Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vko_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 3.A NE LEU 67.A O ARG 3.A HE 3.007 2.199 ARG 3.A NH1 GLU 60.A OE2 ARG 3.A HH12 2.786 1.977 ARG 3.A NH2 GLU 60.A OE1 ARG 3.A HH22 2.949 2.167 ARG 3.A NH2 GLU 60.A OE2 ARG 3.A HH22 3.073 2.363 ARG 3.A NH2 LEU 67.A O ARG 3.A HH21 3.158 2.416 ARG 3.A NH2 ALA 68.A O ARG 3.A HH21 3.404 2.847 HIS 7.A NE2 ASP 84.A OD1 HIS 7.A HE2 2.751 1.953 TYR 10.A N HIS 7.A O TYR 10.A H 3.046 2.196 PHE 11.A N ILE 32.A O PHE 11.A H 2.832 2.020 PHE 13.A N PHE 11.A O PHE 13.A H 2.987 2.377 ASN 14.A N GLN 17.A OE1 ASN 14.A H 2.874 2.053 GLN 17.A N ASN 14.A OD1 GLN 17.A H 2.723 1.883 ALA 18.A N ASN 14.A O ALA 18.A H 2.923 2.109 GLU 19.A N GLY 15.A O GLU 19.A H 3.047 2.223 ASP 20.A N ARG 16.A O ASP 20.A H 2.946 2.131 TYR 21.A N GLN 17.A O TYR 21.A H 2.928 2.080 LEU 22.A N ALA 18.A O LEU 22.A H 3.008 2.209 ARG 23.A N ASP 20.A O ARG 23.A H 3.152 2.306 ARG 23.A NE ASP 20.A OD1 ARG 23.A HE 3.471 2.725 ARG 23.A NH1 ASP 51.A OD1.A ARG 23.A HH11 2.637 2.009 ARG 23.A NH1 ASP 51.A OD1.B ARG 23.A HH12 2.737 1.937 ARG 23.A NH2 ASP 20.A OD1 ARG 23.A HH21 3.350 2.584 LYS 25.A N LEU 22.A O LYS 25.A H 2.892 2.126 GLU 26.A N GLU 29.A OE1 GLU 26.A H 2.918 2.067 ARG 27.A NE LEU 48.A O ARG 27.A HE 2.693 1.857 ARG 27.A NH1 ASN 99.A OD1 ARG 27.A HH11 2.759 1.946 ARG 27.A NH1 THR 102.A OG1 ARG 27.A HH12 2.927 2.098 ARG 27.A NH2 LEU 48.A O ARG 27.A HH21 3.500 2.949 ARG 27.A NH2 ASP 49.A OD1 ARG 27.A HH21 2.929 2.202 GLY 28.A N LYS 47.A O GLY 28.A H 2.803 1.963 GLU 29.A N GLU 26.A O GLU 29.A H 3.057 2.204 VAL 31.A N THR 45.A O VAL 31.A H 2.958 2.177 ILE 32.A N TYR 9.A O ILE 32.A H 2.763 1.904 ARG 33.A N VAL 43.A O ARG 33.A H 2.877 2.114 ARG 33.A NE THR 45.A OG1 ARG 33.A HE 3.009 2.158 ARG 33.A NH1 PHE 13.A O ARG 33.A HH11 3.314 2.526 GLN 34.A NE2 THR 1.A O GLN 34.A HE21 2.972 2.139 ARG 37.A N SER 35.A OG ARG 37.A H 2.779 1.936 ASP 40.A N ASP 40.A OD1 ASP 40.A H 2.696 2.063 HIS 41.A N GLY 38.A O HIS 41.A H 3.138 2.322 HIS 41.A ND1 ASP 57.A OD1 HIS 41.A HD1 2.711 1.891 LEU 42.A N ILE 58.A O LEU 42.A H 2.981 2.176 VAL 43.A N ARG 33.A O VAL 43.A H 2.885 2.074 ILE 44.A N ILE 56.A O ILE 44.A H 3.031 2.228 THR 45.A N VAL 31.A O THR 45.A H 2.975 2.161 TRP 46.A N GLN 54.A O no hydrogen 2.911 N/A TRP 46.A NE1 GLN 54.A OE1 no hydrogen 2.803 N/A LYS 47.A N GLU 29.A O LYS 47.A H 2.960 2.178 LYS 47.A NZ LEU 22.A O LYS 47.A HZ1 3.548 2.818 LYS 47.A NZ ARG 23.A O LYS 47.A HZ1 2.696 2.051 LYS 47.A NZ LYS 25.A O LYS 47.A HZ2 2.631 1.785 LEU 48.A N LEU 52.A O LEU 48.A H 2.895 2.077 ASP 49.A N LEU 52.A O ASP 49.A H 3.371 2.569 LEU 52.A N ASP 49.A O LEU 52.A H 2.922 2.138 GLN 54.A N TRP 46.A O GLN 54.A H 3.037 2.216 GLN 54.A NE2 PRO 141.A O GLN 54.A HE22 3.118 2.575 HIS 55.A ND1 THR 45.A OG1 HIS 55.A HD1 2.815 2.226 HIS 55.A NE2 GLU 19.A OE2 HIS 55.A HE2 2.774 1.921 ILE 56.A N ILE 44.A O ILE 56.A H 2.868 2.026 ILE 58.A N LEU 42.A O ILE 58.A H 2.850 2.044 GLN 59.A N ILE 74.A O GLN 59.A H 2.868 2.028 GLU 60.A N ASP 40.A O GLU 60.A H 2.786 1.985 LEU 61.A N VAL 72.A O LEU 61.A H 2.843 1.989 LYS 63.A NZ GLU 60.A OE1 LYS 63.A HZ3 3.157 2.499 LYS 63.A NZ PRO 66.A O LYS 63.A HZ1 2.927 2.159 LYS 63.A NZ ALA 68.A O LYS 63.A HZ2 2.653 1.885 LEU 67.A N ASN 65.A OD1 LEU 67.A H 2.913 2.208 ALA 68.A N ASN 65.A OD1 ALA 68.A H 2.851 2.147 GLY 70.A N GLU 60.A OE1 GLY 70.A H 2.963 2.180 LYS 71.A N GLU 62.A O LYS 71.A H 3.150 2.299 LYS 71.A NZ GLU 62.A O LYS 71.A HZ3 2.816 2.256 LYS 71.A NZ GLU 64.A OE2 LYS 71.A HZ2 2.950 2.081 VAL 72.A N LEU 61.A O VAL 72.A H 3.286 2.432 LEU 73.A N TYR 80.A O LEU 73.A H 2.890 2.054 ILE 74.A N GLN 59.A O ILE 74.A H 2.812 1.980 VAL 75.A N GLN 78.A O VAL 75.A H 2.918 2.105 GLN 78.A N VAL 75.A O GLN 78.A H 2.962 2.151 GLN 78.A NE2.B ASN 165.A OD1 no hydrogen 3.352 N/A TYR 80.A N LEU 73.A O TYR 80.A H 2.736 1.943 ASN 81.A N GLN 85.A OE1 ASN 81.A H 2.679 1.832 ASN 81.A ND2.A ASP 82.A OD2 ASN 81.A HD21.A 2.919 2.332 GLN 85.A N ASP 82.A OD1 GLN 85.A H 2.809 1.978 GLN 85.A NE2 GLU 89.A OE1 GLN 85.A HE21 3.213 2.417 GLN 85.A NE2 GLU 89.A OE2 GLN 85.A HE21 3.387 2.606 ILE 86.A N ASP 82.A O ILE 86.A H 3.248 2.435 ILE 87.A N LEU 83.A O ILE 87.A H 2.983 2.171 VAL 88.A N ASP 84.A O VAL 88.A H 2.972 2.141 GLU 89.A N GLN 85.A O GLU 89.A H 2.798 1.944 TYR 90.A N ILE 86.A O TYR 90.A H 2.849 2.094 LEU 91.A N ILE 86.A O LEU 91.A H 2.893 2.085 GLN 92.A N ILE 87.A O GLN 92.A H 2.803 2.020 ASN 93.A ND2 GLU 89.A O ASN 93.A HD22 2.906 2.050 LYS 94.A N TYR 90.A O LYS 94.A H 3.122 2.301 LYS 94.A NZ GLN 54.A OE1 LYS 94.A HZ2 3.026 2.414 LYS 94.A NZ TYR 90.A OH LYS 94.A HZ1 2.780 2.046 VAL 95.A N LEU 91.A O VAL 95.A H 2.895 2.104 ARG 96.A N GLN 92.A O ARG 96.A H 2.919 2.094 ARG 96.A NE ASN 93.A OD1 ARG 96.A HE 3.385 2.577 ARG 96.A NH2 ASN 93.A OD1 ARG 96.A HH21 3.478 2.711 LEU 97.A N ASN 93.A O LEU 97.A H 2.953 2.141 LEU 98.A N LYS 94.A O LEU 98.A H 2.908 2.096 ASN 99.A N VAL 95.A O ASN 99.A H 2.963 2.143 GLU 100.A N ARG 96.A O GLU 100.A H 2.945 2.107 MET 101.A N LEU 97.A O no hydrogen 3.003 N/A THR 102.A N LEU 98.A O THR 102.A H 2.897 2.072 SER 103.A N ASN 99.A O SER 103.A H 2.939 2.251 SER 104.A N MET 101.A O SER 104.A H 3.017 2.170 LYS 106.A N SER 104.A OG LYS 106.A H 2.986 2.139 LYS 106.A NZ TYR 132.A O LYS 106.A HZ3 3.055 2.420 PHE 107.A N SER 104.A O PHE 107.A H 3.057 2.204 LYS 108.A N PHE 134.A O LYS 108.A H 2.860 2.035 THR 111.A N ASP 114.A OD2 THR 111.A H 3.023 2.218 LYS 112.A NZ THR 158.A OG1 LYS 112.A HZ1 3.185 2.353 ASP 114.A N THR 111.A OG1 ASP 114.A H 3.174 2.340 VAL 115.A N THR 111.A O VAL 115.A H 3.073 2.312 VAL 115.A N LYS 112.A O VAL 115.A H 3.039 2.446 VAL 116.A N LYS 112.A O VAL 116.A H 2.857 2.012 LYS 117.A N LYS 113.A O LYS 117.A H 2.988 2.166 LYS 117.A NZ ASP 121.A OD2 LYS 117.A HZ2 3.147 2.331 PHE 118.A N ASP 114.A O PHE 118.A H 3.154 2.374 ILE 119.A N VAL 115.A O ILE 119.A H 2.817 2.000 GLU 120.A N VAL 116.A O GLU 120.A H 2.762 1.927 ASP 121.A N LYS 117.A O ASP 121.A H 2.891 2.050 TYR 122.A N PHE 118.A O TYR 122.A H 2.742 1.889 SER 123.A N ILE 119.A O SER 123.A H 2.813 2.015 ARG 124.A N GLU 120.A O ARG 124.A H 2.794 1.990 VAL 125.A N ASP 121.A O VAL 125.A H 3.126 2.337 ASN 126.A N TYR 122.A O ASN 126.A H 2.877 2.161 LYS 129.A N ASN 126.A O LYS 129.A H 3.306 2.450 LYS 129.A NZ TYR 122.A OH LYS 129.A HZ2 3.000 2.329 VAL 131.A N LYS 149.A O no hydrogen 2.881 N/A TYR 133.A N MET 147.A O TYR 133.A H 3.035 2.271 PHE 134.A N LYS 106.A O PHE 134.A H 2.855 2.015 SER 135.A N TYR 145.A O SER 135.A H 2.994 2.237 ASN 137.A N TRP 143.A O ASN 137.A H 3.016 2.180 ASP 139.A N ASN 137.A OD1 ASP 139.A H 2.951 2.315 ASN 140.A N ASN 137.A OD1 ASN 140.A H 2.905 2.274 ASN 140.A ND2 ASN 137.A OD1 ASN 140.A HD22 3.264 2.425 TRP 143.A N ASN 140.A O no hydrogen 3.163 N/A PHE 144.A N VAL 161.A O PHE 144.A H 2.807 1.968 TYR 145.A N SER 135.A O TYR 145.A H 2.791 2.117 LEU 146.A N TRP 159.A O LEU 146.A H 2.929 2.091 MET 147.A N TYR 133.A O no hydrogen 2.947 N/A PHE 148.A N TYR 157.A O PHE 148.A H 2.950 2.159 LYS 149.A N VAL 131.A O LYS 149.A H 2.962 2.223 LYS 149.A NZ ALA 152.A O LYS 149.A HZ1 2.929 2.064 LYS 149.A NZ SER 154.A O LYS 149.A HZ2 2.777 1.975 ILE 150.A N SER 154.A OG ILE 150.A H 2.888 2.187 ASN 151.A N SER 154.A OG ASN 151.A H 3.427 2.595 ALA 152.A N PRO 127.A O ALA 152.A H 2.857 2.043 ASN 153.A N ASN 151.A OD1 no hydrogen 3.062 N/A SER 154.A N ASN 151.A O SER 154.A H 3.041 2.205 SER 154.A OG LYS 155.A O SER 154.A HG 3.045 2.211 TYR 157.A N PHE 148.A O TYR 157.A H 2.884 2.038 TRP 159.A N LEU 146.A O TRP 159.A H 2.813 1.969 VAL 161.A N PHE 144.A O VAL 161.A H 2.930 2.082 LYS 162.A N PHE 169.A O LYS 162.A H 2.892 2.078 LEU 163.A N GLY 142.A O LEU 163.A H 2.862 2.027 THR 164.A N GLY 167.A O THR 164.A H 2.935 2.119 ASN 165.A ND2 GLU 89.A O ASN 165.A HD22 3.491 2.642 THR 166.A N THR 164.A OG1 THR 166.A H 3.253 2.441 GLY 167.A N THR 164.A OG1 GLY 167.A H 3.055 2.454 TYR 168.A N TYR 175.A O TYR 168.A H 2.768 1.962 PHE 169.A N LYS 162.A O PHE 169.A H 2.858 2.004 LEU 170.A N TYR 173.A O LEU 170.A H 2.940 2.115 ASN 172.A N.B LEU 170.A O ASN 172.A H.B 2.789 2.227 TYR 173.A N LEU 170.A O TYR 173.A H 3.246 2.461 ASN 174.A ND2 THR 164.A OG1 ASN 174.A HD22 2.984 2.184 TYR 175.A N TYR 168.A O TYR 175.A H 2.775 1.991 VAL 178.A N GLU 100.A OE2 VAL 178.A H 2.886 2.070 GLN 180.A N SER 177.A OG GLN 180.A H 3.272 2.424 LEU 181.A N SER 177.A O LEU 181.A H 2.949 2.147 CYS 182.A N VAL 178.A O CYS 182.A H 2.886 2.062 ASN 183.A N ILE 179.A O ASN 183.A H 2.993 2.140 GLY 184.A N GLN 180.A O GLY 184.A H 2.814 2.007 PHE 185.A N LEU 181.A O PHE 185.A H 2.884 2.047 LYS 186.A N CYS 182.A O LYS 186.A H 3.168 2.334 THR 187.A N ASN 183.A O THR 187.A H 3.017 2.195 LEU 188.A N GLY 184.A O LEU 188.A H 2.797 1.958 LEU 189.A N PHE 185.A O LEU 189.A H 2.961 2.141 LYS 190.A N LYS 186.A O LYS 190.A H 2.838 1.990 SER 191.A N THR 187.A O SER 191.A H 2.903 2.104 ASN 192.A N LEU 188.A O no hydrogen 2.976 N/A SER 193.A N LEU 189.A O no hydrogen 2.725 N/A SER 194.A N LYS 190.A O no hydrogen 2.878 N/A SER 194.A OG LYS 190.A O no hydrogen 2.922 N/A SER 194.A OG SER 191.A O no hydrogen 3.074 N/A LYS 195.A N SER 191.A O no hydrogen 2.972 N/A ASN 196.A N ASN 192.A O no hydrogen 2.962 N/A ARG 197.A N SER 193.A O no hydrogen 3.194 N/A MET 198.A N LYS 195.A O no hydrogen 3.020 N/A TYR 201.A N ASN 199.A OD1 no hydrogen 2.763 N/A