Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5vp9_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 4.A N MET 1.A O MET 4.A H 3.144 2.291 SER 9.A N SER 38.A O SER 9.A H 2.850 2.019 VAL 10.A N THR 81.A O VAL 10.A H 2.784 2.004 VAL 11.A N SER 55.A O VAL 11.A H 2.917 2.105 VAL 13.A N ILE 53.A O VAL 13.A H 2.735 1.897 ARG 15.A N GLN 26.A O ARG 15.A H 2.832 2.054 ARG 15.A NE GLU 48.A O ARG 15.A HE 3.202 2.522 ARG 15.A NH1 GLN 26.A OE1 ARG 15.A HH11 3.064 2.224 ILE 16.A N VAL 51.A O ILE 16.A H 2.960 2.157 ASN 17.A N TYR 24.A O ASN 17.A H 2.732 1.890 ASN 17.A ND2 GLN 26.A OE1 ASN 17.A HD22 2.971 2.117 SER 19.A N ASN 17.A OD1 SER 19.A H 3.071 2.233 SER 19.A OG ASN 17.A OD1 SER 19.A HG 2.765 1.932 TYR 24.A N ASN 17.A O TYR 24.A H 3.197 2.433 GLN 26.A N ARG 15.A O GLN 26.A H 2.863 2.030 THR 28.A N VAL 13.A O THR 28.A H 2.804 1.974 ARG 29.A N VAL 13.A O ARG 29.A H 3.220 2.474 ARG 29.A NH2 ASP 43.A OD1 ARG 29.A HH21 2.948 2.141 CYS 34.A N GLY 30.A O CYS 34.A H 2.844 2.041 GLN 35.A N GLU 31.A O GLN 35.A H 2.911 2.082 GLU 36.A N GLU 32.A O GLU 36.A H 3.039 2.194 THR 37.A N GLY 33.A O THR 37.A H 2.820 1.982 THR 37.A OG1 GLY 33.A O THR 37.A HG1 2.604 1.830 SER 38.A N CYS 34.A O SER 38.A H 2.816 2.020 SER 38.A OG SER 9.A O SER 38.A HG 2.852 2.019 GLN 39.A N GLN 35.A O GLN 39.A H 3.226 2.465 GLN 39.A N GLU 36.A O GLN 39.A H 3.201 2.617 THR 40.A N GLU 36.A O THR 40.A H 3.061 2.223 GLY 41.A N THR 37.A O GLY 41.A H 2.742 1.994 ARG 42.A N THR 40.A OG1 ARG 42.A H 3.016 2.164 ASP 43.A N SER 84.A O ASP 43.A H 2.859 2.023 LYS 44.A NZ PRO 85.A O LYS 44.A HZ3 3.354 2.788 ASN 45.A N ASP 43.A OD1 ASN 45.A H 2.913 2.078 GLU 50.A N GLU 50.A OE1 GLU 50.A H 2.813 2.187 GLN 52.A N ALA 63.A O GLN 52.A H 2.722 1.890 GLN 52.A NE2 GLU 48.A O GLN 52.A HE22 2.864 2.009 GLN 52.A NE2 GLY 49.A O GLN 52.A HE21 3.252 2.785 ILE 53.A N GLY 14.A O ILE 53.A H 2.855 2.031 VAL 54.A N PHE 61.A O VAL 54.A H 2.814 1.960 SER 55.A N VAL 11.A O SER 55.A H 2.834 2.074 SER 55.A OG THR 60.A OG1 SER 55.A HG 3.170 2.511 THR 56.A N GLN 59.A O THR 56.A H 2.810 2.006 THR 58.A N THR 56.A OG1 THR 58.A H 3.211 2.393 GLN 59.A N THR 56.A OG1 no hydrogen 2.984 N/A THR 60.A OG1 VAL 54.A O THR 60.A HG1 3.081 2.382 THR 60.A OG1 SER 55.A OG THR 60.A HG1 3.170 2.537 PHE 61.A N VAL 54.A O PHE 61.A H 2.890 2.066 LEU 62.A N SER 157.A O LEU 62.A H 2.993 2.153 ALA 63.A N GLN 52.A O ALA 63.A H 2.885 2.111 THR 64.A N TRP 71.A O THR 64.A H 2.919 2.114 THR 64.A OG1 GLY 158.A O THR 64.A HG1 2.724 2.018 SER 65.A N.A GLU 50.A O SER 65.A H.A 2.907 2.081 SER 65.A N.B GLU 50.A O SER 65.A H.B 2.909 2.086 ILE 66.A N VAL 69.A O ILE 66.A H 2.848 2.052 GLY 68.A N SER 111.A OG GLY 68.A H 2.808 1.988 VAL 69.A N ILE 66.A O VAL 69.A H 3.095 2.264 LEU 70.A N TRP 103.A O LEU 70.A H 2.726 1.918 TRP 71.A N THR 64.A O TRP 71.A H 2.804 1.944 TRP 71.A NE1 ILE 66.A O TRP 71.A HE1 3.212 2.440 THR 72.A N VAL 101.A O THR 72.A H 2.961 2.144 THR 72.A OG1 LEU 62.A O THR 72.A HG1 2.681 2.082 TYR 74.A N ASP 99.A O TYR 74.A H 3.091 2.313 HIS 75.A N ASP 99.A OD1 HIS 75.A H 2.738 2.037 HIS 75.A ND1 ASP 99.A OD2 HIS 75.A HD1 2.631 1.801 GLY 76.A N VAL 73.A O GLY 76.A H 3.209 2.457 ALA 77.A N VAL 73.A O ALA 77.A H 3.010 2.163 GLY 78.A N TYR 74.A O GLY 78.A H 2.713 1.898 ARG 80.A N ALA 77.A O ARG 80.A H 3.068 2.220 ARG 80.A NH1 ALA 77.A O ARG 80.A HH11 3.391 2.555 THR 81.A OG1 SER 9.A OG THR 81.A HG1 2.843 2.169 ILE 82.A N VAL 89.A O ILE 82.A H 3.029 2.238 ALA 83.A N VAL 10.A O ALA 83.A H 2.837 2.004 SER 84.A N GLY 41.A O SER 84.A H 3.080 2.290 SER 84.A OG GLY 87.A O SER 84.A HG 2.661 1.846 LYS 86.A N SER 84.A OG LYS 86.A H 3.395 2.608 GLY 87.A N SER 84.A O GLY 87.A H 3.104 2.246 VAL 89.A N ILE 82.A O VAL 89.A H 2.925 2.130 GLN 91.A NE2 GLY 78.A O GLN 91.A HE22 2.777 1.919 GLN 91.A NE2 ARG 80.A O GLN 91.A HE21 3.032 2.307 MET 92.A N GLY 102.A O MET 92.A H 2.805 2.067 TYR 93.A N GLY 102.A O TYR 93.A H 3.123 2.308 THR 94.A OG1 GLN 91.A OE1 THR 94.A HG1 2.633 1.866 ASN 95.A N LEU 100.A O ASN 95.A H 2.732 1.917 LYS 98.A N ASN 95.A O LYS 98.A H 3.106 2.461 LYS 98.A N ASN 95.A OD1 LYS 98.A H 3.095 2.351 LYS 98.A NZ SER 192.A O LYS 98.A HZ3 3.063 2.437 LYS 98.A NZ SER 192.A OG LYS 98.A HZ3 2.934 2.179 LYS 98.A NZ THR 196.A OG1 LYS 98.A HZ2 2.844 1.980 ASP 99.A N VAL 96.A O ASP 99.A H 3.155 2.376 LEU 100.A N ASN 95.A O LEU 100.A H 2.996 2.156 VAL 101.A N THR 72.A O VAL 101.A H 2.899 2.063 GLY 102.A N TYR 93.A O GLY 102.A H 2.921 2.127 TRP 103.A N LEU 70.A O TRP 103.A H 2.961 2.153 TRP 103.A NE1 ARG 80.A O TRP 103.A HE1 3.102 2.330 ALA 105.A N GLY 68.A O ALA 105.A H 2.995 2.172 SER 109.A N PRO 106.A O SER 109.A H 3.085 2.275 SER 109.A OG PRO 106.A O SER 109.A HG 2.563 1.763 ARG 110.A N GLY 49.A O ARG 110.A H 3.044 2.208 LEU 112.A N SER 65.A O.A LEU 112.A H 2.795 1.953 LEU 112.A N SER 65.A O.B LEU 112.A H 2.779 1.940 CYS 115.A N ALA 168.A O CYS 115.A H 2.870 2.068 CYS 115.A SG HIS 167.A ND1 no hydrogen 3.960 N/A CYS 117.A SG HIS 167.A ND1 no hydrogen 3.396 N/A ASP 121.A N SER 119.A OG ASP 121.A H 3.339 2.507 LEU 122.A N VAL 134.A O LEU 122.A H 2.762 1.943 TYR 123.A N LEU 162.A O TYR 123.A H 2.850 2.168 LEU 124.A N ILE 132.A O LEU 124.A H 2.784 1.949 VAL 125.A N PRO 160.A O VAL 125.A H 3.137 2.309 THR 126.A N ASP 130.A O THR 126.A H 2.961 2.142 ARG 127.A N SER 156.A OG ARG 127.A H 2.887 2.075 ARG 127.A NH1 THR 60.A OG1 ARG 127.A HH12 3.272 2.635 ARG 127.A NH1 GLY 155.A O ARG 127.A HH11 3.043 2.203 ARG 127.A NH2 THR 60.A OG1 ARG 127.A HH22 2.980 2.266 HIS 128.A N THR 126.A OG1 HIS 128.A H 3.316 2.601 ALA 129.A N THR 126.A O ALA 129.A H 2.891 2.073 ASP 130.A N THR 126.A OG1 ASP 130.A H 3.056 2.301 ILE 132.A N LEU 124.A O ILE 132.A H 2.774 1.933 VAL 134.A N LEU 122.A O VAL 134.A H 2.855 2.002 ARG 135.A N SER 143.A O ARG 135.A H 2.983 2.211 ARG 135.A NH1 ASP 121.A OD1 ARG 135.A HH11 2.895 2.097 ARG 136.A N SER 120.A O ARG 136.A H 2.772 1.919 ARG 136.A NE GLY 138.A O ARG 136.A HE 2.976 2.180 ARG 136.A NH2 ASP 139.A O ARG 136.A HH21 2.837 2.015 ARG 137.A N ARG 141.A O ARG 137.A H 2.835 1.976 ARG 137.A NE SER 143.A OG ARG 137.A HE 2.994 2.221 GLY 138.A N ARG 141.A O GLY 138.A H 3.253 2.608 GLY 142.A N VAL 185.A O GLY 142.A H 2.943 2.148 SER 143.A N ARG 135.A O SER 143.A H 2.816 2.016 LEU 144.A N LYS 183.A O LEU 144.A H 2.967 2.167 LEU 145.A N PRO 133.A O LEU 145.A H 3.414 2.564 ARG 148.A N ALA 182.A O ARG 148.A H 3.084 2.274 ILE 150.A N GLY 180.A O ILE 150.A H 2.941 2.143 TYR 152.A N PRO 149.A O TYR 152.A H 2.912 2.121 LEU 153.A N ILE 150.A O LEU 153.A H 3.002 2.216 LYS 154.A N ILE 150.A O LYS 154.A H 3.060 2.393 SER 156.A N LEU 153.A O SER 156.A H 3.010 2.257 GLY 158.A N PHE 172.A O GLY 158.A H 2.875 2.049 GLY 159.A N SER 156.A O GLY 159.A H 2.962 2.146 LEU 161.A N GLY 170.A O LEU 161.A H 2.872 2.035 LEU 162.A N TYR 123.A O LEU 162.A H 2.788 1.977 CYS 163.A N HIS 167.A O CYS 163.A H 3.016 2.232 CYS 163.A SG HIS 167.A ND1 no hydrogen 3.271 N/A GLY 166.A N CYS 163.A O GLY 166.A H 2.950 2.096 ALA 168.A N THR 113.A O ALA 168.A H 2.886 2.118 VAL 169.A N LEU 161.A O VAL 169.A H 2.755 1.897 GLY 170.A N LEU 161.A O GLY 170.A H 3.292 2.534 ILE 171.A N ILE 188.A O ILE 171.A H 2.908 2.119 PHE 172.A N GLY 159.A O PHE 172.A H 2.738 1.906 ARG 173.A N ASP 186.A O ARG 173.A H 2.917 2.086 ARG 173.A NE ASP 186.A OD2 ARG 173.A HE 2.462 1.661 ARG 173.A NH1 LYS 98.A O ARG 173.A HH11 2.905 2.162 ARG 173.A NH2 ASP 186.A OD1 ARG 173.A HH21 3.216 2.398 ARG 173.A NH2 ASP 186.A OD2 ARG 173.A HH21 3.057 2.457 ALA 174.A N ASP 186.A O ALA 174.A H 3.135 2.321 VAL 176.A N ALA 184.A O VAL 176.A H 2.977 2.122 THR 178.A N VAL 181.A O THR 178.A H 2.957 2.191 VAL 181.A N THR 178.A O VAL 181.A H 3.114 2.270 ALA 182.A N ARG 148.A O ALA 182.A H 2.587 1.754 LYS 183.A N VAL 176.A O LYS 183.A H 3.135 2.409 VAL 185.A N GLY 142.A O VAL 185.A H 2.707 1.894 ASP 186.A N ALA 174.A O ASP 186.A H 2.795 1.939 PHE 187.A N SER 140.A O PHE 187.A H 2.873 2.067 ILE 188.A N ILE 171.A O ILE 188.A H 2.764 1.938 VAL 190.A N VAL 169.A O VAL 190.A H 2.857 2.057 SER 192.A N PRO 189.A O SER 192.A H 2.854 2.216 LEU 193.A N PRO 189.A O LEU 193.A H 3.282 2.497 GLU 194.A N VAL 190.A O GLU 194.A H 2.810 2.011 THR 195.A N GLU 191.A O THR 195.A H 2.883 2.102 THR 195.A OG1 GLU 191.A O THR 195.A HG1 3.177 2.430 THR 196.A N SER 192.A O THR 196.A H 2.922 2.065 MET 197.A N LEU 193.A O MET 197.A H 2.926 2.162 ARG 198.A N THR 195.A O ARG 198.A H 2.712 1.951