Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6lva_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.936 1.971 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.970 2.078 GLU 11.A N.A GLU 11.A OE1.A GLU 11.A H.A 2.738 1.774 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.790 1.798 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.268 2.293 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.112 2.399 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.118 2.461 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.141 2.159 ASP 16.A N TRP 13.A O ASP 16.A H 3.220 2.503 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.884 1.980 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.837 1.836 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.106 2.112 GLY 22.A N ILE 19.A O.A GLY 22.A H 2.728 1.833 GLY 22.A N ILE 19.A O.B GLY 22.A H 2.805 1.918 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.887 1.937 ARG 24.A NH2 GLU 201.A O ARG 24.A HH21 2.989 2.240 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 3.093 2.303 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 3.020 2.280 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.865 2.009 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.765 1.766 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.816 1.884 HIS 33.A N ASP 31.A OD1 HIS 33.A H 2.853 1.883 HIS 33.A ND1 ASP 31.A OD1 HIS 33.A HD1 2.811 2.055 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.129 2.166 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.999 2.109 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.316 2.438 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.955 2.025 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.694 1.745 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.285 2.323 LYS 42.A N GLY 79.A O LYS 42.A H 3.448 2.458 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.851 1.880 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.855 1.861 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.072 2.088 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.785 1.831 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.807 1.880 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH21 3.277 2.616 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 2.861 2.038 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.935 1.976 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.893 1.993 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H 2.933 1.953 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.040 2.121 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.208 2.230 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.041 2.095 ASN 59.A ND2 ASN 64.A OD1 ASN 59.A HD22 3.517 2.929 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.832 1.854 HIS 61.A N.A ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.A 2.893 1.912 HIS 61.A N.B ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.B 2.914 1.978 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.937 1.944 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.858 1.951 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.880 1.923 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.833 1.831 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.966 2.018 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 2.875 1.900 SER 70.A N ASP 68.A OD1 SER 70.A H 2.945 1.946 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1 LYS 73.A HZ3 2.952 2.073 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2 LYS 73.A HZ1 2.773 1.931 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.942 2.003 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.805 1.837 LYS 77.A N SER 45.A O LYS 77.A H 2.917 1.941 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.096 2.194 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.875 1.894 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.013 2.073 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.849 1.914 ARG 86.A NE ASP 72.A OD1 ARG 86.A HE 2.755 1.913 ARG 86.A NH1 ASP 69.A O ARG 86.A HH11 2.933 2.160 ARG 86.A NH2 ASP 72.A OD1 ARG 86.A HH21 3.049 2.370 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.846 1.838 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.921 1.922 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.958 2.066 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.083 2.158 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.769 1.913 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.869 1.915 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.772 1.939 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.825 1.840 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.857 2.236 GLY 95.A N ALA 112.A O GLY 95.A H 3.358 2.508 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.042 2.159 GLN 100.A N.A LEU 97.A O GLN 100.A H.A 3.200 2.191 GLN 100.A N.B LEU 97.A O GLN 100.A H.B 3.190 2.266 GLN 100.A NE2.B ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE22.B 2.889 2.199 GLN 100.A NE2.B ASP 239.A OD2 GLN 100.A HE22.B 3.474 2.830 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.946 2.083 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.814 1.936 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.826 2.075 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.744 1.900 THR 105.A N VAL 28.A O THR 105.A H 3.480 2.531 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.086 2.156 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.832 1.875 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.743 1.796 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.870 1.894 ALA 113.A N LEU 144.A O ALA 113.A H 3.323 2.474 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.860 1.955 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.840 1.842 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.846 1.839 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.744 1.919 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.912 1.912 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.874 1.871 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.946 2.109 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.025 2.272 TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 2.914 2.034 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.770 2.013 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.796 1.858 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.116 2.155 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.970 1.972 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.118 2.236 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.028 2.027 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.153 2.224 ASP 126.A N TYR 124.A O ASP 126.A H 2.917 2.109 LYS 129.A N ASP 126.A OD1 LYS 129.A H 2.891 1.979 ALA 130.A N ASP 126.A O ALA 130.A H 2.993 2.048 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.035 2.131 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.139 2.228 GLN 132.A NE2 GLY 128.A O GLN 132.A HE22 3.099 2.251 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 2.988 2.046 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.117 2.265 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.845 1.918 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.870 1.916 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.150 2.235 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.961 2.025 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.825 1.853 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.878 1.964 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.919 1.940 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.945 1.972 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.761 1.791 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 2.965 1.981 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ2 3.049 2.088 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 2.968 2.030 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.110 2.115 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1.B GLN 154.A HE22 3.190 2.616 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2.A GLN 154.A HE22 3.173 2.571 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.120 2.150 ASP 158.A N.A GLN 154.A O ASP 158.A H.A 2.863 1.921 ASP 158.A N.B GLN 154.A O ASP 158.A H.B 2.865 1.932 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.099 2.171 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.278 2.283 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.969 2.112 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 2.990 2.043 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H 2.903 1.920 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.794 1.818 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.092 2.094 LYS 168.A NZ GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ2 2.962 2.226 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.933 2.030 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.997 2.015 THR 173.A N ASP 171.A OD1 THR 173.A H 2.893 1.936 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.914 1.978 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 2.965 2.013 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 2.917 2.165 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.157 2.176 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.036 2.041 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.312 2.302 GLU 183.A N GLU 210.A OE2.B GLU 183.A H 3.076 2.179 SER 184.A N GLU 210.A OE1.A SER 184.A H 2.950 1.980 SER 184.A N GLU 210.A OE1.B SER 184.A H 2.903 1.953 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.063 2.058 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.865 1.890 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.819 1.897 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.283 2.416 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.788 1.779 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.912 1.966 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.592 1.811 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.830 1.943 CYS 202.A N LEU 200.A O CYS 202.A H 3.051 2.303 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.109 2.116 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.837 1.849 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.967 2.030 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.991 2.195 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 2.913 1.940 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.824 1.840 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.857 1.887 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 2.936 1.941 LYS 209.A NZ ASP 186.A OD2 LYS 209.A HZ3 2.584 1.769 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.823 1.867 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.896 1.935 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.045 2.073 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.126 2.155 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 3.048 2.211 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE22 2.943 2.094 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.074 2.094 LEU 220.A N SER 216.A O.A LEU 220.A H 2.938 1.961 LEU 220.A N SER 216.A O.B LEU 220.A H 2.871 1.891 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.175 2.250 PHE 222.A N GLN 218.A O PHE 222.A H 3.294 2.338 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.110 2.206 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.844 1.907 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.467 2.827 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.828 2.001 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.130 2.187 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.140 2.173 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.829 1.903 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD21 2.897 2.125 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.897 1.939 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD21 3.280 2.446 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 2.980 2.015 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.781 1.831 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.130 2.208 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.768 1.778 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.811 1.810 ASN 240.A N TRP 94.A O ASN 240.A H 3.317 2.508 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.A ASN 240.A HD22 2.952 2.025 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.B ASN 240.A HD22 2.941 2.167 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.017 2.170 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.783 1.793 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.758 1.944 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.829 2.103 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.147 2.444 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.363 2.750 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.816 1.891 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 2.888 2.183 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ1 2.943 2.016 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.816 1.848 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.081 2.365 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.886 2.046 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.831 2.029 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.965 2.281 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.465 2.817 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 2.950 1.950 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.868 1.887 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.846 1.875