Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6dq2_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 5.A N PHE 1.A O ALA 5.A H 3.015 2.301 ALA 5.A N GLU 2.A O ALA 5.A H 3.171 2.547 LYS 6.A N ALA 3.A O LYS 6.A H 3.215 2.363 PHE 11.A N TYR 19.A O PHE 11.A H 3.309 2.552 ILE 13.A N VAL 17.A O ILE 13.A H 2.847 2.119 TRP 14.A N VAL 17.A O TRP 14.A H 3.309 2.512 TRP 14.A NE1 ASP 160.A OD2 TRP 14.A HE1 2.863 2.037 VAL 17.A N TRP 14.A O VAL 17.A H 2.718 1.875 TRP 18.A N LEU 29.A O TRP 18.A H 2.866 2.086 TYR 19.A N PHE 11.A O TYR 19.A H 2.945 2.136 TYR 19.A OH THR 22.A O TYR 19.A HH 2.486 1.666 VAL 20.A N SER 27.A O VAL 20.A H 2.832 1.972 THR 22.A N LEU 25.A O THR 22.A H 2.849 2.020 THR 22.A OG1 TRP 4.A O THR 22.A HG1 2.587 2.066 GLU 23.A N LYS 6.A O GLU 23.A H 2.915 2.188 ASN 24.A N TRP 4.A O ASN 24.A H 3.012 2.183 LEU 25.A N THR 22.A OG1 LEU 25.A H 3.101 2.331 SER 26.A N ASN 208.A O SER 26.A H 3.152 2.300 SER 26.A OG ALA 207.A O SER 26.A HG 2.597 1.813 SER 27.A OG ASP 40.A O SER 27.A HG 2.816 2.000 VAL 28.A N ILE 39.A O VAL 28.A H 3.213 2.420 LEU 29.A N TRP 18.A O LEU 29.A H 2.805 1.986 LEU 30.A N ILE 37.A O LEU 30.A H 2.653 1.800 THR 31.A N GLY 16.A O THR 31.A H 3.057 2.252 THR 32.A OG1 GLY 35.A O THR 32.A HG1 2.690 1.859 GLN 34.A N THR 32.A OG1 GLN 34.A H 3.048 2.242 GLY 35.A N THR 32.A O GLY 35.A H 3.282 2.440 HIS 36.A N ASP 63.A O HIS 36.A H 2.969 2.200 ILE 37.A N LEU 30.A O ILE 37.A H 2.756 1.945 LEU 38.A N TYR 66.A O LEU 38.A H 2.956 2.119 ILE 39.A N VAL 28.A O ILE 39.A H 2.890 2.074 ASP 40.A N ALA 68.A O ASP 40.A H 2.690 1.865 ALA 41.A N GLN 76.A O ALA 41.A H 2.888 2.128 SER 46.A N LEU 43.A O SER 46.A H 2.985 2.214 ALA 47.A N ASP 44.A O ALA 47.A H 3.301 2.510 GLN 49.A NE2 ASN 53.A OD1 GLN 49.A HE21 2.706 2.007 ILE 50.A N SER 46.A O ILE 50.A H 2.906 2.091 ARG 51.A N ALA 47.A O ARG 51.A H 2.872 2.036 ARG 52.A N PRO 48.A O ARG 52.A H 2.928 2.083 ARG 52.A NH2 GLN 49.A OE1 ARG 52.A HH21 2.801 1.992 ASN 53.A N GLN 49.A O ASN 53.A H 2.808 1.974 ASN 53.A ND2 VAL 20.A O ASN 53.A HD22 2.838 1.997 ILE 54.A N ILE 50.A O ILE 54.A H 2.981 2.138 GLU 55.A N ARG 51.A O GLU 55.A H 2.970 2.143 ALA 56.A N ARG 52.A O ALA 56.A H 2.631 1.869 LEU 57.A N ASN 53.A O LEU 57.A H 3.041 2.281 GLY 58.A N GLU 55.A O GLY 58.A H 3.167 2.371 PHE 59.A N ILE 54.A O PHE 59.A H 3.231 2.414 ASP 63.A N ARG 60.A O ASP 63.A H 3.209 2.414 ILE 64.A N MET 61.A O ILE 64.A H 2.994 2.158 ARG 65.A N HIS 36.A O ARG 65.A H 2.847 2.056 ARG 65.A NH1 GLN 34.A O ARG 65.A HH11 3.177 2.486 ILE 67.A N ARG 90.A O ILE 67.A H 2.811 1.996 ALA 68.A N LEU 38.A O ALA 68.A H 2.769 1.938 ASN 69.A N ILE 92.A O ASN 69.A H 3.149 2.407 ASN 69.A ND2 ASP 40.A OD1 ASN 69.A HD22 3.245 2.650 ASN 69.A ND2 HIS 71.A O ASN 69.A HD21 3.164 2.392 SER 70.A N ASP 40.A OD1 SER 70.A H 2.803 1.982 SER 70.A OG ASP 40.A OD1 SER 70.A HG 3.260 2.442 HIS 71.A ND1 ASP 168.A OD1 HIS 71.A HD1 2.817 1.965 ALA 72.A N ASN 97.A OD1 ALA 72.A H 2.940 2.207 ARG 73.A N HIS 71.A O ARG 73.A H 2.922 2.205 ARG 73.A NE ASP 108.A OD2 ARG 73.A HE 2.767 1.915 ARG 73.A NH1 TYR 175.A OH ARG 73.A HH12 2.932 2.188 ARG 73.A NH2 ASP 108.A OD1 ARG 73.A HH21 2.899 2.056 ARG 73.A NH2 ASP 108.A OD2 ARG 73.A HH21 3.337 2.676 ARG 73.A NH2 TYR 175.A OH ARG 73.A HH22 3.075 2.375 ASP 75.A N ASP 75.A OD1 ASP 75.A H 2.582 1.935 GLN 76.A N ARG 73.A O GLN 76.A H 2.943 2.095 GLN 76.A NE2 ASP 40.A OD2 GLN 76.A HE21 2.809 2.159 GLN 76.A NE2 ASN 208.A O GLN 76.A HE22 3.437 2.721 ALA 77.A N ARG 73.A O ALA 77.A H 2.848 1.990 GLY 79.A N GLY 42.A O GLY 79.A H 2.978 2.275 ILE 80.A N ALA 77.A O ILE 80.A H 3.143 2.295 ARG 82.A NE ASP 44.A OD1 ARG 82.A HE 2.931 2.139 ARG 82.A NH2 ASP 44.A O ARG 82.A HH21 2.752 1.971 LEU 83.A N GLY 79.A O LEU 83.A H 3.063 2.207 LYS 84.A N ILE 80.A O LYS 84.A H 2.756 1.958 LYS 84.A NZ THR 121.A O LYS 84.A HZ1 2.861 2.219 LYS 84.A NZ ASP 123.A OD1 LYS 84.A HZ3 3.553 2.792 ALA 85.A N ALA 81.A O ALA 85.A H 3.054 2.263 TRP 86.A N LEU 83.A O TRP 86.A H 3.372 2.628 SER 87.A N LYS 84.A O SER 87.A H 3.360 2.572 SER 87.A OG LEU 83.A O SER 87.A HG 2.816 2.096 GLY 88.A N LYS 84.A O GLY 88.A H 3.000 2.175 ALA 89.A N SER 87.A OG ALA 89.A H 3.136 2.303 ARG 90.A N ARG 65.A O ARG 90.A H 2.940 2.117 VAL 91.A N ASP 123.A OD2 VAL 91.A H 2.728 1.900 ILE 92.A N ILE 67.A O ILE 92.A H 2.666 1.853 ALA 93.A N MET 124.A O ALA 93.A H 3.335 2.544 SER 94.A OG GLY 150.A O SER 94.A HG 2.780 2.157 HIS 95.A ND1 GLU 125.A OE1 no hydrogen 2.795 N/A HIS 95.A ND1 GLU 125.A OE2 no hydrogen 3.142 N/A ASN 97.A N SER 94.A OG ASN 97.A H 3.370 2.522 ASN 97.A ND2 SER 70.A O ASN 97.A HD21 2.967 2.347 ALA 98.A N SER 94.A O ALA 98.A H 2.771 1.964 GLU 99.A N HIS 95.A O GLU 99.A H 2.941 2.141 GLN 100.A N ALA 96.A O GLN 100.A H 3.160 2.315 GLN 100.A NE2 ALA 72.A O GLN 100.A HE21 2.595 1.843 GLN 100.A NE2 ASP 108.A OD2 GLN 100.A HE22 2.962 2.215 MET 101.A N ASN 97.A O MET 101.A H 2.726 1.898 ALA 102.A N ALA 98.A O ALA 102.A H 2.977 2.246 ALA 102.A N GLU 99.A O ALA 102.A H 3.110 2.505 ARG 103.A N GLU 99.A O ARG 103.A H.A 3.259 2.533 ARG 103.A N GLN 100.A O ARG 103.A H.A 3.218 2.594 ARG 103.A NH2.B GLN 100.A OE1 ARG 103.A HH22.B 3.345 2.620 ARG 103.A NH2.B LYS 106.A O ARG 103.A HH21.B 2.806 2.000 GLY 104.A N MET 101.A O GLY 104.A H 3.248 2.411 GLY 105.A N GLN 100.A O GLY 105.A H 2.853 2.000 LYS 106.A N ARG 103.A O LYS 106.A H 3.222 2.373 GLU 107.A N ASP 113.A OD1 GLU 107.A H 3.097 2.246 ASP 108.A N GLY 112.A O ASP 108.A H 3.102 2.336 ALA 110.A N ASP 108.A OD1 ALA 110.A H 2.892 2.062 LEU 111.A N ASP 108.A OD1 LEU 111.A H 3.074 2.312 GLY 112.A N ASP 108.A O GLY 112.A H 2.823 1.998 ALA 114.A N LEU 111.A O ALA 114.A H 3.119 2.285 PHE 117.A N GLY 104.A O PHE 117.A H 2.848 2.104 VAL 120.A N MET 101.A O VAL 120.A H 2.968 2.147 ASP 123.A N VAL 91.A O ASP 123.A H 3.000 2.256 MET 124.A N VAL 91.A O MET 124.A H 3.084 2.241 ALA 126.A N ALA 93.A O ALA 126.A H 2.814 1.997 GLN 127.A N GLN 130.A OE1 GLN 127.A H 2.871 2.059 GLN 127.A NE2 GLU 125.A O GLN 127.A HE22 3.036 2.534 GLY 129.A N ALA 141.A O GLY 129.A H 2.841 2.045 GLN 130.A N GLN 127.A O GLN 130.A H 2.874 2.024 TRP 132.A N LEU 139.A O TRP 132.A H 2.713 1.904 LEU 134.A N VAL 137.A O LEU 134.A H 2.837 1.992 GLY 135.A N GLN 34.A OE1 GLY 135.A H 2.933 2.150 VAL 137.A N LEU 134.A O VAL 137.A H 2.737 1.901 THR 138.A N THR 157.A O THR 138.A H 3.022 2.211 THR 138.A OG1 HIS 133.A ND1 THR 138.A HG1 3.327 2.559 LEU 139.A N TRP 132.A O LEU 139.A H 2.775 1.926 ALA 140.A N LYS 155.A O ALA 140.A H 2.789 1.993 ALA 141.A N GLN 130.A O ALA 141.A H 3.021 2.208 ILE 142.A N SER 153.A O ILE 142.A H 2.750 1.938 PHE 143.A N ASP 128.A OD1 PHE 143.A H 3.255 2.421 THR 144.A N ALA 151.A O THR 144.A H 2.923 2.136 GLY 146.A N LEU 148.A O GLY 146.A H 3.171 2.370 HIS 147.A ND1 ALA 171.A O HIS 147.A HD1 2.544 1.697 ALA 151.A N LEU 148.A O ALA 151.A H 3.129 2.271 THR 152.A N SER 70.A O THR 152.A H 2.837 2.079 THR 152.A N ASP 168.A OD2 THR 152.A H 3.131 2.525 THR 152.A OG1 GLY 150.A O THR 152.A HG1 2.818 2.064 SER 153.A N ILE 142.A O SER 153.A H 2.799 1.984 SER 153.A OG THR 144.A OG1 SER 153.A HG 2.960 2.149 TRP 154.A N TYR 166.A O TRP 154.A H 2.935 2.118 TRP 154.A NE1 ASN 69.A O TRP 154.A HE1 3.153 2.354 LYS 155.A N ALA 140.A O LYS 155.A H 2.935 2.111 VAL 156.A N LEU 164.A O VAL 156.A H 2.584 1.743 THR 157.A N THR 138.A O THR 157.A H 2.906 2.124 LEU 158.A N LYS 162.A O LEU 158.A H 2.890 2.033 GLY 161.A N LEU 158.A O GLY 161.A H 2.978 2.126 LYS 162.A N ASP 160.A OD1 LYS 162.A H 3.220 2.403 THR 163.A N ASP 203.A OD1 THR 163.A H 3.292 2.444 THR 163.A OG1 GLN 201.A OE1 THR 163.A HG1 3.067 2.471 LEU 164.A N VAL 156.A O LEU 164.A H 2.654 1.831 ILE 165.A N ILE 204.A O ILE 165.A H 3.031 2.218 TYR 166.A N TRP 154.A O TYR 166.A H 2.639 1.794 TYR 166.A OH ASP 40.A OD2 TYR 166.A HH 2.602 1.911 ALA 167.A N LEU 206.A O ALA 167.A H 3.034 2.175 ASP 168.A N SER 153.A OG ASP 168.A H 2.992 2.140 SER 169.A N ASP 168.A OD1 SER 169.A H 2.585 1.850 ALA 171.A N SER 169.A OG ALA 171.A H 3.084 2.236 THR 172.A OG1 GLN 250.A OE1 THR 172.A HG1 2.619 1.918 TYR 175.A N THR 172.A O TYR 175.A H 3.133 2.294 TYR 175.A OH HIS 147.A O TYR 175.A HH 2.931 2.169 LEU 177.A N GLN 254.A OE1 LEU 177.A H 2.943 2.092 ASN 180.A ND2 PRO 176.A O ASN 180.A HD22 2.615 1.821 ASN 182.A N ASN 180.A OD1 ASN 182.A H 2.897 2.288 ASN 182.A ND2 PHE 109.A O ASN 182.A HD22 2.959 2.115 TYR 183.A N ASN 180.A O TYR 183.A H 3.176 2.469 TYR 183.A N ASN 180.A OD1 TYR 183.A H 2.990 2.296 TYR 183.A OH ASP 189.A OD2 TYR 183.A HH 2.506 1.726 THR 185.A OG1 ASP 189.A OD2 THR 185.A HG1 3.107 2.437 LEU 186.A N TYR 183.A O LEU 186.A H 3.108 2.366 ASP 189.A N THR 185.A O ASP 189.A H 2.846 2.030 ILE 190.A N LEU 186.A O ILE 190.A H 2.945 2.123 ARG 191.A N VAL 187.A O ARG 191.A H 3.160 2.329 ARG 191.A NE GLU 248.A OE1 ARG 191.A HE 2.993 2.224 ARG 191.A NH2 GLU 248.A OE1 ARG 191.A HH21 3.469 2.835 ARG 191.A NH2 GLU 248.A OE2 ARG 191.A HH21 3.086 2.255 ARG 192.A N GLU 188.A O ARG 192.A H 3.187 2.329 ARG 192.A NH1 ASP 189.A OD1 ARG 192.A HH12 3.323 2.536 ARG 192.A NH2 ASP 189.A OD1 ARG 192.A HH22 3.327 2.541 SER 193.A N ASP 189.A O SER 193.A H 2.913 2.148 SER 193.A OG PRO 145.A O SER 193.A HG 2.698 2.014 PHE 194.A N ILE 190.A O PHE 194.A H 2.952 2.183 ALA 195.A N ARG 191.A O ALA 195.A H 3.199 2.373 ARG 196.A N ARG 192.A O ARG 196.A H 2.879 2.094 ARG 196.A NH1 ASP 128.A OD1 ARG 196.A HH12 3.322 2.668 ARG 196.A NH1 ASP 128.A OD2 ARG 196.A HH12 3.015 2.161 ARG 196.A NH2 ASP 128.A OD1 ARG 196.A HH22 2.869 2.078 LEU 197.A N SER 193.A O LEU 197.A H 2.984 2.136 GLU 198.A N PHE 194.A O GLU 198.A H 3.061 2.302 ALA 199.A N ALA 195.A O ALA 199.A H 3.188 2.502 GLN 200.A N LEU 197.A O GLN 200.A H 3.233 2.382 GLN 200.A NE2 ARG 196.A O GLN 200.A HE21 2.977 2.140 GLN 201.A NE2 ASP 203.A OD1 GLN 201.A HE22 3.003 2.194 ASP 203.A N THR 163.A O ASP 203.A H 2.944 2.168 ILE 204.A N THR 163.A O ILE 204.A H 2.949 2.128 LEU 206.A N ILE 165.A O LEU 206.A H 2.944 2.087 ASN 208.A N ALA 167.A O ASN 208.A H 3.131 2.478 ASN 208.A ND2 GLN 76.A OE1 ASN 208.A HD22 2.993 2.294 LYS 209.A NZ ASP 75.A OD2 LYS 209.A HZ1 2.835 2.145 LYS 209.A NZ GLN 76.A OE1 LYS 209.A HZ2 2.850 2.221 GLY 210.A N ASN 24.A O GLY 210.A H 3.140 2.366 GLU 211.A N ASN 24.A OD1 GLU 211.A H 2.800 2.029 ARG 212.A N LYS 209.A O ARG 212.A H 3.000 2.184 ARG 212.A NH1 ASN 208.A OD1 ARG 212.A HH11 2.969 2.350 PHE 213.A N GLY 210.A O PHE 213.A H 3.159 2.365 LEU 215.A N GLY 210.A O LEU 215.A H 3.046 2.193 LYS 218.A N GLY 214.A O LYS 218.A H 3.073 2.215 LYS 218.A NZ PHE 213.A O LYS 218.A HZ2 2.822 1.984 LYS 218.A NZ ASP 232.A OD2 LYS 218.A HZ1 2.713 1.831 MET 219.A N LEU 215.A O MET 219.A H 2.805 1.986 ALA 220.A N MET 216.A O ALA 220.A H 3.120 2.303 ARG 221.A N ASP 217.A O ARG 221.A H 2.990 2.187 ARG 221.A NE ASP 217.A OD2 ARG 221.A HE 2.847 2.066 ARG 221.A NH2 ASP 217.A OD2 ARG 221.A HH21 2.936 2.203 LYS 222.A N LYS 218.A O LYS 222.A H 2.918 2.082 LYS 222.A NZ ALA 12.A O LYS 222.A HZ3 3.257 2.564 ALA 223.A N MET 219.A O ALA 223.A H 3.026 2.198 ARG 224.A N ALA 220.A O ARG 224.A H 3.131 2.432 ARG 224.A N ARG 221.A O ARG 224.A H 3.119 2.507 GLY 225.A N LYS 222.A O GLY 225.A H 3.185 2.335 GLU 226.A N ARG 221.A O GLU 226.A H 2.968 2.137 ALA 229.A N GLU 226.A O ALA 229.A H 3.162 2.418 ILE 231.A N ASN 228.A O ILE 231.A H 3.055 2.317 ASP 232.A N ASP 203.A O ASP 232.A H 2.858 2.084 ARG 238.A N ALA 234.A O ARG 238.A H 3.108 2.292 TYR 239.A N GLY 235.A O TYR 239.A H 2.827 2.011 TYR 239.A OH ASP 168.A O TYR 239.A HH 2.892 2.070 VAL 240.A N LEU 236.A O VAL 240.A H 2.866 2.049 ALA 241.A N ALA 237.A O ALA 241.A H 2.923 2.083 GLN 242.A N ARG 238.A O GLN 242.A H 3.017 2.167 SER 243.A N TYR 239.A O SER 243.A H 3.009 2.164 SER 243.A OG TYR 239.A O SER 243.A HG 2.837 2.108 ARG 244.A N VAL 240.A O ARG 244.A H 2.714 1.865 ARG 244.A NH1 GLU 198.A OE1 ARG 244.A HH12 2.874 2.066 ARG 244.A NH2 GLU 198.A OE1 ARG 244.A HH22 3.223 2.528 ARG 244.A NH2 GLU 198.A OE2 ARG 244.A HH22 3.403 2.581 ALA 245.A N ALA 241.A O ALA 245.A H 2.915 2.095 ALA 246.A N GLN 242.A O ALA 246.A H 2.924 2.090 PHE 247.A N SER 243.A O PHE 247.A H 2.835 2.014 GLU 248.A N ARG 244.A O no hydrogen 2.927 N/A LYS 249.A N ALA 245.A O LYS 249.A H 3.115 2.346 GLN 250.A N ALA 246.A O GLN 250.A H 3.064 2.232 GLN 250.A NE2 THR 172.A O GLN 250.A HE22 2.789 1.968 LEU 251.A N PHE 247.A O LEU 251.A H 2.882 2.073 ALA 252.A N GLU 248.A O ALA 252.A H 2.993 2.151 ALA 253.A N LYS 249.A O ALA 253.A H 3.062 2.249 GLN 254.A N GLN 250.A O GLN 254.A H 3.017 2.189 GLN 254.A NE2 TYR 175.A O GLN 254.A HE22 2.853 2.057 ARG 255.A N LEU 251.A O ARG 255.A H 2.835 2.016 ALA 256.A N ALA 252.A O ALA 256.A H 2.966 2.313 ALA 256.A N ALA 253.A O ALA 256.A H 3.112 2.443 GLN 257.A N GLN 254.A O GLN 257.A H 3.162 2.327