Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6nj3_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.960 2.116 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.928 2.218 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.251 2.489 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H.A 2.786 1.945 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.295 2.458 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.054 2.331 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.074 2.432 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.140 2.294 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.857 2.105 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.839 1.984 LYS 21.A N PRO 18.A O.A LYS 21.A H 3.218 2.362 LYS 21.A N PRO 18.A O.B LYS 21.A H 3.123 2.267 GLY 22.A N ILE 19.A O GLY 22.A H 2.767 2.001 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.926 2.098 ARG 24.A NH2 GLU 201.A O ARG 24.A HH21 3.005 2.361 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE22 3.109 2.256 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE21 3.018 2.165 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.877 2.149 SER 26.A OG SER 193.A O SER 26.A HG 3.555 3.166 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.832 1.985 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.897 2.087 THR 32.A OG1 ASP 107.A OD1 THR 32.A HG1 3.295 2.466 HIS 33.A N ASP 31.A OD1 HIS 33.A H 2.820 2.015 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.045 2.210 THR 34.A OG1 ASP 31.A O THR 34.A HG1 3.405 2.783 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.891 2.091 LYS 36.A N ILE 251.A O LYS 36.A H 3.303 2.571 ASP 38.A N.A ALA 253.A O ASP 38.A H.A 2.968 2.128 ASP 38.A N.B ALA 253.A O ASP 38.A H.B 2.978 2.154 SER 40.A N.A ASP 38.A OD1.A SER 40.A H.A 3.073 2.276 SER 40.A N.B ASP 38.A OD1.A SER 40.A H.B 2.477 1.696 SER 40.A N.B ASP 38.A OD1.B SER 40.A H.B 2.601 1.861 SER 40.A OG.A ASP 38.A OD1.A SER 40.A HG.A 2.885 2.070 SER 40.A OG.A ASP 38.A OD1.B SER 40.A HG.A 2.783 1.949 SER 40.A OG.A ASP 38.A OD2.A SER 40.A HG.A 3.529 2.832 SER 40.A OG.B ASP 38.A OD1.A SER 40.A HG.B 3.251 2.476 SER 40.A OG.B ASP 38.A OD1.B SER 40.A HG.B 2.884 2.069 SER 40.A OG.B ASP 38.A OD2.A SER 40.A HG.B 2.710 1.962 SER 40.A OG.B ASP 38.A OD2.B SER 40.A HG.B 3.278 2.583 LEU 41.A N.A ASP 38.A O.A LEU 41.A H.A 2.928 2.069 LEU 41.A N.A ASP 38.A O.B LEU 41.A H.A 3.114 2.257 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.890 2.042 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H.B 2.894 2.039 TYR 48.A OH HIS 119.A NE2 TYR 48.A HH 2.746 1.939 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.070 2.226 SER 53.A OG PHE 172.A O SER 53.A HG 2.700 2.030 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.795 1.988 ARG 55.A NE.B GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE.B 3.085 2.286 ARG 55.A NE.C SER 169.A OG.A ARG 55.A HE.C 2.614 1.819 ARG 55.A NH1.A GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH11.A 2.604 1.756 ARG 55.A NH1.B GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH11.B 3.143 2.377 ARG 55.A NH1.C ASP 171.A OD1 ARG 55.A HH12.C 2.581 1.786 ARG 55.A NH2.B SER 169.A OG.A ARG 55.A HH21.B 3.251 2.596 ARG 55.A NH2.C SER 169.A OG.A ARG 55.A HH21.C 3.026 2.380 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H.A 2.931 2.117 LEU 57.A N.A ASN 64.A O LEU 57.A H.A 2.913 2.185 LEU 57.A N.B ASN 64.A O LEU 57.A H.B 2.930 2.168 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H.A 2.914 2.077 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.087 2.262 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.103 2.250 ASN 59.A N THR 62.A O ASN 59.A H 3.146 2.351 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.796 1.960 HIS 61.A N ASN 59.A OD1 HIS 61.A H 2.870 2.065 THR 62.A N ASN 59.A OD1 THR 62.A H 2.963 2.171 THR 62.A OG1 PHE 92.A O THR 62.A HG1 2.663 2.187 ASN 64.A N LEU 57.A O.A ASN 64.A H 2.846 2.053 ASN 64.A N LEU 57.A O.B ASN 64.A H 2.861 2.059 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.873 2.052 GLU 66.A N ARG 55.A O.A GLU 66.A H 2.972 2.142 GLU 66.A N ARG 55.A O.B GLU 66.A H 2.886 2.043 GLU 66.A N ARG 55.A O.C GLU 66.A H 2.882 2.033 GLU 66.A N ARG 55.A O.D GLU 66.A H 2.906 2.064 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.920 2.110 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 3.006 2.200 SER 70.A N ASP 68.A OD1 SER 70.A H 2.949 2.093 SER 70.A OG ASP 68.A OD1 SER 70.A HG 2.757 1.955 LYS 73.A N.B GLN 71.A O LYS 73.A H.B 3.018 2.357 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H.A 3.001 2.214 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.853 2.026 LYS 77.A N SER 45.A O LYS 77.A H 2.939 2.114 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 2.948 2.117 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.878 2.036 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.008 2.195 TYR 85.A OH ASP 135.A O TYR 85.A HH 2.982 2.342 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.854 2.080 ARG 86.A NE ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE 2.710 1.885 ARG 86.A NE ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE 2.750 1.894 ARG 86.A NH1 ASP 69.A O ARG 86.A HH11 2.933 2.201 ARG 86.A NH2 ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21 3.022 2.322 ARG 86.A NH2 ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21 3.355 2.702 LEU 87.A N ALA 74.A O.A LEU 87.A H 3.091 2.261 LEU 87.A N ALA 74.A O.B LEU 87.A H 2.730 1.870 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.933 2.081 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.968 2.213 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.078 2.301 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.777 1.917 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.888 2.093 HIS 93.A ND1 ASN 239.A O HIS 93.A HD1 2.774 1.936 HIS 93.A NE2 HIS 91.A NE2 no hydrogen 3.148 N/A HIS 93.A NE2 HIS 116.A ND1 no hydrogen 3.086 N/A TRP 94.A N ASN 239.A OD1 TRP 94.A H 2.816 1.982 TRP 94.A NE1 MET 236.A O TRP 94.A HE1 2.840 2.132 SER 96.A N ASP 238.A OD1 SER 96.A H 2.974 2.256 SER 96.A OG ASP 238.A OD1 SER 96.A HG 3.568 2.757 GLY 99.A N HIS 97.A ND1 GLY 99.A H 3.063 2.280 GLN 100.A N HIS 97.A O GLN 100.A H 3.371 2.518 GLN 100.A NE2 ASP 238.A OD1 GLN 100.A HE21 2.880 2.058 GLN 100.A NE2 ASP 238.A OD2 GLN 100.A HE21 3.515 2.901 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.977 2.242 SER 102.A OG HIS 104.A O SER 102.A HG 2.864 2.327 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.824 2.099 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.816 2.135 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.766 1.920 HIS 104.A NE2 TYR 190.A OH HIS 104.A HE2 2.649 1.823 THR 105.A OG1 ASP 29.A OD1 THR 105.A HG1 2.641 1.867 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.213 2.433 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.827 1.995 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.841 2.033 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.848 2.011 LYS 109.A NZ LYS 110.A O.A LYS 109.A HZ2 3.536 2.678 LYS 109.A NZ LYS 110.A O.B LYS 109.A HZ2 3.294 2.425 TYR 111.A N SER 102.A OG TYR 111.A H.A 2.931 2.111 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.911 2.135 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.815 1.963 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.873 2.018 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.752 1.927 LEU 117.A N LEU 140.A O.A LEU 117.A H 2.996 2.150 LEU 117.A N LEU 140.A O.B LEU 117.A H 2.887 2.067 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.851 1.994 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.947 2.224 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.004 2.241 TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 2.935 2.177 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.817 2.059 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.798 2.011 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.084 2.237 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.975 2.121 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.012 2.161 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.039 2.181 TYR 124.A OH ASP 135.A OD1 TYR 124.A HH 2.569 1.763 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.307 2.490 LYS 129.A N ASP 126.A OD1 LYS 129.A H 2.966 2.153 ALA 130.A N ASP 126.A O ALA 130.A H 2.991 2.186 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.000 2.221 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.198 2.380 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 3.013 2.219 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.011 2.255 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.873 2.075 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.884 2.075 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.115 2.308 LEU 140.A N.A LEU 117.A O LEU 140.A H.A 2.961 2.133 LEU 140.A N.B LEU 117.A O LEU 140.A H.B 2.980 2.239 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H.A 2.838 2.026 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.893 2.091 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.948 2.097 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H.B 2.847 2.009 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.805 2.031 ASN 150.A N GLN 218.A OE1 ASN 150.A H 2.953 2.105 ASN 150.A ND2 SER 213.A O.A ASN 150.A HD22 2.964 2.135 ASN 150.A ND2 SER 213.A O.B ASN 150.A HD22 2.883 2.071 GLY 152.A N ASN 150.A OD1 GLY 152.A H.A 2.875 2.137 LEU 153.A N.A ASN 150.A O LEU 153.A H.A 3.048 2.208 LEU 153.A N.B ASN 150.A O LEU 153.A H.B 3.063 2.242 GLN 154.A N PRO 151.A O.A GLN 154.A H.B 3.234 2.404 GLN 154.A N PRO 151.A O.B GLN 154.A H.B 3.239 2.408 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE21 2.820 2.034 LYS 155.A NZ.A ASN 174.A O LYS 155.A HZ1.A 3.032 2.302 LYS 155.A NZ.B THR 173.A O LYS 155.A HZ1.B 3.172 2.535 VAL 156.A N LEU 153.A O.B VAL 156.A H.B 2.937 2.342 VAL 157.A N LEU 153.A O.A VAL 157.A H 3.047 2.203 VAL 157.A N LEU 153.A O.B VAL 157.A H 3.049 2.222 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.881 2.075 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.100 2.289 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.337 2.496 SER 162.A N.A VAL 159.A O SER 162.A H.A 2.859 2.023 SER 162.A N.B VAL 159.A O SER 162.A H.B 3.000 2.165 SER 162.A OG.B VAL 159.A O SER 162.A HG.B 2.689 1.851 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H.B 3.018 2.162 LYS 164.A NZ LYS 224.A O LYS 164.A HZ1 2.671 1.821 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H.A 2.914 2.065 LYS 166.A NZ.B GLU 231.A OE1 LYS 166.A HZ3.B 3.281 2.666 LYS 166.A NZ.B GLU 231.A OE2 LYS 166.A HZ3.B 3.217 2.333 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.831 2.000 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.070 2.221 SER 169.A OG.B ILE 56.A O SER 169.A HG.B 3.071 2.385 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.867 2.089 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.961 2.129 PHE 175.A N SER 53.A OG PHE 175.A H 2.979 2.127 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.982 2.190 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 2.920 2.073 ARG 178.A NE ASP 176.A OD2 ARG 178.A HE 3.277 2.602 ARG 178.A NH1 ASP 49.A OD1 ARG 178.A HH11 2.844 2.153 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 2.879 2.097 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.118 2.289 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.043 2.194 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.237 2.394 SER 184.A N GLU 210.A OE2 SER 184.A H 2.929 2.083 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.162 2.304 TYR 187.A OH LYS 42.A O.A TYR 187.A HH 2.746 1.911 TYR 187.A OH LYS 42.A O.B TYR 187.A HH 2.758 1.927 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.863 2.036 THR 189.A N LYS 252.A O THR 189.A H 2.832 2.063 THR 189.A OG1 TRP 205.A O THR 189.A HG1 2.765 1.979 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.267 2.514 TYR 190.A OH SER 26.A OG TYR 190.A HH 2.822 2.113 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.797 1.939 SER 193.A OG LEU 194.A O SER 193.A HG 2.746 1.962 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.942 2.163 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.595 1.786 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.803 2.056 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.146 2.304 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.857 2.013 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.960 2.148 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.953 2.155 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 2.945 2.126 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.836 2.018 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.877 2.049 LYS 209.A N.A ASP 186.A O LYS 209.A H.A 2.970 2.130 LYS 209.A N.B ASP 186.A O LYS 209.A H.B 2.958 2.109 LYS 209.A NZ.B ASP 186.A OD2 LYS 209.A HZ3.B 2.596 1.755 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.860 2.069 SER 213.A OG.A SER 148.A O SER 213.A HG.A 2.816 2.368 SER 213.A OG.B SER 148.A O SER 213.A HG.B 2.602 2.047 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H.A 3.092 2.393 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.102 2.264 SER 216.A OG.A ASP 98.A OD2 SER 216.A HG.A 2.729 1.945 SER 216.A OG.B ASP 98.A OD2 SER 216.A HG.B 3.083 2.463 GLU 217.A N GLU 217.A OE2 GLU 217.A H.A 2.772 1.979 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.026 2.205 GLN 218.A NE2 ASN 150.A O GLN 218.A HE22 2.953 2.109 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE21 2.889 2.098 VAL 219.A N.A SER 215.A O VAL 219.A H.A 3.123 2.290 VAL 219.A N.B SER 215.A O VAL 219.A H.B 3.124 2.292 SER 220.A N.A SER 216.A O.A SER 220.A H.A 2.941 2.104 SER 220.A N.A SER 216.A O.B SER 220.A H.A 3.076 2.248 SER 220.A N.B SER 216.A O.A SER 220.A H.B 2.944 2.151 SER 220.A N.B SER 216.A O.B SER 220.A H.B 3.096 2.325 SER 220.A N.C SER 216.A O.A no hydrogen 2.806 N/A SER 220.A N.C SER 216.A O.B no hydrogen 2.950 N/A SER 220.A OG.A SER 216.A O.A SER 220.A HG.A 3.139 2.382 SER 220.A OG.A SER 216.A O.B SER 220.A HG.A 2.949 2.196 SER 220.A OG.C GLU 217.A O SER 220.A HG.C 2.703 1.908 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H.A 3.277 2.591 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H.A 3.080 2.395 LYS 221.A NZ ASP 161.A OD2.A LYS 221.A HZ3 2.901 2.131 ARG 223.A N VAL 219.A O.A ARG 223.A H 3.357 2.621 ARG 223.A N SER 220.A O.A ARG 223.A H 3.213 2.591 ARG 223.A N SER 220.A O.B ARG 223.A H 3.080 2.433 ARG 223.A N SER 220.A O.C ARG 223.A H 2.936 2.283 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.795 1.982 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.915 2.059 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.171 2.351 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.215 2.378 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.790 1.981 PHE 227.A N GLU 234.A O PHE 227.A H 2.828 2.025 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 3.161 2.351 GLY 229.A N GLU 231.A OE1 GLY 229.A H 2.760 1.910 GLU 231.A N GLY 229.A O GLU 231.A H 3.129 2.285 GLU 234.A N ASN 228.A OD1 GLU 234.A H 2.882 2.084 MET 236.A N LEU 225.A O MET 236.A H 2.792 1.933 ASN 239.A ND2 HIS 61.A O ASN 239.A HD22 2.925 2.076 TRP 240.A NE1 ASP 238.A OD1 TRP 240.A HE1 2.986 2.145 ARG 241.A N GLU 103.A OE2 ARG 241.A H 2.811 1.971 ARG 241.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 241.A HH12 2.807 1.996 ARG 241.A NH1 SER 26.A O ARG 241.A HH11 2.849 2.102 ARG 241.A NH2 ALA 20.A O ARG 241.A HH22 3.194 2.514 ARG 241.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 241.A HH22 3.336 2.698 GLN 244.A N PRO 27.A O GLN 244.A H 2.833 2.037 GLN 244.A NE2 PRO 242.A O.A GLN 244.A HE21 2.732 1.902 GLN 244.A NE2 PRO 242.A O.B GLN 244.A HE21 3.056 2.210 LYS 247.A NZ GLY 22.A O LYS 247.A HZ1 2.938 2.064 ARG 249.A N LEU 246.A O ARG 249.A H.A 3.281 2.437 ARG 249.A NE LEU 246.A O ARG 249.A HE 2.910 2.054 ARG 249.A NH1 GLN 25.A O ARG 249.A HH12 3.030 2.311 ARG 249.A NH1 PRO 191.A O ARG 249.A HH11 2.906 2.061 ARG 249.A NH2 GLN 25.A O ARG 249.A HH22 2.805 2.010 ARG 249.A NH2 PRO 245.A O ARG 249.A HH21 2.857 2.151 LYS 252.A N THR 189.A O LYS 252.A H 2.973 2.136 ALA 253.A N LYS 36.A O ALA 253.A H 2.835 1.988 SER 254.A N TYR 187.A O SER 254.A H 2.837 1.993 SER 254.A OG TYR 187.A O SER 254.A HG 3.279 2.577