Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6hpv_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 4.A N LEU 1.A O LEU 4.A H 2.885 2.187 HIS 5.A N GLU 45.A O HIS 5.A H 2.887 2.056 LEU 7.A N VAL 43.A O LEU 7.A H 3.150 2.316 CYS 9.A N GLU 284.A O CYS 9.A H 3.339 2.553 CYS 9.A SG VAL 40.A O no hydrogen 3.139 N/A ASP 11.A N GLY 8.A O ASP 11.A H 3.331 2.487 LEU 15.A N ASP 11.A O LEU 15.A H 2.868 2.032 ALA 16.A N SER 12.A O ALA 16.A H 2.901 2.058 VAL 17.A N GLU 13.A O VAL 17.A H 2.917 2.069 ALA 18.A N VAL 14.A O ALA 18.A H 2.862 2.047 GLY 19.A N LEU 15.A O GLY 19.A H 2.927 2.111 PHE 20.A N ALA 16.A O PHE 20.A H 2.955 2.118 ALA 21.A N VAL 17.A O ALA 21.A H 2.882 2.055 LEU 22.A N ALA 18.A O LEU 22.A H 2.907 2.111 GLN 23.A N GLY 19.A O GLN 23.A H 2.965 2.117 GLN 23.A NE2 GLY 19.A O GLN 23.A HE21 3.292 2.805 ASN 24.A N PHE 20.A O ASN 24.A H 2.930 2.107 ILE 25.A N ALA 21.A O ILE 25.A H 2.898 2.075 ASN 26.A N LEU 22.A O ASN 26.A H 2.898 2.068 ASN 26.A ND2 LEU 35.A O ASN 26.A HD21 2.987 2.143 ARG 27.A N GLN 23.A O ARG 27.A H 2.921 2.098 ASP 28.A N ASN 24.A O ASP 28.A H 2.935 2.165 GLN 29.A N ASN 26.A O GLN 29.A H 3.153 2.321 TYR 33.A OH GLU 179.A OE1 TYR 33.A HH 2.810 2.086 MET 34.A N CYS 66.A O MET 34.A H 2.700 1.867 LEU 35.A N ASN 26.A OD1 LEU 35.A H 2.944 2.085 SER 36.A N LEU 62.A O SER 36.A H 2.670 1.868 ASN 38.A N ASP 60.A O ASN 38.A H 2.816 1.981 ARG 39.A N ASP 60.A O ARG 39.A H 3.407 2.619 ARG 39.A NE ASP 60.A OD2 ARG 39.A HE 2.820 2.010 ARG 39.A NH1 GLY 287.A O ARG 39.A HH11 3.281 2.486 HIS 41.A N THR 58.A O HIS 41.A H 2.679 1.946 HIS 41.A ND1 ASP 60.A OD2 HIS 41.A HD1 2.883 2.035 HIS 41.A NE2 GLU 238.A OE2 no hydrogen 2.930 N/A ASP 42.A N THR 58.A O ASP 42.A H 3.288 2.527 ARG 44.A N TYR 56.A O ARG 44.A H 3.064 2.254 ARG 44.A NE ASP 42.A OD1 ARG 44.A HE 2.951 2.102 ARG 44.A NH1 GLU 279.A O ARG 44.A HH12 3.146 2.414 ARG 44.A NH2 ASP 42.A OD2 ARG 44.A HH21 2.794 2.027 ARG 44.A NH2 GLU 279.A O ARG 44.A HH22 3.096 2.348 GLU 45.A N HIS 5.A O GLU 45.A H 2.905 2.064 HIS 46.A N LEU 54.A O HIS 46.A H 2.947 2.093 GLN 48.A N GLY 52.A O GLN 48.A H 2.758 1.995 GLN 48.A NE2 VAL 271.A O GLN 48.A HE22 3.060 2.365 ASP 50.A N GLN 48.A O ASP 50.A H 2.759 2.022 SER 53.A N ILE 96.A O SER 53.A H 2.903 2.056 SER 53.A OG GLU 45.A OE2 SER 53.A HG 2.660 1.962 LEU 54.A N HIS 46.A O LEU 54.A H 2.989 2.191 PHE 55.A N PHE 94.A O PHE 55.A H 2.704 1.850 TYR 56.A N ARG 44.A O TYR 56.A H 2.731 1.880 LEU 57.A N ALA 92.A O LEU 57.A H 2.721 1.863 THR 58.A N ASP 42.A O THR 58.A H 2.903 2.048 LEU 59.A N CYS 90.A O LEU 59.A H 2.714 1.899 ASP 60.A N ARG 39.A O ASP 60.A H 2.953 2.115 VAL 61.A N GLY 88.A O VAL 61.A H 3.101 2.253 LEU 62.A N SER 36.A O LEU 62.A H 2.833 2.024 GLU 63.A N VAL 86.A O GLU 63.A H 2.760 1.922 THR 64.A N MET 34.A O THR 64.A H 2.875 2.024 THR 64.A OG1 MET 34.A O THR 64.A HG1 2.711 1.872 CYS 66.A SG ASP 76.A O no hydrogen 3.596 N/A VAL 68.A N GLY 32.A O VAL 68.A H 3.093 2.247 LEU 69.A N HIS 67.A ND1 LEU 69.A H 3.173 2.315 SER 70.A N HIS 67.A O SER 70.A H 2.919 2.149 ARG 71.A N VAL 68.A O ARG 71.A H 3.056 2.306 ARG 71.A NH1 ASN 26.A O ARG 71.A HH12 2.758 2.137 ARG 71.A NH1 GLN 29.A O ARG 71.A HH12 3.115 2.525 ARG 71.A NH2 GLN 29.A O ARG 71.A HH22 2.573 1.817 LYS 72.A NZ GLU 211.A OE2 LYS 72.A HZ1 2.720 1.863 GLN 74.A NE2 GLN 74.A O GLN 74.A HE21 3.192 2.703 ASP 76.A N ALA 73.A O ASP 76.A H 2.879 2.030 CYS 77.A SG ALA 73.A O no hydrogen 3.491 N/A ARG 80.A N GLU 63.A O ARG 80.A H 3.029 2.203 ARG 80.A NE GLU 63.A OE2 ARG 80.A HE 2.774 1.956 PHE 82.A N LEU 295.A O PHE 82.A H 2.933 2.267 GLU 84.A N MET 81.A O GLU 84.A H 2.870 2.036 SER 85.A N PHE 82.A O SER 85.A H 3.269 2.454 TYR 87.A N ARG 113.A O TYR 87.A H 3.090 2.265 GLY 88.A N VAL 61.A O GLY 88.A H 3.270 2.500 GLN 89.A N THR 111.A O GLN 89.A H 3.095 2.311 GLN 89.A NE2 ASP 60.A OD1 GLN 89.A HE21 2.860 2.072 CYS 90.A N LEU 59.A O CYS 90.A H 2.919 2.153 LYS 91.A N ASN 109.A O LYS 91.A H 2.762 1.982 LYS 91.A NZ VAL 243.A O LYS 91.A HZ2 2.647 1.763 ALA 92.A N LEU 57.A O ALA 92.A H 2.884 2.082 MET 93.A N ALA 107.A O MET 93.A H 3.015 2.158 PHE 94.A N PHE 55.A O PHE 94.A H 2.883 2.097 HIS 95.A N TYR 104.A O HIS 95.A H 2.718 1.862 HIS 95.A ND1 SER 53.A O HIS 95.A HD1 3.037 2.214 ILE 96.A N SER 53.A O ILE 96.A H 3.118 2.315 ASN 97.A N VAL 102.A O ASN 97.A H 2.972 2.164 ASN 97.A ND2 ASP 50.A O ASN 97.A HD21 2.857 2.107 ASN 97.A ND2 TYR 262.A OH ASN 97.A HD22 3.071 2.324 ARG 100.A NH1 GLU 264.A OE2 ARG 100.A HH12 3.556 2.974 ARG 100.A NH2 GLU 264.A OE1 ARG 100.A HH22 3.099 2.443 ARG 100.A NH2 GLU 264.A OE2 ARG 100.A HH22 2.808 2.025 ARG 101.A N LYS 98.A O ARG 101.A H 2.869 2.108 ARG 101.A NH1 LYS 98.A O ARG 101.A HH11 2.812 2.008 VAL 102.A N ASN 97.A O VAL 102.A H 3.129 2.303 TYR 104.A N HIS 95.A O TYR 104.A H 2.949 2.258 TYR 108.A OH ASP 28.A OD2 TYR 108.A HH 2.558 1.738 ASN 109.A N LYS 91.A O ASN 109.A H 2.908 2.195 ASN 109.A ND2 GLN 244.A O no hydrogen 2.624 N/A CYS 110.A N SER 227.A O CYS 110.A H 2.890 2.066 THR 111.A N GLN 89.A O THR 111.A H 2.896 2.065 THR 111.A OG1 PRO 242.A O THR 111.A HG1 2.783 1.961 LEU 112.A N GLN 229.A O LEU 112.A H 2.914 2.076 ARG 113.A N TYR 87.A O ARG 113.A H 2.882 2.040 ARG 113.A NE PRO 232.A O ARG 113.A HE 2.770 2.078 VAL 115.A N SER 85.A O VAL 115.A H 3.047 2.212 LYS 117.A N GLU 233.A OE1 LYS 117.A H 3.101 2.245 LYS 117.A NZ PRO 130.A O LYS 117.A HZ3 3.108 2.440 ARG 118.A NH2 ASP 235.A O ARG 118.A HH21 2.617 1.937 LYS 119.A NZ ASP 236.A OD2 LYS 119.A HZ1 3.516 2.764 THR 120.A N SER 116.A O THR 120.A H 3.140 2.289 HIS 121.A N LYS 117.A O HIS 121.A H 2.891 2.036 THR 122.A N ARG 118.A O THR 122.A H 2.903 2.132 THR 122.A OG1 ARG 118.A O THR 122.A HG1 3.167 2.443 THR 123.A N LYS 119.A O THR 123.A H 2.954 2.177 CYS 124.A N THR 120.A O CYS 124.A H 2.609 1.811 CYS 127.A N CYS 124.A O CYS 127.A H 3.206 2.355 SER 129.A N.A ASN 168.A O SER 129.A H.A 2.941 2.110 SER 129.A N.B ASN 168.A O SER 129.A H.B 2.941 2.110 ILE 131.A N ALA 166.A O ILE 131.A H 3.295 2.492 SER 134.A N ASP 132.A OD1 SER 134.A H 2.590 1.739 SER 134.A OG ASP 132.A OD1 SER 134.A HG 2.618 1.795 ASN 135.A N ASP 132.A O ASN 135.A H 2.882 2.039 SER 137.A N ASN 135.A OD1 SER 137.A H 2.724 2.057 LEU 139.A N ASN 135.A O LEU 139.A H 2.990 2.147 GLU 140.A N PRO 136.A O GLU 140.A H 2.892 2.092 ALA 141.A N SER 137.A O ALA 141.A H 2.891 2.061 ALA 142.A N ALA 138.A O ALA 142.A H 2.941 2.094 THR 143.A N LEU 139.A O THR 143.A H 2.890 2.039 THR 143.A OG1 LEU 139.A O THR 143.A HG1 2.723 1.890 GLU 144.A N GLU 140.A O GLU 144.A H 2.931 2.083 SER 145.A N ALA 141.A O SER 145.A H 2.914 2.061 LEU 146.A N ALA 142.A O LEU 146.A H 2.947 2.094 ALA 147.A N THR 143.A O ALA 147.A H 2.894 2.100 LYS 148.A N GLU 144.A O LYS 148.A H 2.960 2.127 PHE 149.A N SER 145.A O PHE 149.A H 2.953 2.100 ASN 150.A N LEU 146.A O ASN 150.A H 2.891 2.050 ASN 150.A ND2 TYR 158.A O ASN 150.A HD21 2.859 2.068 SER 151.A N ALA 147.A O SER 151.A H 2.864 2.070 SER 151.A OG LYS 148.A O SER 151.A HG 2.504 1.702 LYS 152.A N LYS 148.A O LYS 152.A H 3.068 2.361 LYS 152.A N PHE 149.A O LYS 152.A H 3.214 2.544 SER 153.A N ASN 150.A O SER 153.A H 2.915 2.069 TYR 158.A N ASN 150.A OD1 TYR 158.A H 2.797 1.979 GLU 159.A N LYS 183.A O GLU 159.A H 2.847 2.025 VAL 161.A N LEU 181.A O VAL 161.A H 2.940 2.122 LYS 162.A NZ ASP 31.A OD1 LYS 162.A HZ2 3.169 2.379 THR 164.A N GLU 179.A O THR 164.A H 2.800 1.999 LYS 165.A N GLU 179.A O LYS 165.A H 3.255 2.534 LYS 165.A NZ GLU 84.A OE1 LYS 165.A HZ3 2.696 1.952 ASN 168.A N SER 129.A O.A ASN 168.A H 2.858 2.036 ASN 168.A N SER 129.A O.B ASN 168.A H 2.862 2.040 GLN 169.A N ALA 175.A O GLN 169.A H 3.109 2.284 VAL 171.A N GLY 173.A O VAL 171.A H 2.863 2.108 ALA 175.A N GLN 169.A O ALA 175.A H 2.837 2.108 TYR 176.A N THR 200.A O TYR 176.A H 3.042 2.256 TYR 177.A N MET 167.A O TYR 177.A H 2.877 2.065 VAL 178.A N GLY 198.A O VAL 178.A H 3.004 2.166 GLU 179.A N LYS 165.A O GLU 179.A H 2.858 2.051 TYR 180.A N CYS 196.A O TYR 180.A H 3.022 2.260 TYR 180.A OH SER 145.A OG TYR 180.A HH 2.835 2.144 LEU 181.A N LYS 162.A O LEU 181.A H 3.101 2.348 ILE 182.A N GLY 194.A O ILE 182.A H 3.050 2.238 LYS 183.A N GLU 159.A O LYS 183.A H 2.914 2.087 ALA 185.A N LYS 157.A O ALA 185.A H 2.889 2.041 VAL 193.A N ILE 182.A O VAL 193.A H 2.768 1.920 ILE 195.A N GLU 211.A O ILE 195.A H 2.827 2.045 CYS 196.A N TYR 180.A O CYS 196.A H 2.806 1.966 GLN 197.A N THR 209.A O GLN 197.A H 2.749 1.921 GLY 198.A N VAL 178.A O GLY 198.A H 2.881 2.054 SER 199.A N THR 207.A O SER 199.A H 3.090 2.436 THR 200.A N TYR 176.A O THR 200.A H 3.112 2.320 VAL 201.A N SER 205.A O VAL 201.A H 3.108 2.406 LYS 204.A NZ GLU 140.A OE2 LYS 204.A HZ2 2.908 2.261 SER 205.A N VAL 201.A O SER 205.A H 3.261 2.426 THR 207.A N SER 199.A O THR 207.A H 3.130 2.330 THR 209.A N GLN 197.A O THR 209.A H 3.083 2.270 GLU 211.A N ILE 195.A O GLU 211.A H 2.845 2.030 PHE 213.A N VAL 193.A O PHE 213.A H 2.962 2.118 SER 217.A OG GLN 216.A O SER 217.A HG 2.853 2.317 SER 220.A N SER 218.A O SER 220.A H 2.501 1.782 SER 220.A OG PHE 20.A O SER 220.A HG 3.334 2.670 SER 227.A N ASN 109.A OD1 SER 227.A H 3.129 2.449 GLN 229.A N CYS 110.A O GLN 229.A H 3.022 2.182 GLN 229.A NE2 THR 111.A OG1 GLN 229.A HE21 3.015 2.157 LEU 231.A N LEU 112.A O LEU 231.A H 2.794 2.015 ASN 250.A N THR 248.A OG1 ASN 250.A H 3.080 2.282 ASN 250.A ND2 GLN 252.A OE1 ASN 250.A HD21 3.059 2.280 GLN 252.A N ASN 250.A OD1 GLN 252.A H 2.782 2.000 GLY 253.A N ASN 250.A O GLY 253.A H 2.921 2.234 ASP 254.A N VAL 272.A O ASP 254.A H 2.851 2.020 LEU 256.A N LEU 270.A O LEU 256.A H 2.652 1.834 VAL 258.A N LYS 268.A O VAL 258.A H 2.813 1.960 SER 259.A OG ASP 257.A OD1 SER 259.A HG 3.139 2.550 LEU 261.A N VAL 258.A O LEU 261.A H 3.014 2.173 TYR 262.A N SER 259.A O TYR 262.A H 3.086 2.332 GLU 264.A N GLU 264.A OE1 GLU 264.A H 2.836 2.149 LEU 270.A N LEU 256.A O LEU 270.A H 2.619 1.779 VAL 271.A N GLN 48.A OE1 VAL 271.A H 3.185 2.330 VAL 272.A N ASP 254.A O VAL 272.A H 2.755 1.920 LEU 273.A N TYR 56.A OH LEU 273.A H 2.779 1.926 PHE 275.A N ASP 246.A OD1 PHE 275.A H 3.187 2.395 LYS 278.A NZ GLU 238.A OE1 LYS 278.A HZ3 3.166 2.454 LYS 278.A NZ GLU 239.A OE2 LYS 278.A HZ2 3.210 2.518 ARG 281.A NH2 GLU 238.A OE2 ARG 281.A HH22 2.886 2.045 GLU 284.A N SER 282.A OG GLU 284.A H 3.068 2.239 CYS 285.A N SER 282.A O CYS 285.A H 2.959 2.171 CYS 285.A SG LEU 7.A O no hydrogen 3.364 N/A GLY 287.A N VAL 40.A O GLY 287.A H 2.937 2.089 LYS 290.A N ASN 38.A O LYS 290.A H 2.827 2.034 GLU 291.A N ASN 38.A OD1 GLU 291.A H 3.080 2.224 LEU 295.A N ASN 293.A OD1 LEU 295.A H 2.959 2.117 VAL 296.A N ASN 293.A O VAL 296.A H 2.954 2.096