Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5yy8_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ PRO 2.A O LYS 1.A HZ3 2.842 1.964 LYS 1.A NZ SER 3.A OG LYS 1.A HZ1 3.135 2.480 LYS 1.A NZ ASP 42.A OD2 LYS 1.A HZ2 2.548 1.663 SER 3.A N ASP 42.A OD1 SER 3.A H 2.954 2.114 SER 3.A OG ASP 42.A O SER 3.A HG 2.629 2.070 GLN 5.A N GLU 35.A OE1 GLN 5.A H 2.905 2.054 TYR 6.A N GLU 35.A OE2 TYR 6.A H 3.309 2.512 ARG 8.A N LEU 254.A O ARG 8.A H 3.090 2.283 ARG 8.A NE GLU 35.A OE2 ARG 8.A HE 3.288 2.582 ARG 8.A NH1 THR 33.A OG1 ARG 8.A HH12 2.716 1.933 ARG 8.A NH1 GLU 35.A OE2 ARG 8.A HH11 2.838 2.007 ARG 8.A NH2 GLY 23.A O ARG 8.A HH21 2.853 2.031 ARG 8.A NH2 THR 33.A O ARG 8.A HH22 2.926 2.299 SER 9.A N TYR 25.A O SER 9.A H 2.906 2.104 GLY 10.A N ASN 232.A O GLY 10.A H 2.840 2.010 GLY 12.A N ALA 22.A O GLY 12.A H 2.913 2.099 THR 13.A OG1 ILE 20.A O THR 13.A HG1 3.101 2.408 ALA 14.A N ILE 20.A O ALA 14.A H 3.070 2.319 GLY 17.A N GLU 15.A OE2 GLY 17.A H 3.051 2.250 LYS 18.A NZ ASN 16.A O LYS 18.A HZ2 3.034 2.324 LEU 19.A N TYR 37.A O LEU 19.A H 2.976 2.149 ILE 20.A N ALA 14.A O ILE 20.A H 2.830 1.972 ALA 21.A N GLU 35.A O ALA 21.A H 2.796 1.944 ALA 22.A N GLY 12.A O ALA 22.A H 2.856 2.020 GLY 23.A N THR 33.A O GLY 23.A H 3.045 2.185 GLY 24.A N ARG 53.A O GLY 24.A H 2.852 2.044 TYR 25.A N SER 9.A O TYR 25.A H 2.788 1.989 ASN 26.A N GLU 29.A O ASN 26.A H 3.065 2.245 ASN 26.A ND2 ALA 7.A O ASN 26.A HD22 3.228 2.495 GLU 28.A N ASN 26.A OD1 GLU 28.A H 2.882 2.133 GLU 29.A N ASN 26.A OD1 GLU 29.A H 3.125 2.348 CYS 30.A SG SER 69.A O CYS 30.A HG 3.604 2.607 LEU 31.A N GLY 24.A O LEU 31.A H 2.914 2.138 ARG 32.A NH2 ARG 50.A O ARG 32.A HH21 3.529 2.817 GLU 35.A N ALA 21.A O GLU 35.A H 2.839 2.003 CYS 36.A N SER 45.A O CYS 36.A H 2.837 2.136 TYR 37.A N LEU 19.A O TYR 37.A H 2.785 1.962 TYR 37.A OH ASP 42.A OD1 TYR 37.A HH 2.539 1.744 ASN 38.A N HIS 43.A O ASN 38.A H 2.988 2.140 THR 41.A N ASN 38.A O THR 41.A H 3.090 2.313 THR 41.A N ASN 38.A OD1 THR 41.A H 3.158 2.538 ASP 42.A N ASN 38.A O ASP 42.A H 2.792 2.074 HIS 43.A ND1 THR 41.A O HIS 43.A HD1 2.826 1.991 TRP 44.A NE1 SER 3.A O TRP 44.A HE1 2.842 2.069 SER 45.A N CYS 36.A O SER 45.A H 2.802 2.013 LEU 47.A N VAL 34.A O LEU 47.A H 2.992 2.218 ALA 48.A N ASP 86.A OD1 ALA 48.A H 3.024 2.168 ARG 50.A N GLU 80.A OE1 ARG 50.A H 2.816 1.964 ARG 50.A NE TRP 88.A O ARG 50.A HE 3.048 2.614 ARG 53.A N LEU 31.A O ARG 53.A H 3.173 2.362 ARG 53.A NH1 GLY 67.A O ARG 53.A HH11 2.816 2.040 ARG 53.A NH2 CYS 78.A O ARG 53.A HH22 2.845 1.998 ALA 54.A N SER 69.A O ALA 54.A H 2.782 2.000 ARG 55.A N GLY 10.A O ARG 55.A H 2.783 2.014 GLN 57.A NE2 VAL 146.A O GLN 57.A HE22 2.884 2.046 ALA 58.A N TYR 64.A O ALA 58.A H 3.005 2.161 LEU 60.A N GLN 62.A O LEU 60.A H 2.886 2.055 GLN 62.A N LEU 60.A O GLN 62.A H 2.944 2.098 TYR 64.A N ALA 58.A O TYR 64.A H 2.868 2.018 VAL 65.A N GLU 80.A O VAL 65.A H 2.879 2.029 GLY 68.A N ARG 98.A O GLY 68.A H 3.168 2.355 SER 69.A N ALA 54.A O SER 69.A H 2.827 2.041 ASN 70.A N SER 73.A O ASN 70.A H 3.090 2.272 HIS 72.A N ASN 70.A OD1 HIS 72.A H 2.708 1.864 SER 73.A N ASN 70.A OD1 SER 73.A H 2.619 1.782 LEU 76.A N THR 96.A O LEU 76.A H 3.078 2.316 GLY 79.A N VAL 91.A O GLY 79.A H 2.970 2.195 GLU 80.A N VAL 65.A O GLU 80.A H 3.004 2.188 TYR 81.A N LEU 63.A O TYR 81.A H 2.850 2.089 TYR 81.A OH ASP 86.A OD1 TYR 81.A HH 2.406 1.583 ASP 82.A N ASP 87.A O ASP 82.A H 2.866 2.014 ASN 84.A N ASP 82.A OD1 ASN 84.A H 3.219 2.446 ASN 84.A ND2 ASP 82.A OD1 ASN 84.A HD22 3.015 2.171 ASP 87.A N ASP 82.A O ASP 87.A H 3.073 2.310 TRP 88.A N ASP 87.A OD1 TRP 88.A H 2.732 2.044 TRP 88.A NE1 ALA 48.A O TRP 88.A HE1 2.870 2.137 VAL 91.A N GLY 79.A O VAL 91.A H 2.812 1.971 GLU 93.A N GLU 93.A OE1 GLU 93.A H 2.695 1.913 LEU 94.A N VAL 91.A O LEU 94.A H 2.958 2.120 ARG 95.A N PRO 92.A O ARG 95.A H 3.099 2.255 THR 96.A N LEU 76.A O THR 96.A H 3.393 2.598 ARG 98.A NE GLY 114.A O ARG 98.A HE 2.593 1.860 ARG 98.A NH1 ASP 122.A OD2 ARG 98.A HH12 3.179 2.365 ARG 98.A NH2 GLY 114.A O ARG 98.A HH21 2.562 1.828 ARG 98.A NH2 ASN 120.A O ARG 98.A HH22 3.047 2.505 ASN 100.A N ARG 55.A O ASN 100.A H 3.077 2.239 ASN 100.A ND2 SER 116.A OG ASN 100.A HD22 3.079 2.265 GLY 102.A N VAL 113.A O GLY 102.A H 2.887 2.126 VAL 103.A N GLN 57.A OE1 VAL 103.A H 3.053 2.250 CYS 104.A N TYR 111.A O CYS 104.A H 2.967 2.205 CYS 104.A SG ALA 105.A O CYS 104.A HG 3.683 2.491 LEU 106.A N LYS 109.A O LEU 106.A H 2.886 2.097 LYS 109.A N LEU 106.A O LYS 109.A H 2.913 2.070 LEU 110.A N PHE 124.A O LEU 110.A H 2.941 2.091 TYR 111.A N CYS 104.A O TYR 111.A H 2.847 1.988 ILE 112.A N ASP 122.A O ILE 112.A H 2.896 2.071 VAL 113.A N GLY 102.A O VAL 113.A H 2.873 2.080 GLY 114.A N ASN 120.A O GLY 114.A H 2.969 2.176 GLY 115.A N ARG 141.A O GLY 115.A H 2.946 2.159 SER 116.A N CYS 99.A O SER 116.A H 2.792 1.953 GLY 117.A N GLU 160.A O GLY 117.A H 3.030 2.235 LEU 118.A N ARG 141.A O LEU 118.A H 3.340 2.503 ASP 122.A N ILE 112.A O ASP 122.A H 2.934 2.118 VAL 123.A N THR 132.A O VAL 123.A H 2.836 2.014 PHE 124.A N LEU 110.A O PHE 124.A H 2.785 1.950 ASP 125.A N LEU 130.A O ASP 125.A H 2.999 2.175 VAL 127.A N ASP 125.A OD1 VAL 127.A H 2.740 1.929 LYS 129.A N ASP 125.A O LYS 129.A H 2.586 1.877 LEU 130.A N THR 128.A OG1 LEU 130.A H 3.238 2.522 TRP 131.A NE1 GLU 93.A O TRP 131.A HE1 2.729 1.900 THR 132.A N VAL 123.A O THR 132.A H 2.849 2.060 CYS 134.A N CYS 121.A O CYS 134.A H 2.888 2.057 ALA 135.A N ASN 176.A OD1 ALA 135.A H 2.985 2.131 LEU 137.A N LYS 119.A O LEU 137.A H 2.701 1.875 ASN 138.A N GLU 169.A OE1 ASN 138.A H 2.789 1.949 ASN 138.A ND2 GLU 169.A OE1 ASN 138.A HD22 2.838 2.069 ASN 138.A ND2 TRP 178.A O ASN 138.A HD21 2.981 2.157 ILE 139.A N GLU 169.A OE2 ILE 139.A H 3.088 2.354 ARG 141.A N LEU 118.A O ARG 141.A H 3.178 2.369 ARG 141.A NE GLU 169.A OE2 ARG 141.A HE 3.025 2.216 ARG 141.A NH1 GLY 157.A O ARG 141.A HH11 2.916 2.141 ARG 141.A NH1 THR 167.A O ARG 141.A HH12 2.790 2.091 ARG 141.A NH2 THR 167.A OG1 ARG 141.A HH22 2.692 1.973 ARG 141.A NH2 GLU 169.A OE2 ARG 141.A HH21 3.168 2.420 HIS 142.A N ALA 159.A O HIS 142.A H 3.083 2.322 GLN 143.A N ASN 100.A O GLN 143.A H 2.849 2.004 GLN 143.A NE2 ASN 232.A OD1 GLN 143.A HE21 3.243 2.569 SER 144.A OG GLY 157.A O SER 144.A HG 2.835 2.103 ALA 145.A N ILE 156.A O ALA 145.A H 3.004 2.193 CYS 147.A N TYR 154.A O CYS 147.A H 2.985 2.229 LEU 149.A N TYR 152.A O LEU 149.A H 2.946 2.121 GLY 151.A N GLU 148.A OE2 GLY 151.A H 2.956 2.111 TYR 152.A N LEU 149.A O TYR 152.A H 2.980 2.142 LEU 153.A N TYR 171.A O LEU 153.A H 3.083 2.311 TYR 154.A N CYS 147.A O TYR 154.A H 2.854 2.042 ILE 155.A N GLU 169.A O ILE 155.A H 2.917 2.085 ILE 156.A N ALA 145.A O ILE 156.A H 2.794 2.169 GLY 157.A N THR 167.A O GLY 157.A H 2.971 2.164 GLY 158.A N ARG 187.A O GLY 158.A H 2.924 2.067 ALA 159.A N HIS 142.A O ALA 159.A H 2.822 2.010 GLU 160.A N ASN 163.A O GLU 160.A H 3.017 2.242 SER 161.A N ASN 163.A OD1 SER 161.A H 2.852 1.994 ASN 163.A ND2 GLU 160.A OE1 ASN 163.A HD21 3.448 2.606 CYS 164.A SG PHE 205.A O CYS 164.A HG 3.452 2.551 LEU 165.A N GLY 158.A O LEU 165.A H 2.854 2.041 GLU 169.A N ILE 155.A O GLU 169.A H 2.956 2.133 ARG 170.A N THR 179.A O ARG 170.A H 2.854 2.033 TYR 171.A N LEU 153.A O TYR 171.A H 2.851 2.046 TYR 171.A OH ASN 176.A OD1 TYR 171.A HH 2.691 1.857 ASN 172.A N THR 177.A O ASN 172.A H 2.871 2.047 GLU 174.A N ASN 172.A OD1 GLU 174.A H 2.869 2.081 THR 177.A N ASN 172.A O THR 177.A H 3.077 2.328 THR 177.A OG1 ASN 175.A OD1 THR 177.A HG1 2.624 1.854 THR 179.A N ARG 170.A O THR 179.A H 2.881 2.082 ILE 181.A N VAL 168.A O ILE 181.A H 2.978 2.154 ALA 182.A N ASN 221.A OD1 ALA 182.A H 3.371 2.523 ASN 184.A N GLU 215.A OE1 ASN 184.A H 2.629 1.799 ASN 184.A ND2 GLU 215.A OE1 ASN 184.A HD22 2.848 2.179 VAL 185.A N GLU 215.A OE2 VAL 185.A H 2.818 2.020 ARG 187.A N LEU 165.A O ARG 187.A H 2.996 2.230 ARG 187.A NE VAL 185.A O ARG 187.A HE 3.361 2.601 ARG 187.A NH1 GLY 203.A O ARG 187.A HH11 2.968 2.187 ARG 187.A NH1 CYS 213.A O ARG 187.A HH12 2.908 2.085 ARG 187.A NH2 GLU 215.A OE2 ARG 187.A HH21 2.702 1.893 ARG 188.A N PHE 205.A O ARG 188.A H 2.777 1.948 GLY 189.A N GLN 143.A O GLY 189.A H 2.929 2.088 GLY 191.A N CYS 202.A O GLY 191.A H 3.025 2.173 ALA 193.A N PHE 200.A O ALA 193.A H 2.929 2.123 LEU 195.A N LYS 198.A O LEU 195.A H 2.901 2.062 LYS 198.A N LEU 195.A O LYS 198.A H 2.925 2.147 LEU 199.A N TYR 216.A O LEU 199.A H 3.020 2.193 PHE 200.A N ALA 193.A O PHE 200.A H 2.872 2.014 VAL 201.A N GLU 215.A O VAL 201.A H 2.852 2.005 CYS 202.A N GLY 191.A O CYS 202.A H 2.829 2.007 GLY 203.A N CYS 213.A O GLY 203.A H 2.843 1.985 GLY 204.A N ARG 230.A O GLY 204.A H 2.827 1.970 PHE 205.A N ARG 188.A O PHE 205.A H 2.658 1.926 ASP 206.A N HIS 209.A O ASP 206.A H 3.160 2.369 SER 208.A N ASP 206.A OD1 SER 208.A H 2.741 1.914 SER 208.A OG HIS 209.A ND1 SER 208.A HG 3.009 2.239 HIS 209.A N ASP 206.A OD1 HIS 209.A H 2.768 1.973 ILE 211.A N GLY 204.A O ILE 211.A H 2.949 2.157 GLU 215.A N VAL 201.A O GLU 215.A H 2.914 2.100 TYR 216.A N LEU 199.A O TYR 216.A H 2.815 2.002 TYR 216.A OH ASN 221.A OD1 TYR 216.A HH 2.594 1.764 ASP 217.A N GLU 222.A O ASP 217.A H 3.032 2.195 THR 219.A N ASP 217.A OD1 THR 219.A H 2.923 2.158 THR 219.A OG1 ASP 217.A OD1 THR 219.A HG1 2.763 1.928 ARG 220.A N ASP 217.A O ARG 220.A H 3.076 2.284 ARG 220.A NE GLU 222.A OE2 ARG 220.A HE 2.774 1.923 TRP 223.A NE1 ALA 182.A O TRP 223.A HE1 2.886 2.118 GLY 225.A N ASN 265.A OD1 GLY 225.A H 3.027 2.174 ASN 226.A ND2 SER 212.A OG ASN 226.A HD22 3.045 2.409 THR 227.A N GLU 258.A OE1 THR 227.A H 2.725 1.891 THR 227.A OG1 GLU 258.A OE1 THR 227.A HG1 2.764 1.928 SER 228.A N GLU 258.A OE2 SER 228.A H 3.283 2.577 ARG 230.A N ILE 211.A O ARG 230.A H 3.077 2.253 ARG 230.A NE GLU 258.A OE2 ARG 230.A HE 2.764 1.970 ARG 230.A NH1 GLY 246.A O ARG 230.A HH11 3.064 2.233 ARG 230.A NH1 THR 256.A O ARG 230.A HH12 3.155 2.532 ARG 230.A NH1 THR 256.A OG1 ARG 230.A HH12 2.995 2.289 ARG 230.A NH2 THR 256.A OG1 ARG 230.A HH22 2.997 2.291 ARG 230.A NH2 GLU 258.A OE2 ARG 230.A HH21 2.869 2.130 SER 231.A N PHE 248.A O SER 231.A H 2.828 1.973 ASN 232.A N GLY 189.A O ASN 232.A H 3.006 2.191 GLY 234.A N VAL 245.A O GLY 234.A H 2.855 1.996 ALA 236.A N TYR 243.A O ALA 236.A H 3.030 2.221 THR 237.A OG1 VAL 194.A O THR 237.A HG1 2.718 1.895 VAL 238.A N THR 241.A O VAL 238.A H 2.822 1.977 ASN 240.A ND2 ASN 196.A OD1 ASN 240.A HD21 3.053 2.233 THR 241.A N VAL 238.A O THR 241.A H 2.947 2.207 TYR 243.A N ALA 236.A O TYR 243.A H 2.876 2.033 ALA 244.A N GLU 258.A O ALA 244.A H 2.974 2.144 VAL 245.A N GLY 234.A O VAL 245.A H 2.859 2.068 GLY 246.A N THR 256.A O GLY 246.A H 2.912 2.081 GLY 247.A N ARG 8.A O GLY 247.A H 2.667 1.819 PHE 248.A N SER 231.A O PHE 248.A H 2.833 2.149 ASP 249.A N GLU 252.A O ASP 249.A H 3.138 2.316 ASN 251.A N ASP 249.A OD1 ASN 251.A H 2.809 1.969 GLU 252.A N ASP 249.A OD1 GLU 252.A H 2.690 1.848 LEU 254.A N GLY 247.A O LEU 254.A H 2.785 1.961 GLU 258.A N ALA 244.A O GLU 258.A H 2.884 2.073 VAL 259.A N SER 268.A O VAL 259.A H 2.946 2.120 TYR 260.A N ILE 242.A O TYR 260.A H 2.928 2.105 TYR 260.A OH ASN 265.A OD1 TYR 260.A HH 2.599 1.789 ASN 261.A N GLU 266.A O ASN 261.A H 2.860 2.021 SER 264.A N ASN 261.A OD1 SER 264.A H 3.076 2.258 GLU 266.A N ASN 261.A O GLU 266.A H 3.084 2.325 SER 268.A N VAL 259.A O SER 268.A H 2.913 2.131 TYR 270.A N SER 268.A OG TYR 270.A H 3.059 2.202 THR 271.A N LYS 1.A O THR 271.A H 2.970 2.172