Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6mdn_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 7.A NZ ASP 2.A O LYS 7.A HZ2 3.446 2.647 GLU 16.A N LEU 13.A O GLU 16.A H 2.777 2.073 SER 18.A N ASP 14.A O SER 18.A H 2.866 2.118 ASP 19.A N LYS 15.A O ASP 19.A H 2.823 2.021 ILE 20.A N GLU 16.A O ILE 20.A H 3.011 2.195 PHE 21.A N PHE 17.A O PHE 21.A H 2.977 2.142 ARG 22.A N SER 18.A O ARG 22.A H 2.641 2.021 ARG 22.A NH1 LYS 15.A O ARG 22.A HH12 3.095 2.386 ARG 23.A N ASP 19.A O ARG 23.A H 3.004 2.189 ARG 23.A NH2 ASP 19.A OD1 ARG 23.A HH21 2.432 1.658 ALA 24.A N ILE 20.A O ALA 24.A H 2.718 1.980 PHE 25.A N ILE 20.A O PHE 25.A H 3.020 2.350 ARG 28.A N PHE 25.A O ARG 28.A H 3.304 2.602 ARG 28.A NH2 ASN 155.A OD1 ARG 28.A HH22 3.273 2.622 VAL 29.A N PHE 25.A O VAL 29.A H 3.340 2.500 GLU 33.A N GLU 33.A OE1 GLU 33.A H 2.782 1.997 GLU 36.A N PRO 32.A O GLU 36.A H 2.875 2.065 GLN 37.A N ILE 34.A O GLN 37.A H 2.920 2.165 GLN 37.A NE2 GLU 33.A O GLN 37.A HE22 2.446 1.643 GLY 39.A N VAL 35.A O GLY 39.A H 2.565 1.811 ILE 46.A N VAL 159.A O ILE 46.A H 2.989 2.189 LEU 47.A N VAL 181.A O LEU 47.A H 2.993 2.160 LEU 48.A N GLY 161.A O LEU 48.A H 3.252 2.419 TYR 49.A N MET 183.A O TYR 49.A H 2.922 2.093 LYS 56.A NZ PRO 51.A O LYS 56.A HZ1 2.573 1.749 LEU 59.A N LYS 56.A O LEU 59.A H 2.887 2.145 ARG 61.A NH1 THR 57.A O ARG 61.A HH11 3.230 2.588 ILE 63.A N LEU 59.A O ILE 63.A H 2.961 2.239 ILE 63.A N ALA 60.A O ILE 63.A H 2.965 2.344 GLY 64.A N ALA 60.A O GLY 64.A H 2.975 2.159 LYS 65.A N ARG 61.A O LYS 65.A H 2.658 1.858 MET 66.A N GLN 62.A O MET 66.A H 2.570 1.774 LEU 67.A N ILE 63.A O LEU 67.A H 2.688 1.842 VAL 75.A N ILE 116.A O VAL 75.A H 2.910 2.115 GLU 79.A N ASN 76.A O GLU 79.A H 3.179 2.587 ILE 80.A N GLY 77.A O ILE 80.A H 2.745 2.019 GLU 87.A N TYR 84.A O GLU 87.A H 3.310 2.563 GLU 89.A N GLU 89.A OE1 GLU 89.A H 2.464 1.662 ALA 90.A N GLY 86.A O ALA 90.A H 3.373 2.553 ASN 91.A N GLU 87.A O ASN 91.A H 3.131 2.418 ASN 91.A N SER 88.A O ASN 91.A H 3.110 2.425 ARG 93.A N GLU 89.A O ARG 93.A H 3.109 2.332 LYS 94.A N ALA 90.A O LYS 94.A H 2.927 2.175 LEU 95.A N ASN 91.A O LEU 95.A H 3.065 2.278 PHE 96.A N ILE 92.A O PHE 96.A H 3.045 2.222 ALA 97.A N ARG 93.A O ALA 97.A H 2.878 2.078 ASP 98.A N LYS 94.A O ASP 98.A H 3.118 2.363 ALA 99.A N PHE 96.A O ALA 99.A H 2.984 2.163 GLU 102.A N GLU 102.A OE1 GLU 102.A H 2.739 1.963 GLN 103.A N ALA 99.A O GLN 103.A H 3.010 2.212 ARG 104.A N GLU 100.A O ARG 104.A H 2.925 2.071 ARG 105.A N GLU 101.A O ARG 105.A H 2.810 2.000 LEU 106.A N GLU 102.A O LEU 106.A H 2.711 1.868 SER 110.A OG ASN 156.A OD1 SER 110.A HG 2.784 2.262 HIS 113.A N ASN 156.A O HIS 113.A H 3.098 2.291 ILE 115.A N LEU 158.A O ILE 115.A H 2.758 1.954 PHE 117.A N ILE 160.A O PHE 117.A H 3.284 2.438 ASP 118.A N VAL 75.A O ASP 118.A H 2.734 2.012 ILE 120.A N MET 162.A O ILE 120.A H 3.345 2.568 CYS 124.A N ILE 120.A O CYS 124.A H 3.093 2.345 GLY 135.A N THR 134.A OG1 GLY 135.A H 2.498 1.875 VAL 140.A N HIS 137.A O VAL 140.A H 3.282 2.434 GLN 143.A N VAL 140.A O GLN 143.A H 2.934 2.292 LEU 144.A N VAL 140.A O LEU 144.A H 3.111 2.336 LEU 145.A N VAL 141.A O LEU 145.A H 2.957 2.117 SER 146.A N ASN 142.A O SER 146.A H 2.971 2.161 LYS 147.A N GLN 143.A O LYS 147.A H 2.967 2.255 LYS 147.A N LEU 144.A O LYS 147.A H 2.850 2.224 ILE 148.A N LEU 144.A O ILE 148.A H 2.946 2.217 ASP 149.A N LEU 145.A O ASP 149.A H 2.900 2.069 GLN 153.A N GLN 153.A OE1 GLN 153.A H 2.537 1.781 ASN 156.A ND2 GLY 111.A O ASN 156.A HD22 2.398 1.708 ASN 156.A ND2 ASN 156.A O ASN 156.A HD21 2.558 2.009 ILE 160.A N ILE 115.A O ILE 160.A H 2.950 2.174 GLY 161.A N ILE 46.A O GLY 161.A H 2.869 2.016 ASN 164.A ND2 GLY 50.A O ASN 164.A HD21 2.338 1.716 ARG 165.A N THR 163.A OG1 ARG 165.A H 2.805 1.961 ARG 165.A NH1 ASP 121.A OD2 ARG 165.A HH11 2.529 1.722 ASP 170.A N CYS 124.A O ASP 170.A H 3.312 2.542 ALA 172.A N ASP 170.A OD2 ALA 172.A H 2.549 1.735 ARG 175.A N ALA 172.A O ARG 175.A H 3.306 2.452 ARG 175.A NH1 PRO 176.A O ARG 175.A HH11 3.043 2.266 ARG 178.A N ARG 175.A O ARG 178.A H 3.001 2.226 MET 183.A N LEU 47.A O MET 183.A H 2.971 2.311 ILE 185.A N TYR 49.A O ILE 185.A H 2.634 1.826 ARG 193.A N ASP 189.A O ARG 193.A H 3.008 2.275 LEU 194.A N GLU 190.A O LEU 194.A H 2.812 2.008 GLN 195.A N LYS 191.A O GLN 195.A H 3.048 2.230 GLN 195.A NE2 ASP 14.A OD2 GLN 195.A HE22 3.491 2.662 ILE 196.A N GLY 192.A O ILE 196.A H 2.917 2.117 LEU 197.A N ARG 193.A O LEU 197.A H 2.831 2.015 HIS 198.A N LEU 194.A O HIS 198.A H 2.934 2.121 ILE 199.A N GLN 195.A O ILE 199.A H 2.913 2.177 HIS 200.A N ILE 196.A O HIS 200.A H 2.938 2.118 THR 201.A N LEU 197.A O THR 201.A H 2.960 2.156 ALA 202.A N ILE 199.A O ALA 202.A H 2.859 2.057 ARG 205.A N THR 201.A O ARG 205.A H 2.765 1.938 GLY 206.A N ALA 202.A O GLY 206.A H 3.397 2.604 HIS 207.A N ARG 203.A O HIS 207.A H 2.700 1.891 GLN 208.A N ARG 205.A O GLN 208.A H 3.247 2.583 LYS 217.A N ASP 215.A OD1 LYS 217.A H 2.908 2.136 LEU 219.A N ASP 215.A O LEU 219.A H 3.181 2.404 ALA 220.A N ILE 216.A O ALA 220.A H 2.782 1.994 GLU 222.A N GLU 218.A O GLU 222.A H 2.910 2.157 LYS 224.A NZ ASN 334.A O LYS 224.A HZ1 3.205 2.401 SER 227.A N GLU 230.A OE2 SER 227.A H 3.325 2.537 ALA 229.A N GLY 53.A O ALA 229.A H 3.289 2.497 GLU 230.A N SER 227.A O GLU 230.A H 2.783 2.101 LEU 231.A N SER 227.A O LEU 231.A H 3.342 2.602 GLU 232.A N ALA 229.A O GLU 232.A H 3.246 2.565 LEU 234.A N GLU 230.A O LEU 234.A H 2.618 1.842 VAL 235.A N LEU 231.A O VAL 235.A H 2.566 1.763 ARG 236.A N GLU 232.A O ARG 236.A H 2.759 1.967 ALA 237.A N GLY 233.A O ALA 237.A H 2.614 1.858 ALA 238.A N LEU 234.A O ALA 238.A H 2.567 1.776 GLN 239.A N VAL 235.A O GLN 239.A H 2.572 1.902 SER 240.A N ALA 237.A O SER 240.A H 2.869 2.126 THR 241.A N ALA 237.A O THR 241.A H 3.266 2.597 MET 243.A N SER 240.A O MET 243.A H 2.999 2.403 ASN 244.A N SER 240.A O ASN 244.A H 2.511 1.683 LEU 257.A N LEU 254.A O LEU 257.A H 2.887 2.226 GLU 258.A N LEU 254.A O GLU 258.A H 2.807 2.089 ASN 259.A N ALA 255.A O ASN 259.A H 2.890 2.125 ILE 261.A N GLU 258.A O ILE 261.A H 2.775 2.109 GLN 269.A N GLU 270.A OE1 GLN 269.A H 2.980 2.356 GLU 270.A N GLU 270.A OE1 GLU 270.A H 2.603 1.824 ILE 276.A N TYR 272.A O ILE 276.A H 2.423 1.602 ARG 289.A N ASP 285.A O ARG 289.A H 2.908 2.079 VAL 290.A N PRO 286.A O VAL 290.A H 2.924 2.117 LEU 291.A N VAL 287.A O LEU 291.A H 3.048 2.210 ASP 292.A N THR 288.A O ASP 292.A H 2.813 2.052 ASP 293.A N ARG 289.A O ASP 293.A H 2.806 2.072 GLY 294.A N VAL 290.A O GLY 294.A H 2.896 2.130 GLU 295.A N LEU 291.A O GLU 295.A H 2.948 2.106 LEU 296.A N ASP 293.A O LEU 296.A H 2.966 2.321 LEU 297.A N ASP 293.A O LEU 297.A H 2.958 2.155 VAL 298.A N GLY 294.A O VAL 298.A H 2.980 2.178 GLN 300.A N LEU 297.A O GLN 300.A H 3.193 2.561 THR 301.A N VAL 298.A O THR 301.A H 3.093 2.461 LYS 302.A N VAL 298.A O LYS 302.A H 3.272 2.437 ASN 303.A N GLN 299.A O ASN 303.A H 2.939 2.241 ASN 303.A N GLN 300.A O ASN 303.A H 3.290 2.595 SER 304.A N THR 301.A O SER 304.A H 2.806 1.948 SER 304.A OG THR 307.A O SER 304.A HG 3.174 2.563 SER 304.A OG THR 307.A OG1 SER 304.A HG 2.974 2.323 VAL 312.A N ILE 415.A O VAL 312.A H 3.385 2.570 LEU 314.A N GLY 417.A O LEU 314.A H 2.920 2.114 LYS 322.A NZ GLY 316.A O LYS 322.A HZ2 3.271 2.731 LEU 325.A N GLY 321.A O LEU 325.A H 3.135 2.377 ALA 326.A N LYS 322.A O ALA 326.A H 2.979 2.171 ALA 327.A N THR 323.A O ALA 327.A H 2.968 2.169 LYS 328.A N ALA 324.A O LYS 328.A H 2.912 2.162 ILE 329.A N LEU 325.A O ILE 329.A H 2.906 2.079 ALA 330.A N ALA 326.A O ALA 330.A H 2.943 2.188 GLU 331.A N ALA 327.A O GLU 331.A H 2.853 2.125 CYS 341.A N VAL 374.A O CYS 341.A H 2.932 2.203 SER 342.A OG TYR 275.A OH SER 342.A HG 3.126 2.310 LYS 345.A NZ SER 342.A OG LYS 345.A HZ2 3.277 2.576 MET 346.A N SER 342.A O MET 346.A H 3.396 2.583 GLU 351.A N GLU 351.A OE1 GLU 351.A H 2.420 1.723 ALA 353.A N SER 350.A O ALA 353.A H 2.999 2.246 LYS 354.A N SER 350.A O LYS 354.A H 3.282 2.466 LYS 354.A NZ ASP 383.A OD2 LYS 354.A HZ2 3.447 2.631 ALA 357.A N ALA 353.A O ALA 357.A H 2.979 2.353 ALA 357.A N LYS 354.A O ALA 357.A H 3.091 2.430 MET 358.A N LYS 354.A O MET 358.A H 2.951 2.289 MET 358.A N CYS 355.A O MET 358.A H 3.009 2.368 LYS 359.A N CYS 355.A O LYS 359.A H 2.870 2.052 ILE 361.A N ALA 357.A O ILE 361.A H 2.977 2.215 PHE 362.A N MET 358.A O PHE 362.A H 2.988 2.184 ASP 363.A N LYS 359.A O ASP 363.A H 2.912 2.063 ASP 364.A N LYS 360.A O ASP 364.A H 2.868 2.076 ALA 365.A N ILE 361.A O ALA 365.A H 2.859 2.148 TYR 366.A N PHE 362.A O TYR 366.A H 2.566 1.868 LYS 367.A NZ ASP 363.A O LYS 367.A HZ2 2.324 1.740 SER 368.A N ALA 365.A O SER 368.A H 2.981 2.216 SER 371.A N LYS 412.A O SER 371.A H 2.972 2.352 CYS 372.A N PHE 337.A O CYS 372.A H 3.130 2.319 VAL 373.A N LEU 414.A O VAL 373.A H 2.974 2.165 VAL 374.A N LYS 339.A O VAL 374.A H 3.161 2.422 VAL 375.A N ILE 416.A O VAL 375.A H 2.862 2.019 ASP 376.A N CYS 341.A O ASP 376.A H 3.336 2.539 ASP 377.A N THR 418.A OG1 ASP 377.A H 2.644 1.831 GLU 379.A N GLU 379.A OE1 GLU 379.A H 2.773 1.977 ARG 380.A N ASP 377.A O ARG 380.A H 2.636 1.873 LEU 382.A N ILE 378.A O LEU 382.A H 2.837 2.009 ASP 383.A N ARG 380.A O ASP 383.A H 2.735 1.971 TYR 384.A N GLU 379.A O TYR 384.A H 3.095 2.244 VAL 385.A N ARG 390.A O VAL 385.A H 3.270 2.582 SER 392.A N LEU 382.A O SER 392.A H 3.417 2.622 VAL 395.A N SER 392.A O VAL 395.A H 3.262 2.498 GLN 397.A N ASN 393.A O GLN 397.A H 3.080 2.254 ALA 398.A N LEU 394.A O ALA 398.A H 2.903 2.081 LEU 399.A N VAL 395.A O LEU 399.A H 2.852 2.251 LEU 399.A N LEU 396.A O LEU 399.A H 3.136 2.466 LEU 400.A N LEU 396.A O LEU 400.A H 2.809 2.069 LEU 400.A N GLN 397.A O LEU 400.A H 3.280 2.625 VAL 401.A N GLN 397.A O VAL 401.A H 3.239 2.404 LEU 403.A N LEU 399.A O LEU 403.A H 3.032 2.364 LYS 404.A N VAL 401.A O LYS 404.A H 2.880 2.160 LYS 405.A N LEU 402.A O LYS 405.A H 3.169 2.319 LYS 405.A NZ TYR 366.A OH LYS 405.A HZ3 3.376 2.617 ARG 411.A N PRO 408.A O ARG 411.A H 3.244 2.440 ARG 411.A NE GLN 369.A OE1 ARG 411.A HE 3.122 2.430 LYS 412.A N GLN 369.A O LYS 412.A H 2.587 1.766 LEU 413.A N PRO 308.A O LEU 413.A H 3.015 2.244 LEU 414.A N SER 371.A O LEU 414.A H 2.968 2.214 ILE 416.A N VAL 373.A O ILE 416.A H 2.951 2.274 GLY 417.A N VAL 312.A O GLY 417.A H 3.344 2.547 THR 419.A OG1 ARG 421.A O THR 419.A HG1 3.102 2.706 SER 420.A N GLU 379.A OE2 SER 420.A H 2.832 2.200 ARG 421.A N GLU 379.A OE2 ARG 421.A H 2.772 1.948 GLN 426.A N LYS 422.A O GLN 426.A H 2.833 2.054 GLU 427.A N ASP 423.A O GLU 427.A H 2.971 2.163 MET 428.A N VAL 424.A O MET 428.A H 2.699 2.073 GLU 429.A N GLN 426.A O GLU 429.A H 3.374 2.554 MET 430.A N LEU 425.A O MET 430.A H 3.063 2.249 ALA 433.A N MET 430.A O ALA 433.A H 3.268 2.550 PHE 434.A N MET 430.A O PHE 434.A H 3.248 2.420 SER 435.A N SER 311.A OG SER 435.A H 2.808 1.976 VAL 440.A N GLU 315.A O VAL 440.A H 2.889 2.204 GLU 447.A N GLU 447.A OE1 GLU 447.A H 2.620 1.829 LEU 449.A N THR 445.A O LEU 449.A H 3.165 2.500 LEU 450.A N GLY 446.A O LEU 450.A H 2.939 2.123 ALA 452.A N GLN 448.A O ALA 452.A H 2.974 2.178 LEU 453.A N LEU 449.A O LEU 453.A H 2.898 2.103 GLU 454.A N LEU 450.A O GLU 454.A H 2.811 2.063 LEU 455.A N GLU 451.A O LEU 455.A H 3.000 2.232 LEU 456.A N ALA 452.A O LEU 456.A H 2.891 2.152 GLY 457.A N LEU 453.A O GLY 457.A H 2.640 1.786 LYS 460.A N GLU 463.A OE1 LYS 460.A H 3.134 2.382 ARG 464.A N LYS 460.A O ARG 464.A H 2.646 1.895 THR 465.A N ASP 461.A O THR 465.A H 2.669 1.966 THR 466.A N LYS 462.A O THR 466.A H 2.818 2.055 ALA 468.A N ARG 464.A O ALA 468.A H 2.933 2.096 GLN 469.A N THR 465.A O GLN 469.A H 2.808 2.014 GLN 470.A N THR 466.A O GLN 470.A H 2.935 2.118 VAL 471.A N ILE 467.A O VAL 471.A H 3.088 2.334 ILE 478.A N ILE 443.A O ILE 478.A H 3.282 2.485 LYS 481.A N HIS 319.A O LYS 481.A H 3.314 2.510 LYS 482.A N GLY 479.A O LYS 482.A H 3.202 2.554 LEU 483.A N GLY 479.A O LEU 483.A H 3.351 2.599 LEU 484.A N ILE 480.A O LEU 484.A H 2.963 2.138 MET 485.A N LYS 481.A O MET 485.A H 3.019 2.247 LEU 486.A N LYS 482.A O LEU 486.A H 2.990 2.198 ILE 487.A N LEU 483.A O ILE 487.A H 2.981 2.141 GLU 488.A N LEU 484.A O GLU 488.A H 3.003 2.182 MET 489.A N MET 485.A O MET 489.A H 2.968 2.309 SER 490.A N LEU 486.A O SER 490.A H 2.799 2.056 LEU 491.A N ILE 487.A O LEU 491.A H 2.491 1.754 TYR 497.A N ASP 494.A O TYR 497.A H 2.859 2.246 ARG 498.A N PRO 495.A O ARG 498.A H 3.280 2.497 LYS 501.A N TYR 497.A O LYS 501.A H 3.427 2.610 LEU 503.A N VAL 499.A O LEU 503.A H 2.962 2.210 ALA 504.A N ARG 500.A O ALA 504.A H 2.869 2.038 LEU 505.A N LYS 501.A O LEU 505.A H 2.962 2.114 LEU 506.A N PHE 502.A O LEU 506.A H 2.873 2.122 ARG 507.A N LEU 503.A O ARG 507.A H 3.096 2.466 ARG 507.A N ALA 504.A O ARG 507.A H 3.265 2.532 ARG 507.A NH1 GLU 509.A OE2 ARG 507.A HH11 2.764 1.913 GLU 508.A N LEU 505.A O GLU 508.A H 3.141 2.321 GLU 509.A N GLU 509.A OE1 GLU 509.A H 2.615 1.783