Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6gnl_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N THR 40.A OG1 LYS 1.A H3 2.895 2.032 LYS 1.A NZ GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ1 2.802 1.965 PHE 3.A N PHE 38.A O PHE 3.A H 2.924 2.114 GLY 4.A N GLU 7.A OE1 GLY 4.A H 3.001 2.190 ARG 5.A NH1 TRP 123.A O ARG 5.A HH11 2.937 2.098 ARG 5.A NH1 ARG 125.A O ARG 5.A HH12 2.835 2.022 ARG 5.A NH2 ARG 125.A O ARG 5.A HH22 3.093 2.372 LEU 8.A N GLY 4.A O LEU 8.A H 2.853 2.041 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 2.948 2.107 ALA 10.A N CYS 6.A O ALA 10.A H 2.934 2.125 ALA 11.A N GLU 7.A O ALA 11.A H 3.106 2.278 MET 12.A N LEU 8.A O MET 12.A H 2.817 1.961 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 2.877 2.051 LYS 13.A NZ LEU 129.A OXT LYS 13.A HZ3 2.554 1.679 ARG 14.A N ALA 10.A O ARG 14.A H 2.895 2.062 HIS 15.A N ALA 11.A O HIS 15.A H 3.040 2.261 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 2.921 2.081 LEU 17.A N MET 12.A O LEU 17.A H 2.997 2.140 ASN 19.A N TYR 23.A O ASN 19.A H 2.851 2.199 TYR 20.A N LEU 17.A O TYR 20.A H 3.011 2.153 GLY 22.A N ASN 19.A O GLY 22.A H 2.972 2.178 TYR 23.A N TYR 20.A O TYR 23.A H 3.036 2.183 LEU 25.A N ASP 18.A OD1 LEU 25.A H 3.008 2.279 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.914 2.245 ASN 27.A ND2 SER 24.A OG ASN 27.A HD22 3.005 2.390 VAL 29.A N LEU 25.A O VAL 29.A H 2.988 2.152 CYS 30.A N GLY 26.A O CYS 30.A H 2.896 2.047 ALA 31.A N ASN 27.A O ALA 31.A H 2.954 2.131 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 3.010 2.168 LYS 33.A N VAL 29.A O LYS 33.A H 2.897 2.084 LYS 33.A NZ ASN 37.A OD1 LYS 33.A HZ2 2.840 1.958 PHE 34.A N CYS 30.A O PHE 34.A H 3.138 2.322 GLU 35.A N ALA 31.A O GLU 35.A H 2.801 2.010 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 2.925 2.085 SER 36.A OG ALA 32.A O SER 36.A HG 3.041 2.311 ASN 37.A N LYS 33.A O ASN 37.A H 2.814 2.092 PHE 38.A N SER 36.A OG PHE 38.A H 3.112 2.491 ASN 39.A N SER 36.A O ASN 39.A H 3.064 2.244 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.839 1.995 THR 40.A OG1 LEU 84.A O THR 40.A HG1 3.111 2.561 GLN 41.A N ASN 39.A OD1 GLN 41.A H 2.976 2.145 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.226 2.369 ASN 44.A N.A ASP 52.A O ASN 44.A H.A 3.038 2.282 ASN 44.A N.B ASP 52.A O ASN 44.A H.B 3.027 2.254 ASN 44.A ND2.A GLN 57.A OE1 ASN 44.A HD22.A 2.817 1.971 ARG 45.A NH1 GLY 49.A O ARG 45.A HH11 3.371 2.623 ASN 46.A N.A SER 50.A O ASN 46.A H.A 2.779 1.919 ASN 46.A N.B SER 50.A O ASN 46.A H.B 2.773 1.919 ASN 46.A ND2.B ASP 52.A OD2 ASN 46.A HD21.B 3.192 2.371 GLY 49.A N ASN 46.A O.A GLY 49.A H 3.269 2.426 GLY 49.A N ASN 46.A O.B GLY 49.A H 2.908 2.072 SER 50.A N ASP 48.A OD1 SER 50.A H 2.917 2.068 SER 50.A OG ASP 48.A OD1 SER 50.A HG 2.583 1.799 THR 51.A N SER 60.A OG THR 51.A H 2.884 2.055 ASP 52.A N ASN 44.A O.A ASP 52.A H 2.882 2.036 ASP 52.A N ASN 44.A O.B ASP 52.A H 2.765 1.925 TYR 53.A N ILE 58.A O TYR 53.A H 2.884 2.151 TYR 53.A OH ASP 66.A OD2 TYR 53.A HH 2.591 1.838 GLY 54.A N ALA 42.A O GLY 54.A H 2.859 2.026 GLN 57.A N GLY 54.A O GLN 57.A H 2.995 2.188 GLN 57.A NE2 ALA 42.A O GLN 57.A HE22 3.075 2.401 GLN 57.A NE2 ASP 52.A O GLN 57.A HE22 3.688 3.163 GLN 57.A NE2 GLY 54.A O GLN 57.A HE21 2.920 2.062 ILE 58.A N TYR 53.A O ILE 58.A H 2.985 2.193 ASN 59.A ND2 SER 50.A OG ASN 59.A HD21 2.772 1.952 ASN 59.A ND2 ASP 52.A OD1 ASN 59.A HD22 2.814 1.958 SER 60.A N THR 51.A O SER 60.A H 2.942 2.235 SER 60.A OG ASP 66.A OD2 SER 60.A HG 3.282 2.584 ARG 61.A N ASN 59.A OD1 ARG 61.A H 2.847 2.006 ARG 61.A NH1 ASP 48.A OD2 ARG 61.A HH11 3.370 2.631 TRP 63.A N ASN 59.A O TRP 63.A H 3.080 2.280 ASN 65.A N ILE 78.A O ASN 65.A H 2.942 2.113 ARG 68.A N ASP 66.A OD1 ARG 68.A H 3.020 2.164 ARG 68.A NH2 THR 51.A OG1 ARG 68.A HH21 2.914 2.058 THR 69.A OG1 ASP 66.A OD1 THR 69.A HG1 2.716 1.938 SER 72.A OG SER 60.A O SER 72.A HG 3.432 2.684 ARG 73.A N ARG 61.A O ARG 73.A H 2.847 2.107 LEU 75.A N TRP 62.A O LEU 75.A H 2.848 2.000 CYS 76.A N TRP 63.A O CYS 76.A H 2.837 2.014 ASN 77.A N.A ASN 74.A O ASN 77.A H.A 2.900 2.090 ASN 77.A N.B ASN 74.A O ASN 77.A H.B 2.915 2.093 ILE 78.A N ASN 74.A OD1 ILE 78.A H.A 2.931 2.116 CYS 80.A N ASN 65.A O CYS 80.A H 2.897 2.068 ALA 82.A N PRO 79.A O ALA 82.A H 2.943 2.196 LEU 83.A N CYS 80.A O LEU 83.A H 2.872 2.069 LEU 84.A N SER 81.A O LEU 84.A H 2.982 2.131 SER 85.A OG.B ASP 87.A O SER 85.A HG.B 2.656 2.003 ASP 87.A N SER 85.A OG.A ASP 87.A H 2.988 2.164 THR 89.A N ASP 87.A OD1 THR 89.A H 2.919 2.070 THR 89.A OG1 ASP 87.A OD1 THR 89.A HG1 2.589 1.818 VAL 92.A N ILE 88.A O VAL 92.A H 2.881 2.059 ASN 93.A N THR 89.A O ASN 93.A H 2.899 2.055 CYS 94.A N ALA 90.A O CYS 94.A H 3.015 2.181 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 2.816 1.970 LYS 96.A N VAL 92.A O LYS 96.A H 2.916 2.103 LYS 96.A NZ HIS 15.A O LYS 96.A HZ1 2.795 2.069 LYS 97.A N.B ASN 93.A O LYS 97.A H.B 3.415 2.607 ILE 98.A N CYS 94.A O ILE 98.A H.A 2.962 2.168 VAL 99.A N ALA 95.A O VAL 99.A H 2.895 2.045 SER 100.A N LYS 97.A O.A SER 100.A H 3.253 2.534 SER 100.A N LYS 97.A O.B SER 100.A H 2.858 2.114 SER 100.A OG LYS 96.A O SER 100.A HG 2.750 2.048 ASP 101.A N ILE 98.A O ASP 101.A H 3.058 2.222 ASN 106.A N ASN 103.A O ASN 106.A H 3.125 2.379 ASN 106.A ND2 ASN 103.A O ASN 106.A HD22 2.990 2.218 ALA 107.A N GLY 104.A O ALA 107.A H 3.372 2.512 TRP 108.A N MET 105.A O TRP 108.A H 2.936 2.114 TRP 108.A NE1 LEU 56.A O TRP 108.A HE1 2.821 2.108 TRP 111.A NE1 ASN 27.A OD1 TRP 111.A HE1 2.873 2.059 ARG 112.A N TRP 108.A O ARG 112.A H 3.081 2.269 ASN 113.A N VAL 109.A O ASN 113.A H 2.879 2.081 ARG 114.A N ALA 110.A O ARG 114.A H 2.872 2.156 CYS 115.A N TRP 111.A O CYS 115.A H 2.875 2.055 LYS 116.A N TRP 111.A O LYS 116.A H 2.834 2.009 LYS 116.A NZ ASN 106.A OD1 LYS 116.A HZ2 2.919 2.039 THR 118.A N CYS 115.A O THR 118.A H 2.969 2.119 THR 118.A OG1 CYS 115.A O THR 118.A HG1 2.730 1.912 ALA 122.A N ASP 119.A O ALA 122.A H 3.107 2.290 TRP 123.A N VAL 120.A O TRP 123.A H 2.940 2.104 ILE 124.A N GLN 121.A O ILE 124.A H 2.998 2.169 ARG 125.A N ALA 122.A O ARG 125.A H 3.220 2.384 ARG 125.A NE GLN 121.A OE1 ARG 125.A HE 2.871 2.224 ARG 125.A NH1 ASP 119.A OD2 ARG 125.A HH12 2.792 2.126 ARG 125.A NH1 GLN 121.A OE1 ARG 125.A HH11 3.327 2.783 CYS 127.A N ILE 124.A O CYS 127.A H 3.240 2.394 CYS 127.A SG ILE 124.A O no hydrogen 3.401 N/A CYS 127.A SG ARG 125.A O no hydrogen 3.786 N/A