Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6ss2_AAA.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 5.A N HIS 43.A O VAL 5.A H 2.896 2.029 ALA 6.A N SER 91.A O ALA 6.A H 2.902 2.027 VAL 7.A N LYS 45.A O VAL 7.A H 2.987 2.161 ILE 8.A N VAL 93.A O ILE 8.A H 2.880 2.041 GLY 9.A N GLY 48.A O GLY 9.A H 2.927 2.029 ALA 10.A N LEU 95.A O ALA 10.A H 3.003 2.092 PHE 12.A N ALA 10.A O PHE 12.A H 2.840 2.160 GLN 14.A NE2 VAL 66.A O GLN 14.A HE22 3.476 2.659 GLN 14.A NE2 SER 134.A O GLN 14.A HE21 2.794 1.934 GLY 15.A N SER 13.A OG GLY 15.A H 2.999 2.096 GLN 16.A N LEU 64.A O GLN 16.A H 2.666 1.796 ARG 18.A N GLY 15.A O ARG 18.A H 3.281 2.493 ARG 18.A NH1 THR 243.A OG1 ARG 18.A HH12 3.099 2.430 ARG 18.A NH2 THR 243.A OG1 ARG 18.A HH22 2.579 1.722 LYS 19.A NZ GLU 22.A OE1 LYS 19.A HZ1 2.671 1.940 LYS 19.A NZ GLU 22.A OE2 LYS 19.A HZ3 2.991 2.307 VAL 21.A N ARG 18.A O VAL 21.A H 3.185 2.301 GLU 22.A N LYS 19.A O GLU 22.A H 3.165 2.264 HIS 23.A N GLY 20.A O HIS 23.A H 2.941 2.072 GLY 24.A N VAL 21.A O GLY 24.A H 3.008 2.110 ALA 27.A N HIS 23.A O ALA 27.A H 3.104 2.200 ILE 28.A N GLY 24.A O ILE 28.A H 2.902 2.047 ARG 29.A N PRO 25.A O ARG 29.A H 3.053 2.153 ARG 29.A NE ASP 49.A OD1 ARG 29.A HE 2.936 2.251 ARG 29.A NE ASP 49.A OD2 ARG 29.A HE 3.457 2.760 ARG 29.A NH1 ASP 46.A OD1 ARG 29.A HH12 3.185 2.422 ARG 29.A NH1 ASP 46.A OD2 ARG 29.A HH12 2.564 1.802 ARG 29.A NH2 ASP 46.A OD1 ARG 29.A HH22 3.205 2.441 ARG 29.A NH2 ASP 49.A OD1 ARG 29.A HH21 2.708 1.965 GLU 30.A N ALA 26.A O GLU 30.A H 2.908 2.074 ALA 31.A N ALA 27.A O ALA 31.A H 3.315 2.626 GLY 32.A N ARG 29.A O GLY 32.A H 2.794 1.941 ARG 36.A N GLY 32.A O ARG 36.A H 3.185 2.289 ARG 36.A NH1 ASP 295.A OD1 ARG 36.A HH12 2.617 1.803 ARG 36.A NH2 ASP 295.A OD1 ARG 36.A HH22 2.897 2.190 LEU 37.A N LEU 33.A O LEU 37.A H 3.018 2.124 SER 38.A N MET 34.A O SER 38.A H 2.933 2.189 SER 39.A N LYS 35.A O SER 39.A H 2.950 2.073 LEU 40.A N ARG 36.A O LEU 40.A H 3.219 2.389 GLY 41.A N SER 38.A O GLY 41.A H 2.944 2.152 HIS 43.A N HIS 3.A O HIS 43.A H 3.288 2.566 LYS 45.A N VAL 5.A O LYS 45.A H 3.159 2.341 PHE 47.A N VAL 7.A O PHE 47.A H 3.062 2.175 GLY 48.A N ASP 46.A OD1 GLY 48.A H 2.647 1.786 LEU 50.A N GLY 9.A O LEU 50.A H 2.904 2.001 VAL 55.A N SER 70.A OG VAL 55.A H 2.916 2.169 ASN 62.A N ASP 59.A OD2 ASN 62.A H 2.997 2.122 ASN 62.A ND2 ASP 59.A OD2 ASN 62.A HD22 2.711 2.005 ASN 63.A N LEU 60.A O ASN 63.A H 2.954 2.168 ASN 63.A ND2 ASP 58.A OD2 ASN 63.A HD21 3.097 2.233 ASN 63.A ND2 ASP 59.A O ASN 63.A HD22 2.851 1.971 LEU 64.A N LEU 60.A O LEU 64.A H 3.072 2.422 LEU 64.A N TYR 61.A O LEU 64.A H 3.057 2.266 ILE 65.A N TYR 61.A O ILE 65.A H 2.846 1.957 VAL 66.A N GLN 14.A O VAL 66.A H 3.250 2.357 ASN 67.A ND2 VAL 55.A O ASN 67.A HD21 2.788 1.916 GLY 72.A N PRO 68.A O GLY 72.A H 2.876 1.983 LEU 73.A N ARG 69.A O LEU 73.A H 2.781 1.907 ALA 74.A N SER 70.A O ALA 74.A H 2.977 2.108 ASN 75.A N VAL 71.A O ASN 75.A H 3.039 2.164 ASN 75.A ND2 VAL 71.A O ASN 75.A HD22 3.058 2.332 ASN 75.A ND2 SER 100.A O ASN 75.A HD21 3.246 2.668 GLN 76.A N GLY 72.A O GLN 76.A H 3.144 2.399 GLU 77.A N LEU 73.A O GLU 77.A H 3.146 2.296 LEU 78.A N ALA 74.A O LEU 78.A H 2.994 2.101 ALA 79.A N ASN 75.A O ALA 79.A H 2.953 2.091 VAL 81.A N GLU 77.A O VAL 81.A H 3.325 2.482 VAL 82.A N LEU 78.A O VAL 82.A H 2.970 2.112 SER 83.A N ALA 79.A O SER 83.A H 2.969 2.090 ARG 84.A N GLU 80.A O ARG 84.A H 2.902 2.038 ALA 85.A N VAL 81.A O ALA 85.A H 2.937 2.031 VAL 86.A N VAL 82.A O VAL 86.A H 2.910 2.078 SER 87.A N SER 83.A O SER 87.A H 2.906 2.042 ASP 88.A N ARG 84.A O ASP 88.A H 2.920 2.105 GLY 89.A N VAL 86.A O GLY 89.A H 2.875 2.036 TYR 90.A N ALA 85.A O TYR 90.A H 2.965 2.096 SER 91.A N SER 4.A O SER 91.A H 3.025 2.290 CYS 92.A N SER 268.A O CYS 92.A H 2.884 2.079 VAL 93.A N ALA 6.A O VAL 93.A H 2.696 1.785 THR 94.A N LEU 270.A O THR 94.A H 2.831 1.974 LEU 95.A N ILE 8.A O LEU 95.A H 2.816 1.932 GLY 96.A N LEU 272.A O GLY 96.A H 2.912 2.004 GLY 97.A N VAL 21.A O GLY 97.A H 3.033 2.048 ASP 98.A N PHE 12.A O ASP 98.A H 2.885 2.006 HIS 99.A N GLU 274.A OE2 HIS 99.A H 2.952 2.170 HIS 99.A NE2 SER 227.A OG HIS 99.A HE2 2.874 2.002 SER 100.A N ASP 98.A OD1 SER 100.A H 3.044 2.239 LEU 101.A N ASP 98.A O LEU 101.A H 3.399 2.493 ALA 102.A N HIS 99.A O ALA 102.A H 3.140 2.270 ILE 103.A N SER 100.A O ILE 103.A H 3.125 2.253 GLY 104.A N ASN 75.A OD1 GLY 104.A H 2.957 2.279 GLY 104.A N LEU 101.A O GLY 104.A H 2.805 2.123 THR 105.A N LEU 101.A O THR 105.A H 3.108 2.269 THR 105.A OG1 ASP 271.A OD1 THR 105.A HG1 2.901 2.143 THR 105.A OG1 ASP 271.A OD2 THR 105.A HG1 3.169 2.453 ILE 106.A N ALA 102.A O ILE 106.A H 3.054 2.157 GLY 108.A N GLY 104.A O GLY 108.A H 2.985 2.085 HIS 109.A N THR 105.A O HIS 109.A H 2.686 1.843 ALA 110.A N ILE 106.A O ALA 110.A H 2.778 1.928 CYS 116.A N PRO 223.A O CYS 116.A H 2.957 2.097 VAL 117.A N SER 170.A O VAL 117.A H 2.848 2.013 VAL 118.A N HIS 225.A O VAL 118.A H 2.955 2.087 TRP 119.A N VAL 172.A O TRP 119.A H 2.916 2.029 TRP 119.A NE1 ASP 121.A OD2 TRP 119.A HE1 2.914 2.179 VAL 120.A N SER 227.A O VAL 120.A H 2.992 2.155 ASP 121.A N ILE 174.A O ASP 121.A H 3.084 2.270 ALA 122.A N ASP 231.A OD1 ALA 122.A H 3.400 2.497 HIS 123.A N ASP 121.A OD1 HIS 123.A H 3.162 2.281 HIS 123.A ND1 ASP 121.A OD1 HIS 123.A HD1 3.037 2.255 ILE 126.A N GLU 183.A OE2 ILE 126.A H 3.035 2.135 ASN 127.A N GLY 139.A O ASN 127.A H 3.055 2.261 ASN 127.A ND2 ASP 180.A OD2 ASN 127.A HD21 2.955 2.159 THR 128.A N THR 131.A OG1 THR 128.A H 2.722 1.976 LEU 130.A N THR 128.A OG1 LEU 130.A H 3.131 2.332 THR 131.A N THR 128.A O THR 131.A H 2.992 2.162 ASN 136.A ND2 THR 132.A OG1 ASN 136.A HD22 2.945 2.266 LEU 137.A N GLN 14.A OE1 LEU 137.A H 2.876 1.989 GLY 139.A N ASN 136.A O GLY 139.A H 3.038 2.161 GLN 140.A N LEU 137.A O GLN 140.A H 2.946 2.069 GLN 140.A NE2 ASN 136.A O GLN 140.A HE22 3.114 2.358 VAL 142.A N ASP 125.A O VAL 142.A H 3.127 2.229 SER 143.A N GLN 140.A O SER 143.A H 2.908 2.157 SER 143.A OG ASN 127.A O SER 143.A HG 3.107 2.633 PHE 144.A N PRO 141.A O PHE 144.A H 3.080 2.308 LEU 145.A N VAL 142.A O LEU 145.A H 3.262 2.500 LEU 146.A N VAL 142.A O LEU 146.A H 2.954 2.143 GLU 148.A N GLU 148.A OE1 GLU 148.A H 2.786 2.025 GLN 150.A N ARG 147.A O GLN 150.A H 3.450 2.577 GLN 150.A NE2 ARG 147.A O GLN 150.A HE22 3.185 2.586 LYS 152.A N LEU 149.A O LYS 152.A H 2.921 2.077 VAL 153.A N GLN 150.A O VAL 153.A H 3.398 2.530 PHE 159.A N LEU 156.A O PHE 159.A H 3.331 2.505 CYS 165.A N LEU 145.A O CYS 165.A H 3.049 2.310 ILE 166.A N LEU 145.A O ILE 166.A H 3.230 2.351 SER 168.A N GLU 148.A OE2 SER 168.A H 3.242 2.356 SER 168.A OG TYR 190.A O SER 168.A HG 3.327 2.785 SER 170.A N SER 167.A O SER 170.A H 2.991 2.119 VAL 172.A N VAL 117.A O VAL 172.A H 3.021 2.166 TYR 173.A N GLN 193.A O TYR 173.A H 3.369 2.509 ILE 174.A N TRP 119.A O ILE 174.A H 2.840 1.964 GLY 175.A N PHE 195.A O GLY 175.A H 2.990 2.098 ARG 177.A N ALA 122.A O ARG 177.A H 2.874 1.985 ARG 177.A NE VAL 245.A O ARG 177.A HE 2.924 2.186 ARG 177.A NH1 ASP 231.A O ARG 177.A HH12 2.926 2.309 ARG 177.A NH1 ALA 232.A O ARG 177.A HH12 3.554 2.974 ARG 177.A NH1 PHE 233.A O ARG 177.A HH12 3.311 2.630 ARG 177.A NH1 VAL 245.A O ARG 177.A HH11 2.671 1.858 ARG 177.A NH2 GLY 175.A O ARG 177.A HH21 3.490 2.717 ARG 177.A NH2 ALA 232.A O ARG 177.A HH22 2.801 2.017 ASP 178.A N ALA 122.A O ASP 178.A H 3.075 2.296 ASP 180.A N GLU 183.A OE1 ASP 180.A H 3.054 2.234 HIS 184.A N ASP 180.A O HIS 184.A H 3.075 2.219 PHE 185.A N PRO 181.A O PHE 185.A H 2.956 2.081 ILE 186.A N PRO 182.A O ILE 186.A H 3.030 2.132 LEU 187.A N GLU 183.A O LEU 187.A H 3.107 2.215 LYS 188.A N HIS 184.A O LYS 188.A H 3.097 2.199 LYS 188.A NZ TYR 194.A OH LYS 188.A HZ3 3.488 2.773 ASN 189.A N PHE 185.A O ASN 189.A H 2.739 1.856 TYR 190.A N ILE 186.A O TYR 190.A H 2.917 2.035 ASP 191.A N LYS 188.A O ASP 191.A H 3.435 2.583 ILE 192.A N LEU 187.A O ILE 192.A H 2.906 2.087 GLN 193.A NE2 ASP 191.A O GLN 193.A HE22 3.200 2.329 PHE 195.A N TYR 173.A O PHE 195.A H 2.768 1.887 SER 196.A N ASP 199.A OD2 SER 196.A H 3.037 2.233 MET 197.A N LEU 176.A O MET 197.A H 3.049 2.239 ARG 198.A N SER 196.A OG ARG 198.A H 3.024 2.390 ASP 199.A N SER 196.A OG ASP 199.A H 3.164 2.281 ILE 200.A N SER 196.A O ILE 200.A H 3.112 2.252 ASP 201.A N MET 197.A O ASP 201.A H 2.824 1.960 ARG 202.A N ARG 198.A O ARG 202.A H 2.925 2.149 ARG 202.A N ASP 199.A O ARG 202.A H 3.067 2.422 ARG 202.A NH1 ASP 199.A OD1 ARG 202.A HH12 2.588 1.739 LEU 203.A N ASP 199.A O LEU 203.A H 2.733 1.864 GLY 204.A N ILE 200.A O GLY 204.A H 2.660 1.839 GLN 206.A NE2 GLU 210.A OE1 GLN 206.A HE22 3.165 2.506 VAL 208.A N GLY 204.A O VAL 208.A H 3.228 2.383 MET 209.A N ILE 205.A O MET 209.A H 3.001 2.152 GLU 210.A N GLN 206.A O GLU 210.A H 3.198 2.324 ARG 211.A N LYS 207.A O ARG 211.A H 2.956 2.152 THR 212.A N VAL 208.A O THR 212.A H 2.978 2.106 PHE 213.A N MET 209.A O PHE 213.A H 3.136 2.271 ASP 214.A N GLU 210.A O ASP 214.A H 3.250 2.414 LEU 215.A N ARG 211.A O LEU 215.A H 3.018 2.182 LEU 216.A N THR 212.A O LEU 216.A H 3.176 2.413 ILE 217.A N PHE 213.A O ILE 217.A H 2.675 1.820 ARG 220.A NE ASP 114.A OD2 ARG 220.A HE 2.961 2.096 ARG 220.A NH2 ASP 114.A OD1 ARG 220.A HH21 2.822 1.945 ARG 222.A NE ASP 114.A O ARG 222.A HE 2.868 2.056 ARG 222.A NE ASP 114.A OD1 ARG 222.A HE 3.316 2.695 ARG 222.A NH1 LEU 216.A O ARG 222.A HH11 3.107 2.241 ARG 222.A NH2 ASP 114.A O ARG 222.A HH21 3.347 2.681 ARG 222.A NH2 SER 170.A OG ARG 222.A HH22 2.819 1.945 ILE 224.A N LEU 266.A O ILE 224.A H 2.799 1.929 HIS 225.A N CYS 116.A O HIS 225.A H 2.877 2.000 HIS 225.A NE2 ASP 271.A OD2 HIS 225.A HE2 2.896 2.053 LEU 226.A N ALA 269.A O LEU 226.A H 3.014 2.152 SER 227.A N VAL 118.A O SER 227.A H 3.066 2.250 PHE 228.A N ASP 271.A O PHE 228.A H 3.012 2.128 ASP 229.A N VAL 120.A O ASP 229.A H 2.821 1.937 ILE 230.A N VAL 273.A O ILE 230.A H 2.955 2.048 ASP 231.A N ASP 229.A OD2 ASP 231.A H 3.135 2.244 ALA 232.A N ASP 229.A O ALA 232.A H 3.006 2.111 PHE 233.A N ILE 230.A O PHE 233.A H 3.171 2.377 ASP 234.A N LEU 249.A O ASP 234.A H 3.020 2.124 THR 236.A N ASP 234.A OD2 THR 236.A H 3.174 2.270 LEU 237.A N ASP 234.A O LEU 237.A H 2.879 2.024 ALA 238.A N ASP 234.A O ALA 238.A H 3.170 2.298 GLY 247.A N ASP 234.A OD1 GLY 247.A H 2.789 1.980 GLY 248.A N ASP 234.A OD1 GLY 248.A H 3.050 2.192 LEU 249.A N ALA 232.A O LEU 249.A H 3.038 2.146 THR 250.A N GLU 253.A OE1 THR 250.A H 3.286 2.428 GLU 253.A N THR 250.A OG1 GLU 253.A H 3.336 2.427 GLY 254.A N THR 250.A O GLY 254.A H 3.168 2.305 MET 255.A N TYR 251.A O MET 255.A H 2.943 2.083 TYR 256.A N ARG 252.A O TYR 256.A H 2.938 2.058 ILE 257.A N GLU 253.A O ILE 257.A H 2.994 2.107 ALA 258.A N GLY 254.A O ALA 258.A H 3.322 2.472 GLU 259.A N MET 255.A O GLU 259.A H 2.763 1.958 GLU 260.A N TYR 256.A O GLU 260.A H 2.923 2.038 ILE 261.A N ILE 257.A O ILE 261.A H 2.991 2.082 HIS 262.A N ALA 258.A O HIS 262.A H 3.025 2.132 ASN 263.A N GLU 259.A O ASN 263.A H 2.893 2.021 THR 264.A N ILE 261.A O THR 264.A H 3.276 2.441 GLY 265.A N HIS 262.A O GLY 265.A H 2.947 2.135 LEU 266.A N THR 264.A OG1 LEU 266.A H 3.283 2.393 SER 268.A N ILE 224.A O SER 268.A H 3.007 2.104 ALA 269.A N ILE 224.A O ALA 269.A H 3.369 2.550 LEU 270.A N CYS 92.A O LEU 270.A H 2.750 1.896 ASP 271.A N LEU 226.A O ASP 271.A H 2.769 1.913 LEU 272.A N THR 94.A O LEU 272.A H 3.006 2.157 VAL 273.A N PHE 228.A O VAL 273.A H 3.084 2.229 GLU 274.A N GLY 97.A O GLU 274.A H 2.920 2.048 ASN 276.A N ALA 240.A O ASN 276.A H 2.944 2.056 GLN 278.A N ASN 276.A OD1 GLN 278.A H 3.214 2.449 LEU 279.A N ASN 276.A O LEU 279.A H 3.353 2.492 ALA 280.A N PRO 277.A O ALA 280.A H 3.392 2.614 THR 281.A N GLU 285.A OE1 THR 281.A H 2.899 2.003 GLU 285.A N SER 282.A OG GLU 285.A H 3.195 2.329 ALA 286.A N SER 282.A O ALA 286.A H 3.302 2.435 LYS 287.A N GLU 283.A O LYS 287.A H 2.847 1.987 THR 288.A N GLU 284.A O THR 288.A H 2.994 2.115 THR 289.A N GLU 285.A O THR 289.A H 3.151 2.280 ALA 290.A N ALA 286.A O ALA 290.A H 3.112 2.261 ASN 291.A N LYS 287.A O ASN 291.A H 2.721 1.884 LEU 292.A N THR 288.A O LEU 292.A H 3.049 2.174 ALA 293.A N THR 289.A O ALA 293.A H 3.169 2.293 VAL 294.A N ALA 290.A O VAL 294.A H 3.296 2.416 ASP 295.A N ASN 291.A O ASP 295.A H 3.001 2.190 VAL 296.A N LEU 292.A O VAL 296.A H 3.053 2.210 ILE 297.A N ALA 293.A O ILE 297.A H 3.224 2.366 ALA 298.A N VAL 294.A O ALA 298.A H 2.939 2.033 SER 299.A N ASP 295.A O SER 299.A H 2.883 1.983 SER 299.A OG MET 255.A O SER 299.A HG 3.411 2.808 SER 300.A N VAL 296.A O SER 300.A H 2.866 2.095 PHE 301.A N ALA 298.A O PHE 301.A H 2.976 2.129 GLY 302.A N SER 299.A O GLY 302.A H 3.415 2.586 GLN 303.A N ALA 298.A O GLN 303.A H 3.240 2.331 THR 304.A OG1 GLY 307.A O THR 304.A HG1 2.686 1.840 ARG 305.A NE GLU 259.A OE2 ARG 305.A HE 2.813 1.968 ARG 305.A NH2 GLU 259.A OE1 ARG 305.A HH21 3.069 2.195 HIS 309.A NE2 LEU 40.A O HIS 309.A HE2 2.889 2.166 ASP 313.A N ASP 313.A OD2 ASP 313.A H 2.306 1.575