Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6i2d_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 4.A N LYS 1.A O GLN 4.A H 3.054 2.443 GLU 5.A N GLY 2.A O GLU 5.A H 3.243 2.414 VAL 7.A N GLU 3.A O VAL 7.A H 3.002 2.306 LYS 8.A N GLN 4.A O LYS 8.A H 3.007 2.202 GLU 9.A N GLU 5.A O GLU 9.A H 3.005 2.175 PHE 10.A N SER 6.A O PHE 10.A H 2.919 2.078 LEU 11.A N VAL 7.A O LEU 11.A H 2.953 2.171 ALA 12.A N LYS 8.A O ALA 12.A H 3.066 2.231 LYS 13.A N GLU 9.A O LYS 13.A H 3.039 2.203 ALA 14.A N PHE 10.A O ALA 14.A H 2.880 2.065 LYS 15.A N LEU 11.A O LYS 15.A H 2.888 2.091 GLU 16.A N ALA 12.A O GLU 16.A H 3.177 2.341 GLU 17.A N LYS 13.A O GLU 17.A H 2.984 2.165 PHE 18.A N ALA 14.A O PHE 18.A H 2.814 2.017 LEU 19.A N LYS 15.A O LEU 19.A H 2.926 2.090 LYS 20.A N GLU 16.A O LYS 20.A H 3.211 2.421 LYS 21.A N GLU 17.A O LYS 21.A H 3.356 2.505 TRP 22.A N PHE 18.A O TRP 22.A H 2.642 1.866 GLU 23.A N LEU 19.A O GLU 23.A H 2.792 1.960 SER 24.A N LYS 20.A O SER 24.A H 3.144 2.392 SER 26.A N GLN 88.A OE1 SER 26.A H 2.772 1.986 GLN 27.A NE2 THR 337.A O GLN 27.A HE22 3.415 2.843 GLN 27.A NE2 PHE 339.A O GLN 27.A HE21 2.798 1.981 THR 29.A N SER 101.A O THR 29.A H 2.835 2.042 HIS 34.A N GLN 31.A O HIS 34.A H 2.914 2.082 PHE 35.A N LEU 32.A O PHE 35.A H 2.905 2.064 ASP 36.A N LYS 53.A O ASP 36.A H 2.834 1.977 ARG 37.A NH1 GLU 323.A O ARG 37.A HH12 2.874 2.146 ARG 37.A NH2 GLU 322.A OE1 ARG 37.A HH21 3.015 2.232 ARG 37.A NH2 GLU 323.A O ARG 37.A HH22 2.744 1.967 ILE 38.A N LEU 51.A O ILE 38.A H 2.882 2.081 LYS 39.A N LEU 51.A O LYS 39.A H 3.360 2.596 LYS 39.A NZ ASP 319.A OD1 LYS 39.A HZ1 2.542 1.713 THR 40.A N GLU 322.A OE2 THR 40.A H 2.666 1.820 THR 40.A OG1 GLU 322.A OE1 THR 40.A HG1 2.634 1.872 LEU 41.A N VAL 49.A O LEU 41.A H 2.788 1.954 GLY 42.A N VAL 49.A O GLY 42.A H 3.328 2.613 GLY 44.A N GLY 47.A O GLY 44.A H 2.836 2.124 GLY 47.A N GLY 44.A O GLY 47.A H 3.412 2.596 ARG 48.A N ILE 65.A O ARG 48.A H 2.928 2.145 ARG 48.A NH1 GLU 323.A O ARG 48.A HH12 2.864 2.171 ARG 48.A NH1 GLU 324.A O ARG 48.A HH12 3.261 2.622 ARG 48.A NH2 GLU 324.A O ARG 48.A HH22 2.877 2.130 VAL 49.A N GLY 42.A O VAL 49.A H 2.922 2.091 MET 50.A N MET 63.A O MET 50.A H 2.869 2.050 LEU 51.A N LYS 39.A O LEU 51.A H 2.737 1.946 VAL 52.A N TYR 61.A O VAL 52.A H 2.941 2.101 LYS 53.A N ASP 36.A O LYS 53.A H 2.874 2.100 HIS 54.A N ASN 59.A O HIS 54.A H 2.835 2.016 LYS 55.A N HIS 34.A O LYS 55.A H 3.082 2.224 GLU 56.A N HIS 54.A ND1 GLU 56.A H 3.034 2.399 THR 57.A N HIS 54.A ND1 THR 57.A H 3.389 2.565 GLY 58.A N HIS 54.A O GLY 58.A H 2.650 1.848 TYR 61.A N VAL 52.A O TYR 61.A H 2.813 2.004 ALA 62.A N MET 112.A O ALA 62.A H 2.669 1.950 MET 63.A N MET 50.A O MET 63.A H 2.810 1.960 LYS 64.A N MET 110.A O LYS 64.A H 2.657 1.844 LYS 64.A NZ GLU 83.A OE1 LYS 64.A HZ3 2.922 2.079 ILE 65.A N ARG 48.A O ILE 65.A H 2.779 1.920 LEU 66.A N LEU 108.A O LEU 66.A H 2.791 1.963 ASP 67.A N PHE 46.A O ASP 67.A H 2.841 2.055 LYS 68.A N SER 106.A O LYS 68.A H 2.940 2.096 LYS 68.A NZ ASP 104.A O LYS 68.A HZ1 2.699 1.946 LYS 68.A NZ LYS 331.A O LYS 68.A HZ2 2.937 2.087 LYS 70.A N ASP 67.A OD1 LYS 70.A H 3.196 2.396 VAL 71.A N ASP 67.A O VAL 71.A H 2.909 2.063 VAL 72.A N LYS 68.A O VAL 72.A H 2.984 2.162 LYS 73.A N GLN 69.A O LYS 73.A H 2.932 2.077 LEU 74.A N LYS 70.A O LEU 74.A H 2.848 2.028 LYS 75.A N VAL 72.A O LYS 75.A H 2.947 2.125 GLN 76.A N VAL 71.A O GLN 76.A H 2.882 2.028 GLN 76.A NE2 LEU 74.A O GLN 76.A HE21 3.310 2.479 HIS 79.A ND1 GLN 76.A OE1 HIS 79.A HD1 2.822 1.974 THR 80.A N GLN 76.A O THR 80.A H 2.903 2.072 THR 80.A OG1 GLN 76.A O THR 80.A HG1 2.905 2.158 LEU 81.A N ILE 77.A O LEU 81.A H 2.961 2.103 ASN 82.A N GLU 78.A O ASN 82.A H 2.963 2.141 ASN 82.A ND2 GLU 78.A O ASN 82.A HD22 3.624 3.012 GLU 83.A N HIS 79.A O GLU 83.A H 2.936 2.158 LYS 84.A N THR 80.A O LYS 84.A H 3.234 2.400 LYS 84.A NZ SER 26.A O LYS 84.A HZ1 2.855 2.034 LYS 84.A NZ PHE 339.A OXT LYS 84.A HZ2 2.806 2.075 ARG 85.A N LEU 81.A O ARG 85.A H 2.990 2.141 ARG 85.A NE TRP 22.A O ARG 85.A HE 3.110 2.345 ARG 85.A NH2 TRP 22.A O ARG 85.A HH21 3.000 2.214 ILE 86.A N ASN 82.A O ILE 86.A H 2.868 2.024 LEU 87.A N GLU 83.A O LEU 87.A H 2.943 2.091 GLN 88.A N LYS 84.A O GLN 88.A H 2.980 2.156 GLN 88.A NE2 LYS 21.A O GLN 88.A HE22 2.903 2.057 GLN 88.A NE2 ARG 85.A O GLN 88.A HE21 2.939 2.138 ALA 89.A N ILE 86.A O ALA 89.A H 2.952 2.170 VAL 90.A N ILE 86.A O VAL 90.A H 3.000 2.262 LEU 95.A N PHE 92.A O LEU 95.A H 3.220 2.381 VAL 96.A N VAL 173.A O VAL 96.A H 3.032 2.181 GLU 99.A N VAL 111.A O GLU 99.A H 2.845 2.022 PHE 100.A N VAL 111.A O PHE 100.A H 3.313 2.496 SER 101.A N THR 29.A OG1 SER 101.A H 3.022 2.231 PHE 102.A N TYR 109.A O PHE 102.A H 3.174 2.372 LYS 103.A NZ PHE 336.A O LYS 103.A HZ2 2.815 1.967 LYS 103.A NZ PHE 339.A O LYS 103.A HZ3 2.659 1.769 ASP 104.A N ASN 107.A O ASP 104.A H 3.034 2.227 SER 106.A N ASP 104.A OD1 SER 106.A H 2.944 2.179 ASN 107.A N ASP 104.A OD1 ASN 107.A H 2.789 1.987 ASN 107.A ND2 TYR 109.A OH ASN 107.A HD22 3.117 2.285 ASN 107.A ND2 ARG 326.A O ASN 107.A HD21 3.044 2.313 LEU 108.A N LEU 66.A O LEU 108.A H 2.871 2.048 TYR 109.A N PHE 102.A O TYR 109.A H 2.866 2.052 TYR 109.A OH ASP 104.A OD2 TYR 109.A HH 2.548 1.837 MET 110.A N LYS 64.A O MET 110.A H 2.915 2.094 VAL 111.A N PHE 100.A O VAL 111.A H 2.962 2.178 MET 112.A N ALA 62.A O MET 112.A H 2.834 2.000 GLU 113.A N LYS 97.A O GLU 113.A H 3.245 2.484 TYR 114.A N HIS 60.A O TYR 114.A H 3.240 2.426 TYR 114.A OH ASP 313.A O TYR 114.A HH 2.761 1.927 GLY 118.A N VAL 115.A O GLY 118.A H 3.329 2.511 MET 120.A N LEU 163.A O MET 120.A H 2.723 1.889 PHE 121.A N PRO 160.A O PHE 121.A H 3.231 2.548 HIS 123.A NE2 GLY 117.A O HIS 123.A HE2 2.745 1.905 LEU 124.A N MET 120.A O LEU 124.A H 2.752 1.901 ARG 125.A N PHE 121.A O ARG 125.A H 2.914 2.098 ARG 125.A NH1 GLU 220.A OE2 ARG 125.A HH12 2.737 2.050 ARG 125.A NH2 GLU 220.A OE2 ARG 125.A HH22 2.516 1.746 ARG 126.A N SER 122.A O ARG 126.A H 2.967 2.160 ARG 126.A NH1 HIS 123.A ND1 ARG 126.A HH12 3.382 2.693 ARG 126.A NH2 HIS 123.A ND1 ARG 126.A HH22 2.931 2.096 ILE 127.A N HIS 123.A O ILE 127.A H 2.935 2.090 GLY 128.A N LEU 124.A O GLY 128.A H 2.848 2.040 ARG 129.A NH2 ALA 222.A O ARG 129.A HH21 2.815 2.186 PHE 130.A N MET 221.A O PHE 130.A H 2.803 1.944 ARG 135.A N GLU 131.A O ARG 135.A H 2.736 1.951 ARG 135.A NH2 TRP 286.A O ARG 135.A HH21 2.931 2.280 PHE 136.A N PRO 132.A O PHE 136.A H 3.070 2.284 ALA 138.A N ALA 134.A O ALA 138.A H 2.917 2.088 ALA 139.A N ARG 135.A O ALA 139.A H 2.893 2.058 GLN 140.A NE2 PHE 136.A O GLN 140.A HE21 2.928 2.173 ILE 141.A N TYR 137.A O ILE 141.A H 3.141 2.356 VAL 142.A N ALA 138.A O VAL 142.A H 2.864 2.043 LEU 143.A N ALA 139.A O LEU 143.A H 3.067 2.230 THR 144.A N GLN 140.A O THR 144.A H 2.954 2.189 THR 144.A OG1 GLN 140.A O THR 144.A HG1 2.712 1.974 PHE 145.A N ILE 141.A O PHE 145.A H 2.818 2.007 GLU 146.A N VAL 142.A O GLU 146.A H 2.967 2.121 TYR 147.A N LEU 143.A O TYR 147.A H 3.000 2.167 LEU 148.A N THR 144.A O LEU 148.A H 2.870 2.016 HIS 149.A N PHE 145.A O HIS 149.A H 2.680 1.826 HIS 149.A NE2 ASP 210.A OD2 HIS 149.A HE2 2.795 1.946 SER 150.A N GLU 146.A O SER 150.A H 3.024 2.238 SER 150.A OG TYR 147.A O SER 150.A HG 2.762 1.922 LEU 151.A N LEU 148.A O LEU 151.A H 2.946 2.226 ASP 152.A N HIS 149.A O ASP 152.A H 2.784 1.970 LEU 153.A N LEU 148.A O LEU 153.A H 2.986 2.157 ILE 154.A N LYS 180.A O ILE 154.A H 2.983 2.200 TYR 155.A N ASP 210.A OD2 TYR 155.A H 2.845 1.990 TYR 155.A OH ASP 175.A O TYR 155.A HH 2.716 2.075 ARG 156.A N ASP 210.A OD1 ARG 156.A H 2.755 1.898 ARG 156.A NE PHE 178.A O ARG 156.A HE 2.750 1.958 ARG 156.A NH1 TYR 205.A OH ARG 156.A HH11 2.794 2.058 ARG 156.A NH2 PHE 178.A O ARG 156.A HH21 2.977 2.268 LYS 159.A NZ THR 191.A OG1 LYS 159.A HZ3 2.762 1.896 GLU 161.A N GLU 161.A OE1 GLU 161.A H 2.693 1.931 ASN 162.A N LYS 159.A O ASN 162.A H 2.904 2.053 ASN 162.A ND2 ASP 157.A O ASN 162.A HD22 2.985 2.140 LEU 164.A N GLN 172.A O LEU 164.A H 2.804 1.954 ILE 165.A N GLY 118.A O ILE 165.A H 2.958 2.155 ASP 166.A N TYR 170.A O ASP 166.A H 2.755 1.912 GLN 168.A N ASP 166.A OD1 GLN 168.A H 3.088 2.441 GLY 169.A N ASP 166.A O GLY 169.A H 2.768 1.940 TYR 170.A N ASP 166.A OD1 TYR 170.A H 2.794 1.995 TYR 170.A OH VAL 300.A O TYR 170.A HH 2.489 1.740 ILE 171.A N GLN 140.A OE1 ILE 171.A H 2.845 1.989 GLN 172.A N LEU 164.A O GLN 172.A H 2.967 2.183 VAL 173.A N PHE 94.A O VAL 173.A H 2.739 1.911 THR 174.A N ASN 162.A O THR 174.A H 2.985 2.176 THR 174.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 174.A HG1 2.812 2.139 PHE 176.A N GLU 83.A OE2 PHE 176.A H 2.903 2.061 ALA 179.A N PHE 176.A O ALA 179.A H 3.051 2.232 LYS 180.A N ILE 154.A O LYS 180.A H 3.128 2.356 LYS 180.A NZ THR 186.A OG1 LYS 180.A HZ3 2.752 1.869 ARG 181.A NE LEU 151.A O ARG 181.A HE 2.849 2.078 ARG 181.A NH2 LEU 151.A O ARG 181.A HH21 3.553 2.962 VAL 182.A N ASP 152.A O VAL 182.A H 2.709 1.883 THR 186.A N TYR 205.A O THR 186.A H 2.847 2.048 GLU 193.A N GLU 193.A OE1 GLU 193.A H 2.705 1.985 TYR 194.A N THR 191.A O TYR 194.A H 2.834 2.022 TYR 194.A OH GLU 220.A OE1 TYR 194.A HH 2.750 1.953 LEU 195.A N PRO 192.A O LEU 195.A H 3.232 2.377 GLU 198.A N GLU 198.A OE1 GLU 198.A H 2.839 2.011 ILE 199.A N ALA 196.A O ILE 199.A H 3.029 2.381 ILE 200.A N ALA 196.A O ILE 200.A H 3.273 2.441 LEU 201.A N PRO 197.A O LEU 201.A H 2.839 2.061 SER 202.A N ILE 199.A O SER 202.A H 2.998 2.155 TYR 205.A N THR 186.A O TYR 205.A H 2.965 2.179 ASN 206.A ND2 ASN 273.A OD1 ASN 206.A HD21 3.484 2.798 LYS 207.A NZ VAL 182.A O LYS 207.A HZ3 2.811 2.194 ALA 208.A N ASN 206.A OD1 ALA 208.A H 2.863 2.036 VAL 209.A N ASN 206.A O VAL 209.A H 3.188 2.328 ASP 210.A N LYS 207.A O ASP 210.A H 2.998 2.202 TRP 212.A N ALA 208.A O TRP 212.A H 3.065 2.234 ALA 213.A N VAL 209.A O ALA 213.A H 2.959 2.137 LEU 214.A N ASP 210.A O LEU 214.A H 2.871 2.098 GLY 215.A N TRP 211.A O GLY 215.A H 3.178 2.367 VAL 216.A N TRP 212.A O VAL 216.A H 3.113 2.326 LEU 217.A N ALA 213.A O LEU 217.A H 2.932 2.113 ILE 218.A N LEU 214.A O ILE 218.A H 2.879 2.032 TYR 219.A N GLY 215.A O TYR 219.A H 3.011 2.154 TYR 219.A OH ARG 246.A O TYR 219.A HH 2.516 1.699 GLU 220.A N VAL 216.A O GLU 220.A H 2.824 1.987 MET 221.A N LEU 217.A O MET 221.A H 2.906 2.054 ALA 222.A N ILE 218.A O ALA 222.A H 2.854 2.028 ALA 223.A N TYR 219.A O ALA 223.A H 2.791 1.988 GLY 224.A N GLU 220.A O GLY 224.A H 2.798 2.018 GLN 232.A N GLN 235.A OE1 GLN 232.A H 2.856 2.099 GLN 235.A N GLN 232.A O GLN 235.A H 3.081 2.467 ILE 236.A N GLN 232.A O ILE 236.A H 3.347 2.545 TYR 237.A N PRO 233.A O TYR 237.A H 3.011 2.203 GLU 238.A N ILE 234.A O GLU 238.A H 3.255 2.434 LYS 239.A N GLN 235.A O LYS 239.A H 3.341 2.542 LYS 239.A NZ PHE 229.A O LYS 239.A HZ2 2.729 1.840 ILE 240.A N ILE 236.A O ILE 240.A H 2.960 2.148 VAL 241.A N TYR 237.A O VAL 241.A H 3.023 2.195 SER 242.A N LYS 239.A O SER 242.A H 3.154 2.360 SER 242.A OG LYS 239.A O SER 242.A HG 2.706 1.957 LYS 244.A N SER 242.A OG LYS 244.A H 3.004 2.165 PHE 251.A N PRO 248.A O PHE 251.A H 3.182 2.333 SER 252.A N GLU 131.A OE2 SER 252.A H 2.777 1.946 LEU 255.A N SER 252.A OG LEU 255.A H 2.898 2.065 LYS 256.A N SER 252.A O LYS 256.A H 2.987 2.135 ASP 257.A N SER 253.A O ASP 257.A H 2.950 2.133 LEU 258.A N ASP 254.A O LEU 258.A H 2.863 2.018 LEU 259.A N LEU 255.A O LEU 259.A H 2.864 2.019 ARG 260.A N LYS 256.A O ARG 260.A H 2.895 2.075 ASN 261.A N ASP 257.A O ASN 261.A H 3.315 2.583 ASN 261.A N LEU 258.A O ASN 261.A H 2.925 2.248 ASN 261.A ND2 ASP 257.A O ASN 261.A HD22 2.983 2.195 LEU 262.A N LEU 258.A O LEU 262.A H 2.954 2.194 LEU 263.A N LEU 259.A O LEU 263.A H 2.630 1.791 ASP 266.A N GLN 264.A OE1 ASP 266.A H 2.962 2.112 THR 268.A N ASP 266.A OD1 THR 268.A H 3.047 2.269 THR 268.A OG1 ASP 266.A OD1 THR 268.A HG1 2.845 2.006 THR 268.A OG1 ASP 266.A OD2 THR 268.A HG1 3.417 2.823 LYS 269.A N ASP 266.A O LYS 269.A H 2.728 1.891 LYS 269.A NZ ASP 266.A OD2 LYS 269.A HZ3 3.342 2.481 ARG 270.A N LEU 267.A O ARG 270.A H 3.342 2.485 ARG 270.A NE GLN 264.A O ARG 270.A HE 2.877 2.094 ARG 270.A NH1 GLU 198.A OE2 ARG 270.A HH12 2.781 1.964 ARG 270.A NH1 ALA 208.A O ARG 270.A HH11 3.032 2.221 ARG 270.A NH2 GLU 198.A OE1 ARG 270.A HH22 2.930 2.075 ARG 270.A NH2 GLU 198.A OE2 ARG 270.A HH22 3.521 2.917 ARG 270.A NH2 GLN 264.A O ARG 270.A HH21 2.871 2.108 PHE 271.A N ASN 261.A O PHE 271.A H 2.956 2.179 ASN 273.A N ARG 270.A O ASN 273.A H 2.907 2.080 ASN 273.A ND2 LEU 267.A O ASN 273.A HD22 2.911 2.085 GLY 277.A N LEU 274.A O GLY 277.A H 2.878 2.051 ASN 279.A N ASN 276.A O ASN 279.A H 3.148 2.387 ASN 279.A ND2 ASN 276.A O ASN 279.A HD22 3.536 3.065 ASP 280.A N GLY 277.A O ASP 280.A H 3.331 2.563 ILE 281.A N VAL 278.A O ILE 281.A H 3.056 2.415 LYS 282.A N VAL 278.A O LYS 282.A H 2.960 2.132 LYS 282.A NZ GLU 146.A OE1 LYS 282.A HZ3 2.710 2.056 LYS 282.A NZ GLU 146.A OE2 LYS 282.A HZ1 3.422 2.792 ASN 283.A N ASN 279.A O ASN 283.A H 2.760 1.993 HIS 284.A N ILE 281.A O HIS 284.A H 3.094 2.241 HIS 284.A NE2 ASP 257.A OD2 HIS 284.A HE2 2.754 1.927 TRP 286.A N HIS 284.A ND1 TRP 286.A H 2.981 2.133 TRP 286.A NE1 GLU 131.A OE1 TRP 286.A HE1 2.876 2.039 PHE 287.A N HIS 284.A O PHE 287.A H 2.887 2.094 ALA 288.A N LYS 285.A O ALA 288.A H 2.971 2.132 THR 290.A N PHE 287.A O THR 290.A H 3.024 2.174 ALA 294.A N ASP 291.A OD2 ALA 294.A H 2.913 2.058 ILE 295.A N ASP 291.A O ILE 295.A H 2.783 1.984 TYR 296.A N TRP 292.A O TYR 296.A H 2.952 2.102 GLN 297.A N ILE 293.A O GLN 297.A H 2.982 2.176 ARG 298.A N ILE 295.A O ARG 298.A H 2.935 2.104 ARG 298.A NH1 ASP 166.A OD1 ARG 298.A HH12 3.245 2.664 ARG 298.A NH1 ASP 166.A OD2 ARG 298.A HH12 2.500 1.655 ARG 298.A NH1 GLN 168.A OE1 ARG 298.A HH11 3.505 2.855 LYS 299.A N ALA 294.A O LYS 299.A H 3.031 2.193 ASP 313.A N GLY 310.A O ASP 313.A H 3.258 2.411 SER 315.A N ASP 313.A OD2 SER 315.A H 3.043 2.227 SER 315.A OG ASP 313.A OD2 SER 315.A HG 2.857 2.074 ASN 316.A ND2 PRO 116.A O ASN 316.A HD22 3.050 2.238 PHE 317.A N THR 314.A O PHE 317.A H 2.973 2.121 LYS 331.A N ASN 105.A O LYS 331.A H 2.931 2.117 GLU 335.A N GLU 335.A OE1 GLU 335.A H 2.829 2.045 THR 337.A N LYS 334.A O THR 337.A H 3.429 2.614 THR 337.A OG1 LYS 334.A O THR 337.A HG1 3.177 2.390 PHE 339.A N PHE 336.A O PHE 339.A H 3.123 2.298