Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6hvd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 3.A NE2 MET 1.A O GLN 3.A HE21 2.822 1.971 THR 8.A N ALA 80.A O THR 8.A H 3.051 2.210 ARG 9.A NE LYS 2.A O ARG 9.A HE 2.979 2.371 ARG 9.A NH1 LYS 2.A O ARG 9.A HH11 2.565 1.855 ARG 9.A NH1 GLU 53.A OE1 ARG 9.A HH12 2.654 1.840 ARG 9.A NH2 GLU 53.A OE1 ARG 9.A HH22 3.369 2.769 ASP 10.A N TYR 82.A O ASP 10.A H 3.305 2.504 GLU 14.A N ASN 12.A OD1 GLU 14.A H 2.939 2.108 ASP 15.A N ASN 12.A O ASP 15.A H 2.879 2.064 PHE 16.A N PRO 13.A O PHE 16.A H 3.051 2.221 TRP 17.A N PRO 13.A O TRP 17.A H 2.891 2.113 TRP 17.A NE1 ASP 79.A OD2 TRP 17.A HE1 2.989 2.131 GLU 18.A N GLN 35.A O GLU 18.A H 2.830 1.977 ILE 20.A N LYS 33.A O ILE 20.A H 2.802 1.950 LEU 23.A N VAL 31.A O LEU 23.A H 2.730 1.876 GLY 26.A N ASP 25.A OD1 GLY 26.A H 2.708 1.992 GLY 29.A N GLY 26.A O GLY 29.A H 3.059 2.273 VAL 31.A N GLY 24.A O VAL 31.A H 2.864 2.014 TYR 32.A N ALA 45.A O TYR 32.A H 2.881 2.048 LYS 33.A N GLY 21.A O LYS 33.A H 2.821 2.028 ALA 34.A N ALA 43.A O ALA 34.A H 2.754 1.911 GLN 35.A N GLU 18.A O GLN 35.A H 2.841 2.082 GLN 35.A NE2 SER 40.A O GLN 35.A HE21 3.400 2.561 ASN 36.A N VAL 41.A O ASN 36.A H 2.779 1.936 LYS 37.A N PHE 16.A O LYS 37.A H 2.786 1.938 LYS 37.A NZ GLU 14.A O LYS 37.A HZ1 3.077 2.202 GLU 38.A N ASN 36.A OD1 GLU 38.A H 2.948 2.241 THR 39.A N ASN 36.A OD1 THR 39.A H 2.862 2.052 SER 40.A N ASN 36.A O SER 40.A H 2.879 2.130 VAL 41.A N THR 39.A OG1 VAL 41.A H 3.318 2.461 ALA 43.A N ALA 34.A O ALA 43.A H 2.848 2.128 ALA 44.A N ILE 91.A O ALA 44.A H 2.840 2.103 ALA 45.A N TYR 32.A O ALA 45.A H 2.751 1.940 LYS 46.A N ILE 89.A O LYS 46.A H 2.882 2.141 LYS 46.A NZ GLU 62.A OE1 LYS 46.A HZ3 2.913 2.089 LYS 46.A NZ GLU 62.A OE2 LYS 46.A HZ3 3.273 2.475 LYS 46.A NZ ASP 156.A OD1 LYS 46.A HZ2 2.950 2.074 ILE 48.A N LEU 87.A O ILE 48.A H 2.809 2.000 THR 50.A N ASN 85.A O THR 50.A H 2.941 2.103 LYS 51.A N GLU 55.A OE1 LYS 51.A H 2.704 1.904 SER 52.A N GLU 55.A OE1 SER 52.A H 3.349 2.616 GLU 55.A N SER 52.A OG GLU 55.A H 3.109 2.278 LEU 56.A N SER 52.A O LEU 56.A H 3.174 2.346 GLU 57.A N GLU 53.A O GLU 57.A H 3.228 2.414 ASP 58.A N GLU 54.A O ASP 58.A H 3.286 2.517 TYR 59.A N GLU 55.A O TYR 59.A H 3.089 2.267 MET 60.A N LEU 56.A O MET 60.A H 2.987 2.336 MET 60.A N GLU 57.A O MET 60.A H 3.254 2.563 GLU 62.A N TYR 59.A O GLU 62.A H 3.298 2.595 ASP 64.A N.A MET 60.A O ASP 64.A H.A 2.883 2.040 ASP 64.A N.B MET 60.A O ASP 64.A H.B 2.899 2.075 ILE 65.A N VAL 61.A O ILE 65.A H.B 2.953 2.144 LEU 66.A N GLU 62.A O LEU 66.A H 2.903 2.046 ALA 67.A N ILE 63.A O ALA 67.A H 2.818 1.981 SER 68.A N ASP 64.A O.A SER 68.A H 2.862 2.151 SER 68.A N ASP 64.A O.B SER 68.A H 3.068 2.378 SER 68.A N ILE 65.A O SER 68.A H 3.117 2.470 SER 68.A OG ASP 64.A O.A SER 68.A HG 2.985 2.199 SER 68.A OG ASP 64.A O.B SER 68.A HG 2.849 2.093 SER 68.A OG ILE 65.A O SER 68.A HG 2.960 2.497 CYS 69.A N ILE 65.A O CYS 69.A H 3.099 2.383 CYS 69.A SG ILE 65.A O CYS 69.A HG 3.315 2.360 ASP 70.A N TYR 128.A OH ASP 70.A H 2.971 2.160 ASN 73.A N HIS 71.A ND1 ASN 73.A H 3.100 2.247 ASN 73.A ND2 GLN 121.A OE1 ASN 73.A HD21 2.955 2.452 ASN 73.A ND2 ILE 152.A O ASN 73.A HD22 2.960 2.105 ILE 74.A N HIS 71.A O ILE 74.A H 3.123 2.301 VAL 75.A N LEU 154.A O VAL 75.A H 3.206 2.360 LYS 76.A N GLU 92.A OE1 LYS 76.A H 2.937 2.187 LEU 78.A N LEU 90.A O LEU 78.A H 2.803 1.976 ASP 79.A N LEU 90.A O ASP 79.A H 3.222 2.426 ALA 80.A N ASP 79.A OD1 ALA 80.A H 3.010 2.350 PHE 81.A N TRP 88.A O PHE 81.A H 2.916 2.114 TYR 82.A N THR 8.A O TYR 82.A H 2.763 1.937 TYR 83.A N ASN 86.A O TYR 83.A H 2.928 2.102 ASN 86.A N TYR 83.A O ASN 86.A H 2.952 2.180 LEU 87.A N ILE 48.A O LEU 87.A H 2.804 1.971 TRP 88.A N PHE 81.A O TRP 88.A H 2.726 1.884 ILE 89.A N LYS 46.A O ILE 89.A H 2.910 2.094 LEU 90.A N ASP 79.A O LEU 90.A H 2.881 2.031 ILE 91.A N ALA 44.A O ILE 91.A H 2.798 1.978 GLU 92.A N LYS 76.A O GLU 92.A H 2.901 2.062 GLY 96.A N PHE 146.A O GLY 96.A H 2.901 2.226 GLY 97.A N CYS 94.A O GLY 97.A H 3.314 2.469 VAL 99.A N ILE 144.A O VAL 99.A H 2.913 2.160 VAL 102.A N ALA 98.A O VAL 102.A H 3.125 2.348 MET 103.A N VAL 99.A O MET 103.A H 3.101 2.269 LEU 104.A N ASP 100.A O LEU 104.A H 3.013 2.201 GLU 105.A N ALA 101.A O GLU 105.A H 2.823 1.995 LEU 106.A N VAL 102.A O LEU 106.A H 2.909 2.069 GLU 107.A N LEU 104.A O GLU 107.A H 3.205 2.505 ARG 108.A N MET 103.A O ARG 108.A H 3.141 2.456 LEU 110.A N MET 205.A O LEU 110.A H 2.912 2.171 THR 111.A N GLN 114.A OE1 THR 111.A H 2.986 2.168 GLN 114.A N THR 111.A OG1 GLN 114.A H 3.331 2.509 ILE 115.A N THR 111.A O ILE 115.A H 2.857 2.018 GLN 116.A N GLU 112.A O GLN 116.A H 2.859 2.051 GLN 116.A NE2 PHE 268.A O GLN 116.A HE21 2.820 2.050 VAL 118.A N GLN 114.A O VAL 118.A H 3.145 2.298 CYS 119.A N ILE 115.A O CYS 119.A H 2.742 1.905 LYS 120.A N GLN 116.A O LYS 120.A H 3.006 2.153 LYS 120.A NZ ASP 124.A OD1 LYS 120.A HZ2 3.243 2.473 GLN 121.A N VAL 117.A O GLN 121.A H 3.048 2.200 GLN 121.A NE2 ASP 151.A OD1 GLN 121.A HE22 2.997 2.197 THR 122.A N VAL 118.A O THR 122.A H 2.802 1.966 THR 122.A OG1 VAL 118.A O THR 122.A HG1 2.768 2.128 LEU 123.A N CYS 119.A O LEU 123.A H 2.820 1.977 ASP 124.A N LYS 120.A O ASP 124.A H 2.910 2.117 ALA 125.A N GLN 121.A O ALA 125.A H 3.065 2.259 LEU 126.A N THR 122.A O LEU 126.A H 2.795 1.955 ASN 127.A N LEU 123.A O ASN 127.A H 2.841 1.996 ASN 127.A ND2 THR 260.A OG1 ASN 127.A HD22 2.761 1.917 ASN 127.A ND2 SER 261.A OG.B ASN 127.A HD21 3.341 2.644 TYR 128.A N ASP 124.A O TYR 128.A H 3.143 2.314 LEU 129.A N ALA 125.A O LEU 129.A H 3.020 2.187 HIS 130.A N LEU 126.A O HIS 130.A H 2.868 2.030 HIS 130.A NE2 ASP 194.A OD2 HIS 130.A HE2 2.862 2.007 ASP 131.A N ASN 127.A O ASP 131.A H 2.899 2.066 ASN 132.A N TYR 128.A O ASN 132.A H 3.103 2.387 ASN 132.A N LEU 129.A O ASN 132.A H 2.932 2.299 ASN 132.A ND2 TYR 128.A O ASN 132.A HD22 2.814 1.980 LYS 133.A N HIS 130.A O LYS 133.A H 2.846 2.001 LYS 133.A NZ ASP 186.A OD2 LYS 133.A HZ2 2.609 1.757 ILE 134.A N LEU 129.A O ILE 134.A H 2.863 2.008 ILE 135.A N ALA 161.A O ILE 135.A H 2.894 2.067 HIS 136.A N ASP 194.A OD2 HIS 136.A H 2.866 2.069 HIS 136.A NE2 ALA 155.A O HIS 136.A HE2 2.863 2.040 ARG 137.A N ASP 194.A OD1 ARG 137.A H 2.939 2.088 ARG 137.A NH1 VAL 159.A O ARG 137.A HH11 2.940 2.104 ASP 138.A N HIS 136.A ND1 ASP 138.A H 2.961 2.148 ALA 141.A N GLU 204.A OE2 ALA 141.A H 2.966 2.123 ASN 143.A N LYS 140.A O ASN 143.A H 3.004 2.169 ASN 143.A ND2 ASP 138.A O ASN 143.A HD22 2.771 1.929 ASN 143.A ND2 ASP 138.A OD2 ASN 143.A HD21 3.097 2.452 ILE 144.A N ALA 141.A O ILE 144.A H 3.255 2.405 LEU 145.A N LYS 153.A O LEU 145.A H 2.849 2.004 PHE 146.A N GLY 97.A O PHE 146.A H 2.885 2.041 THR 147.A N ASP 151.A O THR 147.A H 2.780 1.943 ASP 149.A N THR 147.A OG1 ASP 149.A H 3.239 2.565 GLY 150.A N THR 147.A O GLY 150.A H 3.110 2.262 ASP 151.A N THR 147.A OG1 ASP 151.A H 3.070 2.255 ILE 152.A N GLN 121.A OE1 ILE 152.A H 2.961 2.131 LYS 153.A N LEU 145.A O LYS 153.A H 2.782 2.003 LYS 153.A NZ PRO 72.A O LYS 153.A HZ1 2.778 2.118 LEU 154.A N ASN 73.A O LEU 154.A H 2.797 1.951 ALA 155.A N ASN 143.A O ALA 155.A H 2.859 2.041 GLY 158.A N ASP 156.A OD1 GLY 158.A H 3.027 2.237 SER 160.A N PHE 157.A O SER 160.A H 3.172 2.353 SER 160.A OG HIS 136.A O SER 160.A HG 2.604 1.783 ALA 161.A N ILE 135.A O ALA 161.A H 3.040 2.238 ASN 163.A N LYS 133.A O ASN 163.A H 2.994 2.195 ASN 163.A ND2 LYS 185.A O ASN 163.A HD22 3.071 2.301 ASN 163.A ND2 ASP 190.A OD2 ASN 163.A HD21 3.012 2.169 ARG 165.A N LYS 162.A O ARG 165.A H 2.910 2.060 MET 174.A N PRO 171.A O MET 174.A H 3.043 2.190 GLU 177.A N GLU 177.A OE1 GLU 177.A H 2.798 1.989 VAL 178.A N ALA 175.A O VAL 178.A H 3.025 2.377 VAL 179.A N ALA 175.A O VAL 179.A H 3.071 2.240 MET 180.A N PRO 176.A O MET 180.A H 2.809 1.987 CYS 181.A N VAL 178.A O CYS 181.A H 3.226 2.394 GLU 182.A N GLU 177.A O GLU 182.A H 2.836 2.026 THR 183.A N ASP 186.A OD1 THR 183.A H 3.015 2.222 THR 183.A OG1 ASP 186.A OD1 THR 183.A HG1 2.660 1.821 LYS 185.A N THR 183.A OG1 LYS 185.A H 3.165 2.492 ASP 186.A N THR 183.A O ASP 186.A H 2.954 2.187 ARG 187.A N SER 184.A O ARG 187.A H 3.179 2.358 TYR 191.A OH LYS 185.A O TYR 191.A HH 2.760 1.976 LYS 192.A N PRO 188.A O LYS 192.A H 3.295 2.573 LYS 192.A N TYR 189.A O LYS 192.A H 3.199 2.494 LYS 192.A NZ VAL 254.A O LYS 192.A HZ3 2.954 2.274 LYS 192.A NZ ARG 257.A O LYS 192.A HZ3 2.975 2.415 ALA 193.A N ASP 190.A O ALA 193.A H 3.213 2.378 ASP 194.A N TYR 191.A O ASP 194.A H 3.049 2.292 TRP 196.A N LYS 192.A O TRP 196.A H 3.118 2.302 SER 197.A N ALA 193.A O SER 197.A H 3.131 2.287 SER 197.A OG ALA 193.A O SER 197.A HG 3.332 2.580 LEU 198.A N ASP 194.A O LEU 198.A H 2.853 2.050 GLY 199.A N VAL 195.A O GLY 199.A H 3.114 2.318 ILE 200.A N TRP 196.A O ILE 200.A H 3.052 2.249 THR 201.A N SER 197.A O THR 201.A H 2.912 2.096 THR 201.A OG1 SER 197.A O THR 201.A HG1 2.826 2.027 LEU 202.A N LEU 198.A O LEU 202.A H 2.878 2.145 LEU 202.A N GLY 199.A O LEU 202.A H 3.136 2.537 ILE 203.A N GLY 199.A O ILE 203.A H 3.165 2.340 GLU 204.A N ILE 200.A O GLU 204.A H 2.851 2.018 MET 205.A N THR 201.A O MET 205.A H 2.955 2.169 ALA 206.A N LEU 202.A O ALA 206.A H 2.981 2.254 GLU 207.A N GLU 204.A O GLU 207.A H 3.365 2.579 HIS 213.A N PRO 210.A O HIS 213.A H 3.295 2.595 HIS 213.A ND1 PRO 210.A O no hydrogen 3.186 N/A GLU 214.A N GLU 214.A OE1 GLU 214.A H 2.631 1.812 LEU 215.A N HIS 212.A O LEU 215.A H 2.878 2.026 MET 218.A N ASN 216.A OD1 MET 218.A H 2.785 2.069 VAL 220.A N ASN 216.A O VAL 220.A H 2.865 2.095 LEU 221.A N PRO 217.A O LEU 221.A H 3.169 2.375 LEU 222.A N MET 218.A O LEU 222.A H 3.356 2.555 LYS 223.A N ARG 219.A O LYS 223.A H 2.927 2.112 ILE 224.A N VAL 220.A O ILE 224.A H 2.851 2.005 ALA 225.A N LEU 221.A O ALA 225.A H 3.178 2.367 LYS 226.A N LEU 222.A O LYS 226.A H 3.008 2.254 SER 227.A N LYS 223.A O SER 227.A H 2.770 1.933 SER 227.A OG LYS 223.A O SER 227.A HG 3.047 2.473 ALA 233.A N GLU 207.A OE2 ALA 233.A H 2.685 1.838 ARG 237.A N GLN 234.A O ARG 237.A H 3.099 2.249 TRP 238.A N PRO 235.A O TRP 238.A H 3.328 2.506 SER 239.A N GLU 112.A OE2 SER 239.A H 2.954 2.130 PHE 242.A N SER 239.A OG PHE 242.A H 2.993 2.144 LYS 243.A N SER 239.A O LYS 243.A H 2.980 2.135 LYS 243.A NZ PRO 235.A O LYS 243.A HZ2 2.880 2.016 ASP 244.A N SER 240.A O ASP 244.A H 2.825 2.025 PHE 245.A N ASN 241.A O PHE 245.A H 2.900 2.056 LEU 246.A N PHE 242.A O LEU 246.A H 3.015 2.175 LYS 247.A N LYS 243.A O LYS 247.A H 3.054 2.278 LYS 248.A N ASP 244.A O LYS 248.A H 3.147 2.424 LYS 248.A N PHE 245.A O LYS 248.A H 3.044 2.392 CYS 249.A N PHE 245.A O CYS 249.A H 3.206 2.504 CYS 249.A N LEU 246.A O CYS 249.A H 3.070 2.415 LEU 250.A N LEU 246.A O LEU 250.A H 2.706 1.865 LYS 252.A NZ ALA 225.A O LYS 252.A HZ1 2.703 1.834 LYS 252.A NZ SER 227.A O LYS 252.A HZ2 2.750 1.927 ASN 253.A N GLU 251.A OE2 ASN 253.A H 2.949 2.122 ALA 256.A N ASN 253.A O ALA 256.A H.A 3.069 2.456 ALA 256.A N ASN 253.A OD1 ALA 256.A H.A 3.051 2.298 ARG 257.A N ASN 253.A O ARG 257.A H 2.990 2.239 ARG 257.A NE GLU 251.A O ARG 257.A HE 2.845 2.052 ARG 257.A NH1 LYS 192.A O ARG 257.A HH11 2.873 2.068 ARG 257.A NH2 GLU 251.A O ARG 257.A HH21 2.876 2.114 TRP 258.A N LYS 248.A O TRP 258.A H 3.078 2.229 THR 259.A N GLN 262.A OE1 THR 259.A H 2.875 2.048 GLN 262.A N THR 259.A OG1 GLN 262.A H 3.053 2.225 LEU 263.A N THR 259.A O LEU 263.A H 2.989 2.169 LEU 264.A N THR 260.A O LEU 264.A H 2.953 2.200 GLN 265.A N GLN 262.A O GLN 265.A H 3.066 2.251 HIS 266.A N LEU 263.A O HIS 266.A H 3.023 2.176 HIS 266.A NE2 ASP 244.A OD2 HIS 266.A HE2 2.731 1.899 PHE 268.A N HIS 266.A ND1 PHE 268.A H 3.029 2.171 VAL 269.A N HIS 266.A O VAL 269.A H 3.043 2.212 THR 270.A N PRO 267.A O THR 270.A H 3.279 2.434 ASN 274.A ND2 ASP 149.A O ASN 274.A HD21 3.358 2.895 ASN 274.A ND2 ASP 151.A OD1 ASN 274.A HD22 2.875 2.058 LYS 275.A N SER 273.A OG LYS 275.A H 2.972 2.124 ILE 277.A N ASN 274.A O ILE 277.A H 2.891 2.185 ARG 278.A N ASN 274.A O ARG 278.A H 3.077 2.259 ARG 278.A NE ASN 274.A OD1 ARG 278.A HE 2.864 2.304 ARG 278.A NH2 ASN 274.A OD1 ARG 278.A HH21 2.915 2.377 GLU 279.A N LYS 275.A O GLU 279.A H 2.806 1.989 LEU 280.A N PRO 276.A O LEU 280.A H 3.047 2.265 ILE 281.A N ILE 277.A O ILE 281.A H 2.947 2.115 ALA 282.A N ARG 278.A O ALA 282.A H 2.896 2.168 GLU 283.A N GLU 279.A O GLU 283.A H 3.110 2.255 ALA 284.A N LEU 280.A O ALA 284.A H 3.382 2.590 LYS 285.A N ILE 281.A O LYS 285.A H 3.345 2.621 ALA 286.A N GLU 283.A O ALA 286.A H 3.046 2.340