Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6km0_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.952 1.982 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.873 1.943 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.008 2.168 GLU 11.A N GLU 11.A OE1 GLU 11.A H 2.758 1.796 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.801 1.814 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.312 2.331 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.073 2.359 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.126 2.465 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.160 2.186 ASP 16.A N.B TRP 13.A O ASP 16.A H.B 3.252 2.592 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.883 1.991 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.866 1.870 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.139 2.147 GLY 22.A N ILE 19.A O.A GLY 22.A H 2.558 1.676 GLY 22.A N ILE 19.A O.B GLY 22.A H 2.937 2.081 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.885 1.938 ARG 24.A NH2 GLU 201.A O ARG 24.A HH21 3.000 2.294 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 3.092 2.241 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 3.004 2.164 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.864 2.022 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.799 1.798 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.832 1.907 HIS 33.A N ASP 31.A OD1 HIS 33.A H 2.818 1.864 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.141 2.172 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.973 2.053 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.381 2.525 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.941 1.970 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.911 2.009 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.156 2.211 LYS 42.A N GLY 79.A O LYS 42.A H 3.418 2.438 SER 45.A N LYS 77.A O.A SER 45.A H 2.875 1.887 SER 45.A N LYS 77.A O.B SER 45.A H 2.873 1.883 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.867 1.878 GLN 50.A NE2 ASP 49.A OD2.B GLN 50.A HE22 3.300 2.540 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.061 2.060 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.806 1.828 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.765 1.832 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH21 3.291 2.634 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 2.853 2.011 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.939 1.963 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.934 2.033 ASN 58.A N LYS 168.A O.A ASN 58.A H 2.921 1.931 ASN 58.A N LYS 168.A O.B ASN 58.A H 2.915 1.928 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.064 2.149 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.179 2.200 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.095 2.148 ASN 59.A ND2 ASN 64.A OD1 ASN 59.A HD22 3.553 2.983 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.824 1.856 HIS 61.A N.A ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.A 2.942 1.958 HIS 61.A N.B ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.B 2.892 1.960 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.963 2.000 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.856 1.930 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.864 1.910 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.859 1.850 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.956 1.991 ASP 68.A N.A THR 52.A O.A ASP 68.A H.A 2.797 1.951 ASP 68.A N.A THR 52.A O.B ASP 68.A H.A 2.873 2.039 ASP 68.A N.B THR 52.A O.A ASP 68.A H.B 2.840 2.099 ASP 68.A N.B THR 52.A O.B ASP 68.A H.B 2.901 2.115 SER 70.A N ASP 68.A OD1.A SER 70.A H 2.781 1.808 LYS 73.A N GLN 71.A O LYS 73.A H 2.900 2.157 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1.A LYS 73.A HZ3 2.828 1.961 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1.B LYS 73.A HZ3 3.155 2.310 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2.A LYS 73.A HZ1 2.870 2.060 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.974 2.038 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.859 1.876 LYS 77.A N.A SER 45.A O LYS 77.A H.A 2.932 1.974 LYS 77.A N.B SER 45.A O LYS 77.A H.B 2.952 1.973 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.099 2.187 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.867 1.891 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.004 2.079 ARG 86.A N.A TRP 120.A O ARG 86.A H.A 2.842 1.892 ARG 86.A N.B TRP 120.A O ARG 86.A H.B 2.835 1.868 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.A 2.589 1.631 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.A 2.484 1.555 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.B 2.894 2.036 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.B 3.000 2.301 ARG 86.A NH1.A ASP 69.A O ARG 86.A HH11.A 3.068 2.346 ARG 86.A NH1.B ASP 69.A O ARG 86.A HH11.B 2.950 2.100 ARG 86.A NH2.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.A 3.019 2.384 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21.B 2.910 2.175 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.B 2.409 1.600 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.843 1.834 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.919 1.914 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.951 2.041 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.057 2.123 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.768 1.912 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.895 1.946 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.755 1.920 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.808 1.822 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.827 2.172 GLY 95.A N ALA 112.A O GLY 95.A H 3.408 2.565 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.029 2.152 GLN 100.A N.A LEU 97.A O GLN 100.A H.A 3.293 2.432 GLN 100.A N.B LEU 97.A O GLN 100.A H.B 3.294 2.287 GLN 100.A NE2.B ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE22.B 2.892 2.234 GLN 100.A NE2.B ASP 239.A OD2 GLN 100.A HE22.B 3.494 2.846 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.949 2.071 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.833 1.971 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.820 2.057 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.757 1.910 THR 105.A N VAL 28.A O THR 105.A H 3.468 2.513 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.088 2.154 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.822 1.859 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.764 1.816 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.865 1.903 ALA 113.A N LEU 144.A O ALA 113.A H 3.324 2.465 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.885 1.973 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.792 1.789 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.821 1.813 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.676 1.844 LEU 117.A N LEU 140.A O.A LEU 117.A H 2.870 1.875 LEU 117.A N LEU 140.A O.B LEU 117.A H 2.915 1.912 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.855 1.854 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.937 2.114 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 2.999 2.232 TRP 120.A N ARG 86.A O.A TRP 120.A H 2.864 1.972 TRP 120.A N ARG 86.A O.B TRP 120.A H 2.955 2.041 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.777 2.011 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.792 1.838 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.087 2.113 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.955 1.952 LYS 123.A N.A ASN 121.A OD1 LYS 123.A H.A 3.035 2.364 LYS 123.A N.B ASN 121.A OD1 LYS 123.A H.B 3.160 2.254 LYS 123.A NZ.B ASP 135.A OD2 LYS 123.A HZ2.B 3.013 2.190 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.047 2.045 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.157 2.236 ASP 126.A N.A TYR 124.A O ASP 126.A H.A 2.887 2.076 LYS 129.A N.A ASP 126.A OD1.A LYS 129.A H.A 2.801 1.914 LYS 129.A N.A ASP 126.A OD1.B LYS 129.A H.A 3.114 2.127 LYS 129.A N.B ASP 126.A O.A LYS 129.A H.B 3.052 2.396 LYS 129.A N.B ASP 126.A OD1.A LYS 129.A H.B 2.821 1.946 LYS 129.A N.B ASP 126.A OD1.B LYS 129.A H.B 3.140 2.152 ALA 130.A N ASP 126.A O.A ALA 130.A H 2.847 1.881 ALA 130.A N ASP 126.A O.B ALA 130.A H 3.134 2.197 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.017 2.086 GLN 132.A N LYS 129.A O.A GLN 132.A H 3.105 2.194 GLN 132.A N LYS 129.A O.B GLN 132.A H 3.118 2.208 GLN 132.A NE2 GLY 128.A O GLN 132.A HE22 3.062 2.213 GLN 133.A N.A ALA 130.A O GLN 133.A H.A 2.987 2.051 GLN 133.A N.B ALA 130.A O GLN 133.A H.B 3.017 2.076 GLY 136.A N GLN 133.A O.A GLY 136.A H 2.936 2.104 GLY 136.A N GLN 133.A O.B GLY 136.A H 3.256 2.396 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.845 1.912 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.860 1.894 ILE 139.A N THR 204.A O ILE 139.A H 3.147 2.224 LEU 140.A N.A LEU 117.A O LEU 140.A H.A 2.985 2.065 LEU 140.A N.B LEU 117.A O LEU 140.A H.B 2.904 1.924 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.801 1.821 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.889 1.964 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.925 1.945 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.921 1.939 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.759 1.772 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 3.006 2.011 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ2 3.238 2.279 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 2.991 2.040 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.108 2.107 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2 GLN 154.A HE22 3.171 2.555 LYS 155.A NZ.B THR 173.A O LYS 155.A HZ2.B 2.843 1.913 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.135 2.154 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.921 1.998 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.145 2.256 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.244 2.276 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.950 2.071 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.038 2.084 LYS 166.A N.A ASN 228.A O LYS 166.A H.A 2.901 1.918 LYS 166.A N.B ASN 228.A O LYS 166.A H.B 2.907 1.923 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.774 1.817 LYS 168.A N.A THR 165.A O LYS 168.A H.A 3.111 2.122 LYS 168.A N.B THR 165.A O LYS 168.A H.B 3.111 2.121 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.901 1.983 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.951 1.972 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.952 2.028 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 2.898 1.949 ARG 178.A NH1 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH12 2.883 2.135 ARG 178.A NH2 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH22 3.327 2.720 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 3.173 2.549 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.137 2.163 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.019 2.033 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.314 2.311 GLU 183.A N.A GLU 210.A OE2.B GLU 183.A H.A 2.947 2.029 GLU 183.A N.B GLU 210.A OE2.B GLU 183.A H.B 3.071 2.145 SER 184.A N GLU 210.A OE1.A SER 184.A H 2.949 1.967 SER 184.A N GLU 210.A OE1.B SER 184.A H 2.901 1.964 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.045 2.040 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 2.927 1.946 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.851 1.869 THR 189.A N LYS 253.A O.A THR 189.A H 2.871 1.941 THR 189.A N LYS 253.A O.B THR 189.A H 2.825 1.918 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.261 2.367 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.793 1.784 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.932 1.990 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.579 1.783 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.831 1.956 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.121 2.143 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.869 1.880 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.958 2.021 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.951 2.157 ILE 206.A N ILE 139.A O ILE 206.A H 2.949 1.972 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.829 1.837 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.860 1.885 LYS 209.A N.A ASP 186.A O LYS 209.A H.A 2.812 1.807 LYS 209.A N.B ASP 186.A O LYS 209.A H.B 3.092 2.132 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.858 1.929 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.900 1.920 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.031 2.062 GLU 217.A N GLU 217.A OE1 GLU 217.A H 2.904 2.025 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.152 2.205 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 3.024 2.172 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE22 2.946 2.094 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.074 2.089 LEU 220.A N SER 216.A O.A LEU 220.A H 2.949 1.984 LEU 220.A N SER 216.A O.B LEU 220.A H 2.842 1.863 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.218 2.317 PHE 222.A N GLN 218.A O PHE 222.A H 3.342 2.417 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.111 2.201 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.845 1.929 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.549 2.894 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.880 2.029 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.174 2.222 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.190 2.224 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.821 1.931 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD21 2.883 2.014 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.879 1.916 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD21 3.222 2.434 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 3.013 2.037 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.867 1.942 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.169 2.217 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.770 1.775 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.805 1.800 ASN 240.A N TRP 94.A O ASN 240.A H 3.318 2.506 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.A ASN 240.A HD22 2.957 1.993 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.B ASN 240.A HD22 2.982 2.140 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.025 2.179 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.811 1.812 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.760 1.942 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.848 2.104 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.156 2.473 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.330 2.702 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.794 1.849 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 2.859 2.078 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ1 2.903 1.995 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.816 1.849 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.067 2.343 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.882 2.041 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.815 2.008 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.924 2.227 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.513 2.882 LYS 253.A N.A THR 189.A O LYS 253.A H.A 2.963 1.959 LYS 253.A N.B THR 189.A O LYS 253.A H.B 2.971 1.967 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.891 1.892 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.853 1.871