Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6fby_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N GLY 1.A O GLY 4.A H 3.062 2.208 MET 6.A N MET 3.A O MET 6.A H 3.047 2.197 ARG 8.A NH1 GLU 45.A OE2 ARG 8.A HH12 2.892 2.054 ARG 8.A NH2 GLU 45.A OE1 ARG 8.A HH22 2.815 1.957 LEU 11.A N GLU 7.A O LEU 11.A H 2.956 2.142 ILE 12.A N ARG 8.A O ILE 12.A H 3.036 2.216 GLN 13.A N ALA 9.A O GLN 13.A H 2.952 2.122 LYS 14.A N SER 10.A O LYS 14.A H 2.891 2.075 ALA 15.A N LEU 11.A O ALA 15.A H 2.859 2.055 LYS 16.A N ILE 12.A O LYS 16.A H 3.098 2.306 LEU 17.A N GLN 13.A O LEU 17.A H 3.050 2.248 ALA 18.A N LYS 14.A O ALA 18.A H 2.774 1.938 GLU 19.A N ALA 15.A O GLU 19.A H 2.946 2.141 GLN 20.A N LYS 16.A O GLN 20.A H 3.109 2.302 ALA 21.A N LEU 17.A O ALA 21.A H 2.976 2.213 GLU 22.A N GLU 19.A O GLU 22.A H.A 2.976 2.152 ARG 23.A N ALA 18.A O ARG 23.A H 2.847 1.996 ARG 23.A NE ASP 26.A OD2 ARG 23.A HE 3.004 2.278 ARG 23.A NH2 ASP 26.A OD2 ARG 23.A HH21 2.875 2.099 MET 27.A N ARG 23.A O MET 27.A H 2.930 2.108 ALA 28.A N TYR 24.A O ALA 28.A H 2.879 2.058 ALA 29.A N GLU 25.A O ALA 29.A H 3.031 2.213 PHE 30.A N ASP 26.A O PHE 30.A H 2.926 2.104 MET 31.A N MET 27.A O MET 31.A H 2.958 2.128 LYS 32.A N ALA 28.A O LYS 32.A H 2.789 1.951 LYS 32.A NZ GLU 36.A OE2 LYS 32.A HZ2 2.734 2.000 GLY 33.A N ALA 29.A O GLY 33.A H 3.027 2.191 ALA 34.A N PHE 30.A O ALA 34.A H 2.943 2.148 VAL 35.A N MET 31.A O VAL 35.A H 2.894 2.067 GLU 36.A N LYS 32.A O GLU 36.A H 3.026 2.249 LYS 37.A N ALA 34.A O LYS 37.A H 3.102 2.282 LYS 37.A NZ MET 3.A O LYS 37.A HZ3 3.463 2.758 LYS 37.A NZ MET 6.A O LYS 37.A HZ3 2.727 2.119 GLY 38.A N VAL 35.A O GLY 38.A H 3.000 2.149 GLU 40.A N.B GLU 40.A OE1.B GLU 40.A H.B 2.719 1.956 SER 42.A N GLU 45.A OE1 SER 42.A H 2.841 2.005 GLU 45.A N SER 42.A OG GLU 45.A H 3.102 2.266 ARG 46.A N SER 42.A O ARG 46.A H 2.835 2.000 ASN 47.A N CYS 43.A O.A ASN 47.A H 3.183 2.377 ASN 47.A N CYS 43.A O.B ASN 47.A H 3.146 2.340 LEU 48.A N GLU 44.A O LEU 48.A H 3.036 2.245 LEU 49.A N GLU 45.A O LEU 49.A H 2.952 2.110 SER 50.A N ARG 46.A O SER 50.A H 2.976 2.155 VAL 51.A N ASN 47.A O VAL 51.A H 2.880 2.028 ALA 52.A N LEU 48.A O ALA 52.A H 3.016 2.176 TYR 53.A N LEU 49.A O TYR 53.A H 3.226 2.374 LYS 54.A N.A SER 50.A O LYS 54.A H.A 2.869 2.036 LYS 54.A N.B SER 50.A O LYS 54.A H.B 2.865 2.027 ASN 55.A N VAL 51.A O ASN 55.A H.B 3.091 2.280 ASN 55.A ND2 VAL 51.A O ASN 55.A HD22 2.893 2.033 VAL 56.A N ALA 52.A O VAL 56.A H 3.118 2.294 VAL 57.A N TYR 53.A O VAL 57.A H.A 2.843 1.989 GLY 58.A N LYS 54.A O.A GLY 58.A H 2.870 2.139 GLY 58.A N LYS 54.A O.B GLY 58.A H 2.750 1.998 GLY 59.A N ASN 55.A O GLY 59.A H 3.202 2.388 GLN 60.A N VAL 56.A O GLN 60.A H 3.302 2.482 GLN 60.A NE2 GLU 88.A OE2.B GLN 60.A HE21 2.803 1.946 ARG 61.A N VAL 57.A O ARG 61.A H 2.780 1.941 ARG 61.A NE GLU 130.A OE1 ARG 61.A HE 2.954 2.151 ARG 61.A NH2 GLU 130.A OE1 ARG 61.A HH21 3.416 2.736 ARG 61.A NH2 GLU 130.A OE2 ARG 61.A HH21 2.961 2.148 ALA 62.A N GLY 58.A O ALA 62.A H 3.019 2.188 ALA 63.A N GLY 59.A O ALA 63.A H 3.051 2.224 TRP 64.A N GLN 60.A O TRP 64.A H 2.828 1.986 TRP 64.A NE1 GLU 86.A OE1 TRP 64.A HE1 2.871 2.030 ARG 65.A N ARG 61.A O ARG 65.A H.B 2.924 2.112 ARG 65.A NH2.B GLU 130.A OE1 ARG 65.A HH21.B 3.552 2.732 VAL 66.A N ALA 62.A O VAL 66.A H 3.108 2.286 LEU 67.A N ALA 63.A O LEU 67.A H 2.944 2.110 SER 68.A N TRP 64.A O SER 68.A H.A 2.784 1.962 SER 69.A N ARG 65.A O SER 69.A H.C 3.020 2.207 SER 69.A OG.A ARG 65.A O SER 69.A HG.A 3.015 2.289 ILE 70.A N VAL 66.A O ILE 70.A H 3.063 2.221 GLU 71.A N LEU 67.A O GLU 71.A H 2.859 2.034 GLN 72.A N SER 68.A O GLN 72.A H 2.836 2.029 LYS 73.A N SER 69.A O LYS 73.A H 3.028 2.205 SER 74.A N ILE 70.A O SER 74.A H 3.104 2.323 SER 74.A OG GLU 71.A O SER 74.A HG 2.833 2.117 GLU 77.A N GLU 77.A OE1 GLU 77.A H 2.770 2.037 ARG 79.A NH1 GLU 83.A OE2.A ARG 79.A HH11 3.259 2.429 GLU 80.A N PRO 76.A O GLU 80.A H 2.945 2.106 TYR 81.A N GLU 77.A O TYR 81.A H 2.972 2.151 ARG 82.A N VAL 78.A O ARG 82.A H 2.881 2.025 ARG 82.A NE GLU 71.A OE1 ARG 82.A HE 2.735 1.908 ARG 82.A NH1 GLU 86.A OE1 ARG 82.A HH11 2.917 2.210 ARG 82.A NH2 GLU 71.A OE1 ARG 82.A HH21 3.448 2.839 ARG 82.A NH2 GLU 71.A OE2 ARG 82.A HH21 2.936 2.078 GLU 83.A N ARG 79.A O GLU 83.A H.A 2.793 1.968 LYS 84.A N GLU 80.A O LYS 84.A H 2.920 2.143 LYS 84.A NZ GLU 88.A OE1.A LYS 84.A HZ1 3.202 2.574 VAL 85.A N TYR 81.A O VAL 85.A H 2.998 2.162 GLU 86.A N ARG 82.A O GLU 86.A H 2.843 2.004 THR 87.A N GLU 83.A O THR 87.A H.A 2.858 2.029 THR 87.A OG1.A GLU 83.A O THR 87.A HG1.A 2.949 2.190 THR 87.A OG1.A GLU 83.A OE1.B THR 87.A HG1.A 3.347 2.729 GLU 88.A N.A LYS 84.A O GLU 88.A H.A 3.125 2.307 GLU 88.A N.B LYS 84.A O GLU 88.A H.B 3.098 2.263 LEU 89.A N VAL 85.A O LEU 89.A H.A 2.900 2.064 GLN 90.A N GLU 86.A O GLN 90.A H 2.877 2.037 GLY 91.A N THR 87.A O GLY 91.A H 2.903 2.119 VAL 92.A N GLU 88.A O.A VAL 92.A H 3.049 2.260 VAL 92.A N GLU 88.A O.B VAL 92.A H 3.029 2.246 CYS 93.A N LEU 89.A O CYS 93.A H 2.996 2.150 ASP 94.A N GLN 90.A O ASP 94.A H 2.853 2.014 THR 95.A N GLY 91.A O THR 95.A H 2.961 2.163 THR 95.A OG1 GLY 91.A O THR 95.A HG1 3.083 2.324 VAL 96.A N VAL 92.A O VAL 96.A H 2.980 2.154 LEU 97.A N CYS 93.A O LEU 97.A H 2.880 2.026 GLY 98.A N ASP 94.A O GLY 98.A H 2.872 2.069 LEU 99.A N THR 95.A O LEU 99.A H 2.965 2.154 LEU 100.A N VAL 96.A O LEU 100.A H 2.925 2.094 ASP 101.A N LEU 97.A O ASP 101.A H.B 2.905 2.090 SER 102.A N.A GLY 98.A O SER 102.A H.A 2.839 2.014 SER 102.A N.B GLY 98.A O SER 102.A H.B 2.835 2.009 SER 102.A OG.B GLY 98.A O SER 102.A HG.B 2.580 1.795 HIS 103.A N LEU 99.A O HIS 103.A H.A 2.924 2.148 LEU 104.A N LEU 99.A O LEU 104.A H 3.235 2.589 LEU 104.A N LEU 100.A O LEU 104.A H 3.220 2.470 ILE 105.A N LEU 100.A O ILE 105.A H 2.821 1.967 SER 113.A OG ASP 110.A O SER 113.A HG 3.061 2.371 ARG 114.A N.A ASP 110.A O ARG 114.A H.A 3.037 2.185 ARG 114.A N.B ASP 110.A O ARG 114.A H.B 3.039 2.188 ARG 114.A NE.A GLY 109.A O ARG 114.A HE.A 2.758 2.100 ARG 114.A NH1.A GLU 158.A OE2 ARG 114.A HH12.A 3.162 2.405 ARG 114.A NH2.A GLY 109.A O ARG 114.A HH22.A 3.157 2.603 ARG 114.A NH2.A GLU 158.A OE1 ARG 114.A HH21.A 2.822 2.089 ARG 114.A NH2.A GLU 158.A OE2 ARG 114.A HH21.A 3.334 2.625 VAL 115.A N ALA 111.A O VAL 115.A H 2.898 2.042 PHE 116.A N GLU 112.A O.A PHE 116.A H 3.005 2.175 PHE 116.A N GLU 112.A O.B PHE 116.A H 2.888 2.049 TYR 117.A N SER 113.A O TYR 117.A H 3.009 2.186 LEU 118.A N ARG 114.A O.A LEU 118.A H 3.042 2.198 LEU 118.A N ARG 114.A O.B LEU 118.A H 3.050 2.207 LYS 119.A N VAL 115.A O LYS 119.A H 2.900 2.044 LYS 119.A NZ ASP 123.A OD2 LYS 119.A HZ1 2.789 2.002 MET 120.A N PHE 116.A O MET 120.A H 3.045 2.233 LYS 121.A N TYR 117.A O LYS 121.A H 2.902 2.097 LYS 121.A NZ ASP 101.A OD1.B LYS 121.A HZ3 3.099 2.262 GLY 122.A N LEU 118.A O GLY 122.A H 2.992 2.165 ASP 123.A N LYS 119.A O ASP 123.A H 2.856 2.040 TYR 124.A N MET 120.A O TYR 124.A H 2.964 2.150 TYR 125.A N LYS 121.A O TYR 125.A H 3.023 2.167 ARG 126.A N GLY 122.A O ARG 126.A H 2.833 2.019 ARG 126.A NE TYR 148.A OH ARG 126.A HE 2.929 2.074 ARG 126.A NH2 ASP 123.A OD1 ARG 126.A HH21 3.116 2.302 ARG 126.A NH2 TYR 148.A OH ARG 126.A HH21 3.500 2.824 TYR 127.A N ASP 123.A O TYR 127.A H 2.882 2.128 LEU 128.A N TYR 124.A O LEU 128.A H 3.098 2.272 ALA 129.A N TYR 125.A O ALA 129.A H 2.834 2.055 GLU 130.A N ARG 126.A O GLU 130.A H 2.989 2.272 VAL 131.A N LEU 128.A O VAL 131.A H 3.215 2.443 ALA 132.A N ALA 129.A O ALA 132.A H 3.289 2.492 LYS 137.A N THR 133.A O LYS 137.A H 3.074 2.279 LYS 137.A NZ ALA 129.A O LYS 137.A HZ2 2.863 2.135 ARG 139.A N ASP 135.A O ARG 139.A H 3.139 2.361 ILE 140.A N ASP 136.A O ILE 140.A H 3.148 2.317 ILE 141.A N LYS 137.A O ILE 141.A H 2.827 1.992 ASP 142.A N LYS 138.A O ASP 142.A H 3.017 2.221 SER 143.A N ARG 139.A O SER 143.A H 2.975 2.180 SER 143.A OG ARG 139.A O SER 143.A HG 3.281 2.534 ALA 144.A N ILE 140.A O ALA 144.A H 2.998 2.170 ARG 145.A N ILE 141.A O ARG 145.A H.B 2.984 2.140 ARG 145.A NE.A ASP 142.A OD1 ARG 145.A HE.A 2.879 2.046 ARG 145.A NH1.A ASP 142.A OD1 ARG 145.A HH11.A 3.381 2.707 ARG 145.A NH1.A ASP 142.A OD2 ARG 145.A HH11.A 3.174 2.321 SER 146.A N ASP 142.A O SER 146.A H.A 2.891 2.067 SER 146.A OG.B ASP 142.A O SER 146.A HG.B 2.969 2.202 ALA 147.A N SER 143.A O ALA 147.A H 3.158 2.332 TYR 148.A N ALA 144.A O TYR 148.A H 2.949 2.091 TYR 148.A OH ASP 123.A OD1 TYR 148.A HH 2.596 1.777 GLN 149.A N ARG 145.A O GLN 149.A H 2.780 1.969 GLN 149.A NE2 GLN 149.A O GLN 149.A HE21 3.418 2.942 GLN 149.A NE2 ASP 153.A OD1 GLN 149.A HE21 3.071 2.273 GLU 150.A N SER 146.A O GLU 150.A H 3.037 2.200 ALA 151.A N ALA 147.A O ALA 151.A H 3.053 2.212 MET 152.A N TYR 148.A O MET 152.A H.A 2.817 2.006 ASP 153.A N GLN 149.A O ASP 153.A H 2.968 2.169 ILE 154.A N GLU 150.A O ILE 154.A H 3.140 2.301 SER 155.A N.A ALA 151.A O SER 155.A H.A 2.893 2.090 SER 155.A N.B ALA 151.A O SER 155.A H.B 2.891 2.064 SER 155.A OG.A ALA 151.A O SER 155.A HG.A 3.437 2.909 SER 155.A OG.A MET 152.A O SER 155.A HG.A 2.933 2.173 SER 155.A OG.B ALA 151.A O SER 155.A HG.B 2.667 1.852 LYS 156.A N MET 152.A O LYS 156.A H 2.979 2.171 LYS 157.A N.A ASP 153.A O LYS 157.A H.A 3.324 2.575 LYS 157.A N.A ILE 154.A O LYS 157.A H.A 3.164 2.544 LYS 157.A N.B ASP 153.A O LYS 157.A H.B 3.325 2.571 LYS 157.A N.B ILE 154.A O LYS 157.A H.B 3.163 2.547 GLU 158.A N ILE 154.A O GLU 158.A H 2.890 2.129 MET 159.A N SER 155.A O.A MET 159.A H 3.075 2.326 MET 159.A N SER 155.A O.B MET 159.A H 2.968 2.205 ASN 163.A N PRO 160.A O ASN 163.A H 2.978 2.122 ASN 163.A ND2 GLU 112.A OE1.B ASN 163.A HD21 2.955 2.107 ILE 165.A N.B ASN 163.A OD1 ILE 165.A H.B 2.863 2.282 ARG 166.A N ASN 163.A OD1 ARG 166.A H.A 3.017 2.200 ARG 166.A NH1 MET 159.A O ARG 166.A HH11 2.846 2.216 LEU 167.A N ASN 163.A O LEU 167.A H 2.905 2.093 GLY 168.A N PRO 164.A O GLY 168.A H 2.884 2.057 LEU 169.A N ILE 165.A O.A LEU 169.A H 2.933 2.094 LEU 169.A N ILE 165.A O.B LEU 169.A H 2.950 2.114 ALA 170.A N ARG 166.A O ALA 170.A H 3.022 2.193 LEU 171.A N.A LEU 167.A O LEU 171.A H.A 2.948 2.124 LEU 171.A N.B LEU 167.A O LEU 171.A H.B 2.951 2.129 ASN 172.A N GLY 168.A O ASN 172.A H.A 3.038 2.217 ASN 172.A ND2 ASP 123.A OD1 ASN 172.A HD22 2.934 2.190 ASN 172.A ND2 ASP 123.A OD2 ASN 172.A HD22 3.417 2.697 PHE 173.A N LEU 169.A O PHE 173.A H 2.804 1.954 SER 174.A N ALA 170.A O SER 174.A H.B 2.897 2.065 VAL 175.A N LEU 171.A O.A VAL 175.A H 3.013 2.202 VAL 175.A N LEU 171.A O.B VAL 175.A H 2.975 2.162 PHE 176.A N ASN 172.A O PHE 176.A H 2.849 2.019 HIS 177.A N PHE 173.A O HIS 177.A H 2.908 2.092 TYR 178.A N SER 174.A O TYR 178.A H 2.990 2.217 GLU 179.A N VAL 175.A O GLU 179.A H 2.806 1.959 ILE 180.A N PHE 176.A O ILE 180.A H 2.958 2.144 ALA 181.A N PHE 176.A O ALA 181.A H 3.012 2.223 SER 183.A N HIS 177.A O SER 183.A H 2.837 1.997 SER 183.A OG ALA 181.A O SER 183.A HG 3.119 2.287 ALA 187.A N SER 183.A O ALA 187.A H 3.032 2.203 ILE 188.A N PRO 184.A O ILE 188.A H 2.892 2.059 SER 189.A N GLU 185.A O SER 189.A H.A 2.904 2.059 SER 189.A OG.A GLU 185.A O SER 189.A HG.A 3.161 2.465 LEU 190.A N GLU 186.A O LEU 190.A H 2.884 2.050 ALA 191.A N ALA 187.A O ALA 191.A H 2.989 2.142 LYS 192.A N ILE 188.A O LYS 192.A H.B 2.941 2.113 LYS 192.A NZ.B ASP 196.A OD2 LYS 192.A HZ1.B 2.981 2.221 THR 193.A N SER 189.A O THR 193.A H.A 2.961 2.103 THR 193.A OG1.B SER 189.A O THR 193.A HG1.B 3.085 2.362 THR 194.A N LEU 190.A O THR 194.A H 2.979 2.145 PHE 195.A N ALA 191.A O PHE 195.A H 2.942 2.098 ASP 196.A N LYS 192.A O ASP 196.A H 2.909 2.070 GLU 197.A N THR 193.A O GLU 197.A H 2.941 2.114 ALA 198.A N THR 194.A O ALA 198.A H 3.064 2.241 MET 199.A N.A PHE 195.A O MET 199.A H.A 2.891 2.040 MET 199.A N.B PHE 195.A O MET 199.A H.B 2.914 2.077 ALA 200.A N ASP 196.A O ALA 200.A H 3.147 2.346 ASP 201.A N ALA 198.A O ASP 201.A H 2.981 2.230 LEU 202.A N MET 199.A O.A LEU 202.A H 3.222 2.378 LEU 202.A N MET 199.A O.B LEU 202.A H 3.338 2.499 HIS 203.A ND1 ALA 200.A O no hydrogen 3.078 N/A THR 204.A N ASP 201.A O THR 204.A H 3.070 2.223 THR 204.A OG1 ASP 201.A O THR 204.A HG1 2.675 1.852 LEU 205.A N LEU 202.A O LEU 205.A H 2.996 2.156 SER 206.A OG.A SER 209.A OG SER 206.A HG.A 3.343 2.753 SER 209.A N SER 206.A OG.A SER 209.A H 3.199 2.341 TYR 210.A N SER 206.A O TYR 210.A H 2.842 2.019 LYS 211.A N GLU 207.A O LYS 211.A H 3.042 2.251 ASP 212.A N ASP 208.A O ASP 212.A H 3.131 2.302 SER 213.A N SER 209.A O SER 213.A H 2.922 2.085 THR 214.A N TYR 210.A O THR 214.A H 2.855 2.004 THR 214.A OG1 TYR 210.A O THR 214.A HG1 2.788 2.007 THR 214.A OG1 LYS 211.A O THR 214.A HG1 3.457 2.947 LEU 215.A N LYS 211.A O LEU 215.A H 3.057 2.250 MET 217.A N SER 213.A O MET 217.A H 2.979 2.127 GLN 218.A N THR 214.A O GLN 218.A H 2.862 2.070 LEU 219.A N LEU 215.A O LEU 219.A H 3.302 2.519 LEU 220.A N ILE 216.A O LEU 220.A H 2.996 2.186 ARG 221.A N MET 217.A O ARG 221.A H.A 2.926 2.115 ASP 222.A N GLN 218.A O ASP 222.A H 2.876 2.068 ASN 223.A N LEU 219.A O ASN 223.A H 3.105 2.304 LEU 224.A N LEU 220.A O LEU 224.A H 2.931 2.091 THR 225.A N ARG 221.A O THR 225.A H 2.838 2.012 THR 225.A OG1 ARG 221.A O THR 225.A HG1 3.094 2.316 THR 225.A OG1 ASP 222.A O THR 225.A HG1 3.212 2.689 LEU 226.A N ASP 222.A O LEU 226.A H 3.006 2.223 TRP 227.A N ASN 223.A O TRP 227.A H 2.919 2.152 THR 228.A N LEU 224.A O THR 228.A H 2.986 2.380