Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6km4_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.950 1.974 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.822 1.963 ASN 8.A N GLY 5.A O ASN 8.A H 3.398 2.548 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.090 2.240 GLU 11.A N.A GLU 11.A OE1.A GLU 11.A H.A 2.782 1.798 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.780 1.797 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.327 2.351 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.049 2.328 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.111 2.467 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.148 2.169 ASP 16.A N.A TRP 13.A O ASP 16.A H.A 3.216 2.527 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.888 2.001 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.853 1.851 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.126 2.127 GLY 22.A N ILE 19.A O.A GLY 22.A H 2.715 1.851 GLY 22.A N ILE 19.A O.B GLY 22.A H 2.834 1.989 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.886 1.933 ARG 24.A NH2 GLU 201.A O ARG 24.A HH21 3.014 2.292 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 3.081 2.236 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 3.039 2.213 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.870 2.002 SER 26.A OG SER 193.A O SER 26.A HG 3.565 3.190 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.806 1.804 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.846 1.896 HIS 33.A N ASP 31.A OD1 HIS 33.A H 2.845 1.905 HIS 33.A ND1 ASP 31.A OD1 HIS 33.A HD1 2.880 2.153 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.157 2.203 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.999 2.090 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.362 2.520 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.960 1.996 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.838 1.929 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.093 2.168 LYS 42.A N GLY 79.A O LYS 42.A H 3.545 2.564 SER 45.A N LYS 77.A O.A SER 45.A H 2.872 1.880 SER 45.A N LYS 77.A O.B SER 45.A H 2.870 1.878 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.864 1.861 GLN 50.A NE2 ASP 49.A OD2.B GLN 50.A HE22 3.242 2.447 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.093 2.101 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.802 1.817 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.793 1.892 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH21 3.226 2.538 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 2.918 2.089 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.933 1.974 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.934 2.030 ASN 58.A N LYS 168.A O.A ASN 58.A H 2.935 1.941 ASN 58.A N LYS 168.A O.B ASN 58.A H 2.936 1.942 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.048 2.133 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.201 2.222 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.093 2.139 ASN 59.A ND2 ASN 64.A OD1 ASN 59.A HD22 3.608 3.072 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.819 1.844 HIS 61.A N.A ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.A 2.889 1.908 HIS 61.A N.B ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.B 2.895 1.968 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.980 2.018 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.847 1.932 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.853 1.906 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.850 1.843 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.982 2.030 ASP 68.A N.A THR 52.A O ASP 68.A H.A 2.983 2.045 ASP 68.A N.B THR 52.A O ASP 68.A H.B 2.902 1.935 SER 70.A N ASP 68.A OD1.A SER 70.A H 2.894 1.913 SER 70.A N ASP 68.A OD1.B SER 70.A H 3.447 2.481 LYS 73.A N GLN 71.A O LYS 73.A H 2.947 2.222 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1 LYS 73.A HZ3 2.976 2.119 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2.A LYS 73.A HZ1 3.049 2.196 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.960 2.021 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.833 1.853 LYS 77.A N.A SER 45.A O LYS 77.A H.A 2.930 1.958 LYS 77.A N.B SER 45.A O LYS 77.A H.B 2.932 1.953 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.099 2.194 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.846 1.860 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 2.973 2.042 ARG 86.A N.A TRP 120.A O ARG 86.A H.A 2.850 1.908 ARG 86.A N.B TRP 120.A O ARG 86.A H.B 2.849 1.903 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.A 2.402 1.443 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.A 2.626 1.745 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.B 2.739 1.889 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.B 3.051 2.325 ARG 86.A NH1.A ASP 69.A O ARG 86.A HH11.A 3.072 2.322 ARG 86.A NH1.B ASP 69.A O ARG 86.A HH11.B 2.914 2.064 ARG 86.A NH2.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.A 2.839 2.158 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21.B 2.758 2.036 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.B 2.528 1.722 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.842 1.835 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.924 1.920 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.970 2.070 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.065 2.137 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.777 1.920 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.898 1.952 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.768 1.930 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.812 1.824 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.858 2.204 GLY 95.A N ALA 112.A O GLY 95.A H 3.398 2.539 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.002 2.129 GLN 100.A N LEU 97.A O GLN 100.A H 3.253 2.279 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.948 2.063 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.827 1.963 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.807 2.032 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.753 1.906 THR 105.A N VAL 28.A O THR 105.A H 3.485 2.528 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.078 2.146 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.811 1.845 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.766 1.817 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.863 1.897 ALA 113.A N LEU 144.A O ALA 113.A H 3.363 2.521 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.891 1.974 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.797 1.795 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.828 1.819 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.675 1.842 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.905 1.908 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.877 1.874 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.959 2.125 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.021 2.258 TRP 120.A N ARG 86.A O.A TRP 120.A H 2.939 2.037 TRP 120.A N ARG 86.A O.B TRP 120.A H 2.940 2.038 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.769 2.021 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.791 1.830 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.097 2.123 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.930 1.926 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.102 2.372 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.014 2.007 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.157 2.218 ASP 126.A N.A TYR 124.A O ASP 126.A H.A 2.847 2.037 LYS 129.A N ASP 126.A OD1.A LYS 129.A H 2.788 1.926 LYS 129.A N ASP 126.A OD1.B LYS 129.A H 3.073 2.093 ALA 130.A N ASP 126.A O.A ALA 130.A H 2.818 1.852 ALA 130.A N ASP 126.A O.B ALA 130.A H 3.211 2.256 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.012 2.091 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.117 2.196 GLN 132.A NE2 GLY 128.A O GLN 132.A HE22 3.081 2.232 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 3.017 2.069 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.089 2.227 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.852 1.918 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.871 1.907 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.142 2.217 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.951 2.011 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.821 1.839 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.899 1.982 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.925 1.941 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.916 1.934 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.788 1.799 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 3.007 2.012 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ2 3.326 2.367 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 2.981 2.042 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.062 2.061 LYS 155.A NZ.B THR 173.A O LYS 155.A HZ2.B 2.798 1.895 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.161 2.187 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.901 1.968 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.118 2.252 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.258 2.278 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.932 2.039 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.046 2.081 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H 2.905 1.940 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.729 1.777 LYS 168.A N.A THR 165.A O LYS 168.A H.A 3.114 2.119 LYS 168.A N.B THR 165.A O LYS 168.A H.B 3.113 2.119 LYS 168.A NZ.A GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ2.A 3.498 2.783 LYS 168.A NZ.B GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ2.B 2.964 2.199 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.897 1.977 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.949 1.971 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.954 2.020 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 2.873 1.932 ARG 178.A NH1 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH12 2.950 2.241 ARG 178.A NH2 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH22 3.357 2.774 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 3.131 2.482 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.151 2.182 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.026 2.037 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.355 2.351 GLU 183.A N GLU 210.A OE2.A GLU 183.A H 3.004 2.088 SER 184.A N GLU 210.A OE1.A SER 184.A H 2.918 1.974 SER 184.A N GLU 210.A OE1.B SER 184.A H 2.942 1.984 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.027 2.020 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 2.942 1.962 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.863 1.886 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.848 1.925 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.298 2.415 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.790 1.781 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.932 1.994 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.565 1.768 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.837 1.968 CYS 202.A N LEU 200.A O CYS 202.A H 3.078 2.341 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.125 2.134 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.874 1.883 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.974 2.031 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.977 2.192 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 2.936 1.962 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.843 1.858 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.873 1.889 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 2.953 1.956 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.866 1.931 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.897 1.921 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.039 2.070 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.134 2.166 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 3.024 2.167 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE22 2.956 2.107 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.062 2.077 LEU 220.A N SER 216.A O.A LEU 220.A H 2.965 1.989 LEU 220.A N SER 216.A O.B LEU 220.A H 2.878 1.897 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.208 2.319 PHE 222.A N.A GLN 218.A O PHE 222.A H.A 3.316 2.369 PHE 222.A N.B GLN 218.A O PHE 222.A H.B 3.387 2.482 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.138 2.226 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.830 1.903 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.878 2.028 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.190 2.236 LEU 225.A N PHE 222.A O.A LEU 225.A H 3.220 2.238 LEU 225.A N PHE 222.A O.B LEU 225.A H 3.187 2.225 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.817 1.899 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD21 2.932 2.087 PHE 227.A N GLU 235.A O.A PHE 227.A H 2.862 1.908 PHE 227.A N GLU 235.A O.B PHE 227.A H 2.862 1.908 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD21 3.362 2.561 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 3.044 2.081 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.816 1.854 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.125 2.180 GLU 235.A N.A ASN 228.A OD1 GLU 235.A H.A 2.782 1.795 GLU 235.A N.B ASN 228.A OD1 GLU 235.A H.B 2.783 1.802 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.806 1.802 ASN 240.A N TRP 94.A O ASN 240.A H 3.306 2.484 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.A ASN 240.A HD22 2.927 1.959 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.B ASN 240.A HD22 2.935 2.064 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.017 2.171 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.804 1.808 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.761 1.948 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.832 2.091 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.188 2.511 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.298 2.662 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.784 1.830 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 2.864 2.034 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ1 2.942 2.013 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.838 1.868 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.073 2.345 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.900 2.058 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.833 2.030 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.923 2.231 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.522 2.885 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 3.005 2.004 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.884 1.889 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.854 1.869