Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6emd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 4.A N LYS 1.A O GLN 4.A H 3.046 2.437 GLU 5.A N GLY 2.A O GLU 5.A H 3.244 2.413 VAL 7.A N GLU 3.A O VAL 7.A H 3.016 2.324 LYS 8.A N GLN 4.A O LYS 8.A H 3.015 2.210 GLU 9.A N GLU 5.A O GLU 9.A H 3.002 2.170 PHE 10.A N SER 6.A O PHE 10.A H 2.920 2.077 LEU 11.A N VAL 7.A O LEU 11.A H 2.944 2.160 ALA 12.A N LYS 8.A O ALA 12.A H 3.063 2.229 LYS 13.A N GLU 9.A O LYS 13.A H 3.044 2.208 ALA 14.A N PHE 10.A O ALA 14.A H 2.882 2.069 LYS 15.A N LEU 11.A O LYS 15.A H 2.884 2.086 GLU 16.A N ALA 12.A O GLU 16.A H 3.169 2.336 GLU 17.A N LYS 13.A O GLU 17.A H 2.978 2.157 PHE 18.A N ALA 14.A O PHE 18.A H 2.817 2.023 LEU 19.A N LYS 15.A O LEU 19.A H 2.928 2.093 LYS 20.A N GLU 16.A O LYS 20.A H 3.212 2.419 LYS 21.A N GLU 17.A O LYS 21.A H 3.360 2.510 TRP 22.A N PHE 18.A O TRP 22.A H 2.644 1.870 GLU 23.A N LEU 19.A O GLU 23.A H 2.796 1.962 SER 24.A N LYS 20.A O SER 24.A H 3.147 2.392 SER 26.A N GLN 88.A OE1 SER 26.A H 2.777 1.996 GLN 27.A NE2 THR 337.A O GLN 27.A HE22 3.403 2.831 GLN 27.A NE2 PHE 339.A O GLN 27.A HE21 2.820 2.000 THR 29.A N SER 101.A O THR 29.A H 2.829 2.037 HIS 34.A N GLN 31.A O HIS 34.A H 2.914 2.083 PHE 35.A N LEU 32.A O PHE 35.A H 2.903 2.062 ASP 36.A N LYS 53.A O ASP 36.A H 2.840 1.983 ARG 37.A NH1 GLU 323.A O ARG 37.A HH12 2.870 2.144 ARG 37.A NH2 GLU 322.A OE1 ARG 37.A HH21 3.013 2.232 ARG 37.A NH2 GLU 323.A O ARG 37.A HH22 2.733 1.956 ILE 38.A N LEU 51.A O ILE 38.A H 2.884 2.084 LYS 39.A N LEU 51.A O LYS 39.A H 3.356 2.593 LYS 39.A NZ ASP 319.A OD1 LYS 39.A HZ1 2.558 1.727 THR 40.A N GLU 322.A OE2 THR 40.A H 2.662 1.815 THR 40.A OG1 GLU 322.A OE1 THR 40.A HG1 2.628 1.863 LEU 41.A N VAL 49.A O LEU 41.A H 2.791 1.957 GLY 42.A N VAL 49.A O GLY 42.A H 3.326 2.608 GLY 44.A N GLY 47.A O GLY 44.A H 2.833 2.123 GLY 47.A N GLY 44.A O GLY 47.A H 3.415 2.599 ARG 48.A N ILE 65.A O ARG 48.A H 2.928 2.146 ARG 48.A NH1 GLU 323.A O ARG 48.A HH12 2.875 2.185 ARG 48.A NH1 GLU 324.A O ARG 48.A HH12 3.254 2.617 ARG 48.A NH2 GLU 324.A O ARG 48.A HH22 2.872 2.128 VAL 49.A N GLY 42.A O VAL 49.A H 2.920 2.090 MET 50.A N MET 63.A O MET 50.A H 2.864 2.045 LEU 51.A N LYS 39.A O LEU 51.A H 2.743 1.952 VAL 52.A N TYR 61.A O VAL 52.A H 2.941 2.101 LYS 53.A N ASP 36.A O LYS 53.A H 2.877 2.107 HIS 54.A N ASN 59.A O HIS 54.A H 2.834 2.016 LYS 55.A N HIS 34.A O LYS 55.A H 3.082 2.224 GLU 56.A N HIS 54.A ND1 GLU 56.A H 3.037 2.406 THR 57.A N HIS 54.A ND1 THR 57.A H 3.397 2.566 GLY 58.A N HIS 54.A O GLY 58.A H 2.651 1.848 TYR 61.A N VAL 52.A O TYR 61.A H 2.814 2.005 ALA 62.A N MET 112.A O ALA 62.A H 2.668 1.948 MET 63.A N MET 50.A O MET 63.A H 2.811 1.962 LYS 64.A N MET 110.A O LYS 64.A H 2.658 1.844 LYS 64.A NZ GLU 83.A OE1 LYS 64.A HZ3 2.920 2.079 ILE 65.A N ARG 48.A O ILE 65.A H 2.780 1.922 LEU 66.A N LEU 108.A O LEU 66.A H 2.797 1.970 ASP 67.A N PHE 46.A O ASP 67.A H 2.838 2.054 LYS 68.A N SER 106.A O LYS 68.A H 2.933 2.091 LYS 68.A NZ ASP 104.A O LYS 68.A HZ1 2.706 1.950 LYS 68.A NZ LYS 331.A O LYS 68.A HZ2 2.941 2.090 LYS 70.A N ASP 67.A OD1 LYS 70.A H 3.197 2.397 VAL 71.A N ASP 67.A O VAL 71.A H 2.910 2.063 VAL 72.A N LYS 68.A O VAL 72.A H 2.988 2.167 LYS 73.A N GLN 69.A O LYS 73.A H 2.932 2.078 LEU 74.A N LYS 70.A O LEU 74.A H 2.846 2.028 LYS 75.A N VAL 72.A O LYS 75.A H 2.950 2.127 GLN 76.A N VAL 71.A O GLN 76.A H 2.885 2.030 GLN 76.A NE2 LEU 74.A O GLN 76.A HE21 3.316 2.485 HIS 79.A ND1 GLN 76.A OE1 HIS 79.A HD1 2.814 1.967 THR 80.A N GLN 76.A O THR 80.A H 2.901 2.067 THR 80.A OG1 GLN 76.A O THR 80.A HG1 2.898 2.150 LEU 81.A N ILE 77.A O LEU 81.A H 2.964 2.106 ASN 82.A N GLU 78.A O ASN 82.A H 2.966 2.144 ASN 82.A ND2 GLU 78.A O ASN 82.A HD22 3.631 3.020 GLU 83.A N HIS 79.A O GLU 83.A H 2.934 2.156 LYS 84.A N THR 80.A O LYS 84.A H 3.236 2.401 LYS 84.A NZ SER 26.A O LYS 84.A HZ1 2.855 2.035 LYS 84.A NZ PHE 339.A OXT LYS 84.A HZ2 2.802 2.076 ARG 85.A N LEU 81.A O ARG 85.A H 2.989 2.141 ARG 85.A NE TRP 22.A O ARG 85.A HE 3.117 2.351 ARG 85.A NH2 TRP 22.A O ARG 85.A HH21 3.004 2.218 ILE 86.A N ASN 82.A O ILE 86.A H 2.865 2.022 LEU 87.A N GLU 83.A O LEU 87.A H 2.942 2.090 GLN 88.A N LYS 84.A O GLN 88.A H 2.977 2.153 GLN 88.A NE2 LYS 21.A O GLN 88.A HE22 2.909 2.063 GLN 88.A NE2 ARG 85.A O GLN 88.A HE21 2.928 2.126 ALA 89.A N ILE 86.A O ALA 89.A H 2.950 2.169 VAL 90.A N ILE 86.A O VAL 90.A H 2.999 2.259 LEU 95.A N PHE 92.A O LEU 95.A H 3.216 2.376 VAL 96.A N VAL 173.A O VAL 96.A H 3.039 2.190 GLU 99.A N VAL 111.A O GLU 99.A H 2.843 2.020 PHE 100.A N VAL 111.A O PHE 100.A H 3.313 2.497 SER 101.A N THR 29.A OG1 SER 101.A H 3.018 2.227 PHE 102.A N TYR 109.A O PHE 102.A H 3.174 2.373 LYS 103.A NZ PHE 336.A O LYS 103.A HZ2 2.812 1.966 LYS 103.A NZ PHE 339.A O LYS 103.A HZ3 2.660 1.771 ASP 104.A N ASN 107.A O ASP 104.A H 3.041 2.235 SER 106.A N ASP 104.A OD1 SER 106.A H 2.937 2.169 ASN 107.A N ASP 104.A OD1 ASN 107.A H 2.795 1.993 ASN 107.A ND2 TYR 109.A OH ASN 107.A HD22 3.109 2.276 ASN 107.A ND2 ARG 326.A O ASN 107.A HD21 3.050 2.320 LEU 108.A N LEU 66.A O LEU 108.A H 2.868 2.044 TYR 109.A N PHE 102.A O TYR 109.A H 2.865 2.053 TYR 109.A OH ASP 104.A OD2 TYR 109.A HH 2.550 1.839 MET 110.A N LYS 64.A O MET 110.A H 2.917 2.095 VAL 111.A N PHE 100.A O VAL 111.A H 2.962 2.180 MET 112.A N ALA 62.A O MET 112.A H 2.832 1.998 GLU 113.A N LYS 97.A O GLU 113.A H 3.250 2.490 TYR 114.A N HIS 60.A O TYR 114.A H 3.245 2.432 TYR 114.A OH ASP 313.A O TYR 114.A HH 2.751 1.917 GLY 118.A N VAL 115.A O GLY 118.A H 3.328 2.508 MET 120.A N LEU 163.A O MET 120.A H 2.727 1.893 PHE 121.A N PRO 160.A O PHE 121.A H 3.238 2.551 HIS 123.A NE2 GLY 117.A O HIS 123.A HE2 2.743 1.905 LEU 124.A N MET 120.A O LEU 124.A H 2.752 1.901 ARG 125.A N PHE 121.A O ARG 125.A H 2.910 2.096 ARG 125.A NH1 GLU 220.A OE2 ARG 125.A HH12 2.740 2.054 ARG 125.A NH2 GLU 220.A OE2 ARG 125.A HH22 2.512 1.741 ARG 126.A N SER 122.A O ARG 126.A H 2.959 2.149 ARG 126.A NH1 HIS 123.A ND1 ARG 126.A HH12 3.378 2.691 ARG 126.A NH2 HIS 123.A ND1 ARG 126.A HH22 2.926 2.093 ILE 127.A N HIS 123.A O ILE 127.A H 2.928 2.083 GLY 128.A N LEU 124.A O GLY 128.A H 2.845 2.035 ARG 129.A NH2 ALA 222.A O ARG 129.A HH21 2.812 2.185 PHE 130.A N MET 221.A O PHE 130.A H 2.803 1.943 ARG 135.A N GLU 131.A O ARG 135.A H 2.736 1.956 ARG 135.A NH2 TRP 286.A O ARG 135.A HH21 2.924 2.275 PHE 136.A N PRO 132.A O PHE 136.A H 3.068 2.278 ALA 138.A N ALA 134.A O ALA 138.A H 2.918 2.087 ALA 139.A N ARG 135.A O ALA 139.A H 2.889 2.054 GLN 140.A NE2 PHE 136.A O GLN 140.A HE21 2.930 2.176 ILE 141.A N TYR 137.A O ILE 141.A H 3.142 2.358 VAL 142.A N ALA 138.A O VAL 142.A H 2.860 2.038 LEU 143.A N ALA 139.A O LEU 143.A H 3.067 2.231 THR 144.A N GLN 140.A O THR 144.A H 2.949 2.185 THR 144.A OG1 GLN 140.A O THR 144.A HG1 2.714 1.976 PHE 145.A N ILE 141.A O PHE 145.A H 2.817 2.006 GLU 146.A N VAL 142.A O GLU 146.A H 2.966 2.120 TYR 147.A N LEU 143.A O TYR 147.A H 3.004 2.171 LEU 148.A N THR 144.A O LEU 148.A H 2.869 2.014 HIS 149.A N PHE 145.A O HIS 149.A H 2.686 1.833 HIS 149.A NE2 ASP 210.A OD2 HIS 149.A HE2 2.792 1.941 SER 150.A N GLU 146.A O SER 150.A H 3.028 2.243 SER 150.A OG TYR 147.A O SER 150.A HG 2.763 1.923 LEU 151.A N LEU 148.A O LEU 151.A H 2.939 2.218 ASP 152.A N HIS 149.A O ASP 152.A H 2.783 1.971 LEU 153.A N LEU 148.A O LEU 153.A H 2.984 2.154 ILE 154.A N LYS 180.A O ILE 154.A H 2.979 2.195 TYR 155.A N ASP 210.A OD2 TYR 155.A H 2.847 1.990 TYR 155.A OH ASP 175.A O TYR 155.A HH 2.717 2.077 ARG 156.A N ASP 210.A OD1 ARG 156.A H 2.752 1.895 ARG 156.A NE PHE 178.A O ARG 156.A HE 2.753 1.960 ARG 156.A NH1 TYR 205.A OH ARG 156.A HH11 2.797 2.062 ARG 156.A NH2 PHE 178.A O ARG 156.A HH21 2.989 2.281 LYS 159.A NZ THR 191.A OG1 LYS 159.A HZ3 2.765 1.898 GLU 161.A N GLU 161.A OE1 GLU 161.A H 2.693 1.929 ASN 162.A N LYS 159.A O ASN 162.A H 2.905 2.054 ASN 162.A ND2 ASP 157.A O ASN 162.A HD22 2.981 2.135 LEU 164.A N GLN 172.A O LEU 164.A H 2.802 1.951 ILE 165.A N GLY 118.A O ILE 165.A H 2.963 2.159 ASP 166.A N TYR 170.A O ASP 166.A H 2.760 1.917 GLN 168.A N ASP 166.A OD1 GLN 168.A H 3.089 2.444 GLY 169.A N ASP 166.A O GLY 169.A H 2.765 1.937 TYR 170.A N ASP 166.A OD1 TYR 170.A H 2.797 1.997 TYR 170.A OH VAL 300.A O TYR 170.A HH 2.486 1.735 ILE 171.A N GLN 140.A OE1 ILE 171.A H 2.837 1.981 GLN 172.A N LEU 164.A O GLN 172.A H 2.960 2.176 VAL 173.A N PHE 94.A O VAL 173.A H 2.739 1.910 THR 174.A N ASN 162.A O THR 174.A H 2.981 2.173 THR 174.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 174.A HG1 2.805 2.130 PHE 176.A N GLU 83.A OE2 PHE 176.A H 2.902 2.059 ALA 179.A N PHE 176.A O ALA 179.A H 3.042 2.223 LYS 180.A N ILE 154.A O LYS 180.A H 3.127 2.353 LYS 180.A NZ THR 186.A OG1 LYS 180.A HZ3 2.750 1.867 ARG 181.A NE LEU 151.A O ARG 181.A HE 2.846 2.075 ARG 181.A NH2 LEU 151.A O ARG 181.A HH21 3.547 2.956 VAL 182.A N ASP 152.A O VAL 182.A H 2.707 1.881 THR 186.A N TYR 205.A O THR 186.A H 2.846 2.047 GLU 193.A N GLU 193.A OE1 GLU 193.A H 2.710 1.989 TYR 194.A N THR 191.A O TYR 194.A H 2.837 2.026 TYR 194.A OH GLU 220.A OE1 TYR 194.A HH 2.741 1.945 LEU 195.A N PRO 192.A O LEU 195.A H 3.229 2.375 GLU 198.A N GLU 198.A OE1 GLU 198.A H 2.839 2.013 ILE 199.A N ALA 196.A O ILE 199.A H 3.023 2.379 ILE 200.A N ALA 196.A O ILE 200.A H 3.266 2.435 LEU 201.A N PRO 197.A O LEU 201.A H 2.837 2.058 SER 202.A N ILE 199.A O SER 202.A H 2.996 2.152 TYR 205.A N THR 186.A O TYR 205.A H 2.966 2.177 ASN 206.A ND2 ASN 273.A OD1 ASN 206.A HD21 3.494 2.812 LYS 207.A NZ VAL 182.A O LYS 207.A HZ1 2.812 2.196 ALA 208.A N ASN 206.A OD1 ALA 208.A H 2.864 2.036 VAL 209.A N ASN 206.A O VAL 209.A H 3.186 2.327 ASP 210.A N LYS 207.A O ASP 210.A H 3.004 2.211 TRP 212.A N ALA 208.A O TRP 212.A H 3.060 2.229 ALA 213.A N VAL 209.A O ALA 213.A H 2.951 2.127 LEU 214.A N ASP 210.A O LEU 214.A H 2.872 2.104 GLY 215.A N TRP 211.A O GLY 215.A H 3.183 2.373 VAL 216.A N TRP 212.A O VAL 216.A H 3.119 2.331 LEU 217.A N ALA 213.A O LEU 217.A H 2.938 2.118 ILE 218.A N LEU 214.A O ILE 218.A H 2.883 2.037 TYR 219.A N GLY 215.A O TYR 219.A H 3.011 2.154 TYR 219.A OH ARG 246.A O TYR 219.A HH 2.524 1.707 GLU 220.A N VAL 216.A O GLU 220.A H 2.822 1.987 MET 221.A N LEU 217.A O MET 221.A H 2.908 2.057 ALA 222.A N ILE 218.A O ALA 222.A H 2.856 2.032 ALA 223.A N TYR 219.A O ALA 223.A H 2.791 1.986 GLY 224.A N GLU 220.A O GLY 224.A H 2.791 2.011 GLN 232.A N GLN 235.A OE1 GLN 232.A H 2.843 2.089 GLN 235.A N GLN 232.A O GLN 235.A H 3.081 2.465 ILE 236.A N GLN 232.A O ILE 236.A H 3.347 2.546 TYR 237.A N PRO 233.A O TYR 237.A H 3.011 2.201 GLU 238.A N ILE 234.A O GLU 238.A H 3.256 2.435 LYS 239.A N GLN 235.A O LYS 239.A H 3.343 2.544 LYS 239.A NZ PHE 229.A O LYS 239.A HZ2 2.728 1.838 ILE 240.A N ILE 236.A O ILE 240.A H 2.961 2.151 VAL 241.A N TYR 237.A O VAL 241.A H 3.018 2.191 SER 242.A N LYS 239.A O SER 242.A H 3.157 2.362 SER 242.A OG LYS 239.A O SER 242.A HG 2.716 1.968 LYS 244.A N SER 242.A OG LYS 244.A H 2.995 2.157 PHE 251.A N PRO 248.A O PHE 251.A H 3.192 2.343 SER 252.A N GLU 131.A OE2 SER 252.A H 2.776 1.945 LEU 255.A N SER 252.A OG LEU 255.A H 2.905 2.071 LYS 256.A N SER 252.A O LYS 256.A H 2.997 2.145 ASP 257.A N SER 253.A O ASP 257.A H 2.946 2.132 LEU 258.A N ASP 254.A O LEU 258.A H 2.854 2.009 LEU 259.A N LEU 255.A O LEU 259.A H 2.857 2.013 ARG 260.A N LYS 256.A O ARG 260.A H 2.896 2.076 ASN 261.A N ASP 257.A O ASN 261.A H 3.318 2.585 ASN 261.A N LEU 258.A O ASN 261.A H 2.922 2.245 ASN 261.A ND2 ASP 257.A O ASN 261.A HD22 2.986 2.201 LEU 262.A N LEU 258.A O LEU 262.A H 2.955 2.190 LEU 263.A N LEU 259.A O LEU 263.A H 2.627 1.783 ASP 266.A N GLN 264.A OE1 ASP 266.A H 2.974 2.124 THR 268.A N ASP 266.A OD1 THR 268.A H 3.041 2.262 THR 268.A OG1 ASP 266.A OD1 THR 268.A HG1 2.850 2.011 THR 268.A OG1 ASP 266.A OD2 THR 268.A HG1 3.406 2.811 LYS 269.A N ASP 266.A O LYS 269.A H 2.728 1.892 LYS 269.A NZ ASP 266.A OD2 LYS 269.A HZ3 3.355 2.494 ARG 270.A N LEU 267.A O ARG 270.A H 3.347 2.490 ARG 270.A NE GLN 264.A O ARG 270.A HE 2.881 2.097 ARG 270.A NH1 GLU 198.A OE2 ARG 270.A HH12 2.775 1.955 ARG 270.A NH1 ALA 208.A O ARG 270.A HH11 3.033 2.221 ARG 270.A NH2 GLU 198.A OE1 ARG 270.A HH22 2.927 2.073 ARG 270.A NH2 GLU 198.A OE2 ARG 270.A HH22 3.513 2.908 ARG 270.A NH2 GLN 264.A O ARG 270.A HH21 2.872 2.107 PHE 271.A N ASN 261.A O PHE 271.A H 2.957 2.181 ASN 273.A N ARG 270.A O ASN 273.A H 2.911 2.084 ASN 273.A ND2 LEU 267.A O ASN 273.A HD22 2.906 2.079 GLY 277.A N LEU 274.A O GLY 277.A H 2.869 2.038 ASN 279.A N ASN 276.A O ASN 279.A H 3.138 2.381 ASN 279.A ND2 ASN 276.A O ASN 279.A HD22 3.539 3.065 ASP 280.A N GLY 277.A O ASP 280.A H 3.327 2.563 ILE 281.A N VAL 278.A O ILE 281.A H 3.054 2.411 LYS 282.A N VAL 278.A O LYS 282.A H 2.957 2.130 LYS 282.A NZ GLU 146.A OE1 LYS 282.A HZ3 2.706 2.057 LYS 282.A NZ GLU 146.A OE2 LYS 282.A HZ1 3.424 2.790 ASN 283.A N ASN 279.A O ASN 283.A H 2.758 1.988 HIS 284.A N ILE 281.A O HIS 284.A H 3.104 2.250 HIS 284.A NE2 ASP 257.A OD2 HIS 284.A HE2 2.751 1.925 TRP 286.A N HIS 284.A ND1 TRP 286.A H 2.985 2.137 TRP 286.A NE1 GLU 131.A OE1 TRP 286.A HE1 2.872 2.037 PHE 287.A N HIS 284.A O PHE 287.A H 2.891 2.099 ALA 288.A N LYS 285.A O ALA 288.A H 2.969 2.129 THR 290.A N PHE 287.A O THR 290.A H 3.025 2.176 ALA 294.A N ASP 291.A OD2 ALA 294.A H 2.919 2.062 ILE 295.A N ASP 291.A O ILE 295.A H 2.776 1.974 TYR 296.A N TRP 292.A O TYR 296.A H 2.951 2.102 GLN 297.A N ILE 293.A O GLN 297.A H 2.979 2.175 ARG 298.A N ILE 295.A O ARG 298.A H 2.937 2.105 ARG 298.A NH1 ASP 166.A OD1 ARG 298.A HH12 3.245 2.660 ARG 298.A NH1 ASP 166.A OD2 ARG 298.A HH12 2.502 1.657 ARG 298.A NH1 GLN 168.A OE1 ARG 298.A HH11 3.498 2.849 LYS 299.A N ALA 294.A O LYS 299.A H 3.037 2.199 ASP 313.A N GLY 310.A O ASP 313.A H 3.265 2.419 SER 315.A N ASP 313.A OD2 SER 315.A H 3.039 2.222 SER 315.A OG ASP 313.A OD2 SER 315.A HG 2.853 2.068 ASN 316.A ND2 PRO 116.A O ASN 316.A HD22 3.062 2.255 PHE 317.A N THR 314.A O PHE 317.A H 2.964 2.113 LYS 331.A N ASN 105.A O LYS 331.A H 2.937 2.125 GLU 335.A N GLU 335.A OE1 GLU 335.A H 2.826 2.044 THR 337.A N LYS 334.A O THR 337.A H 3.437 2.620 THR 337.A OG1 LYS 334.A O THR 337.A HG1 3.181 2.396 PHE 339.A N PHE 336.A O PHE 339.A H 3.121 2.297