Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6nj1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 3.A N ASP 1.A OD1 GLN 3.A H 2.572 1.968 TYR 4.A N ASP 1.A OD1 TYR 4.A H 3.054 2.278 SER 6.A N ILE 2.A O SER 6.A H 3.298 2.460 ALA 7.A N GLN 3.A O ALA 7.A H 3.281 2.467 PHE 8.A N TYR 4.A O PHE 8.A H 2.830 1.996 SER 9.A N ASN 5.A O SER 9.A H 2.912 2.065 GLN 10.A N SER 6.A O GLN 10.A H 2.920 2.126 GLN 10.A NE2 ASP 14.A OD1 GLN 10.A HE21 2.589 1.950 GLN 10.A NE2 ASP 14.A OD2 GLN 10.A HE21 3.286 2.439 LEU 11.A N ALA 7.A O LEU 11.A H 3.091 2.290 GLU 12.A N PHE 8.A O GLU 12.A H 2.980 2.180 SER 13.A N SER 9.A O SER 13.A H 3.000 2.173 SER 13.A OG SER 9.A O SER 13.A HG 3.262 2.483 ASP 14.A N GLN 10.A O ASP 14.A H 2.783 1.944 TYR 15.A N LEU 11.A O TYR 15.A H 2.877 2.071 GLY 16.A N GLU 12.A O GLY 16.A H 2.722 2.125 ALA 17.A N GLU 12.A O ALA 17.A H 3.128 2.365 LYS 18.A N THR 233.A O LYS 18.A H 2.851 2.014 LYS 18.A NZ ASP 38.A OD2 LYS 18.A HZ1 3.562 2.924 LEU 19.A N GLU 12.A OE2 LEU 19.A H 2.956 2.103 GLY 20.A N LEU 231.A O GLY 20.A H 2.825 1.978 VAL 21.A N TYR 34.A O VAL 21.A H 2.795 1.961 TYR 22.A N ALA 229.A O TYR 22.A H 2.941 2.116 TYR 22.A OH GLU 31.A OE1 TYR 22.A HH 2.949 2.133 ALA 23.A N VAL 32.A O ALA 23.A H 2.865 2.050 PHE 24.A N ILE 227.A O PHE 24.A H 2.803 1.995 ASP 25.A N LYS 30.A O ASP 25.A H 2.867 2.014 THR 26.A N PRO 225.A O THR 26.A H 2.979 2.162 THR 26.A OG1 PRO 225.A O THR 26.A HG1 2.676 1.845 GLU 27.A N ASP 25.A OD1 GLU 27.A H 2.992 2.241 THR 28.A N ASP 25.A O THR 28.A H 3.330 2.620 ASN 29.A N ASP 25.A O ASN 29.A H 2.751 2.041 VAL 32.A N ALA 23.A O VAL 32.A H 2.952 2.146 ALA 33.A N TYR 4.A OH ALA 33.A H 3.063 2.228 TYR 34.A N VAL 21.A O TYR 34.A H 2.899 2.053 TYR 34.A OH GLU 12.A OE1 TYR 34.A HH 2.663 1.854 ARG 35.A NE GLU 12.A OE2 ARG 35.A HE 2.795 1.979 ARG 35.A NH2 GLU 12.A OE1 ARG 35.A HH21 2.866 2.011 ARG 35.A NH2 GLU 12.A OE2 ARG 35.A HH21 3.443 2.823 ASP 38.A N ARG 35.A O ASP 38.A H 3.159 2.305 ARG 39.A NH1 VAL 130.A O ARG 39.A HH12 2.915 2.155 ARG 39.A NH1 THR 151.A OG1 ARG 39.A HH11 2.898 2.126 ARG 39.A NH2 VAL 130.A O ARG 39.A HH22 2.869 2.094 PHE 40.A N SER 152.A O PHE 40.A H 2.879 2.054 TYR 42.A N ASP 150.A O TYR 42.A H 3.172 2.368 THR 45.A N TYR 42.A O THR 45.A H 3.264 2.473 THR 45.A OG1 TYR 42.A O THR 45.A HG1 2.805 1.998 LYS 47.A N SER 44.A O LYS 47.A H 3.005 2.153 LYS 47.A NZ SER 44.A OG LYS 47.A HZ2 2.797 1.992 LYS 47.A NZ SER 101.A O LYS 47.A HZ3 2.977 2.324 LYS 47.A NZ ASN 103.A OD1 LYS 47.A HZ1 2.765 1.900 ALA 48.A N THR 45.A O ALA 48.A H 3.340 2.574 ALA 50.A N PHE 46.A O ALA 50.A H 2.825 1.993 ALA 51.A N LYS 47.A O ALA 51.A H 3.050 2.232 GLY 52.A N ALA 48.A O GLY 52.A H 3.055 2.225 ALA 53.A N LEU 49.A O ALA 53.A H 2.955 2.157 VAL 54.A N ALA 50.A O VAL 54.A H 2.941 2.155 LEU 55.A N ALA 51.A O LEU 55.A H 2.971 2.143 LYS 56.A N GLY 52.A O LYS 56.A H 2.950 2.186 LYS 56.A NZ ILE 169.A O LYS 56.A HZ3 2.835 1.991 GLN 57.A N.A ALA 53.A O GLN 57.A H.A 2.972 2.173 GLN 57.A N.B ALA 53.A O GLN 57.A H.B 3.006 2.214 GLN 57.A NE2.A ASP 58.A OD1 GLN 57.A HE21.A 2.973 2.128 GLN 57.A NE2.A HIS 112.A O GLN 57.A HE22.A 3.174 2.322 GLN 57.A NE2.B ASP 58.A OD1 GLN 57.A HE21.B 3.054 2.292 GLN 57.A NE2.B HIS 112.A O GLN 57.A HE22.B 3.051 2.261 ASP 58.A N VAL 54.A O ASP 58.A H.A 2.970 2.222 SER 59.A N GLN 62.A OE1 SER 59.A H 3.019 2.202 GLN 62.A N SER 59.A OG GLN 62.A H 3.027 2.229 LEU 63.A N LEU 60.A O LEU 63.A H 3.093 2.316 LYS 64.A N GLU 61.A O LYS 64.A H 3.085 2.245 LYS 64.A NZ GLU 91.A OE1 LYS 64.A HZ3 3.503 2.770 GLN 65.A N GLN 62.A O GLN 65.A H 3.204 2.349 TYR 69.A OH ALA 81.A O TYR 69.A HH 2.667 1.880 LYS 70.A N ASP 73.A OD2 LYS 70.A H 2.920 2.061 LYS 70.A NZ GLU 72.A OE1 LYS 70.A HZ2 3.248 2.499 LYS 71.A NZ LYS 82.A O LYS 71.A HZ1 3.100 2.467 ASP 73.A N LYS 70.A O ASP 73.A H 2.923 2.131 VAL 74.A N LYS 71.A O VAL 74.A H 2.910 2.080 LEU 75.A N THR 104.A OG1 LEU 75.A H 2.934 2.157 TYR 77.A OH PHE 100.A O TYR 77.A HH 2.682 1.842 ILE 80.A N ASP 102.A OD2 ILE 80.A H 2.893 2.107 ALA 81.A N ASP 102.A OD2 ALA 81.A H 2.920 2.083 LYS 82.A N ALA 78.A O LYS 82.A H 2.991 2.147 ASP 83.A N ILE 80.A O ASP 83.A H 3.068 2.229 ASN 84.A N ALA 81.A O ASN 84.A H 3.160 2.310 ASN 84.A ND2 ILE 80.A O ASN 84.A HD22 2.837 2.113 GLY 88.A N ASN 84.A O GLY 88.A H 2.932 2.163 THR 89.A N GLU 92.A OE1 THR 89.A H 2.914 2.081 ILE 90.A N GLN 65.A O ILE 90.A H 3.034 2.352 GLU 91.A N LEU 63.A O GLU 91.A H 2.952 2.180 GLU 92.A N THR 89.A OG1 GLU 92.A H 3.193 2.356 ILE 93.A N THR 89.A O ILE 93.A H 2.850 2.032 CYS 94.A N ILE 90.A O CYS 94.A H 2.932 2.096 SER 95.A N GLU 91.A O SER 95.A H 2.901 2.056 ALA 96.A N GLU 92.A O ALA 96.A H 2.896 2.058 ALA 97.A N ILE 93.A O ALA 97.A H 2.966 2.129 ILE 98.A N CYS 94.A O ILE 98.A H 2.997 2.191 ARG 99.A N SER 95.A O ARG 99.A H 2.752 1.896 ARG 99.A NE SER 95.A OG ARG 99.A HE 3.039 2.398 ARG 99.A NH1 ASP 180.A O ARG 99.A HH12 3.095 2.441 ARG 99.A NH1 ALA 182.A O ARG 99.A HH12 3.104 2.530 ARG 99.A NH1 ASN 184.A OD1 ARG 99.A HH11 3.024 2.189 ARG 99.A NH2 ASP 180.A O ARG 99.A HH22 3.146 2.503 ARG 99.A NH2 ASP 180.A OD2 ARG 99.A HH22 3.069 2.394 PHE 100.A N ALA 96.A O PHE 100.A H 3.138 2.328 SER 101.A N ALA 97.A O SER 101.A H 3.055 2.432 ASP 102.A N ALA 96.A O ASP 102.A H 3.258 2.413 ASN 103.A N TYR 77.A O ASN 103.A H 2.996 2.149 THR 104.A OG1 ASP 73.A O THR 104.A HG1 2.779 2.159 ALA 105.A N ASP 102.A OD1 ALA 105.A H 2.787 1.940 ALA 106.A N ASP 102.A O ALA 106.A H 2.967 2.170 ASN 107.A N ASN 103.A O ASN 107.A H 3.007 2.221 ASN 107.A ND2 GLU 137.A O ASN 107.A HD21 2.969 2.112 LEU 108.A N THR 104.A O LEU 108.A H 2.895 2.068 LEU 109.A N ALA 105.A O LEU 109.A H 2.830 1.999 LEU 110.A N ALA 106.A O LEU 110.A H 2.858 2.013 ASN 111.A N ASN 107.A O ASN 111.A H 2.877 2.046 HIS 112.A N LEU 108.A O HIS 112.A H 3.027 2.269 HIS 112.A NE2 ASP 58.A OD2 HIS 112.A HE2 2.613 1.778 ILE 113.A N LEU 109.A O ILE 113.A H 3.310 2.623 ILE 113.A N LEU 110.A O ILE 113.A H 3.139 2.437 GLY 114.A N ASN 111.A O GLY 114.A H 3.135 2.286 GLY 115.A N LEU 110.A O GLY 115.A H 2.767 1.944 GLY 118.A N GLY 114.A O GLY 118.A H 3.148 2.400 PHE 119.A N GLY 115.A O PHE 119.A H 2.923 2.095 LYS 120.A N PRO 116.A O LYS 120.A H 2.879 2.032 SER 121.A N LYS 117.A O SER 121.A H 2.973 2.184 ALA 122.A N GLY 118.A O ALA 122.A H 2.974 2.172 LEU 123.A N PHE 119.A O LEU 123.A H 2.935 2.102 ASN 124.A N LYS 120.A O ASN 124.A H 2.850 2.028 GLN 125.A N SER 121.A O GLN 125.A H 2.949 2.134 GLN 125.A NE2 SER 121.A O GLN 125.A HE21 3.388 2.635 LEU 126.A N ALA 122.A O no hydrogen 3.166 N/A GLY 127.A N ASN 124.A O GLY 127.A H 2.900 2.071 ASP 128.A N LEU 123.A O ASP 128.A H 2.980 2.144 VAL 130.A N ASP 128.A OD1 VAL 130.A H 2.876 2.081 THR 131.A N ASP 128.A OD1 THR 131.A H 2.859 2.021 GLN 132.A N THR 151.A O GLN 132.A H 3.064 2.258 VAL 134.A N ASP 150.A OD1 VAL 134.A H 2.989 2.171 HIS 135.A N ASP 150.A OD1 HIS 135.A H 2.949 2.095 HIS 135.A ND1 ASP 150.A OD2 HIS 135.A HD1 2.716 1.857 GLU 137.A N ASN 107.A OD1 GLU 137.A H 2.867 2.034 LEU 140.A N ILE 136.A O LEU 140.A H 3.073 2.409 ASN 141.A ND2 THR 207.A O ASN 141.A HD22 2.977 2.129 GLU 142.A N GLU 139.A O GLU 142.A H 3.016 2.169 ASP 147.A N ILE 144.A O ASP 147.A H 3.087 2.233 ASP 150.A N GLN 132.A O ASP 150.A H 2.778 1.951 THR 151.A N ILE 148.A O THR 151.A H 3.181 2.478 THR 151.A OG1 ILE 148.A O THR 151.A HG1 2.674 1.848 SER 152.A N PHE 40.A O SER 152.A H 3.077 2.281 ARG 155.A N ALA 36.A O ARG 155.A H 2.974 2.117 ARG 155.A NE ASP 37.A OD1 ARG 155.A HE 2.758 1.946 ARG 155.A NH2 ASP 37.A OD2 ARG 155.A HH21 3.189 2.380 GLN 156.A N THR 153.A OG1 GLN 156.A H 2.994 2.162 GLN 156.A NE2 GLN 156.A O GLN 156.A HE21 3.532 2.991 GLN 156.A NE2 ASP 160.A OD1 GLN 156.A HE21 2.974 2.165 LEU 157.A N THR 153.A O LEU 157.A H 3.000 2.148 ALA 158.A N PRO 154.A O ALA 158.A H 3.022 2.171 THR 159.A N ARG 155.A O THR 159.A H 2.872 2.059 THR 159.A OG1 ARG 155.A O THR 159.A HG1 2.871 2.133 ASP 160.A N GLN 156.A O ASP 160.A H 2.903 2.087 LEU 161.A N LEU 157.A O LEU 161.A H 2.959 2.116 GLN 162.A N ALA 158.A O GLN 162.A H 2.900 2.059 ALA 163.A N THR 159.A O ALA 163.A H 2.985 2.195 TYR 164.A N ASP 160.A O TYR 164.A H 3.095 2.282 THR 165.A N LEU 161.A O THR 165.A H 2.919 2.115 THR 165.A OG1 LEU 161.A O THR 165.A HG1 2.781 1.955 THR 166.A N GLN 162.A O THR 166.A H 2.901 2.105 THR 166.A OG1 GLN 162.A O THR 166.A HG1 2.864 2.140 GLY 167.A N GLN 162.A O GLY 167.A H 3.136 2.546 GLY 167.A N ALA 163.A O GLY 167.A H 3.157 2.452 ASN 168.A N ASN 168.A OD1 ASN 168.A H 2.536 1.873 LYS 174.A N THR 171.A OG1 LYS 174.A H 3.206 2.361 LYS 174.A NZ LEU 55.A O LYS 174.A HZ3 2.766 1.917 LYS 175.A N THR 171.A O LYS 175.A H 2.894 2.061 LYS 175.A NZ GLY 167.A O LYS 175.A HZ1 2.382 1.624 LYS 175.A NZ LEU 170.A O LYS 175.A HZ2 3.072 2.241 LYS 176.A N GLU 172.A O LYS 176.A H 3.114 2.303 ILE 177.A N ASP 173.A O ILE 177.A H 3.009 2.224 LEU 178.A N LYS 174.A O LEU 178.A H 3.024 2.187 ILE 179.A N LYS 175.A O ILE 179.A H 2.925 2.080 ASP 180.A N LYS 176.A O ASP 180.A H 2.922 2.081 TRP 181.A N ILE 177.A O TRP 181.A H 2.929 2.100 ALA 182.A N ASP 180.A O ALA 182.A H 3.140 2.341 ASN 184.A ND2 TRP 181.A O ASN 184.A HD21 2.886 2.053 THR 186.A OG1 ARG 99.A O THR 186.A HG1 3.553 2.971 GLY 187.A N ASN 184.A O GLY 187.A H 2.955 2.121 ASN 188.A N THR 185.A O.A ASN 188.A H 2.811 1.960 ASN 188.A N THR 185.A O.B ASN 188.A H 3.074 2.217 THR 189.A OG1 ASP 243.A OD2 THR 189.A HG1 2.581 1.884 LEU 190.A N GLY 187.A O LEU 190.A H 3.222 2.375 ILE 191.A N ASP 215.A OD2 ILE 191.A H 2.999 2.151 ARG 192.A NH1 ASN 184.A O ARG 192.A HH12 2.883 2.106 ARG 192.A NH1 ASN 188.A OD1 ARG 192.A HH11 2.971 2.238 ARG 192.A NH2 VAL 201.A O ARG 192.A HH21 2.890 2.087 ALA 193.A N LEU 190.A O ALA 193.A H 2.966 2.300 GLY 194.A N ILE 191.A O GLY 194.A H 2.943 2.196 ALA 195.A N ARG 192.A O ALA 195.A H 3.247 2.393 TRP 199.A N PRO 196.A O TRP 199.A H.A 3.002 2.175 ALA 202.A N ILE 218.A O ALA 202.A H 2.953 2.095 LYS 204.A N ILE 216.A O LYS 204.A H 2.819 2.039 LYS 204.A NZ SER 101.A OG LYS 204.A HZ1 2.960 2.083 LYS 204.A NZ SER 205.A O LYS 204.A HZ2 2.840 1.972 GLY 206.A N ASN 214.A O GLY 206.A H 2.868 2.078 GLY 208.A N ARG 212.A O GLY 208.A H 3.092 2.361 TYR 210.A N LYS 237.A O TYR 210.A H 2.935 2.126 ARG 212.A N GLY 208.A O ARG 212.A H 3.174 2.487 ARG 212.A N PRO 209.A O ARG 212.A H 3.255 2.485 ARG 212.A NH1 ASN 141.A O ARG 212.A HH11 3.044 2.370 ARG 212.A NH1 GLY 143.A O ARG 212.A HH12 2.894 2.130 ARG 212.A NH2 GLY 143.A O ARG 212.A HH22 2.869 2.100 ARG 213.A N SER 232.A O ARG 213.A H 3.188 2.398 ARG 213.A NE ASP 243.A OD1 ARG 213.A HE 2.735 1.893 ARG 213.A NH1 GLY 206.A O ARG 213.A HH11 3.279 2.435 ARG 213.A NH2 ASP 243.A OD1 ARG 213.A HH21 3.479 2.865 ARG 213.A NH2 ASP 243.A OD2 ARG 213.A HH21 3.088 2.249 ASN 214.A N GLY 206.A O ASN 214.A H 2.876 2.044 ASN 214.A ND2 ALA 41.A O ASN 214.A HD21 2.964 2.180 ASN 214.A ND2 TYR 42.A O ASN 214.A HD22 3.024 2.253 ASP 215.A N ILE 230.A O ASP 215.A H 2.837 2.023 ILE 216.A N LYS 204.A O ILE 216.A H 3.070 2.238 ALA 217.A N ILE 228.A O ALA 217.A H 2.880 2.097 ILE 218.A N ALA 202.A O ILE 218.A H 2.914 2.140 VAL 219.A N ILE 226.A O VAL 219.A H 2.774 1.954 LYS 223.A N PRO 220.A O LYS 223.A H 3.439 2.602 LYS 224.A N GLU 27.A OE1 LYS 224.A H 2.933 2.097 ILE 226.A N VAL 219.A O ILE 226.A H 2.833 1.994 ILE 227.A N PHE 24.A O ILE 227.A H 2.881 2.046 ILE 228.A N ALA 217.A O ILE 228.A H 2.883 2.066 ALA 229.A N TYR 22.A O ALA 229.A H 2.808 1.963 ILE 230.A N ASP 215.A O ILE 230.A H 2.923 2.070 LEU 231.A N GLY 20.A O LEU 231.A H 2.803 1.971 SER 232.A N ASN 214.A OD1 SER 232.A H 3.088 2.303 SER 232.A OG ARG 213.A O SER 232.A HG 2.691 1.856 THR 233.A N LYS 18.A O THR 233.A H 3.001 2.231 HIS 234.A N TYR 210.A O HIS 234.A H 2.790 2.006 HIS 234.A ND1 GLY 16.A O HIS 234.A HD1 3.050 2.419 ALA 239.A N THR 236.A O ALA 239.A H 3.133 2.282 LYS 244.A N ASP 242.A OD1 LYS 244.A H 2.921 2.085 LEU 245.A N ASP 242.A O LEU 245.A H 3.067 2.254 ILE 246.A N ASP 243.A O ILE 246.A H 2.975 2.351 ALA 247.A N ASP 243.A O ALA 247.A H 3.124 2.296 LYS 248.A N LYS 244.A O LYS 248.A H 2.809 1.975 LYS 248.A NZ TYR 15.A OH LYS 248.A HZ2 2.915 2.077 ALA 249.A N LEU 245.A O ALA 249.A H 3.000 2.167 SER 250.A N.A ILE 246.A O SER 250.A H.A 2.893 2.076 SER 250.A N.B ILE 246.A O SER 250.A H.B 2.881 2.056 SER 250.A OG.A ILE 246.A O SER 250.A HG.A 2.796 1.984 LYS 251.A N ALA 247.A O LYS 251.A H.A 3.037 2.234 LYS 251.A NZ ASP 255.A OD1 LYS 251.A HZ3 3.539 2.882 LYS 251.A NZ ASP 255.A OD2 LYS 251.A HZ3 3.322 2.432 ILE 252.A N LYS 248.A O ILE 252.A H 3.109 2.292 ILE 253.A N ALA 249.A O ILE 253.A H 3.100 2.301 PHE 254.A N SER 250.A O.A PHE 254.A H 2.939 2.103 PHE 254.A N SER 250.A O.B PHE 254.A H 2.965 2.130 ASP 255.A N LYS 251.A O ASP 255.A H 2.883 2.040 SER 256.A N ILE 252.A O SER 256.A H 3.015 2.210 SER 256.A OG ILE 252.A O SER 256.A HG 2.623 1.833 PHE 257.A N ILE 253.A O PHE 257.A H 3.046 2.277 THR 258.A N ASP 255.A O THR 258.A H 3.168 2.388