Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6mk6_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 2.A NZ ASP 6.A OD2 LYS 2.A HZ2 2.925 2.072 MET 4.A N ASN 3.A OD1 MET 4.A H 2.617 1.969 ALA 5.A N ASN 1.A O ALA 5.A H 3.149 2.290 ASP 6.A N LYS 2.A O ASP 6.A H 3.009 2.187 ILE 7.A N ASN 3.A O ILE 7.A H 3.048 2.232 GLU 8.A N MET 4.A O GLU 8.A H 2.950 2.113 ALA 9.A N ALA 5.A O ALA 9.A H 2.988 2.184 ALA 10.A N ASP 6.A O ALA 10.A H 3.079 2.246 PHE 11.A N ILE 7.A O PHE 11.A H 3.012 2.234 GLU 12.A N ALA 9.A O GLU 12.A H 3.018 2.234 ARG 14.A N THR 237.A O ARG 14.A H 2.764 1.919 ARG 14.A NH1 GLU 34.A OE1 ARG 14.A HH11 3.000 2.186 ARG 14.A NH1 ARG 35.A O ARG 14.A HH12 2.924 2.158 ARG 14.A NH2 ARG 35.A O ARG 14.A HH22 2.937 2.172 VAL 15.A N GLU 8.A OE2 VAL 15.A H 2.867 2.026 GLY 16.A N TYR 235.A O GLY 16.A H 2.821 1.980 VAL 17.A N TYR 30.A O VAL 17.A H 2.721 1.896 TYR 18.A N SER 233.A O TYR 18.A H 2.955 2.133 ALA 19.A N TYR 28.A O ALA 19.A H 2.862 2.054 ILE 20.A N ILE 231.A O ILE 20.A H 2.939 2.160 ASN 21.A N LYS 26.A O ASN 21.A H 2.785 1.940 ASN 21.A ND2 VAL 261.A O ASN 21.A HD22 2.938 2.115 THR 22.A N PRO 229.A O THR 22.A H 3.103 2.256 THR 22.A OG1 PRO 229.A O THR 22.A HG1 2.752 1.956 GLY 23.A N ASN 21.A OD1 GLY 23.A H 2.989 2.234 SER 24.A N ASN 21.A OD1 SER 24.A H 3.304 2.484 GLY 25.A N ASN 21.A O GLY 25.A H 2.648 1.872 LYS 26.A N SER 24.A OG LYS 26.A H 3.154 2.296 LYS 26.A NZ ASN 260.A O LYS 26.A HZ1 3.028 2.449 TYR 28.A N ALA 19.A O TYR 28.A H 2.793 1.992 TYR 30.A N VAL 17.A O TYR 30.A H 2.862 2.016 TYR 30.A OH GLU 8.A OE1 TYR 30.A HH 2.739 1.915 ARG 31.A NE GLU 8.A OE2 ARG 31.A HE 2.735 1.898 ARG 31.A NH1 GLU 34.A OE2 ARG 31.A HH11 2.974 2.147 ARG 31.A NH2 GLU 8.A OE1 ARG 31.A HH21 2.956 2.126 GLU 34.A N ARG 31.A O GLU 34.A H 3.124 2.276 ARG 35.A NH1 LYS 130.A O ARG 35.A HH12 2.864 2.085 ARG 35.A NH1 THR 151.A OG1 ARG 35.A HH11 2.862 2.120 ARG 35.A NH2 LYS 130.A O ARG 35.A HH22 3.175 2.491 PHE 36.A N SER 152.A O PHE 36.A H 2.978 2.159 LEU 38.A N ASP 150.A O LEU 38.A H 2.910 2.058 CYS 39.A SG PRO 37.A O no hydrogen 4.011 N/A CYS 39.A SG THR 214.A O no hydrogen 4.025 N/A SER 41.A N LEU 38.A O SER 41.A H 3.111 2.277 SER 41.A OG LEU 38.A O SER 41.A HG 2.729 1.981 LYS 43.A N SER 40.A O LYS 43.A H 2.919 2.063 LYS 43.A NZ SER 40.A OG LYS 43.A HZ2 2.731 1.867 LYS 43.A NZ SER 100.A O LYS 43.A HZ3 2.708 1.837 LYS 43.A NZ ASN 102.A OD1 LYS 43.A HZ1 2.713 1.879 LEU 46.A N PHE 42.A O LEU 46.A H 2.890 2.101 ALA 47.A N LYS 43.A O ALA 47.A H 3.006 2.189 ALA 48.A N ALA 44.A O ALA 48.A H 3.090 2.300 ALA 49.A N PHE 45.A O ALA 49.A H 2.816 2.019 VAL 50.A N LEU 46.A O VAL 50.A H 2.987 2.196 LEU 51.A N ALA 47.A O LEU 51.A H 2.966 2.130 LYS 52.A N ALA 48.A O LYS 52.A H 2.892 2.072 LYS 52.A NZ VAL 169.A O LYS 52.A HZ3 2.969 2.162 MET 53.A N ALA 49.A O MET 53.A H 2.998 2.203 ASP 54.A N VAL 50.A O ASP 54.A H 3.034 2.258 GLN 55.A N LEU 51.A O GLN 55.A H 2.843 2.082 GLN 55.A NE2 VAL 169.A O GLN 55.A HE22 3.265 2.731 ASP 56.A N LYS 52.A O ASP 56.A H 2.970 2.172 SER 57.A N MET 53.A O SER 57.A H 2.959 2.338 SER 57.A N ASP 54.A O SER 57.A H 3.173 2.538 GLY 59.A N ASP 54.A OD1 GLY 59.A H 3.038 2.266 VAL 60.A N SER 57.A O VAL 60.A H 3.296 2.478 LEU 61.A N ASP 54.A OD1 LEU 61.A H 3.068 2.213 LEU 62.A N GLY 59.A O LEU 62.A H 2.987 2.231 GLU 63.A N VAL 60.A O GLU 63.A H 3.086 2.242 LYS 64.A NZ GLN 85.A O LYS 64.A HZ1 2.830 1.956 VAL 65.A N MET 87.A O VAL 65.A H 2.727 1.903 TYR 67.A OH THR 79.A O TYR 67.A HH 2.689 1.851 ARG 70.A N TYR 67.A O ARG 70.A H 3.168 2.320 ARG 70.A NE GLU 73.A OE1 ARG 70.A HE 3.164 2.308 ARG 70.A NH1 GLU 110.A OE1 ARG 70.A HH12 2.998 2.173 ARG 70.A NH1 GLU 110.A OE2 ARG 70.A HH12 3.412 2.775 ARG 70.A NH2 GLU 73.A OE2 ARG 70.A HH21 2.864 2.079 ARG 70.A NH2 GLU 110.A OE2 ARG 70.A HH22 2.795 1.967 GLU 73.A N GLU 73.A OE1 GLU 73.A H 2.629 1.829 ILE 78.A N ASP 101.A OD2 ILE 78.A H 2.875 2.185 THR 79.A N ASP 101.A OD2 THR 79.A H 2.937 2.110 GLU 80.A N SER 76.A O GLU 80.A H 2.883 2.048 PHE 82.A N ILE 78.A O PHE 82.A H 3.146 2.409 GLN 83.A N GLU 80.A O GLN 83.A H 3.485 2.626 GLN 83.A NE2 TYR 67.A O GLN 83.A HE21 2.912 2.066 GLN 83.A NE2 ARG 70.A O GLN 83.A HE22 2.856 2.044 GLN 85.A N PHE 82.A O GLN 85.A H 3.258 2.561 GLY 86.A N PHE 82.A O GLY 86.A H 3.037 2.426 MET 87.A N VAL 65.A O MET 87.A H 3.071 2.264 ALA 88.A N GLU 91.A OE1 ALA 88.A H 2.897 2.058 VAL 89.A N GLU 63.A O VAL 89.A H 2.882 2.129 GLY 90.A N LEU 61.A O GLY 90.A H 2.776 1.926 LEU 92.A N ALA 88.A O LEU 92.A H 2.953 2.159 ALA 93.A N VAL 89.A O ALA 93.A H 2.953 2.144 ALA 94.A N GLY 90.A O ALA 94.A H 2.926 2.080 ALA 95.A N GLU 91.A O ALA 95.A H 2.935 2.137 THR 96.A N LEU 92.A O THR 96.A H 2.841 2.013 THR 96.A OG1 ASP 101.A O THR 96.A HG1 2.965 2.155 LEU 97.A N ALA 93.A O LEU 97.A H 3.109 2.286 GLN 98.A N ALA 94.A O GLN 98.A H 2.734 1.880 GLN 98.A NE2 TRP 181.A O GLN 98.A HE21 3.093 2.279 TYR 99.A N ALA 95.A O TYR 99.A H 2.955 2.146 ASP 101.A N ALA 95.A O ASP 101.A H 3.260 2.404 ASN 102.A N HIS 75.A O ASN 102.A H 3.027 2.190 ASN 102.A ND2 PRO 74.A O ASN 102.A HD22 2.836 1.977 GLY 103.A N SER 76.A OG GLY 103.A H 2.857 2.054 ALA 104.A N ASP 101.A OD1 ALA 104.A H 2.777 1.984 ALA 105.A N ASP 101.A O ALA 105.A H 3.238 2.435 ASN 106.A N ASN 102.A O ASN 106.A H 3.004 2.158 ASN 106.A ND2 GLU 73.A OE2 ASN 106.A HD22 2.889 2.039 ASN 106.A ND2 GLU 137.A O ASN 106.A HD21 2.866 2.024 LEU 107.A N GLY 103.A O LEU 107.A H 2.807 1.960 LEU 108.A N ALA 104.A O LEU 108.A H 2.917 2.086 MET 109.A N ALA 105.A O MET 109.A H 3.008 2.223 GLU 110.A N ASN 106.A O GLU 110.A H 2.767 2.026 LYS 111.A N LEU 107.A O LYS 111.A H 3.031 2.345 TYR 112.A N LEU 108.A O TYR 112.A H 2.969 2.191 TYR 112.A OH GLU 63.A OE1 TYR 112.A HH 2.649 1.816 ILE 113.A N LEU 108.A O ILE 113.A H 2.875 2.051 GLY 115.A N MET 109.A O GLY 115.A H 2.775 2.066 GLY 118.A N LYS 114.A O GLY 118.A H 2.905 2.153 MET 119.A N GLY 115.A O MET 119.A H 2.926 2.118 THR 120.A N PRO 116.A O THR 120.A H 2.929 2.079 THR 120.A OG1 PRO 116.A O THR 120.A HG1 2.941 2.136 GLN 121.A N GLU 117.A O GLN 121.A H 2.843 2.063 PHE 122.A N GLY 118.A O PHE 122.A H 2.955 2.161 MET 123.A N MET 119.A O MET 123.A H 3.196 2.366 ASN 124.A N THR 120.A O ASN 124.A H 2.870 2.035 SER 125.A N GLN 121.A O SER 125.A H 2.921 2.174 SER 125.A OG PHE 122.A O SER 125.A HG 2.449 1.621 ILE 126.A N MET 123.A O ILE 126.A H 3.195 2.416 GLY 127.A N ASN 124.A O GLY 127.A H 2.981 2.143 ASP 128.A N MET 123.A O ASP 128.A H 3.035 2.204 LYS 130.A N ASP 128.A OD1 LYS 130.A H 2.928 2.104 PHE 131.A N ASP 128.A OD1 PHE 131.A H 2.883 2.048 ARG 132.A N THR 151.A O ARG 132.A H 3.015 2.207 ARG 132.A NE ASP 134.A OD2 ARG 132.A HE 2.908 2.121 ARG 132.A NH2 ASP 134.A OD1 ARG 132.A HH21 2.849 2.005 ARG 132.A NH2 ASP 134.A OD2 ARG 132.A HH21 3.479 2.861 LEU 133.A N THR 120.A OG1 LEU 133.A H 2.933 2.102 ASP 134.A N ASP 150.A OD1 ASP 134.A H 2.609 1.773 ARG 135.A N ASP 150.A OD1 ARG 135.A H 2.874 2.079 ARG 135.A NE ASP 150.A OD2 ARG 135.A HE 2.748 1.965 ARG 135.A NH1 SER 142.A OG ARG 135.A HH12 2.840 2.111 ARG 135.A NH2 SER 142.A OG ARG 135.A HH22 2.857 2.131 ARG 135.A NH2 ASP 150.A OD2 ARG 135.A HH21 2.876 2.150 GLU 137.A N ASN 106.A OD1 GLU 137.A H 3.152 2.357 LEU 140.A N TRP 136.A O LEU 140.A H 3.026 2.228 ASN 141.A N LEU 138.A O ASN 141.A H 3.191 2.351 ASN 141.A ND2 GLU 137.A OE1 ASN 141.A HD21 2.769 2.032 ASN 141.A ND2 LEU 138.A O ASN 141.A HD22 2.983 2.163 SER 142.A N ASP 139.A O SER 142.A H 3.305 2.566 ASP 147.A N ILE 144.A O ASP 147.A H 3.002 2.159 ARG 149.A N ASP 147.A OD1 ARG 149.A H 3.043 2.196 ARG 149.A NE ASP 147.A OD1 ARG 149.A HE 3.088 2.297 ARG 149.A NE ASP 147.A OD2 ARG 149.A HE 2.968 2.232 ARG 149.A NH2 ASP 147.A OD2 ARG 149.A HH21 2.739 1.939 ASP 150.A N ASP 134.A OD2 ASP 150.A H 2.966 2.156 THR 151.A OG1 GLU 148.A O THR 151.A HG1 2.634 1.943 SER 152.A N PHE 36.A O SER 152.A H 3.188 2.408 LYS 155.A N ALA 32.A O LYS 155.A H 3.033 2.184 ALA 156.A N THR 153.A OG1 ALA 156.A H 3.023 2.175 VAL 157.A N THR 153.A O VAL 157.A H 3.048 2.203 ALA 158.A N PRO 154.A O ALA 158.A H 3.039 2.186 GLU 159.A N LYS 155.A O GLU 159.A H 2.808 1.971 SER 160.A N ALA 156.A O SER 160.A H 2.905 2.090 SER 160.A OG ALA 156.A O SER 160.A HG 3.212 2.612 LEU 161.A N VAL 157.A O LEU 161.A H 2.928 2.084 ASN 162.A N ALA 158.A O ASN 162.A H 2.952 2.114 LYS 163.A N GLU 159.A O LYS 163.A H 3.045 2.229 LYS 163.A NZ ILE 126.A O LYS 163.A HZ2 2.821 2.017 LEU 164.A N SER 160.A O LEU 164.A H 3.129 2.387 LEU 164.A N LEU 161.A O LEU 164.A H 2.985 2.360 ILE 165.A N ASN 162.A O ILE 165.A H 3.102 2.292 SER 166.A OG ASN 162.A O SER 166.A HG 2.579 1.789 ASN 167.A N GLN 175.A OE1 ASN 167.A H 2.693 1.853 THR 168.A OG1 LYS 163.A O THR 168.A HG1 2.788 1.985 ASP 171.A N GLN 55.A OE1 ASP 171.A H 2.734 1.904 HIS 174.A N ASP 171.A OD1 HIS 174.A H 3.083 2.244 HIS 174.A ND1 ASP 171.A OD1 HIS 174.A HD1 2.724 1.882 HIS 174.A NE2 ASP 54.A OD2 HIS 174.A HE2 2.613 1.779 GLN 175.A N ASP 171.A O GLN 175.A H 2.771 1.916 GLN 175.A NE2 ASN 167.A OD1 GLN 175.A HE22 3.139 2.569 GLU 176.A N ASN 172.A O GLU 176.A H 2.908 2.081 ILE 177.A N TYR 173.A O ILE 177.A H 3.236 2.420 PHE 178.A N HIS 174.A O PHE 178.A H 2.952 2.095 LYS 179.A N GLN 175.A O LYS 179.A H 2.816 1.976 LYS 179.A NZ GLU 176.A OE2 LYS 179.A HZ3 3.056 2.376 LYS 180.A N GLU 176.A O LYS 180.A H 2.937 2.119 TRP 181.A N ILE 177.A O TRP 181.A H 2.975 2.137 MET 182.A N PHE 178.A O MET 182.A H 2.975 2.130 ILE 183.A N LYS 179.A O ILE 183.A H 2.842 2.004 GLY 184.A N LYS 180.A O GLY 184.A H 3.003 2.265 GLY 184.A N TRP 181.A O GLY 184.A H 3.070 2.473 ASN 185.A N MET 182.A O ASN 185.A H 3.097 2.244 ASN 185.A ND2 THR 187.A OG1 ASN 185.A HD21 3.206 2.450 ASN 185.A ND2 ASP 204.A OD1 ASN 185.A HD22 2.979 2.129 ASN 185.A ND2 ASP 204.A OD2 ASN 185.A HD22 3.286 2.695 THR 186.A N GLN 98.A O THR 186.A H 3.193 2.370 THR 186.A OG1 GLN 98.A O THR 186.A HG1 2.802 2.141 THR 187.A OG1 ASN 185.A OD1 THR 187.A HG1 3.448 2.629 ARG 191.A N GLY 188.A O ARG 191.A H 3.102 2.243 ARG 191.A NE ASP 247.A OD1 ARG 191.A HE 2.785 1.989 ARG 191.A NH1 GLY 207.A O ARG 191.A HH12 3.003 2.294 ARG 191.A NH1 THR 208.A OG1 ARG 191.A HH12 3.105 2.421 ARG 191.A NH1 ASN 216.A O ARG 191.A HH11 2.976 2.259 ARG 191.A NH2 THR 208.A OG1 ARG 191.A HH22 2.844 2.078 ARG 191.A NH2 ASP 247.A OD1 ARG 191.A HH21 2.911 2.186 ILE 192.A N ASP 217.A OD2 ILE 192.A H 3.042 2.194 ARG 193.A NE ASP 204.A OD1 ARG 193.A HE 2.890 2.099 ARG 193.A NH2 ILE 183.A O ARG 193.A HH22 3.074 2.325 ARG 193.A NH2 ASP 204.A OD1 ARG 193.A HH21 3.128 2.427 ALA 194.A N ARG 191.A O ALA 194.A H 2.969 2.223 ALA 195.A N ILE 192.A O ALA 195.A H 2.896 2.066 VAL 196.A N ARG 193.A O VAL 196.A H 3.190 2.333 TRP 200.A N PRO 197.A O TRP 200.A H 3.248 2.438 VAL 201.A N LEU 222.A O VAL 201.A H 3.126 2.443 GLY 203.A N PHE 220.A O GLY 203.A H 3.058 2.250 ASP 204.A N MET 182.A O ASP 204.A H 3.152 2.409 LYS 205.A N HIS 218.A O LYS 205.A H 2.987 2.209 LYS 205.A NZ SER 100.A OG LYS 205.A HZ3 2.922 2.069 LYS 205.A NZ THR 206.A O LYS 205.A HZ1 2.731 1.877 GLY 207.A N ASN 216.A O GLY 207.A H 3.058 2.231 CYS 209.A N THR 214.A O CYS 209.A H 2.969 2.139 CYS 209.A SG ASN 141.A OD1 no hydrogen 3.864 N/A TYR 212.A N GLU 241.A O TYR 212.A H 2.778 1.925 THR 214.A N LYS 211.A O THR 214.A H 3.106 2.411 THR 214.A OG1 LYS 211.A O THR 214.A HG1 3.110 2.512 THR 214.A OG1 TYR 212.A O THR 214.A HG1 3.006 2.330 ALA 215.A N THR 236.A O ALA 215.A H 3.216 2.518 ASN 216.A N GLY 207.A O ASN 216.A H 2.819 2.093 ASN 216.A ND2 LEU 38.A O ASN 216.A HD21 2.998 2.227 ASP 217.A N ILE 234.A O ASP 217.A H 2.875 2.091 HIS 218.A N LYS 205.A O HIS 218.A H 3.153 2.359 ALA 219.A N LEU 232.A O ALA 219.A H 2.822 2.060 PHE 220.A N GLY 203.A O PHE 220.A H 3.006 2.328 ILE 221.A N LEU 230.A O ILE 221.A H 2.875 2.116 LEU 222.A N VAL 201.A O LEU 222.A H 2.831 1.984 ALA 227.A N GLY 224.A O ALA 227.A H 2.948 2.096 LEU 230.A N ILE 221.A O LEU 230.A H 2.883 2.105 ILE 231.A N ILE 20.A O ILE 231.A H 2.866 2.030 LEU 232.A N ALA 219.A O LEU 232.A H 2.967 2.127 SER 233.A N TYR 18.A O SER 233.A H 2.912 2.241 SER 233.A OG PRO 154.A O SER 233.A HG 2.846 2.174 ILE 234.A N ASP 217.A O ILE 234.A H 2.876 2.053 TYR 235.A N GLY 16.A O TYR 235.A H 2.868 2.037 TYR 235.A OH SER 41.A OG TYR 235.A HH 2.863 2.033 THR 236.A N ALA 215.A O THR 236.A H 2.851 2.159 THR 237.A N ARG 14.A O THR 237.A H 3.060 2.271 THR 237.A OG1 TYR 212.A O THR 237.A HG1 3.104 2.634 THR 237.A OG1 THR 214.A OG1 THR 237.A HG1 2.364 1.631 ARG 238.A N TYR 212.A O ARG 238.A H 2.795 2.043 ARG 238.A NE GLU 12.A O ARG 238.A HE 3.090 2.282 ARG 238.A NH1 LYS 244.A O ARG 238.A HH11 3.215 2.378 MET 243.A N GLY 240.A O MET 243.A H 3.076 2.234 GLU 248.A N ASP 246.A OD1 GLU 248.A H 2.868 2.182 ALA 251.A N ASP 247.A O ALA 251.A H 2.977 2.145 LYS 252.A N GLU 248.A O LYS 252.A H 2.808 1.986 ALA 253.A N VAL 249.A O ALA 253.A H 2.910 2.056 ALA 254.A N ILE 250.A O ALA 254.A H 2.888 2.078 ARG 255.A N ALA 251.A O ARG 255.A H 3.049 2.257 ARG 255.A NH2 ALA 194.A O ARG 255.A HH21 3.312 2.488 ILE 256.A N LYS 252.A O ILE 256.A H 3.196 2.385 ALA 257.A N ALA 253.A O ALA 257.A H 2.917 2.085 ILE 258.A N ALA 254.A O ILE 258.A H 2.896 2.050 GLU 259.A N ARG 255.A O GLU 259.A H 3.013 2.154 ASN 260.A N ILE 256.A O ASN 260.A H 2.965 2.204 VAL 261.A N ILE 258.A O VAL 261.A H 3.220 2.429 LYS 262.A N ILE 258.A O LYS 262.A H 2.878 2.081