Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6tdy_G.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 5.A N GLY 1.A O ILE 5.A H 2.578 1.753 ARG 6.A N GLY 2.A O ARG 6.A H 3.009 2.177 PHE 7.A N GLY 3.A O PHE 7.A H 2.879 2.097 TRP 8.A N THR 4.A O TRP 8.A H 2.982 2.152 ARG 9.A N ILE 5.A O ARG 9.A H 2.889 2.060 GLU 10.A N ARG 6.A O GLU 10.A H 2.923 2.124 LYS 11.A N PHE 7.A O LYS 11.A H 3.008 2.189 LEU 12.A N TRP 8.A O LEU 12.A H 2.876 2.039 GLU 13.A N ARG 9.A O GLU 13.A H 2.995 2.142 GLY 14.A N GLU 10.A O GLY 14.A H 2.871 2.086 TYR 15.A N LYS 11.A O TYR 15.A H 2.931 2.156 LYS 16.A N LEU 12.A O LYS 16.A H 2.942 2.111 LYS 17.A N GLU 13.A O LYS 17.A H 2.991 2.205 TYR 18.A N GLY 14.A O TYR 18.A H 2.890 2.077 HIS 19.A N TYR 15.A O HIS 19.A H 2.853 2.060 ILE 21.A N LYS 17.A O ILE 21.A H 3.126 2.313 VAL 22.A N TYR 18.A O VAL 22.A H 2.997 2.187 LYS 23.A N HIS 19.A O LYS 23.A H 2.892 2.076 THR 24.A N GLN 20.A O THR 24.A H 2.869 2.140 THR 24.A OG1 GLN 20.A O THR 24.A HG1 2.762 1.931 ILE 25.A N ILE 21.A O ILE 25.A H 3.108 2.312 LYS 26.A N VAL 22.A O LYS 26.A H 3.034 2.269 MET 27.A N LYS 23.A O MET 27.A H 2.993 2.202 VAL 28.A N THR 24.A O VAL 28.A H 3.049 2.194 THR 29.A N ILE 25.A O THR 29.A H 2.876 2.091 THR 29.A OG1 ILE 25.A O THR 29.A HG1 2.561 1.787 LEU 30.A N LYS 26.A O LEU 30.A H 2.957 2.178 ALA 31.A N MET 27.A O ALA 31.A H 2.994 2.164 LYS 32.A N VAL 28.A O LYS 32.A H 3.064 2.328 TYR 33.A N LEU 30.A O TYR 33.A H 3.039 2.344 ARG 34.A N LEU 30.A O ARG 34.A H 2.926 2.076 THR 36.A N TYR 33.A O THR 36.A H 2.963 2.232 THR 36.A OG1 LYS 32.A O THR 36.A HG1 2.935 2.220 VAL 37.A N TYR 33.A O VAL 37.A H 2.889 2.153 ARG 39.A N THR 36.A O ARG 39.A H 2.961 2.213 ARG 39.A NH1 GLU 236.A OE2 ARG 39.A HH12 3.207 2.571 ARG 39.A NH2 GLU 236.A OE2 ARG 39.A HH22 2.646 1.830 THR 40.A N VAL 37.A O THR 40.A H 2.764 2.027 VAL 42.A N ARG 39.A O VAL 42.A H 2.845 2.112 ARG 48.A N GLN 45.A O ARG 48.A H 3.383 2.543 ARG 48.A NE GLN 45.A OE1 ARG 48.A HE 2.679 1.962 LYS 52.A N TYR 49.A O LYS 52.A H 3.102 2.397 ALA 53.A N THR 50.A O ALA 53.A H 2.997 2.197 LEU 54.A N THR 50.A O LEU 54.A H 3.393 2.576 ASP 55.A N ARG 51.A O ASP 55.A H 2.729 2.000 ASP 60.A N GLU 63.A OE2 ASP 60.A H 2.817 2.147 GLN 62.A N GLN 62.A OE1 GLN 62.A H 2.757 1.933 ILE 65.A N ASP 61.A O ILE 65.A H 3.062 2.243 GLU 66.A N GLU 63.A O GLU 66.A H 3.060 2.466 LYS 67.A N GLU 63.A O LYS 67.A H 2.949 2.153 SER 68.A N VAL 64.A O SER 68.A H 2.800 2.048 SER 68.A OG VAL 64.A O SER 68.A HG 2.718 1.979 SER 68.A OG ILE 65.A O SER 68.A HG 3.551 2.986 GLU 69.A N ASP 153.A OD2 GLU 69.A H 2.815 2.033 LEU 71.A N LYS 101.A O LEU 71.A H 2.757 1.956 LEU 72.A N ARG 154.A O LEU 72.A H 2.952 2.318 TYR 73.A N THR 103.A O TYR 73.A H 2.950 2.221 VAL 74.A N GLN 156.A O VAL 74.A H 2.972 2.188 ILE 76.A N VAL 158.A O ILE 76.A H 3.228 2.528 THR 77.A N VAL 107.A O THR 77.A H 2.517 1.746 THR 78.A OG1 ASN 87.A OD1 THR 78.A HG1 3.175 2.606 CYS 83.A SG ARG 80.A O CYS 83.A HG 3.383 2.591 CYS 83.A SG GLY 81.A O CYS 83.A HG 3.628 2.585 ASN 89.A N ALA 85.A O ASN 89.A H 2.780 1.943 MET 90.A N LEU 86.A O MET 90.A H 2.935 2.136 VAL 91.A N ASN 87.A O VAL 91.A H 3.013 2.320 VAL 91.A N THR 88.A O VAL 91.A H 3.044 2.436 ARG 92.A N THR 88.A O ARG 92.A H 2.864 2.084 ARG 92.A NH1 THR 88.A OG1 ARG 92.A HH12 2.734 2.014 TYR 93.A N ASN 89.A O TYR 93.A H 2.929 2.121 LEU 94.A N VAL 91.A O LEU 94.A H 3.065 2.471 GLN 95.A N VAL 91.A O GLN 95.A H 3.056 2.228 GLU 96.A N ARG 92.A O GLU 96.A H 2.863 2.083 VAL 97.A N LEU 94.A O VAL 97.A H 3.051 2.370 LYS 101.A NZ ILE 65.A O LYS 101.A HZ3 2.704 1.967 ILE 104.A N THR 122.A O ILE 104.A H 3.372 2.599 ILE 105.A N TYR 73.A O ILE 105.A H 3.389 2.618 SER 106.A N ARG 125.A O SER 106.A H 3.116 2.319 VAL 107.A N PRO 75.A O VAL 107.A H 2.972 2.329 GLY 108.A N ILE 127.A O GLY 108.A H 2.694 1.900 LYS 110.A N THR 78.A O LYS 110.A H 3.303 2.529 LEU 112.A N LYS 109.A O LEU 112.A H 2.914 2.130 MET 115.A N ALA 111.A O MET 115.A H 3.362 2.590 THR 116.A OG1 LEU 112.A O THR 116.A HG1 3.220 2.581 LYS 117.A N ALA 114.A O LYS 117.A H 2.936 2.278 VAL 118.A N ALA 114.A O VAL 118.A H 2.986 2.287 VAL 118.A N MET 115.A O VAL 118.A H 2.952 2.318 PHE 119.A N MET 115.A O PHE 119.A H 2.394 1.611 GLN 120.A NE2 LYS 117.A O GLN 120.A HE21 3.017 2.536 ARG 124.A N ILE 104.A O ARG 124.A H 3.004 2.177 ARG 125.A NE HIS 146.A ND1 ARG 125.A HE 3.253 2.445 ARG 125.A NH2 HIS 146.A ND1 ARG 125.A HH21 3.366 2.593 ARG 125.A NH2 THR 149.A OG1 ARG 125.A HH22 3.427 2.614 THR 126.A OG1 SER 106.A OG THR 126.A HG1 2.727 1.975 PHE 139.A N SER 136.A O PHE 139.A H 3.069 2.385 ALA 140.A N SER 136.A O ALA 140.A H 3.368 2.565 ALA 141.A N PHE 137.A O ALA 141.A H 2.976 2.153 TYR 142.A N GLN 138.A O TYR 142.A H 2.817 2.059 VAL 143.A N PHE 139.A O VAL 143.A H 2.946 2.236 VAL 143.A N ALA 140.A O VAL 143.A H 3.148 2.559 LEU 144.A N ALA 140.A O LEU 144.A H 2.969 2.176 GLU 145.A N ALA 141.A O GLU 145.A H 2.935 2.192 HIS 146.A N VAL 143.A O HIS 146.A H 3.046 2.390 MET 147.A N VAL 143.A O MET 147.A H 3.044 2.220 ASN 148.A N LEU 144.A O ASN 148.A H 2.867 2.082 THR 149.A N HIS 146.A O THR 149.A H 3.067 2.268 THR 149.A OG1 HIS 146.A O THR 149.A HG1 2.408 1.671 VAL 150.A N MET 147.A O VAL 150.A H 3.127 2.317 ASP 153.A N CYS 70.A O ASP 153.A H 3.270 2.498 ARG 154.A NH1 GLN 156.A OE1 ARG 154.A HH12 3.555 2.857 ARG 154.A NH2 GLN 156.A OE1 ARG 154.A HH22 3.093 2.261 ALA 155.A N LEU 175.A O ALA 155.A H 2.955 2.144 GLN 156.A N LEU 72.A O GLN 156.A H 2.893 2.050 GLN 156.A NE2 TYR 93.A OH GLN 156.A HE22 3.221 2.514 ILE 157.A N PHE 173.A O ILE 157.A H 2.917 2.158 VAL 158.A N VAL 74.A O VAL 158.A H 2.882 2.031 TYR 159.A N ALA 171.A O TYR 159.A H 2.934 2.154 ASN 160.A ND2 LYS 169.A O ASN 160.A HD22 3.689 2.873 ARG 161.A N LYS 169.A O ARG 161.A H 2.786 1.964 ARG 161.A NH2 ASP 44.A OD1 ARG 161.A HH22 2.514 1.728 TYR 162.A N GLU 236.A OE1 TYR 162.A H 3.322 2.490 HIS 163.A N SER 167.A O HIS 163.A H 3.007 2.365 HIS 163.A ND1 ARG 161.A O no hydrogen 3.201 N/A GLY 164.A N SER 167.A O GLY 164.A H 3.137 2.295 SER 167.A N GLY 164.A O SER 167.A H 3.188 2.351 GLN 168.A NE2 ALA 165.A O GLN 168.A HE22 2.925 2.134 LYS 169.A N ARG 161.A O LYS 169.A H 3.002 2.401 ALA 171.A N TYR 159.A O ALA 171.A H 2.897 2.194 PHE 173.A N ILE 157.A O PHE 173.A H 2.943 2.160 LEU 175.A N ALA 155.A O LEU 175.A H 2.865 2.011 GLU 179.A N GLU 179.A OE1 GLU 179.A H 2.595 1.880 TRP 181.A N LYS 177.A O TRP 181.A H 2.515 1.772 TRP 181.A NE1 ALA 53.A O TRP 181.A HE1 3.245 2.488 LYS 182.A N PHE 178.A O LYS 182.A H 2.872 2.042 LYS 182.A NZ GLU 215.A OE2 LYS 182.A HZ2 3.003 2.329 LYS 184.A N ASP 180.A O LYS 184.A H 2.969 2.125 LEU 185.A N TRP 181.A O LEU 185.A H 2.794 2.028 GLU 186.A N LYS 182.A O GLU 186.A H 3.004 2.189 GLU 187.A N GLN 183.A O GLU 187.A H 2.928 2.077 ASP 188.A N LYS 184.A O ASP 188.A H 2.926 2.083 SER 189.A N LEU 185.A O SER 189.A H 2.858 2.075 SER 189.A OG LEU 185.A O SER 189.A HG 3.188 2.731 SER 189.A OG GLU 186.A O SER 189.A HG 2.779 2.003 ALA 190.A N GLU 186.A O ALA 190.A H 3.008 2.319 LEU 200.A N GLU 197.A O LEU 200.A H 3.234 2.467 LYS 207.A N SER 203.A O LYS 207.A H 3.198 2.395 LYS 207.A NZ ASP 188.A OD2 LYS 207.A HZ2 3.332 2.525 THR 208.A N LEU 204.A O THR 208.A H 3.064 2.317 THR 208.A OG1 PRO 205.A O THR 208.A HG1 2.458 1.921 ALA 209.A N PRO 205.A O ALA 209.A H 2.970 2.131 LEU 210.A N MET 206.A O LEU 210.A H 2.855 1.999 GLU 212.A N THR 208.A O GLU 212.A H 3.084 2.387 LEU 213.A N ALA 209.A O LEU 213.A H 3.203 2.548 LEU 213.A N LEU 210.A O LEU 213.A H 2.959 2.319 VAL 218.A N GLU 214.A O VAL 218.A H 3.300 2.543 GLU 219.A N GLU 215.A O GLU 219.A H 3.016 2.181 ASP 220.A N THR 216.A O ASP 220.A H 3.003 2.201 PHE 221.A N ALA 217.A O PHE 221.A H 2.789 2.051 TYR 222.A N VAL 218.A O TYR 222.A H 2.995 2.164 ASN 223.A N GLU 219.A O ASN 223.A H 3.051 2.203 PHE 224.A N ASP 220.A O PHE 224.A H 2.815 2.022 HIS 225.A N PHE 221.A O HIS 225.A H 3.011 2.155 HIS 225.A ND1 THR 50.A OG1 no hydrogen 2.573 N/A SER 226.A N TYR 222.A O SER 226.A H 2.974 2.131 CYS 227.A N ASN 223.A O CYS 227.A H 2.929 2.164 LEU 228.A N PHE 224.A O LEU 228.A H 3.001 2.212 ALA 229.A N HIS 225.A O ALA 229.A H 3.007 2.181 VAL 230.A N SER 226.A O VAL 230.A H 2.955 2.112 LEU 231.A N CYS 227.A O LEU 231.A H 2.927 2.119 ASN 232.A N LEU 228.A O ASN 232.A H 2.938 2.123 ALA 233.A N ALA 229.A O ALA 233.A H 3.058 2.245 VAL 234.A N VAL 230.A O VAL 234.A H 3.011 2.208 SER 235.A N LEU 231.A O SER 235.A H 2.947 2.127 SER 235.A OG LEU 231.A O SER 235.A HG 3.125 2.374 GLU 236.A N ASN 232.A O GLU 236.A H 2.930 2.079 ASN 237.A N ALA 233.A O ASN 237.A H 2.982 2.180 GLU 238.A N VAL 234.A O GLU 238.A H 2.912 2.152 LEU 239.A N SER 235.A O LEU 239.A H 3.054 2.221 SER 240.A N GLU 236.A O SER 240.A H 2.892 2.101 GLU 241.A N ASN 237.A O GLU 241.A H 2.789 1.984 TYR 242.A N GLU 238.A O TYR 242.A H 3.037 2.202 ALA 243.A N LEU 239.A O ALA 243.A H 2.890 2.266 ALA 244.A N SER 240.A O ALA 244.A H 2.839 2.054 ARG 245.A N GLU 241.A O ARG 245.A H 2.940 2.155 ARG 245.A NE GLY 81.A O ARG 245.A HE 3.107 2.271 ARG 245.A NH2 ARG 80.A O ARG 245.A HH21 3.171 2.475 ARG 245.A NH2 GLU 241.A OE2 ARG 245.A HH22 2.891 2.091 ALA 248.A N ALA 244.A O ALA 248.A H 2.910 2.058 GLU 250.A N ILE 246.A O GLU 250.A H 2.923 2.095 ASN 251.A N VAL 247.A O ASN 251.A H 3.104 2.273 LEU 253.A N VAL 249.A O LEU 253.A H 2.954 2.184 GLY 254.A N GLU 250.A O GLY 254.A H 3.005 2.182 ASN 255.A N ASN 251.A O ASN 255.A H 2.934 2.134 ILE 256.A N GLN 252.A O ILE 256.A H 2.835 2.004 THR 257.A N LEU 253.A O THR 257.A H 2.938 2.112 GLY 258.A N GLY 254.A O GLY 258.A H 2.965 2.166 LEU 259.A N ASN 255.A O LEU 259.A H 2.940 2.188 MET 260.A N ILE 256.A O MET 260.A H 2.830 2.100 GLN 261.A N THR 257.A O GLN 261.A H 2.934 2.132 ALA 263.A N LEU 259.A O ALA 263.A H 2.897 2.090 ASP 264.A N MET 260.A O ASP 264.A H 2.853 2.009 TYR 265.A N GLN 261.A O TYR 265.A H 2.809 2.046 THR 266.A N LEU 262.A O THR 266.A H 2.858 2.014 TYR 267.A N ALA 263.A O TYR 267.A H 2.836 2.025 ASN 268.A N ASP 264.A O ASN 268.A H 2.994 2.195 ASN 268.A ND2 ASP 264.A O ASN 268.A HD22 2.832 2.329 LYS 269.A N TYR 265.A O LYS 269.A H 2.852 2.014 THR 270.A N THR 266.A O THR 270.A H 2.872 2.027 THR 270.A OG1 THR 266.A O THR 270.A HG1 2.761 2.008 ARG 271.A N TYR 267.A O ARG 271.A H 2.870 2.066 ARG 271.A NE ASN 268.A OD1 ARG 271.A HE 3.065 2.275 ARG 271.A NH2 ASN 268.A OD1 ARG 271.A HH21 3.402 2.715 LYS 272.A N ASN 268.A O LYS 272.A H 2.910 2.084 GLU 273.A N LYS 269.A O GLU 273.A H 2.958 2.137 LEU 274.A N THR 270.A O LEU 274.A H 2.890 2.075 ILE 275.A N ARG 271.A O ILE 275.A H 3.011 2.243 THR 276.A N LYS 272.A O THR 276.A H 2.967 2.133 THR 276.A OG1 LYS 272.A O THR 276.A HG1 2.830 2.002 ALA 277.A N GLU 273.A O ALA 277.A H 2.922 2.113 GLU 278.A N LEU 274.A O GLU 278.A H 3.034 2.195 LEU 279.A N ILE 275.A O LEU 279.A H 3.063 2.239 LEU 280.A N THR 276.A O LEU 280.A H 2.990 2.192 GLU 281.A N ALA 277.A O GLU 281.A H 2.951 2.147 ILE 282.A N GLU 278.A O ILE 282.A H 3.087 2.275 ILE 283.A N LEU 279.A O ILE 283.A H 2.885 2.083 GLY 284.A N LEU 280.A O GLY 284.A H 2.839 2.014 THR 285.A N GLU 281.A O THR 285.A H 3.047 2.253 THR 285.A OG1 GLU 281.A O THR 285.A HG1 3.419 2.663 THR 285.A OG1 ILE 282.A O THR 285.A HG1 2.577 2.086 MET 286.A N ILE 282.A O MET 286.A H 2.966 2.122 THR 287.A N ILE 283.A O THR 287.A H 2.893 2.081 THR 287.A OG1 ILE 283.A O THR 287.A HG1 2.520 1.754 ALA 288.A N GLY 284.A O ALA 288.A H 2.908 2.068 MET 289.A N THR 285.A O MET 289.A H 2.973 2.164 HIS 290.A N MET 286.A O HIS 290.A H 2.994 2.206 ALA 291.A N THR 287.A O ALA 291.A H 3.012 2.218 GLY 292.A N ALA 288.A O GLY 292.A H 2.917 2.183 LYS 293.A N MET 289.A O LYS 293.A H 2.846 2.066