Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6tmc_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 1.A N.B GLU 1.A OE1.B no hydrogen 2.290 N/A TYR 2.A OH ASN 39.A OD1 TYR 2.A HH 2.720 1.902 THR 4.A N GLU 7.A OE1 THR 4.A H 3.005 2.192 GLU 7.A N THR 4.A O GLU 7.A H 2.923 2.108 GLU 12.A N PRO 9.A O GLU 12.A H 3.011 2.170 ARG 14.A N ILE 26.A O ARG 14.A H 2.872 2.041 ARG 14.A NH1 GLU 12.A OE1 ARG 14.A HH12 2.964 2.128 ARG 14.A NH2 GLU 7.A O ARG 14.A HH21 2.905 2.271 ARG 14.A NH2 GLU 12.A OE1 ARG 14.A HH22 3.372 2.664 TYR 16.A N SER 24.A O TYR 16.A H 2.926 2.116 GLN 17.A NE2.A ALA 19.A O GLN 17.A HE21.A 3.627 2.978 ILE 18.A N VAL 22.A O ILE 18.A H 2.861 2.065 ALA 19.A N VAL 22.A O ALA 19.A H 3.259 2.435 VAL 22.A N ALA 19.A O VAL 22.A H 2.987 2.158 TRP 23.A N ILE 42.A O TRP 23.A H 2.905 2.057 SER 24.A N TYR 16.A O SER 24.A H 2.886 2.145 SER 24.A OG TYR 2.A OH SER 24.A HG 2.847 2.098 HIS 25.A N GLY 40.A O HIS 25.A H 2.996 2.208 HIS 25.A NE2 ASP 53.A O HIS 25.A HE2 2.986 2.365 ILE 26.A N ARG 14.A O ILE 26.A H 2.885 2.074 ALA 27.A N SER 38.A O ALA 27.A H 2.981 2.162 THR 28.A OG1 ILE 8.A O THR 28.A HG1 2.813 2.062 GLN 29.A N TYR 36.A O GLN 29.A H 3.049 2.295 GLN 29.A NE2 TRP 56.A O GLN 29.A HE21 2.990 2.140 SER 30.A N GLN 29.A OE1 SER 30.A H 2.918 2.167 PHE 31.A N ALA 34.A O PHE 31.A H 2.790 1.982 ALA 34.A N PHE 31.A O ALA 34.A H 3.218 2.360 TYR 36.A N GLN 29.A O TYR 36.A H 2.914 2.093 SER 38.A N ALA 27.A O SER 38.A H 2.812 2.054 ASN 39.A N GLY 208.A O ASN 39.A H 2.820 1.962 ASN 39.A ND2 PRO 207.A O ASN 39.A HD22 2.922 2.064 ASN 39.A ND2 GLY 210.A O ASN 39.A HD21 2.773 1.929 GLY 40.A N HIS 25.A O GLY 40.A H 2.902 2.108 LEU 41.A N ILE 52.A O LEU 41.A H 2.966 2.151 ILE 42.A N TRP 23.A O ILE 42.A H 2.815 2.000 VAL 43.A N LEU 50.A O VAL 43.A H 2.872 2.052 ARG 44.A N GLY 21.A O ARG 44.A H 2.859 2.017 ARG 44.A NH1 GLY 46.A O ARG 44.A HH11 2.816 2.059 ASP 45.A N GLU 48.A O ASP 45.A H 2.737 1.892 ASP 47.A N ASP 47.A OD1 ASP 47.A H 2.656 1.957 GLU 48.A N ASP 45.A O GLU 48.A H 3.036 2.197 LEU 49.A N PRO 75.A O LEU 49.A H 2.801 2.013 LEU 50.A N VAL 43.A O LEU 50.A H 2.920 2.071 LEU 51.A N ARG 78.A O LEU 51.A H 2.959 2.104 ILE 52.A N LEU 41.A O ILE 52.A H 2.765 1.912 ASP 53.A N VAL 80.A O ASP 53.A H 2.802 1.995 THR 54.A N ARG 88.A O THR 54.A H 3.249 2.391 THR 54.A OG1 GLY 90.A O THR 54.A HG1 2.747 2.110 ALA 55.A N THR 61.A OG1 ALA 55.A H 3.157 2.341 TRP 56.A N THR 54.A OG1 TRP 56.A H 3.379 2.533 GLY 57.A N GLY 90.A O GLY 57.A H 2.877 2.048 ASN 60.A ND2 THR 28.A O ASN 60.A HD21 2.902 2.106 ASN 60.A ND2 ALA 55.A O ASN 60.A HD22 3.012 2.211 THR 61.A N GLY 57.A O THR 61.A H 2.873 2.076 THR 61.A OG1 GLY 57.A O THR 61.A HG1 2.765 2.042 ALA 62.A N ALA 58.A O ALA 62.A H 2.886 2.070 ALA 63.A N LYS 59.A O ALA 63.A H 3.057 2.237 LEU 64.A N ASN 60.A O LEU 64.A H 2.798 2.001 LEU 65.A N THR 61.A O LEU 65.A H 3.054 2.231 ALA 66.A N ALA 62.A O ALA 66.A H 3.096 2.294 GLU 67.A N ALA 63.A O GLU 67.A H 2.860 2.047 ILE 68.A N LEU 64.A O ILE 68.A H 2.921 2.077 GLU 69.A N LEU 65.A O GLU 69.A H 3.011 2.197 LYS 70.A N ALA 66.A O LYS 70.A H 3.014 2.216 GLN 71.A N GLU 67.A O GLN 71.A H 2.856 2.047 GLN 71.A NE2 GLU 67.A OE1 GLN 71.A HE21 3.086 2.256 ILE 72.A N ILE 68.A O ILE 72.A H 2.811 1.983 GLY 73.A N ILE 68.A O GLY 73.A H 2.919 2.093 THR 77.A N LEU 49.A O THR 77.A H 3.073 2.276 THR 77.A OG1 GLU 48.A OE1 THR 77.A HG1 2.740 1.906 ARG 78.A NH2 ASP 45.A OD2 ARG 78.A HH21 2.893 2.105 ALA 79.A N ALA 101.A O ALA 79.A H 2.898 2.125 VAL 80.A N LEU 51.A O VAL 80.A H 2.895 2.104 SER 81.A N TYR 103.A O SER 81.A H 2.945 2.125 SER 81.A OG ARG 88.A O SER 81.A HG 2.792 2.086 THR 82.A N ASP 53.A OD1 THR 82.A H 2.768 1.969 HIS 83.A NE2 HIS 85.A ND1 no hydrogen 3.176 N/A HIS 85.A NE2 ASP 182.A OD2 HIS 85.A HE2 2.778 1.930 ARG 88.A N HIS 85.A O ARG 88.A H 2.936 2.110 ARG 88.A NH1 ASN 39.A O ARG 88.A HH12 2.862 2.170 ARG 88.A NH2 ASN 39.A O ARG 88.A HH22 3.527 3.013 ARG 88.A NH2 GLY 208.A O ARG 88.A HH22 2.952 2.224 VAL 89.A N HIS 85.A O VAL 89.A H 3.067 2.271 GLY 90.A N ASP 86.A O.A GLY 90.A H 2.934 2.200 GLY 90.A N ASP 86.A O.B GLY 90.A H 2.905 2.163 GLY 91.A N GLU 118.A OE1 GLY 91.A H 3.079 2.290 GLY 91.A N GLU 118.A OE2 GLY 91.A H 3.233 2.445 VAL 92.A N VAL 89.A O VAL 92.A H 2.988 2.150 ASP 93.A N GLU 118.A OE1 ASP 93.A H 2.880 2.022 LEU 95.A N GLY 91.A O LEU 95.A H 2.997 2.169 ARG 96.A N.A VAL 92.A O ARG 96.A H.A 2.902 2.058 ARG 96.A N.B VAL 92.A O ARG 96.A H.B 2.874 2.030 ARG 96.A NE.A THR 121.A OG1 ARG 96.A HE.A 3.105 2.279 ARG 96.A NH1.A ASP 93.A OD1 ARG 96.A HH12.A 2.865 2.037 ARG 96.A NH1.B ILE 119.A O ARG 96.A HH12.B 2.953 2.122 ARG 96.A NH1.B THR 121.A OG1 ARG 96.A HH11.B 2.552 1.773 ARG 96.A NH2.A THR 121.A OG1 ARG 96.A HH21.A 3.326 2.582 ARG 96.A NH2.B ASP 93.A OD1 ARG 96.A HH21.B 2.624 1.965 ARG 96.A NH2.B ILE 119.A O ARG 96.A HH22.B 3.315 2.599 ALA 97.A N ASP 93.A O ALA 97.A H 2.937 2.127 ALA 98.A N VAL 94.A O ALA 98.A H 2.999 2.297 ALA 98.A N LEU 95.A O ALA 98.A H 3.060 2.395 GLY 99.A N ARG 96.A O.A GLY 99.A H 2.854 2.015 GLY 99.A N ARG 96.A O.B GLY 99.A H 3.149 2.316 VAL 100.A N LEU 95.A O VAL 100.A H 2.941 2.099 ALA 101.A N THR 77.A O ALA 101.A H 3.007 2.170 TYR 103.A N ALA 79.A O TYR 103.A H 2.779 2.088 ALA 104.A N HIS 122.A O ALA 104.A H 3.049 2.255 SER 105.A OG THR 108.A OG1 SER 105.A HG 3.154 2.425 THR 108.A N SER 105.A OG THR 108.A H 2.988 2.133 THR 108.A OG1 ASP 151.A OD2 THR 108.A HG1 2.634 1.801 ARG 109.A N SER 105.A O ARG 109.A H 2.923 2.085 ARG 109.A NE PRO 120.A O ARG 109.A HE 2.726 1.881 ARG 109.A NH2 PRO 120.A O ARG 109.A HH21 3.561 2.957 ARG 110.A N.A PRO 106.A O ARG 110.A H.A 2.944 2.120 ARG 110.A N.B PRO 106.A O ARG 110.A H.B 2.927 2.105 ARG 110.A N.C PRO 106.A O ARG 110.A H.C 2.945 2.119 LEU 111.A N SER 107.A O LEU 111.A H 2.865 2.019 ALA 112.A N THR 108.A O ALA 112.A H 2.851 2.030 GLU 113.A N ARG 109.A O GLU 113.A H 3.065 2.240 VAL 114.A N ARG 110.A O.A VAL 114.A H 2.986 2.167 VAL 114.A N ARG 110.A O.B VAL 114.A H 3.043 2.228 VAL 114.A N ARG 110.A O.C VAL 114.A H 2.984 2.164 GLU 115.A N LEU 111.A O GLU 115.A H 2.951 2.176 GLY 116.A N GLU 113.A O GLY 116.A H 3.164 2.359 ASN 117.A N ALA 112.A O ASN 117.A H 2.872 2.081 ASN 117.A ND2 PHE 84.A O ASN 117.A HD22 2.875 2.035 THR 121.A N THR 102.A OG1 THR 121.A H 2.954 2.122 HIS 122.A N THR 102.A O HIS 122.A H 2.848 2.035 LEU 124.A N ALA 104.A O LEU 124.A H 2.834 2.047 SER 129.A N ASP 132.A OD2 SER 129.A H 2.882 2.055 GLY 131.A N TYR 143.A O GLY 131.A H 2.799 1.969 ASP 132.A N SER 129.A O ASP 132.A H 2.944 2.168 VAL 134.A N LEU 141.A O VAL 134.A H 2.962 2.168 ARG 135.A NE GLY 137.A O ARG 135.A HE 2.506 1.955 PHE 136.A N VAL 139.A O PHE 136.A H 2.905 2.047 VAL 139.A N PHE 136.A O VAL 139.A H 3.199 2.346 GLU 140.A N TYR 156.A O GLU 140.A H 2.817 1.986 LEU 141.A N VAL 134.A O LEU 141.A H 2.797 1.962 PHE 142.A N VAL 154.A O PHE 142.A H 2.930 2.127 TYR 143.A N ASP 132.A O TYR 143.A H 2.937 2.103 TYR 143.A OH THR 150.A O TYR 143.A HH 2.576 1.877 ALA 147.A N SER 149.A O ALA 147.A H 2.945 2.108 SER 149.A N ASN 152.A OD1 SER 149.A H 2.998 2.163 ASP 151.A N ASP 151.A OD1 ASP 151.A H 2.691 2.020 ASN 152.A ND2 GLY 145.A O ASN 152.A HD21 2.944 2.260 ASN 152.A ND2 ASN 152.A O ASN 152.A HD22 2.782 1.967 LEU 153.A N THR 82.A O LEU 153.A H 2.833 2.028 VAL 154.A N PHE 142.A O VAL 154.A H 2.918 2.079 VAL 155.A N TYR 164.A O VAL 155.A H 2.949 2.115 TYR 156.A N GLU 140.A O TYR 156.A H 2.929 2.092 VAL 157.A N VAL 162.A O VAL 157.A H 2.792 1.962 ALA 160.A N VAL 157.A O ALA 160.A H 3.035 2.220 VAL 162.A N VAL 157.A O VAL 162.A H 3.376 2.569 LEU 163.A N PHE 204.A O LEU 163.A H 2.796 1.942 TYR 164.A N VAL 155.A O TYR 164.A H 2.722 1.876 TYR 164.A OH ASP 53.A OD2 TYR 164.A HH 2.665 1.864 GLY 165.A N ILE 206.A O GLY 165.A H 2.864 2.011 CYS 167.A SG ASP 87.A OD2 no hydrogen 3.508 N/A CYS 167.A SG HIS 209.A NE2 no hydrogen 3.499 N/A ILE 169.A N GLY 166.A O ILE 169.A H 3.203 2.344 TYR 170.A N THR 221.A OG1 TYR 170.A H 2.776 1.921 ARG 174.A N.A GLU 171.A O ARG 174.A H.A 3.137 2.341 ARG 174.A N.B GLU 171.A O ARG 174.A H.B 3.123 2.304 ARG 174.A NE.B SER 176.A O ARG 174.A HE.B 2.990 2.168 ARG 174.A NH2.B ALA 177.A O ARG 174.A HH21.B 2.725 1.922 ASN 179.A ND2 ASP 32.A OD2 ASN 179.A HD22 3.298 2.446 ALA 181.A N ASN 179.A OD1 ALA 181.A H 2.884 2.044 ALA 183.A N VAL 180.A O ALA 183.A H 3.079 2.232 ASP 184.A N ALA 147.A O ASP 184.A H 2.857 2.026 GLU 187.A N ASP 184.A O GLU 187.A H 3.188 2.548 GLU 187.A N ASP 184.A OD1 GLU 187.A H 3.235 2.474 TRP 188.A N ASP 184.A O TRP 188.A H 3.002 2.317 TRP 188.A NE1 ALA 168.A O TRP 188.A HE1 2.988 2.182 SER 191.A N GLU 187.A O SER 191.A H 2.977 2.172 SER 191.A OG ALA 146.A O SER 191.A HG 2.617 1.899 ILE 192.A N TRP 188.A O ILE 192.A H 2.934 2.118 GLU 193.A N PRO 189.A O GLU 193.A H 2.998 2.191 ARG 194.A N THR 190.A O ARG 194.A H 3.081 2.313 ARG 194.A NH1 PRO 144.A O ARG 194.A HH11 2.841 2.076 ILE 195.A N SER 191.A O ILE 195.A H 3.161 2.378 GLN 196.A N ILE 192.A O GLN 196.A H 2.990 2.148 GLN 197.A N GLU 193.A O GLN 197.A H 2.944 2.116 HIS 198.A N ARG 194.A O HIS 198.A H 3.041 2.267 TYR 199.A N ILE 195.A O TYR 199.A H 2.900 2.151 TYR 199.A OH GLU 140.A OE1 TYR 199.A HH 2.560 1.801 ALA 202.A N TYR 199.A O ALA 202.A H 3.228 2.377 GLN 203.A N SER 161.A O GLN 203.A H 2.872 2.045 GLN 203.A NE2 GLU 201.A O.A GLN 203.A HE21 3.037 2.250 GLN 203.A NE2 GLU 201.A O.B GLN 203.A HE21 3.154 2.363 PHE 204.A N SER 161.A O PHE 204.A H 3.210 2.388 VAL 205.A N GLY 213.A O VAL 205.A H 2.836 1.988 ILE 206.A N LEU 163.A O ILE 206.A H 2.796 1.972 GLY 208.A N ILE 169.A O GLY 208.A H 3.303 2.530 HIS 209.A ND1 PRO 37.A O HIS 209.A HD1 2.626 1.795 HIS 209.A NE2 ASP 87.A OD2 no hydrogen 2.922 N/A LEU 211.A N GLU 171.A OE1 LEU 211.A H 2.915 2.076 GLY 213.A N VAL 205.A O GLY 213.A H 2.900 2.052 GLY 214.A N ASP 216.A OD2 GLY 214.A H 2.945 2.267 LEU 217.A N GLY 214.A O LEU 217.A H 3.013 2.154 LEU 218.A N.A LEU 215.A O LEU 218.A H.A 2.975 2.158 LEU 218.A N.B LEU 215.A O LEU 218.A H.B 2.986 2.168 HIS 220.A N ASP 216.A O HIS 220.A H 3.134 2.293 HIS 220.A NE2 ARG 174.A O.A HIS 220.A HE2 2.675 2.018 HIS 220.A NE2 ARG 174.A O.B HIS 220.A HE2 2.713 2.045 THR 221.A N LEU 217.A O THR 221.A H 2.898 2.067 THR 221.A OG1 LEU 217.A O THR 221.A HG1 2.766 1.959 THR 222.A N LEU 218.A O.A THR 222.A H 3.054 2.215 THR 222.A N LEU 218.A O.B THR 222.A H 3.036 2.195 ASN 223.A N LYS 219.A O ASN 223.A H 2.914 2.092 VAL 224.A N HIS 220.A O VAL 224.A H 3.009 2.209 VAL 225.A N THR 221.A O VAL 225.A H 2.847 1.990 LYS 226.A N THR 222.A O LYS 226.A H 2.815 1.958 ALA 227.A N ASN 223.A O ALA 227.A H 2.965 2.172 HIS 228.A N VAL 224.A O HIS 228.A H 3.022 2.304 HIS 228.A N VAL 225.A O HIS 228.A H 3.057 2.433 THR 229.A N VAL 225.A O THR 229.A H 2.894 2.056 THR 229.A OG1 VAL 225.A O THR 229.A HG1 3.002 2.200 ASN 230.A N LYS 226.A O ASN 230.A H 2.656 2.045