Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6dq1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 1.A N GLU 3.A OE2 no hydrogen 3.478 N/A GLY 1.A N LYS 79.A O no hydrogen 3.017 N/A GLY 1.A N MET 82.A O no hydrogen 3.219 N/A LEU 4.A N GLY 1.A O LEU 4.A H 3.297 2.518 PHE 5.A N GLU 2.A O PHE 5.A H 2.931 2.082 VAL 9.A N GLY 32.A O VAL 9.A H 2.878 2.057 ILE 11.A N GLY 30.A O ILE 11.A H 2.869 2.048 LEU 12.A N LEU 113.A O LEU 12.A H 2.931 2.120 VAL 13.A N GLY 28.A O VAL 13.A H 2.945 2.112 GLU 14.A N ASN 115.A O GLU 14.A H 2.939 2.111 LEU 15.A N VAL 26.A O LEU 15.A H 2.854 2.040 ASP 16.A N.A ILE 117.A O ASP 16.A H.A 3.060 2.223 ASP 16.A N.B ILE 117.A O ASP 16.A H.B 3.052 2.226 GLY 17.A N PHE 24.A O GLY 17.A H.A 2.845 2.021 ASP 18.A N LEU 119.A O ASP 18.A H 2.989 2.264 VAL 19.A N HIS 22.A O VAL 19.A H 2.979 2.173 ASN 20.A N GLY 121.A O ASN 20.A H 2.886 2.043 ASN 20.A ND2 PHE 124.A O ASN 20.A HD21 2.981 2.236 GLY 21.A N ASP 18.A OD1 GLY 21.A H 2.882 2.140 HIS 22.A N VAL 19.A O HIS 22.A H 2.928 2.098 LYS 23.A NZ GLY 21.A O LYS 23.A HZ2 3.244 2.590 PHE 24.A N GLY 17.A O PHE 24.A H 2.998 2.185 SER 25.A N THR 47.A OG1 SER 25.A H 3.082 2.282 SER 25.A OG ASP 16.A OD1.A SER 25.A HG 2.861 2.121 VAL 26.A N LEU 15.A O VAL 26.A H 2.905 2.084 ARG 27.A N ILE 44.A O ARG 27.A H 2.954 2.138 GLY 28.A N VAL 13.A O GLY 28.A H 2.779 1.949 GLU 29.A N LYS 42.A O GLU 29.A H 3.039 2.245 GLY 30.A N ILE 11.A O GLY 30.A H 3.204 2.452 GLU 31.A N THR 40.A O GLU 31.A H 2.933 2.139 GLY 32.A N VAL 9.A O GLY 32.A H 2.884 2.079 ASP 33.A N LYS 38.A O ASP 33.A H 2.783 1.940 ASN 36.A N ASP 33.A O ASN 36.A H.A 3.089 2.391 ASN 36.A ND2 ASP 33.A OD2 ASN 36.A HD22 2.904 2.084 GLY 37.A N ALA 34.A O GLY 37.A H 3.121 2.382 LYS 38.A N ASP 33.A O LYS 38.A H 2.977 2.136 LEU 39.A N GLU 215.A O LEU 39.A H 2.814 1.976 THR 40.A N GLU 31.A O THR 40.A H 3.038 2.189 LEU 41.A N LEU 213.A O LEU 41.A H 2.981 2.141 LYS 42.A N GLU 29.A O LYS 42.A H 2.971 2.129 LYS 42.A NZ ASP 203.A OD2 LYS 42.A HZ2 2.916 2.083 LYS 42.A NZ GLU 206.A OE2 LYS 42.A HZ1 2.787 1.929 PHE 43.A N MET 211.A O PHE 43.A H 2.836 2.012 ILE 44.A N ARG 27.A O ILE 44.A H 2.821 1.997 CYS 45.A N ASP 209.A O CYS 45.A H 2.941 2.103 THR 46.A N SER 25.A O THR 46.A H 3.012 2.320 LEU 50.A N ASP 209.A OD2 LEU 50.A H 2.883 2.027 TRP 54.A NE1 ASP 209.A OD1 TRP 54.A HE1 2.888 2.032 THR 56.A N PRO 53.A O THR 56.A H 2.996 2.254 THR 56.A OG1 PRO 53.A O THR 56.A HG1 2.773 1.949 LEU 57.A N TRP 54.A O LEU 57.A H 2.934 2.083 VAL 58.A N PRO 55.A O VAL 58.A H 3.314 2.461 LEU 61.A N LEU 57.A O LEU 61.A H 2.942 2.095 PHE 65.A N VAL 62.A O PHE 65.A H 3.005 2.167 SER 66.A N GLN 63.A O SER 66.A H 3.152 2.302 SER 66.A OG GLN 63.A O SER 66.A HG 2.831 2.161 ARG 67.A N VAL 217.A O ARG 67.A H 2.955 2.102 ARG 67.A NH1 THR 35.A O.A ARG 67.A HH11 3.512 2.699 ARG 67.A NH1 THR 35.A O.B ARG 67.A HH11 3.502 2.692 HIS 71.A NE2 ILE 222.A O HIS 71.A HE2 2.840 2.019 MET 72.A N PRO 69.A O MET 72.A H 2.764 1.942 LYS 73.A N ASP 70.A O LYS 73.A H 3.286 2.428 LYS 73.A NZ TYR 68.A O LYS 73.A HZ3 3.140 2.301 HIS 75.A N MET 72.A O HIS 75.A H 2.864 2.019 ASP 76.A N LYS 73.A O ASP 76.A H 3.220 2.423 LYS 79.A N ASP 76.A OD1 LYS 79.A H 3.138 2.290 LYS 79.A NZ CYS 64.A O LYS 79.A HZ2 2.896 2.218 LYS 79.A NZ SER 66.A O LYS 79.A HZ1 2.801 1.985 LYS 79.A NZ ASP 76.A OD2 LYS 79.A HZ3 2.819 2.000 SER 80.A N ASP 76.A O SER 80.A H 3.294 2.507 SER 80.A OG PHE 77.A O SER 80.A HG 2.774 1.938 ALA 81.A N PHE 77.A O ALA 81.A H 3.142 2.467 MET 82.A N LYS 79.A O MET 82.A H 3.122 2.289 GLU 84.A N.A GLU 84.A OE2.A GLU 84.A H.A 2.826 2.051 GLY 85.A N ALA 81.A O GLY 85.A H 2.716 1.894 TYR 86.A N VAL 106.A O TYR 86.A H 2.991 2.224 VAL 87.A N THR 179.A O VAL 87.A H 2.801 1.965 GLN 88.A N ALA 104.A O GLN 88.A H 2.841 2.029 GLU 89.A N GLN 177.A O GLU 89.A H 2.876 2.023 ARG 90.A N THR 102.A O ARG 90.A H 3.014 2.224 ARG 90.A NE GLN 176.A OE1 ARG 90.A HE 2.874 2.163 ARG 90.A NH1 THR 59.A O ARG 90.A HH12 2.878 2.095 ARG 90.A NH2 GLN 176.A OE1 ARG 90.A HH21 2.855 2.165 THR 91.A N TYR 175.A O THR 91.A H 2.970 2.202 ILE 92.A N TYR 100.A O ILE 92.A H 2.820 1.976 SER 93.A N ASP 173.A O.A SER 93.A H 2.838 2.016 SER 93.A N ASP 173.A O.B SER 93.A H 2.827 2.008 PHE 94.A N GLY 98.A O PHE 94.A H 3.028 2.206 LYS 95.A N LEU 171.A O LYS 95.A H 3.045 2.222 ASP 97.A N PHE 94.A O ASP 97.A H 2.895 2.171 GLY 98.A N ASP 97.A OD1 GLY 98.A H 2.882 2.284 THR 99.A N ILE 122.A O THR 99.A H 3.014 2.209 TYR 100.A N ILE 92.A O TYR 100.A H 2.847 2.066 TYR 100.A OH THR 56.A OG1 TYR 100.A HH 2.852 2.087 LYS 101.A N LYS 120.A O LYS 101.A H 2.787 1.947 THR 102.A N ARG 90.A O THR 102.A H 2.947 2.118 ARG 103.A N GLU 118.A O.A ARG 103.A H 2.990 2.165 ARG 103.A N GLU 118.A O.B ARG 103.A H 2.990 2.165 ARG 103.A NH1 GLU 105.A OE2 ARG 103.A HH12 3.005 2.227 ARG 103.A NH2 GLU 105.A OE2 ARG 103.A HH22 3.105 2.361 ALA 104.A N GLN 88.A O ALA 104.A H 2.831 2.066 GLU 105.A N ARG 116.A O GLU 105.A H 2.933 2.146 VAL 106.A N TYR 86.A O VAL 106.A H 2.890 2.043 LYS 107.A N VAL 114.A O LYS 107.A H 3.041 2.245 LYS 107.A NZ GLU 105.A OE1 LYS 107.A HZ1 2.615 1.730 PHE 108.A N PRO 83.A O PHE 108.A H 3.232 2.387 GLU 109.A N THR 112.A O GLU 109.A H 2.784 1.970 THR 112.A N GLU 109.A O THR 112.A H 3.142 2.297 LEU 113.A N PRO 10.A O LEU 113.A H 2.881 2.075 VAL 114.A N LYS 107.A O VAL 114.A H 2.877 2.028 ASN 115.A N LEU 12.A O ASN 115.A H 2.977 2.164 ASN 115.A ND2 THR 60.A O ASN 115.A HD21 3.387 2.604 ASN 115.A ND2 LEU 61.A O ASN 115.A HD22 2.978 2.286 ARG 116.A N GLU 105.A O ARG 116.A H 2.986 2.140 ARG 116.A NE GLU 14.A OE2 ARG 116.A HE 2.867 2.083 ARG 116.A NH2 GLU 14.A OE2 ARG 116.A HH21 2.926 2.174 ILE 117.A N GLU 14.A O ILE 117.A H 2.810 2.024 GLU 118.A N.A ARG 103.A O GLU 118.A H.A 2.877 2.034 GLU 118.A N.B ARG 103.A O GLU 118.A H.B 2.874 2.028 LEU 119.A N ASP 16.A O.A LEU 119.A H 2.912 2.131 LEU 119.A N ASP 16.A O.B LEU 119.A H 2.884 2.091 LYS 120.A N LYS 101.A O LYS 120.A H 2.841 1.995 GLY 121.A N ASP 18.A O GLY 121.A H 2.665 1.818 ILE 122.A N THR 99.A O ILE 122.A H 3.047 2.256 PHE 124.A N ASN 20.A OD1 PHE 124.A H 3.102 2.268 LYS 125.A N ASP 97.A OD1 LYS 125.A H 2.833 2.029 LYS 125.A NZ ASP 96.A O LYS 125.A HZ2 2.894 2.153 GLY 128.A N LYS 125.A O GLY 128.A H 2.943 2.100 ASN 129.A ND2 GLN 170.A OE1 ASN 129.A HD22 2.973 2.169 GLY 132.A N GLY 128.A O GLY 132.A H 2.941 2.224 HIS 133.A N ILE 130.A O HIS 133.A H 2.961 2.121 LYS 134.A N ASN 129.A O LYS 134.A H 3.025 2.171 LYS 134.A NZ ASP 127.A OD2 LYS 134.A HZ3 3.251 2.367 GLU 136.A N ASN 163.A O GLU 136.A H 2.972 2.177 TYR 137.A OH SER 201.A O TYR 137.A HH 2.700 1.882 ASN 138.A N GLU 136.A O ASN 138.A H 3.016 2.375 ASN 138.A ND2 GLU 136.A OE1 ASN 138.A HD21 2.911 2.065 ASN 140.A ND2 ARG 161.A O ASN 140.A HD22 2.843 2.032 ASN 140.A ND2 ASN 163.A OD1 ASN 140.A HD21 3.093 2.239 HIS 142.A N THR 196.A O HIS 142.A H 3.137 2.421 HIS 142.A N THR 196.A OG1 HIS 142.A H 3.198 2.447 VAL 143.A N LEU 194.A O VAL 143.A H 2.815 1.986 TYR 144.A N ASN 157.A O.A TYR 144.A H 3.067 2.218 TYR 144.A N ASN 157.A O.B TYR 144.A H 3.095 2.248 ILE 145.A N HIS 192.A O ILE 145.A H 2.865 2.007 THR 146.A N LYS 155.A O THR 146.A H 2.920 2.085 THR 146.A OG1 ASN 191.A OD1 THR 146.A HG1 2.796 1.975 ASP 148.A N GLY 153.A O ASP 148.A H 2.816 1.962 LYS 151.A NZ THR 179.A OG1 no hydrogen 3.030 N/A ASN 152.A N LYS 149.A O ASN 152.A H 2.918 2.110 GLY 153.A N ASP 148.A O GLY 153.A H 3.030 2.193 ILE 154.A N ASN 178.A O ILE 154.A H 3.097 2.324 LYS 155.A N THR 146.A O LYS 155.A H 2.880 2.051 ALA 156.A N GLN 176.A O ALA 156.A H 2.920 2.119 ASN 157.A N.A TYR 144.A O ASN 157.A H.A 3.006 2.253 ASN 157.A N.B TYR 144.A O ASN 157.A H.B 3.013 2.267 PHE 158.A N HIS 174.A O PHE 158.A H 3.223 2.431 LYS 159.A NZ ASP 173.A OD1.A LYS 159.A HZ3 2.660 1.794 LYS 159.A NZ ASP 173.A OD2.B LYS 159.A HZ3 2.582 1.730 ILE 160.A N ALA 172.A O ILE 160.A H 2.972 2.132 ARG 161.A N HIS 142.A NE2 ARG 161.A H 3.070 2.222 ARG 161.A NH2 SER 141.A O ARG 161.A HH22 2.832 2.198 HIS 162.A N GLN 170.A O HIS 162.A H 2.857 2.001 ASN 163.A ND2 GLU 136.A OE1 ASN 163.A HD22 3.277 2.470 VAL 164.A N SER 168.A O VAL 164.A H 2.945 2.104 GLU 165.A N LYS 134.A O GLU 165.A H 2.886 2.072 GLY 167.A N VAL 164.A O GLY 167.A H 2.951 2.122 SER 168.A N ASP 166.A OD1 SER 168.A H 2.996 2.141 SER 168.A OG ASP 166.A OD1 SER 168.A HG 2.707 1.869 GLN 170.A N HIS 162.A O GLN 170.A H 2.804 1.947 GLN 170.A NE2 LYS 95.A O GLN 170.A HE22 2.947 2.090 GLN 170.A NE2 LEU 171.A O GLN 170.A HE21 3.102 2.251 ALA 172.A N ILE 160.A O ALA 172.A H 2.824 2.018 ASP 173.A N.A SER 93.A O ASP 173.A H.A 2.863 2.060 ASP 173.A N.B SER 93.A O ASP 173.A H.B 2.860 2.059 HIS 174.A N PHE 158.A O HIS 174.A H 2.829 1.980 HIS 174.A ND1 ALA 172.A O HIS 174.A HD1 2.920 2.131 HIS 174.A NE2 THR 59.A OG1 no hydrogen 2.725 N/A TYR 175.A N THR 91.A O TYR 175.A H 2.967 2.117 GLN 176.A N ALA 156.A O GLN 176.A H 2.937 2.190 GLN 176.A NE2 GLN 63.A OE1 GLN 176.A HE22 2.848 2.005 GLN 176.A NE2 ASN 178.A OD1 GLN 176.A HE21 2.876 2.032 GLN 177.A N GLU 89.A O GLN 177.A H 2.903 2.083 ASN 178.A N ILE 154.A O ASN 178.A H 2.895 2.050 ASN 178.A ND2 GLN 88.A OE1 ASN 178.A HD21 2.924 2.090 THR 179.A N VAL 87.A O THR 179.A H 2.941 2.141 ILE 181.A N GLY 85.A O ILE 181.A H 2.943 2.085 LEU 187.A N SER 80.A OG LEU 187.A H 3.044 2.195 ASP 190.A N HIS 75.A ND1 ASP 190.A H 2.957 2.139 HIS 192.A N ILE 145.A O HIS 192.A H 3.206 2.406 HIS 192.A ND1 ASP 190.A O HIS 192.A HD1 2.838 1.986 HIS 192.A NE2 TYR 68.A OH no hydrogen 2.689 N/A TYR 193.A N ALA 220.A O TYR 193.A H 2.988 2.132 LEU 194.A N VAL 143.A O LEU 194.A H 2.835 2.045 SER 195.A N THR 218.A O SER 195.A H 2.766 1.935 THR 196.A N HIS 142.A O THR 196.A H 2.964 2.127 THR 196.A OG1 HIS 142.A O THR 196.A HG1 3.175 2.336 GLN 197.A N.A PHE 216.A O GLN 197.A H.A 2.948 2.228 GLN 197.A N.B PHE 216.A O GLN 197.A H.B 2.964 2.268 VAL 199.A N LEU 214.A O VAL 199.A H 2.805 1.978 SER 201.A N VAL 212.A O SER 201.A H 2.882 2.073 LYS 202.A NZ HIS 210.A O LYS 202.A HZ3 2.729 2.148 ASP 203.A N HIS 210.A NE2 ASP 203.A H 2.847 2.007 ASN 205.A N ASP 203.A OD1 ASN 205.A H 2.866 2.039 GLU 206.A N ASP 203.A O GLU 206.A H 3.082 2.253 ARG 208.A N GLU 206.A OE1 ARG 208.A H 2.977 2.138 ARG 208.A NE GLU 206.A OE1 ARG 208.A HE 2.589 1.761 ARG 208.A NH1 GLU 206.A OE1 ARG 208.A HH11 3.378 2.794 ARG 208.A NH1 GLU 206.A OE2 ARG 208.A HH11 2.827 2.062 HIS 210.A ND1 ARG 208.A O HIS 210.A HD1 2.848 2.035 MET 211.A N PHE 43.A O MET 211.A H 2.874 2.085 VAL 212.A N SER 201.A O VAL 212.A H 3.000 2.169 LEU 213.A N LEU 41.A O LEU 213.A H 2.813 1.986 LEU 214.A N VAL 199.A O LEU 214.A H 2.981 2.134 GLU 215.A N LEU 39.A O GLU 215.A H 2.989 2.173 PHE 216.A N GLN 197.A O.A PHE 216.A H 2.902 2.059 PHE 216.A N GLN 197.A O.B PHE 216.A H 2.865 2.021 VAL 217.A N GLY 37.A O VAL 217.A H 2.943 2.159 THR 218.A N SER 195.A O THR 218.A H 3.029 2.229 ALA 219.A N ARG 67.A O ALA 219.A H 2.856 2.074 ALA 220.A N TYR 193.A O ALA 220.A H 2.877 2.047 MET 226.A N THR 223.A O MET 226.A H 3.024 2.170 LEU 229.A N MET 226.A O LEU 229.A H 3.041 2.193 TYR 230.A N ASP 227.A O TYR 230.A H 3.110 2.276 LYS 231.A NZ ASP 227.A O no hydrogen 3.377 N/A LYS 231.A NZ GLU 228.A O no hydrogen 3.375 N/A