Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6rm7_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N GLY 1.A O GLY 4.A H 2.997 2.165 MET 6.A N MET 3.A O MET 6.A H 3.060 2.212 ARG 8.A NH1 GLU 44.A OE1 ARG 8.A HH12 3.547 2.913 ARG 8.A NH1 GLU 44.A OE2 ARG 8.A HH12 2.944 2.097 ARG 8.A NH2 GLU 44.A OE1 ARG 8.A HH22 2.816 1.962 LEU 11.A N GLU 7.A O LEU 11.A H 2.940 2.115 ILE 12.A N.A ARG 8.A O ILE 12.A H.A 3.045 2.218 ILE 12.A N.B ARG 8.A O ILE 12.A H.B 3.064 2.259 GLN 13.A N ALA 9.A O GLN 13.A H 2.955 2.115 LYS 14.A N SER 10.A O LYS 14.A H 2.851 2.024 ALA 15.A N LEU 11.A O ALA 15.A H 2.828 2.026 LYS 16.A N ILE 12.A O.A LYS 16.A H 3.073 2.277 LYS 16.A N ILE 12.A O.B LYS 16.A H 3.117 2.317 LEU 17.A N GLN 13.A O LEU 17.A H 3.056 2.254 ALA 18.A N LYS 14.A O ALA 18.A H 2.787 1.956 GLU 19.A N ALA 15.A O GLU 19.A H 2.941 2.114 GLN 20.A N LYS 16.A O GLN 20.A H 3.132 2.322 ALA 21.A N LEU 17.A O ALA 21.A H 2.968 2.187 GLU 22.A N GLU 19.A O GLU 22.A H 3.066 2.227 ARG 23.A N ALA 18.A O ARG 23.A H 2.841 1.989 ARG 23.A NE ASP 26.A OD2 ARG 23.A HE 2.901 2.151 ARG 23.A NH2 ASP 26.A OD2 ARG 23.A HH21 2.835 2.079 MET 27.A N ARG 23.A O MET 27.A H 2.895 2.071 ALA 28.A N TYR 24.A O ALA 28.A H 2.859 2.042 ALA 29.A N GLU 25.A O ALA 29.A H 3.012 2.182 PHE 30.A N ASP 26.A O PHE 30.A H 2.884 2.047 MET 31.A N MET 27.A O MET 31.A H 2.965 2.147 LYS 32.A N ALA 28.A O LYS 32.A H 2.770 1.922 LYS 32.A NZ GLU 36.A OE2 LYS 32.A HZ1 2.625 1.878 GLY 33.A N ALA 29.A O GLY 33.A H 2.985 2.143 ALA 34.A N PHE 30.A O ALA 34.A H 2.922 2.144 VAL 35.A N MET 31.A O VAL 35.A H 2.863 2.024 GLU 36.A N LYS 32.A O GLU 36.A H 2.946 2.132 LYS 37.A N ALA 34.A O LYS 37.A H 3.079 2.281 LYS 37.A NZ MET 3.A O LYS 37.A HZ2 3.377 2.707 LYS 37.A NZ MET 6.A O LYS 37.A HZ2 2.716 2.103 GLY 38.A N VAL 35.A O GLY 38.A H 2.965 2.112 SER 42.A N GLU 44.A OE1 SER 42.A H 2.846 2.012 GLU 44.A N SER 42.A OG GLU 44.A H 3.195 2.348 ARG 45.A N SER 42.A O ARG 45.A H 2.838 1.996 ARG 45.A NH1 LEU 41.A O ARG 45.A HH11 2.904 2.335 LEU 47.A N GLU 43.A O LEU 47.A H 2.938 2.145 LEU 48.A N GLU 44.A O LEU 48.A H 2.980 2.139 SER 49.A N ARG 45.A O SER 49.A H 2.951 2.134 VAL 50.A N ASN 46.A O VAL 50.A H 2.841 1.983 ALA 51.A N LEU 47.A O ALA 51.A H 3.054 2.221 TYR 52.A N LEU 48.A O TYR 52.A H 3.213 2.360 LYS 53.A N SER 49.A O LYS 53.A H 2.816 1.988 ASN 54.A N VAL 50.A O ASN 54.A H 3.067 2.243 ASN 54.A ND2 VAL 50.A O ASN 54.A HD22 2.923 2.101 VAL 55.A N ALA 51.A O VAL 55.A H 3.113 2.280 VAL 56.A N TYR 52.A O VAL 56.A H 2.834 1.975 GLY 57.A N LYS 53.A O GLY 57.A H 2.881 2.130 GLY 58.A N ASN 54.A O GLY 58.A H 3.193 2.367 GLN 59.A N VAL 55.A O GLN 59.A H 3.307 2.511 GLN 59.A NE2 GLU 93.A O.B GLN 59.A HE22 3.215 2.571 GLN 59.A NE2 GLU 93.A OE2.A GLN 59.A HE21 2.794 1.941 ARG 60.A N VAL 56.A O ARG 60.A H 2.795 1.973 ARG 60.A NE GLU 135.A OE1 ARG 60.A HE 2.930 2.086 ARG 60.A NH2 GLU 135.A OE1 ARG 60.A HH21 3.474 2.810 ARG 60.A NH2 GLU 135.A OE2 ARG 60.A HH21 2.915 2.085 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 3.003 2.162 ALA 62.A N GLY 58.A O ALA 62.A H 3.038 2.210 TRP 63.A N GLN 59.A O TRP 63.A H 2.819 1.974 TRP 63.A NE1 GLU 91.A OE1 TRP 63.A HE1 2.805 1.957 ARG 64.A N ARG 60.A O ARG 64.A H 2.969 2.168 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.163 2.337 LEU 66.A N ALA 62.A O LEU 66.A H 3.013 2.184 SER 67.A N.A TRP 63.A O SER 67.A H.A 2.780 1.940 SER 67.A N.B TRP 63.A O SER 67.A H.B 2.784 1.942 SER 68.A N ARG 64.A O SER 68.A H 3.011 2.194 ILE 69.A N VAL 65.A O ILE 69.A H 3.096 2.265 GLU 70.A N LEU 66.A O GLU 70.A H 2.853 2.043 GLN 71.A N SER 67.A O.A GLN 71.A H 2.880 2.068 GLN 71.A N SER 67.A O.B GLN 71.A H 2.855 2.040 LYS 72.A N SER 68.A O LYS 72.A H 3.032 2.173 SER 73.A N ILE 69.A O SER 73.A H 2.912 2.109 SER 73.A OG GLU 70.A O SER 73.A HG 2.606 1.779 ASN 74.A N GLU 70.A O ASN 74.A H 3.195 2.593 ASN 74.A N GLN 71.A O ASN 74.A H 2.940 2.201 GLU 75.A N LYS 72.A O GLU 75.A H 3.056 2.204 GLU 82.A N GLU 82.A OE1 GLU 82.A H 2.827 2.103 ARG 84.A NH1 GLU 88.A OE1.A ARG 84.A HH11 3.089 2.271 GLU 85.A N PRO 81.A O GLU 85.A H 2.883 2.038 TYR 86.A N GLU 82.A O TYR 86.A H 2.905 2.084 ARG 87.A N VAL 83.A O ARG 87.A H 2.863 2.008 ARG 87.A NE GLU 70.A OE1 ARG 87.A HE 2.733 1.893 ARG 87.A NH1 GLU 88.A OE2.B ARG 87.A HH12 2.802 2.131 ARG 87.A NH1 GLU 91.A OE1 ARG 87.A HH11 2.919 2.208 ARG 87.A NH2 GLU 70.A OE1 ARG 87.A HH21 3.427 2.799 ARG 87.A NH2 GLU 70.A OE2 ARG 87.A HH21 2.971 2.115 GLU 88.A N.A ARG 84.A O GLU 88.A H.A 2.823 1.978 GLU 88.A N.B ARG 84.A O GLU 88.A H.B 2.849 2.001 LYS 89.A N.A GLU 85.A O LYS 89.A H 2.886 2.131 VAL 90.A N TYR 86.A O VAL 90.A H 3.039 2.197 GLU 91.A N ARG 87.A O GLU 91.A H 2.808 1.970 THR 92.A N GLU 88.A O.A THR 92.A H 2.859 2.041 THR 92.A N GLU 88.A O.B THR 92.A H 2.814 1.986 THR 92.A OG1 GLU 88.A O.A THR 92.A HG1 2.864 2.107 THR 92.A OG1 GLU 88.A O.B THR 92.A HG1 2.900 2.153 GLU 93.A N.A LYS 89.A O.A GLU 93.A H.A 3.067 2.245 GLU 93.A N.A LYS 89.A O.C GLU 93.A H.A 3.124 2.302 GLU 93.A N.B LYS 89.A O.A GLU 93.A H.B 3.097 2.298 GLU 93.A N.B LYS 89.A O.C GLU 93.A H.B 3.154 2.352 LEU 94.A N VAL 90.A O LEU 94.A H 2.863 2.027 GLN 95.A N GLU 91.A O GLN 95.A H 2.872 2.027 GLY 96.A N THR 92.A O GLY 96.A H 2.919 2.157 VAL 97.A N GLU 93.A O.A VAL 97.A H 3.029 2.234 VAL 97.A N GLU 93.A O.B VAL 97.A H 3.101 2.297 CYS 98.A N LEU 94.A O CYS 98.A H 2.979 2.131 ASP 99.A N GLN 95.A O ASP 99.A H 2.834 1.994 THR 100.A N GLY 96.A O THR 100.A H 2.914 2.128 THR 100.A OG1 GLY 96.A O THR 100.A HG1 2.989 2.214 VAL 101.A N VAL 97.A O VAL 101.A H 2.977 2.137 LEU 102.A N CYS 98.A O LEU 102.A H 2.891 2.034 GLY 103.A N ASP 99.A O GLY 103.A H 2.831 2.048 LEU 104.A N THR 100.A O LEU 104.A H 3.031 2.235 LEU 105.A N VAL 101.A O LEU 105.A H 2.997 2.177 ASP 106.A N LEU 102.A O ASP 106.A H 2.921 2.138 SER 107.A N GLY 103.A O SER 107.A H 2.825 2.197 LEU 109.A N LEU 104.A O LEU 109.A H 3.317 2.464 ILE 110.A N LEU 105.A O ILE 110.A H 2.942 2.082 LYS 111.A NZ HIS 108.A ND1 LYS 111.A HZ3 2.990 2.111 GLU 112.A N HIS 108.A O GLU 112.A H 3.376 2.620 ALA 113.A N ILE 110.A O ALA 113.A H 3.005 2.168 SER 118.A N ASP 115.A O SER 118.A H 3.171 2.534 SER 118.A OG ASP 115.A O SER 118.A HG 3.048 2.405 ARG 119.A N ASP 115.A O ARG 119.A H 2.875 2.015 ARG 119.A NH1 ALA 113.A O ARG 119.A HH11 2.981 2.163 ARG 119.A NH2 GLU 155.A OE2 ARG 119.A HH21 3.256 2.443 VAL 120.A N ALA 116.A O VAL 120.A H 2.838 1.993 TYR 122.A N SER 118.A O TYR 122.A H 2.974 2.147 LEU 123.A N ARG 119.A O LEU 123.A H 2.923 2.075 LYS 124.A N VAL 120.A O LYS 124.A H 2.877 2.026 LYS 124.A NZ ASP 128.A OD2 LYS 124.A HZ1 2.872 2.080 MET 125.A N PHE 121.A O MET 125.A H 3.010 2.185 LYS 126.A N TYR 122.A O LYS 126.A H 2.879 2.065 GLY 127.A N LEU 123.A O GLY 127.A H 2.941 2.103 ASP 128.A N LYS 124.A O ASP 128.A H 2.851 2.041 TYR 129.A N MET 125.A O TYR 129.A H 2.922 2.114 TYR 130.A N LYS 126.A O TYR 130.A H 3.074 2.222 ARG 131.A N GLY 127.A O ARG 131.A H 2.846 2.046 ARG 131.A NE TYR 153.A OH ARG 131.A HE 2.919 2.062 ARG 131.A NH2 ASP 128.A OD1 ARG 131.A HH21 3.302 2.483 ARG 131.A NH2 TYR 153.A OH ARG 131.A HH21 3.535 2.863 TYR 132.A N ASP 128.A O TYR 132.A H 2.893 2.120 LEU 133.A N TYR 129.A O LEU 133.A H 3.064 2.238 ALA 134.A N TYR 130.A O ALA 134.A H 2.794 2.013 GLU 135.A N ARG 131.A O GLU 135.A H 2.983 2.269 VAL 136.A N LEU 133.A O VAL 136.A H 3.209 2.423 ALA 137.A N ALA 134.A O ALA 137.A H 3.190 2.367 LYS 142.A N GLY 139.A O LYS 142.A H 3.275 2.415 ARG 144.A NE ASP 141.A OD1 ARG 144.A HE 3.423 2.574 ILE 145.A N ASP 141.A O ILE 145.A H 2.860 2.042 ILE 146.A N LYS 142.A O ILE 146.A H 2.914 2.064 ASP 147.A N LYS 143.A O ASP 147.A H 2.936 2.122 SER 148.A N ARG 144.A O SER 148.A H 2.898 2.100 SER 148.A OG ARG 144.A O SER 148.A HG 3.159 2.429 ALA 149.A N ILE 145.A O ALA 149.A H 3.005 2.177 ARG 150.A N.A ILE 146.A O ARG 150.A H.A 2.925 2.078 ARG 150.A N.B ILE 146.A O ARG 150.A H.B 2.919 2.068 ARG 150.A NE.B ASP 147.A OD1 ARG 150.A HE.B 2.796 1.952 ARG 150.A NH2.B ASP 147.A OD1 ARG 150.A HH21.B 3.272 2.590 ARG 150.A NH2.B ASP 147.A OD2 ARG 150.A HH21.B 3.392 2.539 SER 151.A N ASP 147.A O SER 151.A H.B 2.847 2.024 ALA 152.A N SER 148.A O ALA 152.A H 3.122 2.282 TYR 153.A N ALA 149.A O TYR 153.A H 2.964 2.106 TYR 153.A OH ASP 128.A OD1 TYR 153.A HH 2.579 1.763 GLN 154.A N ARG 150.A O.A GLN 154.A H 2.822 2.026 GLN 154.A N ARG 150.A O.B GLN 154.A H 2.823 2.027 GLN 154.A NE2 GLN 154.A O GLN 154.A HE21 3.499 2.975 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE21 2.998 2.191 GLU 155.A N SER 151.A O GLU 155.A H 3.023 2.181 ALA 156.A N ALA 152.A O ALA 156.A H 3.031 2.180 MET 157.A N.A TYR 153.A O MET 157.A H.A 2.796 1.989 MET 157.A N.B TYR 153.A O MET 157.A H.B 2.789 1.985 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.897 2.068 ILE 159.A N GLU 155.A O ILE 159.A H 3.095 2.253 SER 160.A N ALA 156.A O SER 160.A H 2.915 2.093 SER 160.A OG ALA 156.A O SER 160.A HG 3.463 2.952 SER 160.A OG MET 157.A O.A SER 160.A HG 2.968 2.193 SER 160.A OG MET 157.A O.B SER 160.A HG 2.953 2.176 LYS 161.A N MET 157.A O.A LYS 161.A H 2.933 2.125 LYS 161.A N MET 157.A O.B LYS 161.A H 2.950 2.144 LYS 162.A N ASP 158.A O LYS 162.A H 3.312 2.538 GLU 163.A N ILE 159.A O GLU 163.A H 2.891 2.193 MET 164.A N SER 160.A O MET 164.A H 3.047 2.278 THR 167.A OG1 ASP 206.A OD2 THR 167.A HG1 2.677 1.988 ASN 168.A N PRO 165.A O ASN 168.A H 3.010 2.156 ILE 170.A N ASN 168.A OD1 ILE 170.A H 2.869 2.263 ARG 171.A N ASN 168.A OD1 ARG 171.A H 3.128 2.317 ARG 171.A NH1 MET 164.A O ARG 171.A HH11 2.761 2.097 LEU 172.A N ASN 168.A O LEU 172.A H 2.876 2.057 GLY 173.A N PRO 169.A O GLY 173.A H 2.920 2.084 LEU 174.A N ILE 170.A O LEU 174.A H 2.957 2.114 ALA 175.A N ARG 171.A O ALA 175.A H 2.997 2.173 LEU 176.A N LEU 172.A O LEU 176.A H 2.921 2.073 ASN 177.A N GLY 173.A O ASN 177.A H 3.013 2.178 ASN 177.A ND2 ASP 128.A OD1 ASN 177.A HD22 2.913 2.107 ASN 177.A ND2 ASP 128.A OD2 ASN 177.A HD22 3.310 2.653 PHE 178.A N LEU 174.A O PHE 178.A H 2.833 1.982 SER 179.A N.A ALA 175.A O SER 179.A H.A 2.864 2.048 SER 179.A N.B ALA 175.A O SER 179.A H.B 2.852 2.026 SER 179.A OG.A ALA 175.A O SER 179.A HG.A 3.446 2.904 SER 179.A OG.A LEU 176.A O SER 179.A HG.A 2.643 1.859 VAL 180.A N LEU 176.A O VAL 180.A H 3.110 2.317 PHE 181.A N ASN 177.A O PHE 181.A H 2.888 2.045 HIS 182.A N PHE 178.A O HIS 182.A H 2.893 2.075 TYR 183.A N SER 179.A O.A TYR 183.A H 2.953 2.181 TYR 183.A N SER 179.A O.B TYR 183.A H 2.924 2.153 GLU 184.A N VAL 180.A O GLU 184.A H 3.054 2.228 ILE 185.A N PHE 181.A O ILE 185.A H 2.915 2.116 ALA 186.A N PHE 181.A O ALA 186.A H 2.952 2.123 SER 188.A N HIS 182.A O SER 188.A H 2.763 1.918 ALA 192.A N SER 188.A O ALA 192.A H 3.054 2.233 ILE 193.A N PRO 189.A O ILE 193.A H 2.964 2.139 SER 194.A N.A GLU 190.A O SER 194.A H.A 2.946 2.092 SER 194.A N.B GLU 190.A O SER 194.A H.B 2.954 2.107 SER 194.A OG.B GLU 190.A O SER 194.A HG.B 3.105 2.402 LEU 195.A N GLU 191.A O LEU 195.A H 2.903 2.063 ALA 196.A N ALA 192.A O ALA 196.A H 2.994 2.156 LYS 197.A N ILE 193.A O LYS 197.A H 2.912 2.063 THR 198.A N.A SER 194.A O.A THR 198.A H.A 2.913 2.054 THR 198.A N.A SER 194.A O.B THR 198.A H.A 2.983 2.126 THR 198.A N.B SER 194.A O.A THR 198.A H.B 2.927 2.067 THR 198.A N.B SER 194.A O.B THR 198.A H.B 2.996 2.137 THR 198.A OG1.B SER 194.A O.A THR 198.A HG1.B 2.869 2.047 THR 198.A OG1.B SER 194.A O.B THR 198.A HG1.B 2.789 1.977 THR 198.A OG1.B LEU 195.A O THR 198.A HG1.B 3.235 2.845 THR 199.A N LEU 195.A O THR 199.A H 2.921 2.080 THR 199.A OG1 LEU 195.A O THR 199.A HG1 2.686 1.952 PHE 200.A N ALA 196.A O PHE 200.A H 2.950 2.113 ASP 201.A N LYS 197.A O ASP 201.A H 2.893 2.046 GLU 202.A N THR 198.A O.A GLU 202.A H 2.938 2.095 GLU 202.A N THR 198.A O.B GLU 202.A H 2.989 2.149 ALA 203.A N THR 199.A O ALA 203.A H 3.035 2.222 MET 204.A N.A PHE 200.A O MET 204.A H.A 2.889 2.043 MET 204.A N.B PHE 200.A O MET 204.A H.B 2.882 2.030 ALA 205.A N ASP 201.A O ALA 205.A H 3.209 2.419 ASP 206.A N ALA 203.A O ASP 206.A H 2.908 2.085 LEU 207.A N MET 204.A O.A LEU 207.A H 3.346 2.511 LEU 207.A N MET 204.A O.B LEU 207.A H 3.328 2.493 HIS 208.A ND1 ALA 205.A O no hydrogen 3.178 N/A THR 209.A N ASP 206.A O THR 209.A H 3.166 2.315 THR 209.A OG1 ASP 206.A O THR 209.A HG1 2.748 1.927 LEU 210.A N LEU 207.A O LEU 210.A H 3.112 2.267 SER 214.A N SER 211.A OG SER 214.A H 3.138 2.280 TYR 215.A N SER 211.A O TYR 215.A H 2.819 1.978 LYS 216.A N GLU 212.A O LYS 216.A H 3.143 2.346 ASP 217.A N ASP 213.A O ASP 217.A H 3.117 2.293 SER 218.A N SER 214.A O SER 218.A H 2.947 2.113 SER 218.A OG THR 167.A O SER 218.A HG 2.640 1.960 THR 219.A N TYR 215.A O THR 219.A H 2.912 2.061 THR 219.A OG1 TYR 215.A O THR 219.A HG1 2.862 2.080 THR 219.A OG1 LYS 216.A O THR 219.A HG1 3.352 2.856 LEU 220.A N LYS 216.A O LEU 220.A H 3.120 2.325 MET 222.A N SER 218.A O MET 222.A H 2.984 2.151 GLN 223.A N THR 219.A O GLN 223.A H 2.990 2.226 GLN 223.A NE2 ASP 227.A OD1 GLN 223.A HE21 2.921 2.082 LEU 225.A N ILE 221.A O LEU 225.A H 3.209 2.409 ARG 226.A N MET 222.A O ARG 226.A H 3.015 2.195 ASP 227.A N GLN 223.A O ASP 227.A H 2.767 1.952 ASN 228.A N LEU 224.A O ASN 228.A H 3.086 2.261 LEU 229.A N LEU 225.A O LEU 229.A H 2.913 2.070 THR 230.A N ARG 226.A O THR 230.A H 2.849 2.038 THR 230.A OG1 ARG 226.A O THR 230.A HG1 3.037 2.276 LEU 231.A N ASP 227.A O LEU 231.A H 3.240 2.471 TRP 232.A N ASN 228.A O TRP 232.A H 2.919 2.286 TRP 232.A N LEU 229.A O TRP 232.A H 3.173 2.485 THR 233.A N LEU 229.A O THR 233.A H 3.023 2.434 THR 233.A OG1 LEU 229.A O THR 233.A HG1 2.640 1.809