Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6mby_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.868 2.014 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.849 2.117 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.149 2.290 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.801 1.953 HIS 12.A NE2 LYS 6.A O HIS 12.A HE2 3.074 2.370 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.360 2.537 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.058 2.339 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.105 2.439 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.133 2.288 LYS 15.A NZ HIS 12.A ND1 LYS 15.A HZ2 2.760 1.847 ASP 16.A N TRP 13.A O ASP 16.A H 3.218 2.618 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.877 2.106 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.807 1.950 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.076 2.218 GLY 22.A N ILE 19.A O GLY 22.A H 2.773 2.027 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.943 2.101 ARG 24.A NE GLY 192.A O ARG 24.A HE 2.995 2.190 ARG 24.A NH1 PRO 134.A O ARG 24.A HH12 3.391 2.706 ARG 24.A NH2 PRO 134.A O ARG 24.A HH22 3.221 2.491 ARG 24.A NH2 GLY 192.A O ARG 24.A HH21 2.981 2.257 ARG 24.A NH2 VAL 203.A O ARG 24.A HH21 3.002 2.405 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE22 3.100 2.247 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE21 3.040 2.187 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.853 2.138 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.817 1.973 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.801 1.976 THR 32.A OG1 ASP 107.A OD1 THR 32.A HG1 3.308 2.496 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.076 2.301 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.980 2.237 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.222 2.464 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.946 2.136 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 3.002 2.229 SER 40.A OG ASP 38.A OD1 SER 40.A HG 2.665 1.827 SER 40.A OG ASP 38.A OD2 SER 40.A HG 3.444 2.829 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 2.891 2.038 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.870 2.021 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.911 2.055 TYR 48.A OH HIS 119.A NE2 TYR 48.A HH 2.697 1.887 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.094 2.256 SER 53.A OG PHE 172.A O SER 53.A HG 2.583 1.982 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.784 1.971 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.784 1.879 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH21 3.282 2.651 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 2.773 1.932 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.931 2.104 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.906 2.163 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H 2.935 2.086 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.055 2.117 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.225 2.263 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.140 2.344 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.833 1.997 HIS 61.A N ASN 59.A OD1 HIS 61.A H 2.892 2.058 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.957 2.152 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.786 1.992 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.887 2.088 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.823 1.978 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.992 2.196 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 2.835 2.012 SER 70.A N ASP 68.A OD1 SER 70.A H 2.934 2.079 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1 LYS 73.A HZ3 3.028 2.145 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2 LYS 73.A HZ2 2.857 1.960 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.996 2.202 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.791 1.963 LYS 77.A N SER 45.A O LYS 77.A H 2.921 2.091 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.093 2.282 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.834 1.996 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.020 2.210 TYR 85.A OH ASP 135.A O TYR 85.A HH 2.995 2.341 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.806 2.023 ARG 86.A NE ASP 72.A OD1 ARG 86.A HE 2.422 1.471 ARG 86.A NH1 ASP 69.A O ARG 86.A HH11 2.913 2.168 ARG 86.A NH2 ASP 72.A OD1 ARG 86.A HH21 3.030 2.409 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.865 2.010 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.905 2.054 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.934 2.169 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.048 2.278 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.742 1.884 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.885 2.079 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.796 1.953 HIS 93.A NE2 HIS 116.A ND1 no hydrogen 3.059 N/A TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.854 2.018 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.810 2.134 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 2.980 2.242 GLN 100.A N LEU 97.A O GLN 100.A H 3.247 2.413 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE21 2.825 1.968 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD2 GLN 100.A HE21 3.416 2.847 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.976 2.260 SER 102.A OG HIS 104.A O SER 102.A HG 2.783 2.232 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.872 2.139 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.821 2.109 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.761 1.920 HIS 104.A NE2 TYR 190.A OH HIS 104.A HE2 2.599 1.775 THR 105.A OG1 ASP 29.A OD1 THR 105.A HG1 2.695 1.922 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.073 2.287 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.793 1.955 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.768 1.959 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.847 2.007 TYR 111.A N SER 102.A OG TYR 111.A H 2.890 2.082 ALA 112.A N LEU 144.A O ALA 112.A H 3.075 2.479 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.866 2.108 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.749 1.898 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.840 1.983 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.671 1.836 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.890 2.047 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.834 1.977 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.895 2.144 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.030 2.265 TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 2.927 2.180 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.687 1.940 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.744 1.898 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.272 2.320 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.978 2.134 THR 122.A OG1 THR 84.A O THR 122.A HG1 3.331 2.532 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.058 2.217 LYS 123.A NZ ASP 135.A OD2 LYS 123.A HZ1 3.344 2.567 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.107 2.250 TYR 124.A OH ASP 135.A OD1 TYR 124.A HH 2.572 1.775 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.105 2.289 ASP 126.A N TYR 124.A O ASP 126.A H 2.908 2.212 LYS 129.A N ASP 126.A OD1 LYS 129.A H 2.859 2.080 ALA 130.A N ASP 126.A O ALA 130.A H 2.987 2.199 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 2.999 2.211 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.105 2.295 GLN 132.A NE2 GLY 128.A O GLN 132.A HE21 3.045 2.192 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 2.961 2.155 GLN 133.A NE2 LYS 129.A O GLN 133.A HE21 3.239 2.426 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.141 2.385 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.814 2.027 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.882 2.071 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.140 2.373 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.909 2.094 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.801 1.971 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.866 2.088 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.937 2.092 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.933 2.108 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.756 1.923 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 3.002 2.156 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ1 3.226 2.270 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 3.025 2.213 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.066 2.211 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE21 3.126 2.467 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2 GLN 154.A HE21 3.240 2.404 LYS 155.A NZ ASN 174.A O LYS 155.A HZ2 3.168 2.355 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.110 2.282 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.891 2.120 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.186 2.442 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.246 2.408 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.927 2.142 SER 162.A OG VAL 159.A O SER 162.A HG 2.676 1.839 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 2.970 2.144 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H 2.917 2.082 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.773 1.955 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.136 2.308 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.922 2.153 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.976 2.119 THR 173.A N ASP 171.A OD1.B THR 173.A H 3.121 2.334 THR 173.A OG1 ASP 171.A OD1.B THR 173.A HG1 2.992 2.181 PHE 175.A N SER 53.A OG PHE 175.A H 2.861 2.008 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.933 2.133 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 2.994 2.143 ARG 178.A NE ASP 176.A OD2 ARG 178.A HE 3.229 2.565 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 2.875 2.084 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.194 2.346 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 2.974 2.120 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.317 2.464 SER 184.A N GLU 210.A OE1 SER 184.A H 2.956 2.149 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.089 2.231 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 2.927 2.095 TYR 187.A OH LYS 42.A O TYR 187.A HH 2.917 2.105 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.848 2.025 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.833 2.062 THR 189.A OG1 TRP 205.A O THR 189.A HG1 2.799 2.024 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.218 2.478 TYR 190.A OH SER 26.A OG TYR 190.A HH 2.808 2.121 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.811 1.952 SER 193.A OG LEU 194.A O SER 193.A HG 2.768 2.010 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.990 2.207 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.630 1.829 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.823 2.068 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.262 2.415 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.845 2.006 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.925 2.103 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.942 2.135 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 2.954 2.120 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.806 1.968 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.893 2.059 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 2.992 2.163 LYS 209.A NZ ASP 186.A OD2 LYS 209.A HZ2 3.361 2.481 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.875 2.071 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.881 2.051 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.068 2.243 GLU 217.A N GLU 217.A OE1 GLU 217.A H 2.873 2.100 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.109 2.293 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE22 2.979 2.130 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE21 2.942 2.131 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.080 2.257 LEU 220.A N SER 216.A O LEU 220.A H 2.853 2.035 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.179 2.462 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H 3.170 2.511 PHE 222.A N GLN 218.A O PHE 222.A H 3.389 2.620 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.181 2.409 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.893 2.124 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.515 2.886 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.791 1.936 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.270 2.447 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.203 2.364 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.798 2.037 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.887 2.077 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 2.969 2.047 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.739 1.925 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.164 2.445 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.763 1.913 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.774 1.919 ASP 239.A N TRP 94.A O ASP 239.A H 2.845 2.241 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O ASN 240.A HD22 2.885 1.926 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.029 2.183 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.784 1.956 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.782 1.967 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.834 2.133 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.148 2.474 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.355 2.717 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.830 1.999 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE21 2.819 1.972 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ2 2.842 1.935 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.808 1.838 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.007 2.295 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.843 2.003 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.772 1.977 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.894 2.199 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.512 2.876 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 2.986 2.139 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.894 2.061 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.857 2.023