Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6t1v_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 3.A NH1 GLN 211.A OE1 ARG 3.A HH12 2.671 1.863 ARG 3.A NH2 GLN 211.A OE1 ARG 3.A HH22 2.978 2.277 LEU 5.A N ASP 1.A O LEU 5.A H 3.142 2.355 ALA 6.A N LEU 2.A O ALA 6.A H 3.150 2.332 LYS 7.A N ARG 3.A O LYS 7.A H 2.980 2.152 LYS 7.A NZ ASP 11.A OD2 LYS 7.A HZ3 3.209 2.402 HIS 8.A N ALA 4.A O HIS 8.A H 2.914 2.058 HIS 8.A NE2 SER 93.A O HIS 8.A HE2 2.949 2.150 LEU 9.A N LEU 5.A O LEU 9.A H 2.857 2.006 TYR 10.A N ALA 6.A O TYR 10.A H 2.884 2.093 ASP 11.A N LYS 7.A O ASP 11.A H 2.856 1.998 SER 12.A N HIS 8.A O SER 12.A H 2.990 2.165 SER 12.A OG HIS 8.A O SER 12.A HG 3.107 2.271 TYR 13.A N LEU 9.A O TYR 13.A H 2.870 2.039 TYR 13.A OH ASP 172.A OD1 TYR 13.A HH 2.708 1.892 ILE 14.A N TYR 10.A O ILE 14.A H 2.877 2.049 LYS 15.A N ASP 11.A O LYS 15.A H 3.203 2.448 SER 16.A N SER 12.A O SER 16.A H 2.849 2.127 SER 16.A N TYR 13.A O SER 16.A H 3.093 2.474 SER 16.A OG SER 12.A O SER 16.A HG 2.877 2.041 PHE 17.A N TYR 13.A O PHE 17.A H 3.001 2.254 LYS 21.A N ASP 172.A OD1 LYS 21.A H 2.719 1.909 LYS 21.A NZ LEU 170.A O LYS 21.A HZ3 2.834 1.980 ALA 22.A N ASP 172.A OD2 ALA 22.A H 2.916 2.089 LYS 23.A N THR 20.A OG1 LYS 23.A H 3.131 2.275 LYS 23.A NZ PRO 18.A O LYS 23.A HZ2 3.232 2.598 ALA 24.A N THR 20.A O ALA 24.A H 2.825 1.998 ARG 25.A N LYS 21.A O ARG 25.A H 2.738 1.918 ARG 25.A NH1 MET 125.A O ARG 25.A HH12 3.241 2.650 ARG 25.A NH2 SER 123.A O ARG 25.A HH21 2.939 2.202 ARG 25.A NH2 MET 125.A O ARG 25.A HH22 2.552 1.737 ALA 26.A N ALA 22.A O ALA 26.A H 3.127 2.332 ILE 27.A N LYS 23.A O ILE 27.A H 3.183 2.381 LEU 28.A N ALA 24.A O LEU 28.A H 2.936 2.105 THR 29.A N ARG 25.A O THR 29.A H 2.963 2.200 THR 29.A OG1 ARG 25.A O THR 29.A HG1 2.575 1.749 GLY 30.A N ILE 27.A O no hydrogen 2.871 N/A THR 32.A OG1 ASP 34.A OD1 THR 32.A HG1 2.547 1.951 ASP 34.A N ASP 34.A OD1 ASP 34.A H 2.391 1.772 PHE 38.A N GLN 136.A O PHE 38.A H 3.031 2.340 ILE 40.A N PHE 138.A O ILE 40.A H 2.778 1.933 TYR 41.A N SER 45.A OG TYR 41.A H 2.759 1.959 ASP 42.A N SER 45.A OG ASP 42.A H 2.983 2.185 SER 45.A N ASP 42.A OD1 SER 45.A H 2.911 2.056 SER 45.A OG ASP 42.A O SER 45.A HG 3.093 2.630 SER 45.A OG ASP 42.A OD1 SER 45.A HG 2.787 2.001 LEU 46.A N ASP 42.A O LEU 46.A H 2.922 2.104 MET 47.A N MET 43.A O MET 47.A H 2.938 2.119 MET 48.A N ASN 44.A O MET 48.A H 3.023 2.243 GLY 49.A N SER 45.A O GLY 49.A H 3.103 2.437 GLY 49.A N LEU 46.A O GLY 49.A H 3.048 2.366 ASP 51.A N ASP 51.A OD1 ASP 51.A H 2.543 1.923 LYS 52.A N GLY 49.A O LYS 52.A H 2.856 2.054 ILE 53.A N GLU 50.A O ILE 53.A H 3.190 2.347 LYS 54.A N SER 133.A OG LYS 54.A H 2.914 2.127 LYS 54.A NZ GLU 82.A OE1 LYS 54.A HZ3 2.982 2.108 GLN 62.A N GLN 62.A OE1 GLN 62.A H 2.757 1.964 GLU 63.A N PRO 60.A O GLU 63.A H 2.904 2.141 GLN 64.A N LEU 61.A O GLN 64.A H 2.925 2.074 GLU 67.A N SER 65.A OG GLU 67.A H 2.947 2.103 ARG 71.A N GLU 67.A O ARG 71.A H 3.174 2.326 ARG 71.A NE SER 65.A O ARG 71.A HE 2.784 1.984 ARG 71.A NH1 GLU 50.A OE2 ARG 71.A HH11 2.762 2.022 ARG 71.A NH2 LYS 66.A O ARG 71.A HH21 3.357 2.610 ILE 72.A N VAL 68.A O ILE 72.A H 2.918 2.088 PHE 73.A N ALA 69.A O PHE 73.A H 2.927 2.122 GLN 74.A N ILE 70.A O GLN 74.A H 2.927 2.135 GLY 75.A N ARG 71.A O GLY 75.A H 3.012 2.165 CYS 76.A N ILE 72.A O CYS 76.A H 2.991 2.213 GLN 77.A N PHE 73.A O GLN 77.A H 3.092 2.311 GLN 77.A NE2 GLN 74.A OE1 GLN 77.A HE21 2.744 1.958 GLN 77.A NE2 SER 255.A O GLN 77.A HE22 3.146 2.287 PHE 78.A N GLN 74.A O PHE 78.A H 3.197 2.409 ARG 79.A N GLY 75.A O ARG 79.A H 3.189 2.394 ARG 79.A NH1 GLU 86.A OE2 ARG 79.A HH12 3.128 2.275 ARG 79.A NH2 GLU 86.A OE1 ARG 79.A HH22 2.994 2.150 SER 80.A N CYS 76.A O SER 80.A H 2.911 2.117 VAL 81.A N GLN 77.A O VAL 81.A H 3.087 2.244 GLU 82.A N PHE 78.A O GLU 82.A H 3.459 2.614 ALA 83.A N ARG 79.A O ALA 83.A H 2.826 2.050 VAL 84.A N SER 80.A O VAL 84.A H 2.910 2.078 GLN 85.A N VAL 81.A O GLN 85.A H 3.234 2.428 GLU 86.A N GLU 82.A O GLU 86.A H 2.999 2.196 ILE 87.A N ALA 83.A O ILE 87.A H 2.944 2.129 THR 88.A N VAL 84.A O THR 88.A H 2.874 2.050 THR 88.A OG1 VAL 84.A O THR 88.A HG1 2.901 2.149 GLU 89.A N GLN 85.A O GLU 89.A H 3.121 2.302 TYR 90.A N GLU 86.A O TYR 90.A H 3.091 2.260 TYR 90.A OH ALA 176.A O TYR 90.A HH 2.521 1.865 ALA 91.A N ILE 87.A O ALA 91.A H 2.830 2.009 LYS 92.A N THR 88.A O LYS 92.A H 3.153 2.397 SER 93.A N TYR 90.A O SER 93.A H 2.873 2.079 SER 93.A OG TYR 90.A O SER 93.A HG 2.536 1.735 ILE 94.A N ALA 91.A O ILE 94.A H 3.026 2.211 PHE 97.A N ILE 94.A O PHE 97.A H 2.828 1.972 ASN 99.A N GLY 96.A O ASN 99.A H 3.117 2.343 LEU 100.A N.A PHE 97.A O LEU 100.A H.A 3.237 2.438 LEU 100.A N.B PHE 97.A O LEU 100.A H.B 3.224 2.418 ASN 103.A N ASP 101.A OD1 ASN 103.A H 2.680 1.861 ASP 104.A N ASP 101.A O ASP 104.A H 2.888 2.296 GLN 105.A N ASP 101.A O GLN 105.A H 2.958 2.125 GLN 105.A NE2 VAL 98.A O GLN 105.A HE22 3.155 2.649 GLN 105.A NE2 LEU 100.A O.A GLN 105.A HE21 2.822 1.977 GLN 105.A NE2 LEU 100.A O.B GLN 105.A HE21 2.811 1.965 VAL 106.A N LEU 102.A O VAL 106.A H 3.043 2.226 THR 107.A N ASN 103.A O THR 107.A H 3.020 2.214 THR 107.A OG1 ASN 103.A O THR 107.A HG1 3.163 2.385 LEU 108.A N ASP 104.A O LEU 108.A H 2.801 1.956 LEU 109.A N GLN 105.A O LEU 109.A H 3.087 2.255 LYS 110.A N VAL 106.A O LYS 110.A H 2.799 1.946 LYS 110.A NZ ILE 263.A O LYS 110.A HZ2 2.893 2.213 LYS 110.A NZ LYS 265.A O LYS 110.A HZ1 2.576 1.712 TYR 111.A N THR 107.A O TYR 111.A H 3.087 2.273 GLY 112.A N LEU 108.A O GLY 112.A H 2.781 2.037 VAL 113.A N LEU 109.A O VAL 113.A H 2.920 2.136 ILE 116.A N GLY 112.A O ILE 116.A H 2.992 2.200 ILE 117.A N VAL 113.A O ILE 117.A H 2.858 2.064 TYR 118.A N HIS 114.A O TYR 118.A H 3.003 2.181 THR 119.A N GLU 115.A O THR 119.A H 3.149 2.333 THR 119.A OG1 GLU 115.A O THR 119.A HG1 2.989 2.151 MET 120.A N ILE 116.A O MET 120.A H 2.993 2.153 LEU 121.A N ILE 117.A O LEU 121.A H 2.842 2.056 SER 123.A N MET 120.A O SER 123.A H 3.072 2.447 LEU 124.A N LEU 121.A O LEU 124.A H 2.753 1.971 MET 125.A N ALA 122.A O MET 125.A H 3.170 2.315 ASN 126.A N GLY 129.A O ASN 126.A H 3.046 2.288 LYS 127.A NZ ASP 128.A OD1 LYS 127.A HZ3 3.496 2.768 LYS 127.A NZ ASP 128.A OD2 LYS 127.A HZ3 2.914 2.123 ASP 128.A N ASN 126.A OD1 ASP 128.A H 2.902 2.113 GLY 129.A N ASN 126.A O GLY 129.A H 3.408 2.618 VAL 130.A N MET 139.A O VAL 130.A H 2.916 2.096 LEU 131.A N LEU 124.A O LEU 131.A H 2.903 2.066 ILE 132.A N GLY 137.A O ILE 132.A H 2.902 2.068 GLY 135.A N ILE 132.A O GLY 135.A H 3.022 2.371 GLN 136.A N SER 133.A O GLN 136.A H 3.030 2.189 GLY 137.A N ILE 132.A O GLY 137.A H 3.179 2.337 PHE 138.A N PHE 38.A O PHE 138.A H 2.930 2.185 MET 139.A N VAL 130.A O MET 139.A H 2.946 2.110 THR 140.A N ILE 40.A O THR 140.A H 3.006 2.183 ARG 141.A N ASP 128.A O ARG 141.A H 2.843 1.998 ARG 141.A NE GLU 156.A OE1 ARG 141.A HE 3.007 2.178 ARG 141.A NE GLU 156.A OE2 ARG 141.A HE 3.181 2.464 ARG 141.A NH1 LYS 127.A O ARG 141.A HH11 2.982 2.163 ARG 141.A NH2 GLU 156.A OE2 ARG 141.A HH21 2.906 2.112 PHE 143.A N THR 140.A OG1 PHE 143.A H 3.055 2.219 LEU 144.A N THR 140.A O LEU 144.A H 3.148 2.314 LYS 145.A N ARG 141.A O LYS 145.A H 2.930 2.137 SER 146.A N GLU 142.A O SER 146.A H 3.032 2.389 SER 146.A N PHE 143.A O SER 146.A H 3.118 2.418 SER 146.A OG PHE 143.A O SER 146.A HG 2.775 1.940 LEU 147.A N LEU 144.A O LEU 147.A H 3.440 2.603 ARG 148.A NE GLU 67.A OE1 ARG 148.A HE 2.810 1.963 ARG 148.A NH1 LYS 149.A O ARG 148.A HH11 3.180 2.501 ARG 148.A NH1 GLU 251.A OE2 ARG 148.A HH12 2.797 1.978 ARG 148.A NH2 GLU 67.A OE1 ARG 148.A HH21 3.277 2.591 ARG 148.A NH2 GLU 67.A OE2 ARG 148.A HH21 3.354 2.512 ARG 148.A NH2 GLU 251.A OE1 ARG 148.A HH22 2.995 2.160 ARG 148.A NH2 GLU 251.A OE2 ARG 148.A HH22 3.151 2.450 LYS 149.A NZ ASP 153.A OD1 LYS 149.A HZ2 2.844 2.034 GLY 152.A N ARG 148.A O GLY 152.A H 3.244 2.504 ASP 153.A N PRO 150.A O ASP 153.A H 2.909 2.073 PHE 154.A N PHE 151.A O PHE 154.A H 3.388 2.528 LYS 158.A N MET 155.A O LYS 158.A H 2.863 2.223 PHE 159.A N MET 155.A O PHE 159.A H 3.028 2.222 GLU 160.A N GLU 156.A O GLU 160.A H 2.935 2.124 PHE 161.A N PRO 157.A O PHE 161.A H 2.948 2.092 ALA 162.A N LYS 158.A O ALA 162.A H 2.878 2.089 VAL 163.A N PHE 159.A O VAL 163.A H 2.922 2.111 PHE 165.A N PHE 161.A O PHE 165.A H 2.834 1.988 ASN 166.A N ALA 162.A O ASN 166.A H 2.758 1.906 ASN 166.A ND2 ALA 122.A O ASN 166.A HD21 2.948 2.135 ALA 167.A N VAL 163.A O ALA 167.A H 3.362 2.611 ALA 167.A N LYS 164.A O ALA 167.A H 3.188 2.587 LEU 168.A N PHE 165.A O LEU 168.A H 2.999 2.199 GLU 169.A N ASN 166.A O GLU 169.A H 2.837 1.998 ASP 171.A N ASP 174.A OD2 ASP 171.A H 2.997 2.166 SER 173.A OG ASP 171.A OD1 SER 173.A HG 3.011 2.250 ASP 174.A N ASP 171.A OD1 ASP 174.A H 3.034 2.216 LEU 175.A N ASP 171.A O LEU 175.A H 2.889 2.055 ALA 176.A N ASP 172.A O ALA 176.A H 2.990 2.210 ILE 177.A N ASP 174.A O ILE 177.A H 3.168 2.550 PHE 178.A N ASP 174.A O PHE 178.A H 3.167 2.323 ILE 179.A N LEU 175.A O ILE 179.A H 2.890 2.044 ALA 180.A N ALA 176.A O ALA 180.A H 3.416 2.597 VAL 181.A N ILE 177.A O VAL 181.A H 2.915 2.078 ILE 182.A N PHE 178.A O ILE 182.A H 3.066 2.291 ILE 183.A N ILE 179.A O ILE 183.A H 2.987 2.190 LEU 184.A N ALA 180.A O LEU 184.A H 3.054 2.216 SER 185.A OG ILE 182.A O SER 185.A HG 2.863 2.139 ARG 188.A NH1 GLU 115.A OE1 ARG 188.A HH12 3.455 2.810 ARG 188.A NH1 GLU 115.A OE2 ARG 188.A HH12 2.943 2.130 ARG 188.A NH2 GLU 115.A OE1 ARG 188.A HH22 2.800 1.948 ARG 188.A NH2 ILE 182.A O ARG 188.A HH21 3.243 2.567 LEU 192.A N ASP 104.A OD1 LEU 192.A H 2.782 1.930 LEU 192.A N ASP 104.A OD2 LEU 192.A H 3.208 2.580 ASN 193.A N ASP 104.A OD2 ASN 193.A H 2.851 2.012 LYS 195.A NZ ASP 199.A OD1 LYS 195.A HZ2 3.275 2.502 GLU 198.A N VAL 194.A O GLU 198.A H 2.887 2.047 ASP 199.A N LYS 195.A O ASP 199.A H 2.820 1.991 ILE 200.A N PRO 196.A O ILE 200.A H 3.134 2.350 GLN 201.A N ILE 197.A O GLN 201.A H 2.875 2.031 GLN 201.A NE2 VAL 181.A O GLN 201.A HE21 3.010 2.179 ASP 202.A N GLU 198.A O ASP 202.A H 2.878 2.084 LEU 204.A N ILE 200.A O LEU 204.A H 2.968 2.138 LEU 205.A N GLN 201.A O LEU 205.A H 2.750 1.919 GLN 206.A N ASP 202.A O GLN 206.A H 3.076 2.242 GLN 206.A NE2 ASP 202.A O GLN 206.A HE21 3.508 2.767 GLN 206.A NE2 ASP 202.A OD1 GLN 206.A HE21 3.252 2.529 ALA 207.A N ASN 203.A O ALA 207.A H 2.871 2.029 LEU 208.A N LEU 204.A O LEU 208.A H 2.816 1.985 GLU 209.A N LEU 205.A O GLU 209.A H 2.886 2.062 LEU 210.A N GLN 206.A O LEU 210.A H 3.026 2.178 GLN 211.A N ALA 207.A O GLN 211.A H 2.921 2.093 GLN 211.A NE2 ASP 174.A OD1 GLN 211.A HE21 2.994 2.155 LEU 212.A N LEU 208.A O LEU 212.A H 2.908 2.097 LYS 213.A N GLU 209.A O LYS 213.A H 3.056 2.233 LEU 214.A N LEU 210.A O LEU 214.A H 2.950 2.137 ASN 215.A N GLN 211.A O ASN 215.A H 2.814 1.980 ASN 215.A ND2 ASP 171.A OD2 ASN 215.A HD21 2.830 1.988 ASN 215.A ND2 ASP 174.A OD1 ASN 215.A HD22 3.098 2.259 ASN 215.A ND2 ASP 174.A OD2 ASN 215.A HD22 3.303 2.618 HIS 216.A N LEU 212.A O HIS 216.A H 2.849 2.162 HIS 216.A NE2 ASP 174.A OD2 HIS 216.A HE2 2.605 1.750 SER 219.A N HIS 216.A O SER 219.A H 2.914 2.078 LEU 222.A N SER 219.A O LEU 222.A H 3.105 2.335 LYS 225.A N GLN 221.A O LYS 225.A H 3.233 2.401 LEU 226.A N LEU 222.A O LEU 226.A H 2.949 2.135 LEU 227.A N PHE 223.A O LEU 227.A H 2.956 2.115 GLN 228.A N ALA 224.A O GLN 228.A H 3.333 2.557 GLN 228.A NE2 ALA 224.A O GLN 228.A HE21 2.752 1.897 LYS 229.A N LEU 226.A O LYS 229.A H 2.890 2.242 MET 230.A N LEU 227.A O MET 230.A H 3.050 2.283 THR 231.A N GLN 228.A O THR 231.A H 3.245 2.504 LEU 233.A N LYS 229.A O LEU 233.A H 3.201 2.394 ARG 234.A N THR 231.A O ARG 234.A H 3.203 2.596 ARG 234.A NH1 ASP 187.A OD2 ARG 234.A HH12 3.265 2.577 ARG 234.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 234.A HH22 2.840 2.018 ARG 234.A NH2 ASP 187.A OD2 ARG 234.A HH22 3.177 2.465 GLN 235.A N THR 231.A O GLN 235.A H 3.388 2.618 ILE 236.A N ASP 232.A O ILE 236.A H 2.946 2.126 VAL 237.A N LEU 233.A O VAL 237.A H 3.043 2.200 THR 238.A N ARG 234.A O THR 238.A H 3.036 2.205 GLU 239.A N GLN 235.A O GLU 239.A H 3.025 2.199 HIS 240.A N ILE 236.A O HIS 240.A H 2.882 2.093 VAL 241.A N.A VAL 237.A O VAL 241.A H.A 2.958 2.132 VAL 241.A N.B VAL 237.A O VAL 241.A H.B 2.922 2.072 GLN 242.A N THR 238.A O GLN 242.A H.B 3.321 2.485 LEU 243.A N GLU 239.A O LEU 243.A H 3.125 2.334 LEU 244.A N HIS 240.A O LEU 244.A H 2.869 2.031 GLN 245.A N VAL 241.A O.A GLN 245.A H 2.901 2.156 GLN 245.A N VAL 241.A O.B GLN 245.A H 2.844 2.095 VAL 246.A N GLN 242.A O VAL 246.A H 3.100 2.307 ILE 247.A N LEU 243.A O ILE 247.A H 3.195 2.409 LYS 248.A N LEU 244.A O LYS 248.A H 3.030 2.220 LYS 249.A N GLN 245.A O LYS 249.A H 2.934 2.157 THR 250.A N VAL 246.A O THR 250.A H 2.963 2.311 THR 250.A OG1 VAL 246.A O THR 250.A HG1 2.753 1.924 GLU 251.A N ILE 247.A O GLU 251.A H 2.910 2.178 MET 254.A N GLU 251.A O MET 254.A H 3.481 2.628 TYR 257.A N GLN 77.A OE1 TYR 257.A H 2.843 2.064 GLN 261.A N TYR 257.A O GLN 261.A H 2.904 2.060 GLU 262.A N PRO 258.A O GLU 262.A H 2.961 2.156 ILE 263.A N LEU 259.A O ILE 263.A H 3.166 2.406 TYR 264.A N LEU 260.A O TYR 264.A H 3.052 2.207 LYS 265.A N GLN 261.A O LYS 265.A H 3.008 2.316 LEU 267.A N TYR 264.A O LEU 267.A H 3.013 2.231