Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6ss4_AAA.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N VAL 86.A O MET 1.A H1 2.985 2.213 VAL 2.A N TYR 90.A O VAL 2.A H 3.356 2.489 VAL 5.A N HIS 43.A O VAL 5.A H 2.946 2.148 ALA 6.A N SER 91.A O ALA 6.A H 2.844 1.949 VAL 7.A N LYS 45.A O VAL 7.A H 2.966 2.140 ILE 8.A N VAL 93.A O ILE 8.A H 3.125 2.352 GLY 9.A N GLY 48.A O GLY 9.A H 2.768 1.858 ALA 10.A N LEU 95.A O ALA 10.A H 3.114 2.288 SER 13.A OG ARG 18.A O SER 13.A HG 2.910 2.124 GLN 14.A NE2 SER 135.A O GLN 14.A HE21 2.889 2.087 GLN 14.A NE2 GLY 136.A O GLN 14.A HE22 2.620 1.931 GLY 15.A N SER 13.A OG GLY 15.A H 3.362 2.534 GLN 16.A N LEU 64.A O GLN 16.A H 3.201 2.383 ARG 18.A NH1 THR 244.A OG1 ARG 18.A HH12 2.773 2.154 LYS 19.A NZ GLU 22.A OE2 LYS 19.A HZ1 3.473 2.858 LYS 19.A NZ ASN 63.A O LYS 19.A HZ3 2.671 1.953 HIS 23.A N GLY 20.A O HIS 23.A H 3.112 2.273 ALA 27.A N HIS 23.A O ALA 27.A H 3.343 2.487 ILE 28.A N GLY 24.A O ILE 28.A H 2.903 2.018 ARG 29.A N PRO 25.A O ARG 29.A H 2.637 1.742 ARG 29.A NH1 ASP 46.A OD1 ARG 29.A HH12 3.449 2.722 ARG 29.A NH1 ASP 46.A OD2 ARG 29.A HH12 2.712 2.018 ARG 29.A NH2 ASP 46.A OD1 ARG 29.A HH22 3.018 2.156 GLU 30.A N ALA 26.A O GLU 30.A H 2.554 1.666 ALA 31.A N ILE 28.A O ALA 31.A H 2.713 1.895 GLY 32.A N ARG 29.A O GLY 32.A H 3.165 2.357 LEU 33.A N ARG 29.A O LEU 33.A H 3.416 2.570 ARG 36.A N GLY 32.A O ARG 36.A H 3.378 2.467 ARG 36.A NH1 ASP 296.A OD1 ARG 36.A HH12 3.007 2.340 ARG 36.A NH2 ASP 296.A OD1 ARG 36.A HH22 2.542 1.698 LEU 37.A N LEU 33.A O LEU 37.A H 3.108 2.217 SER 38.A N MET 34.A O SER 38.A H 2.653 1.759 SER 39.A N LYS 35.A O SER 39.A H 2.596 1.768 LEU 40.A N LEU 37.A O LEU 40.A H 3.092 2.256 CYS 42.A N LEU 37.A O CYS 42.A H 3.362 2.530 LYS 45.A N VAL 5.A O LYS 45.A H 2.843 2.102 PHE 47.A N VAL 7.A O PHE 47.A H 2.873 2.078 GLY 48.A N ASP 46.A OD1 GLY 48.A H 2.701 1.912 LEU 50.A N GLY 9.A O LEU 50.A H 2.899 2.052 VAL 55.A N SER 70.A OG VAL 55.A H 2.780 1.877 ASN 62.A N ASP 59.A O ASN 62.A H 3.220 2.522 ASN 62.A N ASP 59.A OD2 ASN 62.A H 3.353 2.474 ASN 62.A ND2 ASP 59.A OD2 ASN 62.A HD22 2.544 1.743 ASN 63.A ND2 ASP 58.A OD2 ASN 63.A HD21 2.580 1.957 LEU 64.A N LEU 60.A O LEU 64.A H 3.102 2.288 ILE 65.A N TYR 61.A O ILE 65.A H 2.673 1.786 VAL 66.A N GLN 14.A O VAL 66.A H 3.087 2.212 ASN 67.A ND2 VAL 55.A O ASN 67.A HD21 2.436 1.859 SER 70.A N ASN 67.A O SER 70.A H 3.100 2.225 VAL 71.A N PRO 68.A O VAL 71.A H 2.964 2.220 GLY 72.A N PRO 68.A O GLY 72.A H 3.150 2.253 ALA 74.A N SER 70.A O ALA 74.A H 3.295 2.546 ASN 75.A N VAL 71.A O ASN 75.A H 2.881 2.011 ASN 75.A ND2 SER 100.A O ASN 75.A HD21 2.693 1.961 GLN 76.A N GLY 72.A O GLN 76.A H 3.309 2.470 LEU 78.A N ALA 74.A O LEU 78.A H 3.016 2.359 ALA 79.A N ASN 75.A O ALA 79.A H 2.781 1.911 GLU 80.A N GLN 76.A O GLU 80.A H 3.321 2.419 VAL 81.A N LEU 78.A O VAL 81.A H 2.834 2.157 VAL 82.A N LEU 78.A O VAL 82.A H 2.829 1.929 SER 83.A N ALA 79.A O SER 83.A H 2.764 1.896 ARG 84.A N GLU 80.A O ARG 84.A H 3.132 2.233 ARG 84.A NE ASP 88.A OD1 ARG 84.A HE 2.953 2.314 ALA 85.A N VAL 81.A O ALA 85.A H 3.201 2.416 VAL 86.A N VAL 82.A O VAL 86.A H 2.848 1.948 SER 87.A N SER 83.A O SER 87.A H 2.741 1.867 ASP 88.A N ARG 84.A O ASP 88.A H 2.979 2.247 GLY 89.A N VAL 86.A O GLY 89.A H 2.729 1.843 SER 91.A N SER 4.A O SER 91.A H 2.691 1.849 CYS 92.A N SER 269.A O CYS 92.A H 3.021 2.231 VAL 93.A N ALA 6.A O VAL 93.A H 2.892 1.989 THR 94.A N LEU 271.A O THR 94.A H 2.983 2.171 LEU 95.A N ILE 8.A O LEU 95.A H 3.038 2.312 GLY 96.A N LEU 273.A O GLY 96.A H 2.997 2.210 GLY 97.A N ALA 10.A O GLY 97.A H 3.377 2.507 ASP 98.A N PHE 12.A O ASP 98.A H 2.880 1.983 HIS 99.A N GLU 275.A OE2 HIS 99.A H 2.655 1.783 HIS 99.A NE2 SER 228.A OG HIS 99.A HE2 3.081 2.244 SER 100.A N ASP 98.A OD1 SER 100.A H 3.326 2.473 LEU 101.A N ASP 98.A O LEU 101.A H 3.374 2.511 ILE 103.A N SER 100.A O ILE 103.A H 3.083 2.202 GLY 104.A N LEU 101.A O GLY 104.A H 2.782 2.031 THR 105.A N LEU 101.A O THR 105.A H 3.019 2.145 THR 105.A OG1 ASP 272.A OD1 THR 105.A HG1 2.979 2.198 THR 105.A OG1 ASP 272.A OD2 THR 105.A HG1 2.888 2.270 ILE 106.A N ALA 102.A O ILE 106.A H 2.912 2.017 SER 107.A N ILE 103.A O SER 107.A H 3.257 2.397 GLY 108.A N GLY 104.A O GLY 108.A H 2.832 1.995 HIS 109.A N THR 105.A O HIS 109.A H 3.010 2.100 ALA 110.A N ILE 106.A O ALA 110.A H 2.908 2.002 ARG 111.A N SER 107.A O ARG 111.A H 3.394 2.588 ARG 111.A N GLY 108.A O ARG 111.A H 3.266 2.623 ARG 111.A NH2 GLU 80.A OE1 ARG 111.A HH22 3.254 2.552 HIS 112.A N HIS 109.A O HIS 112.A H 2.900 2.221 CYS 113.A N HIS 109.A O CYS 113.A H 2.869 2.081 CYS 117.A N PRO 224.A O CYS 117.A H 3.151 2.321 VAL 118.A N SER 171.A O VAL 118.A H 2.916 2.034 VAL 119.A N HIS 226.A O VAL 119.A H 3.315 2.535 TRP 120.A N VAL 173.A O TRP 120.A H 2.810 1.942 TRP 120.A NE1 ASP 122.A OD2 TRP 120.A HE1 3.008 2.212 ASP 122.A N ILE 175.A O ASP 122.A H 3.079 2.279 HIS 124.A N ASP 122.A OD1 HIS 124.A H 2.816 1.926 HIS 124.A ND1 ASP 122.A OD1 HIS 124.A HD1 3.041 2.322 ILE 127.A N GLU 184.A OE2 ILE 127.A H 3.152 2.273 ASN 128.A ND2 ASP 181.A OD2 ASN 128.A HD21 3.145 2.328 LEU 131.A N THR 129.A OG1 LEU 131.A H 3.302 2.550 THR 132.A N THR 129.A O THR 132.A H 2.654 1.759 ASN 137.A N SER 134.A O ASN 137.A H 2.985 2.269 GLN 141.A NE2 ASN 137.A O GLN 141.A HE22 2.361 1.689 VAL 143.A N ASP 126.A O VAL 143.A H 3.165 2.290 SER 144.A OG ASN 128.A O SER 144.A HG 2.529 1.974 PHE 145.A N PRO 142.A O PHE 145.A H 3.473 2.590 LEU 147.A N VAL 143.A O LEU 147.A H 3.253 2.346 LYS 153.A N LEU 150.A O LYS 153.A H 2.619 1.746 GLN 156.A NE2 LEU 157.A O GLN 156.A HE22 3.010 2.368 PHE 160.A N LEU 157.A O PHE 160.A H 3.155 2.391 TRP 162.A NE1 GLY 72.A O TRP 162.A HE1 2.793 2.062 TRP 162.A NE1 GLY 159.A O TRP 162.A HE1 2.738 2.120 ILE 163.A N PHE 160.A O ILE 163.A H 3.483 2.593 ILE 167.A N LEU 146.A O ILE 167.A H 3.127 2.434 SER 169.A N GLU 149.A OE1 SER 169.A H 2.786 2.014 SER 171.A N SER 168.A O SER 171.A H 2.998 2.140 VAL 173.A N VAL 118.A O VAL 173.A H 2.973 2.124 ILE 175.A N TRP 120.A O ILE 175.A H 2.973 2.142 GLY 176.A N PHE 196.A O GLY 176.A H 2.796 1.937 ARG 178.A N ALA 123.A O ARG 178.A H 3.091 2.210 ARG 178.A NE VAL 246.A O ARG 178.A HE 3.354 2.660 ARG 178.A NE VAL 247.A O ARG 178.A HE 3.228 2.551 ARG 178.A NH1 ASP 232.A O ARG 178.A HH12 2.872 2.195 ARG 178.A NH1 VAL 246.A O ARG 178.A HH11 2.809 1.955 ARG 178.A NH2 GLY 176.A O ARG 178.A HH21 3.446 2.718 ARG 178.A NH2 ALA 233.A O ARG 178.A HH22 2.944 2.308 ASP 179.A N ALA 123.A O ASP 179.A H 3.257 2.422 ASP 181.A N GLU 184.A OE1 ASP 181.A H 2.966 2.097 HIS 185.A N ASP 181.A O HIS 185.A H 2.736 1.858 PHE 186.A N PRO 182.A O PHE 186.A H 2.934 2.029 ILE 187.A N PRO 183.A O ILE 187.A H 3.153 2.389 LEU 188.A N GLU 184.A O LEU 188.A H 2.985 2.114 LYS 189.A N HIS 185.A O LYS 189.A H 3.229 2.319 ASN 190.A N PHE 186.A O ASN 190.A H 2.716 1.806 TYR 191.A N ILE 187.A O TYR 191.A H 2.860 1.960 ASP 192.A N LYS 189.A O ASP 192.A H 2.937 2.063 ILE 193.A N LEU 188.A O ILE 193.A H 3.191 2.396 GLN 194.A NE2 ASP 192.A O GLN 194.A HE22 3.361 2.552 GLN 194.A NE2 ASP 192.A OD1 GLN 194.A HE21 3.142 2.521 PHE 196.A N TYR 174.A O PHE 196.A H 2.828 1.940 SER 197.A N ASP 200.A OD2 SER 197.A H 3.158 2.336 MET 198.A N LEU 177.A O MET 198.A H 3.020 2.133 ILE 201.A N SER 197.A O ILE 201.A H 3.045 2.309 ASP 202.A N MET 198.A O ASP 202.A H 3.035 2.184 ARG 203.A N ARG 199.A O ARG 203.A H 3.070 2.244 LEU 204.A N ASP 200.A O LEU 204.A H 2.637 1.761 GLY 205.A N ILE 201.A O GLY 205.A H 3.012 2.294 VAL 209.A N GLY 205.A O VAL 209.A H 2.957 2.077 MET 210.A N ILE 206.A O MET 210.A H 3.086 2.264 GLU 211.A N GLN 207.A O GLU 211.A H 3.134 2.224 ARG 212.A N LYS 208.A O ARG 212.A H 2.759 1.860 THR 213.A N VAL 209.A O THR 213.A H 2.852 2.015 PHE 214.A N MET 210.A O PHE 214.A H 2.962 2.085 ASP 215.A N GLU 211.A O ASP 215.A H 3.297 2.394 LEU 216.A N ARG 212.A O LEU 216.A H 3.273 2.508 LEU 216.A N THR 213.A O LEU 216.A H 3.113 2.427 LEU 217.A N THR 213.A O LEU 217.A H 3.137 2.469 LEU 217.A N PHE 214.A O LEU 217.A H 2.869 2.162 ILE 218.A N PHE 214.A O ILE 218.A H 2.683 1.834 ARG 221.A NE ASP 115.A OD1 ARG 221.A HE 3.450 2.711 ARG 221.A NE ASP 115.A OD2 ARG 221.A HE 3.332 2.519 ARG 221.A NH2 ASP 115.A OD1 ARG 221.A HH21 3.131 2.309 ARG 223.A NE ASP 115.A O ARG 223.A HE 3.053 2.224 ARG 223.A NE ASP 115.A OD1 ARG 223.A HE 3.274 2.650 ARG 223.A NH1 LEU 217.A O ARG 223.A HH11 3.409 2.533 ARG 223.A NH2 ASP 115.A O ARG 223.A HH21 3.438 2.738 ARG 223.A NH2 ASP 115.A OD1 ARG 223.A HH21 3.403 2.789 ARG 223.A NH2 SER 171.A OG ARG 223.A HH22 2.568 1.854 ILE 225.A N LEU 267.A O ILE 225.A H 3.042 2.157 HIS 226.A N CYS 117.A O HIS 226.A H 2.856 2.098 HIS 226.A NE2 ASP 272.A OD2 HIS 226.A HE2 2.753 2.010 LEU 227.A N ALA 270.A O LEU 227.A H 3.158 2.503 SER 228.A N VAL 119.A O SER 228.A H 3.130 2.304 PHE 229.A N ASP 272.A O PHE 229.A H 2.810 2.135 ASP 230.A N VAL 121.A O ASP 230.A H 2.793 1.934 ILE 231.A N VAL 274.A O ILE 231.A H 2.927 2.049 ASP 232.A N ASP 230.A OD1 ASP 232.A H 3.328 2.443 ALA 233.A N ASP 230.A O ALA 233.A H 3.177 2.311 PHE 234.A N ILE 231.A O PHE 234.A H 3.417 2.613 ASP 235.A N LEU 250.A O ASP 235.A H 2.878 1.973 THR 237.A N ASP 235.A OD2 THR 237.A H 2.896 2.005 LEU 238.A N ASP 235.A O LEU 238.A H 2.876 2.015 ALA 239.A N ASP 235.A O ALA 239.A H 3.288 2.497 GLY 248.A N ASP 235.A OD1 GLY 248.A H 3.230 2.409 LEU 250.A N ALA 233.A O LEU 250.A H 3.004 2.115 THR 251.A N GLU 254.A OE1 THR 251.A H 2.925 2.086 GLU 254.A N THR 251.A OG1 GLU 254.A H 3.014 2.107 GLY 255.A N THR 251.A O GLY 255.A H 3.135 2.313 MET 256.A N TYR 252.A O MET 256.A H 3.032 2.135 TYR 257.A N ARG 253.A O TYR 257.A H 2.974 2.102 ILE 258.A N GLU 254.A O ILE 258.A H 3.137 2.249 ALA 259.A N GLY 255.A O ALA 259.A H 3.118 2.262 GLU 260.A N MET 256.A O GLU 260.A H 2.624 1.731 GLU 261.A N TYR 257.A O GLU 261.A H 2.806 1.950 ILE 262.A N ILE 258.A O ILE 262.A H 2.998 2.150 HIS 263.A N ALA 259.A O HIS 263.A H 2.960 2.060 ASN 264.A N GLU 260.A O ASN 264.A H 3.066 2.366 THR 265.A N GLU 261.A O THR 265.A H 3.294 2.607 THR 265.A N ILE 262.A O THR 265.A H 3.181 2.370 GLY 266.A N HIS 263.A O GLY 266.A H 2.711 1.862 LEU 267.A N THR 265.A OG1 LEU 267.A H 3.223 2.460 SER 269.A N ILE 225.A O SER 269.A H 2.803 1.927 LEU 271.A N CYS 92.A O LEU 271.A H 2.468 1.649 ASP 272.A N LEU 227.A O ASP 272.A H 2.768 1.920 LEU 273.A N THR 94.A O LEU 273.A H 3.134 2.257 VAL 274.A N PHE 229.A O VAL 274.A H 3.161 2.370 GLU 275.A N GLY 97.A O GLU 275.A H 2.995 2.097 ASN 277.A N ALA 241.A O ASN 277.A H 3.127 2.232 GLN 279.A N ASN 277.A OD1 GLN 279.A H 3.222 2.596 LEU 280.A N ASN 277.A O LEU 280.A H 3.309 2.418 ALA 281.A N PRO 278.A O ALA 281.A H 3.242 2.336 THR 282.A N GLU 286.A OE1 THR 282.A H 2.951 2.041 ALA 287.A N SER 283.A O ALA 287.A H 3.235 2.358 LYS 288.A N GLU 284.A O LYS 288.A H 2.850 1.945 THR 289.A N GLU 285.A O THR 289.A H 2.746 1.907 THR 290.A N GLU 286.A O THR 290.A H 3.122 2.233 ALA 291.A N ALA 287.A O ALA 291.A H 3.134 2.264 ASN 292.A N LYS 288.A O ASN 292.A H 2.850 2.067 LEU 293.A N THR 289.A O LEU 293.A H 2.984 2.113 ALA 294.A N THR 290.A O ALA 294.A H 3.146 2.311 VAL 295.A N ALA 291.A O VAL 295.A H 3.015 2.236 ASP 296.A N ASN 292.A O ASP 296.A H 3.041 2.210 VAL 297.A N LEU 293.A O VAL 297.A H 3.138 2.272 ALA 299.A N VAL 295.A O ALA 299.A H 3.064 2.192 SER 300.A N ASP 296.A O SER 300.A H 2.792 1.928 SER 301.A N VAL 297.A O SER 301.A H 2.947 2.038 PHE 302.A N ILE 298.A O PHE 302.A H 2.905 2.173 PHE 302.A N ALA 299.A O PHE 302.A H 3.146 2.471 GLY 303.A N SER 300.A O GLY 303.A H 2.850 1.987 GLN 304.A N ALA 299.A O GLN 304.A H 2.652 1.768 THR 305.A OG1 GLY 308.A O THR 305.A HG1 2.234 1.419 ARG 306.A NE GLU 260.A OE2 ARG 306.A HE 2.926 2.059 ARG 306.A NH2 GLU 260.A OE1 ARG 306.A HH21 2.483 1.613