Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6l27_A.pdb H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 3.A N.A SER 86.A O no hydrogen 2.696 N/A GLY 4.A N LYS 85.A O GLY 4.A H 3.115 2.321 GLU 6.A N GLU 6.A OE1 GLU 6.A H 2.725 1.767 LEU 7.A N GLY 4.A O LEU 7.A H 2.932 1.964 PHE 8.A N GLU 5.A O PHE 8.A H 3.038 2.056 THR 9.A N GLU 6.A O THR 9.A H 3.629 2.629 VAL 12.A N GLY 35.A O VAL 12.A H 2.853 1.874 ILE 14.A N GLY 33.A O ILE 14.A H 2.878 1.897 LEU 15.A N LEU 119.A O LEU 15.A H 2.936 1.967 VAL 16.A N GLY 31.A O VAL 16.A H 2.834 1.851 GLU 17.A N ASN 121.A O GLU 17.A H 2.920 1.958 LEU 18.A N VAL 29.A O LEU 18.A H 2.840 1.881 ASP 19.A N ILE 123.A O ASP 19.A H 3.022 2.060 GLY 20.A N PHE 27.A O GLY 20.A H 2.794 1.805 ASP 21.A N LEU 125.A O ASP 21.A H 3.005 2.176 VAL 22.A N HIS 25.A O VAL 22.A H 2.951 1.989 ASN 23.A N GLY 127.A O ASN 23.A H 2.851 1.856 ASN 23.A ND2 PHE 130.A O ASN 23.A HD21 2.920 2.077 GLY 24.A N ASP 21.A OD1 GLY 24.A H 2.863 2.005 HIS 25.A N VAL 22.A O HIS 25.A H 2.871 1.873 PHE 27.A N GLY 20.A O PHE 27.A H 2.980 2.034 SER 28.A OG.A ASP 19.A OD2 SER 28.A HG.A 2.719 1.995 SER 28.A OG.B THR 49.A OG1 SER 28.A HG.B 2.478 1.691 VAL 29.A N LEU 18.A O VAL 29.A H 2.896 1.945 SER 30.A N ILE 47.A O SER 30.A H 2.955 2.046 GLY 31.A N VAL 16.A O GLY 31.A H 2.807 1.912 GLU 32.A N LYS 45.A O GLU 32.A H 2.995 2.062 GLY 33.A N ILE 14.A O GLY 33.A H 3.098 2.182 GLU 34.A N.A THR 43.A O.A GLU 34.A H.A 2.963 2.070 GLU 34.A N.A THR 43.A O.B GLU 34.A H.A 2.964 2.087 GLU 34.A N.B THR 43.A O.A GLU 34.A H.B 2.930 1.996 GLU 34.A N.B THR 43.A O.B GLU 34.A H.B 2.941 2.019 GLY 35.A N VAL 12.A O GLY 35.A H 2.885 1.918 ASP 36.A N LYS 41.A O ASP 36.A H 2.835 1.849 TYR 39.A N ASP 36.A O TYR 39.A H 2.950 2.021 GLY 40.A N ALA 37.A O GLY 40.A H 2.968 1.987 LYS 41.A N ASP 36.A O LYS 41.A H 3.151 2.134 LEU 42.A N.A GLU 222.A O.A LEU 42.A H.A 2.853 1.899 LEU 42.A N.A GLU 222.A O.B LEU 42.A H.A 2.929 1.931 LEU 42.A N.B GLU 222.A O.A LEU 42.A H.B 2.948 1.978 LEU 42.A N.B GLU 222.A O.B LEU 42.A H.B 3.025 2.061 THR 43.A N.A GLU 34.A O.A THR 43.A H.A 3.113 2.136 THR 43.A N.A GLU 34.A O.B THR 43.A H.A 3.058 2.065 THR 43.A N.B GLU 34.A O.A THR 43.A H.B 3.025 2.036 THR 43.A N.B GLU 34.A O.B THR 43.A H.B 2.973 1.997 LEU 44.A N.A LEU 220.A O LEU 44.A H.A 2.922 1.964 LEU 44.A N.B LEU 220.A O LEU 44.A H.B 2.947 1.959 LYS 45.A N GLU 32.A O LYS 45.A H 2.896 1.913 LYS 45.A NZ ASP 210.A OD2.A LYS 45.A HZ2 2.999 2.060 LYS 45.A NZ GLU 213.A OE1.A LYS 45.A HZ1 2.696 1.709 LYS 45.A NZ GLU 213.A OE1.B LYS 45.A HZ1 2.794 1.792 PHE 46.A N MET 218.A O PHE 46.A H 2.807 1.804 ILE 47.A N SER 30.A O ILE 47.A H 2.791 1.842 SER 48.A N ASP 216.A O SER 48.A H 2.939 1.932 THR 49.A N SER 28.A O THR 49.A H 2.910 1.942 THR 50.A OG1 SER 28.A OG.B THR 50.A HG1 2.931 2.219 TRP 57.A NE1 ASP 216.A OD1 TRP 57.A HE1 2.861 1.854 THR 59.A N PRO 56.A O THR 59.A H 2.931 2.070 THR 59.A OG1 PRO 56.A O THR 59.A HG1 2.798 1.821 LEU 60.A N TRP 57.A O LEU 60.A H 2.909 1.906 VAL 61.A N PRO 58.A O VAL 61.A H 3.374 2.375 THR 62.A OG1 HIS 181.A NE2 THR 62.A HG1 2.834 1.859 LEU 64.A N LEU 60.A O LEU 64.A H 2.934 1.919 CYS 70.A N TYR 92.A OH CYS 70.A H 3.446 2.623 PHE 71.A N VAL 68.A O PHE 71.A H 2.982 1.987 SER 72.A N GLN 69.A O SER 72.A H 3.139 2.142 SER 72.A OG GLN 69.A O SER 72.A HG 2.785 1.964 ARG 73.A N VAL 224.A O ARG 73.A H 2.856 1.838 ARG 73.A NE THR 225.A OG1.B ARG 73.A HE 3.278 2.516 TYR 74.A OH HIS 199.A NE2 TYR 74.A HH 2.736 1.856 HIS 77.A NE2 ILE 229.A O HIS 77.A HE2 2.468 1.547 MET 78.A N PRO 75.A O MET 78.A H 2.759 1.833 LYS 79.A N ASP 76.A O LYS 79.A H 3.123 2.117 HIS 81.A N MET 78.A O HIS 81.A H 2.889 1.888 ASP 82.A N LYS 79.A O ASP 82.A H 3.219 2.223 LYS 85.A N ASP 82.A OD1 LYS 85.A H 3.201 2.202 LYS 85.A NZ SER 72.A O LYS 85.A HZ1 2.840 1.876 LYS 85.A NZ ASP 82.A OD2 LYS 85.A HZ3 2.770 1.944 SER 86.A N ASP 82.A O SER 86.A H 3.434 2.519 SER 86.A OG PHE 83.A O SER 86.A HG 2.755 1.790 ALA 87.A N PHE 83.A O ALA 87.A H 3.236 2.430 MET 88.A N LYS 85.A O MET 88.A H 3.061 2.067 GLY 91.A N ALA 87.A O GLY 91.A H 2.811 1.826 TYR 92.A N VAL 112.A O TYR 92.A H 2.941 2.039 VAL 93.A N THR 186.A O VAL 93.A H 2.818 1.883 GLN 94.A N ALA 110.A O GLN 94.A H 2.841 1.885 GLU 95.A N GLN 184.A O GLU 95.A H 2.866 1.861 ARG 96.A N THR 108.A O ARG 96.A H 2.989 2.058 ARG 96.A NE GLN 183.A OE1 ARG 96.A HE 2.797 1.923 ARG 96.A NH1 THR 62.A O ARG 96.A HH12 2.784 1.890 ARG 96.A NH2 GLN 183.A OE1 ARG 96.A HH21 2.855 2.050 THR 97.A N TYR 182.A O THR 97.A H 2.910 2.010 ILE 98.A N TYR 106.A O ILE 98.A H 2.770 1.791 PHE 99.A N ASP 180.A O PHE 99.A H 2.866 1.893 PHE 100.A N GLY 104.A O PHE 100.A H 2.941 1.972 LYS 101.A N LEU 178.A O LYS 101.A H 2.954 1.969 ASP 103.A N PHE 100.A O ASP 103.A H 2.851 2.027 ASN 105.A N ILE 128.A O ASN 105.A H 3.023 2.070 TYR 106.A N ILE 98.A O TYR 106.A H 2.919 2.050 TYR 106.A OH THR 59.A OG1 TYR 106.A HH 2.785 1.849 LYS 107.A N LYS 126.A O LYS 107.A H 2.784 1.786 LYS 107.A NZ THR 97.A OG1 LYS 107.A HZ3 2.820 1.821 THR 108.A N ARG 96.A O THR 108.A H 2.922 1.958 ARG 109.A N GLU 124.A O.A ARG 109.A H 2.980 2.016 ARG 109.A N GLU 124.A O.B ARG 109.A H 2.996 2.034 ARG 109.A NH1 GLU 111.A OE2 ARG 109.A HH12 2.964 1.949 ALA 110.A N GLN 94.A O ALA 110.A H 2.849 1.980 GLU 111.A N ARG 122.A O GLU 111.A H 2.894 1.971 VAL 112.A N TYR 92.A O VAL 112.A H 2.906 1.902 LYS 113.A N.A VAL 120.A O LYS 113.A H.A 3.002 2.090 LYS 113.A N.B VAL 120.A O LYS 113.A H.B 2.987 2.067 LYS 113.A NZ.B GLU 111.A OE1 LYS 113.A HZ3.B 3.181 2.186 PHE 114.A N PRO 89.A O PHE 114.A H 3.312 2.331 GLU 115.A N THR 118.A O GLU 115.A H 2.845 1.844 THR 118.A N GLU 115.A O THR 118.A H 3.178 2.222 LEU 119.A N PRO 13.A O LEU 119.A H 2.877 1.902 VAL 120.A N LYS 113.A O.A VAL 120.A H 2.824 1.807 VAL 120.A N LYS 113.A O.B VAL 120.A H 2.861 1.847 ASN 121.A N LEU 15.A O ASN 121.A H 2.881 1.920 ASN 121.A ND2 THR 63.A O ASN 121.A HD21 3.530 2.594 ASN 121.A ND2 LEU 64.A O ASN 121.A HD22 2.979 2.209 ARG 122.A N GLU 111.A O ARG 122.A H 2.973 1.975 ILE 123.A N GLU 17.A O ILE 123.A H 2.787 1.861 GLU 124.A N.A ARG 109.A O GLU 124.A H.A 2.883 1.883 GLU 124.A N.B ARG 109.A O GLU 124.A H.B 2.882 1.890 LEU 125.A N ASP 19.A O LEU 125.A H 2.885 1.928 LYS 126.A N LYS 107.A O LYS 126.A H 2.879 1.889 GLY 127.A N ASP 21.A O GLY 127.A H 2.746 1.754 ILE 128.A N ASN 105.A O ILE 128.A H 3.086 2.197 PHE 130.A N ASN 23.A OD1 PHE 130.A H 3.071 2.081 LYS 131.A N ASP 103.A OD1 LYS 131.A H 2.806 1.847 LYS 131.A NZ ASP 102.A O LYS 131.A HZ2 2.675 1.846 ASP 133.A N ASP 133.A OD1 ASP 133.A H 2.487 1.696 GLY 134.A N LYS 131.A O GLY 134.A H 3.013 2.000 ASN 135.A ND2 GLN 177.A OE1 ASN 135.A HD22 2.890 1.873 GLY 138.A N GLY 134.A O GLY 138.A H 2.864 2.018 HIS 139.A N ILE 136.A O HIS 139.A H 3.022 2.022 LYS 140.A N ASN 135.A O LYS 140.A H 2.995 1.976 GLU 142.A N ASN 170.A O GLU 142.A H 2.891 1.923 TYR 143.A OH SER 208.A O TYR 143.A HH 2.694 1.746 ASN 144.A ND2 GLU 142.A OE1 ASN 144.A HD21 3.048 2.055 HIS 148.A N.A THR 203.A O.A HIS 148.A H.A 3.524 2.584 HIS 148.A N.A THR 203.A O.B HIS 148.A H.A 3.143 2.227 HIS 148.A N.B THR 203.A O.A HIS 148.A H.B 3.001 2.043 HIS 148.A N.B THR 203.A O.B HIS 148.A H.B 2.880 2.030 HIS 148.A ND1.A ASN 149.A O.A HIS 148.A HD1.A 2.928 2.037 HIS 148.A ND1.A ASN 149.A O.B HIS 148.A HD1.A 3.386 2.485 ASN 149.A ND2.A TYR 151.A OH ASN 149.A HD22.A 3.398 2.415 ASN 149.A ND2.B TYR 151.A OH ASN 149.A HD22.B 3.366 2.405 VAL 150.A N.A LEU 201.A O VAL 150.A H.A 2.941 2.098 VAL 150.A N.B LEU 201.A O no hydrogen 2.898 N/A TYR 151.A N ASN 164.A O.A TYR 151.A H 3.040 2.062 TYR 151.A N ASN 164.A O.B TYR 151.A H 2.933 1.945 ILE 152.A N HIS 199.A O ILE 152.A H 2.860 1.854 MET 153.A N LYS 162.A O MET 153.A H 2.900 1.915 ASP 155.A N.A GLY 160.A O.A ASP 155.A H.A 3.054 2.035 ASP 155.A N.A GLY 160.A O.B ASP 155.A H.A 2.772 1.754 ASP 155.A N.B GLY 160.A O.A ASP 155.A H.B 2.962 1.946 ASP 155.A N.B GLY 160.A O.B ASP 155.A H.B 2.683 1.676 GLN 157.A N.A ASP 155.A OD2.B GLN 157.A H.A 2.852 1.933 LYS 158.A N.A ASP 155.A O.A LYS 158.A H.A 2.880 1.971 LYS 158.A N.A ASP 155.A O.B LYS 158.A H.A 3.070 2.236 LYS 158.A N.A ASP 155.A OD2.B LYS 158.A H.A 3.105 2.314 LYS 158.A N.B ASP 155.A O.B LYS 158.A H.B 3.058 2.148 LYS 158.A N.B ASP 155.A OD2.B LYS 158.A H.B 3.436 2.610 LYS 158.A NZ.A ASP 155.A OD1.A LYS 158.A HZ3.A 2.767 1.828 LYS 158.A NZ.A ASP 155.A OD1.B LYS 158.A HZ3.A 2.720 1.789 LYS 158.A NZ.B GLN 184.A OE1 LYS 158.A HZ3.B 2.905 2.195 GLN 159.A N.B LYS 156.A O.B GLN 159.A H.B 2.789 1.795 GLN 159.A NE2.A GLY 191.A O GLN 159.A HE21.A 3.496 2.723 GLY 160.A N.B ASP 155.A O.B GLY 160.A H.B 3.017 1.999 GLY 160.A N.B LYS 158.A O.A GLY 160.A H.B 2.756 1.944 ILE 161.A N ASN 185.A O ILE 161.A H 3.002 2.065 LYS 162.A N MET 153.A O LYS 162.A H 2.867 1.893 LYS 162.A NZ.A ASP 155.A OD1.A LYS 162.A HZ2.A 3.105 2.344 LYS 162.A NZ.A GLN 184.A OE1 LYS 162.A HZ2.A 2.606 1.674 LYS 162.A NZ.B GLN 184.A OE1 LYS 162.A HZ3.B 2.557 1.724 VAL 163.A N GLN 183.A O VAL 163.A H 2.842 1.864 ASN 164.A N.A TYR 151.A O ASN 164.A H.A 2.918 1.992 ASN 164.A N.B TYR 151.A O ASN 164.A H.B 2.884 1.940 PHE 165.A N HIS 181.A O PHE 165.A H 3.224 2.288 LYS 166.A NZ ASP 180.A OD1 LYS 166.A HZ3 2.764 1.742 THR 167.A N ALA 179.A O THR 167.A H 2.953 1.971 ARG 168.A N.B HIS 148.A NE2.B ARG 168.A H.B 3.390 2.469 HIS 169.A N.A GLN 177.A O HIS 169.A H.A 2.819 1.856 HIS 169.A N.B GLN 177.A O HIS 169.A H.B 2.902 1.883 ILE 171.A N SER 175.A O ILE 171.A H 2.876 1.864 GLU 172.A N LYS 140.A O GLU 172.A H 2.854 1.882 GLY 174.A N ILE 171.A O GLY 174.A H 2.903 1.928 SER 175.A N ASP 173.A OD1 SER 175.A H 2.896 1.890 VAL 176.A N.B SER 175.A OG VAL 176.A H.B 2.722 1.943 GLN 177.A N HIS 169.A O.A GLN 177.A H 2.865 1.852 GLN 177.A N HIS 169.A O.B GLN 177.A H 2.721 1.710 GLN 177.A NE2 LYS 101.A O GLN 177.A HE22 2.937 1.918 GLN 177.A NE2 LEU 178.A O GLN 177.A HE21 3.056 2.060 ALA 179.A N THR 167.A O ALA 179.A H 2.857 1.881 ASP 180.A N PHE 99.A O ASP 180.A H 2.924 1.973 HIS 181.A N PHE 165.A O HIS 181.A H 2.804 1.792 HIS 181.A ND1 ALA 179.A O HIS 181.A HD1 3.106 2.275 TYR 182.A N THR 97.A O TYR 182.A H 2.912 1.905 GLN 183.A N VAL 163.A O GLN 183.A H 2.852 1.968 GLN 183.A NE2 GLN 69.A OE1 GLN 183.A HE22 2.918 1.913 GLN 183.A NE2 ASN 185.A OD1 GLN 183.A HE21 2.852 1.850 GLN 184.A N GLU 95.A O GLN 184.A H 2.874 1.915 GLN 184.A NE2 ASP 155.A OD1.A GLN 184.A HE22 2.513 1.655 GLN 184.A NE2 ASP 155.A OD1.B GLN 184.A HE22 2.977 2.138 GLN 184.A NE2 ASN 185.A O GLN 184.A HE21 3.418 2.466 ASN 185.A N ILE 161.A O ASN 185.A H 2.985 2.006 ASN 185.A ND2 GLN 94.A OE1 ASN 185.A HD21 2.869 1.893 THR 186.A N VAL 93.A O THR 186.A H 3.005 2.078 ILE 188.A N GLY 91.A O ILE 188.A H 2.867 1.851 LEU 194.A N SER 86.A OG LEU 194.A H 2.882 1.887 ASP 197.A N HIS 81.A ND1 ASP 197.A H 3.011 2.070 HIS 199.A N ILE 152.A O HIS 199.A H 3.123 2.177 HIS 199.A ND1 ASP 197.A O HIS 199.A HD1 2.858 1.842 TYR 200.A N ALA 227.A O TYR 200.A H 3.033 2.021 LEU 201.A N VAL 150.A O.A LEU 201.A H 2.839 1.911 LEU 201.A N VAL 150.A O.B LEU 201.A H 2.777 1.858 SER 202.A N THR 225.A O.A SER 202.A H 2.754 1.784 SER 202.A N THR 225.A O.B SER 202.A H 2.878 1.901 THR 203.A N.A HIS 148.A O.A THR 203.A H.A 2.971 1.964 THR 203.A N.A HIS 148.A O.B THR 203.A H.A 2.901 2.001 THR 203.A N.B HIS 148.A O.A THR 203.A H.B 2.934 1.920 THR 203.A N.B HIS 148.A O.B THR 203.A H.B 2.883 1.953 THR 203.A OG1.A LEU 201.A O THR 203.A HG1.A 3.211 2.248 THR 203.A OG1.B HIS 148.A O.A THR 203.A HG1.B 2.928 1.954 THR 203.A OG1.B HIS 148.A O.B THR 203.A HG1.B 2.476 1.517 GLN 204.A N.A PHE 223.A O.A GLN 204.A H.A 2.892 1.908 GLN 204.A N.A PHE 223.A O.B GLN 204.A H.A 3.009 2.003 GLN 204.A N.B PHE 223.A O.A GLN 204.A H.B 2.933 2.046 GLN 204.A N.B PHE 223.A O.B GLN 204.A H.B 3.052 2.241 ALA 206.A N LEU 221.A O ALA 206.A H 2.855 1.911 SER 208.A N VAL 219.A O SER 208.A H 2.875 1.961 ASP 210.A N.A HIS 217.A NE2 ASP 210.A H.A 2.859 1.918 ASP 210.A N.B HIS 217.A NE2 ASP 210.A H.B 2.927 2.006 ASN 212.A N.A ASP 210.A OD1.A ASN 212.A H.A 2.971 1.978 ASN 212.A N.A ASP 210.A OD1.B ASN 212.A H.A 1.962 1.008 ASN 212.A N.B ASP 210.A OD1.B ASN 212.A H.B 2.862 1.894 GLU 213.A N.A ASP 210.A O.A GLU 213.A H.A 3.042 2.028 GLU 213.A N.A ASP 210.A O.B GLU 213.A H.A 2.959 1.964 GLU 213.A N.B ASP 210.A O.A GLU 213.A H.B 2.983 1.980 GLU 213.A N.B ASP 210.A O.B GLU 213.A H.B 2.855 1.907 ARG 215.A N GLU 213.A OE2.A ARG 215.A H 2.990 2.012 ARG 215.A N GLU 213.A OE2.B ARG 215.A H 2.973 1.976 ARG 215.A NE GLU 213.A OE2.A ARG 215.A HE 2.764 1.745 ARG 215.A NE GLU 213.A OE2.B ARG 215.A HE 2.972 1.952 ARG 215.A NH2 GLU 213.A OE1.A ARG 215.A HH21 2.880 1.929 ARG 215.A NH2 GLU 213.A OE1.B ARG 215.A HH21 2.934 1.951 ARG 215.A NH2 GLU 213.A OE2.A ARG 215.A HH21 3.537 2.806 HIS 217.A ND1 ARG 215.A O HIS 217.A HD1 2.856 1.910 MET 218.A N PHE 46.A O MET 218.A H 2.904 1.979 VAL 219.A N SER 208.A O VAL 219.A H 2.985 1.979 LEU 220.A N LEU 44.A O.A LEU 220.A H 2.836 1.828 LEU 220.A N LEU 44.A O.B LEU 220.A H 2.773 1.791 LEU 221.A N ALA 206.A O LEU 221.A H 2.963 1.970 GLU 222.A N.A LEU 42.A O.A GLU 222.A H.A 2.954 1.992 GLU 222.A N.A LEU 42.A O.B GLU 222.A H.A 3.034 2.068 GLU 222.A N.B LEU 42.A O.A GLU 222.A H.B 2.907 1.918 GLU 222.A N.B LEU 42.A O.B GLU 222.A H.B 2.984 1.978 PHE 223.A N.A GLN 204.A O.A PHE 223.A H.A 2.923 1.984 PHE 223.A N.A GLN 204.A O.B PHE 223.A H.A 2.958 2.055 PHE 223.A N.B GLN 204.A O.A PHE 223.A H.B 3.029 2.060 PHE 223.A N.B GLN 204.A O.B PHE 223.A H.B 3.070 2.121 VAL 224.A N GLY 40.A O VAL 224.A H 2.886 1.980 THR 225.A N.A SER 202.A O THR 225.A H.A 3.024 2.079 THR 225.A N.B SER 202.A O THR 225.A H.B 3.093 2.178 ALA 226.A N ARG 73.A O ALA 226.A H 2.829 1.848 ALA 227.A N TYR 200.A O ALA 227.A H 2.839 1.915