Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6km6_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.975 1.984 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.801 1.939 ASN 8.A N GLY 5.A O ASN 8.A H 3.392 2.530 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.124 2.268 GLU 11.A N.A GLU 11.A OE1.A GLU 11.A H.A 2.798 1.809 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.814 1.833 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.326 2.341 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.044 2.320 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.119 2.471 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.132 2.177 ASP 16.A N TRP 13.A O ASP 16.A H 3.206 2.473 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.896 1.974 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.840 1.838 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.102 2.102 GLY 22.A N ILE 19.A O.A GLY 22.A H 2.721 1.834 GLY 22.A N ILE 19.A O.B GLY 22.A H 2.822 1.957 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.890 1.943 ARG 24.A NH2 GLU 201.A O ARG 24.A HH21 2.992 2.230 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 3.076 2.258 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 3.045 2.259 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.854 1.984 SER 26.A OG SER 193.A O SER 26.A HG 3.561 3.182 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.796 1.790 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.824 1.871 HIS 33.A N ASP 31.A OD1 HIS 33.A H 2.868 1.933 HIS 33.A ND1 ASP 31.A OD1 HIS 33.A HD1 2.908 2.184 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.129 2.183 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.989 2.085 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.298 2.403 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.934 1.964 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.871 1.994 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.116 2.155 LYS 42.A N GLY 79.A O LYS 42.A H 3.478 2.531 SER 45.A N LYS 77.A O.A SER 45.A H 2.841 1.853 SER 45.A N LYS 77.A O.B SER 45.A H 2.840 1.851 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.856 1.862 GLN 50.A NE2 ASP 49.A OD2.B GLN 50.A HE22 3.303 2.733 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.030 2.037 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.773 1.783 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.782 1.856 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH21 3.221 2.551 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 2.907 2.077 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.914 1.942 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.933 2.036 ASN 58.A N LYS 168.A O.A ASN 58.A H 2.915 1.924 ASN 58.A N LYS 168.A O.B ASN 58.A H 2.915 1.924 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.040 2.137 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.198 2.224 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.083 2.122 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.814 1.846 HIS 61.A N.A ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.A 2.879 1.907 HIS 61.A N.B ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.B 2.877 1.938 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.965 1.989 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.842 1.922 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.852 1.907 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.843 1.836 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.967 2.020 ASP 68.A N.A THR 52.A O ASP 68.A H.A 2.892 1.929 ASP 68.A N.B THR 52.A O ASP 68.A H.B 2.924 1.955 SER 70.A N ASP 68.A OD1.A SER 70.A H 2.920 1.931 SER 70.A N ASP 68.A OD1.B SER 70.A H 3.280 2.315 LYS 73.A N GLN 71.A O LYS 73.A H 2.943 2.209 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1 LYS 73.A HZ3 3.059 2.212 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2.A LYS 73.A HZ1 2.881 2.049 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.974 2.029 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.832 1.855 LYS 77.A N.A SER 45.A O LYS 77.A H.A 2.913 1.957 LYS 77.A N.B SER 45.A O LYS 77.A H.B 2.916 1.939 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.094 2.193 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.888 1.901 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.006 2.084 ARG 86.A N.A TRP 120.A O ARG 86.A H.A 2.843 1.902 ARG 86.A N.B TRP 120.A O ARG 86.A H.B 2.843 1.895 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.A 2.486 1.519 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.A 2.688 1.784 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.B 2.791 1.932 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.B 3.074 2.336 ARG 86.A NH1.A ASP 69.A O ARG 86.A HH11.A 3.029 2.271 ARG 86.A NH1.B ASP 69.A O ARG 86.A HH11.B 2.862 2.014 ARG 86.A NH2.A ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21.A 3.205 2.608 ARG 86.A NH2.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.A 2.899 2.198 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21.B 2.818 2.088 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.B 2.605 1.805 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.811 1.802 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.934 1.929 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.962 2.061 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.060 2.131 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.773 1.916 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.878 1.929 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.774 1.939 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.816 1.829 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.854 2.219 GLY 95.A N ALA 112.A O GLY 95.A H 3.377 2.531 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.024 2.147 GLN 100.A N LEU 97.A O GLN 100.A H 3.221 2.240 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.941 2.059 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.843 1.970 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.822 2.051 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.732 1.887 THR 105.A N VAL 28.A O THR 105.A H 3.485 2.536 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.068 2.137 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.794 1.824 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.765 1.814 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.849 1.885 ALA 113.A N LEU 144.A O ALA 113.A H 3.317 2.475 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.875 1.955 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.816 1.816 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.819 1.809 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.698 1.861 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.895 1.899 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.845 1.842 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.953 2.116 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.024 2.261 TRP 120.A N ARG 86.A O.A TRP 120.A H 2.930 2.023 TRP 120.A N ARG 86.A O.B TRP 120.A H 2.931 2.023 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.761 2.013 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.775 1.814 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.124 2.160 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.960 1.955 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.079 2.307 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 2.995 1.990 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.151 2.219 ASP 126.A N.A TYR 124.A O ASP 126.A H.A 2.836 2.008 ASP 126.A N.B TYR 124.A O ASP 126.A H.B 3.058 2.312 LYS 129.A N ASP 126.A OD1.A LYS 129.A H 2.818 1.948 LYS 129.A N ASP 126.A OD1.B LYS 129.A H 3.118 2.143 ALA 130.A N ASP 126.A O.A ALA 130.A H 2.889 1.917 ALA 130.A N ASP 126.A O.B ALA 130.A H 3.238 2.271 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 2.997 2.072 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.098 2.188 GLN 132.A NE2 GLY 128.A O GLN 132.A HE22 3.058 2.206 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 3.027 2.088 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.081 2.234 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.851 1.913 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.863 1.898 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.118 2.190 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.948 1.995 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.812 1.833 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.913 1.999 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.923 1.939 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.921 1.937 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.782 1.793 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 3.021 2.025 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ2 3.214 2.257 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 2.958 2.023 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.047 2.063 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2 GLN 154.A HE22 3.323 2.744 LYS 155.A NZ.B THR 173.A O LYS 155.A HZ2.B 2.842 1.894 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.136 2.158 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.865 1.938 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.110 2.222 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.272 2.300 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.928 2.025 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.041 2.072 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H 2.916 1.934 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.754 1.809 LYS 168.A N.A THR 165.A O LYS 168.A H.A 3.114 2.117 LYS 168.A N.B THR 165.A O LYS 168.A H.B 3.115 2.116 LYS 168.A NZ.A GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ2.A 3.301 2.558 LYS 168.A NZ.B GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ2.B 3.021 2.249 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.927 2.007 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.927 1.949 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.945 1.992 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 2.902 1.961 ARG 178.A NH1 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH12 2.908 2.157 ARG 178.A NH2 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH22 3.370 2.756 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 3.140 2.485 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.121 2.144 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.031 2.040 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.326 2.323 GLU 183.A N GLU 210.A OE2.A GLU 183.A H 3.110 2.216 SER 184.A N GLU 210.A OE1.A SER 184.A H 2.900 1.934 SER 184.A N GLU 210.A OE1.B SER 184.A H 2.947 1.966 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.027 2.022 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 2.950 1.969 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.845 1.874 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.828 1.893 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.286 2.404 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.785 1.776 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.916 1.971 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.577 1.778 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.853 1.999 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.117 2.131 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.882 1.896 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.959 2.020 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.991 2.204 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 2.915 1.940 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.816 1.830 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.879 1.891 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 2.975 1.977 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.841 1.913 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.903 1.930 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.031 2.060 GLU 217.A N GLU 217.A OE1 GLU 217.A H 2.930 2.057 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.150 2.180 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 3.012 2.185 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE22 2.941 2.090 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.064 2.091 LEU 220.A N SER 216.A O.A LEU 220.A H 2.941 1.971 LEU 220.A N SER 216.A O.B LEU 220.A H 2.873 1.895 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.195 2.299 PHE 222.A N GLN 218.A O PHE 222.A H 3.376 2.451 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.099 2.190 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.830 1.896 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.542 2.897 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.854 2.011 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.182 2.236 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.168 2.198 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.820 1.913 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD21 2.902 2.051 PHE 227.A N GLU 235.A O.A PHE 227.A H 2.897 1.931 PHE 227.A N GLU 235.A O.B PHE 227.A H 2.898 1.932 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD21 3.381 2.593 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 3.015 2.043 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.774 1.801 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.085 2.131 GLU 235.A N.A ASN 228.A OD1 GLU 235.A H.A 2.807 1.819 GLU 235.A N.B ASN 228.A OD1 GLU 235.A H.B 2.803 1.820 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.804 1.802 ASN 240.A N TRP 94.A O ASN 240.A H 3.325 2.511 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.A ASN 240.A HD22 2.957 2.002 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.B ASN 240.A HD22 2.950 2.118 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.009 2.162 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.828 1.831 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.774 1.953 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.848 2.107 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.165 2.487 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.324 2.686 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.804 1.872 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 2.855 2.110 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ1 2.955 2.010 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.836 1.868 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.065 2.344 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.900 2.061 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.823 2.024 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.910 2.224 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.510 2.870 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 2.987 1.984 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.855 1.864 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.862 1.887