Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6mdo_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 7.A NZ ASP 2.A O LYS 7.A HZ2 2.544 1.721 PHE 17.A N LEU 13.A O PHE 17.A H 3.014 2.191 SER 18.A N ASP 14.A O SER 18.A H 2.816 2.049 ASP 19.A N LYS 15.A O ASP 19.A H 2.888 2.084 ILE 20.A N GLU 16.A O ILE 20.A H 3.090 2.264 PHE 21.A N PHE 17.A O PHE 21.A H 2.953 2.112 ARG 22.A N SER 18.A O ARG 22.A H 2.672 2.016 ARG 22.A N ASP 19.A O ARG 22.A H 2.923 2.332 ARG 22.A NH1 LYS 15.A O ARG 22.A HH12 3.403 2.692 ARG 23.A N ASP 19.A O ARG 23.A H 3.082 2.261 ARG 23.A NE ASP 19.A OD1 ARG 23.A HE 3.218 2.607 ARG 23.A NH2 ASP 19.A OD1 ARG 23.A HH21 2.445 1.680 ALA 24.A N ILE 20.A O ALA 24.A H 2.799 2.033 PHE 25.A N ILE 20.A O PHE 25.A H 3.270 2.595 ARG 28.A NH2 VAL 43.A O ARG 28.A HH21 3.290 2.449 ILE 34.A N PRO 31.A O ILE 34.A H 3.255 2.467 GLU 36.A N PRO 32.A O GLU 36.A H 2.932 2.094 GLN 37.A N ILE 34.A O GLN 37.A H 2.999 2.259 GLN 37.A NE2 GLU 33.A O GLN 37.A HE22 2.439 1.634 GLY 39.A N VAL 35.A O GLY 39.A H 2.908 2.177 LYS 44.A NZ LEU 154.A O LYS 44.A HZ3 2.458 1.723 ILE 46.A N VAL 159.A O ILE 46.A H 2.888 2.088 LEU 47.A N VAL 181.A O LEU 47.A H 2.930 2.119 LEU 48.A N GLY 161.A O LEU 48.A H 2.968 2.150 TYR 49.A N MET 183.A O TYR 49.A H 2.977 2.175 GLY 50.A N THR 163.A O GLY 50.A H 3.389 2.624 CYS 54.A SG GLY 186.A O CYS 54.A HG 3.332 2.494 LEU 59.A N LYS 56.A O LEU 59.A H 2.805 2.145 ALA 60.A N LYS 56.A O ALA 60.A H 3.021 2.302 ARG 61.A NH1 THR 57.A O ARG 61.A HH11 3.481 2.815 ILE 63.A N LEU 59.A O ILE 63.A H 2.918 2.200 ILE 63.A N ALA 60.A O ILE 63.A H 3.044 2.428 GLY 64.A N ALA 60.A O GLY 64.A H 3.027 2.203 LYS 65.A N ARG 61.A O LYS 65.A H 2.957 2.146 MET 66.A N GLN 62.A O MET 66.A H 2.879 2.125 LEU 67.A N ILE 63.A O LEU 67.A H 2.873 2.030 ARG 70.A N LEU 112.A O ARG 70.A H 3.314 2.613 ARG 70.A NH1 SER 110.A OG ARG 70.A HH12 2.611 1.795 LYS 73.A NZ ASP 98.A OD2 LYS 73.A HZ1 2.893 2.056 VAL 75.A N ILE 116.A O VAL 75.A H 3.008 2.198 GLY 77.A N GLU 119.A O GLY 77.A H 3.175 2.557 ILE 80.A N GLY 77.A O ILE 80.A H 2.756 2.063 GLU 87.A N TYR 84.A O GLU 87.A H 3.366 2.615 ALA 90.A N GLY 86.A O ALA 90.A H 2.999 2.185 ASN 91.A N GLU 87.A O ASN 91.A H 2.869 2.095 ILE 92.A N SER 88.A O ILE 92.A H 3.101 2.293 ARG 93.A N GLU 89.A O ARG 93.A H 2.909 2.109 ARG 93.A NH2 GLU 89.A OE2 ARG 93.A HH22 3.267 2.470 LYS 94.A N ALA 90.A O LYS 94.A H 2.917 2.132 LEU 95.A N ASN 91.A O LEU 95.A H 3.049 2.235 PHE 96.A N ILE 92.A O PHE 96.A H 3.061 2.239 ALA 97.A N ARG 93.A O ALA 97.A H 2.811 2.017 ASP 98.A N LYS 94.A O ASP 98.A H 3.142 2.404 ALA 99.A N PHE 96.A O ALA 99.A H 2.874 2.054 GLU 102.A N GLU 102.A OE1 GLU 102.A H 2.556 1.846 GLN 103.A N ALA 99.A O GLN 103.A H 2.989 2.195 ARG 104.A N GLU 100.A O ARG 104.A H 2.961 2.108 ARG 105.A N GLU 101.A O ARG 105.A H 2.943 2.111 LEU 106.A N GLU 102.A O LEU 106.A H 2.878 2.026 SER 110.A OG ASN 156.A OD1 SER 110.A HG 2.872 2.374 HIS 113.A N ASN 156.A O HIS 113.A H 2.982 2.170 ILE 115.A N LEU 158.A O ILE 115.A H 2.917 2.111 PHE 117.A N ILE 160.A O PHE 117.A H 3.142 2.324 ASP 118.A N VAL 75.A O ASP 118.A H 2.558 1.787 CYS 124.A N ILE 120.A O CYS 124.A H 2.999 2.265 LYS 125.A NZ ALA 122.A O LYS 125.A HZ2 3.118 2.466 VAL 140.A N HIS 137.A O VAL 140.A H 3.352 2.508 GLN 143.A N VAL 140.A O GLN 143.A H 2.942 2.317 LEU 144.A N VAL 140.A O LEU 144.A H 3.007 2.210 LEU 145.A N VAL 141.A O LEU 145.A H 2.953 2.103 SER 146.A N ASN 142.A O SER 146.A H 2.908 2.101 SER 146.A OG GLN 143.A OE1 SER 146.A HG 3.499 2.982 LYS 147.A N GLN 143.A O LYS 147.A H 3.005 2.246 LYS 147.A N LEU 144.A O LYS 147.A H 3.028 2.438 ILE 148.A N LEU 144.A O ILE 148.A H 2.986 2.228 ASP 149.A N LEU 145.A O ASP 149.A H 2.987 2.154 ASN 156.A ND2 SER 110.A OG ASN 156.A HD22 3.098 2.399 ASN 156.A ND2 GLY 111.A O ASN 156.A HD22 2.456 1.805 ASN 156.A ND2 ASN 156.A O ASN 156.A HD21 2.679 2.115 VAL 159.A N LYS 44.A O VAL 159.A H 3.181 2.575 ILE 160.A N ILE 115.A O ILE 160.A H 3.085 2.284 GLY 161.A N ILE 46.A O GLY 161.A H 2.916 2.082 MET 162.A N PHE 117.A O MET 162.A H 3.203 2.603 ASN 164.A ND2 ASN 164.A O ASN 164.A HD21 2.447 1.876 ASP 170.A N CYS 124.A O ASP 170.A H 3.140 2.449 ALA 172.A N ASP 170.A OD2 ALA 172.A H 2.573 1.807 LEU 173.A N ASP 170.A OD2 LEU 173.A H 3.015 2.375 ARG 175.A N ALA 172.A O ARG 175.A H 3.342 2.498 ARG 175.A NH1 PRO 176.A O ARG 175.A HH11 2.827 1.995 ARG 178.A N ARG 175.A O ARG 178.A H 3.151 2.383 GLU 180.A N GLY 45.A O GLU 180.A H 3.218 2.464 MET 183.A N LEU 47.A O MET 183.A H 2.940 2.234 ILE 185.A N TYR 49.A O ILE 185.A H 2.641 1.801 ARG 193.A N ASP 189.A O ARG 193.A H 2.895 2.151 ARG 193.A NH2 THR 223.A O ARG 193.A HH22 2.261 1.640 LEU 194.A N GLU 190.A O LEU 194.A H 2.890 2.061 GLN 195.A N LYS 191.A O GLN 195.A H 3.020 2.200 GLN 195.A NE2 ASP 14.A OD2 GLN 195.A HE22 3.449 2.607 ILE 196.A N GLY 192.A O ILE 196.A H 2.862 2.063 LEU 197.A N ARG 193.A O LEU 197.A H 2.885 2.075 HIS 198.A N LEU 194.A O HIS 198.A H 2.965 2.147 ILE 199.A N GLN 195.A O ILE 199.A H 2.883 2.117 HIS 200.A N ILE 196.A O HIS 200.A H 2.957 2.116 THR 201.A N LEU 197.A O THR 201.A H 2.873 2.076 ALA 202.A N ILE 199.A O ALA 202.A H 3.072 2.268 ARG 205.A N THR 201.A O ARG 205.A H 2.821 1.993 GLY 206.A N ALA 202.A O GLY 206.A H 2.915 2.128 HIS 207.A N ARG 203.A O HIS 207.A H 2.846 2.026 GLN 208.A N MET 204.A O GLN 208.A H 2.696 2.089 GLN 208.A NE2 ARG 205.A O GLN 208.A HE21 2.743 2.266 LYS 217.A N ASP 215.A OD1 LYS 217.A H 2.894 2.148 LYS 217.A NZ ASP 215.A OD1 LYS 217.A HZ2 3.291 2.450 LYS 217.A NZ ASP 215.A OD2 LYS 217.A HZ2 2.904 2.286 LEU 219.A N ASP 215.A O LEU 219.A H 2.934 2.155 ALA 220.A N ILE 216.A O ALA 220.A H 2.792 2.012 GLU 222.A N GLU 218.A O GLU 222.A H 2.935 2.164 ALA 229.A N GLY 53.A O ALA 229.A H 2.673 1.882 LEU 231.A N SER 227.A O LEU 231.A H 2.980 2.325 LEU 234.A N GLU 230.A O LEU 234.A H 2.970 2.183 VAL 235.A N LEU 231.A O VAL 235.A H 2.870 2.037 ARG 236.A N GLU 232.A O ARG 236.A H 2.844 2.067 ALA 237.A N GLY 233.A O ALA 237.A H 2.911 2.159 ALA 238.A N LEU 234.A O ALA 238.A H 2.916 2.118 GLN 239.A N VAL 235.A O GLN 239.A H 2.928 2.145 SER 240.A N ALA 237.A O SER 240.A H 3.030 2.389 THR 241.A N ALA 237.A O THR 241.A H 2.930 2.180 MET 243.A N SER 240.A O MET 243.A H 3.199 2.560 ASN 244.A N SER 240.A O ASN 244.A H 2.866 2.063 ILE 248.A N ARG 245.A O ILE 248.A H 3.404 2.594 LEU 257.A N LEU 254.A O LEU 257.A H 2.937 2.247 GLU 258.A N LEU 254.A O GLU 258.A H 2.937 2.183 ASN 259.A N ALA 255.A O ASN 259.A H 2.943 2.126 LYS 262.A N GLU 258.A O LYS 262.A H 2.979 2.237 GLU 270.A N GLU 270.A OE1 GLU 270.A H 2.498 1.858 ILE 276.A N TYR 272.A O ILE 276.A H 2.720 1.894 ARG 289.A N ASP 285.A O ARG 289.A H 2.962 2.137 VAL 290.A N PRO 286.A O VAL 290.A H 2.897 2.100 LEU 291.A N VAL 287.A O LEU 291.A H 3.062 2.221 ASP 292.A N THR 288.A O ASP 292.A H 2.807 2.049 ASP 293.A N ARG 289.A O ASP 293.A H 2.861 2.113 GLY 294.A N VAL 290.A O GLY 294.A H 2.974 2.187 GLU 295.A N LEU 291.A O GLU 295.A H 2.930 2.081 LEU 296.A N ASP 292.A O LEU 296.A H 2.762 2.165 LEU 296.A N ASP 293.A O LEU 296.A H 3.043 2.421 LEU 297.A N ASP 293.A O LEU 297.A H 2.956 2.155 VAL 298.A N GLY 294.A O VAL 298.A H 2.979 2.215 GLN 300.A N LEU 297.A O GLN 300.A H 3.204 2.557 ASN 303.A N GLN 299.A O ASN 303.A H 2.966 2.243 SER 304.A N THR 301.A O SER 304.A H 3.035 2.198 SER 304.A OG THR 307.A O SER 304.A HG 3.160 2.670 SER 304.A OG THR 307.A OG1 SER 304.A HG 2.671 1.945 VAL 310.A N LEU 413.A O VAL 310.A H 3.023 2.256 VAL 312.A N ILE 415.A O VAL 312.A H 2.945 2.126 LEU 314.A N GLY 417.A O LEU 314.A H 2.820 1.991 GLU 315.A N ILE 438.A O GLU 315.A H 3.028 2.424 LYS 322.A NZ THR 418.A O LYS 322.A HZ3 3.346 2.465 LEU 325.A N GLY 321.A O LEU 325.A H 2.971 2.186 ALA 326.A N LYS 322.A O ALA 326.A H 2.956 2.156 ALA 327.A N THR 323.A O ALA 327.A H 2.922 2.120 LYS 328.A N ALA 324.A O LYS 328.A H 2.887 2.100 ILE 329.A N LEU 325.A O ILE 329.A H 2.933 2.096 ALA 330.A N ALA 326.A O ALA 330.A H 2.929 2.180 GLU 331.A N ALA 327.A O GLU 331.A H 2.888 2.134 GLU 332.A N LYS 328.A O GLU 332.A H 2.898 2.290 CYS 341.A N VAL 374.A O CYS 341.A H 3.106 2.312 SER 342.A OG TYR 275.A OH SER 342.A HG 3.141 2.370 LYS 345.A NZ SER 342.A OG LYS 345.A HZ2 3.195 2.450 MET 346.A N SER 342.A O MET 346.A H 3.056 2.286 ALA 353.A N SER 350.A O ALA 353.A H 2.946 2.241 LYS 354.A N SER 350.A O LYS 354.A H 2.998 2.191 LYS 354.A NZ ASP 383.A OD2 LYS 354.A HZ2 2.962 2.130 ALA 357.A N ALA 353.A O ALA 357.A H 2.913 2.255 MET 358.A N LYS 354.A O MET 358.A H 2.910 2.242 MET 358.A N CYS 355.A O MET 358.A H 3.125 2.482 LYS 359.A N CYS 355.A O LYS 359.A H 2.862 2.022 PHE 362.A N MET 358.A O PHE 362.A H 2.998 2.229 ASP 363.A N LYS 359.A O ASP 363.A H 2.857 2.005 ASP 364.A N LYS 360.A O ASP 364.A H 2.919 2.107 ALA 365.A N ILE 361.A O ALA 365.A H 2.909 2.228 TYR 366.A N PHE 362.A O TYR 366.A H 2.849 2.109 LYS 367.A NZ ASP 363.A O LYS 367.A HZ2 2.923 2.156 SER 368.A N ALA 365.A O SER 368.A H 3.208 2.471 SER 371.A N LYS 412.A O SER 371.A H 2.989 2.356 CYS 372.A N PHE 337.A O CYS 372.A H 3.179 2.360 VAL 373.A N LEU 414.A O VAL 373.A H 2.973 2.148 VAL 375.A N ILE 416.A O VAL 375.A H 2.810 1.985 ASP 376.A N ASP 376.A OD1 ASP 376.A H 2.583 1.971 ASP 377.A N THR 418.A OG1 ASP 377.A H 2.720 1.916 GLU 379.A N GLU 379.A OE1 GLU 379.A H 2.740 1.940 ARG 380.A N ASP 377.A O ARG 380.A H 2.665 1.908 LEU 382.A N ILE 378.A O LEU 382.A H 2.857 2.038 ASP 383.A N ARG 380.A O ASP 383.A H 2.757 1.976 TYR 384.A N GLU 379.A O TYR 384.A H 3.039 2.212 SER 392.A N LEU 382.A O SER 392.A H 3.391 2.580 VAL 395.A N SER 392.A O VAL 395.A H 3.306 2.604 GLN 397.A N ASN 393.A O GLN 397.A H 3.143 2.300 ALA 398.A N LEU 394.A O ALA 398.A H 2.931 2.101 LEU 399.A N LEU 396.A O LEU 399.A H 3.136 2.438 LEU 400.A N LEU 396.A O LEU 400.A H 2.938 2.160 VAL 401.A N GLN 397.A O VAL 401.A H 3.107 2.261 LEU 403.A N LEU 399.A O LEU 403.A H 3.007 2.320 LYS 404.A N VAL 401.A O LYS 404.A H 3.032 2.322 ARG 411.A N PRO 408.A O ARG 411.A H 3.182 2.375 LYS 412.A N GLN 369.A O LYS 412.A H 2.733 1.909 LYS 412.A NZ THR 301.A O LYS 412.A HZ3 2.585 1.869 LYS 412.A NZ SER 304.A O LYS 412.A HZ3 2.953 2.360 LEU 413.A N PRO 308.A O LEU 413.A H 2.928 2.192 LEU 414.A N SER 371.A O LEU 414.A H 2.988 2.219 ILE 415.A N VAL 310.A O ILE 415.A H 2.958 2.272 ILE 416.A N VAL 373.A O ILE 416.A H 2.951 2.322 GLY 417.A N VAL 312.A O GLY 417.A H 2.904 2.078 THR 418.A N VAL 375.A O THR 418.A H 3.021 2.388 ARG 421.A N GLU 379.A OE2 ARG 421.A H 3.058 2.238 GLN 426.A N LYS 422.A O GLN 426.A H 2.863 2.072 GLU 427.A N ASP 423.A O GLU 427.A H 3.047 2.218 MET 428.A N VAL 424.A O MET 428.A H 2.841 2.135 MET 430.A N LEU 425.A O MET 430.A H 3.232 2.420 ALA 433.A N MET 430.A O ALA 433.A H 3.261 2.569 PHE 434.A N MET 430.A O PHE 434.A H 3.078 2.253 SER 435.A N SER 311.A OG SER 435.A H 3.135 2.358 ILE 438.A N LEU 313.A O ILE 438.A H 3.289 2.569 VAL 440.A N GLU 315.A O VAL 440.A H 2.951 2.240 GLU 447.A N GLU 447.A OE1 GLU 447.A H 2.950 2.166 LEU 449.A N THR 445.A O LEU 449.A H 2.961 2.242 LEU 450.A N GLY 446.A O LEU 450.A H 2.934 2.102 ALA 452.A N GLN 448.A O ALA 452.A H 2.947 2.149 LEU 453.A N LEU 449.A O LEU 453.A H 2.891 2.078 GLU 454.A N LEU 450.A O GLU 454.A H 2.862 2.113 LEU 455.A N GLU 451.A O LEU 455.A H 2.991 2.235 LEU 456.A N ALA 452.A O LEU 456.A H 2.978 2.219 GLY 457.A N LEU 453.A O GLY 457.A H 2.844 1.986 LYS 460.A N GLU 463.A OE1 LYS 460.A H 3.354 2.618 ARG 464.A N LYS 460.A O ARG 464.A H 2.874 2.135 ARG 464.A NH1 PHE 459.A O ARG 464.A HH12 2.687 2.061 ARG 464.A NH2 PHE 459.A O ARG 464.A HH22 2.413 1.700 THR 465.A N ASP 461.A O THR 465.A H 2.813 2.070 THR 466.A N LYS 462.A O THR 466.A H 2.932 2.153 ALA 468.A N ARG 464.A O ALA 468.A H 2.936 2.090 GLN 469.A N THR 465.A O GLN 469.A H 2.893 2.109 GLN 470.A N THR 466.A O GLN 470.A H 2.853 2.081 VAL 471.A N ILE 467.A O VAL 471.A H 3.018 2.227 LYS 481.A N HIS 319.A O LYS 481.A H 3.293 2.506 LYS 482.A N GLY 479.A O LYS 482.A H 3.036 2.454 LEU 483.A N GLY 479.A O LEU 483.A H 2.951 2.207 LEU 484.A N ILE 480.A O LEU 484.A H 2.878 2.058 MET 485.A N LYS 481.A O MET 485.A H 2.961 2.191 LEU 486.A N LYS 482.A O LEU 486.A H 2.904 2.098 ILE 487.A N LEU 483.A O ILE 487.A H 2.930 2.093 GLU 488.A N LEU 484.A O GLU 488.A H 3.013 2.191 MET 489.A N MET 485.A O MET 489.A H 2.913 2.277 SER 490.A N LEU 486.A O SER 490.A H 2.865 2.101 LEU 491.A N ILE 487.A O LEU 491.A H 2.781 2.057 TYR 497.A N ASP 494.A O TYR 497.A H 2.937 2.289 ARG 498.A N PRO 495.A O ARG 498.A H 3.298 2.487 ARG 498.A NH1 LEU 491.A O ARG 498.A HH12 2.383 1.679 LYS 501.A N TYR 497.A O LYS 501.A H 3.005 2.182 PHE 502.A N ARG 498.A O PHE 502.A H 3.068 2.267 LEU 503.A N VAL 499.A O LEU 503.A H 2.882 2.094 ALA 504.A N ARG 500.A O ALA 504.A H 2.871 2.039 LEU 505.A N LYS 501.A O LEU 505.A H 2.979 2.127 LEU 506.A N PHE 502.A O LEU 506.A H 2.887 2.103 ARG 507.A N LEU 503.A O ARG 507.A H 2.946 2.296 ARG 507.A N ALA 504.A O ARG 507.A H 3.240 2.547 ARG 507.A NH1 GLU 509.A OE2 ARG 507.A HH11 3.082 2.238 GLU 508.A N LEU 505.A O GLU 508.A H 3.042 2.213 GLU 509.A N GLU 509.A OE1 GLU 509.A H 2.448 1.679