2.279 SER 106.A OG ASP 104.A OD1 no hydrogen 3.144 N/A SER 106.A OG GLU 134.A OE1 no hydrogen 3.277 N/A SER 106.A OG GLY 136.A O no hydrogen 3.240 N/A HIS 108.A N ALA 105.A O HIS 108.A H 2.984 2.147 ASN 113.A N ALA 109.A O ASN 113.A H 3.014 2.158 ASN 113.A ND2 GLU 134.A O ASN 113.A HD21 2.961 2.127 LEU 114.A N PHE 110.A O LEU 114.A H 2.870 2.017 GLU 115.A N GLU 111.A O GLU 115.A H 2.922 2.104 LEU 116.A N GLU 112.A O LEU 116.A H 2.937 2.092 THR 117.A N ASN 113.A O THR 117.A H 2.855 1.999 THR 117.A OG1 ASN 113.A O THR 117.A HG1 2.907 2.246 THR 117.A OG1 ASN 113.A OD1 THR 117.A HG1 3.117 2.699 SER 118.A N LEU 114.A O SER 118.A H 2.839 2.012 LYS 119.A N GLU 115.A O LYS 119.A H 3.097 2.309 VAL 120.A N LEU 116.A O VAL 120.A H 3.015 2.184 VAL 121.A N THR 117.A O VAL 121.A H 2.888 2.062 LYS 122.A N SER 118.A O LYS 122.A H 3.053 2.226 MET 123.A N LYS 119.A O MET 123.A H 3.350 2.527 ALA 124.A N VAL 120.A O ALA 124.A H 2.788 1.936 HIS 125.A N VAL 121.A O HIS 125.A H 2.798 1.943 HIS 125.A NE2 ASP 157.A OD2 HIS 125.A HE2 2.840 1.998 ASN 126.A N LYS 122.A O ASN 126.A H 3.275 2.469 ALA 127.A N ALA 124.A O ALA 127.A H 2.896 2.197 GLY 128.A N HIS 125.A O GLY 128.A H 3.045 2.214 VAL 129.A N ALA 124.A O VAL 129.A H 2.857 2.003 SER 130.A N THR 99.A O SER 130.A H 3.384 2.562 VAL 131.A N ASP 157.A OD2 VAL 131.A H 2.772 1.989 GLU 132.A N VAL 101.A O GLU 132.A H 2.843 2.017 ALA 133.A N TYR 158.A O ALA 133.A H 3.204 2.435 LEU 135.A N ALA 160.A O LEU 135.A H 3.052 2.220 ARG 137.A N VAL 140.A O ARG 137.A H 2.697 1.857 ARG 137.A NE SER 106.A O ARG 137.A HE 2.970 2.127 ARG 137.A NH2 SER 106.A O ARG 137.A HH21 3.411 2.712 ARG 137.A NH2 HIS 108.A O ARG 137.A HH21 2.976 2.331 VAL 142.A N ALA 162.A O VAL 142.A H 2.921 2.078 LYS 145.A NZ GLU 148.A OE1 LYS 145.A HZ1 3.025 2.423 GLU 146.A N ASN 143.A OD1 GLU 146.A H 3.238 2.423 ALA 147.A N ASN 143.A O ALA 147.A H 2.888 2.074 GLU 148.A N PRO 144.A O GLU 148.A H 2.961 2.159 GLN 149.A N LYS 145.A O GLN 149.A H 3.273 2.427 PHE 150.A N GLU 146.A O PHE 150.A H 2.747 1.921 VAL 151.A N ALA 147.A O VAL 151.A H 2.867 2.020 LYS 152.A N GLU 148.A O LYS 152.A H 3.144 2.311 GLU 153.A N GLN 149.A O GLU 153.A H 2.904 2.074 SER 154.A N PHE 150.A O SER 154.A H 2.914 2.108 GLN 155.A N VAL 151.A O GLN 155.A H 2.975 2.213 GLN 155.A NE2 LYS 152.A O GLN 155.A HE22 3.022 2.180 ASP 157.A N VAL 131.A O ASP 157.A H 3.006 2.282 TYR 158.A N VAL 131.A O TYR 158.A H 3.120 2.319 LEU 159.A N PRO 193.A O LEU 159.A H 3.298 2.526 ALA 160.A N ALA 133.A O ALA 160.A H 2.821 1.975 ALA 162.A N LEU 135.A O ALA 162.A H 2.945 2.120 THR 165.A OG1 HIS 197.A O THR 165.A HG1 2.577 1.849 LYS 171.A N LYS 221.A O LYS 171.A H 3.041 2.194 LYS 171.A NZ SER 166.A O LYS 171.A HZ2 2.723 2.097 LYS 171.A NZ GLY 168.A O LYS 171.A HZ3 2.646 1.980 LYS 171.A NZ GLY 198.A O LYS 171.A HZ2 3.138 2.519 LYS 177.A NZ LEU 178.A O LYS 177.A HZ2 3.426 2.586 ASP 179.A N ILE 163.A O ASP 179.A H 2.864 2.021 ARG 182.A N ASP 179.A OD2 ARG 182.A H 3.052 2.232 ARG 182.A NE ASP 179.A OD1 ARG 182.A HE 2.793 2.009 ARG 182.A NH1 VAL 142.A O ARG 182.A HH11 2.852 2.071 ARG 182.A NH2 ASP 179.A OD1 ARG 182.A HH21 3.281 2.648 LEU 183.A N ASP 179.A O LEU 183.A H 3.106 2.277 GLN 184.A N PHE 180.A O GLN 184.A H 2.937 2.119 GLU 185.A N GLU 181.A O GLU 185.A H 3.105 2.321 VAL 186.A N ARG 182.A O VAL 186.A H 3.013 2.168 LYS 187.A N LEU 183.A O LYS 187.A H 2.954 2.124 LYS 187.A NZ ILE 192.A O LYS 187.A HZ1 2.967 2.083 LYS 187.A NZ GLY 235.A O LYS 187.A HZ2 2.740 1.866 ARG 188.A N GLN 184.A O ARG 188.A H 2.986 2.161 LEU 189.A N GLU 185.A O LEU 189.A H 2.950 2.164 THR 190.A N VAL 186.A O THR 190.A H 2.886 2.153 THR 190.A OG1 VAL 186.A O THR 190.A HG1 2.782 2.005 ASN 191.A N LYS 187.A O ASN 191.A H 2.773 1.950 LEU 194.A N ASN 237.A OD1 LEU 194.A H 3.322 2.590 VAL 195.A N LEU 159.A O VAL 195.A H 2.817 2.044 LEU 196.A N LYS 238.A O LEU 196.A H 2.846 2.020 HIS 197.A ND1 HIS 83.A NE2 no hydrogen 3.065 N/A HIS 197.A NE2 GLU 132.A OE2 HIS 197.A HE2 2.625 1.791 ALA 199.A N ASN 240.A O ALA 199.A H 3.252 2.482 ALA 201.A N ASP 244.A OD2 ALA 201.A H 2.823 1.979 ILE 202.A N ASP 244.A OD1 ILE 202.A H 2.676 1.883 ARG 207.A N PRO 203.A O ARG 207.A H 2.980 2.137 ARG 207.A NH1 SER 220.A O ARG 207.A HH12 3.116 2.356 ARG 207.A NH2 SER 220.A O ARG 207.A HH22 3.415 2.739 LYS 208.A N ASP 204.A O LYS 208.A H 2.924 2.114 LYS 208.A NZ ASP 212.A OD2 LYS 208.A HZ2 2.813 1.986 SER 209.A N ASN 205.A O SER 209.A H 3.002 2.196 TYR 210.A N VAL 206.A O TYR 210.A H 3.072 2.268 LEU 211.A N ARG 207.A O LEU 211.A H 2.869 2.021 ASP 212.A N LYS 208.A O ASP 212.A H 2.796 1.956 ALA 213.A N SER 209.A O ALA 213.A H 3.167 2.466 ALA 213.A N TYR 210.A O ALA 213.A H 3.202 2.542 GLY 214.A N LEU 211.A O GLY 214.A H 2.951 2.121 GLY 215.A N TYR 210.A O GLY 215.A H 3.015 2.240 LYS 218.A N ASP 216.A OD2 LYS 218.A H 3.445 2.603 SER 220.A N LEU 217.A O SER 220.A H 3.166 2.321 LYS 221.A N ALA 169.A O LYS 221.A H 2.643 1.875 VAL 223.A N SER 200.A O VAL 223.A H 2.894 2.062 GLU 226.A N GLU 226.A OE1 GLU 226.A H 2.629 1.847 PHE 227.A N PRO 224.A O PHE 227.A H 2.927 2.294 LEU 228.A N PRO 224.A O LEU 228.A H 3.147 2.359 GLN 229.A N PHE 225.A O GLN 229.A H 2.988 2.166 GLU 230.A N GLU 226.A O GLU 230.A H 2.915 2.111 SER 231.A N PHE 227.A O SER 231.A H 2.768 1.992 VAL 232.A N LEU 228.A O VAL 232.A H 3.071 2.258 LYS 233.A N GLN 229.A O LYS 233.A H 3.015 2.181 GLY 234.A N GLU 230.A O GLY 234.A H 2.912 2.186 GLY 235.A N VAL 232.A O GLY 235.A H 3.092 2.310 ILE 236.A N SER 231.A O ILE 236.A H 3.022 2.169 ASN 237.A N LEU 194.A O ASN 237.A H 2.728 1.876 ASN 237.A ND2 TYR 17.A O ASN 237.A HD22 3.056 2.197 LYS 238.A N LEU 194.A O LYS 238.A H 3.077 2.287 LYS 238.A NZ GLN 47.A OE1 LYS 238.A HZ1 3.004 2.249 LYS 238.A NZ GLU 132.A OE1 LYS 238.A HZ2 2.834 1.981 LYS 238.A NZ ASN 240.A OD1 LYS 238.A HZ3 2.837 1.971 VAL 239.A N VAL 19.A O VAL 239.A H 2.903 2.113 ASN 240.A N LEU 196.A O ASN 240.A H 2.983 2.136 THR 241.A N ALA 21.A O THR 241.A H 2.873 2.077 THR 241.A OG1 VAL 239.A O THR 241.A HG1 3.157 2.368 ARG 246.A N ASP 242.A O ARG 246.A H 3.064 2.261 ARG 246.A NE ASP 242.A OD1 ARG 246.A HE 2.951 2.101 ARG 246.A NH2 ASP 242.A OD2 ARG 246.A HH21 2.944 2.148 ILE 247.A N THR 243.A O ILE 247.A H 3.021 2.171 ALA 248.A N ASP 244.A O ALA 248.A H 3.104 2.261 PHE 249.A N LEU 245.A O PHE 249.A H 2.998 2.185 ILE 250.A N ARG 246.A O ILE 250.A H 2.811 1.957 ALA 251.A N ILE 247.A O ALA 251.A H 2.853 2.038 GLU 252.A N PHE 249.A O GLU 252.A H 3.099 2.463 VAL 253.A N PHE 249.A O VAL 253.A H 3.260 2.455 ARG 254.A N ILE 250.A O ARG 254.A H 2.840 1.986 LYS 255.A N ALA 251.A O LYS 255.A H 2.983 2.170 VAL 256.A N GLU 252.A O VAL 256.A H 3.036 2.211 ALA 257.A N VAL 253.A O ALA 257.A H 3.074 2.233 ASN 258.A N ARG 254.A O ASN 258.A H 2.914 2.113 ASN 258.A ND2 ALA 213.A O ASN 258.A HD22 2.635 1.907 GLU 259.A N LYS 255.A O GLU 259.A H 2.979 2.207 ASP 260.A N VAL 256.A O ASP 260.A H 3.212 2.428 SER 262.A N ASP 260.A OD1 SER 262.A H 2.847 2.041 GLN 263.A N ASP 260.A O GLN 263.A H 3.273 2.425 ASP 265.A N GLN 263.A OE1 ASP 265.A H 2.957 2.121 ARG 267.A N ASP 265.A OD1 ARG 267.A H 2.966 2.210 LYS 268.A N ASP 265.A O LYS 268.A H 2.929 2.263 PHE 269.A N LEU 266.A O PHE 269.A H 3.025 2.332 PHE 270.A N LEU 266.A O PHE 270.A H 2.992 2.227 SER 271.A N ARG 267.A O SER 271.A H 2.897 2.069 GLN 274.A N PHE 270.A O GLN 274.A H 2.885 2.048 LEU 275.A N SER 271.A O LEU 275.A H 3.156 2.362 ALA 276.A N PRO 272.A O ALA 276.A H 3.033 2.217 LEU 277.A N ALA 273.A O LEU 277.A H 3.042 2.198 LYS 278.A N GLN 274.A O LYS 278.A H 2.753 1.896 LYS 278.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 278.A HZ3 3.079 2.296 LYS 278.A NZ GLU 39.A OE2 LYS 278.A HZ3 3.084 2.261 ASN 279.A N LEU 275.A O ASN 279.A H 2.950 2.132 VAL 280.A N ALA 276.A O VAL 280.A H 3.165 2.352 VAL 281.A N LEU 277.A O VAL 281.A H 3.072 2.245 LYS 282.A N LYS 278.A O LYS 282.A H 2.846 2.010 LYS 282.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 282.A HZ1 2.879 2.006 GLU 283.A N ASN 279.A O GLU 283.A H 3.000 2.149 ARG 284.A N VAL 280.A O ARG 284.A H 3.035 2.249 ARG 284.A NH1 ASP 244.A OD2 ARG 284.A HH12 2.881 2.128 ARG 284.A NH2 ASP 244.A OD2 ARG 284.A HH22 2.840 2.071 MET 285.A N VAL 281.A O MET 285.A H 2.950 2.125 LYS 286.A N LYS 282.A O LYS 286.A H 3.176 2.354 LYS 286.A NZ GLU 283.A OE2 LYS 286.A HZ2 2.955 2.146 LEU 287.A N GLU 283.A O LEU 287.A H 2.891 2.086 LEU 288.A N ARG 284.A O LEU 288.A H 2.846 2.062 GLY 289.A N MET 285.A O GLY 289.A H 3.184 2.563 GLY 289.A N LYS 286.A O GLY 289.A H 3.289 2.550 SER 290.A N MET 285.A O SER 290.A H 3.061 2.341 ALA 291.A N MET 285.A O ALA 291.A H 3.306 2.556 ASN 292.A N GLU 40.A O ASN 292.A H 2.856 2.052 LYS 293.A N ASN 41.A O LYS 293.A H 3.088 2.464 LYS 293.A N SER 290.A O LYS 293.A H 3.287 2.618 LYS 293.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 293.A HZ3 2.721 1.897 ILE 294.A N ASN 41.A O ILE 294.A H 3.353 2.575