Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6rug_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 1.A N TYR 25.A O ALA 1.A H3 2.767 2.003 GLN 3.A N TYR 23.A O GLN 3.A H 2.817 1.993 GLN 3.A NE2 THR 81.A O GLN 3.A HE21 2.835 2.015 ALA 6.A N SER 21.A O ALA 6.A H 2.852 2.075 TRP 8.A NE1 THR 206.A O TRP 8.A HE1 2.954 2.244 TRP 8.A NE1 ASP 207.A O TRP 8.A HE1 3.123 2.482 ALA 11.A N PRO 7.A O ALA 11.A H 3.218 2.385 ARG 12.A N TRP 8.A O ARG 12.A H 2.796 2.038 ARG 12.A NE ASP 187.A OD1 ARG 12.A HE 2.756 1.920 ARG 12.A NE ASP 187.A OD2 ARG 12.A HE 3.388 2.724 ARG 12.A NH1 ARG 12.A O ARG 12.A HH12 3.083 2.396 ARG 12.A NH1 SER 15.A O ARG 12.A HH11 2.792 2.126 ARG 12.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 12.A HH22 3.568 2.978 ARG 12.A NH2 ASP 187.A OD2 ARG 12.A HH22 2.809 1.973 ILE 13.A N GLY 9.A O ILE 13.A H 3.075 2.290 SER 14.A N ALA 11.A O SER 14.A H 3.263 2.512 SER 14.A OG ALA 11.A O SER 14.A HG 3.560 3.018 SER 15.A N ARG 12.A O SER 15.A H 3.171 2.337 SER 15.A OG SER 17.A O SER 15.A HG 2.706 1.904 TYR 23.A N GLN 3.A O TYR 23.A H 2.997 2.191 TYR 24.A N SER 14.A OG TYR 24.A H 2.935 2.081 TYR 25.A N ALA 1.A O TYR 25.A H 2.992 2.199 ASP 26.A N TYR 236.A OH ASP 26.A H 2.893 2.035 SER 28.A N ASP 26.A OD1 SER 28.A H 2.937 2.089 ALA 29.A N ASP 26.A O ALA 29.A H 3.042 2.339 GLN 31.A N SER 28.A O GLN 31.A H 2.888 2.035 SER 33.A N GLY 30.A O SER 33.A H 3.097 2.255 SER 33.A OG THR 88.A OG1 SER 33.A HG 2.824 2.167 CYS 34.A N GLY 126.A O CYS 34.A H 3.059 2.287 VAL 35.A N GLN 89.A O VAL 35.A H 2.839 2.014 TYR 36.A N VAL 128.A O TYR 36.A H 2.818 1.985 TYR 36.A OH ASP 117.A OD2 TYR 36.A HH 2.644 1.806 VAL 37.A N PHE 91.A O VAL 37.A H 2.822 2.003 ILE 38.A N SER 130.A O ILE 38.A H 3.118 2.260 ASP 39.A N VAL 93.A O ASP 39.A H 2.942 2.129 THR 40.A N ASP 39.A OD2 THR 40.A H 2.744 2.013 THR 40.A OG1 ASP 65.A OD1 THR 40.A HG1 2.761 2.024 GLU 43.A N THR 71.A OG1 GLU 43.A H 2.872 2.048 HIS 46.A N GLU 43.A O HIS 46.A H 3.098 2.244 HIS 46.A NE2 SER 216.A O HIS 46.A HE2 2.842 2.002 GLU 48.A N HIS 46.A ND1 GLU 48.A H 3.122 2.265 PHE 49.A N HIS 46.A O PHE 49.A H 2.921 2.078 GLU 50.A N PRO 47.A O GLU 50.A H 3.174 2.485 ARG 52.A N PHE 49.A O ARG 52.A H 2.875 2.022 ARG 52.A NE GLU 50.A OE1 ARG 52.A HE 3.301 2.574 ARG 52.A NH1 GLY 78.A O ARG 52.A HH11 2.867 2.103 ARG 52.A NH1 THR 88.A O ARG 52.A HH12 2.902 2.084 ARG 52.A NH2 GLU 50.A OE1 ARG 52.A HH22 2.928 2.119 ARG 52.A NH2 GLY 78.A O ARG 52.A HH21 2.903 2.150 GLN 54.A N LEU 90.A O GLN 54.A H 3.019 2.267 VAL 56.A N GLY 92.A O VAL 56.A H 2.908 2.053 TYR 59.A N LYS 94.A O TYR 59.A H 3.240 2.482 TYR 60.A N THR 58.A OG1 TYR 60.A H 3.121 2.279 TYR 60.A OH VAL 95.A O TYR 60.A HH 2.630 1.827 ARG 64.A N SER 62.A OG ARG 64.A H 2.978 2.119 GLY 66.A N ASP 98.A OD1 GLY 66.A H 2.927 2.148 ASN 67.A N ASP 65.A OD1 ASN 67.A H 2.962 2.134 ASN 67.A ND2 ASP 98.A O ASN 67.A HD21 2.943 2.102 GLY 68.A N ASP 65.A OD1 GLY 68.A H 2.884 2.035 GLY 68.A N ASP 65.A OD2 GLY 68.A H 3.255 2.606 HIS 69.A N ASN 67.A OD1 HIS 69.A H 2.958 2.150 HIS 69.A ND1 ASP 39.A OD2 HIS 69.A HD1 2.661 1.805 GLY 70.A N THR 40.A OG1 GLY 70.A H 2.847 2.025 THR 71.A N ASP 65.A OD2 THR 71.A H 3.010 2.227 THR 71.A OG1 ASP 65.A OD2 THR 71.A HG1 2.630 1.859 HIS 72.A N GLY 68.A O HIS 72.A H 2.873 2.055 HIS 72.A NE2 ARG 218.A O HIS 72.A HE2 2.985 2.299 CYS 73.A N HIS 69.A O CYS 73.A H 2.981 2.136 CYS 73.A SG SER 132.A OG CYS 73.A HG 3.618 2.426 CYS 73.A SG SER 224.A O CYS 73.A HG 3.396 2.615 ALA 74.A N GLY 70.A O ALA 74.A H 2.864 2.010 GLY 75.A N THR 71.A O GLY 75.A H 2.904 2.114 THR 76.A N HIS 72.A O THR 76.A H 3.097 2.332 THR 76.A OG1 HIS 72.A O THR 76.A HG1 3.472 3.006 VAL 77.A N CYS 73.A O VAL 77.A H 3.077 2.269 GLY 78.A N ALA 74.A O GLY 78.A H 2.981 2.195 SER 79.A N GLY 75.A O SER 79.A H 2.957 2.118 ARG 80.A N GLU 48.A O ARG 80.A H 2.934 2.108 ARG 80.A NE GLU 48.A OE2 ARG 80.A HE 3.002 2.162 THR 81.A N GLU 48.A OE1 THR 81.A H 2.797 1.947 TYR 82.A N SER 79.A OG TYR 82.A H 2.997 2.262 GLY 83.A N SER 79.A O GLY 83.A H 2.979 2.323 VAL 84.A N THR 76.A O VAL 84.A H 2.931 2.145 ALA 85.A N VAL 77.A O ALA 85.A H 2.860 2.009 LYS 86.A NZ GLN 3.A OE1 LYS 86.A HZ2 2.738 1.970 LYS 86.A NZ ARG 80.A O LYS 86.A HZ3 2.858 1.993 LYS 86.A NZ GLY 83.A O LYS 86.A HZ1 2.907 2.049 LYS 87.A N ALA 29.A O LYS 87.A H 2.809 1.989 LYS 87.A NZ GLU 27.A O LYS 87.A HZ2 2.962 2.161 THR 88.A N ALA 85.A O THR 88.A H 3.244 2.386 GLN 89.A N SER 33.A O GLN 89.A H 3.216 2.358 LEU 90.A N ARG 52.A O LEU 90.A H 2.886 2.031 PHE 91.A N VAL 35.A O PHE 91.A H 2.938 2.115 GLY 92.A N GLN 54.A O GLY 92.A H 2.794 1.975 VAL 93.A N VAL 37.A O VAL 93.A H 3.063 2.218 LYS 94.A N LYS 57.A O LYS 94.A H 2.866 2.027 LYS 94.A NZ THR 40.A O LYS 94.A HZ2 2.749 1.963 LYS 94.A NZ LEU 96.A O LYS 94.A HZ1 2.840 1.968 LYS 94.A NZ ASP 98.A OD1 LYS 94.A HZ3 2.793 2.047 VAL 95.A N ASP 39.A O VAL 95.A H 2.974 2.384 LEU 96.A N ASP 39.A O LEU 96.A H 3.048 2.231 ASP 97.A N SER 101.A O ASP 97.A H 2.757 1.921 ASN 99.A N ASP 97.A OD1 ASN 99.A H 2.853 2.155 GLY 100.A N ASP 97.A O GLY 100.A H 2.839 1.995 SER 101.A N ASP 97.A OD1 SER 101.A H 3.096 2.248 ILE 107.A N GLN 103.A O ILE 107.A H 3.022 2.200 ILE 108.A N TYR 104.A O ILE 108.A H 2.859 2.014 ALA 109.A N SER 105.A O ALA 109.A H 3.065 2.231 GLY 110.A N THR 106.A O GLY 110.A H 2.926 2.119 MET 111.A N ILE 107.A O MET 111.A H 3.019 2.230 ASP 112.A N ILE 108.A O ASP 112.A H 3.002 2.156 PHE 113.A N ALA 109.A O PHE 113.A H 2.784 1.982 VAL 114.A N GLY 110.A O VAL 114.A H 3.080 2.282 ALA 115.A N MET 111.A O ALA 115.A H 3.142 2.331 SER 116.A N ASP 112.A O SER 116.A H 3.263 2.482 SER 116.A N PHE 113.A O SER 116.A H 3.172 2.568 ASP 117.A N PHE 113.A O ASP 117.A H 2.680 1.846 LYS 118.A N VAL 114.A O LYS 118.A H 3.130 2.313 LYS 118.A NZ ALA 115.A O LYS 118.A HZ3 2.732 1.985 LYS 118.A NZ SER 151.A OG LYS 118.A HZ2 3.059 2.231 ASN 119.A N SER 116.A O ASN 119.A H 2.964 2.145 ASN 119.A ND2 SER 116.A O ASN 119.A HD22 3.291 2.772 ASN 120.A N ASP 117.A O ASN 120.A H 2.747 1.907 ARG 121.A N LYS 118.A O ARG 121.A H 3.200 2.362 ARG 121.A NE ASP 117.A OD2 ARG 121.A HE 2.817 1.967 ARG 121.A NH2 ASP 117.A OD1 ARG 121.A HH22 2.882 2.125 ARG 121.A NH2 ASP 117.A OD2 ARG 121.A HH22 3.367 2.704 LYS 125.A N GLY 32.A O LYS 125.A H 2.912 2.057 GLY 126.A N CYS 123.A O GLY 126.A H 2.982 2.195 VAL 128.A N CYS 34.A O VAL 128.A H 2.907 2.115 ALA 129.A N MET 154.A O ALA 129.A H 2.845 2.012 SER 130.A N TYR 36.A O SER 130.A H 2.818 1.982 LEU 131.A N ALA 156.A O LEU 131.A H 2.886 2.067 GLY 135.A N SER 170.A O GLY 135.A H 2.974 2.177 SER 138.A N SER 170.A OG SER 138.A H 2.833 1.999 ASN 142.A N SER 138.A O ASN 142.A H 3.029 2.185 ASN 142.A ND2 SER 173.A OG ASN 142.A HD22 2.900 2.043 SER 143.A N SER 139.A O SER 143.A H 2.848 2.034 SER 143.A OG.B SER 139.A O SER 143.A HG.B 3.009 2.265 ALA 144.A N SER 140.A O ALA 144.A H 3.020 2.218 ALA 145.A N VAL 141.A O ALA 145.A H 3.066 2.246 ALA 146.A N ASN 142.A O ALA 146.A H 2.860 2.045 ARG 147.A N SER 143.A O ARG 147.A H 2.836 2.025 ARG 147.A NE ASP 112.A OD1 ARG 147.A HE 2.981 2.136 ARG 147.A NH2 ASP 112.A OD1 ARG 147.A HH22 3.448 2.758 ARG 147.A NH2 ASP 112.A OD2 ARG 147.A HH22 2.852 2.022 LEU 148.A N ALA 144.A O LEU 148.A H 2.998 2.168 GLN 149.A N ALA 145.A O GLN 149.A H 3.023 2.178 GLN 149.A NE2 ALA 245.A O GLN 149.A HE21 3.109 2.356 SER 150.A N ALA 146.A O SER 150.A H 2.880 2.030 SER 151.A N ARG 147.A O SER 151.A H 2.904 2.162 SER 151.A N LEU 148.A O SER 151.A H 3.252 2.629 GLY 152.A N GLN 149.A O GLY 152.A H 2.997 2.147 MET 154.A N VAL 127.A O MET 154.A H 2.961 2.130 VAL 155.A N GLN 149.A OE1 VAL 155.A H 3.000 2.146 ALA 156.A N ALA 129.A O ALA 156.A H 2.935 2.080 VAL 157.A N CYS 178.A O VAL 157.A H 2.832 1.999 ALA 158.A N LEU 131.A O ALA 158.A H 3.071 2.282 ALA 159.A N VAL 180.A O ALA 159.A H 2.890 2.119 GLY 160.A N THR 223.A OG1 GLY 160.A H 3.032 2.258 ASN 162.A N ASN 194.A OD1 ASN 162.A H 2.890 2.179 ASN 163.A N PHE 192.A O ASN 163.A H 2.998 2.197 ALA 164.A N ASN 194.A OD1 ALA 164.A H 2.949 2.141 ALA 166.A N TYR 195.A O ALA 166.A H 2.797 1.960 ARG 167.A N ASP 165.A OD1 ARG 167.A H 2.916 2.074 ASN 168.A N ASP 165.A O ASN 168.A H 3.421 2.565 TYR 169.A N ALA 166.A O TYR 169.A H 3.097 2.296 SER 170.A N GLY 135.A O SER 170.A H 2.850 2.048 SER 170.A OG ASN 142.A OD1 SER 170.A HG 2.727 1.993 SER 173.A N TYR 169.A O SER 173.A H 2.879 2.168 SER 173.A OG TYR 169.A O SER 173.A HG 2.741 2.071 GLU 174.A N PRO 171.A O GLU 174.A H 2.975 2.118 SER 176.A N GLU 174.A OE2 SER 176.A H 3.049 2.212 SER 176.A OG GLU 174.A OE2 SER 176.A HG 2.748 1.946 CYS 178.A N VAL 155.A O CYS 178.A H 2.879 2.031 THR 179.A N ASP 200.A OD2 THR 179.A H 2.877 2.034 THR 179.A OG1 ALA 172.A O THR 179.A HG1 2.679 2.183 VAL 180.A N VAL 157.A O VAL 180.A H 2.869 2.087 GLY 181.A N ILE 201.A O GLY 181.A H 2.906 2.096 SER 183.A N GLY 203.A O SER 183.A H 2.924 2.152 ASP 184.A N ARG 188.A O ASP 184.A H 2.888 2.107 TYR 186.A N ASP 184.A OD1 TYR 186.A H 2.919 2.168 ASP 187.A N ASP 184.A O ASP 187.A H 2.956 2.150 ARG 188.A N ASP 184.A OD1 ARG 188.A H 3.003 2.157 ARG 188.A NE ASP 184.A OD2 ARG 188.A HE 2.826 1.987 ARG 188.A NH2 ASP 184.A OD2 ARG 188.A HH21 3.163 2.446 ARG 189.A N SER 262.A O ARG 189.A H 2.939 2.084 ARG 189.A NE ASN 263.A O ARG 189.A HE 2.843 2.022 ARG 189.A NH1 ASN 163.A OD1 ARG 189.A HH11 2.848 2.023 ARG 189.A NH1 SER 193.A O ARG 189.A HH12 2.739 2.202 ARG 189.A NH2 ASN 163.A OD1 ARG 189.A HH21 3.221 2.519 SER 190.A N ALA 182.A O SER 190.A H 2.841 1.987 SER 193.A N SER 190.A O SER 193.A H 2.981 2.139 ASN 194.A N GLY 160.A O ASN 194.A H 2.900 2.065 ASN 194.A ND2 ALA 159.A O ASN 194.A HD22 2.856 2.090 ASN 194.A ND2 ASN 162.A OD1 ASN 194.A HD21 2.972 2.167 TYR 195.A N ALA 164.A O TYR 195.A H 2.977 2.191 GLY 196.A N THR 268.A OG1 GLY 196.A H 2.801 2.004 LEU 199.A N GLY 196.A O LEU 199.A H 3.141 2.335 ASP 200.A N THR 179.A O ASP 200.A H 2.888 2.034 PHE 202.A N LEU 271.A O PHE 202.A H 2.894 2.098 GLY 203.A N GLY 181.A O GLY 203.A H 2.901 2.075 GLY 205.A N SER 183.A O GLY 205.A H 2.826 1.971 THR 206.A N SER 183.A O THR 206.A H 3.237 2.499 ASP 207.A N SER 221.A OG ASP 207.A H 2.822 1.997 ILE 208.A N ILE 220.A O ILE 208.A H 2.918 2.061 SER 210.A N ARG 218.A O SER 210.A H 3.058 2.240 SER 210.A OG HIS 72.A O SER 210.A HG 2.804 2.018 TRP 212.A N SER 216.A O TRP 212.A H 2.891 2.108 GLY 214.A N GLU 43.A OE2 GLY 214.A H 2.807 2.024 GLY 215.A N GLU 43.A OE1 GLY 215.A H 2.820 2.062 SER 216.A N TRP 212.A O SER 216.A H 3.237 2.461 SER 216.A OG.A ILE 213.A O SER 216.A HG.A 2.772 2.001 SER 216.A OG.B THR 217.A O SER 216.A HG.B 3.512 2.748 ARG 218.A N SER 210.A O ARG 218.A H 2.998 2.229 ILE 220.A N ILE 208.A O ILE 220.A H 3.193 2.414 GLY 222.A N GLY 205.A O GLY 222.A H 2.827 2.027 THR 223.A N ASN 161.A OD1 THR 223.A H 2.825 1.968 THR 223.A OG1 ASN 161.A OD1 THR 223.A HG1 2.893 2.078 MET 225.A N GLY 222.A O MET 225.A H 2.971 2.169 THR 227.A N THR 223.A O THR 227.A H 3.082 2.264 THR 227.A OG1 THR 223.A O THR 227.A HG1 2.861 2.033 HIS 229.A N ALA 226.A O HIS 229.A H 3.044 2.442 HIS 229.A ND1 MET 225.A O HIS 229.A HD1 2.872 2.111 VAL 230.A N ALA 226.A O VAL 230.A H 3.358 2.569 ALA 231.A N THR 227.A O ALA 231.A H 2.916 2.089 GLY 232.A N PRO 228.A O GLY 232.A H 2.888 2.033 LEU 233.A N HIS 229.A O LEU 233.A H 2.917 2.115 ALA 234.A N VAL 230.A O ALA 234.A H 2.868 2.029 ALA 235.A N ALA 231.A O ALA 235.A H 3.064 2.240 TYR 236.A N GLY 232.A O TYR 236.A H 2.941 2.095 LEU 237.A N LEU 233.A O LEU 237.A H 2.875 2.063 MET 238.A N ALA 234.A O MET 238.A H 2.863 2.047 THR 239.A N ALA 235.A O THR 239.A H 2.957 2.114 THR 239.A OG1 ALA 235.A O THR 239.A HG1 3.341 2.644 LEU 240.A N TYR 236.A O LEU 240.A H 3.169 2.386 GLY 241.A N MET 238.A O GLY 241.A H 2.907 2.090 LYS 242.A N LEU 237.A O LYS 242.A H 3.028 2.228 THR 244.A N SER 247.A OG THR 244.A H 3.236 2.456 SER 247.A N THR 244.A O SER 247.A H 3.116 2.363 TYR 251.A N SER 247.A O TYR 251.A H 2.881 2.067 ILE 252.A N ALA 248.A O ILE 252.A H 2.798 1.950 ALA 253.A N CYS 249.A O ALA 253.A H 2.924 2.083 ASP 254.A N ARG 250.A O ASP 254.A H 2.796 1.993 THR 255.A N TYR 251.A O THR 255.A H 2.950 2.237 THR 255.A OG1 TYR 251.A O THR 255.A HG1 2.842 2.033 THR 255.A OG1 ILE 252.A O THR 255.A HG1 3.527 3.057 ALA 256.A N ALA 253.A O ALA 256.A H 3.385 2.536 ASN 257.A N LEU 272.A O ASN 257.A H 2.953 2.227 ASN 257.A ND2 SER 15.A O ASN 257.A HD21 2.892 2.188 GLY 259.A N ASN 270.A O GLY 259.A H 2.954 2.120 LEU 261.A N ASN 270.A OD1 LEU 261.A H 2.968 2.123 SER 262.A N ASP 187.A O SER 262.A H 2.865 2.075 THR 268.A N PRO 265.A O THR 268.A H 2.962 2.123 ASN 270.A ND2 LEU 261.A O ASN 270.A HD21 2.898 2.122 LEU 272.A N ASN 257.A O LEU 272.A H 2.909 2.102 ALA 273.A N PHE 202.A O ALA 273.A H 2.928 2.086 ASN 275.A N ILE 13.A O ASN 275.A H 2.770 1.982 ASN 275.A ND2 TYR 24.A O ASN 275.A HD21 2.978 2.147 ASN 276.A ND2 THR 255.A O ASN 276.A HD22 2.607 1.787 ASN 276.A ND2 TYR 274.A O ASN 276.A HD21 3.314 2.605 TYR 277.A N ASN 275.A OD1 TYR 277.A H 2.961 2.145