Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6skw_AAA.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 2.A N ALA 244.A O GLY 2.A H 2.878 1.929 ILE 4.A N TYR 242.A O ILE 4.A H 2.793 1.789 SER 6.A N ARG 240.A O SER 6.A H 2.926 1.919 VAL 15.A N CYS 82.A O VAL 15.A H 2.737 1.964 ARG 17.A N VAL 80.A O ARG 17.A H 2.804 1.849 ARG 17.A NE GLU 58.A OE1 ARG 17.A HE 3.450 2.756 ARG 17.A NH2 GLU 58.A OE1 ARG 17.A HH21 3.362 2.654 HIS 18.A NE2 ASN 77.A OD1 HIS 18.A HE2 2.772 1.976 TYR 19.A N THR 78.A O TYR 19.A H 2.934 1.930 ASN 21.A N TYR 76.A O ASN 21.A H 3.262 2.298 ASN 21.A ND2 PHE 74.A O ASN 21.A HD21 2.933 2.076 GLU 22.A N SER 20.A OG GLU 22.A H 2.969 1.982 GLN 23.A N GLN 23.A OE1 GLN 23.A H 2.730 1.794 GLN 23.A NE2 SER 20.A O GLN 23.A HE21 2.959 2.199 GLU 24.A N ASN 21.A O GLU 24.A H 3.187 2.247 GLN 29.A N ASN 26.A OD1 GLN 29.A H 3.030 2.035 GLN 29.A NE2 ASN 72.A O GLN 29.A HE21 3.025 2.529 ALA 30.A N LEU 27.A O ALA 30.A H 2.998 2.117 GLN 31.A N GLN 29.A O GLN 31.A H 2.824 1.876 ARG 32.A NE ILE 34.A O ARG 32.A HE 3.210 2.622 ARG 32.A NH1 PRO 104.A O ARG 32.A HH11 2.828 2.045 ARG 32.A NH2 PHE 36.A O ARG 32.A HH22 3.413 2.817 THR 33.A N ASP 107.A OD1 THR 33.A H 2.880 1.885 GLN 39.A N PHE 102.A O GLN 39.A H 2.886 1.915 GLN 39.A NE2 PRO 37.A O GLN 39.A HE22 2.765 1.957 GLN 39.A NE2 ASN 135.A OD1 GLN 39.A HE21 2.927 2.081 ILE 40.A N GLU 134.A O ILE 40.A H 2.732 1.781 VAL 41.A N SER 100.A O VAL 41.A H 2.860 1.854 ARG 42.A NE GLU 134.A OE2 ARG 42.A HE 3.016 2.151 ARG 42.A NH1 ASP 233.A OD1 ARG 42.A HH12 2.722 1.846 ARG 42.A NH1 ASP 233.A OD2 ARG 42.A HH12 3.563 2.976 ARG 42.A NH2 GLU 134.A OE1 ARG 42.A HH21 2.933 2.063 ARG 42.A NH2 ASP 233.A OD1 ARG 42.A HH22 3.403 2.746 ARG 42.A NH2 ASP 233.A OD2 ARG 42.A HH22 2.618 1.745 VAL 43.A N ILE 98.A O VAL 43.A H 2.961 1.962 GLY 45.A N PHE 96.A O GLY 45.A H 3.145 2.214 LEU 47.A N THR 94.A O LEU 47.A H 2.719 1.745 THR 48.A N ASN 46.A OD1 THR 48.A H 2.949 1.998 LEU 50.A N LEU 47.A O LEU 50.A H 3.201 2.215 SER 53.A N ASP 56.A OD2 SER 53.A H 3.069 2.092 ASP 56.A N SER 53.A OG ASP 56.A H 2.965 1.967 VAL 57.A N SER 53.A O VAL 57.A H 3.239 2.290 GLU 58.A N CYS 54.A O GLU 58.A H 2.903 1.915 ASN 59.A N ASP 55.A O ASN 59.A H 2.869 1.934 GLU 60.A N ASP 56.A O GLU 60.A H 3.007 2.008 ILE 61.A N VAL 57.A O ILE 61.A H 3.049 2.077 ASP 62.A N GLU 58.A O ASP 62.A H 2.956 2.041 GLN 63.A N ASN 59.A O GLN 63.A H 2.968 1.987 VAL 64.A N GLU 60.A O VAL 64.A H 3.088 2.185 PHE 65.A N ILE 61.A O PHE 65.A H 2.914 2.146 SER 66.A N ILE 61.A O SER 66.A H 3.261 2.291 SER 66.A OG ASP 62.A OD1 SER 66.A HG 2.860 2.231 LYS 67.A N ASP 62.A O LYS 67.A H 3.153 2.180 LYS 68.A N PHE 65.A O LYS 68.A H 3.040 2.203 LYS 68.A NZ TYR 120.A OH LYS 68.A HZ2 2.851 2.124 ILE 69.A N SER 66.A O ILE 69.A H 3.340 2.426 ASN 72.A N SER 70.A OG ASN 72.A H 3.001 2.045 LEU 73.A N SER 70.A O LEU 73.A H 3.159 2.226 PHE 74.A N SER 70.A O PHE 74.A H 3.031 2.262 THR 75.A N ASP 103.A O THR 75.A H 3.165 2.294 TYR 76.A N ASN 21.A OD1 TYR 76.A H 2.992 2.003 ASN 77.A N TYR 101.A O ASN 77.A H 2.965 2.009 ASN 77.A ND2 TYR 101.A OH ASN 77.A HD22 3.104 2.242 THR 78.A N TYR 19.A O THR 78.A H 2.783 1.877 TYR 79.A N GLN 99.A O TYR 79.A H 2.699 1.690 VAL 80.A N ARG 17.A O VAL 80.A H 2.841 1.838 SER 81.A N SER 97.A O SER 81.A H 2.944 1.954 CYS 82.A N VAL 15.A O CYS 82.A H 2.858 1.876 GLY 83.A N ASN 95.A O GLY 83.A H 2.975 2.112 GLY 83.A N ASN 95.A OD1 GLY 83.A H 3.102 2.382 TYR 84.A N ASN 13.A O TYR 84.A H 2.992 1.992 ASP 85.A N HIS 92.A O ASP 85.A H 3.246 2.252 ASN 87.A N ASP 85.A OD1 ASN 87.A H 3.344 2.498 ASP 88.A N ASP 85.A O ASP 88.A H 3.332 2.441 GLU 90.A N ASP 88.A OD1 GLU 90.A H 3.348 2.343 GLN 91.A N ASP 88.A O GLN 91.A H 2.859 1.963 GLN 91.A NE2 VAL 86.A O GLN 91.A HE22 2.857 1.981 HIS 92.A N ASP 88.A OD2 HIS 92.A H 3.150 2.191 ALA 93.A N LEU 52.A O ALA 93.A H 2.701 1.819 THR 94.A N GLY 83.A O THR 94.A H 2.916 1.920 PHE 96.A N GLY 45.A O PHE 96.A H 3.029 2.089 SER 97.A N SER 81.A O SER 97.A H 2.856 1.895 ILE 98.A N VAL 43.A O ILE 98.A H 2.910 1.913 GLN 99.A N TYR 79.A O GLN 99.A H 2.867 1.862 GLN 99.A NE2 ASP 238.A OD2 GLN 99.A HE21 3.165 2.281 SER 100.A N VAL 41.A O SER 100.A H 2.885 1.922 TYR 101.A N ASN 77.A O TYR 101.A H 3.126 2.187 PHE 102.A N GLN 39.A O PHE 102.A H 2.969 2.068 ASP 103.A N THR 75.A O ASP 103.A H 2.862 1.937 LEU 105.A N LEU 73.A O LEU 105.A H 2.904 1.975 ASP 107.A N GLN 31.A O ASP 107.A H 2.971 2.008 ALA 109.A N THR 106.A OG1 ALA 109.A H 2.974 2.021 VAL 110.A N THR 106.A O VAL 110.A H 2.962 2.098 ASP 111.A N ASP 107.A O ASP 111.A H 2.997 2.046 TYR 112.A N ASN 108.A O TYR 112.A H 3.040 2.035 LEU 113.A N ALA 109.A O LEU 113.A H 2.834 1.919 LYS 114.A N VAL 110.A O LYS 114.A H 2.953 2.002 SER 115.A N ASP 111.A O SER 115.A H 3.401 2.478 TYR 116.A N TYR 112.A O TYR 116.A H 2.959 1.993 LEU 117.A N LEU 113.A O LEU 117.A H 2.799 1.817 LYS 118.A N LYS 114.A O LYS 118.A H 3.164 2.213 GLU 119.A N SER 115.A O GLU 119.A H 3.449 2.566 TYR 120.A N TYR 116.A O TYR 120.A H 2.931 2.126 ASN 121.A N LEU 117.A O ASN 121.A H 2.841 1.914 ASN 121.A ND2 ILE 133.A O ASN 121.A HD21 3.259 2.504 GLY 122.A N LEU 131.A O GLY 122.A H 2.911 1.963 TYR 123.A N TYR 120.A O TYR 123.A H 2.951 2.035 ASN 124.A ND2 ASN 127.A OD1 ASN 124.A HD21 2.639 1.940 LEU 125.A N THR 129.A O LEU 125.A H 2.735 1.803 THR 128.A N LEU 125.A O THR 128.A H 2.962 2.009 THR 129.A N LEU 125.A O THR 129.A H 3.234 2.241 LEU 131.A N TYR 123.A O LEU 131.A H 2.778 1.788 GLN 132.A NE2 THR 130.A OG1 GLN 132.A HE22 2.894 2.077 ILE 133.A N ASN 121.A OD1 ILE 133.A H 2.919 1.922 GLU 134.A N ILE 40.A O GLU 134.A H 2.787 1.778 ALA 136.A N THR 38.A O ALA 136.A H 2.886 1.920 LYS 137.A N VAL 228.A O LYS 137.A H 2.778 2.005 GLY 138.A N VAL 228.A O GLY 138.A H 3.324 2.350 ILE 139.A N PHE 169.A O ILE 139.A H 2.935 1.964 ILE 140.A N ILE 226.A O ILE 140.A H 2.826 1.829 VAL 141.A N PHE 167.A O VAL 141.A H 2.871 1.918 SER 142.A N GLU 224.A O SER 142.A H 3.021 2.078 ASN 143.A N GLN 222.A O ASN 143.A H 3.020 2.026 ASN 143.A ND2 ASN 145.A OD1 ASN 143.A HD21 2.971 2.128 ASN 143.A ND2 GLN 222.A OE1 ASN 143.A HD22 2.850 1.972 LEU 144.A N ASP 163.A O LEU 144.A H 2.831 1.831 ASN 145.A N GLU 220.A O ASN 145.A H 2.836 1.841 ASN 145.A ND2 GLU 220.A OE1 ASN 145.A HD22 3.096 2.263 ALA 146.A N ARG 161.A O ALA 146.A H 2.994 2.059 GLY 147.A N TYR 218.A O GLY 147.A H 2.940 2.002 LEU 148.A N THR 158.A O LEU 148.A H 2.906 1.947 LYS 149.A N ASN 217.A OD1 LYS 149.A H 2.863 1.864 LYS 149.A NZ LYS 154.A O LYS 149.A HZ3 2.824 1.977 ASP 153.A N ASN 151.A OD1 ASP 153.A H 2.792 1.889 LYS 154.A N ASN 151.A O LYS 154.A H 3.121 2.151 THR 158.A N LEU 148.A O THR 158.A H 2.858 1.910 TYR 160.A N ALA 146.A O TYR 160.A H 2.830 1.879 ARG 161.A N ALA 146.A O ARG 161.A H 3.290 2.324 ARG 161.A NE ASP 163.A OD2 ARG 161.A HE 2.843 2.127 ARG 161.A NH2 ASP 163.A OD1 ARG 161.A HH21 2.882 2.272 GLN 162.A NE2 ASN 143.A OD1 GLN 162.A HE22 3.574 2.979 GLN 162.A NE2 ASN 145.A OD1 GLN 162.A HE22 3.113 2.539 ASP 163.A N LEU 144.A O ASP 163.A H 3.118 2.143 ARG 164.A NH1 SER 142.A OG ARG 164.A HH11 2.877 2.043 ASN 165.A ND2 TRP 201.A O ASN 165.A HD22 2.895 2.057 ASN 166.A N ASN 165.A OD1 ASN 166.A H 2.914 2.003 PHE 167.A N VAL 141.A O PHE 167.A H 2.929 1.963 PHE 169.A N ILE 139.A O PHE 169.A H 2.909 1.901 ASN 172.A ND2 GLU 22.A OE1 ASN 172.A HD21 3.358 2.710 ASN 172.A ND2 GLU 22.A OE2 ASN 172.A HD21 3.360 2.480 PHE 173.A N ASP 103.A OD2 PHE 173.A H 3.105 2.197 ASP 174.A N SER 171.A OG ASP 174.A H 3.195 2.279 VAL 175.A N SER 171.A O VAL 175.A H 3.401 2.455 ARG 176.A N ASN 172.A O ARG 176.A H 2.951 1.963 ARG 176.A NH1 GLU 22.A O ARG 176.A HH12 2.948 2.163 ARG 176.A NH2 GLU 24.A O ARG 176.A HH22 2.659 1.814 LYS 177.A N PHE 173.A O LYS 177.A H 2.911 1.985 GLU 178.A N ASP 174.A O GLU 178.A H 3.017 2.091 LEU 179.A N VAL 175.A O LEU 179.A H 2.838 2.016 ILE 180.A N VAL 175.A O ILE 180.A H 2.997 2.015 SER 181.A N ARG 176.A O SER 181.A H 3.093 2.242 SER 181.A OG LYS 177.A O SER 181.A HG 2.641 2.161 ILE 183.A N LEU 179.A O ILE 183.A H 2.966 2.029 TYR 184.A N ILE 180.A O TYR 184.A H 3.250 2.262 GLN 185.A N SER 181.A O GLN 185.A H 3.023 2.115 ARG 186.A N ASP 182.A O ARG 186.A H 2.752 1.837 ARG 186.A NE ASP 182.A OD1 ARG 186.A HE 2.781 2.010 ARG 186.A NH2 ASP 182.A OD1 ARG 186.A HH21 3.391 2.777 ARG 186.A NH2 ASP 182.A OD2 ARG 186.A HH21 2.770 1.901 PHE 187.A N ILE 183.A O PHE 187.A H 2.990 2.189 TYR 188.A N ILE 183.A O TYR 188.A H 3.492 2.612 ASP 191.A N SER 189.A OG ASP 191.A H 3.168 2.231 ASP 193.A N ASP 191.A OD1 ASP 193.A H 3.001 2.077 ILE 194.A N ASP 191.A O ILE 194.A H 3.102 2.115 LEU 195.A N PRO 192.A O LEU 195.A H 3.042 2.110 PHE 198.A N ILE 194.A O PHE 198.A H 3.023 2.059 ASP 199.A N LEU 195.A O ASP 199.A H 2.980 2.048 LYS 200.A N PRO 196.A O LYS 200.A H 3.021 2.153 LYS 200.A NZ GLU 178.A OE2 LYS 200.A HZ2 3.320 2.558 TRP 201.A N PHE 197.A O TRP 201.A H 2.932 2.029 TRP 201.A NE1 ASP 182.A OD2 TRP 201.A HE1 2.762 1.897 ILE 202.A N PHE 198.A O ILE 202.A H 2.857 1.934 PHE 203.A N PHE 198.A O PHE 203.A H 3.362 2.478 ALA 206.A N PHE 203.A O ALA 206.A H 2.907 1.940 GLY 207.A N ASP 199.A OD1 GLY 207.A H 2.795 1.865 SER 208.A N TYR 205.A O SER 208.A H 3.053 2.254 VAL 209.A N TYR 205.A O VAL 209.A H 3.374 2.388 TYR 210.A N ALA 206.A O TYR 210.A H 2.895 2.064 LEU 214.A N TYR 210.A O LEU 214.A H 2.696 1.708 ALA 215.A N SER 212.A O ALA 215.A H 3.206 2.420 ALA 215.A N ILE 213.A O ALA 215.A H 3.140 2.380 SER 216.A N LEU 214.A O SER 216.A H 3.367 2.521 ASN 217.A N GLY 147.A O ASN 217.A H 2.903 1.947 ASN 217.A ND2 LYS 149.A O ASN 217.A HD21 2.930 2.066 LEU 219.A N ASN 245.A O LEU 219.A H 3.120 2.126 GLU 220.A N ASN 145.A O GLU 220.A H 2.925 1.954 LEU 221.A N PHE 243.A O LEU 221.A H 2.926 1.974 GLN 222.A N ASN 143.A O GLN 222.A H 2.942 1.952 GLN 222.A NE2 GLU 220.A OE1 GLN 222.A HE21 2.984 2.252 GLU 224.A N SER 142.A O GLU 224.A H 3.296 2.440 GLU 224.A N GLN 222.A O GLU 224.A H 3.185 2.477 ARG 225.A NH1 TYR 101.A OH ARG 225.A HH11 2.874 2.041 ARG 225.A NH1 LEU 239.A O ARG 225.A HH12 3.118 2.430 ARG 225.A NH2 PRO 223.A O ARG 225.A HH21 3.259 2.481 ILE 226.A N ILE 140.A O ILE 226.A H 2.784 1.826 PHE 227.A N PHE 235.A O PHE 227.A H 2.772 1.871 VAL 228.A N GLY 138.A O VAL 228.A H 2.889 1.901 ASP 233.A N ASN 230.A O ASP 233.A H 3.158 2.240 PHE 235.A N PHE 227.A O PHE 235.A H 2.989 1.991 ASP 238.A N GLN 99.A OE1 ASP 238.A H 2.793 1.917 LEU 239.A N SER 237.A OG LEU 239.A H 2.723 1.841 ARG 240.A NH1 GLU 224.A OE1 ARG 240.A HH11 3.496 2.652 ARG 240.A NH1 GLU 224.A OE2 ARG 240.A HH11 2.595 1.914 TYR 242.A N ILE 4.A O TYR 242.A H 2.842 1.885 PHE 243.A N LEU 221.A O PHE 243.A H 2.789 1.781 ALA 244.A N GLY 2.A O ALA 244.A H 2.976 1.978 ASN 245.A N LEU 219.A O ASN 245.A H 2.906 2.029 LEU 246.A N ASP 1.A OD2 LEU 246.A H 2.709 1.707 CYS 247.A SG ASN 245.A O no hydrogen 3.934 N/A CYS 247.A SG ASN 245.A OD1 no hydrogen 3.893 N/A LYS 248.A N LEU 246.A O LYS 248.A H 3.066 2.146 ARG 249.A N LEU 246.A O ARG 249.A H 3.216 2.359 ARG 249.A NH1 ASP 1.A OD2 ARG 249.A HH11 2.817 2.066 ASN 250.A N CYS 247.A O ASN 250.A H 3.161 2.166 ASN 250.A ND2 HIS 254.A O ASN 250.A HD22 2.699 1.825 ASN 252.A ND2 LEU 256.A O ASN 252.A HD21 3.217 2.380 ASN 252.A ND2 LEU 256.A OXT ASN 252.A HD21 3.406 2.624 LYS 253.A N ASN 250.A O LYS 253.A H 3.171 2.282 HIS 254.A N ASN 252.A OD1 HIS 254.A H 3.022 2.092 HIS 254.A ND1 ASN 252.A O HIS 254.A HD1 2.810 2.059 CYS 255.A N SER 216.A O CYS 255.A H 3.073 2.167 LEU 256.A N LEU 214.A O LEU 256.A H 3.228 2.434