Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6tmq_AAA.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N SER 2.A O LYS 5.A H 2.668 1.895 TYR 6.A N SER 2.A O TYR 6.A H 3.052 2.065 ILE 7.A N ALA 3.A O ILE 7.A H 2.932 1.923 GLU 8.A N PRO 4.A O GLU 8.A H 3.153 2.223 HIS 9.A N LYS 5.A O HIS 9.A H 2.781 1.801 PHE 10.A N TYR 6.A O PHE 10.A H 2.797 1.797 SER 11.A N ILE 7.A O SER 11.A H 2.973 2.068 LYS 12.A N HIS 9.A O LYS 12.A H 3.035 2.139 PHE 13.A N PHE 10.A O PHE 13.A H 3.099 2.215 SER 16.A N GLU 39.A OE2 SER 16.A H 2.731 1.738 LEU 18.A N GLU 332.A OE1 LEU 18.A H 2.977 1.971 MET 20.A N SER 330.A O MET 20.A H 2.912 1.924 GLN 22.A N SER 19.A OG GLN 22.A H 3.170 2.174 GLN 22.A NE2 SER 19.A OG GLN 22.A HE22 3.159 2.406 PHE 23.A N SER 19.A O PHE 23.A H 2.959 1.988 LEU 24.A N MET 20.A O LEU 24.A H 3.024 2.019 ASP 25.A N LYS 21.A O ASP 25.A H 3.061 2.078 LYS 30.A NZ GLU 87.A OE1 LYS 30.A HZ3 3.086 2.227 SER 32.A N CYS 28.A O SER 32.A H 3.415 2.452 PHE 33.A N GLU 29.A O PHE 33.A H 2.916 1.922 THR 34.A N LYS 30.A O THR 34.A H 2.912 1.951 PHE 35.A N THR 31.A O PHE 35.A H 2.899 1.984 LEU 36.A N SER 32.A O LEU 36.A H 2.794 1.857 ARG 37.A N PHE 33.A O ARG 37.A H 2.975 2.027 ARG 37.A NH1 PHE 81.A O ARG 37.A HH11 2.848 2.127 ARG 37.A NH1 LYS 84.A O ARG 37.A HH12 2.879 2.044 GLU 39.A N PHE 35.A O GLU 39.A H 2.842 1.905 LEU 40.A N LEU 36.A O LEU 40.A H 2.707 1.706 VAL 42.A N GLN 38.A O VAL 42.A H 3.245 2.274 ARG 43.A N GLU 39.A O ARG 43.A H 2.990 2.085 ARG 43.A NE GLU 39.A OE2 ARG 43.A HE 3.098 2.232 ARG 43.A NH1 GLU 332.A OE2 ARG 43.A HH12 2.920 2.057 ARG 43.A NH2 SER 16.A O ARG 43.A HH21 2.842 2.227 ARG 43.A NH2 GLU 332.A OE1 ARG 43.A HH22 2.888 2.041 LEU 44.A N LEU 40.A O LEU 44.A H 2.715 1.705 ALA 45.A N PRO 41.A O ALA 45.A H 2.782 1.819 ASN 46.A N VAL 42.A O ASN 46.A H 3.045 2.124 ASN 46.A ND2 PHE 13.A O ASN 46.A HD21 3.181 2.324 ASN 46.A ND2 VAL 42.A O ASN 46.A HD22 2.505 1.684 ILE 47.A N ARG 43.A O ILE 47.A H 3.393 2.455 MET 48.A N LEU 44.A O MET 48.A H 2.878 1.890 LYS 49.A N ALA 45.A O LYS 49.A H 2.827 1.906 LYS 49.A NZ TYR 337.A OH LYS 49.A HZ3 3.331 2.477 GLU 50.A N ASN 46.A O GLU 50.A H 3.308 2.498 ILE 51.A N ILE 47.A O ILE 51.A H 2.944 1.982 ASN 52.A N MET 48.A O ASN 52.A H 3.101 2.145 LEU 53.A N GLU 50.A O LEU 53.A H 2.991 2.115 LEU 54.A N ILE 51.A O LEU 54.A H 2.963 1.996 VAL 58.A N PRO 55.A O VAL 58.A H 3.099 2.338 LEU 59.A N PRO 55.A O LEU 59.A H 2.878 1.901 SER 60.A N ASP 56.A O SER 60.A H 2.793 1.908 THR 61.A N VAL 58.A O THR 61.A H 3.189 2.236 GLN 65.A N THR 61.A O GLN 65.A H 3.184 2.190 GLN 65.A NE2 LEU 59.A O GLN 65.A HE22 2.413 1.568 LEU 66.A N PRO 62.A O LEU 66.A H 2.789 1.918 VAL 67.A N SER 63.A O VAL 67.A H 3.096 2.160 GLN 68.A N VAL 64.A O GLN 68.A H 2.868 1.870 GLN 68.A NE2 MET 48.A O GLN 68.A HE21 3.597 2.985 GLN 68.A NE2 ASN 52.A OD1 GLN 68.A HE21 2.852 2.200 SER 69.A N GLN 65.A O SER 69.A H 2.956 2.036 TRP 70.A N LEU 66.A O TRP 70.A H 3.142 2.194 TYR 71.A N VAL 67.A O TYR 71.A H 2.943 1.988 VAL 72.A N GLN 68.A O VAL 72.A H 2.878 1.890 GLN 73.A N SER 69.A O GLN 73.A H 3.034 2.049 GLN 73.A NE2 ASP 77.A OD1 GLN 73.A HE22 3.157 2.293 SER 74.A N TRP 70.A O SER 74.A H 3.066 2.153 LEU 75.A N TYR 71.A O LEU 75.A H 2.972 1.996 LEU 76.A N VAL 72.A O LEU 76.A H 3.023 2.031 ASP 77.A N GLN 73.A O ASP 77.A H 2.703 1.746 ILE 78.A N LEU 75.A O ILE 78.A H 2.881 2.020 MET 79.A N LEU 75.A O MET 79.A H 3.044 2.048 GLU 80.A N LEU 76.A O GLU 80.A H 3.471 2.472 PHE 81.A N ILE 78.A O PHE 81.A H 3.042 2.113 LEU 82.A N MET 79.A O LEU 82.A H 2.624 1.638 ASP 88.A N ASP 85.A OD2 ASP 88.A H 3.328 2.414 ARG 90.A N ASP 88.A OD1 ARG 90.A H 3.031 2.097 ARG 90.A NH1 ASP 88.A OD2 ARG 90.A HH12 3.349 2.725 THR 91.A N ASP 88.A O THR 91.A H 2.768 1.919 THR 91.A OG1 ASP 85.A O THR 91.A HG1 2.932 2.247 LEU 92.A N ASP 88.A O LEU 92.A H 3.460 2.498 SER 93.A N HIS 89.A O SER 93.A H 3.255 2.329 GLN 94.A N ARG 90.A O GLN 94.A H 3.375 2.538 PHE 95.A N THR 91.A O PHE 95.A H 3.105 2.257 THR 96.A N LEU 92.A O THR 96.A H 3.202 2.211 ASP 97.A N SER 93.A O ASP 97.A H 3.455 2.474 ALA 98.A N GLN 94.A O ALA 98.A H 3.061 2.176 LEU 99.A N PHE 95.A O LEU 99.A H 2.817 1.878 VAL 100.A N THR 96.A O VAL 100.A H 3.018 2.031 THR 101.A N ASP 97.A O THR 101.A H 2.933 1.950 ILE 102.A N ALA 98.A O ILE 102.A H 3.027 2.034 ARG 103.A N LEU 99.A O ARG 103.A H 2.740 1.752 ARG 103.A NH1 ASN 153.A OD1 ARG 103.A HH11 2.908 2.255 ARG 103.A NH1 THR 156.A OG1 ARG 103.A HH12 3.240 2.381 ASN 104.A N VAL 100.A O ASN 104.A H 3.138 2.135 ARG 105.A N THR 101.A O ARG 105.A H 2.961 1.956 ARG 105.A NE SER 74.A OG ARG 105.A HE 3.403 2.599 ARG 105.A NH2 SER 74.A OG ARG 105.A HH21 3.269 2.436 ARG 105.A NH2 ASP 77.A OD2 ARG 105.A HH22 2.663 1.805 HIS 106.A N ILE 102.A O HIS 106.A H 3.320 2.461 HIS 106.A N ARG 103.A O HIS 106.A H 3.333 2.515 ASN 107.A N ASN 104.A O ASN 107.A H 2.758 1.791 VAL 109.A N HIS 106.A O VAL 109.A H 3.235 2.286 THR 112.A N ASP 108.A O THR 112.A H 3.085 2.189 MET 113.A N VAL 109.A O MET 113.A H 2.655 1.657 ALA 114.A N VAL 110.A O ALA 114.A H 2.914 1.967 GLN 115.A N PRO 111.A O GLN 115.A H 3.080 2.194 GLN 115.A NE2 GLU 119.A OE1 GLN 115.A HE22 2.766 1.933 GLY 116.A N THR 112.A O GLY 116.A H 3.346 2.397 VAL 117.A N MET 113.A O VAL 117.A H 2.864 1.906 LEU 118.A N ALA 114.A O LEU 118.A H 2.892 1.915 GLU 119.A N GLN 115.A O GLU 119.A H 2.877 1.956 TYR 120.A N GLY 116.A O TYR 120.A H 2.979 2.100 LYS 121.A N VAL 117.A O LYS 121.A H 2.978 2.031 LYS 121.A NZ MET 283.A O LYS 121.A HZ1 3.216 2.378 ASP 122.A N LEU 118.A O ASP 122.A H 3.450 2.558 THR 123.A N GLU 119.A O THR 123.A H 2.889 2.043 TYR 124.A N TYR 120.A O TYR 124.A H 2.810 1.905 GLY 125.A N TYR 120.A O GLY 125.A H 3.165 2.237 SER 130.A N ASP 127.A OD2 SER 130.A H 2.990 2.024 ASN 131.A N ASP 127.A O ASN 131.A H 3.085 2.102 GLN 132.A N PRO 128.A O GLN 132.A H 3.070 2.131 ASN 133.A N VAL 129.A O ASN 133.A H 3.162 2.219 ILE 134.A N SER 130.A O ILE 134.A H 2.952 1.959 GLN 135.A N ASN 131.A O GLN 135.A H 2.962 1.990 GLN 135.A NE2 PHE 280.A O GLN 135.A HE21 2.957 2.216 TYR 136.A N GLN 132.A O TYR 136.A H 2.838 1.899 PHE 137.A N ASN 133.A O PHE 137.A H 2.975 1.989 LEU 138.A N ILE 134.A O LEU 138.A H 2.796 1.800 ASP 139.A N GLN 135.A O ASP 139.A H 3.094 2.141 ARG 140.A N TYR 136.A O ARG 140.A H 3.365 2.422 ARG 140.A NE GLU 50.A OE1 ARG 140.A HE 3.388 2.649 ARG 140.A NE GLU 50.A OE2 ARG 140.A HE 2.784 1.972 ARG 140.A NH2 GLU 50.A OE1 ARG 140.A HH21 3.013 2.162 ARG 140.A NH2 VAL 336.A O ARG 140.A HH22 3.069 2.223 PHE 141.A N PHE 137.A O PHE 141.A H 2.826 1.858 TYR 142.A N LEU 138.A O TYR 142.A H 2.719 1.733 LEU 143.A N ASP 139.A O LEU 143.A H 2.969 2.053 SER 144.A N ARG 140.A O SER 144.A H 2.835 1.840 ARG 145.A N PHE 141.A O ARG 145.A H 2.879 1.926 ARG 145.A NH2 HIS 106.A O ARG 145.A HH21 2.716 2.105 ILE 146.A N TYR 142.A O ILE 146.A H 2.780 1.825 SER 147.A N LEU 143.A O SER 147.A H 3.003 2.118 ILE 148.A N SER 144.A O ILE 148.A H 3.006 2.093 ARG 149.A N ARG 145.A O ARG 149.A H 2.951 1.949 ARG 149.A NH1 ARG 103.A O ARG 149.A HH12 3.397 2.691 ARG 149.A NH2 ARG 103.A O ARG 149.A HH22 3.103 2.309 MET 150.A N ILE 146.A O MET 150.A H 3.039 2.174 LEU 151.A N SER 147.A O LEU 151.A H 3.310 2.308 ILE 152.A N ILE 148.A O ILE 152.A H 3.101 2.129 ASN 153.A N ARG 149.A O ASN 153.A H 2.779 1.781 GLN 154.A N MET 150.A O GLN 154.A H 2.924 1.966 GLN 154.A NE2 ILE 164.A O GLN 154.A HE21 2.733 1.854 HIS 155.A N LEU 151.A O HIS 155.A H 3.087 2.108 THR 156.A N ILE 152.A O THR 156.A H 2.960 1.965 LEU 157.A N ASN 153.A O LEU 157.A H 2.856 1.926 ILE 158.A N GLN 154.A O ILE 158.A H 3.303 2.451 PHE 159.A N HIS 155.A O PHE 159.A H 3.071 2.103 ILE 164.A N ILE 167.A O ILE 164.A H 2.737 1.729 SER 166.A N GLN 154.A OE1 SER 166.A H 2.734 1.812 ILE 167.A N ILE 164.A O ILE 167.A H 3.147 2.198 ASP 168.A N TYR 216.A O ASP 168.A H 2.823 1.880 ASN 170.A N ASP 168.A OD1 ASN 170.A H 3.011 2.108 CYS 171.A N MET 214.A O CYS 171.A H 2.766 1.966 VAL 173.A N ILE 212.A O VAL 173.A H 3.441 2.448 GLU 175.A N ASN 172.A OD1 GLU 175.A H 2.945 2.027 VAL 176.A N ASN 172.A O VAL 176.A H 3.387 2.426 VAL 177.A N VAL 173.A O VAL 177.A H 2.925 1.962 LYS 178.A N SER 174.A O LYS 178.A H 2.875 1.956 ASP 179.A N GLU 175.A O ASP 179.A H 2.968 2.007 ALA 180.A N VAL 176.A O ALA 180.A H 3.012 2.006 TYR 181.A N VAL 177.A O TYR 181.A H 2.892 1.936 ASP 182.A N LYS 178.A O ASP 182.A H 2.766 1.798 MET 183.A N ASP 179.A O MET 183.A H 3.121 2.183 ALA 184.A N ALA 180.A O ALA 184.A H 3.004 2.040 LYS 185.A N TYR 181.A O LYS 185.A H 2.704 1.721 LYS 185.A NZ ASP 189.A OD2 LYS 185.A HZ3 3.237 2.583 LYS 185.A NZ SER 195.A OG LYS 185.A HZ3 3.186 2.461 LEU 186.A N ASP 182.A O LEU 186.A H 2.885 1.929 LEU 187.A N MET 183.A O LEU 187.A H 3.188 2.181 CYS 188.A N ALA 184.A O CYS 188.A H 2.759 1.820 ASP 189.A N LYS 185.A O ASP 189.A H 2.615 1.659 LYS 190.A N LEU 186.A O LYS 190.A H 3.073 2.129 TYR 191.A N LEU 187.A O TYR 191.A H 3.021 2.072 TYR 192.A N CYS 188.A O TYR 192.A H 2.863 1.961 MET 193.A N ASP 189.A O MET 193.A H 2.852 2.072 GLU 199.A N ILE 249.A O GLU 199.A H 3.007 2.033 GLN 201.A N VAL 251.A O GLN 201.A H 3.059 2.081 ILE 203.A N VAL 253.A O ILE 203.A H 2.751 1.796 ASN 204.A ND2 GLN 210.A O ASN 204.A HD22 3.021 2.177 ALA 205.A N LEU 255.A O ALA 205.A H 3.158 2.268 ASN 207.A N ASN 204.A OD1 ASN 207.A H 3.380 2.470 ILE 212.A N GLU 202.A OE2 ILE 212.A H 2.907 2.036 MET 214.A N CYS 171.A O MET 214.A H 2.888 2.096 TYR 216.A N ASP 168.A O TYR 216.A H 3.190 2.219 LEU 221.A N VAL 217.A O LEU 221.A H 3.313 2.365 TYR 222.A N PRO 218.A O TYR 222.A H 2.823 1.830 HIS 223.A N SER 219.A O HIS 223.A H 2.897 1.937 MET 224.A N HIS 220.A O MET 224.A H 3.193 2.251 LEU 225.A N LEU 221.A O LEU 225.A H 2.837 1.844 PHE 226.A N TYR 222.A O PHE 226.A H 2.761 1.795 GLU 227.A N HIS 223.A O GLU 227.A H 3.159 2.154 LEU 228.A N MET 224.A O LEU 228.A H 3.065 2.097 PHE 229.A N LEU 225.A O PHE 229.A H 2.913 1.949 LYS 230.A N PHE 226.A O LYS 230.A H 2.892 1.908 LYS 230.A NZ GLU 227.A OE1 LYS 230.A HZ3 3.008 2.135 LYS 230.A NZ PHE 289.A O LYS 230.A HZ1 2.787 2.108 ASN 231.A N GLU 227.A O ASN 231.A H 3.183 2.215 ASN 231.A ND2 GLU 227.A O ASN 231.A HD22 2.719 1.970 ALA 232.A N LEU 228.A O ALA 232.A H 2.961 1.988 MET 233.A N PHE 229.A O MET 233.A H 2.859 1.940 ARG 234.A N LYS 230.A O ARG 234.A H 2.863 1.859 ALA 235.A N ASN 231.A O ALA 235.A H 3.004 2.080 THR 236.A N ALA 232.A O THR 236.A H 2.871 1.929 VAL 237.A N MET 233.A O VAL 237.A H 2.935 1.970 GLU 238.A N ARG 234.A O GLU 238.A H 3.047 2.069 SER 239.A N ALA 235.A O SER 239.A H 2.897 1.949 HIS 240.A N VAL 237.A O HIS 240.A H 2.979 2.166 HIS 240.A ND1 SER 239.A OG HIS 240.A HD1 2.698 1.961 GLU 241.A N GLU 238.A O GLU 241.A H 3.567 2.591 SER 243.A N HIS 240.A O SER 243.A H 3.043 2.140 ILE 249.A N ASP 197.A O ILE 249.A H 2.807 1.821 LYS 250.A N SER 265.A O LYS 250.A H 2.932 1.944 VAL 251.A N GLU 199.A O VAL 251.A H 2.868 1.864 MET 252.A N LYS 263.A O MET 252.A H 2.769 1.899 VAL 253.A N GLN 201.A O VAL 253.A H 2.946 1.957 ALA 254.A N SER 261.A O ALA 254.A H 2.981 1.972 LEU 255.A N ILE 203.A O LEU 255.A H 2.841 1.847 GLY 256.A N ASP 259.A O GLY 256.A H 2.864 1.874 LEU 260.A N LEU 323.A O LEU 260.A H 2.942 2.007 SER 261.A N ALA 254.A O SER 261.A H 2.966 1.981 ILE 262.A N ILE 321.A O ILE 262.A H 2.751 1.812 LYS 263.A N MET 252.A O LYS 263.A H 2.939 1.989 MET 264.A N ALA 319.A O MET 264.A H 2.840 1.836 SER 265.A N LYS 250.A O SER 265.A H 2.715 1.727 ASP 266.A N THR 317.A O ASP 266.A H 3.084 2.130 GLY 268.A N ASP 266.A OD1 GLY 268.A H 2.750 1.776 GLY 269.A N PHE 315.A O GLY 269.A H 2.863 1.999 LYS 275.A N PRO 272.A O LYS 275.A H 3.008 2.105 ILE 276.A N LEU 273.A O ILE 276.A H 3.160 2.201 LEU 279.A N ILE 276.A O LEU 279.A H 2.994 2.088 PHE 280.A N GLU 277.A O PHE 280.A H 2.865 1.907 SER 281.A N ARG 278.A O SER 281.A H 3.076 2.146 TYR 282.A N GLN 135.A OE1 TYR 282.A H 3.202 2.261 TYR 284.A N SER 281.A OG TYR 284.A H 2.765 1.770 SER 285.A N SER 281.A O SER 285.A H 3.111 2.272 THR 286.A N MET 283.A O THR 286.A H 3.095 2.184 SER 296.A N GLY 292.A O SER 296.A H 3.110 2.187 ARG 297.A N LEU 293.A O ARG 297.A H 2.881 1.880 LEU 298.A N PRO 294.A O LEU 298.A H 3.241 2.363 TYR 299.A N ILE 295.A O TYR 299.A H 3.025 2.055 ALA 300.A N SER 296.A O ALA 300.A H 3.224 2.317 LYS 301.A N ARG 297.A O LYS 301.A H 2.898 1.910 TYR 302.A N LEU 298.A O TYR 302.A H 2.849 2.083 GLN 304.A N LYS 301.A O GLN 304.A H 2.816 1.930 GLN 304.A NE2 VAL 331.A O GLN 304.A HE22 2.856 2.025 GLN 304.A NE2 GLU 332.A O GLN 304.A HE22 3.481 2.879 GLY 305.A N ALA 300.A O GLY 305.A H 2.865 2.150 ASP 306.A N TYR 322.A O ASP 306.A H 2.860 1.953 LEU 307.A N ASP 306.A OD1 LEU 307.A H 2.874 1.981 GLN 308.A N VAL 320.A O GLN 308.A H 2.992 2.006 GLN 308.A NE2 ASP 306.A OD2 GLN 308.A HE22 2.755 1.875 PHE 310.A N ASP 318.A O PHE 310.A H 2.895 1.903 MET 312.A N GLY 316.A O MET 312.A H 2.918 1.971 GLY 314.A N GLY 269.A O GLY 314.A H 2.841 1.883 PHE 315.A N MET 312.A O PHE 315.A H 2.847 1.902 GLY 316.A N MET 312.A O GLY 316.A H 3.275 2.501 THR 317.A N ASP 266.A OD1 THR 317.A H 3.077 2.112 ASP 318.A N PHE 310.A O ASP 318.A H 2.757 1.806 ALA 319.A N MET 264.A O ALA 319.A H 2.985 1.989 VAL 320.A N GLN 308.A O VAL 320.A H 2.894 1.890 ILE 321.A N ILE 262.A O ILE 321.A H 2.752 1.790 TYR 322.A N ASP 306.A O TYR 322.A H 2.802 1.823 LEU 323.A N LEU 260.A O LEU 323.A H 2.954 1.992 ALA 325.A N GLU 258.A O ALA 325.A H 2.835 1.833 ASP 329.A N LEU 326.A O ASP 329.A H 3.073 2.194 SER 330.A N SER 327.A O SER 330.A H 3.443 2.597 GLU 332.A N LEU 18.A O GLU 332.A H 2.982 1.983 ARG 333.A N TYR 302.A O ARG 333.A H 2.749 1.795 TYR 337.A N ASN 46.A OD1 TYR 337.A H 3.521 2.608