Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6ubq_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 3.A N GLU 6.A OE1 THR 3.A H 2.953 2.146 GLU 6.A N THR 3.A OG1 GLU 6.A H 3.129 2.301 VAL 7.A N THR 3.A O VAL 7.A H 2.768 1.957 GLN 8.A N ALA 4.A O GLN 8.A H 3.047 2.225 GLN 8.A NE2 VAL 72.A O GLN 8.A HE21 2.919 2.090 GLY 9.A N GLN 5.A O GLY 9.A H 3.117 2.309 LEU 10.A N GLU 6.A O LEU 10.A H 2.898 2.064 MET 11.A N VAL 7.A O MET 11.A H 2.904 2.063 ALA 12.A N GLN 8.A O ALA 12.A H 3.070 2.230 ARG 13.A N GLY 9.A O ARG 13.A H 2.873 2.052 TYR 14.A N LEU 10.A O TYR 14.A H 2.957 2.150 ILE 15.A N MET 11.A O ILE 15.A H 3.250 2.435 GLU 16.A N.A ALA 12.A O GLU 16.A H.A 2.978 2.148 GLU 16.A N.B ALA 12.A O GLU 16.A H.B 2.968 2.132 LEU 17.A N ARG 13.A O LEU 17.A H.A 2.900 2.108 VAL 18.A N TYR 14.A O VAL 18.A H 2.901 2.068 ASP 19.A N ILE 15.A O ASP 19.A H 2.898 2.090 VAL 20.A N GLU 16.A O.A VAL 20.A H 3.131 2.340 VAL 20.A N GLU 16.A O.B VAL 20.A H 3.112 2.322 GLY 21.A N LEU 17.A O GLY 21.A H 2.890 2.157 ASP 22.A N LEU 17.A O ASP 22.A H 3.164 2.381 GLU 24.A N GLU 24.A OE1 GLU 24.A H 2.814 2.134 ALA 25.A N ASP 22.A OD1 ALA 25.A H 2.980 2.133 ILE 26.A N ASP 22.A O ILE 26.A H 3.081 2.266 VAL 27.A N ILE 23.A O VAL 27.A H 2.955 2.122 GLN 28.A N.A GLU 24.A O GLN 28.A H.A 3.033 2.211 GLN 28.A N.B GLU 24.A O GLN 28.A H.B 3.038 2.231 MET 29.A N ILE 26.A O MET 29.A H.A 2.950 2.183 TYR 30.A N VAL 27.A O TYR 30.A H 3.042 2.196 TYR 30.A OH TYR 55.A OH TYR 30.A HH 2.665 1.924 ALA 31.A N.A ILE 111.A O ALA 31.A H.A 2.852 1.996 ALA 31.A N.B ILE 111.A O ALA 31.A H.B 2.848 1.991 ASP 33.A N.A ASP 33.A OD1.A ASP 33.A H.A 2.521 1.816 ALA 34.A N.A ALA 31.A O.A ALA 34.A H.A 3.069 2.262 ALA 34.A N.A ALA 31.A O.B ALA 34.A H.A 3.001 2.218 ALA 34.A N.B ALA 31.A O.A ALA 34.A H.B 3.258 2.437 ALA 34.A N.B ALA 31.A O.B ALA 34.A H.B 3.197 2.390 THR 35.A N GLN 112.A O THR 35.A H.A 3.130 2.353 VAL 36.A N ILE 45.A O VAL 36.A H 2.971 2.173 GLU 37.A N MET 114.A O.A GLU 37.A H 2.919 2.092 GLU 37.A N MET 114.A O.B GLU 37.A H 2.818 1.977 PHE 40.A N ALA 116.A O PHE 40.A H 2.741 1.897 GLN 42.A N PRO 39.A O GLN 42.A H 3.034 2.194 ILE 45.A N VAL 36.A O ILE 45.A H 2.772 1.921 ARG 48.A NH1 TYR 30.A O ARG 48.A HH12 2.989 2.236 ARG 48.A NH2 TYR 30.A O ARG 48.A HH22 2.933 2.157 ARG 48.A NH2 ASP 32.A OD1.A ARG 48.A HH21 2.767 1.941 ARG 48.A NH2 ASP 32.A OD1.B ARG 48.A HH21 2.869 2.012 ILE 51.A N GLY 47.A O ILE 51.A H 2.857 2.050 ALA 52.A N ARG 48.A O ALA 52.A H 2.937 2.091 ALA 53.A N GLU 49.A O ALA 53.A H 2.881 2.054 PHE 54.A N GLN 50.A O PHE 54.A H 3.004 2.193 TYR 55.A N ILE 51.A O TYR 55.A H 3.071 2.264 TYR 55.A OH TYR 14.A OH TYR 55.A HH 2.632 1.840 ARG 56.A N ALA 52.A O ARG 56.A H 2.825 1.994 GLN 57.A N.A ALA 53.A O GLN 57.A H.A 2.815 1.963 GLN 57.A N.B ALA 53.A O GLN 57.A H.B 2.833 1.984 GLY 58.A N PHE 54.A O GLY 58.A H.A 3.038 2.244 LEU 59.A N TYR 55.A O LEU 59.A H 2.772 1.993 GLY 60.A N ARG 56.A O GLY 60.A H 2.701 2.046 GLY 62.A N LEU 59.A O GLY 62.A H 3.007 2.185 ARG 65.A N GLU 87.A O ARG 65.A H 2.924 2.096 ARG 65.A NE ASP 19.A OD1 ARG 65.A HE 2.703 1.848 ARG 65.A NH2 ASP 19.A OD1 ARG 65.A HH21 3.528 2.917 ARG 65.A NH2 ASP 19.A OD2 ARG 65.A HH21 3.182 2.461 ALA 66.A N ASP 19.A OD1 ALA 66.A H 2.925 2.099 CYS 67.A N.A ARG 85.A O CYS 67.A H.A 3.063 2.277 CYS 67.A N.B ARG 85.A O CYS 67.A H.B 3.071 2.283 CYS 67.A SG.A LEU 68.A O CYS 67.A HG.A 3.533 2.401 THR 69.A N PRO 83.A O THR 69.A H 2.983 2.147 ARG 73.A N ALA 81.A O ARG 73.A H 2.851 2.032 ARG 73.A NH1 PRO 71.A O ARG 73.A HH11 2.803 1.975 SER 75.A N CYS 79.A O SER 75.A H 2.869 2.012 SER 75.A OG ASN 77.A OD1 SER 75.A HG 2.378 1.674 ASN 77.A N SER 75.A OG ASN 77.A H 2.993 2.185 CYS 79.A N SER 75.A OG CYS 79.A H 3.108 2.292 CYS 79.A SG ASN 77.A O CYS 79.A HG 3.692 2.499 GLY 80.A N MET 103.A O GLY 80.A H 2.916 2.135 ALA 81.A N ARG 73.A O ALA 81.A H 2.794 1.992 MET 82.A N ASP 101.A O MET 82.A H 2.944 2.182 PHE 84.A N VAL 99.A O PHE 84.A H 2.935 2.102 ARG 85.A N CYS 67.A O.A ARG 85.A H 2.975 2.159 ARG 85.A N CYS 67.A O.B ARG 85.A H 2.997 2.178 ARG 85.A NE ASP 98.A OD1 ARG 85.A HE 2.698 1.881 ARG 85.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 85.A HH21 3.069 2.388 ARG 85.A NH2 ASP 98.A OD2 ARG 85.A HH21 2.848 2.052 VAL 86.A N LEU 97.A O VAL 86.A H 2.865 2.020 GLU 87.A N ARG 65.A O GLU 87.A H 2.766 1.954 MET 88.A N CYS 95.A O.A MET 88.A H 3.044 2.216 MET 88.A N CYS 95.A O.B MET 88.A H 3.007 2.175 TRP 90.A N GLN 93.A O TRP 90.A H 2.825 1.973 GLN 93.A N TRP 90.A O GLN 93.A H 2.911 2.073 CYS 95.A N.A MET 88.A O CYS 95.A H.A 2.696 1.877 CYS 95.A N.B MET 88.A O CYS 95.A H.B 2.713 1.870 ALA 96.A N SER 124.A O.A ALA 96.A H.A 2.829 2.038 ALA 96.A N SER 124.A O.B ALA 96.A H.A 2.872 2.066 LEU 97.A N VAL 86.A O LEU 97.A H 2.836 2.057 ASP 98.A N ASN 122.A O ASP 98.A H 3.066 2.245 VAL 99.A N PHE 84.A O VAL 99.A H 2.956 2.119 ILE 100.A N TYR 117.A O ILE 100.A H 3.152 2.328 ASP 101.A N MET 82.A O ASP 101.A H 3.109 2.371 VAL 102.A N GLN 115.A O VAL 102.A H 2.811 1.975 MET 103.A N GLY 80.A O MET 103.A H 2.870 2.041 ARG 104.A N.A THR 113.A O ARG 104.A H.A 3.072 2.265 ARG 104.A N.B THR 113.A O ARG 104.A H.B 3.074 2.260 PHE 105.A N GLY 78.A O PHE 105.A H.A 2.816 1.984 ASP 106.A N ARG 110.A O ASP 106.A H 2.819 2.003 HIS 108.A N ASP 106.A OD1 HIS 108.A H.A 2.671 1.961 GLY 109.A N ASP 106.A O GLY 109.A H 3.081 2.230 ARG 110.A N ASP 106.A OD1 ARG 110.A H 2.972 2.116 ARG 110.A NE GLN 28.A O.A ARG 110.A HE 3.443 2.752 ARG 110.A NH2 GLN 28.A O.A ARG 110.A HH21 3.019 2.184 ARG 110.A NH2 GLN 28.A O.B ARG 110.A HH21 3.183 2.355 ILE 111.A N MET 29.A O ILE 111.A H 2.801 1.967 GLN 112.A N ARG 104.A O.A GLN 112.A H 2.768 1.957 GLN 112.A N ARG 104.A O.B GLN 112.A H 2.736 1.920 THR 113.A N ARG 104.A O.A THR 113.A H 3.292 2.480 THR 113.A N ARG 104.A O.B THR 113.A H 3.228 2.432 MET 114.A N.A THR 35.A O MET 114.A H.A 2.980 2.177 MET 114.A N.B THR 35.A O MET 114.A H.B 3.001 2.293 GLN 115.A N VAL 102.A O GLN 115.A H.A 2.901 2.101 GLN 115.A NE2.A GLU 37.A OE2 GLN 115.A HE21.A 3.019 2.164 GLN 115.A NE2.B GLU 37.A OE2 GLN 115.A HE21.B 3.314 2.540 ALA 116.A N GLU 37.A O ALA 116.A H 2.938 2.108 TYR 117.A N ILE 100.A O TYR 117.A H 2.793 1.941 TRP 118.A NE1 ASP 38.A OD1 TRP 118.A HE1 2.841 2.000 SER 119.A N ASN 122.A OD1 SER 119.A H 3.186 2.430 GLU 120.A N.A GLU 120.A OE1.A GLU 120.A H.A 2.665 1.855 ASN 122.A N SER 119.A O ASN 122.A H 2.820 1.980 LEU 123.A N GLU 120.A O.A LEU 123.A H 3.236 2.385 LEU 123.A N GLU 120.A O.B LEU 123.A H 2.937 2.086 SER 124.A N.A ALA 96.A O SER 124.A H.A 2.807 1.975 SER 124.A N.B ALA 96.A O SER 124.A H.B 2.773 1.921 ARG 126.A N PRO 94.A O ARG 126.A H 2.980 2.159 ARG 126.A NE CYS 95.A O.A ARG 126.A HE 3.082 2.524 ARG 126.A NE CYS 95.A O.B ARG 126.A HE 3.151 2.581 ARG 126.A NH2 MET 88.A O ARG 126.A HH21 3.120 2.374 ARG 126.A NH2 CYS 95.A O.A ARG 126.A HH21 3.085 2.538 ARG 126.A NH2 CYS 95.A O.B ARG 126.A HH21 3.116 2.551